UNIVERSIDADE FEDERAL DO CEAR CENTRO DE CINCIAS DEPARTAMENTO DE BIOQUMICA E BIOLOGIA MOLECULAR DISCIPLINA: BIOQUMICA FUNDAMENTAL ESTUDO DIRIGIDO 1.

Escreva as reaes de dissociao dos aminocidos abaixo, indicando suas respectivas cargas eltricas resultantes: a) cido asprtico (pK1 = 2,09; pK2 = 9,82 e pKR = 3,86) b) lisina (pK1 = 2,18; pK2 = 8,95 e pKR = 10,53) 2. Cite, pelo menos, duas evidncias que demonstram ser os aminocidos possuidores de estruturas inicas dipolares (Zwitterions). 3. Utilizando a frmula geral inica de um L-aminocido, demonstre atravs de reaes qumicas o seu comportamento anftero. 4. Escreva a(s) estrutura(s) predominante(s) para cada um dos aminocidos abaixo nos pHs 3; 7 e 13. a) b) c) d) glicina (pK1 = 2,34 e pK2 = 9,60) cido glutmico (pK1 = 2,09; pK2 = 9,67 e pKR = 4,25) asparagina (pK1 = 2,02 e pK2 = 8,80) Arginina (pK1 = 1,82; pK2 = 8,99; pKR = 12,48)

5. Para cada um dos aminocidos abaixo, determine seu ponto isoeltrico (pI): a) cido glutmico (pK1 = 2,09; pK2 = 9,67 e pKR = 4,25) b) arginina (pK1 = 2,17; pK2 = 9,04 e pKR = 12,48) Em que direo migrar (anodo ou catodo) cada um dos aminocidos acima, quando uma soluo contendo uma mistura equimolar deles, for submetida uma diferena de potencial eltrico, tal como uma eletroforese em papel, pH 5,7? Explique. 6. Escreva as estruturas inicas predominantes do tripeptdeo Glu-Met-Tyr nos pHs 6,0 e determine seu pI. cido glutmico (pK1 = 2,09; pK2 = 9,67 e pKR = 4,25); metionina (pK1 = 2,17 e pK2 = 9,27) e tirosina (pK1 = 2,20; pK2 = 9,11 e pKR = 10,07) 7. Considere os peptdeos Ser-Glu-Gly-His-Ala e Gly-His-Ala-Glu-Ser. Em que esses dois peptdeos se diferem? Se voc soubesse tudo sobre as propriedades desses aminocidos, voc seria capaz de dizer as propriedades de uma protena (ou de um grande peptdeo) feita a partir deles? Por que?

8. Sugira uma explicao para a observao de que, quando as protenas so modificadas de modo a conferir uma natureza qumica diferente a cadeias laterais especficas, elas no podem mais ser desnaturadas de modo reversvel. 9. Explique as seguintes observaes: a) Substituio da Ser por Trp causa grandes efeitos na estrutura e na funo de uma protena. b) Substituies como Lys por Arg e Leu por Ile geralmente causam apenas um pequeno efeito na estrutura e na funo de uma protena. 10. Uma mutao mais provavelmente alterar a conformao tridimensional de uma protena e, consequentemente, sua funo caso: a) haja uma substituio de um aminocido apolar por um outro apolar b) altere o aminocido na extremidade amino c) altere o aminocido na extremidade carboxi d) insira o aminocido prolina no meio de uma -hlice JUSTIFIQUE. 11. Uma protena foi tratada com cloreto de dansila e, ento, sujeita a uma hidrlise cida completa, sendo detectada a presena de dois derivados danslicos de aminocidos: dansilalanina e dansilmetionina. O que voc pode concluir acerca da estrutura da protena? 12. Um peptdeo sinttico constitudo apenas de resduo de lisina apresenta conformao alfa-helicoidal em pH igual ou superior a 12,0. Explique esta mudana conformacional com o pH e determine o nmero de resduos de lisina de que formado o peptdeo, sabendo que seu comprimento de 45 a pH 12,0. 13. Relacione quatro tipos de foras responsveis pela manuteno da estrutura terciria de uma protena. Cite exemplos de grupos na protena que esto envolvidos em cada tipo de interao. 14. Dos nveis organizacionais das protenas qual aquele que no sofre alterao durante o processo de desnaturao? Explique porque uma protena quando modificada covalentemente no pode ser renaturada?