Sunteți pe pagina 1din 13

TB cauzat de ali membri ai complexului M.tuberculosis. M.bovis- bolile pe care le determin la om. Tuberculoza bovin este cauzat de M.

bovis, micobacterie similar cu M. tuberculosis i aparinnd acelueai complex M. tuberculosis. Gazdele principale ale M. bovis sunt bovinele (bos taurus), dar afecteaz mai multe alte mamifere, inclusiv omul. La om, aceasta este cea mai frecvent cauz de TB zoonotic, TB transmis de la animal la om. nainte de pasteurizarea laptelui, M. bovis era cauza important de TB uman, n special TB intestinal la copil. O dat cu pasteurizarea laptelui i a altor produse lactate, TB zoonotic a sczut ca inciden. Dup Rieder (1999) raportul ntre infecia tuberculoas la oameni i prevalena tuberculozei la efectivele de bovine este limitat. Cu toate acestea, numrul de cazuri de tuberculoz - boal la 1000 de reacii tuberculinice pozitive la om este n scdere, dei crete frecvena infectailor. Acest lucru indic faptul c riscul de mbolnavire la infectatii cu M. bovis este mult mai sczut dect al celui consecutiv infeciei cu M tuberculosis. Plecnd de la un model matematic, Magnus a evaluat diferenele de frecvene ale apariiei bolii consecutive unei infecii cu o su bovin i al unei sue umane. Riscul de boal consecutiv infeciei cu M.tuberculosis este de 7 pn la 12 ori mai mare dect al celui ce urmeaz infeciei cu M. bovis. Aceasta demonsreaz c tuberculoza bovin este un factor puternic de prevalen a infeciei, dar cu impact mult mai mic mic asupra morbiditii, comparativ cu cel al infeciei cu M. tuberculosis (ceea ce dovedete c R. Koch nu a greit ntru totul cnd a afirmat c M. bovis are mai puin importan pentru oameni fa de M. tuberculosis). n rile industrializate, cazurile de boal determinate de M. bovis sunt rare. Cu toate acestea diagnosticul de laborator poate fi dificil, un numr de cazuri putnd fi eronat atribuite complexului M. tuberculosis. Kleeberg a trecut n revist frecvena cazurilor provocate de M. bovis. n timpul primelor decenii ale celui de-al XX-lea secol au fost atribuite M bovis ntre 10 si 30% din cazurile de TB ganglionar i aproape 5% dintre cazurile de TB pulmonar. Din anul 1960 frecvena acestora a nceput s scad aproape de 1-2 % n rile unde acestea au fost nregistrate. Sunt foarte puine studii despre TB zoonotic. n ultimii 50 ani de cercetare privind TB zoonotic, aceasta ar fi fost influenat de tendinele tiintifice, grijile sociale cum ar fi HIV/SIDA, alimentele contaminate, precum i de disponibilitatea instrumentelor pentru identificarea bacililor bovini de TB. De exemplu, dezvoltarea tehnicii PCR , precum i a altor instrumente moleculare de identificare a M. bovis i diferenierea de ceilali membri ai complexului M. tuberculosis, au permis descoperirea de cazuri prin mai multe studii retrospective i au sugerat noi forme de transmitere. Literatura de specialitate, privind incidena TB zoonotic este marcat de numeroase descrieri clinice ale cazurilor de M. bovis la nivel regional sau nosocomial, existnd ns puine studii sistematizate de M. bovis diagnosticat la nivel naional (Anon 2003, Barrera 1987, Cousins 1999, Pavlik 1998). Exist 3 explicaii pricipale pentru lipsa unei estimri exacte i metodice a contribuiei M. bovis n TB la nivel mondial. n primul rand, din punct de vedere clinic sau radiologic nu exist nici o diferen ntre TB cauzat de M. tuberculosis sau de ctre M. bovis. n al 2- lea rnd, cele mai multe laboratoare folosesc mediul de cultur cu glicerol Lwenstein-Jensen,

care nu pomoveaz creterea M. bovis. n plus, cultivarea este costisitoare pentru mai multe ri cu venituri mici n comparaie cu mai ieftin i mai repede -colorare acid. n al 3- lea rnd, i poate cel mai imporant, tratamentul TB cauzate de M. tuberculosis sau M. bovis a fost acelai, prin urmare nu exist interes clinic pentru diferenierea agentului cauzal. Exist o corelaie direct ntre TB uman de origine bovin i a TB n efectivele de animale (Cosivi 1998). La nivel global, situaia TB bovine este dispersat. n multe ri dezvoltate TB bovin a fost eradicat cu 30-40 de ani n urm, prin campanii puternice bazate pe testarea la tuberculin i sacrificiul animalelor n abator. n aceste ri, TB uman produs de M. bovis reprezint aproximativ 1% din toate cazurile de TB, iar cazurile sporadice apar la persoane n vrst prin reactivarea focarelor vechi sau la imigrani din rile n care TB bovin nu a fost eradicat. Important, ri precum Anglia sau Noua Zeelanda, nu au putut elimina complet tuberculoza bovin sau, mai ru, exist o reapariie a bolii (Thoen 2006). Persistena M. bovis n slbticie, este frecvent indicat ca principala cauz de reapariie. Pe de alt parte, n multe ri cu venituri mici, TB bovin continu s fie o important problem de sntate animal. Pot fi observate diferite scenarii epidemiologice. Carnea i produsele din carne bovin sunt resurse importante n unele ri precum Argentina, Brazilia, Mexic, Venezuela, iar n cazul n care numrul de bovine este egal sau mai mare cu cel al populaiei umane, atunci riscul de TB bovin ar fi mai mare. Mai puin clar este situaia n rile n care industria laptelui este mai puin dezvoltat, iar creterea bovinelor este o afacere de familie pentru consumul de lapte sau de comercializare cu amnuntul, n care numrul animalelor este foarte redus, iar oamenii triesc n apropierea animalelor i consum lapte crud. n America Central i Africa, precum i n China, vacile sunt pstrate pentru producia de lapte, iar carnea este consumat de la alte specii, cum af fi ovinele i porcinele, mai puin sensibile la M. bovis. n cele din urm, n India, o mare parte din oameni nu consum carne de bovine, dar consum lapte i sunt n strns legtur cu animalele, crescnd astfel riscul. Unele ri cu venituri mici precum Cuba, Mongolia, Costa Rica sunt excepii