Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Organismele vii posed dispozitive de transformare a energiei, deosebit de subtile i eficiente; Energia chimic a substanelor nutritive, dup transformarea ei ntr-o form convenabil, este utilizat pentru efectuarea de travalii specifice vieii- cretere, reparaii tisulare, activitate contractil, osmotic etc.
Ca sisteme termodinamice pot fi cercetate att indivizii unei specii, celulele izolate, ct i reaciile biochimice;
Organismele vii pot fi considerate sisteme termodinamice, pentru care sunt valabile legile termodinamice:
I. Principiul conservrii energia reaciilor chimice nu dispare i nu apare din nimic, dar se transform dintr-o form n alta; II. Principiul evoluiei toate procesele asociate cu transfer de energie se desfoar de la sine numai ntr-o direcie i numai pn la o anumit limit - ce corespunde entropiei maxime.
Entropia - S este gradul de dezordine a unui sistem. Moleculele organice, proteinele, acizii nucleici, celulele vii, organismele pluricelulare sunt sisteme naturale cu entropii din cele mai mici. Entropia Universului crete permanent. Ordinea se transform spontan n dezordine.
Sisteme deschise (schimb de energie i materie cu mediul nconjurtor); Fiecare sistem are o energie intern (E), care este constituit din energie liber (G) i energie dependent de variaiile TS; E= G + TS; Fora motrice a reaciilor este tendina sistemului att de a-i spori gradul de dezordine, ct i de a-i reduce coninutul de energie liber ordonat.
Cum celula recepioneaz energia i capacitatea reductoare (NADPH + H+) din mediul ambiant ? Cum celulele sintetizeaz diferite macromolecule ?
Metabolismul
- este un sistem coordonat de
FUNCIILE METABOLISMULUI:
-
aprovizionarea celulelor cu energie chimic (generat din molecule nutritive); transformarea substanelor nutritive n precursori macromoleculari i asamblarea lor n componentele celulare; biosinteza i catabolismul biomoleculelor specifice organismului;
Torentul de energie n biosfer este un proces direcionat, neciclic, cheltuindu-se o energie anumit pentru activitatea cilor metabolice; Energia utilizat nu poate fi regenerat;
FAZELE METABOLISMULUI:
Catabolismul
. faza degradrii macromoleculelor (provenite din mediul nconjurtor sau rezervele proprii n timpul rennoirii) n produi mai simpli; . este nsoit de degajarea energiei libere, care se acumuleaz n ATP i n structura NADPH+H+
Anabolismul
. faza de sintez a diverilor compui organici . necesit utilizarea energiei libere (ATP) i a componenilor reductori - NADPH+H+
CILE METABOLICE
- reprezint reaciile chimice n lan, cu o anumit funcie. S ==>A ==> B ==> C ==> P
DEOSEBIM CI METABOLICE: a) centrale (comune pentru degradarea i sinteza principalelor macromolecule) b) specifice (caracteristice doar pentru substane individuale (cofactor). a) liniare (glicoliza) b) ciclice (ciclul Krebs) a) anabolice b) catabolice c) amfibolice a) aerobe b) anaerobe
ETAPELE CATABOLISMULUI
I etap: . decurge n tractul gastro-intestinal fr eliminare de E; . se ncheie cu formarea monomerilor universali (AA, AG, Monozaharide, Glicerol); II etap: . toi monomerii se transform ntrun precursor comun Acetil- CoA; III etap: . este ciclul Krebs i fosforilarea oxidativ; . are loc generare de E.
Proteine
I
AA
CetoI I Gluco
Glucide
Monozaharide
Piruvat
Lipide
Glicerol + AG
II
Acetil -CoA
III
c. Krebs
L.R FO
ADP + Pi ATP
CO2
H2O
Catabolismul aerob
PF =
4. la nivel de inducie i represie enzimatic determinat de modificrile n sistemul neuro-hormonal; 5. influiena medicamentelor de diferit origine.
