Sunteți pe pagina 1din 34

Proteine globulare care catalizeaz reaciile

biologice desfurarea proceselor chimice


necesare vieii
Definitie:
Nomenclatur i clasificare

a) denumire uzual - nu indic tipul reaciei catalizate
(pepsin, tripsin etc.)

b) pentru enzimele care catalizeaz reacii de hidroliz:
numele substratului + sufixul az (peptidaz; ureaz;
fosfataz)

c) numele substratului urmat de cel al reaciei catalizate +
az (malat dehidrogenaz, lactat dehidrogenaz etc.)

d) n 1961 - clasificare i nomenclatur sistematic: 6
clase - subclase - sub-subclase

* numr de cod din 4 cifre -EC abcd- , unde a = clasa, b
= subclasa, c = sub-subclasa, d = numrul de ordine al
enzimei n sub-subclas
1.OXIDO-REDUCTAZE catalizeaz reacii de oxido-
reducere
2. TRANSFERAZE catalizeaz transferul unor grupe
funcionale
3. HIDROLAZE catalizeaz reacii de scindare a unor
legturi cu ajutorul apei
4. LIAZE (SINTAZE) catalizeaz reacii de adiie sau de
eliminare
5. IZOMERAZE catalizeaz reacii de izomerizare
6. LIGAZE (SINTETAZE) catalizeaz reacii de sintez prin
condensarea a dou molecule, simultan cu hidroliza unei
legturi fosforice din ATP sau din alt compus macroergic
Exemplu:
lactat dehidrogenaza:
EC 1.1.1.27

1 clasa: oxido-reductaze;
2 subclasa: oxido-
reductaze ce acioneaz
asupra substraturilor de tip
R
2
CH-OH;
1 sub-subclasa: acceptorul
de hidrogen este NAD
+
sau
NADP
+
;
27 numrul de ordine al
enzimei
Proprietile enzimelor

- se regsesc neschimbate la sfritul reaciilor
- nu modific echilibrul reaciilor - permit atingerea lui
ntr-un timp foarte scurt, mrind vitezele ambelor reacii
- nu modific termodinamica reaciilor cataliznd numai
reacii termodinamic posibile
- sunt de natur proteic
- eficien catalitic f.
mare: cresc foarte mult
vitezele reaciilor
biochimice prin micorarea
energiilor de activare ale
acestora => atingerea
unor timpi de reacie foarte
mici, (ps = 10
-12
s);
Ex: * hidratarea CO
2
- vitez de 36 milioane
molecule/min.
* descompunerea apei oxigenate:
- fr catalizator: 18Kcal/mol;
- n prezen de Pt coloidal: 11,7 Kcal/mol;
- n prezena enzimei catalaz: 2 Kcal/mol

-specificitate: fa de reacie i fa de substrat absoluta,
relativa de grup, larga; specificitate stereochimica
-evit formarea produilor secundari de reacie (datorit
eficienei catalitice i a specificitii ridicate)
- permit atingerea unor randamente de 100%
- acioneaz n concentraii foarte mici (cca 10
-6
moli)
- acioneaz n condiii blnde de temperatur
(~ 37C) i la pH neutru

- activitatea reglat i
autoreglat: viteza reaciilor
biochimice este controlat de
necesarul celulei, cantitatea
de produi este controlat
prin reglarea aciunii
enzimelor
Centrul activ

*legarea substratului - situs/centru
de legare
*cataliza (transformarea chimic)
situs/centru catalitic
Proprietile situsului catalitic:
* este localizat n poriunea intern, hidrofob a
moleculei proteice exist condiii favorabile pentru
transferul de electroni, de protoni sau de grupe chimice ntre
enzim i substrat
* are o geometrie spaial perfect ordonat
* este alctuit dintr-un numr mic de resturi de
aminoacizi distanai n structura primar
* resturile de aminoacizi includ grupe funcionale active: -
OH, -NH
2
, SH, -COOH, ciclu imidazolic etc. particip
la legarea substratului la enzim i la procesul de rupere
a legturilor chimice din substrat si de formare a
legaturilor din produsi
Tipuri de interaciune situs substrat: interacii hidrofobe
(chimotripsin), interacii ionice (tripsin)

