Sunteți pe pagina 1din 10

1

Cursul 9
BIOCHIMIA SAU CHIMIA BIOSFEREI

VALOAREA ANTROPIC A SUBSTANELOR CONSTITUTIVE
ALE CELULELOR VII

1.1 BIOMOLECULA

Cele mai multe componente ale organismelor vii sunt
compui (molecule) organici ai carbonului, muli dintre acetia
coninnd i azot. Cu toate c fiecare specie vie conine
combinaia proprie a acestor biomolecule diversitatea
structural a lumii vii poate fi redus la cteva blocuri
constitutive cu o structur comun. Este posibil s se
organizeze aceste blocuri constitutive ntr-o scar ierarhic n
acord cu greutatea molecular a acestora (vezi figura 1.1).
Partea inferioar a scrii este ocupat de gaze cu greutate molecular mic
(oxigen O
2
, azot N
2
, dioxid de carbon CO
2
) i ap H
2
O.
Aceste molecule mpreun cu ionii monovaleni n special: Na
+
, Ka
+
, Cl
-

dar i divaleni Mg
2+
, Ca
2+
, precum i elementele: P, S, Mn, Fe, Ca, Cu i Zn sunt
n mod obinuit implicai n procese care vor conduce la formarea de biomolecule
mai complexe aa cum arat scara greutilor moleculare. Examinnd scara din
fig. 1.1 se observ c n procesele biochimice sunt implicate att moleculele
simple, protoni, ioni, ap, oxigen etc. ct i moleculele organice cu structur
complicat cu greutate molecular pn la 10
8
.
Cele mai abundente biomolecule sunt proteinele, grsimile i zaharidele
dar sunt multe altele ca vitaminele, hormonii, enzimele etc.
2
Aceste elemente sunt eseniale n nutriia omului sau a altor specii dar nu
toate sunt eseniale pentru toate speciile.
Tabelul 1.1
Clasificarea elementelor din punctul de vedere al valorii antropice

Clasa nti de elemente
(Elementele
materiei organice i
apa)
Oxigen (O), Carbon (C), Azot (N),
Hidrogen (H), Fosfor (P), Sulf (S),
Apa (H
2
O)
Clasa a doua de
elemente
Ionii mono i
divaleni
Ionul de sodiu (Na
+
), ionul de
potasiu (K
+
), ionul de magneziu
(Mg
2+
), ionul de calciu (Ca
2+
), ionul
de clor (Cl
-
)
Clasa a treia de
elemente
Oligoelementele
Mn, Fe, Co, Cu, Zn, B, Al, V, Mo, I,
Si, Sn, Cr, F, Se



1.2 PROPRIETILE ELEMENTELOR CONSTITUTIVE ALE MATERIEI
ORGANICE (clasa nti de elemente)


1.2.2 PROPRIETILE HIDROGENULUI

Hidrogenul este substana care prezint cele mai mici fore
intermoleculare, cu excepia heliului, aa cum rezult din valorile punctelor de
topire i fierbere (-259,2C respectiv 252,8C). Toate valorile parametrilor
fizico-chimici indic faptul c hidrogenul obinut n condiii de laborator este un
3
gaz diatomic cu formula molecular H
2
. La temperaturi nalte se formeaz
hidrogenul atomic H, iar la temperaturi foarte nalte se formeaz protoni i
electroni. Hidrogenul i compuii si prezint efecte cuantice moleculare ntr-o
msur mult mai mare dect orice alt substan deoarece masa sa redus
conduce la existena spaiilor largi ntre nivelele cuantice. ntruct fiecare atom
de hidrogen este format dintr-un proton i un electron, rezult c molecula este
format din doi protoni i doi electroni Energia de ionizare fiind ridicat, 356 Kcal
mol
-1
, este clar faptul c hidrogenul reine cu aviditate electronul.
De asemenea molecula de hidrogen accept cu greutate un electron,
molecula H
2
-
se formeaz n condiii speciale i disociaz imediat n H i H
-
.
Stabilitatea moleculei de hidrogen poate fi corelat i cu faptul c este
izoelectronic cu atomul de heliu.
n compuii cu unele metale, hidrogenul molecular este prezent sub forma
ionului hidrur, H
-
, cu altele apare sub form atomic, iar cu cele mai multe
nemetale se leag prin covalena (de exemplu n ap H-O-H).
Cu toate ca hidrogenul molecular reacioneaz exoterm cu multe
elemente, el este puin reactiv, iar reaciile sale la temperatura camerei sunt
extrem de lente, ntruct energia lor de activare este mare datorit triei legturii
H-H.
Hidrogenul gazos este inodor, incolor, insipid, puin solubil n ap i n
solveni polari, dar este solubil n solveni nepolari.
Una dintre reaciile obinuite ale hidrogenului este aceea de adiie la
legturile multiple ale compuilor nesaturai.

