Markerii RAPD (Random amplified polymorphic DNA - polimorfisme de ADN amplificate aleator) sunt rezultai prin amplificarea PCR

a unor segmente necunoscute de ADN genomic cu ajutorul unei amorse decamere aleatoare (Williams i colab., 1990), a fost utilizat intens n mai multe scopuri, de exemplu: identificarea genelor (Aufauvre i colab., 1992; Ballinger-Crabtree, 1992), variabilitatea genetic a populailor (Lehmann, 1992; Chatterjee i colab., 2004;), hri cromozomale i relaii filogenetice (Kazan i colab., 1993). Produii de amplificare se separ prin electroforez n gel de agaroz i se evideniaz n lumin UV dup o colorare prealabil cu un colorant specific, imaginea obinut numindu-se fingerprint. Markerii RAPD se comport ca markeri dominani cnd sunt urmrii n descenden. Diversitatea genetic i relaiile de nrudire dintre indivizi se evalueaz pe baza prezenei sau absenei benzilor, rezultnd o amprent genetic specific. Avantajele analizei RAPD: relevarea unui numr mare de polimorfisme, costuri sczute, utilizarea metodelor de vizualizare prin fluorescente n local celor bazate pe radioactivitate; analizarea unui numr mare de probe ntr-o zi; un implic un grad foarte ridicat de pregtire al personalului din laborator; Dezavantaje: comportamentul dominant al markerilor RAPD