II.

BIOMOLECULE I METODE BIOCHIMICE

Unul din obiectivele fundamentale ale biochimiei este cunoaterea compoziiei chimice a organismului uman i a claselor de molecule organice i anorganice care sunt implicate n procesele vieii. n concepia modern biochimia este o disciplin de grani ntre biologie i chimie, fr a se putea trage o linie net de demarcaie i, n acelai timp, cu interferene profunde cu fizica. Biochimia s-a dezvoltat n dou direcii distincte i anume, o direcie care deriv din fiziologie i este o preocupare mai veche de a cunoate compoziia chimic a sngelui, a urinei i a esuturilor i a doua direcie, care deriv din chimia organic. Compoziia chimic a organismelor vii este diferit din punct de vedere calitativ de compoziia mediului nconjurtor cu toate c din punct de vedere cantitativ putem ntlni aceleai molecule att n celula vie ct i n afara acesteia. Celula este unitatea major structural, funcional i genetic a biologiei. Majoritatea reaciilor ce se desfoar n organism au loc n celul. Celulele funcioneaz ca nite entiti capabile s efectueze nenumrate transformri chimice i n acelai timp s-i asigure condiiile energetice optime pentru aceste transformri. O proprietate remarcabil a celulelor este c toate reaciile care se desfoar aici sunt catalizate enzimatic cu un randament de 100%, deci fr produi secundari. Din acest motiv celula este mai degrab asemnat cu o main chimic dect cu o uzin chimic. Deoarece enzimele catalizeaz reacii de transformare a unor anumite substane i ntr-un anumit sens, fr s influeneze i alte procese, organismele vii sunt capabile s realizeze simultan un numr enorm de procese variate fr s se influeneze reciproc. Mediul nconjurtor este absolut necesar unui sistem viu, pentru din ascet mediu organismele vii i asigur materia prim necesar proceselor chimice celulare ct i energia necesar desfurrii acestora. Organismele vii fa de mediul nconjurtor se afl ntr-un echilibru dinamic a unui sistem deschis.

11

Principiul II al termodinamicii arat c toate procesele fizico-chimice sunt nsoite de variaia energiei sistemului i a gradului de dezordine, a entropiei. organismele vii, cu toat complexitatea structural, i pstreaz un grad de ordine mai mare dect aceleai structuri n stare nevie. Acest grad ridicat de ordonare a sistemelor vii are o semnificaie deosebit, deoarece nu se poate imagina o ordonare spontan a materiei nevii pentru a trece la cea vie. Organismele vii, conform principiului nti al termodinamicii, nu pot crea i nu pot consuma energie, dect s transforme o form de energie n alta. De aici putem concluziona c organismele vii sunt sisteme deschise. II.1. COMPOZIIA ELEMENTAR A ORGANISMULUI UMAN n urma determinrilor efectuate s-au identificat un numr de peste 60 de elemente care intr n compoziia organismului uman (conform tabelului II.1). Tabel nr. II.1. Compoziia elementar aproximativ a corpului uman (la substan uscat)
Element carbon (C) oxigen (O) hidrogen (H) azot (N) calciu (Ca) fosfor (P) % 50 20 10 8,5 4 1 Element sulf (S) sodiu (Na) clor (Cl) magneziu (Mg) fier (Fe) iod (I) % 0,8 0,4 0,4 0,1 0,01 0,00005

