Proteinele

Proteinele sunt substane organice macromoleculare formate din lanuri simple

sau complexe de aminoacizi; ele sunt prezente n celulele tuturor organismelor vii n proporie de peste 50% din greutatea uscat. Toate proteinele sunt polimeri ai aminoacizilor n care secvena acestora este codificat de ctre o gen. !iecare protein are secvena ei unic de aminoacizi determinat de secvena nucleotidic a genei.

" #tructura insulinei. $ormon pancreatic secretat de celulele %anger&ans cu rol de reglare a nivelului glucozei.'n stnga este redat monomerul insulinei cela care se crede ca este activ biologic . (arbonul verde &idrogenul alb oxigenul ro)u iar azotul albastru.Partea dreapt reprezint &examerul forma de stocare. *nitatea monomerului este format din lanul + ,albastru- )i lanul . cian./albenul reprezint punile disulfurice iar sferele violet ionii de zinc.

Nutriia
0a1oritatea microorganismelor )i plantelor pot sintetiza toi cei 20 aminoacizi standard n timp ce organismele animale obin anumii aminoacizi din diet ,aminoacizii eseniali-.3nzime c&eie cum ar fi de exemplu aspartat4inaza enzim care catalizeaz prima etap n sinteza aminoacizilor lisin metionin )i treonin din acidul aspartic nu sunt prezente n organismele de tip animal.%a aceste organisme aminoacizii se obin prin consumul &ranei coninnd proteine. Proteinele ingerate sunt supuse aciunii acidului clor&idric din stomac )i aciunii enzimelor numite proteaze proces n urma cruia lanurile proteice sunt scindate ,denaturate-. 5ngestia aminoacizilor eseniali este foarte important pentru sntatea organismului deoarece fr ace)ti aminoacizi nu se poate desf)ura sinteza proteinelor necesare organismului.6e asemenea aminoacizii sunt o

surs important de azot;unii aminoacizi nu sunt utilizai direct n sinteza proteic ci sunt introdu)i n procesul de gluconeogenez proces prin care organismul asigur necesarul de glucoz n perioadele de nfometare ,mai ales proteienele aflate n mu)c&i-.

Tipuri de proteine
'n funcie de compoziia lor c&imic ele pot fi clasificate n8 $oloproteine cu urmtoarele clase de proteine o Proteine globulare ,sferoproteine- sunt de regul substane solubile n ap sau n soluii saline8protaminele &istonele prolaminele glutelinele globulinele albuminele. o Proteinele fibrilare ,scleroproteinele- caracteristice regnului animal cu rol de susinere protecie )i rezisten mecanic8colagenul c&eratina )i elastina. $eteroproteinele sunt proteine complexe care sunt constituite din o parte proteic )i o parte prostetic; n funcie de aceast grupare se pot clasifica astfel8 o /licoproteine o %ipoproteine o 9ucleoproteine

Solubilitatea proteinelor
Proteinele sunt substane solide macromoleculare solubile n general n ap )i insolubile n solveni organici nepolari.*nele proteine sunt solubile n ap dar insolubile n alcool altele sunt solubile n soluii apoase de electrolii acizi organici. 6atorit gradului diferit de solubilitate n diferii solveni proteinele se pot izola identifica )i separa. #olubilitatea lor depinde foarte mult de legturile care se stabilesc ntre gruprile libere de la suprafaa macromoleculelor )i moleculele solventului.%a suprafaa macromoleculelor proteice se gsesc grupri libere de tip polar :(;;$ :9$ 2 :;$ :#$ :9$ grupri cu caracter &idrofil care favorizeaz dizolvarea proteinelor n ap.6e asemenea exist grupri de tip apolar &idrofobe de regul radicali de &idrocarburi :($ < :(=$5 :(2$5 care favorizeaz dizolvarea proteinelor n alcool. 'ns n marea lor ma1oritate predomin gruprile polare determinante pentru caracterul &idrofil. 'n contact cu apa proteinele greu solubile manifest fenomenul de gonflare datorit tendinei de &idratare datorat gruprilor polare. /elatina de exemplu se mbib foarte puternic cu apa dnd na)tere prin rcire la geluri. %a dizolvarea proteinelor n ap are loc fenomenul de formare a coloizilor &idrofili. #:a constatat c n soluii diluate se gsesc macromolecule proteice izolate iar n cazul soluiilor concentrate se formeaz agregate de macromolecule proteice. #oluiile coloidale ale proteinelor coaguleaz prin nclzire prezint efectul T>ndall,dispersia fasciculului de lumin-.

