BIBLIOGRAFIE Alberts B., Johnson A., Lewis J., Raff M., Roberts K., Walter P. (2008) MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL, ediia a V-a, Editura Garland Science (New York & London).
1. 2. 3.
4.
5. 6.
Organite implicate n conversia energiei: mitocondria i sinteza ATP Organite implicate n sinteza i transportul macromoleculelor. Mecanismele de sortare i traficul vezicular intracelular Citoscheletul: filamentele de actin, microtubulii i filamentele intermediare Receptorii membranari i cile de semnalizare intracelular Controlul proliferrii celulare Rspunsul celular la factori de stres
MITOCONDRIA
Organizare structural i funcii:
- Sinteza ATP - Apoptoza
Figure 1-30 Molecular Biology of the Cell, Fifth Edition ( Garland Science 2008)
Consideraii generale
Mitocondriile sunt organite specializate n transformarea energiei ce rezult din catabolizarea substanelor nutritive ntr-o form adecvat reaciilor celulare, reprezentat de adenozin trifosfat (ATP). Denumirea de mitocondrie a fost introdus n 1903 de Carl Benda, pe baza morfologiei organitului, reprezentnd etimologic un cuvnt obinut prin reunirea a dou cuvinte din limba greac: mito (mitos) fir, a, filament i ondrion (chondrion), diminutiv de la ondro (chondros) grune, bucic, granul.
Numrul mitocondriilor este relativ constant n diverse tipuri de celule fiind cuprins ntre 500 i 2000 mitocondrii per celul. n unele tipuri de celule mitocondriile constituie o fracie relativ mare din masa citoplasmatic (circa 22% n celula hepatic i 50% n celula miocardic). n general mitocondriile sunt localizate n apropierea structurilor intracelulare ce necesit un aport mare de ATP sau n apropierea unor surse de combustibil celular. Mitocondriile au dimensiuni cuprinse ntre 0,5 1 m; mrimea i forma depind de tipul celular.
Mitocondriile nu sunt organite statice. Mrimea i forma se pot modifica rapid n funcie de starea metabolic i sub influena unor diveri factori.
Matricea mitocondrial
Matricea mitocondrial conine enzime ce particip la procesele metabolice specifice acestui organit: ciclul Krebs, oxidarea acizilor grai, reacii de transaminare. n matricea mitocondrial exist ADN mitocondrial (dublu catenar circular), ribosomi mitocondriali (70S) i proteine necesare expresiei genelor mitocondriale. Ribosomii mitocondriali prezint numeroase asemnri cu ribosomii de la bacterii. Matricea mitocondrial are o consisten vscoas, similar unui gel, datorit concentraiei mari de proteine (500 mg/ml). Sinteza proteic din matricea mitocondrial este relativ restrns, fiind sintetizate numai 13 tipuri de proteine. Marea majoritate a proteinelor mitocondriale sunt importate din citosol.
Funciile mitocondriilor
Catena respiratorie mitocondrial i sinteza ATP Rolul mitocondriei n iniierea, executarea i controlul apoptozei
Interdependena ntre procesele oxidative mitocondriale i CR Metabolismul oxidativ n mitocondrii este ntreinut de piruvatul format n cursul glicolizei (n citosol), i de acizii grai. Aceti compui sunt transportai selectiv prin membrana intern mitocondrial n matrice unde sunt transformai n acetil-CoA. n matricea mitocondrial piruvatul este decarboxilat oxidativ sub aciunea complexului multienzimatic numit piruvat dehidrogenaza: Piruvat + NAD+ + CoA-SH Acetil-CoA + CO2 + NADH + H+ Acizii grai sunt oxidai n cursul procesului de -oxidare: Cn-acil-CoA + FAD + NAD+ + H2O + CoA-SH Cn-2acil-CoA + FADH2 + NADH + Acetil-CoA + H+
Acetil-CoA este transformat n cursul ciclului Krebs: Acetil-CoA + 3NAD+ + FAD + ADP + Pi + 2H2O 2CO2 + 3NADH + 3H+ + FADH2 + ATP + CoA-SH Echivalenii de reducere NADH, H+ i FADH2 reprezint principalele surse care alimenteaz cu electroni lanul transportor de electroni din membrana intern mitocondrial.
Ciclul Krebs
Cuplul NADH, H+/ NAD+ Eliberarea din structura NADH a ionului hidrur (H:-) i transformarea acestuia ntr-un proton i 2 electroni cu energie nalt.
