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molculas segn la movilidad de estas en un campo elctrico. La separacin puede realizarse sobre la superficie hidratada de un soporte slido (p. ej., electroforesis en papel de acetato de celulosa), o bien a travs de una matriz porosa (electroforesis en gel), o bien en disolucin (electroforesis libre). Dependiendo de la tcnica que se use, la separacin obedece en distinta medida a la carga elctrica de las molculas y a su masa.
Cromatografa de intercambio inico: En la este tipo de cromatografa se emplea una resina de intercambio inico, la cual puede estar cargada positivamente (intercambiadora de aniones) o negativamente (intercambiadora de cationes) al agregarse la muestra que se desea purificar las partculas cargadas contrariamente a la resina se unen a ella y son retenidas, las partculas cargadas igualmente a la resina son rechazadas y eluyen. La elucin de las partculas segn su carga se consigue modificando el pH del solvente hasta igualarlo a su punto isoelctrico.
Cromatografa de afinidad: Basado en la interaccin especifica de dos molculas (como la de una hormona con su receptor, o de un anticuerpo con un antgeno), se aade la mezcla de protenas a la columnas que contiene un polmero unido a un ligando especifico para la protena de inters, las otras protenas se lavan atreves de la columnas, y al agregar la solucin de ligando eluyen las protenas de inters. Es un mtodo altamente efectivo para purificar muestras de protenas.
HPLC o LPLC (Cromatografa lquida de alta eficacia): Es una tcnica utilizada para separar los componentes de una mezcla basndose en diferentes tipos de interacciones qumicas entre las sustancias analizadas y la columna cromatogrfica.