UNIVERSITATEA DE VEST DIN TIMISOARA FACULTATEA DE CHIMIE BIOLOGIE GEOGRAFIE DPARTAMENTUL DE CHIMIE BIOLOGIE SPECIALIZAREA: T.A.C.A.I.A.C.F.

PROTEINELE

Masterand: Vldulescu (Axinte) Iuliana Lcramioara

Timisoara, 2013

CUPRINS
1. Definiie. 2. Compoziia proteinelor....... 3. Structurile proteinelor..... 3.1. Structura primar.. 3.2. Structura secundar.. 3.2.1. Structura de elice alfa 3.2.2. Structura . 3.3. Structura teriar... 3.4. Structura cuaternar. 4. Clasificarea proteinelor 4.1. Clasificarea proteinelor dup solubilitate. 4.2. Clasificarea proteinelor dup compoziie. 5. Proprietile generale ale proteinelor... 5.1. Proprietile fizice .... 5.2. Proprietile chimice .... 6. Rolul proteinelor.. 7. Studii recente... 8. Concluzii.. 3 3 3 4 5 6 8 9 10 12 12 14 14 14 15 16 16 17

1. Definiie
Proteinele sunt macromolecule eseniale tutror organismelor, cu un nalt grad de organizare structural i cu rol fundamental n structura i funciile celulei. Sunt alctuite dintrun numr mare de aminoacizi (legai prin legturi peptidice), a cror succesiune este determinat genetic. Imensa diversitate structural i funcional a proteinelor este determinat att de numrul, tipul i secvena aminoacizilor componeni, ct i de organizarea spaial, configuraional a moleculei [5].

2. Compoziia proteinelor
Proteinele sunt compui organici care conin toate elementele organogene: C, H, O, N, S, P, halogeni, unele metale. Compoziia procentual variaz n limite restranse: C = 51 56% H = 6,5 7,5% O = 20 23% N = 15,5 18,5% S = 0,5 2% P = 0,1 1% Prin hidroliz total, acid, bazic sau enzematic, proteinele sunt transformate ntr-un amestec de -aminoacizi (obinuit se foloeste hidroliza acid prin fierberea proteinei cu un amestec de acid formic i acid clorhidric). n produsele de hidroliz total ale proteinelor s-au identificat circa 20 de - aminoacizi prezeni n mod constant; mai rar sau chiar foarte rar din hidrolizatele anumitor proteine s-au mai identificat nc 30 40 de amino acizi de diferite tipuri. Din mediile de hidroliz aminoacizii sunt separai indiviual, cel mai bine prin metoda cromatografic [8]. Cercetarea diverselor proteine a demonstrat c raspandirea diferiilor -aminoacizi este foarte variat i c nu exist protein alcatuit numai dintr-un singur aminoacid. n fapt, n compoziia proteinelor animale sau vegetale, se gsesc toi cei circa 20 de -aminoacizi, dar n cele mai variate proporii. Doar 8 dintre cei 20 de -aminoacizi cunoscui sunt considerai eseniali, ntrucat nu pot fi sintetizai n organismul omului i trebuie adui zilnic cu alimentele. Acestia sunt: valina, lizina, leucina, izoleucina, metionina, triptofanul, treonina, fenilalanina [5] .

3. Structurile proteinelor
Complexitatea proteinelor a facut necesar introducerea mai multor trepte de organizare strucutral denumite astfel: structur primar, structur secundar, structur teriar i structur cuaternar.

3.1. Structura primar

Structura primar este structura de baz a fiecrei proteine i reprezint numrul, tipul, proporia i ordinea aminoacizilor n catena polipeptidic. Ea se caracterizeaz prin: existena legturilor peptidice (-CO-NH-) ntre diversi aminoacizi; existena unei succesiuni (secvene) bine definite a aminoacizilor n catenele polipetidice, controlat genetic de informaia cuprins n ADN; determin configuraia de ansamblu specific fiecrei proteine [4].

Fig. 1- Structura primar

Prima protein a crei structur primar a fost stabilit este insulina, protein mic cu 5 1 resturi aminoacidice (Fig. 2). Dup aceasta a urmat ribonucleaza (Fig. 3) cu 124 aminoacizi. Aszi, numrul proteinelor a cror structur primar este cunoscut depete cteva zeci de mii [1].