Caracter amfoter
Proteinele la fel ca )i aminoacizii sunt substane amfotere )i formeaz n soluii apoase amfioni8 2

n prezena H2O. 'n mediu acid proteinele se comport ca baze slabe ele primind protoni )i fomnd

cationi proteici8 cation al proteinei. ?eacia st la baza electroforezei proteinelor datorit incrcrii pozitive cationii migreaz spre catod fenomen numit cataforez proteina fiind n acest caz electropozitiv. 'n mediu bazic proteinele se comport ca acizii slabi ele cednd protoni se formeaz astfel anioni proteici care migreaz spre anod fenomenul fiind denumit anaforez proteina avnd ncrcare electronegativ.

anion al proteinei. 6atorit caracterului amfoter proteinele pot neutraliza cantiti mici de substan acid sau bazic avind n acest fel rol de soluie tampon prin acest lucru contribuind la meninerea ec&ilibrului acido:bazic al organismului. 'n general caracterul amfoter este imprimat de cele gruprile :9$2 )i :(;;$ libere care nu sunt implicate n legturile peptidice. 6ac n molecula proteinei exist mai muli aminoacizi dicarboxilici atunci molecula se va comporta ca un acid slab iar n cele n care predomin aminoacizii diaminai se comport ca baze slabe. (&iar dac ntr:o molecul exist un numr egal de grupri amino si carboxil deci teoretic molecula ar trebui sa fie neutr n realitate datorit gradului de ionizare mult mai mare a gruprii carboxil fa de gruparea amino molecula proteinei va avea un caracter slab acid n soluia ei ntlnindu:se amfiioni proteici anioni proteici )i protoni ,$@ -

Reacii de culoare
6atorit existenei anumitor aminoacizi n molecula proteinelor a legturilor peptidice formate n molecula proteinei dar )i gruprile funcionale libere sunt responsabile de reaciile de culoare. Denumirea reaciei Aantoproteic Reactivul folosit Culoarea rezultat Tipul de identificat aminoacid

acid azotic &idroxid de portocalie amoniu

aminoacizii aromatici ,formeaz nitroderivaiciclici cu &idroxil

0illon

precipitat ro)u aminoacizi azotat de mercur n crmiziu sau grupare acid azoticBazotit coloraie ro)ie ,tirosina-

<

#ulfurii de plumb

precipitat ne!ru aminoacizi cu sulf n +cetat sau azotat de de sulfur de molecul 8 cistein plumb n mediu alcalin plumb metionin cistin C naftol )i &ipoclorit de sodiu n mediu ro)ie carmin bazic acid acetic glacialBacid glioxilicBacid sulfuric violet fumans carbonat de sodiu )i acid diazobenzen ro)ie vi)inie sulfonic nin&idrin albastr arginin cu guanidinic grupare

#a4aguc&i

+dam4ieDicz: $op4ins

aminoacid cu nucleu indolic ,triptofan-

Paul>

&istidin )i tirosin caracteristic att pentru aminoacizi ct )i pentru proteine legatura peptidic )i se datoreaz formrii de combinaii complexe legtura peptidic aminoacizi cu grupre tiol ,:#$- liber