Substane macroergice
Compuii supramacroergici Fosfoenolpiruvat 1,3 difosfoglicerat Creatinfosfat Compuii macroergici ATP ADP +H3PO4 ADP AMP + H3PO4 H4P2O7 2H3PO4 Compuii submacroergici Glucozo -1- P Fructozo - 6 - P Glucozo - 6- P
G0 (kJ/mol) kcal/mol
Ciclul ATP
Metabolismul celular este bazat pe o economie maxim i este determinat de necesitile n ATP i NADPH + H+ reacionnd fin la modificrile i necesitile n energie;
Toate celulele plantelor i animalelor n condiii normale sunt aerobe i combustibilul organic este oxidat pn la CO2 i H2O; Energia accesibil este eliminat numai n cazul n care toi atomii de H legai de atomii de C vor fi substituii de O; Cantitatea de energie liber e aproximativ proporional cu raportul dintre numrul atomilor de H legai de C la numrul atomilor de C - CO2 (o), CH2 (2), CH4 (4).
Complexul nativ enzimatic se formeaz prin autoasamblare. Recent sa constatat c la un complex structural stabil revin 60 componente E2, 20-30 molecule E1, 6 molecule E3, 12 proteina X, 3+15 molecule K i mai mult de 3 molecule F; Proteina X e un component lipoil auxiliar, ce particip la transferul electronilor;
Reacia sumar:
Complexul PDH:
S E1-TPP, E2-AL S E3-FAD HS-CoA, NAD
CH3-CO-COOH
LR =3 ATP
Ciclul Krebs
Ph-tase
Mg2+ +
Ca2+ +
Reducerea semnificativ a funcionrii ciclului Krebs; Deficit energetic i acumulare de acizi: lactic, piruvic, -cetoglutarat; Niveluri nalte de alanin i acizi ramificai n snge, ca rezultat al blocrii catabolismului lor, n condiiile reducerii fluxului intermediatorilor n ciclul Krebs;
Intoxicaia cu arseniu:
Forma cea mai toxic este cea trivalent (AsO2-); Srurile de arseniu substituie fosfatul inorganic n reaciile biologice, n enzime formnd esteri ai arsenatului (HAsO42-) care sunt instabili; Arsenitul formeaz un complex stabil cu acidul lipoic n enzimele respective, inhibnd activitatea lor: PDH, -GDH, -AcilDH;
O (CH2)4C E AsO2H
+
O (CH2)4C S As OH S E H2O
HS
SH
Intoxicaia cronic cu arseniu are loc la utilizarea apei contaminate cu pesticidele arsenice; Crima cu arsenit se identific prin analiza prului i a unghiilor victimei, determinnd concentraia de arseniu. Individul normal la 1 kg de pr conine 0,5 mg de As, n intoxicaii concentraia crete de sute de ori;
Ciclul Krebs
Donor de protoni i electroni pentru LR; Integrativ; Amfibolic; Energetic.
Diacilarea 4. Oxidarea 2. Trecerea SuccinilCoA alfa Citratului cetoglutaratului cu la la succinil CoA sub actiunea 3. Oxidarea Izocitratului Izocitrat formare de Succinat i la Alfa6.Dehidrogenarea complexului polienzimatic Alfa 1 cetoglutarat .la E-IzocitratDH, care GTP, ca rezultat al Condensarea Succinatului E Aconitaz ce Fumarat contine Fe i cetoglutaratDH asemntor Acetil cu OA are caCoA coenzim NAD, fosforilrii la nivel de necesit glutation ESDH FAD redus. cu complexul Piruvat E-Citrat sintetaza Mg2+, const din 8 DH subunitti substrat dependent compus Enzima exist sub 2 forme din 5 coenzime i 3 de: cu formare de (380000D)este activat enzime. Procesul se izoenzimatice: a. n MC CoA Acetyl Citrat. ADPinhibat de: NADH+H+ATP CH3-C=O n cinci etape. desfoar b. Citoplasm I
SCoA
CS
NADH NAD+ COOH I CH2 I HC-OH I FR COOH COOH I CH II CH FADH2 I COOH FAD+
OAA
MDH
Cit
AC
Mal
ICit
COOH I ICDH CH2 I CH2 I CH=O I COOH
NAD+ NADH
Fum
SDH
Suc
a-KG
NAD+ NADH
aKGDH
SCoA
Reacia sumar
CH3COSCoA +3NAD+FAD+GDP+Pi+2H2O
Afeciuni ereditare caracterizate prin acidoz lactic acumularea piruvatului din glicoliz; Deficit energetic marcat retard mintal, hipotonie, encefalopatii severe; Amplificarea excesiv a cetogenezei; Apar n perioada perinatal, afeciunile sunt rare.
