Tema 2:Structura proteinelor

reprezint partea principal a celulelor oricrui organism viu

protos - primul, de prima importan
Proteinele sunt substane organice azotate, alctuite din AA, legai n catene prin legturi
peptidice i care posed organizare structural complicat.
Principalele caracteristici: prezena permanent a componenilor structurali ai AA;legturile
peptidice ntre AA;
Functiile proteinelor:
structural (colagenul, elastina, keratina);catalitic (amilaza, pepsina, LDH);de recepie (receptorii
hormonali); contractil i locomotor (dinamic) actina, miozina; transport i depozitare (Hb transport
oxigenul, iar Mb l depoziteaz n muchi; transferina i feritina transport i depoziteaz fierul n
snge, ficat);reglator i hormonal - reglarea creterii i diferenierii celulelor (insulina, proteinele-
represor); de protejare fa de corpi strini, virui, bacterii (imunoglobuline);homeostatic meninerea
constantelor sngelui (albuminele determin presiunea oncotic cantitatea, volumul lichidului n
vasele sanguine);de rezerv, trofic proteinele alimentare.
Nivele de organizare:
S St tr ru uc ct tu ur ra a p pr ri im ma ar r
prezint componena i succesiunea aminoacizilor din lanul polipeptidic, determinat genetic.
Este stabilizat de legturile peptidice covalente, care se formeaz la interaciunea grupei -carboxilice
a unui aminoacid cu -aminogrupa urmtorului aminoacid.
Proprietile legturii peptidice:
este o legtur covalent
coplanarea toi atomii grupelor peptidice se afl ntr-un singur plan
2 forme de rezonan(ceto sau enol)
poziia trans a substituienilor n raport cu leg C-N
capacitatea de a forma legturi de hidrogen (fiecare gr. peptidic poate forma 2 legturi de hidrogen)



Structura secundar
reprezint modul mpachetrii catenei polipeptidice ntr-o structur ordonat, datorit formrii legturii
de H ntre grupele peptidice ale unei catene sau a catenelor nvecinate.
Dup configuraie structura secundar poate fi sub form de -elice, sau s structur
n spaiu molecula proteic tinde s ocupe o form cu cea mai mic energie liber.
P Pa ar rt ti ic cu ul la ar ri it t i il le e d de e b ba az za a a al le e - -s sp pi ir ra al le ei i: :
orientat spre dreapta
posed simetrie elicoidal;
legturile de hidrogen se formeaz ntre grupele peptidice ale primului i ale celui de al patrulea rest de
aminoacid;
radicalii laterali ai aminoacizilor nu particip la formarea -spiralei i snt dispui n exterior.
regularitatea i identitatea spirelor: nalimea unei spire constituie 0,54 nm (5,4 A) i cuprinde 3,6 resturi
de aminoacizi (nlimea unui aminoacid este de 0,15 nm sau 1,5 A).
Periodicitatea regularitii -spiralei este egal cu 5 spire sau cu 18 aminoacizi. Lungimea unei perioade
este de 2,7 nm.