remarcabile, pentru c au eredicat TB bovin, probabil pentru c producia de animale este relativ mic. Epidemiologia TB zoonotice, a fost examinat recent de Thoen i col. (Thoen 2006), care a revizuit publicaia din 1996. n Africa, exist mai multe rapoarte cu privire la TB zoonotic. Sunt multe studii de cercetare n Egipt, Nigeria, Madagascar, Zair, Tanzania. Ali autori au cutat M. bovis, n ri precum Ghana si Zambia, unde a fost descris incidena mare. Un alt studiu a demonstrat prezena M. bovis n Tanzania (Kazwala 1998). O revizuire excelent despre TB bovin a publicat Ayele (Ayele 2004). Genotiparea demonstreaz populaii diferite n funcie de regiunea geografic n studiu. Datorit consumului de lapte crud n regiunile n care SIDA este foarte rspndit, mai multe studii s-au concentrat asupra pacienilor cu limfadenit. Un studiu din Djibouti, a artat o prevalen sczut de M. bovis la aceti pacieni (Koeck 2002), n timp ce alii din Etiopia (Kidane 2002) i Tanzania (Mfinanga 2004) au demonstrat 17% i respectiv 10% prevalen . n Asia, exist foarte puine publicaii pe TB zoonotic, datorit faptului c politica de control a tuberculozei bovine a fost adoptat doar n cteva ri n mod evident, este nevoie de o cutare activ pentru M. bovis pe continentul asiatic, datorit incidenei mari a TB. n America Latin, majoritatea studiilor au fost publicate n Argentina, descriind o inciden variind de la 0.7% la 6.2% ntr o regiune cu lapte i cu prevalena national mult mai mic. n Brazilia i Mexic , exist doar cte o publicaie disponibil pentru fiecare ar. n Chile, ntr-o mic colectivitate uman, M. bovis nu a fost gsit (Manccila 2006), constatare ce merita un studiu mai extins n acea ar. Analiza genotipic a M.bovis de la oamenii din Argentina, a artat c genotipul predomina att la oameni ct i la bovine, ceea

ce indica cu trie c transmiterea se face de la vite. Mai mult, majoritatea pacienilor lucrau n agricultur sau industria crnii.( Zumaraga 1999). Teste de genotipare la aceste bovine au artat c micobacteriile izolate aparin unui spoligotype ce nu este predominent la bovine, sugernd prezena unei clone.(M. Romano- observaii nepublicate). Situaia TB zoonotice din America Latina a fost recent revizuit de ctre Ritacco i col. ( Ritacco 2006). n SUA, descrierea unui focar de M.bovis n San Diego, a prezentat interes special. Sursa de infecie a fost considerat ingestia de lapte crud de ctre copii imigrani (Dankner 1993, 2006). Nu au fost cazuri recente in Canada. Alte rapoarte descriu incidena mai mare a imigranilor din lumea a 3 a care locuiesc n rile industrializate (Cousins 1999, Jalava 2007). n Europa, n ultimele decenii, M.bovis la om au fost raportate sporadic (Thoen 2006). Prevalena cazurilor de TB provocat de M.bovis este de aproximativ 1.0% din toate cazurile de TB raportate n Regatul Unit. O situaie similar se gsete n Germania, unde este relevant M.caprae i n Spania. O lucrare recent descrie c n Lyon, Frana, nu a existat nici o nrudire genetic ntre micobacteriile izolate de la pacieni n ultimii 5 ani, indicnd c nu exist o transmitere activ (Mignard 2006). Un studiu din Marea Britanie a artat c nu exist nici o cretere a M. bovis la om, n ciuda unei incidene crescute a M.bovis ( Javala 2006). n Noua Zeelanda, M.bovis reprezint 2.7% din cazurile confirmate de TB uman. Multe dintre genotipuri au fost identice cu modelele de la animalele de cresctorie i slbatice (Baker 2006). n schimb, n Australia, n ulimii 6 ani, nu au existat publicaii de TB zoonotic. n ultimii 10 ani a fost descris rezistena la medicamente a M.bovis, cei mai muli dintre pacieni fiind HIV pozitiv.Aceast tulpin este rspndit n Europa i n Canada i a afectat 141 pacieni (S.Sampers- comunicare personal). Acest fapt subliniaz risc ridicat de rspndire a MDR M.bovis, n special n unele ri din Africa unde M.bovis determin boli la animale i coexist cu infecia HIV la oameni. La om, boala cauzat de M.bovis sau M.tuberculosis este imperceptibil. Cu toate acestea, n cazul n care fiziopatologia TB la om i bovine este comparabil, exist i unele diferene. La om, lobii superiori sunt cei mai afectai. La bovine, leziunile sunt localizate frecvent n regiunile dorsale pulmonare (Cassidy 2006). La bovine, leziunile sunt localizate frecvent n ganglionii limfatici i tractul respirator, nu i n parenchimul pulmonar. Aceast observaie poate fi legat de faptul c detectarea bovinelor infectate se face n primele etape ale progresiei bolii, nainte de prezentarea leziunii cavitare avansate. La nivel histologic, diferenele sunt legate de tipurile de celule care intervin n rspunsul imun i formarea unui granulom. De exemplu, coninutul de celule T este mai mare la bovine i aceste celule, precum i neutrofilele, particip la granulom i formarea leziunii (Cassidy 2001). n zilele noastre, ca urmare a controlului, leziunile lichefiate mari sunt mai puin frecvente la bovine n contrast cu constatrile fcute la speciile slbatice n cazul n care este posibil s se observe leziuni avansate (Cassidy 2006). Infecia este rar la oi i cai. Infecia la capre poate avea variaii extreme n funcie de locaia geografic. Transmiterea direct de M.bovis de la animalele salbatice este mult mai puin frecvent. Transmiterea de la om la cerb a fost raportat n Canada (Long 1999). Pisicile au fost raportate n mai multe ri ca surs de TB uman (Fernandez 1999, Underwood 2000). Prevalena M.bovis la bovine este mai mare, dar nu pare s fie asociat cu o inciden mai mare la om, poate sugera c oamenii sunt mai puin predispui la M. bovis dect la M. tuberculosis (de la Rua- Domenech 2006). Dup introducerea pasteurizrii laptelui, a existat un impact evident asupra ratei de mortalitate a