1. 2.
3.
Membrana intern: Formeaz invaginri cunoscute ca criste; Fosfolipidele constituie 30 35% din greutate total care sunt distribuite asimetric; Fosfatidiletanolamina predomin pe partea matricei, iar fosfatidilcolina pe partea citoplasmic;
4.
5.
6.
Cardiolipina este prezent numai pe partea matricial; Ea este presturat cu sfere ataate prin tulpini Sferele sunt prezente pe partea M, dar lipsesc pe partea C;
7.
8.
9.
Componentele ei conin proteinele lanului respirator, molecule transportatoare i ATP sintaze; ATP-ADP translocazele i ATP sintazele prezint din toate proteinele; Moleculele mici sunt transferate prin sisteme de transport specific.
1.
2.
3.
Membrana extern: La fiecare unitate de protein revin 2 sau mai multe fosfolipide; n ea predomina colesterolul; Permeabilitatea ei se datorez unor structuri proteice ncadrate n stratul fosfolipidic, formnd pori porina, proteina identificat.
Mitocondriile sunt implicate n moartea celular programat apoptoza. Structura, mecanismul replicrii DNA mitocondrial i procesele de transcripie i translaie sunt unicale.
1.
2.
3.
4.
Particulele submitocondriale (SMPs): Apar la dezintegrarea mitocondriilor n rezultatul ocului mecanic, osmotic, sonic; Fragmentele membranei interne se transform n vezicule; Membranele SMPs sunt capabile de transportul de electroni i fosforilarea oxidativ; Structurile care includ sfere (F1), tulpine i o subunitate proteic membranar (F0) pot sintetiza ATP; oligomicina antibiotic ce puternic inhib aceast subunitate.
Genomul mitocondrial
Se deosebete de codul genetic universal, prin urmtoarele: Prezint o molecul circular cu caten dubl de DNA, foarte compact, ce conine 16,569 perechi de baze; Genele mitocondriale umane nu sunt separate prin secvene intercistronice;
Deosebim o caten cu densitate mare H i alta uoar L i o regiune necodat D-inel aici se afl originea replicrii i promotorii pentru transcripia ambelor catene. DNAmt conine 37 de gene ce codific proteinele lanului respirator, restul genelor codific RNAr (12S i 16S) i 22S RNAt;
RNAmt nu conine nici secvene iniiale i nici secvene de terminale, nu este poliadenilat; DNAn susine fosforilarea oxidativ a produselor genelor mitocondriale; Proteinele codificate de genele nucleare sunt sintetizate n ribozomii citoplasmici, importate i asamblate n mitocondrii.
2.
3.
Este transmis prin citoplasm i motenit matern; n caz de mutaie se creaz o populaie intracelular mixt de molecule provenite din mutaii i originale, care ntmpltor sunt distribuite n celule fiice; Defectele severe reduc randamentul energetic celular;
4.
5.
6.
Are o rat de mutaii de 10-17 ori mai mare dect DNAn, care afecteaz ambele linii germinale i a esutului somatic; Mutaiile liniilor germinale rezult n boli transmise pe lina matern sau predispoziii la boli degenerative ce se manifest ntrziat; Mutaiile somatice se acumuleaz n esuturi i intensific defectele fosforilrii oxidative motenite.
Mutaiile apar datorit concentraiei nalte a radicalilor oxigenului, lipsa mecanismelor insuficiente de reparare a DNAmt, ct i/sau lipsa histonelor. Cu vrsta capacitatea de generare a ATP-ului scade, ce este asociat cu creterea lezrilor DNAmt somatic.
Sinteza membranelor mitocondriale strns legate de ciclul celular; Diferenierea organitelor ce necesit un control coordonat a genelor nucleare i mitocondriale, care sunt independente de creterea i diviziunea celular;
Formarea complexului funcional enzimatic care are loc graie asamblrii succesive de subuniti; Unele secvene proteice importante conin aminoacizi bazici i hidroxilai n cantiti majore i lipsa aminoacizilor acizi i ramificai cu secven hidrofob.