9in&idrinei

.iuretului .iuretului 9itroprusiatului de sodiu

soluie diluat de sulfat de cupru n albastr violet mediu bazic nic&el n mediu bazic portocalie

nitroprusiat de sodiu n ro)ie soluie amoniacal

Structura proteinelor
#tructura substanelor proteice este nc insuficient cunoscut datorit dinamicitii structurii proteinelor deoarece ele sunt n permanen supuse unor procese de sintez )i de degradare. Pentru evidenierea succesiunii aminoacizilor n structura proteinelor se folosesc 2 metode8 Degradarea Edman folose)te ca reactiv izotiocianatul de fenil care evideniaz selectiv aminoacidul. /rupa amino terminal se adiioneaz la izotiocianat trecnd printr:un derivat de tiouree. 6up ce se trateaz cu un acid slab aminoacidul marcat sub form de feniltio&idantoin se deta)eaz de restul polipeptidei. +ceasta cu noul su aminoacid terminal poate fi supus la alt ciclu de tratri pentru identificarea urmtoarei grupe amino. Degradarea Sanger are la baz tratarea polipetidei cu fluoro:2 E:dinitrobenzen avind loc atacul reactivului asupra gruprii amino a aminoacidului 9:terminal. 0etoda #anger are dezavanta1ul degradrii complete a polipeptidei.

Structura primar #tructura primar este dat de aminoacizii care intr n lantul proteic prin formarea legturilor pepetidice. 6atorit numrului relativ mic de aminoacizi care intr n structura proteinelor teoretic ar trebui s se formeze proteine cu masa molecular n 1ur de E200. 'ns n realitate masele moleculare ale proteinelor au valori de peste 70 000 ceea ce a dus la concluzia c cel puin o parte de aminoacizi se repet de mai multe ori n cadrul unei molecule. 5poteza c proteinele sunt formate din lanuri lineare de aminoacizi a fost fomulat pentru prima dat n anul 7F02 la a GE:a reuniune a #ocietii ;amenilor de #tiin din /ermania inut n ora)ul Harlsbad de ctre !ranz $ofmeister ,innd cont de reacia biuretului- )i 3mil !isc&er ,care aduce clarificri asupra sc&eletului proteic-. 5poteza c n molecula proteinelor exist legturi amidice fusese elaborat de c&imistul francez 3 /rimaux nc din anul 7II2. 'n ciuda evidenelor care demonstrau faptul c proteinele supuse aciunii proteolitice se scindeaz n oligopeptide ideea c lanul proteic este liniar au fost idei greu de Jdigerat J. 'n perioada respectiv numero)i savani ,Killiam +stbur> $ermann #taudinger- punnd la ndoial acest lucru prin argumentarea c legturile amidice nu sunt ndea1uns de puternice pentru a susine o molecul proteic lung. (u timpul au aprut diverse ipoteze8 Ipoteza coloidal care susinea ca proteinele sunt ansambluri moleculare coloidal formate din molecule mai mici:ipotez contrazis de msurarea ultracentrifugrii de ctre #vedberg care arat faptul c proteinele sunt molecule bine definite au greutate molecular iar prin electroforez +rne Tiselius demonstreaz c proteinele sunt molecule unice. 5poteza a 2:a numit ipoteza ciclol avansat de 6orot&> Krinc& are la baz < elemente8 o (iclol reaction n care gruparea carbonil )i gruparea amino a 2 peptide se incruci)eaz (L; @ $9 M (,;$-:9.,a)a numita legtur n cruce-;aceste legturi sunt de tip covalent similare cu legturile covalente de &idrogen propuse de Killiam +stbur> pentru a explica stabilitatea structurii proteice.

o %anurile beta vecine au la baz o serie de reacii de tip ciclol o #tructura proteinelor mici corespund a)a numitelor Jsolid de tip Platon fr ca s existe coluri libere. Structura secundar