copiilor sub 5 ani (Thoen 2006). O analiz recent (de la Rua- Domenech 2006) a descris supravieuirea M.bovis n diferite produse alimentare ( bine n laptele de vac), bacilii viabili putnd fi gsii n iaurt i smntn, branza din lapte nepasteurizat pn la 14 zile de la preparare, iar n unt pn la 100 de zile. Consumul de lapte crud sau nepasteurizat este permis n multe ri europene. n rile cu venituri mici, consumul de lapte crud sau produse lactate este comun n zonele rurale. Detectarea M. bovis n laptele de la bovine este problematic deoarece M. bovis este prezent n cantiti mici. Exist contaminare a laptelui cu alte bacterii sau fungi concomitent cu M. bovis. Metodele de decontaminare ale probelor clinice cu ncrctur bacilar mare, cum ar fi sputa sau eantioanele de cultur, ucid cteva M. bovis care pot exista n laptele testat. Acest lucru a dus la o situatie ngrijoratoare n care nu sunt validate nici metodele pentru detectarea sa n lapte/ produse lactate. Principala problem este eecul n cultur ca standard de aur. Metodele PCR pentru depistarea membrilor M. tuberculosis n situaii clinice ce au folosit specimene de cal au fost dezvoltate in mijlocul anilor 90. Detectarea M.bovis n laptele contaminat artificial este redus, 10-1.000 uniti formatoare de colonii (ufc) (Zanini 1998, Antagnoli 2001). Sensibilitatea prin testul la tuberculin- pozitiv la vaci (variaz n diferite studii ntre 11-50% (Cornejo 1998, Romero 1999). Un studiu din Argentina, nu a gsit M. bovis n laptele bovin (Perez 2002). Aceast variaie este de ateptat, innd seama de faptul c M. bovis este excretat sporadic i nu toate animalele elimin bacili. Nu sunt publicate studii cu privire la detectarea M. bovis prin PCR din branz. n concluzie, PCR se dovedete redutabil n detectarea M. bovis n lapte, dar exist o nevoie urgent de a valida aceast tehnic la un nivel mai larg. . Vaccinul BCG- reacii adverse. Vaccinul BCG, este un vaccin viu atenuat derivat din M. bovis. BCG, cunoscut c provoac reacii locale n concordan cu infecia primar (adic ulcer mic, localizat i posibil adenopatie), reaciile adverse severe fiind rare: ulcere Deep, limfadenit (1%), abcese (2%), osteit (0.04%). Bolala diseminat este considerat rar, de ordinul 1/1000000 doze si legat direct de deficienele imu.ne.Vrsta i doza de vaccin sunt rspunztoare de complicaiile locale. BCG se administreaz de rutin la nou nscui n mai multe ri. Cu toate acestea, aceast practic este n curs de revizuire, datorit problemelor legate mai mult de acest vaccin dect de eficacitatea lui. O alt ngrijorare legat de adminstrarea BCG este efectul acestiua asupra TST. Deoarece administrarea BCG induce un test de piele pozitiv de dimensiuni variabile la o proporie mare dintre persoanele vaccinate, aceast reacie va afecta interpretarea rezultatelor TST n urmrirea contactului, astfel nct pune n pericol utilizarea unui instrument valoros n controlul transmiterii TB n comunitate. Locul vaccinului BCG n cadrul programelor de control al TB este reevaluat cu atenie din cauza riscului semnificativ de diseminare la pacienii imunocompromii. BCG trebuie administrat la nou nscuii din rile cu endemie crescut din Africa, Asia i America Latin pentru c vaccinul este eficient pentru prevenirea tuberculozei diseminate i a meningitei. Cu toate acestea trebuie efectuat o revizuire atent de identificare a riscurilor care stau la originea imunodeficienei. Acest lucru ar trebui s includ un istoric familial de imunodeficien i screening prenatal HIV. Pe de alt parte, n rile non endemice, administratrea BCG poate fi ntrerupt, dar dac vaccinul nu trebuie s mai fie administrat de

rutin nou nscuilor din comunitile endemice din aceste ri consecinele posibile trebuiesc anticipate. Ratele TB miliare i meningitei la aceti copii vor crete dac expunerea copiiilor mici va continua. n acelai timp dac programul de vaccinare de rutin a copilului este abandonat n comuniti, acest lucru trebuie s fie compensat prin mbuntirea detectrii TB i programe de tratament. O prevenie real a TB i un program de control necesit o evaluare real a bolii active, terapie eficient, inclusiv DOTS, detectarea i testarea contacilor cazurilor cazurilor infecioase, identificarea i atitudinea n cazul persoanelor infectate latent. n caz contrar, nu exist ndoial c aceti copii din aceste comuniti endemice vor forma grupuri cu risc crescut. Aceast strategie a avut oarecare succes, msurat la 82% eficacitate (Romanus 1992). Aceasta a fost nsoit de o rat mai mare a infeciilor micobacteriene atipice n populaia non BCG vaccinat.(Romanus 1995). Vaccinuri mai noi i mai eficiente pentru prevenirea tuberculozei vor fi disponibile n curnd. Vaccinuri alternative la BCG sunt la orizont i se sper c vor avea o eficacitate mai bun, vor fi mai standardizate i vor avea mai puine efecte secundare, n special la persoanele imunocompromise, inclusiv populaia infectat cu HIV la nivel mondial care are un risc ridicat al co infeciei cu TB. O alternativ a interveniei exist deja sub forma depistrii precoce i a tratamentului infeciei tuberculoase. Administrarea de Izoniazid este foarte eficient in reducerea riscului de boal i pentru protecie ce poate dura pn la 30 de ani. Tratamentul infeciei este n general bine tolerat de copii, iar compliana este mult mai bun dect la aduli. Avnd n vedere problemele de siguran descriese n acest raport, cea mai bun modalitate de aciune poate fi eliminarea vccinului BCG combinat cu mbuntiri n programele de TB n ri nonendemice. Aceste mbuntiri trebuie s includ depistri precoce ale cazului la aduli pentru a preveni transmitera i depistarea precoce i tratamentul infeciei la copii prin urmrirea contactului i screeningul n comunitile cu risc ridicat. Subtipuri ale M. Africanum M. Africanum, predominant izolat n Africa i n anumite zone ale continentului, este raspunzator direct de producerea unei proporii semnificative