Mutaiile n regiunile cu secvene importante provoac lipsa unor proteine transportatoare de: metil-malonil-CoA-mutaza, alanil-glioxilat-aminotransferaza; Transportul proteinelor n MT este facilitat de proteina de inserie general (GIP). Dup traversarea precurosurului polipeptidelor, el este convertit n proteine mature prin aciunea enzimelor proteolitice.
Expresia DNAmt: Pe lng locurile limitate iniierii transcrierii i prezena structurilor suprapuse posed i alte trsturi distincte, incluznd un codon de repartizare ce difer de cel al DNAn; UGA este folosit ca codon al Trp (n loc de codon STOP);
Codonul AUA este codonul Met, dar nu a Ile; Codonii AUA i AUU sunt codoni de iniiere Nu sunt codonii AGA sau AGG (Arg), ei sunt utilizai ca codoni de terminare n genele DNAmt, de asemenea nici RNAt nu este pentru aceti codoni;
Un singur RNAt Met specific ambele RNAt Met i N-formil-Met, graie modificrilor secundare n transcriptul primar; MT necesit doar 22 molecule de RNAt pentru a citi codul genetic, comparativ cu cele 31 pentru sistemul citozolic;
Unele RNAt sunt codate de genomul nuclear, altele mitocondrial; Codul genetic mitocondrial are varieti la diferite organisme.
Controlul nuclear al expresiei lanului respirator: Majoritatea genelor nucleare contribuie la funcionarea subunitilor respiratorii 80% din genele subunitilor sunt localizate n nucleul celulei; Cteva gene nucleare sunt implicate n tulburri genetice mitocondriale. Unele anomalii ale DNAmt sunt transmise ca trsturi Mendeliene cauzate de mutaii n genele nucleare respective.
Unii factori nucleari sunt implicai n expresia lanului respirator i joac un rol important n controlul funciei mitocondriale:
NRF1 (factor nuclear al respiraiei) se leag de gene ce codific proteinele lanului respirator, particip n biosinteza enzimelor hemului i a componentelor transcripiei i replicrii DNAmt; NRF2 este implicat n funcionarea subunitii 4 i 5b a citocrom-oxidazei c;
Integritatea expresie genelor nucleare i mitocondriale sunt determinate de dou proteine reglatoare care acioneaz asupra unor gene nucleare suprapuse; Comlexele 3,4,5 i citocromul c au cel puin o subunitate expresia creia se afl sub controlul NRF;
Funcia reglatoare n interaciunile nucleu mitocondrie l are proteina reglatoare TFAmt, ce stimuleaz transcripia iniiat de RNA-polimeraza MT; O alt protein reglatoare a DNAn joac un rol deosebit n terminare transcripiei MT. Acest factor TERF se leag de genele 16S RNAr i RNAt-leucil bidirecional.
Procesul de legare este asociat cu o protein de 34kDa. O mutaie punctiform n aceast regiune este asociat cu miopatia, encefalomiopatia mitocondrial, acidoza lactic.
Bolile mitocondriale: Cauza comun a bolilor degenerative sunt defectele bioenergetice; Lezarea interaciunii nucleu-citosol este rezultatul mutaiilor autosomal dominante; Bolile complexe sunt rezultatul epuizrii DNAmt n esuturi;
Mutaiile DNAmt sunt asociate cu un larg spectru de boli cronice degenerative cu o varietate de reprezentri clinice. Mutaiile de substituie: Sunt fenotipuri clinice variate cu implicarea sistemului nervos;
LHON (neuropatia optic ereditar Leber) se caracterizeaz prin o pierdere rapid bilateral a vederii centrale graie atrofiei nervului optic; boala e motenit matern afectnd brbaii tineri; maladia este asociat cu cel puin 16 mutaii diferite missens n DNAmt. Mutaiile n genele ND1, ND4 i ND6 sunt cauzele primare;
Mutaiile missens n gena ATP-azei G duc la o slabiciune muscular neurogenic, ataxie i retinita pigmentoas (NARP), n cele mai multe cazuri manifestarea este descris ca boala lui Leigh; Mutaiile deplaseaz restul de Leu finaliznd cu pierderea produciei de ATP.
