Feb

Mai 2014
Cursul 1
Cursul 1
Fluxul informaiei genetice
gen
(ADN)
transcript primar
(ARN)
transcriere
genetic
procesarea
transcriptului
ARN ribozomal
ARN de transfer
ARN mesager
traducerea
informatiei
genetice
ARN antisens
peptid
Structura Materialului Genetic
ADN =

acid deoxiribonucleic
ARN =

acid ribonucleic
Unitile de baz (monomerii) = nucleotide, legate ntre ele prin legturi covalente -

fosfodiesterice
ADN i ARN = un fel de polimeri
Deci, ADN i ARN = structuri polinucleotidice
dGTP
deoxyguanosine

triphosphate
deoxyadenosine

triphosphate
dATP
dCTP
deoxycytidine

triphosphate
dTTP
deoxythymidine

triphosphate
CH
3
O
Thymine
Adenina i guanina = purine
Timina i citozina = pirimidine
Nucleotid =
baz azotat
pentoz (un zahar format din 5 atomi de carbon)
un rest de radical fosforic
n structura ADN nucleotidele sunt
legate ntre ele
prin legturi fosfodiesterice
(de tip covalent)
Lanuri polinucleotidice
Catene polinucleotidice
Majoritatea moleculelor de ADN = 2 catene polinucleotidice = ADN

dublu-catenar = ADN d.c.
ntotdeauna :
o A de pe o caten se mperecheaz cu o T de pe cealalt caten i invers (o T, cu o A)
o G se mperecheaz cu o C, i invers
mperecherea = formarea de legturi de hidrogen
3 legturi de hidrogen ntre G i C G C
ntr-o molecul de ADN d.c.
numrul de A = numrul de T
numrul de G = numrul de C
Cele dou catene sunt legate ntre ele prin legturi
de hidrogen
Cele dou catene sunt complementare una cu cealalt.
2 legturi de hidrogen ntre A i T A T
Legile lui Chargaff
1. cele 2 catene polinucleotidice sunt complementare una fa de cealalt
Aceasta nseamn c unei adenine de pe una din catene i corespunde o timin pe cealalt caten, de
care se leag prin 2 legturi de hidrogen (A = T); se spune, deci, c adenina este complementar cu
timina. n mod similar, guanina este complementar cu citozina, de care se leag prin 3 legturi de
hidrogen (G C). Se deduce c legturile de hidrogen permise sunt: A =

T i G

C
n moleculele de acizi nucleici dublucatenare dar formate dintr-o caten ADN i o caten ARN
(asemenea molecule hibrid se formeaz de obicei n procesul de transcriere genetic), adeninelor din
catena ADN le corespund n catena ARN molecule de uracil. i n acest caz se formeaz tot dou
legturi de hidrogen: A =

U.
2. ntr-o molecul de acid nucleic d.c. purinele sunt n raport echimolar cu pirimidinele
Aceast regul este, de fapt, o consecin a primei legi. Astfel, dac oricrei A de pe una din catene i
corespunde o T pe cealalt caten i oricrei G i corespunde o C, atunci numrul moleculelor de
adenin este egal cu numrul celor de timin, adic A = T i, respectiv, G = C. Prin adunarea celor
dou ecuaii, se deduce: A + G = T + C. Deci, numrul purinelor dintr-o molecul de acid nucleic d.c.
este egal cu numrul pirimidinelor. Altfel spus, cele dou tipuri de molecule se afl n raport
echimolar.
3. cele dou catene polinucleotidice dintr-o molecul de acid nucleic d.c. sunt antiparalele
O caten polinucleotidic are dou capete: la un capt se afl carbonul din poziia 5

(C5) al unei
pentoze, iar la cellalt capt se afl carbonul din poziia 3

(C3) al unei alte pentoze. n interiorul unei
celule o asemenea caten polinucleotidic este sintetizat chiar

n aceast direcie: 5

3.
Cele 2 catene polinucleotidice ale unei molecule d.c. sunt n orientri inverse una fa de cealalt:
capul 5 al fiecreia corespunde cu capul 3

al celeilalte. Cele 2 catene sunt antiparalele.
P - fosfat
Albastru

-

zahar
Baze: ATGC
Dou reprezentri ale dublului helix ADN.
(a)

Dublu-helix ADN de form B.