de TB pulmonar (Frothingham 1999, Haas 1997). Au fost fcute rapoarte privind izolri sporadice ale M. Africanum n Europa i SUA (Desmond 2004), inclusiv asupra unui focar multidrog rezistent ( MDR) de M. Africanum (Schilke 1999). Pe baza caracteristicilor biochimice, au fost descrise 2 subcategorii majore de M. Africanum, corespunztoare originii lor geografice din Africa de Vest (subtip 1) sau Africa de Est (subtip 2). Analizele numerice a caracteristicilor biochimice au artat c subtipul de M. Africanum 1 este mai nrudit cu M bovis, n timp ce M. africanum 2 este mai nrudit cu M tuberculosis (Niemann 2002, Sola 2002). M. Africanum subtipul 2 a fost clasificat n funcie de rezistena la hidrazida acidului tiofen 2 carboxilic (TCH). Acesta este principala cauz a TB umane in Campala, Uganda, (Africa de Est). Spoligotiparea nu conduce la o difereniere clar ntre M. Tuberculosis i M. Africanum, dar toate subtipurile 2 de M. Africanum izolate au segemntele 33-36 lips ceea ce le difereniaz de subtipul 1 de M. Africanum. Pe o dendrogram bazat pe restricia fragmentului de lungime polimorfic (RFLP) la IS6110, subtipurile 2 de M. Africanum au fost grupate n 2 tulpini de familii strns legate (Uganda 1 si 2) i n mod clar separate de M tuberculosis izolat. O caracteristic suplimentar a ambelor familii de subtipuri 2 de M. Africanum este absena segmentului 40 spoligotip. n plus toate subtipurile 2 de M. Africanum, familia Uganda 1 au lips segmentul 43 (Niemann 2002, Viano-Niero 2001). Lipsa segmentelor 40 si 43 nu sunt markeri de excludere

pentru subtipul 2 de M. Africanum, familia Uganda 1, dar ar putea reprezenta un criteriu suplimentar util pentru identificarea subtipului de M. Africanum n combinaie cu rezultatele testelor biochoimice (Brudey 2004, Mostowy 2004). Secvena gyr B de ADN permite diferenierea subtipului 1 de M Africanum de tulpini de M. bovis, M. caprae si M. microti, (M. Africanum subtipul 1 si M pinnipedii). Cu toate acestea M. Africanum subipul 1 si M. pinnipedii afieaz secvene identice ale ADN-gyr B n acelasi loc cu M. Africanum subtipul 2 si M. tuberculosis (Niemann 2000). Astfel, diferenierea subtipului 2 de M. Africanum de M. tuberculosis continu s se bazeze pe caracteristici fenotipice cum ar fi creterea pe un mediu de bromocresol violet. n studii recente, bazate pe regiuni de difereniere (RD), pentru a distinge M. Africanum au fost identificate 3 grupuri: subtipul 2 de M. Africanum izolat care i- a pierdut TbD1 si a pstrat RD9, RD7, RD 8 si RD 10 intacte. Unii au sugerat c aceste microorganisme ar trebui s fie incluse n speciile de M. tuberculosis. Un al 2 lea grup este format din subtipul 1 de M. Africanum care a pierdut RD 9, RD7, RD8 i RD 10 numit 1a. n cele din urma subtipul 1 de M. Africanum care a pierdut RD9 dar nu i RD7, RD8 si RD10 numit 1b care formeaz al 3 lea grup. Ambele ramuri ale subtipului 1 de M. Africanum au secvene distinctive ale gyrB. n plus Mostowy si colaboratorii (Mostowy 2004) au descris recent cteva locusuri noi ale RD n cadrul microorganismelor de M. Africanum. Printre acestea au fost RD 711 si RD 713 care lipsesc la subtipul 1b de M. Africanum i RD701 si RD 702 gsite lips ntr un studiu mai mare de tulpini ale subtipului 1a de M. Africanum. Boala produs de M microti M. microti este un membru al complexului M. tuberculosis i a fost izolat pentru prima dat in 1937 ca un germen producor de TB pulmonar la oarecele slbatic de cmp (microtus agrestis) (Wells 1937). S-a considerat a fi avirulent pentru oameni, bovine i animale de laborator i a fost propus, prin urmare, ca vaccin viu impotriva TB. Eficacitatea vaccinrii cu M. microti a fost evaluat n studii clinice n Regatul Unit (Hart 1977) i Republica Ceha (Sulla 1976), i ntr adevr tulpina a fost folosit ca un vaccin n Africa pentru mai mult de 15 ani (Fine 1995). n toate cazurile M. microti s- a dovedit a fi sigur i eficient n prevenirea bolilor artnd o eficacitate de protecie similar cu cel al BCG. Cu toate acestea M. microti a fost recent identificat ca agent cauzator al TB pulmonar la om, att la imunocompromii ct i la imunocompeteni (Van Soolingen 1998 si Horstkotte 2001). O mare parte dintre subiecii umani infectai cu M. microti par s nu aib deficite imune. Totui, se presupune c ar putea exista deficite nedetectate ale receptorilor de interleukin, cunoscute a predispune la infecii intracelulare, cum ar fi cele cu micobacterii. Transmiterea interuman a M.microti pare s fie rar. n singura situaie raportat, cazurile secundare au aprut n aceeai gospodrie infestat cu oareci. Analiza fenotipic a M. microti a indicat existena a dou variante diferite de M. microti : tipul oarece de cmp i tipul lama. Tipul oarece de cmp, izolat, de la oarecii de cmp, dihori, porci a hibridizat cu doar 2 din cele 43 de segmente la spoligotipare n timp ce tipul 2 lama spoligotiparea PCR a hibridizat cu secvena segmentului 9. Primele 4 M. microti izolate la oameni n Olanda au artat modele de spoligotipuri de tip oarece de cmp. Trei din cele 4 M. microti izolate au fost obinute de