" 5maginea alfa &elixurilor mio!lobinei a crei structur a fost determinat folosind cristalografia cu raze A

" 3licea alp&a se formeaz prin rotaia unui lan polipeptidic n 1urul propriei axe

#tructura secundar se refer la forma i la lungimea lanurilor polipeptidice proprieti induse de legturile de &idrogen. (ele mai ntlnite tipuri de structura secundar sunt alp&a &elixul )i lanurile beta. +lte &elix:uri cum ar fi &elixul <70 )i &elixul N sunt din punct de vedere energetic favorabile formrii legturilor de &idrogen dar sunt rareori observate n proteinele naturale exceptnd prile terminale ale &elixului C n timpul formrii sc&eletului proteic ,de obicei centrul &elixului-. +minoacizii au un comportament diferit vis:a:vis de posibilitatea formrii structurii secundare. Prolina )i glicina sunt cunoscui ca a)a numiii J &elix brea4ersJ,sprgtori de &elix- deoarece afecteaz configuraia sc&eletului proteic; ambii aminoacizi au abiliti conformaionale neobi)nuite )i de regul se gsesc n colurile sc&eletului proteic. +minoacizii care prefer s adopte conformaia &elixului proteic fac parte din a)a numita serie 0+%3H , codurile formate din 7 liter a aminoacizilor8 metionin alanin leucin acid glutamic )i lizina-; prin contrast aminoacizii aromatici ,triptofanul tirosina )i fenilalanina- dar )i aminoacizii cu legare prin carbonul beta ,izoleucina valina )i treonina- adopt configuraia O. #tructura secundar cunoa)te cteva ipoteze privind formarea ei8 Teoria polipeptidic formulat de ctre 3. $offmeister n 7F02 )i dezvoltat ulterior de ctre 3.!isc&er are la baz conceptul conform cruia moleculele proteice sunt formate din lanuri polipeptidice foarte lungi. Teoria are cteva dezavanta1e8 o nu explica diferenierea biologic a anumitor proteine o unele proteine sunt rezistente la aciunea enzimelor proteolitice ,de)i datorit lungimii lanului nu ar trebui-

Teoria plierii i rsucirii lanului polipeptidic a fost elaborat de ctre (ore> )i Pauling n 7FE< )i a fost confirmat prin spectrele de difracie cu raze X, microscopului electronic prin msurarea ung&iurilor de valen a distanelor interatomice au confirmat faptul c lanul polipeptidic se gse)te sub form pliat. o Structura n foaie pliant. Plierea catenei are loc prin formarea legturilor de &idrogen ntre gruparea carboxilic a unui aminoacid )i gruparea aminic a aminoacidului vecin. %anul polipetidic pliat se prezintz ca o panglic ndoit alternativ la dreapta )i la stnga plierea avnd loc n dreptul carbonilor metinici. 0ai multe lanuri pliate polipeptidice dau na)tere unei reele ntre aceste lanuri pliate putndu:se de asemenea forma legturi de &idrogen acestea fiind n numr mai mare cnd gruprile terminale a 2 lanuri sunt aran1ate diferit ,:9$2 )i (;;$ sau $;;(:)i :9$2-. (atenele polipeptidice pliate predomin n proteinele fibrilare )i mai puin n cele globulare. 6up valoarea perioadei de identitate se cunosc mai multe tipuri de proteine cu structur pliat. Prin perioada de identitate se nelege distana cea mai mic la care se repet aminoacizii identici din molecul o Structura elicoidal ipotez lansat de (ore> )i Pauling ipotez conform creia lanul polipeptidic se poate prezenta )i nf)urat sub form de spiral. 'n acest model fiecare spir conine de obicei 2G aminoacizi iar distana ntre spire este de 5 EE + 0. !iecare aminoacid mre)te spira cu 7 EG +0. 'n faa fiecrei grupri :(;: va apare la o distan de 2 I+ 0 o grupare 9$ de la al treilea aminoacid. 'ntre aceste grupri se stabilesc punile de &idrogen care asigur stabilitatea C &elix:ului. 'n acest model lanul polipeptidic se prezint sub forma unui surub cu pasul fie spre dreapta fie spre stnga. 'n cazul proteinelor naturale acestea datorit coninutului n %:aminoacizi pasul &elixului va fi spre dreapta catenele laterale ies n afara corpului propriu:zis putnd reaciona fie cu moleculele solventului fie cu alte catene polipeptidice. (analul format n interiorul &elixului este foarte ngust n el nu poate ptrunde molecula solventului. %egturile peptidice sunt plane iar 2 planuri consecutive :(;:9$: formeaz un ung&i de 7I00 rotirea lanului se face la carbonul C,metinic-. Structura teriar Prin intermediul cristalografiei cu raze A s:a dovedit faptul c macromoleculele proteice au o conformaie tridrimensional realizat de obicei prin intermediul cuplrii mai multor lanuri polipeptidice scurte ntre ele cuplare care duce la formarea fibrelor proteice;legturile intercatenare pot fi principale sau secundare8