Proprietile substratului:
poate forma cu enzima un complex activat (instabil)
produs de reacie
E + S
(ES)
E + P
-satisface necesitatea de specificitate a enzimei prin anumite
particulariti structurale
- conformaie bine definit care-i permite accesul la centrul
activ al enzimei
- manifest
complementaritate
structural i
conformaional cu
centrul activ al enzimei
cel puin trei puncte
de interaciune specific
- se asociaz cu enzima
pe baza unei orientri
strict specifice care-i
permite ptrunderea n
centrul activ
Enzime alosterice situs alosteric legarea unor
efectori enzimatici influeneaz activitatea situsului
catalitic => activatori sau inhibitori
Enzimele: acioneaz singure =>apoenzime, sau n
prezena unor cofactori (se formeaz un complex catalitic
activ) => holoenzime
Cofactori:
- coenzime: molecule organice de dimensiuni mici, de
obicei legate slab - co-substrate (coenzimele reaciilor de
oxido-reducere sunt i acceptoarele / donoarele de hidrogen:
NAD
+
/NADH, FMN/FMNH
2
, FAD
+
/FADH
2
)
- grupri prostetice: cofactori strns legai de de
molecula apoenzimei prin legturi covalente (ex: hemul
component a citocromilor)
- ioni metalici: Zn
2+
, Fe
2+
, Fe
3+
, Mg
2+
, Cu
2+
, Zn
2+
etc.
Organizarea structural a enzimelor
* monomer M < 30 000 D (ex: tripsina, ribonucleaza)
* oligomeri 2-6 resturi polipeptidice asociate; M > 30 000
D (ex: alcooldehidrogenaza = 4 protomeri)
* izoenzime (izozime) difer protomerii i esutul/organul
n care acioneaz (ex: lactat dehidrogenaza, creatin
kinaza)
* sisteme multienzimatice
Mecanisme implicate n cataliza enzimatic
I. Mecanismul lact cheie
- complementaritate structural perfect ntre substrat i
centrul activ
- la reaciile enzimatice cu specificitate absolut de
substrat
II. Mecanismul ajustrii induse
- flexibilitate a conformaiei centrului activ
- cazul enzimelor care n stare liber nu se afl n
conformaie optim pentru cataliz
- legarea substratului ajustarea centrului activ
geometrie optim pentru ES
III. Mecanism prin cataliz covalent
- legarea reversibil a substratului la centrul activ prin
legturi covalente (prin intermediul unor grupe funcionale
nucleofile din aminoacizii ce alctuiesc situsul)
Cataliz covalent mecanismul catalitic al chimotripsinei:
E + S
1
ES
1
ES
1
+ S
2
ES
1
S
2
sau
E + S
2
ES
2
ES
2
+ S
1
ES
2
S
1
E + P
1
+P
2
E + S
1
ES
1
ES
1
+ S
2
ES
1
S
2
EP
1
P
2
EP
1
P
2 P
2
+ EP
1
E + P
1
Reacii enzimatice cu dou substraturi
A. Reacii cu simpl deplasare centrul activ al enzimei
este disputat simultan de cele dou substraturi
* ntmpltoare:

* ordonate:

E + S
1
ES
1
E
*

+ S
2
E
*
S
2
E + P
2
E + P
1
*
B. Reacii cu dubl deplasare (ping-pong)

Efectori enzimatici - modific cinetica reaciilor
enzimatice
Inhibitorii enzimatici anularea definitiv sau
temporar a activitii enzimatice => inhibiie ireversibil sau
inhibiie reversibil

Inhibiia reversibil:
- nu modific structura
molecular a enzimei;
3 tipuri:
- competitiv
- incompetitiv
- necompetitiv
a) Inhibiia reversibil competitiv - inhibitori
competitivi = substane cu analogie structural cu
substratul => manifest afinitate pentru centrul activ al
enzimelor => competiie pentru ocuparea situsului
catalitic al enzimei
- creterea concentraiei de substrat conduce la
anularea inhibiiei => viteza maxim a reaciei nu se
modific
Exemple:
acidul malonic
(malonatul) - inhibitor competitiv
cu acidul succinic (succinatul) n
reacia de dehidrogenare a
acestuia la acid fumaric
COOH
NH
2
SO
2
NH
2
NH
2
C O
NH CH
COOH
CH
2
CH
2
COOH
NH CH
2
N
N
N
N NH
2
OH
H
H
Acid p-aminobenzoic
p-Aminobenzensulfonamida
Acid tetrahidrofolic (FH
4
)
sulfonamidele
(sulfamidele): p-
aminofenilsulfonamida -
inhibitor competitiv cu
acidul p-aminobenzoic
(necesar biosintezei
coenzimei FH
4
)

b) Inhibiia reversibil incompetitiv - inhibitorul
incompetitiv se fixeaz numai la complexul enzim-substrat
=> complexul ESI este inactiv
- viteza reaciei nu se apropie niciodat de viteza
maxim
c) Inhibiia reversibil necompetitiv - inhibitori
(necompetitivi) - nu prezint analogie structural cu
substratul - acioneaz fie asupra unei regiuni din enzim
(diferit de centrul activ), fie asupra complexului enzim-
substrat

- viteza maxim a
reaciei este diminuat.
Exemplu: enzimele
care au drept cofactori
metale grele (ioni)
inhibate necompetitiv de
EDTA
Inhibiia ireversibil - inhibitori ireversibili - formeaz
legturi covalente cu anumite grupe funcionale ale
enzimelor eseniale pentru activitatea catalitic =>
enzima devine inactiv
- prin ndeprtarea inhibitorului enzima nu i mai
recapt funcia catalitic - util n identificarea grupelor
funcionale cu rol catalitic din situsul activ al enzimelor
Exemple:

ionul CN
-
- acioneaz asupra enzimei citocromoxidaz
(conine Fe)
ionii metalelor grele (Hg
2+
, Pb
2+
) - se combin cu
grupele SH din enzime => denaturare.
- antidot sarea de calciu a EDTA

CaEDTA
2-
+ Pb
2+
Ca
2+
+ PbEDTA
2-
solubil n
fluidele din organism i se elimin prin urin
Zimogeni
* precursori ai enzimelor inactivi fa de substraturile
specifice enzimelor respective stabili; numai n celulele
secretoare (ferii de aciunea enzimelor proteolitice)
* sunt transformai enzimatic ireversibil n formele active
prin hidroliza selectiv a unor legturi peptidice din
molecul
Exemple:
pepsinogenul, tripsinogenul i
chimotripsinogenul, protrombina
etc.