la pacieni imunocompromii (2 au suferit transplant de rinichi, unul a fost infectat cu HIV). 2 dintre pacienii cu M. microti au avut istoric de contact cu oareci care s- a dovedit a fi sugestiv pentru transmiterea zoonotic (Van Soolingen 1998, Brodin 2002). Primul caz de infecie la om cu M. microti tipul lama a fost raportat n Germania, pacientul a fost infectat cu HIV i a dezvoltat TB pulmonar (Horstkotte 2001). Intervalul de timp necesar pentru cultivarea de tulpini de tip oarece de cmp (3-4 luni) este semnificativ mai mare dect cel necesar pentru creterea tulpinii de M. microti de tip lama. Pacientul cu infecie cu M. microti tipul lama a fost tratat cu succes cu Izoniazid, Rifampicin, Piraziamid, ceea ce indic faptul c tratamentul standard al TB este suficient pentru tratamentul pacienilor cu infecie cu M. microti. O posibil surs de infecie nu a putut fi identificat la acest pacient. Date recente au demonstrat c M. microti poate provoca TB pulmonar sever la pacienii imunocompeteni (Niemann 2000). M. microti a fost izolat n Germania la 2 pacieni imunocompeteni HIV negativi cu TB pulmonar. Potrivit modelelor de spoligotip, unul dintre microorganismele izolate a aparinut tipului lama i unul tipului oarece. Aceste constatri subliniaz relevana M. microti ca agent patogen att la pacienii imunocompromii ct i la pacienii imunocompeteni. Importana clinic i prevalena diferitelor tipuri de M. microti ar fi putut fi subestimat pn acum din cauza dificultilor de izolare primar i difereniere. Prin urmare alte studii cu aplicarea unor medote moleculare sunt necesare pentru a analiza mai bine epidemiologia M. microti. Diferenele genomice ntre M. microti i alte tulpini ale complexului M. tuberculosis dezvluie deleii noi specifice de M. microti. O constatare surprinztoare a fost c una dintre aceste deleii se suprapune RD1, un locus care este absent de la subtulpinile BCG, dar prezent la Mtuberculosis i M bovis i prin urmare presupus a fi implicat n atenuarea BCG. Deleia a fost gsit i la M. microti, constatndu-se a fi extins la gene suplimentare nvecinate i a fost numit RD1 i mic. Lucrrile ulterioare au artat c completarea M. microti cu locusul RD1 crete virulenta tulpinei recombinate pe modelul de oarece (Pym 2002) sugernd c pierderea din aceast regiune s fi contribuit la atenuarea M. microti. Deleia RD1 sau RD1mic elimin genele esxA/esxB care aparin familiei de inte antigenice secretoare precoce( ESAT-6) i s-au dovedit a fi antigene potente pentru celulele T. Familia ESAT 6 poate juca un rol in atenuarea M. microti. ntr o analiz genomic folosind microserii pentru a compara M. tuberculosis i M. microti, 13 deleii au fost identificate n 12 tuplini de M. microti, inclusiv la regiunile RD1 la RD10 care de asemenea lipsesc la BCG cu M. bovis. n plus, 4 noi regiuni terse au fost identificate : MiD1, RD1mic, MID2 si MiD3 (Frota2004). n ceea ce privete regiunile terse i virulena, acest studiu a artat c este dificil s se atribuie virulena la un model particular de deleie. Au fost folosite de asemenea microserii pentru a extinde analiza genomului M. microti (Garcia-Pelayo 2004). Astfel, au fost utilizate o M. microti tipul oarece de cmp, o M. microti tipul lama i un al treilea izolat cu un tip neobinuit. Folosind o rezoluie mbuntit a acestei tehnici o deleie nou a fost descris la M. microti care nltur gene care codific antigenele ESAT 6 i proteinele PE/PPE, demonstrndu-se c acest locus poate s fie expus deleiei. Aceast regiune numit MiD4, a fost tears la toate tulpinile de M. microti testate, sugernd c aceast regiune a fost tears la un strmo comun din linia M. microti. Curios, MiD4 a fost gsit de asemenea tears la M. pinnipedii. Cum M. pinnipedii esste strns legat de M. microti este posibil ca tergerea MiD4 s fi avut loc la un strmo comun pentru ambele tulpini (Cousins 2003, Brosch 2002). Utilizarea deleiilor ca marker de evoluie impune s nu fie produse la un locus hipervariabil, deoarece dac aceasta ar fi situaia, deleiile ar putea s apar independent n linii multiple.

Natura nalt repetitiv a ADN care se nvecineaz cu MiD4, sugereaz c ar putea fi expus deleiei, oferind prin urmare o explicaie alternativ de ce lipsete acest locus att la M. microti ct i la M pinnipedii. Oricum, analiza secvenei jonctiunii M pinnipedii a artat c pierderea MiD4 a fost un eveniment unic care a avut loc la un strmo al ambelor tulpini. Genele PE i PPE apar de asemenea suprareprezentate n deleii de la M. microti, RD1mic, RD8, MiD3, MiD4 cu nlocuirea genelor pentru proteinele 4PE si 5PPE. Genele care multiplic o mulime de proteine PE sau PPE au artat un grad nalt de variaie printre membrii complexului M. tuberculosis i ntr adevr printre tulpini din aceeai specie. Cole si col. au fost primii care au intuit c proteinele PE/PPE ar putea fi de importan imunologic ca o surs a variaiei antigenice (Cole 1998). Mai multe lucrri au artat c proteinele PE-PGRS sunt exprimate la suprafa i sunt imunogenice (Brennan 2001, Banu 2002). Folosind o abordare de mutagenez, semnat Comacho si col. au artat c inactivarea PPE 46 a atenuat M. tuberculosis pentru modelul murin (Camacho 1999). Interesant inactivarea unei gene MiD4 produce atenuarea M. tuberculosis i aduce dovezi suplimentare care s sugereze c pierderea Mid4 ar putea atenua M. microti. Oricum, infecia cu M.microti rmne o potenial ameninare pentru un grup de persoane cu imunitate compromis, incluznd-i pe aceia cu defecte genetice necunoscute, n special cele care predispun la infecii cu micobacterii. M. caprae i M. pinnipedii Complexul tradiional al M. tuberculosis este format din 4 membri : M tuberculosis, M. bovis, M africanum i M microti. Recent au fost descrise 3 specii noi : 1 M. canetti : mai puin virulent dect clasicele M tuberculosis H37Rv. 2 M. caprae : o specie care apare n primul rnd la capra spaniol i de asemenea se gsete la om 3 M. pinnipedii : responsabil de TB la gazde marine. M. caprae Numele propus pentru M. caprae sunt M. tuberculosis subspecia caprae (Aranaz 1999) si M. bovis si subspecia caprae (Niemann 2002). Acest specie a fost iniial descris ca prefernd capre sau bovine ca i gazde (Gutirerrez 1995, Aranaz 1996) i a fost gsit n Spania, Austria, Franta, Germania, Ungaria, Italia, Slovenia si Cehia. n plus, M. caprae au fost izolate la oameni i la animale slbatice cum ar fi specii de cerb ( Prodinger 2002) sau mistre (Erler 2004, Machackova 2004). n regiunile Europei centrale cum M. caprae este cauza