Fig. 2. Structura primar a insulinei

Fig. 3. Structura primar a rubonucleozei

3.2. Structura secundar

Structura secundar a unei proteine este determinat de aranjarea n spaiu a catenei polipeptidice i de legturile care se stabilesc ntre catene. Structurile secundare rezultate din interaciunile grupelor C = O i NH din gruprile peptidice, sunt structuri ordonate, periodice, elementul structural care le genereaz prezint nsui regularitate. Dei legturile de hidrogen sunt relativ slabe, structura secundar este totui stabil datorit numrului mare de astfel de legturi de hidrogen i de repartizarea lor uniform de-a lungul catenelor polipeptidice. ncepnd din anul 1930, Pauling i colab. au inteprins studii sistematice, prin cristalografie cu raze X, de msurare a distanelor interatomice, a unhghiurilor de legtur din aminoacizi din peptide. S-a stabilit c n gruparea peptic are loc o conjugare -p, legtura NH CO capt un caracter parial de legtur dubl, rotaia liber n jurul acestei legturi fiind astfel mpiedicat. Atomii C vor adopta poziii rigide fa de planul legturii duble. n peptidele naturale se ntlnete numai configuraia trans, mai stabil dect cea cis (Fig. 4) [1].

Fig.4 - Configuraia trans a unei legturi peptice

Lanul peptic ii pstreaz flexibilitatea prin rotaia liber n jurul legturilor: R1 1 CHCH NH NH O R2 C CH

O alt nsuire a gruprii peptice este capacitatea grupei hidrogen cu un grup C = O aparinnd altei grupri peptice:

NH de a forma o legtur de

N H --- O = C Un lan polipeptidic, n soluie, ar putea adopta o infinitate de conformaii prin rotaii n jurul legturilor CH(R1) N i CH(R2) CO . Pauling i Corey au postulat dou structuri secundare pentru lanutile polipeptidice elicea i structura . 3.2.1 Structura de elice alfa Lanul polipeptidic se rsucete pentru ca gruprile O = C i NH s devin adiacente stereochimice pentru a forma puni de hidrogen. Se obine asadar o structur repetitiv elicoidal n care toate unitile se afl n raporturi spaiale identice cu uniti vecine. O grupare NH formeaz punte de hidrogen cu gruparea CO aparinnd celui de-al patrulea rest aminoacidic din secvena linear. n aces fel, toate grupele CO i NH sunt unite prin puni de hidrogen (Fig.5).

Fig 5 Structura secundar de - elice a unui lan polipeptidic

Structura - elicoidal a lanurilor polipeptidice a fost gsit n diverse proteine, n proporie mai mare sau mai mic (Tabelul1). Structura secundar se ntlnete n diverse proporii att n proteine fibrilare ct i la proteine globulare. O protein fibrilar cu structur secundar n proporie de aproape 100% este keratina, proteina abundent n pr, piele, unghii. Aceasta este alctuit din lanuri polipeptidice lungi, cu structur de -elice, asociate cte dou i superncolcite. Prin asocierea acestor dimeri se realizeaz fibrile i fibre rezistente. Mioglobina i hemoglobina au un procent mare (70%) de structur secundar [1].

Tabelul 1. Coninutul n elice-alfa al unor proteine Proteina Mioglobin Insulin Ovalbumin Serumalbulin (bovin) Pepsin Ribonucleaz Chimotripsin % elice alfa 70 38 31 46 31 16 15

Fig.6 Structur alfa elicoidal

3.2.2. Structura n aceast structur lanul polipeptidic sufer o ndoire (pliere) la un unghi de 90, care se face n dreptul atomului de C, purttor al gruprilor COOH i NH2 implicate n legturi peptidice [4]. Aceast pliere a lanului polipeptidic determin apariia de legturi de hidrogen intercatenare ntre dou sau mai multe lanuri polipeptidice, legturi care confer stabilitate acestei structuri. Modelul n planuri pliate este de tip paralel si antiparalel. Proteinele cu structur -pliat sunt flexibile, dar nu elastice si sunt n general proteinele sub form de filamente (proteinele fibrilare proteina din mtase).