Scheletul glucido-fosforic (n gri gri

i marcat cu linii ro ro ii ii) se afl la exteriorul
helixului. Bazele azotate se afl la interior. Sunt marcate curbura major i cea minor a helixului.
(b

)

Structura schematizat a unui ADN dublu-helix. Cele dou schelete glucido-fosforice (n verde verde

nchis
i deschis) sunt n orientare invers: 5

3, fa de 3

-

5. Bazele azotate de pe cele dou catene sunt
prezentate n albastru

i rou.
Dublul helix
Parametri helicali
n = numrul de nucleotide per tur de spir (de elice)
h

= distana dintre perechile de nucleotide adiacente
P = pasul elicei i este distana traversat de-a lungul axei helixului de un tur complet de spir (adic de o
rotaie de 360
o
). P poate fi exprimat n raport cu numrul de nucleotide dintr-un tur (n) i cu
distana dintre 2 nucleotide n procesul de rotaie (h)
t = unghiul de rsucire sau de rotaie a perechile de baze azotate; acestea nu sunt perfect perpendiculare
pe axa helixului (sau, altfel spus, dou perechi de baze adiacente nu sunt coplanare), ci sunt
nclinate cu un unghi de rsucire t care, de obicei, este 34,6
o
. Aceaste este de fapt cauza pentru
care cele dou catene se rsucesc una n jurul celeilalte, formnd o structur de dublu-helix.
Valorile acestori parametri pot varia ntre anumite limite i determin mai multe forme topologice ale
moleculei de ADN d.c.
Forma B reprezint conformaia cel mai des ntlnit n celule. Are un diametru de aproximativ 20
Angstrom (), iar distanele dintre perechile de baze este de aproximativ 3,4 . n aceast
conformaie exist o medie de 10,4 baze azotate per tur de spir, iar unghiul de rotaie dintre 2
baze adiacente este de +34,6.
Forma A

se ntlnete n celule n regiunile dublucatenare ale moleculelor de ARN i n dublu-helixurile
hibride ADN ARN ce se formeaz n procesele de transcriere genetic. Are un diametru de
aproximativ 23 A, 11 baze per tur de spir i un unghi de +34,7.
Forma Z este mai subire (un diametru de 18A), 12 baze per tur i un unghi de -30

ntre ele. Datorit
acestui lucru, formele A i B sunt denumite de dreapta, iar forma Z este de stnga.
Denaturarea i renaturarea moleculelor de ADN dublu-catenare
TipuridemoleculeADN TipuridemoleculeADN
TipuridemoleculeADN
ADNmonocatenar(mc)

unelevirusuri,deex.parvovirusuri
ADNdublucatenar(dc)
circular
linear
ADNulunorvirusuri
Cromozombacterian
Plasmidebacteriene
ADNmitocondrial
ADNcloroplastic
Unelevirusuri,deex.Adenovirusuri,virusuriherpes,

varicellaetc
Cromozomidelaeucariote
ADNdc ADNdccircular circular

delavirusulSV40 delavirusulSV40
ADNdc ADNdccircular circular

dinmitocondriiumane dinmitocondriiumane
ADNdclinearumaninreplicare ADNdclinearumaninreplicare
ToatemoleculeledeADN,lin ToatemoleculeledeADN,linearesaucirculare,se earesaucirculare,sereplic replic
1moleculADNdc
replicare
2moleculeADNdc
Dpdvchimic,replicarea=sintezauneicatenenoideADN,folosinddreptmatrioaltcatenADN,
pebazdecomplementaritate(AT,GC)
OmoleculADNd.c.sedesface(sedesfaclegturiledehidrogeniseseparcele2cateneunadecealalt)
Fiecaredinaceste2cateneestefolositdreptmatri:pefiecarematrisesintetizeazocatennou
5
3
5
3
3 5
5
3
5
3
3
5
3
5
5
3
ReplicareaADN
Desfacerea Desfacerea
le legturilordeH gturilordeH
3
3
5
5
1m 1moleculADNdc oleculADNdc
3
5
3
5
2moleculeADNmc 2moleculeADNmc
Ata Ata area area
primerilor primerilor
5
3
Prelungirea Prelungirea
primerilor primerilor i i
formarea formarea
catenelornoi catenelornoi
cateneparentale cateneparentale
catenefiice catenefiice
C C A A T T
5 3
A A C C A A
3 5
5
3
5
3
3 5
5
3
5
3
3
5
3
5
5
3
Desfacerea Desfacerea
le legturilordeH gturilordeH
3
3
5
5
1m 1moleculADNdc oleculADNdc
3
5
3
5
2moleculeADNmc 2moleculeADNmc
Ata Ata area area
primerilor primerilor
5
3
Prelungirea Prelungirea
primerilor primerilor i i
formarea formarea
catenelornoi catenelornoi
cateneparentale cateneparentale
catenefiice catenefiice
T T G G T T T T A A C C T T A A G G G G C C A A T T
A A C C A A A A G G T T T T A A C C C C G G T T A A
A A G G T T T T A A C C C C G G T T
A A C C T T A A G G G G C C A A T T
3
3
A A
3
T T G G T T T T A A C C T T A A G G G G C C A A T T
3 5 3
T T G G T T T T A A C C T T A A G G G G C C A A T T
5
A A C C A A A A G G T T T T A A C C C C G G T T A A
3 5
5
5
A A C C A A A A G G T T T T A A C C C C G G T T A A
3 5
A A C C A A A A G G T T T T A A C C C C G G T T A A
5 3
C C A A T T
3 5
A A C C A A
3 5
5
T T G G T T T T A A C C T T A A G G G G C C A A T T
3
T T
3
Ptr fiecare din cele 2 catene iniiale (parentale),
se sintetizeaz o caten nou, pe baz de complementaritate :
-