major de TB la bovine este, de asemenea , agentul predominant al TB la om (Kubica 2003, Prodinger 2002). Diferena fenotipic major dintre micobacteriile caprine izolate i M. bovis este sensibilitatea la Pirazinamid (PZM), care a fost un criteriu major pentru separarea M. bovis de ali membri ai complexului M. tuberculosis. Creterea M. bovis nu este inhibat de PZM, n timp ce alte specii ale complexului M. tuberculosis sunt sensibile la acest medicament antimicobacterian. Secvenierea genei pirazinamidazei (pncA) a artat o mutaie ntr- un singur punct la nucleotidul 169, o substituire a G cu C, care pare a fi unic la M.bovis (Scorpio 1996). Secvena genei pncA la M. caprae evideniaz c aceasta are gena pncA de tip slbatic i poate fi folosit pentru a diferenia M. caprae de M. bovis. Cu toate acestea M. caprae este similar cu M. bovis n alegerea piruvatului pentru cretere, ceea ce difereniaz

ambele specii de ali membri ai complexului M. tuberculosis. n plus, este posibil s se diferenieze M. caprae de toi ceilali membri ai complexului M. tuberculosis prin secvenierea gyr B sau amplificare urmat de analiza restriciei (Chimara 2004). M. caprae are de asemenea modele specifice de amprentare obinute prin RFPL is6110 precum i un model spoligotip care este foarte diferit de cele obinute pentru ali membri ai complexului. Prin spoligotipare, M. caprae formeaz un grup omogen uor de recunoscut prin absena segmentelor 1,3-16,30-33 si 39-43. Lipsa segmentelor 39-43 a fost de asemenea descris la M. bovis , M. microti i M. pinnipedii. Cu toate acestea modelele de amprentare obinute cu IS6110 i spoligotipare separ M.caprae de ceilali membri ai complexului (Liebana 1996, Aranaz 1998). Aa cum s-a raportat n descrierea iniial a M. tuberculosis subspecia caprae, izolatele care afieaz modelul caprin de spoligotipare au fost gsite i la om iar aceste cazuri clinice au fost legate de capra agricol (Gutierez 1997). M. bovis izolat la vite i oameni, descris de Niemann i col. (Niemann 2000 a, Niemann 2000 b) sunt susceptibile de a fi izolate caprine deoarece dein caracteristici comune cum ar fi sensibilitatea la PZM, substituia descris n secvena genei gyrB i modelul definit de spoligotipare, cu absen tipic a segmentelor. Mai multe dovezi pentru independena micobacteriei caprine izolat de la M. bovis deriv de la 2 studii recente care au examinat evoluia complexului de M. tuberculosis (Brosch 2002, Mostowy 2002). n Germania M. bovis subspecia caprae a fost descris ca agentul cauzator la aproape o treime (31%) din cazurile umane de TB asociate M. bovis. Acest procent a fost surprinztor de mare, mai ales n comparaie cu prevalena tulpinii M. bovis subspecia caprae la oameni sau animale in alte ri: un studiu asupra TB produs de M. bovis n Frana nu au evideniat tulpini de M. bovis subspecia caprae mai mult de 1000 izolate la animale (Haddad 2000). Tulpini de M. bovis subspecia caprae nu au fost gsite n Regatul Unit (Sales 2001, Roring 1998), Irlanda (Costello 1999) , America de Sud (Zumarraga 1999) i Camerun. n afara Germaniei un numr mic de M. bovis subspecia caprae au fost identificate doar n Spania (3.6% din M. bovis izolate la om i 12 % din tulpinile izolate de la capre i oi) (Gutierez 1997) i n Austria (12 cazuri la om si animale n 7 ani). S-ar putea presupune c M. bovis subspecia caprae reprezint un genotip nou aprut n Germania i se extinde n alte ri europene. Cu toate acestea, deoarece vrsta medie global pentru pacienii din Germania infectai cu M caprae a fost de 66.1 ani, cazurile se datoreaz mai probabil reactivrii dect achiziionrii unei infecii recente. Prin urmare este probabil ca pacienii s fi fost infectai nainte ca msuri eficiente de control pentru TB bovin s fi fost intoduse n anii 50. n consecin, M. caprae trebuie s fi fost prezent n Germania la acel moment i nu este doar n curs de apariie. nainte de introducerea de instrumente moleculare pentru identificarea i diferenierea tulpinilor de M. bovis, izolatele de M. caprae ar fi fost clasificate incorect datorit sensibilitii lor la PZM, ducnd la rate false sczute de notificare. Cu toate acestea, susceptibilitatea la PZM a fost de asemenea observat la M. bovis subspecia bovis, tulpini care au fost obinute de la 2 pacieni i o vac. Aceste tulpini nu au artat nici modele particulare de spoligotiapare i nici nu au fost relatate analize asemntoare. Din punct de vedere filogentetic aceste tulpini pot reprezenta tulpini ancestrale de M. bovis, din care ambele specii ar putea diverge. Singura diferen evident ntre cele 2 grupuri de pacieni a fost dezvluit de analiza spaial a originii pacienilor din interiorul Germaniei: proporia regional de M. bovis subspecia caprae a artat o diferen mare ntre sudul rii (pn la mai mult de 80%) i partea de nord (mai puin de 10%). Aceasta schimbare observat geografic n proporii regionale a ambelor specii ar putea s

rezulte dintr- o schimbare similar n populaia animal aa cum este indicat de descoperirile la animalele infectate cu M. bovis subspecia caprae care au provenit n special din Germania de sud. Acest lucru este susinut mai mult de prezena tulpinilor de M. Bovis subspecia caprae la animalele salbatice i la animalele din cirezi n vestul Austriei, intr o regiune situat la frontiera de sud german (Prodinger 2002). M. pinnipedii M pinnipedii a fost izolat prima dat la leii de mare slbatici i cei inuti n captivitate i de la focile cu blan din Noua Zeelanda si Australia (Cousins 1993, Cousins 2002). Organisme similare au fost ulterior recuperate de la aceleai specii de mamifere n America de Sud (Bernadelli 1996, Romano 1995, Bastida 1999), precum i de la un tapir brazilian (Cousins 2003). Recent, capacitatea lor de a provoca boala la cobai i la iepuri a fost demonstrat prin inoculri