Fig. 7 Structura secundar

3.3. Structura teriar

Aceast structur nglobeaz structura secundar, definind raporturile dintre segmentele de -elice i structura , modul de mpachetare a lanului polipeptidic. ntre diverii radicali ai aminoacizilor se pot stabili urmtoarele tipuri de legturi necovalente: Puni de hidrogen ntre radicalii cu grupri alcoolice (din restul steril, treoneil), fenolice (din resturi tirozil ), amidice (din resturi glutamil i asparginil). NH H NH CH CH2 O H---O CH2 CH CO CO steril seril

 Legturi ionice, saline, ntre radicalii cu sarcin sau interaciuni polare ntre radicalii polari, fr sarcin: NH H NH CH CH2 O H---O CH2 CH CO CO steril seril

Interaciuni hidrofobe ntre resturile aminoaciacizilor nepolari ca valin, leucin, izoleucin, fenilanin, alanin:

NH CH CH3 CO alanil

H3C H3C

NH CH CH CO valil

Resturile cinestil din multe proteine formeaz legturi disulfice care leag covalent regiuni mai deprtate ale lanurilor peptidice. Prima protein a crei structur tridimensional a fost stabilit n cele mai mici detalii este mioglobina. n Fig. 8 este reprezentat schematic conformaia moleculei de hemoglobin [1].

3.4. Sructura cuaternar

Reprezint cel mai nalt grad de organizare molecular a proteinelor, caracteristic proteinelor native, care exist ca agregate moleculare formate din mai multe catene polipeptidice unite n subuniti. Structura cuaternar reprezint asocierea unor catene polipetidice identice, numite protomeri (care au deja structur primar, secundar si teriar definit) ntr-un ansamblu (agregat) denumit oligomer. n funcie de numrul protomerilor (care pot fi identici sau diferii) proteinele oligomere pot fi dimeri, trimeri, tetrameri [4].
10

Fig.8 - Structura teriar a hemoglobinei

Multe proteine sunt alctuite din mai multe lanuri polipeptidice, de regul un numr mic i pereche (proteine oligomere) (Tabelul 2), lanurile individuale sunt denumite protomeri sau subuniti. Tabelul 2. Proteine oligomere Proteina Masa proteinei Kdaltoni Miozin 468 Creatin kinaz 80 Fosfataz alcalin 80 Hemoglobin 64,5 Lactate dehidrogenaz 150 Aldolaz 160 Glicogen fosforilaz 270 Piruvat kinaz 237 Ceruloplasmin 151 Glucamin sintetaz 592 Nr protomeri 2 2 2 4 4 4 4 4 8 12 Masa protomerilor Kdaltoni 212 40 40 16 35 40 92,5 57,2 18 48,5

Ansamblarea protomerilor, structura cuaternar, se realizeaz numai prin fore slabe necovalente i asocierea devine stabil, permanent numai dac suprafeele de contact sunt complementare i un numr ct mai mare de atomi se apropie pn la nivelul razelor lor Van der Waals. Complementaritatea suprafeelor de contact asigur un grad foarte nalt de preczie i de specificitate a structurilor cuaternare [1] . Un alt exemplu de protein oligomer l constituie enzima RUBISCO care asigur fixarea CO2 n procesul de fotosintez. Structura cuaternar a acestei proteine este un octamer alctuit din patru dimeri, respective 16 catene polipeptidice: 8 catene L identice sintetizate n
11

cloroplast, 8 catene S identice sintetizate n citoplasm si 4 ioni de Mg2+. O caten (subunitate) S sintetizat n citoplasm i care a ptruns prin porii membranei n cloroplast se leag de o subunitate L sintetizat n stroma cloroplastului formnd un dimer, care ulterior fixeaz un ion de Mg2+. Patru astfel de dimeri constituii se asociaz formnd un octamer, structura rezultat avnd opt situsuri pentru fixarea CO2 [4].

4. Clasificarea proteinelor
Complexitatea structural i de compoziie a proteinelor a fcut ca ncercarea de a le clasifica s ntmpine serioase dificultii. Adoptndu-se simultan mai multe criterii, ca: solubilitate, structur, comportare chimica etc.