NADH + H+
E0=1140 mV
G0=-nFE0= 52,7 Kcal/mol
G0=-52,7 Kcal/mol
Figure 14-12a Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)
CR I
CR III
CR IV
Alimentarea cu electroni provenind de la NADH i de la substrate FAD-dependente (de ex. succinat) a lanului transportor de electroni din membrana intern.
Transportul de electroni din catena respiratorie este mediat de coliziunile dintre donorii de e- i acceptorii de e-. Ubichinona (coenzima Q) i citocromul c sunt molecule mobile ce difuzeaz uor n planul membranei, realiznd coliziuni cu complexele respiratorii.
Mecanismul fosforilrii oxidative - Teoria cuplrii chemiosmotice Conform teoriei lui Mitchell, sinteza ATP depinde de procesul chemiosmotic care face legtura ntre procesele chimice i procesele de transport membranar. 1978 - Premiul Nobel pentru Chimie pentru elaborarea teoriei chemiosmotice.
Peter D. Mitchell
Lanul transportor de electroni din MIM este protontranslocator i pompeaz protoni din matricea mitocondrial n spaiul intermembranar atunci cnd electronii circul ntre complexele respiratorii. MIM este impermeabil pentru protoni, anioni i cationi. n MIM exist un complex proteic proton-translocator reversibil, care poate utiliza energia de hidroliz a ATP pentru a pompa protoni prin membran, iar n condiiile unui gradient electrochimic de protoni complexul transport protonii n sens invers i realizeaz sinteza ATP. MIM conine o serie de proteine transportoare ce mediaz importul i exportul metaboliilor eseniali i a ionilor anorganici.
Energia eliberat pe parcursul transportului de electroni este folosit pentru a pompa protoni prin MIM (din matrice n spaiul intermembranar). Acest proces genereaz n MIM un gradient electrochimic de protoni. Revenirea protonilor n matricea mitocondrial are loc la nivelul complexului numit ATP sintaza.
2,4-dinitrofenol
Particule submitocondriale
Tripsin, uree
F1-ATPaza
Dovada direct privind funcia ATP sintazei. Dac n lipozomi se nglobeaz ATP sintaza mitocondrial (izolat din inim de bou) i bacteriorodopsina (pomp de protoni activat de lumin izolat din Halobacterium halobium) i apoi lipozomii sunt expui iluminrii, prin activitatea bacteriorodopsinei de pompare a protonilor n lipozomi se creaz o for proton-motrice capabil s activeze ATP-sintaza.
Bacteriorodopsina
Controlul respirator
Mitocondriile pot oxida NADH numai n prezena unei surse de ADP, proces numit control respirator. In vivo celulele se afl permanent sub un control respirator deoarece oxidarea NADH sau FADH2 i producerea de ATP sunt cuplate prin intermediul forei proton-motrice. n unele tipuri de celule (esut adipos brun), respiraia celular poate fi decuplat de sinteza ATP i cea mai mare parte a energiei este disipat sub form de cldur, n loc s fie convertit n ATP (celulele oxideaz stocurile lipidice i produc cldur n loc de ATP). Membrana intern mitocondrial conine o protein, numit termogenin (UPC1, uncoupling protein 1), care este un decuplant natural al fosforilrii oxidative. Acest mecanism joac un rol important la animalele hibernante i la nou-nscui.
glicoliza
Funciile mitocondriilor
Sinteza ATP
Cuvntul apoptoz vine din limba greac de la apoptein (apo din, de pe i ptosis - cdere) tradus prin cderea frunzelor. Acest termen sugereaz ncetarea funciilor vitale ale celulei.
Fenomenul a fost menionat prima dat de ctre Carl Vogt n 1842. Termenul de apoptoz a fost introdus de John Kerr i colaboratorii si Wyllie i Currie n 1972, referindu-se la apoptoz ca la un proces ordonat al morii celulare, care necesit funcionalitatea mecanismelor genetice i sintez de proteine, fiind un proces activ, cu consum energetic, care duce n final la moartea celulei. Este o form fiziologic de moarte celular, cu activarea secvenial a unor gene ale morii i a unor ci enzimatice de suicid.
Dezvoltarea degetelor la vertebrate presupune eliminarea prin apoptoz a membranelor interdigitale. (A) seciune prin picior de embrion de oarece (a 15-a zi de dezvoltare embrionar); (B) separarea incomplet a dou degete (sindactilie) la om, cauzat de absena apoptozei.