%egturi de &idrogen sunt legturi coordinativ &eteropolare care se stabilesc cu u)urin ntre gruparea carbonil (L; ,electronegativ- )i gruparea 9$: ,electropozitiv- din 2 lanuri polipeptidice alturate sau n cazul formelor lactam:lactim ntre gruparea :;$ )i azotul iminic L9$

%egturile de &idrogen au lungimea cuprins ntre 2 G:< 7+ )i energia de <:GHcalBmol la peptide iar la ap 2:<HcalBmol

%egturile de &idrogen se pot stabili )i ntre catenele laterale care au grupri carboxil &idroxil amino sau tiolice. 6in punct de vedere energetic legtura de &idrogen nu este puternic dar datorit rspndirii relativ uniforme de:a lungul sc&eletului proteic ofer proteinei stabilitatea necesar. %egturi disulfidice

%egtura disulfidic este foarte puternic 50:7004calBmol )i are un rol foarte importantn stabilizarea ar&itecturii spaiale a moleculei proteice

%egtura este rezistent la &idroliz ns se poate desface iar prin reducere formeaz tioli,#$- iar prin oxidare formeaz acizi. 'n general legtura sulfidic se ntlne)te la proteinele transformate care au o rezisten mecanic mare. 'n afar de aceste legturi se mai pot stabili alte tipuri de legturi8 legturi ionice ,stabilite de obicei ntre gruprile aminice )i cele carboxilice ionizate- legturi de tip van der Kaals ,legturi electrostatice slabe care se stabilesc ntre radicalii &idrofobi- legturi fosfodiesterice ,ntre 2 resturi de serin )i acid fosforic- legturi eterice ,stabilite la nivelul aminoacizilor cu grupri &idroxilice. Structura cuaternar #tructura cuaternar se refer la modul cum se unesc subunitile proteice. 3nzimele care catalizeaz asamblarea acestor subuniti poart denumirea de &oloenzime n care o parte poart denumirea de subuniti reglatoare )i subuniti catalitice. Proteine care au structura cuaternar 8"emo!lobina D! polimeraza i canalele ionice, dar i nucleozomi i nanotu"uli care sunt complexe multiproteice. !ragmentele proteice pot suferi transformri n structura cuaternar transformri care se reflect fie n structurile individuale fie n reorientrile fiecrei subuniti proteice. 9umrul subunitilor din oligomeri ce sunt denumite prin adugarea sufix:ului :mer ,grecescul pentru subunitate- precedat de numele subunitii.

Pedere < 6 a "emo!lobinei cele E subuniti ro)u )i galben iar unitatea &emic verde.numele de &emoglobin vine este format din &em )i globin denumire ce denot faptul c &emoglobina are la baz proteine globulare cuplate cu o grupare &em