4.1. Clasificarea proteinelor dupa solubilitate

Proteine - insolubile (fibroase) - solubile (globulare; proteide -heteroproteine) Proteinele fibroase sau cleroproteinele au structura fibrilar i sunt insolubile n ap sau n soluii de electroliti; nu sunt hidrolizate enzematic (cu exceptia colagenului). Se dizolv numai
12

n acizi i baze concentrate, la cald, dar aceast dizolvare este nsoit de o degradare a macromoleculelor, din soluiile obinute nu se mai regenereaz proteina iniial. Aceste proteine se gsesc n organismul animal n stare solid i confer esuturilor rezistena mecanic (proteine de schelet) sau protecie mpotriva agenilor exteriori. Cele mai importante proteine fibroase sunt: Keratina (din ln, pr, pene, unghii, coarne, copite etc.); Colagenul componenta de baz a pielii; Fibrina din fibrele de matase; Miosina componenta a muschilor. n vegetale nu se gsesc proteine fibroase; funciunea lor este ndeplinit n plante de celuloz. Proteinele globulare sunt cele mai raspandite n natur; ele sunt solubile n ap sau n soluii de electrolii i au structura globular. Cele mai importante sunt: Hemoglobina proteina roie din snge; Albuminele proteine din albusul de ou; Globulinele - proteine din plasma sangvina Gluteinele proteinele din cereale; Proteide sau heteroproteide sunt numite proteinele care n afar de lanurile macromoleculare proteice conin i alte grupri de natur neproteic, denumite grupe prostetice. Dupa natura grupelor prostetice proteidele sunt de mai multe feluri: 1. Fosfoproteide, care conin resturi de acid fosforic legat n form esteric la grupri hidroxil, de exemplu caseina din lapte; 2. Lipoproteide, care conin ca grup prostetic resturi de giliceride; 3. Glicoproteide, care au grupa prostetic alcatuit dintr-un rest de zaharida; 4. Metaloproteide, n compoziia crora intr i atomii de metal, de exemplu hemocianinele sau pigmenii respiratori sunt proteine cu Cu; 5. Nucleoproteide, rezultate din legarea unei proteine de un acid nucleic (compus macromolecular, alcatuit din acid fosforic, o momozaharid i o combinaie heterociclic cu N). Nucleoproteidele au rol fundamental n diviziunea celulei vii, animale sau vegetale [6]. 6. Cromoproteinele sunt proteine colorate din cauza gruprii prostetice pe care o cuprind. Dup natura chimic a componentei prostetice, cromoproteidele se clasific n: a. Cromoproteidele porfirinice au drept component prostetic de baz un nucleu tetrahidropirolic, numit protoporfirin IX, substituit cu radicali metil, vinil, carboxil. Aceasta chelateaz un ion de Mg2+ formnd clorofilida, iar dup esterificarea gruprilor carboxil cu metanol sau fitol, formeaz clorofila, un pigment de culoare verde care are rol n absorbia luminii n timpul procesului de fotosintez. b. Cromoproteidele neporfirinice sunt acele heteroproteide la care gruparea prostetic este format din pigemni colorai n galben-portocaliu sau rou, numii carotenoide. De aceea, cromoproteidele neporfirinice se mai numesc i caroteno-proteide [4].

13

Nucleoproteinele sunt heteroproteide la care gruparea prostetic este reprezentat de acizi nucleici, cu rol n stocarea, transmiterea si exprimarea informaiei ereditare, biosinteza proteinelor, diviziunea celular. n funcie de natura chimic a gruprii prostetice se clasific n: - ribonucleoproteide, a cror component prostetic este acidul ribonucleic (ARN) i sunt localizate n citoplasm, mitocondrii, plastide, avnd capacitatea de a se asocia cu ribozomii, dar i n nucleu celulelor; - deoxiribonucleoproteide, a cror component prostetic este acidul deoxiribonucleic (ADN), iar proteina o histon, acestea fiind localizate n nucleul tuturor celulelor i reprezint componentele structurale ale cromozomilor si genelor.

