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I NTRODUCCIN A LA M ORFOMETRA G EOMTRICA C URSO T ERICO -P RCTICO

Silvina Van der Molen (Unidad de Biologa y Manejo de Recursos Acuticos, svandermolen@cenpat.edu.ar) Rolando Gonzlez-Jos (Unidad de Antropologa y Arqueologa, rolando@cenpat.edu.ar)

CENPAT- CONICET Puerto Madryn, Chubut Argentina

La Morfometra Geomtrica, definida como la unin entre la biologa y la geometra, se ha convertido en una herramienta fundamental para el estudio de estructuras fenotpicas. Su principal innovacin terica radica en un cambio rotundo en la aproximacin al tamao y la forma de las estructuras bajo estudio. En lugar de enfocarse en el anlisis multivariante de un conjunto de medidas lineales entre puntos morfomtricos, la Morfometra Geomtrica propone estudiar los cambios en el tamao y la forma a partir del desplazamiento en el plano (2D) o en el espacio (3D) de un conjunto de puntos morfomtricos o landmarks. La relacin espacial en dos o tres dimensiones de estos landmarks siempre se conserva a lo largo de todo el anlisis, lo que permite reconstruir con tanta precisin como se desee la forma y el tamao del espcimen estudiado. Desde comienzos de los aos 90 se han

desarrollado un conjunto de mtodos analticos y grficos que permiten observar estos cambios espaciales desde una ptica estadstica, un paso fundamental en el desarrollo de un mtodo biolgico. La literatura cientfica reciente refleja la aceptacin de estos mtodos en aquellas disciplinas con una larga historia y

Introduccin a la Morfometra Geomtrica

tradicin en la medicin de las formas biolgicas. En resumen, la Morfometra Geomtrica brinda una aproximacin minuciosa y potente al cambio en la forma, que promete enriquecer los anlisis morfolgicos de los prximos tiempos. En este curso, proponemos una introduccin a los principales aspectos tericos y prcticos de la Morfometra Geomtrica. El curso comprende una primera seccin terica, donde se repasar brevemente la historia de este mtodo, sus ventajas con respecto a los mtodos clsicos, las principales tcnicas y sus aplicaciones a casos puntuales. La segunda seccin comprende los aspectos prcticos de la Morfometra Geomtrica, donde los mtodos estudiados se implementan sobre bases de datos reales y utilizando el software disponible en la actualidad.

QUINES EST DIRIGIDO EL CURSO ?

El curso est orientado a alumnos avanzados e investigadores en Biologa, Antropologa, Paleontologa, Geologa, Estadstica, Matemtica y Medicina.

C MO

EST ORG ANIZ ADO EL CURSO ?

El curso comprende 30 horas de clases a lo largo de 5 das (seis horas por da aproximadamente), repartidas en 15 horas de contenidos tericos y 15 de prcticas en computadora. Se proveer una seleccin de bibliografa (artculos en formato pdf), recursos web y los programas y materiales audiovisuales utilizados durante el curso.

Q U

CONOCIMIEN TOS PREVIO S SE REQUIEREN ?

Se requieren conocimientos mnimos de anlisis multivariante y manejo a nivel de usuario de paquetes estadsticos bsicos y hojas de clculo (Excel, Statistica, Systat, SPSS, etc.).

Introduccin a la Morfometra Geomtrica

P ROGR AM A Introduccin: o Breve historia y antecedentes o qu es la Morfometra Geomtrica? Repaso de aplicaciones en las Ciencias Naturales Ventajas (y desventajas) con respecto a la morfometra clsica Definiciones: o Landmark (criterios para su seleccin) o Outlines / contornos o Tamao y forma o Transformaciones en MG o Alometra o Espacios en morfometra Geomtrica o El espacio de Kendall o Forma consenso o Modelos y mtodos en MG Principales mtodos en Morfometra Geomtrica o Mtodos de superposicin Definicin Diferentes tcnicas de superposicin (GLS, Procrustes, Booksteins edge-matching) Distancias de Procrustes F de Goodall y T 2 de Hotelling Caso prctico 1. o Mtodos de deformacin Definicin Thin-Plate Spline (TPS): la metfora de Bookstein Forma (Weight matrix, Principal y Partial Warps) Cambio uniforme y no-uniforme Anlisis cannico de la weight matrix Relative Warp Analysis Singular Warp Analysis (Partial Least Squares Analysis) Caso prctico 2. Caso prctico 3. Caso prctico 4. o Linear-distance based methods Euclidean Distance Matrix Analysis I (EDMA I) Form matrix y Form Difference Matrix. Euclidean Distance Matrix Analysis II (EDMA II) Shape matrix y Shape Difference Matrix Estudios de crecimiento a partir del EDMA: Growth matrix Presentacin grfica de los resultados Caso prctico 5 o Anlisis de Fourier Introduccin Captura de contornos Funcin elptica de Fourier Descomposicin de las curvas en elipses armnicas Obtencin de los coeficientes de Fourier Anlisis multivariante de los coeficientes de Fourier Caso prctico 6. Aspectos prcticos: obtencin de las configuraciones en 2D y 3D para su utilizacin en Morfometra Geomtrica o Tomografas computadas (CT scans) o MRI o Tecnologa Lser o Brazos digitalizadores o Truss Data
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Introduccin a la Morfometra Geomtrica

o Fotografas Recursos web en Morfometra Geomtrica

Prcticas Clase prctica 1: Preparacin de los datos o Presentacin de las bases de datos a utilizar o Digitalizacin de landmarks y outlines (programas TPSUtil y TPSDig) Clase Prctica 2: Mtodos de Superposicin o F de Goodall y distancias de Procrustes(programa IMP) o Obtencin de medidas clsicas a partir de landmark coordinates (programa IMP) o Obtencin de la forma consenso, los componentes principales, los eigenvalues, los polgonos de configuraciones, etc, en dos o tres dimensiones (Morphologika). Clase Prctica 3: Mtodos de Deformacin o Obtencin de la forma consenso, los partial warps, los componentes uniformes, el centroid size y los relative warp scores (programas TPSRelw, TPSRegr y Morpheus) Clase Prctica 4: Anlisis de Fourier (programa Shape) o Obtencin de los outlines y chain-codes o Obtencin de las coeficientes de Fourier o Anlisis de componentes principales a partir de los coeficientes de Fourier. Debate y discusin de casos prcticos puntuales.

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