(A)
(B)
APOPTOZ
moarte programat; o singur celul proces activ (consum de ATP) necesar caspaze i endonucleaze fagocitoza corpilor apoptotici; nu exist rspuns inflamator
NECROZ
moarte accidental; mai multe celule proces pasiv blocat enzime lizosomale declaneaz rspuns inflamator
Mecanismul apoptozei
Primele observaii privind mecanismele implicate n apoptoz au fost realizate prin studii genetice pe nematodul Caenorhabditis elegans. La acest nematod au fost identificate 14 gene ce induc i controleaz apoptoza, numite genele morii ced (cell death).
Gene proapoptotice: ced3 i ced4 Gene antiapoptotice: ced9
Mecanismul apoptozei
Sunt descrise dou ci de inducere i realizare a apoptozei ntr-o celul: Calea extrinsec, care pornete de la receptori ai suprafeei celulare, numii i receptori ai morii, activai prin legarea unui ligand specific. Calea intrinsec n care este implicat mitocondria (n principal prin eliberarea factorilor mitocondriali proapoptotici, respectiv a citocromului c i formarea apoptozomului care activeaz caspaza 9). Existena celor dou ci ale apoptozei i marea diversitate a stimulilor care declaneaz ci de semnalizare celular permit fiecrei celule s elaboreze cel mai adecvat rspuns celular, n conformitate cu nevoile de adaptare la mediul extracelular.
Mitocondria ndeplinete un rol activ n apoptoza declanat de stimuli intracelulari (calea intrinsec) Factori inductori ai apoptozei Citocromul c Proteina Diablo/Smac (second mitochondria derived activator of caspases) AIF (apoptosis inducing factor) Caspaze (cysteinil aspartate-specific proteases) Factori antiapoptotici Proteine aparinnd familiei Bcl-2 (B cell lymphoma-2)
Citocromul c
Este o molecul bifuncional: n calitate de component a catenei respiratorii mitocondriale particip la transferul de electroni, iar n calitate de component a programului apoptotic iniiaz asamblarea apoptozomului, dup eliberarea sa din mitocondrie.
DIABLO (Smac)
Proteina Diablo este o protein mitocondrial de 25 kDa care este eliberat n citosol mpreun cu citocromul c dup iniierea apoptozei. Proteina Diablo asigur executarea rapid a apoptozei, interfernd n procesul de activare al procaspazelor la nivelul apoptozomului (anuleaz efectul de blocare exercitat de proteinelor inhibitorii ale apoptozei IAP).
CASPAZELE:
Membrii familiei caspazelor sunt enzime cu rol proteolitic. Numele acestor proteaze vine de la faptul c prezint n centrul catalitic activ Cys i hidrolizeaz legturi peptidice la care particip resturi de Asp. Pn n prezent au fost descrise 14 tipuri de caspaze, cu meniunea c nu toate sunt implicate n apoptoz, i nu toate sunt localizate la nivel mitocondrial. Caspaza 9 este localizat n spaiul intermembranar Cele mai multe se exprim ca precursori inactivi (zimogene) Au o organizare structural similar: un prodomeniu aminoterminal variabil ca lungime i secven de aminoacizi i dou domenii ce formeaz dou subuniti catalitice: p20, p10 . n cursul apoptozei caspazele inactive sunt transformate n forme catalitic active prin clivare proteolitic, ce poate decurge autocatalitic sau sub aciunea altor caspaze. Se clasific n: Caspaze de iniiere a apoptozei (caspazele 2, 8, 9, 10) Caspaze efectoare (caspazele 3, 6, 7) Activarea secvenial a caspazelor creaz o cascad a activitii proteolitice n mediul intracelular.
p20
p10
Proteinele antiapoptotice prezint omologie privind unul sau mai multe domenii structurale numite BH (Bcl-2 homology): BH1, BH2, BH3 i BH4 Factorii anti-apoptotici dein domenii BH1-BH4 (Bcl-2, Bcl-XL). Factorii pro-apoptotici se clasific n funcie de numrul domeniilor Bcl-2 omoloage n factori BH1-BH3 (Bax, Bak) i factori BH3only (Bad, Bid).