4.2. Clasificarea proteinelor dup compoziie

1. Proteine simple, care prin hidroliz dau numai aminoacizi; de exemplu: albumina din sange; 2. Proteine conjugate sau proteide care prin hidroliza dau i ali compui, pe lng aminoacizi. Molecula unei proteine include n structura sa o parte proteic si un prostetic (resturi fr structur de amninoacizi). Proteidele intr n compoziia celulelor vii, dar i n constiuia enzimelor i virusurilor. Virusurile sunt rensponsabile de apariia i raspandirea multor boli infecioase (ei sunt germenii patogeni). Proteinele provenite din virusuri, numite antigeni provoac formarea n organismul animal a altor proteine, de aparare mpotriva virusurilor, numite anticorpi. Vaccinurile conin anticorpi care dau imunitate organismului faa de diferitele virusuri [6].

5. Proprietile generale ale proteinelor

5.1. Proprieti fizice
1. Starea de agregare n stare pur sunt substane solide, cristaline sau amorfe, stabile la temperatura obisnuit, iar la temperaturi mai mari de 50C se denatureaz. 2. Masa molecular variaz de la cteva mii la milioane de daltoni (1Da este unitatea atomic de mas 1,67 10-24g) [4]. 3. Solubilitatea proteinelor proteinele globulare sunt solubile n ap si soluii saline, iar cele fibrilare sunt insolubile. Solubilitatea proteinelor depinde de pH-ul si compoziia mediului. Diferite sruri ale metaleolor uoare - NaCL, MgCl2, Na2SO4, (NaH4)SO4 influeneaz considerabil solubilitatea proteinelor. 4. Caracterul coloidal datorit configuraiei macromoleculare proteinele formeaz sisteme coloidale, heterogene, n care faza dispersat este proteina, iar dispersantul este apa fa de care proteina manifest o oarecare afinitate. Din acest motiv proteinele nu dializeaz prin membrane semipermeabile si se denatureaz reversibil.
14

5. Disocierea proteinelor fiind polielectrolii, proteinele au caracter amfoter (n mediu acid se comport ca baze, iar n mediu bazic ca acizi). n funcie de structura primar a fiecrei proteine i pH-ul mediului pentru orice protein exist o valoare de pH, numit pH izoelectric (pHi), la care sarcina global a proteinei este zero, starea coloidal se destabilizeaz, iar proteinele manifest solubilitate minim. La pH mai mare dect pHi sarcina global a proteinei este negativ (se comport ca un anion), iar la pH mai mic dect pHi sarcina global a proteinei este pozitiv (se comport ca un cation). 6. Comportarea ca un sistem tampon datorit caracterului amfoter proteinele au capacitatea de a menine pH-ul fiziologic n interiorul celulei vegetale, asigurnd homeostazia acesteia [7].

5.2. Proprieti chimice

Reaciile chimice la care particip proteinele se pot clasifica n patru categorii: 1. Reacii datorate prezenei legturilor peptidice care pot fi clasificate la rndul lor n: a. reacii de hidroliz - sunt reaciile de scindare hidrolitic a legturilor peptidice, n mediu acid, bazic sau sub aciunea enzimelor proteolitice, cu punerea n libertate a aminoacizilor componeni ai macromoleculei proteice. b. reacia biuretului - este o reacie de culoare specific legturii peptidice de reacie cu ionii de Cu2+, n mediu alcalin, formnd combinaii complexe de culoare violacee. 2. Reacii datorate gruprii amino libere toi aminoacizii componenii ai proteinelor reacioneaz cu ninhidrina prin intermediul gruprii amino, care se elibereaz sub form de amoniac, i formeaz un compus de culaore albastr-violet. 3. Reacii de precipitare n funcie de natura reactivilor de precipitare, proteinele precipit reversibil sau ireversibil. a. precipitarea reversibil (salifierea) se realizeaz n prezena unor concentraii mari de electrolii tari, (NH4)2SO4 sau Na2SO4, fr modificarea structurii spaiale, iar dup ndeprtarea agenilor chimici de precipitare proteinele revin la starea lor nativ, fr modificarea proprietilor biologice ale acestora. b. precipitarea ireversibil este nsoit de modificri profunde ale structurii proteinelor, care se denatureaz i nu se mai pot redizolva, rmnnd n stare precipitat. Aceast reacie are loc n prezena acizilor minerali concentrai (HNO3, HCl), acizilor organici (acidul tricloracetic, acidul picric, acidul sulfosalicilic), cu sruri de metale grele (Pb2+, Hg2+) sau cu solveni organici (aceton, alcool). 4. Reacii datorate catenelor laterale sunt reacii chimice n care sunt implicai radicalii provenii de la aminoacizii ce alctuiesc structura primar a unei proteine. Aceste reacii sunt diverse n funcie de natura catenei laterale, fiind de esterificare, alchilare, etc [4].