Familia bolilor LHON demonstreaz c mutaiile puin duntoare a DNAmt se pot acumula pe un cromozom MT n timpul evoluiei crend o predispoziie. Ali factori nocive vor declina (raportat la vrst) producia insuficient de energie cauznd boala.
Mutaiile DNAmt sunt asociate cu un atac ntrziat al bolilor i pot predispune la boala Alzheimer sau Parkinson. Bolile motenite matern vor fi asociate cu mutaiile n RNAt miopatii mitocondriale severe - fibre musculare scheletale roii aspre i acumulare de anormaliti structurale mitocondriale n muchi;
Indivizii
cu mutaii n RNAt pot s nu manifeste semne clinice pn cnd proporia de DNAmt mutant nu va depi 80-90%;
Epilisia mioclonic i boala fibrelor roii (MERRF o mutaie n gena mitocondrial care codifica tRNALys), encefalopatia mitocondrial i acidoza lactic (MELAS mutaie n gena mitocondrial pentru tRNA Leu) la fel ca i miopatiile i cardiomiopatiile (MMC) motenite matern sunt boli mitocondriale bine caracterizate;
Indivizii cu genotip DNAmt identic pot manifesta semne clinice diferite n dependen de vrst la 20 de ani cu 80% DNAmt mutant pot fi asimptomatici, iar la 60 de ani sufer de boli neurologice multisistemice; Mutaiile n DNAmt i RNAt afecteaz SNC i esutul muscular scheletic sau cardiac, mutaiile missens n primul rnd afecteaz esutul nervos;
Deleiile n DNAmt pot provoca miopatia ocular i Sindromul medular-pancreatic Pearson. Cel mai rspndit sindrom al miopatiilor este Sindromul Kernas-Sayre (KSS) oftalmoplegie, retinit pigmentoas atipic, miopatie mitocondrial, sindrom cerebral i anormaliti n conductibilitatea cardiac, sau descris peste 120 deleii diferite n DNAmt;
Duplicaiile DNAmt sunt mai rare, mecanismul de apariie nu este cunoscut; Mitocondiopatiile asociate cu limitarea sever a metabolismului aerobic n astfel de organe ca ficat, rinichi, inim i creier sunt probabil incompatibile cu viaa;
Lanul Respirator:
- ultima etap a degradrii aerobe;
- ansamblul sistemelor redox i enzimelor, care particip la transferul echivalenilor reductori (protoni i electroni) de la coenzimele reduse la oxigen.
Lanul respirator
OAA Suc Fum + 3H ATP + MDH H +0,04-+0,25 + + 2H 2H 2H+ + NADH + O2 H2O 2H matrix NAD FAD FADH2
CI membrana intern NADHDH C II SDH C III Cyt bc1 C IV Cyt c ox ATPase
Mal
2e-
2H+
spaiul -0,32intermembranar
2H+ 2H+
H+
ATP 3H+
2H+
2H+
+0,25-+0,82
NADH-Ubiquinone Oxidoreductase
Cytochrome c Oxidase
X
X
Intoxicaia cu cianuri:
Cianura este cea mai rapid i puternic otrav, la inhalaia gazului cianurii de hidrogen, sau la ingerarea cianurii de potasiu apare o rapid i extins inhibiie a lanului mitocondrial transportator de electroni la momentul oxidrii citocromului;
Cianura se fixeaz de Fe3+ n hemul citocromului a, a3 i inhib reacia dintre oxigen i citocromi; respiraia mitocondrial i producerea de energie nceteaz survine moartea rapid a celulei, mai ales n sitemul nervos central.
Ca surse nedietare de cianide poate fi nitroprusidul de sodiu (agent hipotensiv), succinonitrilul (agent antidepresant), acrilonitrilul, ct i fumul de igar; Expoziia cronic se manifest prin dimielinizare, leziuni ale nervului optic, ataxia i depresia funciei glandei tiroide;
NO3MetHbOH(Fe3+)
CN -
Rodanaza
SCN -
MetHbOH(Fe3+)
Decuplanii
2,4Dinitrophenol
OH
H+
NO2
NO2
H+
O NO2
+ H+
H+
NO2
Aproape 90% din O2 este redus de complexul citocromoxidazic aa3. Unele esuturi conin enzime ce catalizez reacii de oxido-reducere n care atomii de oxigen se includ nemijlocit n molecule i formeaz grupa OH sau carboxilic COOH. Enzimele ce catalizeaz tipul dat de reacii se numesc oxigenaze.