experimentale. Acest fapt mpreun cu descoperirea unui izolat uman provenit de la un dresor de foc care a lucrat ntr o colonie afectat n Australia (Thomson 1993) i un izolat de bovin n Noua Zeeland (Cousins 2003) sugereaz c M. pinnipedii poate provoca infecii la o gam larg de gazde. Multe dintre tulpinile izolate n Australia, Uruguai i Argentina au fost bine caracterizate (Romano 1995, Romano 1996, Cousins 1993, Bernadelli 1996, Cousins 1996, Alito 1999, Zumarraga 1999b, Castro Ramos 1998). Aceste informaii mpreun cu teste preliminare pe izolate de foc din Marea Britanie i Noua Zeeland sugereaz c acel bacil de la foc izolat de Pinniped de pe toate continentele ar putea fi un membru unic al complexului M. tuberculosis. Rezultatul testelor biochimice confirm n mod clar c izolatele de la foc aparin complexului M tuberculosis. Reaciile negative de reducere a nitratului i testele de acumulare a niacinei au fost compatibile cu identificarea M. bovis, fapt ce a condus la identificarea lor iniial ca atare n Australia (Forshaw 1991), Argentina (Bernadelli 1996) si Marea Britanie. Cele mai multe izolate de la foc au produs cantiti variabile de niacin, la fel ca unele izolate de M. africanum. Cele mai multe izolate de foc au crescut preferenial pe medii care conin piruvat de sodiu, dei unele au crscut de asemenea pe mediul Lowenstein Jensen care conine glicerol. n contrast cu M. bovis izolatele de la foc au fost sensibile la PZM, izolatele inoculate la iepuri au cauzat moartea dup 6 sptmni confirmnd c izolatele au fost n totalitate virulente pentru ambele animale de laborator. Spoligotipurile de micobacterii izolate de la foci (Romano1995), au artat formarea unui grup care este clar diferit de cele ale tuturor celorlali membri ai complexului M. tuberculosis. Toate izolatele de foc aveau lipsa segmentele 1-3, 8-12, 39-43. Absena acestor segmente din urm este o caracteristic comun cu izolatele de M bovis. Micobacteria izolat de la foci a fost de asemenea testat pentru polimorfisme ale genelor oxyR si pncA. n mod similar la M. tuberculosis, M microti, M africanum i M pinnipedi s- a descoperit c au CAC(His) la codonul 57 al genei pncA i gena oxyR prezint G la numarul 258. n plus, aceste micobacterii au avut aceeai secven de polimorfism a genei gyrA i kat G ca i M. bovis i unele M. tuberculosis. Antigenul MPB70 care este n totdeauna detectat la M. bovis a fost detectat la micobacteriile de la foci. n contrast, genomul lor coninea fragmente P-40 prezente n regiunea RD5 descris de Brosch i colaboratorii (Brosch 2002). Regiunea RD5 este prezent la toate izolatele de foc, dar nu este prezent la M. bovis i BCG. Pentru a extinde repertoriul acestor markeri de deleie s-a realizat o analiz a microseriilor genomului M. pinnipedii recent definite (Biggi 2005). n acest studiu s-a evaluat extinderea

variabilitii genomului M. pinnipedii bazat pe compararea microseriilor. Aceasta este o metod eficace, care permite genomului s fie rapid cutat pentru eventualele deleii. Utiliznd microserii de ADN care au inclus att secvene de tulpini M. tuberculosis (H37Rv i CDC1551) ct i M. bovis AF2221/97 s-au identificat 2 regiuni exclusiv absente de la M. pinnipedii. Deleia PID 1 a fost identificat n acest studiu pentru prima dat ca fiind absent de la toate izolatele M. pinnipedii. Secvenele de codificare de la punctele de intersecie sunt trunchiate indicnd c este o deleie. Regiunile sale limitrofe genomic nu conin secvene repetitive sugernd c deleia a fost rezultatul unui eveniment ireversibil ntr-o tulpin precursoare comun. Aceast deleie inlocuiete Rv3531c i pri din Rv3530c, codificnd o protein ipotetic i posibil o oxidoreductaz implicat n metabolismul celular. Semnificaia acestor funcii care lipsesc la bacilul de foc asupra tropismului de gazd i a fenotipului este necunoscut n prezent. A doua deleie specific PID a fost recent definit ca RD2 la foc,deoarece se suprapune cu regiunea RD2 de 10,7kbp (Marmiesse 2004). Curios o regiune Rv 1978 cuprinznd i o parte din RV 1979 de asemenea lipsesc la unele izolate de M. microti. Totui aceast deleie numit RD2mic are o hart a locusului uor diferit de RD2 de la foc. Aceste informaii mpreun cu faptul c regiune a RD2 se elimin de la unele subtulpini BCG sugereaz c aceste deleii au avut loc ca evenimente independente ntr o regiune instabil. Aceste deleii specifice de tulpin ar putea servi ca markeri pentru studii filogenetice i evolutive sau ca o semnatur pentru identificare rapid i diagnostic. Astfel, aceste consatatri mpreun cu stiudii anterioare susin poziia unic taxonomic a M. pinnipedii n cadrul complexului M. tuberculosis. Identificarea speciilor n cadrul complexului M. tuberculosis. Gradul ridicat de conservare a secvenei ntre membrii complexului M. tuberculosis face diferenierea speciilor n laboratoarele clinice de micobacteriologie, o operaie dificil care este nc bazat pe caracteristicile fenotipice cum ar fi preferina pentru oxigen, acumularea niacinei, activitatea nitrat reductazei, morfologia coloniei i rezistena la doi compusi TCH si PZM. M. tuberculosis este cauza cea mai frecvent a TB umane, dar unele cazuri sunt produse de M. bovis. Este necesar s se fac diferena ntre M. bovis si M. tuberculosis cu scopul de a cunoate diferena ntre prevalena M bovis i M. tuberculosis i cu scopul de a cunoate prevalena i distribuia TB umane de M bovis. Aceasta ar putea contribui la o nelegere mai bun asupra factorilor de risc asociai cu transmiterea M. bovis la populaia uman. M. bovis difer de M. tuberculosis prin faptul c are o rat de cretere sczut pe medii de ou suplimentate cu glicerol, dar o rat de cretere mai rapid pe medii de ou suplimentate cu piruvat. Izolatele de M. bovis sunt rezistente la PZM n timp ce tulpini de