15

6. Rolul proteinelor
Datorit compoziiei, fiind formate exclusiv din aminoacizi se ntlnesc alturi de ali compui importani de tipul polizaharidelor, lipidelor i acizilor nucleici ncepind cu structura virusurilor, a organismelor procariote, eucariote i terminind cu omul. Practic nu se concepe via fr proteine. Proteinele pot fi enzime care catalizeaz diferite reacii biochimice n organism, altele pot juca un rol important n meninerea integritii celulare (proteinele din peretele celular), n rspunsul imun i autoimun al organismului. Proteinele iau parte la formarea unor fermeni i intervin n desfurarea tuturor proceselor vitale n organism: intr n structura multor hormoni; particip la formarea anticorpilor cu rolul de aprtori ai organismului mpotriva microbilor i toxinelor acestora; intr n combinaii chimice cu substane chimice toxice, transformndu-le n substane netoxice; ndeplinesc funcia de transportatori formnd diferite complexe (proteino-lipidic, proteino-glucidic, proteino-mineral, proteino-vitaminic, proteino-hidric i cu unele medicamente); particip la meninerea echilibrului osmotic, la repartizarea apei i a substanelor dizolvate n ea n diferitele pri ale organismului; pot fi arse n organism cu scop energetic, 1 g de proteine eliberand 4 kcalorii [8].

7. Studii recente
n ultimii ani s-a ncercat demonstrarea complexitii proteinei legaturilor intracelulare (TJ). TJ reprezint o barier de protejare a pielii, aceasta modificndu-se n cazul bolilor de piele. Rolul TJ ca barier a pielii prezint o mare importan pentru prevenirea i tratarea bolilor de piele, cercetarile fiind in progress [2] . Jan van der Deursen i colegii si de la Mayo clinic au localizat o protein care are rolul de a proteja animalele de cancer i alte boli asocialte cu mbtrnirea. S-au modificat genetic cobaii pentru a produce mai puin protein BubR1 i s-a constatat c starea de sntate a cobailor care sunt primai de aceast protein se deterioareaz rapid. oareci care au aceast protein au murit n 15 % din cazuri iar cei care aveau protein n cantiri normale au murit de cancer n 40% din cazuri [3].

16

8. Concluzii
Proteinele prezint un rol fundamental n structura i funciile celulei. Diversitatea structural i funcional a proteinelor este determinat att de numrul, tipul i secvena aminoacizilor componeni, ct i de organizarea spaial, configuraional a moleculei de protein. Nu se concepe via fr proteine, acestea lund parte la toate desfurarea tuturor proceselor vitale n organism.

17

Bibliografie
[1] Dinu, V., Truia, E., Popa-cristea, E., Popescu, A., Biochimie medical- mic tratat, Ed. Medical, Bucuresti, 2000; [2] Brandner, J., Poetzl, C., Schmage, P., HAuswirth, U., Moll, I., A (leaky?) barrier: thight junction proteins in skin deasese, Drug discovery today: deasease mechanism, volume 5, No I, 2008; [3] Oamenii de tiin au descoperit protein care ne apr de cancer i de mbtrnire, online url: http://www.descopera.ro/dnews/10398674-oamenii-de-stiinta-au-descoperit-proteina-care-neapara-de-cancer-si-de-imbatranire; [4] Biochimie, online url: http://www.scribd.com/doc/157284653/Biochimie; [5] Proteine, online url: http://www.scribd.com/doc/49542954/proteine; [6] Proteine, online url: http://www.scribd.com/doc/191139519/Proteine; [7] Proteine, onine url: http://www.scribd.com/doc/149379415/Proteine; [8] Proteine, online url: http://www.scribd.com/doc/157050522/Proteine.

18