H-H + H
2
C = CH
2
H
3
C CH
3
(1.3)

n acest mod uleiurile vegetale nesaturate lichide pot fi convertite n
materiale solide. ntruct multe dintre reaciile hidrogenului i ale compuilor lui
(de exemplu hidrocarburile) sunt puternic exoterme, aa cum este reacia cu
oxigenul, att hidrogenul ct i compuii si sunt utilizai adesea drept
combustibili. Trebuie subliniat ns faptul c i aceste reacii se caracterizeaz
4
prin viteze iniiale sczute, astfel c un amestec de oxigen i hidrogen poate fi
meninut la temperatura ambiant un timp nedefinit. Reacia exploziv este
iniiat de flacr sau scnteie.
Pentru a facilita reacia hidrogenului cu muli compui inclusiv n lumea vie
este necesar prezena unor catalizatori care pentru reaciile biochimice sunt
enzimele.
n concluzie hidrogenul formeaz compui binari cu aproape toate
elementele i n mod special formeaz un numr foarte mare de compui cu
carbonul. Rolul general al hidrogenului este acela de a acoperi periferia
moleculei. Fiecare atom de hidrogen formeaz n mod obinuit o legtur
puternic cu un singur alt atom. Ionii de hidrogen simpli, H
+
exist n faza
gazoas numai la temperatur foarte nalt. n alte condiii cmpul electric
extrem de concentrat al protonului interacioneaz puternic cu ali atomi sau
molecule.
Peste 99% dintre compuii organici cunoscui din lumea vie conin
hidrogen fapt ce demonstreaz importana acestui element pentru structurile vii.
Toate proprietile hidrogenului se datoreaz poziiei sale n sistemul periodic i
faptului c este cel mai uor element. Moleculele de hidrogen sunt cele mai
mobile. Hidrogenul gazos care se formeaz, fie intr n reacie cu alte molecule
de exemplu cu oxigenul, fie scap n atmosfer. Dei este cel mai rspndit atom
n univers att ca greutate ct i ca numr el reprezint numai 0,22% din scoara
terestra. (tabelul nr.1.4).
Atomul de hidrogen are un singur electron, pe care l doneaz unor
acceptori sau poate primi un electron pentru a completa stratul K. El este simetric
ambivalent i astfel se comport n ambele sensuri simultan, formnd legturile
de hidrogen cunoscute.

1.2.5 PROPRIETILE FOSFORULUI (P)

Fosforul are structura electronic Ne s
2
p
3
, temperatura de topire
T
t
=317,4K, temperatura de fierbere T
f
= 553K. n natur se ntlnete mai ales
5
sub forma de fosfat tricalcic Ca
3
(PO
4
)
2
. Strile de oxidare stabile n soluii apoase
sunt: -3 (PH
3
); 0 (P
4
); +3 (H
2
PO
3
-
, HPO
3
2-
) i +5 (H
3
PO
4
).
Aceast capacitate de a forma legturi chimice variate asigur fosforului
un rol important ca agent de transfer energetic i masic n reaciile biochimice.
Majoritatea reaciilor de transfer de energie i de grupri chimice sunt
dirijate de fosfaii organici mai ales adenozin trifosfatul ATP. Molecula de ATP
este format dintr-o parte azotat, o parte de hidrat de carbon i o parte de fosfat
fig.1.4.