acolo unde pe catena parental este o A, pe catena nou vine o T, i invers
-

acolo unde pe catena parental este o G, pe catena nou vine o C, i invers
Sinteza catenei noi se face in direc Sinteza catenei noi se face in direc ie 5 ie 5



3 3
Ptr c n ADN d.c. cele 2 catene sunt n orientare invers (una 53, iar cealalt 35),
sinteza celor 2 catene noi se face n direcie opus, dar ntotdeauna n sens 53
La o bifurcaie de replicare
-

una din catene este sintetizat continuu, de la un singur primer =
-

cealalt caten este sintetizat din buci

= fragmente Okazaki, fiecare pornind de la un primer
caten ntrziat, lagging
Fiecare din catenele parenatale este folosit

ca matri

ptr sinteza unei catene noi
Replicarea ADN se desf Replicarea ADN se desf oar la bifurcarea de replicare oar la bifurcarea de replicare zon unde desface zon unde desface
dublul helix dublul helix
catena

conductoare, leading
3
3
5
5
1m 1moleculADNdc oleculADNdc
3
3
5
5
3
3
5
5
3
5
5
3
bifurcatiedereplicare bifurcatiedereplicare
Catenaintarziata Catenaintarziata
( (lagging lagging) )
Sintezacontinua,
delaunsingurprimer
Sintezadiscontinua,
delamaimultiprimeri
Catenaconducatoare Catenaconducatoare
( (leading leading) )
Dublulhelixsedesface Dublulhelixsedesface
maideparte maideparte
Bifurcatiadereplicare Bifurcatiadereplicare
sedeplaseaza sedeplaseaza
(sprestanga) (sprestanga)
FragmenteOkazaki FragmenteOkazaki
Atasareaunuinouprimer Atasareaunuinouprimer
P
3
5
P
5 3
3
3
5
5
5 3
5 3
3
5
3 5
5
3 P
5
3
3
5
3
3
3
5
5
5
3
5 5
3
3
3
5
5
3 5
5 3
3
3
5
5
1m 1moleculADNdc oleculADNdc
3
3
5
5
3
3
5
5
3
5
5
3
bifurcatiedereplicare bifurcatiedereplicare
Catenaintarziata Catenaintarziata
( (lagging lagging) )
Sintezacontinua,
delaunsingurprimer
Sintezadiscontinua,
delamaimultiprimeri
Catenaconducatoare Catenaconducatoare
( (leading leading) )
Dublulhelixsedesface Dublulhelixsedesface
maideparte maideparte
Bifurcatiadereplicare Bifurcatiadereplicare
sedeplaseaza sedeplaseaza
(sprestanga) (sprestanga)
FragmenteOkazaki FragmenteOkazaki
Atasareaunuinouprimer Atasareaunuinouprimer
P
3
5
P
5 3
3
3
5
5
5 3
5 3
5
3
3 5
5
3 P
5
3
3
5
3
3
3
5
5
5
3
5 5
3
3
3
5
5
3 5
5 3
Trei moduri posibile de replicare
Dere
Dere

inut
inut
1molecul

ADN

dc
replicare
2 molecule ADN dc
Fiecarecatenamoleculeiparentale=matriptrsintezauneicatenenoi
Sintezacatenelornoisefaceprincomplementaritatecucatenele

vechi:A T,G

C
Ocatennousesintetizeazntotdeaunandirecie5

3
Sinteza

uneinoicateneADNncepeintotdeaunadelaunprimer
ADNpolimerazapoateaduganucleotideporninddelauncap3OHliber,
darnupoateiniiasintezaunuilan

polinucleotidic
Unadincatenelenoiestesintetizatcontinuu,porninddelaunsingurprimer
Cealaltcatenestesintetizatdiscontinuu,porninddelamaimuliprimeri,
esteformatdinfragmente=fragmenteOkazaki
Primer=unfragmentoligonucleotidic

scurt,deobiceiARN