Dioxigenazele sunt enzime ce catalizez reacii care includ n molecula substratului organic ambii atomi de O2, exp: pirocatehaza. Monooxigenazele reprezint enzime ce catalizeaz reacii de includere a unui atom de O2, cellalt fiind redus la H2O. Aceste enzime necesit dou substraturi unul adiioneaz un atom, iar al doilea cosubstratul este donator de H pentru reducerea atomului de O2 la H2O:
Primul substrat se hidrolizeaz, de aceea enzimele sunt denumite i hidroxilaze; monooxigenazele se divizeaz n subclase n dependen de natura cosubstratului (FMN, FAD, NAD, NADP, -cetoglutarat).
Modelul situsului activ a CYP2C5 la mamifere, cu grupa prostetic protoporfirina IX (rou) cu ligandul cistein tiolat (galben) ataat la hem
Numeroase i complexe sunt reaciile de oxido-reducere, cu participarea citocromului P450 (prezent n reticulul endoplasmatic). Acest citocrom poate interaciona cu O2 cu CO, formnd cu ultimul un complex ce absoarbe lumina la 450 nm.
Citocromul P450 catalizeaz reaciile de hidroxilare a substratului (RH ROH), iar cellalt se reduce la H2O, adiionnd echivaleni redui ai NADH, NADPH sau proteine fiero-sulf.
Particip la: Hidroxilarea steroizilor; Inactivarea substanelor strine, mai ales puin solubile n ap; Hidroxilarea medicamentelor hidroxilare ce amplific solubilitatea lor, favoriznd procesele de dezintoxicare i eliminare din organism.
Producere de Energie
Glucoza
Glicogen
Glicogenoliza Glicoliza
AG
b-Oxidarea Acetil-CoA LR Koetone bodies
G6P
AA Ile, Val
Producere de ATP
3 Na+
Ouabane
Rcepteur insulinique
-?
Na+-K+ATPase
G
ATP
Adenylate Cyclase
2 K+
La pompe du sodium contrle environ 40 % de la respiration des hpatocytes Laugmentation de la consommation de O2 au cours de l hyperthyrodisme est cause par une augmentation de lactivit des pompes du Na dans le foie
NAD + H2O
NADH2 + 1/2 O2
Pathway Perturbations
Glc G6Pase G6P Cytosol GK
F6P
F16BPase F16BP PFK Ala Asp ALT AST Malate NADH PDH Acetyl CoA
NAD+
MDH NADH
PK MDH NADH
OAA
Malate
Cit
Mitochondrion ICit NAD+ aKG NADH IDH NADH
Fum
Suc S CoA
aKGDH
NAD+
acidoza lactic; deficit energetic marcat - retard mintal, insuficien neuromotorie, hipotonie, encefalopatii severe; amplificarea cetogenezei.
Sunt descrise diferite cazuri de deficiene a proteinelor lanului respirator. Administrarea de mediatori redox potrivii, acid ascorbic i alii pot ocoli deficiena factorilor i permite transportul de electroni spre oxigen. La aceti indivizi nectnd la scderea produciei de ATP cu 33% n mitocondrie se mbuntete fosforilarea i activitatea funcional.
Opiunile de tratament sunt limitate; la dou surori a fost descris o deficien de NADHCoQ reductaz, ele manifestau intolerana la exerciii fizice oboseal rapid; n perioada post-exerciii avea loc o restabilire uoar a nivelului de fosfocreatin; la un alt pacient apariia unor slbiciuni musculare progresive i acidoza lactic deficitul era ntre CoQ i citocromul c.
- Hipoxia (insuficien cardio-respiratorie, oc); - Insuficiena vitaminelor B1, B2, PP, acidul lipoic, acidul pantoteic, deficitul de Fe; - Acumularea de radicali liberi; Toate duc la deficit energetic important deficit de ATP.
Deficitul ereditar al unui din complexele enzimatice mitocondriale (mutaii n DNA) au consecine catastrofale pentru viaa omului Encefalopatii, afeciuni neurodegenerative; Patologia miocardului i muchilor scheletici.