Fig. 1.4 Structura ATP

ATP este o coenzim ce acioneaz mpreun cu anumite enzime pentru
a cataliza reaciile biochimice. O alt coenzim similar cu ATP-ul este
adenozindifosfatul ADP care are o structur similar dar cu o grupare fosfat mai
puin. Rolul biologic al ATP-ului este de a genera energie prin hidroliz cu
formarea ADP, conform reaciei:

ATP + H
2
O = ADP + H
3
PO
4
(1.14)
cu H
o
= -5,0 Kcal mol
-1
i G
o
= -7,9 Kcal mol
-1
.

Aceste valori sunt calculate pentru un amestec de echilibru al tuturor
ionilor menionai la pH = 7 i 310 K, adic M 1 ] PO [ ] ADP [ ] ATP [
3
4
= = =



6
Reacia de hidroliz a ATP este una din principalele surse de energie din
sistemele vii, energie ce poate fi eliberat fie sub form de cldur, fie sub form
de electricitate sau contracie muscular, fie se consum n sinteze endoterme
n funcie de sistemul de enzime implicat n proces. Motivul pentru care
organismele folosesc transferul unui radical - P pentru obinerea energiei
necesare reaciilor biochimice n locul oxidrii glucozei, este acela c la arderea
glucozei se elibereaz o cantitate prea mare de energie, 686 Kcal mol
-1
, fa de
cea necesar pentru ruperea i formarea legturilor de hidrogen 1 Kcal mol
-1
.
1.2.6 PROPRIETILE SULFULUI (S)

Sulful are temperatura de topire 392K, temperatura de fierbere 717K i
structura electronic Ne s
2
p
4
. n natur se gsete att sub form de combinaii
ct i sub form de sulf elementar. Face parte din grupa chalcogenilor

.
Poate exista n diverse stri de oxidare, cele mai frecvente sunt: -2, i 1
dar i 0, +2, +4 i +6. Atomii de sulf formeaz ntre ei catene, lanuri, din 6-8
atomi.
Capacitatea sulfului de a forma legturi chimice stabile cu sine nsui, S
8
,
prezint un interes biochimic deosebit. n general legturile S-S sunt foarte
stabile avnd energia de legtur de aproximativ 63 Kcal mol
-1
i nu se rup uor
ca n cazul legturilor O-O (33 Kcal mol
-1
).
De aceea aceste legturi sunt extrem de importante pentru meninerea
aminoacizilor enzimelor n poziii de orientare corecte, deoarece atunci cnd
punile (legturile intermoleculare) de sulf se rup, enzimele i pierd configuraia
specific i n acest mod i capacitatea de a cataliza reaciile biochimice. Dintre
cei 20 de aminoacizi eseniali doar doi, cisteina i metionina conin atomi de sulf
iar dintre ei, doar cisteina este capabil s foloseasc sulful pentru a forma puni
cu structur i orientare stabil.





7
1.3 IONII I OLIGOELEMENTELE

1.3.1 IONII SUBSTANELOR MINERALE

Ionii substanelor minerale, anioni i cationi, care aparin clasei a doua de
substane prezentate n tabelul 1.1 ndeplinesc funcii deosebit de importante n
fiziologia vieuitoarelor. Astfel, cationii, n mod special, intervin n procese de
reglare la nivel celular (stabilizarea sistemelor coloidale), n echilibrele
electrochimice, n stabilizarea membranelor, n stabilirea presiunii osmotice i
formarea structurilor plasmatice, de asemeni intervin n procese catalitice etc. Cu
alte cuvinte aceti ioni controleaz starea de ansamblu a soluiei apoase n care
decurg reaciile biochimice ale organismelor vii, echilibrul dintre diferitele
subdiviziuni ale mediului celular precum i transportul moleculelor prin
membranele celulare.