Dintre acestea remarcm c primele patru elemente adic carbonul, oxigenul, hidrogenul i azotul sunt constitueni majori ai organismului uman i reprezint aproximativ 90%. Fosforul este o component a acizilor nucleici i a altor molecule i este rspndit n tot organismul uman sub form ionizat. Calciul are un rol cheie n nenumrate procese i este n centrul ateniei a mai multor curente de cercetare. Restul de elemente sunt, de asemenea, foarte importante n buna funcionare a echilibrului de electrolii (K+, Na+, Cl- i Mg+2), deficitul de fier (Fe+2) provoac anemia iar carena de iod (I-) disfuncii ale tiroidei. Toate aceste elemente reprezint 99,9% din constituenii organismului uman. Remarcm c un numr foarte mic de elemente carbonul, hidrogenul, azotul i oxigenul constituie marea majoritate a elementelor din materia vie, la care se mai adaug nc un numr restrns pentru a forma aproape toi constituenii din organism. Pentru buna funcionare a proceselor din organism mai este nevoie de cantiti extrem de
12

mici i din celelalte elemente. S-au identificat aproximativ 60 de elemente care au fost denumite microelemente, oligoelemente sau elemente n urme. Dintre acestea amintim cupru, arsen, cobalt, mangan, vanadiu etc. II.2. PRINCIPALELE CLASE DE BIOMOLECULE DIN NATUR Cele mai importante biomolecule care intr n componena celulelor i a esuturilor animale sunt acizii nucleici, proteinele, polizaharidele i lipidele. (tabelul II.2.). Moleculele complexe sunt alctuite din molecule simple. Astfel, acizii dezoxiribonucleici i acizii ribonucleici sunt construii din dezoxiribonucleotide i ribonucleotide iar proteinele sunt cldite din aminoacizi. Polizaharidele sunt formate din molecule simple de hidrai de carbon (cum este cazul glicogenului, polizaharida principal a organismului animal este format din glucoz). Ca biopolimeri sunt considerai acizii nucleici, proteinele i polizaharidele deoarece sunt formai din uniti care se repet n structura respectiv. Aceste molecule complexe sunt eseniale vieii, motiv pentru care vor fi descrise mai n amnunt. Componentele principal a lipidelor sunt considerai a fi acizii grai. Tabel nr. II.2. Principalele biomolecule complexe din celule i esuturi. Acizii nucleici, proteinele i polizaharidele sunt biopolimeri construii din structuri care se repet. Lipidele, n general, nu sunt biopolimeri i nu toate lipidele au n structur i acizi grai.
Biomolecula ADN ARN proteine polizaharide (glicogenul) lipide Monomeri dezoxinucleotide ribonucleotide aminoacizi glucoz acizi grai Funcii majore Material genetic Tipar pentru sinteza proteinelor Funcii multiple Stoc de energie Componente ale membranei celulare, rezerv de energie

Compoziia elementar a organismului uman a fost descris mai sus. Compoziia molecular este prezentat n tabelul nr. II.3. n proteine, grsimi, hidrai de carbon, ap i minerale. Apa este, de asemenea, un constituent major al organismului uman fiind prezent n toate esuturile. Natura polar a moleculei de ap i capacitatea de a forma legturi de hidrogen i confer acesteia proprieti excepionale de solvent i de mediu de reacie. Din studiile efectuate pe E. coli ntr-o celul exist aproximativ 3000 de tipuri diferite de proteine i 1000 de tipuri de acizi nucleici. Toate aceste

13

proteine sunt formate numai din 20 de aminoacizi, iar acizii nucleici numai din 8 nucleotide. S-a apreciat c viaa pe pmnt, n prima faz, a fost format din cteva zeci de molecule complexe diferite. Tabel nr. II.3. Compoziia medie a organismului n componentele majore
proteine grsimi hidrai de carbon ap minerale Kg 11 9 1 40 4 % 17 13,8 1,5 61,6 6,1

Cum evoluia vieii a dus la formare de organisme tot mai variate i mai difereniate, astzi se cunosc foarte muli aminoacizi care deriv din cei 20 de aminoacizi primari. Se mai cunosc cteva zeci de nucleotide, care au la baz tot nucleotidele primare. Se cunosc peste 70 de structuri de monozaharide care deriv toate de la glucoz. n ce privesc lipidele se cunosc nenumrate forme de acizi grai care ns deriv n totalitate din cei primordiari.

14