M. tuberculosis sunt n general considerate PZM sensibile. Mai multe tehnici moleculare au fost concepute pentru a diferenia complexul de M. tuberculosis incluznd metode pentru a detecta mutaii ale genelor pncA si oxyR (Scorpio 1996), mtp40-PCR (Del Portillo 1991, Liebana 1996) i amplificarea PCR a regiunii de difereniere(RD) (Parsons 2002, Huard 2003), printre altele. Unele tehnici sunt utile pentru diferenierea M tuberculosis de M bovis cum ar fi pncA si oxyR. Un anumit element specific al ADN micobacterian al complexulu M. tuberculosis a fost descris de Del Portillo (1991) fragmentul mpt40 al M. tuberculosis. Proteina mpt40 a fost iniial descris ca fiind produs numai de M tuberculosis. Acum este bine tiut faptul c aceast protein este codificat de gena plcA, coninut n RD5. Aceast regiune este prezent n cele mai multe dar nu n toate izolatele de M tuberculosis, M africanum, M pinnipedii si M microti i este constant absent

de la M bovis i BCG de M. bovis. Avnd n vedere polimorfismul ridicat al acestei regiuni, utilizarea secvenei mpt40 ca marker genetic pentru M tuberculosis, stricto sensu este foarte limitat (Viana-Niero 2004). Spoligotiparea poate fi folosit de asemenea pentru diferenierea membrilor complexului M tuberculosis (Kamerbeek 1997). De exemplu la spoligotiparea tulpinilor tipice de M tuberculosis modern lipsesc secvenele de segmente 33-36 n regiunile de repetiie direct (RD). n mod asemntor tulpini de la M bovis i de la M caprae sunt cunoscute pentru lipsa segmentelor 3,9,16. Toate tulpinile de M. bovis, M. caprae i M microti sunt cunoscute pentru lipsa segmentelor 39-43 la spoligotiparea lor (Zumarraga 1999b). De asemenea trebuie remarcat faptul c la toate organismele complexului M. tuberculosis de la M. africanum tipul 1 la M bovis ca urmare a evoluiei lipsesc segmentele 9 si 39. Prin urmare segmentele 9 si 39 sunt markeri poteniali pentru diferenierea M. tuberculosis de speciile rmase ale complexului M. tuberculosis prin spoligotipare. Dei absena lor a fost observat la izolate ale M. africanum subtipul 1 ele sunt prezente la M. africanum subtipul 2. Analiza RD este ultilizat n prezent pentru diferenierea ntre specii ale complexului M. tubrculosis. TbD1 este o deleie gsit numai la M tuberculosis, toate celelate tulpini ale complexului inclusiv unele M. tuberculosis avnd TbD1. Bazat pe prezena sau absena acestei deleii 1 specific M. tuberculosis, tulpinile pot fi mprite n tulpini ancestrale i moderne; acestea din urm cuprinznd reprezentani ai unor epidemii majore precum acelea de la Beijing, Harlem i altele (Brosch 2002). TbD1 este ntotdeauna absent la tulpinile de M. africanum de tip 2. Anterior, pe baza secvenelor polimorfice ale Kat G codonului 463 si a gyrA codonul 95, Sreevatsan si col. (1996,1997) a definit 3 grupe de bacili tuberculoi : grupa 1 cu katG463CTG (Leu), gyrA95ACC(Thr), grupa 2 cu katG463CGG(Arg), gyrA95ACC(thr) i grupa 3 cu katG463CGG(Arg), gyrA95AGC(Ser). Organismele de M. tuberculosis care aparin grupului 1 au secvenele katG si gyrA spre deosebire de cele ale M. microti, M. africanum si M. bovis. Tulpinile de M. tuberculosis care conin regiunea TbD1 aparin grupei 1 i sunt cosiderate tulpini ancestrale, dei majoritatea tulpinilor care reprezint M. tuberculosis cu deleia TbD1 aparin grupelor 2 si 3. Aceast constatare sugereaz c n timpul evoluiei M. tuberculosis mutaia katG la codonul 463CTG(Leu) a aprut la o tulpin progenitoare care a avut regiunea TbD1 tears. Aceast propunere este susinut de constatarea c tulpinile care aparin grupului 1 pot sau nu pot s aib deleia regiunii TbD1, n timp ce la tulpinile din grupele 2 si 3 lipseste TbD1. Mai mult ,o pierdere ulterioar a ADN reflectat prin deleia DR9 a fost identificat pe o filiaie evolutiv care a provenit de la o tulpin progenitoare de M tuberculosis, fiind reprezentat de M. africanum, M. microti, M .caprae, M. pinnipedii i M. bovis (Brosch 2002). Astfel, RD9 pemite diferenierea ntre M. tuberculosis i alte specii. Deleia RD 7 a fost observat la M. bovis, M. microti, unele M. africanum i M. pinnipedii. ntr- un raport precedent a fost descris un protocol PCR pentru diferenierea M. tuberculosis de M. bovis (Zumarraga 1999c). Aceast strategie diferenial se bazeaz pe amplificarea regiunii desemnat ca RD7. Deleia nlocuiete cea mai mare parte a operonului MCE-3, unul din cei 4 operoni implicai n ptrunderea n celul i prin urmare poate contribui la diferenierea virulenei sau specificitii de gazd a speciilor complexului M. tuberculosis. Fiinele umane pot fi infectate cu M. caprae sau M bovis provenite de la animale infectate iar infecia cu ambele specii rmne o problem serioas de sntate public n unele ri. Diferena dintre aceste specii este important din motive epidemiologice. M. pinnipedii, M. microti, M. bovis i M. caprae arat un singur polimorfism de nucleotide n regiunea TbD1 la

codonul 551 (AAG) a genei mmp L6, relativ la M. canettii, M. africanum i tulpinile de M. tuberculosis care sunt caracterizate prin codonul AAC. Acest polimorfism care este asociat cu diminuarea de locusuri RD12 si RD13 difereniaz grupul format de M bovis si M caprae de alte specii ale complexului M tuberculosis. Pe de alt parte, acum este cunoscut faptul c M. caprae poate fi difereniat genetic de M bovis pe baza unei amplificri pozitive a locusului RD4, precum si o analiz SNP a gyrB nucleotida 1311-1410 i pncA 169. Tulpinile din BCG posed un polomorfism specific deleia RD1. Aceast deleie permite diferenierea ntre BCG i alte specii ale complexului M. tuberculosis, M. pinnipedii si M. microti, microorganisme foarte strns legate. Deleiile tulpini-specifice pot servi ca markeri pentru studii filogenetice i evolutive i de asemenea ca o semntur pentru identificarea rapid i diagnostic.