Proteinele familiei Bcl-2 anti-apoptotice sunt ancorate prin domeniile lor hidrofobe C-terminale la suprafaa mitocondriilor, prevenind eliberarea citocromului c din spaiul intermembranar Proteinele pro-apoptotice se gsesc n general n citosol unde acioneaz ca senzori pentru leziunile celulare sau pentru factorii de stres. Aciunea stimulilor stresani determin relocalizarea lor intracelular, fiind direcionai spre suprafaa mitocondriilor. Interaciunea dintre proteinele pro- i anti-apoptotice la nivelul suprafeei mitocondriilor perturb funcia normal a proteinelor anti-apoptotice. Membrii familiei Bcl-2 cu activitate pro-apoptotic aparinnd grupului de factori BH1-BH3 (Bax i Bak), redirecionai spre mitocondrie ca rspuns la stimulii apoptotici, formeaz canale MAC (mitochondrial apoptosisinduced channels) n membrana mitocondrial extern prin care pot fi eliberai citocromul c i ceilali factorii apoptotici din spaiul intermembranar. Raportul dintre proteinele anti- i pro-apoptotice controleaz susceptibilitatea la apoptoz.
Etapele apoptozei
Procesul apoptotic poate fi mprit n 3 etape distincte:
- angajarea, etapa n care celula ce a primit un semnal apoptotic letal devine angajat ireversibil pe calea morii; - executarea, etapa pe parcursul creia apar majoritatea modificrilor biochimice i structurale; - clearance-ul, etapa n care sunt ndeprtate prin fagocitoz resturile celulare (corpii apoptotici).
(B)
Modificrile structurale ale celulei pe parcursul apoptozei (imagine stnga): Celul normal (A). Celul n cursul procesului de apoptoz (B); Sgetile indic fragmente de cromatin condensat.
Anomalii n reglarea apoptozei nsoesc o mare diversitate de patologii. Apoptoza excesiv poate sta la originea unor boli degenerative (Alzheimer, Parkinson) sau hematologice. n schimb, scderea ratei apoptozei are drept rezultat promovarea semnalelor de supravieuire i acumularea n organism de celule anormale, cu generarea de tumori (cancer colorectal, cancer hepatic, cancer de prostat, leucemii).
Genomul mitocondrial
Genomul mitocondrial este reprezentat de o molecul de ADN circular dublu catenar de dimensiune mic (16.569 pb pentru genomul mitocondrial uman). Genomul mitocondrial are o pondere de aproximativ 1% din cantitatea total de ADN din celul. Genomul mitocondrial uman conine 37 de gene dintre care 13 codific proteine (componente ale catenei respiratorii mitocondriale i ale ATP sintazei), iar celelalte codific diferite tipuri de ARN: 2 tipuri de ARN ribosomal (12S i 16S rARN) i 22 tipuri de ARN de transport. Aceste molecule sunt eseniale pentru funcionarea aparatului de sintez a proteinelor la nivel mitocondrial.
Intr-o celul exist mii de copii ale genomului mitocondrial (fiecare mitocondrie are 2-10 copii ale mADN, i ntr-o celul sunt 500-2000 de mitocondrii).
Diviziunea mitocondriilor
Diviziunea mitocondriilor se realizeaz prin fisiune. Observaiile realizate pe celule vii prin tehnici de microscopie au evideniat procese de fisiune, dar i procese inverse, de fuziune a mitocondriilor. Mitocondriile se motenesc strict pe linie matern.
Severitatea fenotipului bolii depinde de numrul de copii mutante de mtADN motenite de la mam.
Cele mai importante aspecte funcionale corelate cu patogeneza se refer la producerea de energie, generarea speciilor reactive de oxigen, reglarea apoptozei. Exemple de maladii mitocondriale:
Neuropatia optic ereditar Leber (Leber Hereditary Optic Neuropathy): leziuni ale nervului optic i orbire bilataral; pierderea vederii se instaleaz la vrste cuprinse ntre 15 i 35 de ani. Epilepsia mioclonic cu fibre musculare roii n lambou (Myoclonic Epilepsy with Ragged Red Fibers): se manifest prin contracii musculare necontrolate.
Electron micrographs showing characteristic ultrastructural changes of mitochondria in patients with pathological mtDNA mutations. a: Ring mitochondria; b: giant mitochondria with membrane fusion and circular cristae; c: concentric cristae; d and e: giant organelles with irregularly whorled and undulated cristae. Uranyl acetate, lead citrate; magnification, x5600 and (a and d), x16,000 (b) and x9600 (c and e).
Expresia fenotipic a bolilor mitocondriale implic 2 factori: (1) mutaia ca factor de predispoziie la boal, i (2) naintarea n vrst care determin un declin al funciei mitocondriale i care amplific defectul motenit.
-Helix amfipatic
Importul proteinelor mitocondriale sintetizate n citosol necesit intervenia proteinelor de oc termic (hsp) i consum de energie.