1.3.2 OLIGOELEMENTELE

Oligoelementele aparin clasei a treia din tabelul 1.1. Se caracterizeaz
prin faptul c se gsesc n organismele vii n cantiti extrem de reduse, ce nu
depesc 0,02% din greutatea uscat, dar au o activitate biologic extrem de
important. Lipsa oligoelementelor din organism provoac perturbaii grave mai
ales n metabolismul general, n evoluia proceselor de cretere i dezvoltare sau
chiar n consolidarea imunitii.
De asemenea, trebuie precizat faptul c oligoelementele au o eficien
biologic maxim, la concentraii foarte mici, bine definite, iar prezena lor n
organism n concentraii mai mari are o limit de toleran peste care ele devin
duntoare proceselor vitale
Rolul fundamental al oligoelementelor const n activarea i dirijarea
reaciilor enzimatice. Astfel, sistemele enzimatice care conin un atom metalic n
grupa prostetic, denumite metaloenzime, controleaz mecanismul de reacie
enzimatic. Menionm astfel ciclul reaciilor de fermentaie care sunt activate de
8
fier, molibden, cupru, cobalt, mangan, zinc, bor, cadmiu. Procesele redox
specifice respiraiei celulare depind de prezena zincului, cuprului, fierului,
cobaltului.
Oligoelementele intervin i n procesele de evoluie a structurilor
intracelulare cum sunt mitocondriile i cloroplastele. Este demn de remarcat
importantul rol al oligoelementelor: mangan, nichel, fier, crom, zinc n pstrarea
configuraiei moleculare a acizilor nucleici prin legarea oligoelementului de
protein. Astfel sunt influenate, n mod hotrtor, structura, proprietile fizico-
chimice inclusiv recunoaterea molecular i n consecin i funciile biologice
ale acestora, precum i ale ribozomului care reprezint nanomaina de produs
proteine.

1.4 PROPRIETILE CARBONULUI I ALE
DERIVAILOR SI

1.4.1 CARBONUL

Carbonul este componentul de baza al organismelor vii aa nct se poate
afirma c viaa este o consecin a apariiei carbonului n univers.
Ca element, carbonul aparine grupei a IV
a
a tabelului periodic al lui
Mendeleev, prin urmare configuraia sa electronic fundamental este: 1s
2
2s
2

2p
2
. Aceti patru orbitali atomici, n majoritatea cazurilor, sunt hibridizai sp
3
,
adic sunt

identici ca lungime, frecven, polaritate i distribuie unghiular, fiind
orientai n spaiu dup unghiurile unui tetraedru regulat formnd unghiuri de
10930. Orbitalii hibrizi sp
3
formeaz orbitali moleculari stabili.
n ceea ce privete rspndirea n natur, carbonul se gsete n cantitate
mare n ntregul univers att sub forma diverselor combinaii ct i n stare
elementar. Astfel, n scoara terestr mineralul cel mai abundent care nu
conine siliciu este carbonatul de calciu, iar n form elementar se gsete sub
form de diamant i grafit. Diamantul reprezint forma cea mai stabil a
carbonului cristalin, este o macromolecul de carbon hibridizat sp
3
, ce formeaz
9
o structur cubic cu parametru de reea a
o
= 0,3566nm la 193 K, figura 1.6.
Legturile covalente sp
3
-sp
3
sunt rigide i mpiedic clivajul cristalului astfel nct
materialul cristalin rezultat are o duritate foarte mare, 10 pe scara Mohs i 8500
pe scara Knoop. O proprietate extrem de important pentru industria de
prelucrare a diamantului este anizotropia sa, adic variaia proprietilor cu
direcia n cristal.


Fig. 1.6 Structura diamantului


Fullerene
O form nou artificial complex a carbonului este aceea denumit
fullerena backminster, sau mai simplu fullerena, alctuit din 60 de atomi de
carbon structurai sub forma unei sfere geodezice de tip Buckminster Fuller
(fig.1.8).

a) b)
10

c)
Fig. 1.8 Structuri derivate din C60:
a) Fullerene, C60; b) C70; c) Fullerene C60- tratate la 153K ; cristalizate ntr-un
aranjament cubic cu fete centrate
S-a constat pe cale spectral ca fullerenele se gsesc n norii stelari
rezultai n urma exploziei supernovelor.