A Am mi in no oa ac ci iz zi ii i c ce e d di im mi in nu ui ie ea az z ( ( m mp pe ed di ic c ) ) f fo or rm ma ar re ea a e el li ic ce ei i: :
P Pr re ez ze en n a a: :
p pr ro ol li in ne ei i ( (a at to om mu ul l d de e N N n nu u a ar re e H H i i n nu u e e c ca ap pa ab bi il l s s f fo or rm me ez ze e l le eg g t tu ur ri i d de e h hi id dr ro og ge en n i in nt tr ra ac ca at te en na ar r s se e
f fo or rm me ea az z o o n nd do oi ir re e, , o o n nc co ov vo oi ie er re e n n l la an n . .
r ra ad di ic ca al li il lo or r v vo ol lu um mi in no o i i ( (( (V Va al l, , A As sp p) ) c co on nf fe er r o o s st tr r n ng ge er re e s st te er ri ic c a a e el li ic ce ei i) )
S Se er r, , T Tr re e g gr r. . O OH H p po ot t f fo or rm ma a p pu un n i i d de e H H p po ot t s se er rv vi i c ca a f fa ac ct to or ri i d de es st ta ab bi il li iz za at to or ri i
G Gl lu u, , L Li iz z, , H Hi is s, , A Ar rg g a ap pa ar r f fo or r e e e el le ec ct tr ro os st ta at ti ic ce e d de e r re es sp pi in ng ge er re e s sa au u a at tr ra ag ge er re e
- -s st tr ru uc ct tu ur r
a ar re e c co on nf fi ig gu ur ra a i ia a c cu ur rb ba at t , , c ca ar re e s se e f fo or rm me ea az z c cu u a aj ju ut to or ru ul l l le eg g t tu ur ri il lo or r d de e h hi id dr ro og ge en n i in nt te er rc ca at te en na ar re e n n l li im mi it ta a
u un no or r s se ec ct to oa ar re e a a a ac ce el lu ui ia a l la an n p po ol li ip pe ep pt ti id di ic c s sa au u a a l la an n u ur ri il lo or r a al l t tu ur ra at te e. .
A Ac ce ea as st t s st tr ru uc ct tu ur r s se e m ma ai i n nu um me e t te e s st tr ru uc ct tu ur r n n s st tr ra at tu ur ri i p pl li ia an nt te e. .
- -s st tr ru uc ct tu ur r p po oa at te e f fi i d de e 2 2 t ti ip pu ur ri i: :
c cr ro os ss s f fo or rm m p pa ar rt ti ic ci ip p u un n s si in ng gu ur r l la an n
- -s st tr ru uc ct tu ur r c co om mp pl le et t p pa ar rt ti ic ci ip p 2 2 s sa au u m ma ai i m mu ul lt te e c ca at te en ne e, , c ca ar re e p po ot t f fi i: :
- - p pa ar ra al le el le e ( (N N- -t te er rm mi in na a i ii il le e c ca at te en ne el lo or r p po ol li ip pe ep pt ti id di ic ce e s s n nt t n nd dr re ep pt ta at te e n n a ac ce ee ea a i i d di ir re ec c i ie e) )
- - a an nt ti ip pa ar ra al le el le e ( (N N- -t te er rm mi in na a i ii il le e s s n nt t n nd dr re ep pt ta at te e n n d di if fe er ri it te e d di ir re ec c i ii i) ). .
d di is st ta an n a a n nt tr re e 2 2 r re es st tu ur ri i d de e a am mi in no oa ac ci iz zi i e es st te e d de e 3 3, ,5 5 A A
S St tr ru uc ct tu ur ra a t te er r i ia ar r
reprezint modul de mpachetare a LP n spaiu tridimensional. Proteinele se mpart n globulare i
fibrilare.
Se formeaz datorit interaciunii dintre radicalii AA situai la distanta.
Legturile covalente:
- disulfidice - pseudopeptidice - esterice
Legturile polare
- de hidrogen - ionice,- electrostatice
interaciuni hidrofobe : -forele Van der Waals
S St tr ru uc ct tu ur ra a c cu ua at te er rn na ar r a a p pr ro ot te ei in ne el lo or r: :
- - e es st te e c ca ar ra ac ct te er ri is st ti ic c p pe en nt tr ru u p pr ro ot te ei in ne el le e a al lc c t tu ui it te e d di in n m ma ai i m mu ul lt te e L LP P( (p pr ro ot to om me er ri i s sa au u s su ub bu un ni it t i i) ). .
- - r re ep pr re ez zi in nt t a as sa am mb bl la ar re ea a p pr ro ot to om me er ri il lo or r n n s sp pa a i iu u ( (o ol li ig go om me er r) )
F Fu un nc c i ia a s sp pe ec ci if fi ic c a a u un ne ei i p pr ro ot te ei in ne e o ol li ig go om me er re e s se e m ma an ni if fe es st t n nu um ma ai i l la a n ni iv ve el lu ul l s st tr ru uc ct tu ur ri ii i c cu ua at te er rn na ar re e, ,
p pr ro ot to om me er ri i s se ep pa ar ra a i i s su un nt t i in na ac ct ti iv vi i. .
L Le eg g t tu ur ri i c ca ar re e s st ta ab bi il li iz ze ea az z s st tr ru uc ct tu ur ra a c cu ua at te er rn na ar r s su un nt t l le eg g t tu ur ri il le e s sl la ab be e ( (d de e h hi id dr ro og ge en n, , s sa al li in ne e, , f fo or r e e
h hi id dr ro of fo ob be e e et tc c. .) ). .
I In nt te er ra ac c i iu un ni il le e p pr ri in n s su up pr ra af fe e e e c co om mp pl le em me en nt ta ar re e p pr re ez zi in nt t f fe en no om me en nu ul l d de e c co oo op pe er ra ar re e- - p pr ri im me el le e
i in nt te er ra ac c i iu un ni i f fa av vo or ri iz ze ea az z f fo or rm ma ar re ea a c ce el lo or rl la al lt te e. .
E Ex x. . m mo ol le ec cu ul la a h he em mo og gl lo ob bi in ne ei i c co on ns st t d di in n 4 4 p pr ro ot to om me er ri i. .

Structura domenica: (suprasecunda)-reflecta faptul ca intr-o molecula proteica
multidomeniala corespunde unei portiuni continue in structura primara a lantului
polipeptidic care este si are o organizare proprie secundara si tertiara.
Clasificarea proteinelor:
13 Proteinele simple (holoproteine)
Histonele -localizate n nucleu, conin AA bazici pn la 30% (Arg, Liz). Au sarcina pozitiv, sunt
legate electrostatic cu acizii nucleici. Funcia: iau parte la reglarea metabolic a activitii
genomului, funcie structural
Albuminele mas molecular mic, PI 4,7, sarcin negativ, sunt solubile n ap. Rolul:
determin presiunea oncotic, particip la transportul substanelo
Globulinele - mas molecular mai mare ca albuminele, au caracter acid (PI 6 -7,3), conin n
cantitate mare Glu, se dizolv n soluii saline slabe, dar nu n ap. Rolul imunologic: sintetizeaz
anticorpi.
Protaminele au mas molecular mic, caracter alcalin (Arg i Liz) dar nu conin Trh, Tir i Fen,
sunt solubile n ap, se dizolv n soluii diluate de acizi i baze. Se gsesc n cantiti mari n
celule germinale naturale ale petilor: salmina (lapii somnului), scumbrina (scumbrie).
Prolaminele (gliadine), se gsesc n boabele cerealelor, au un coninut mare de Glu(20-25%) i
Pro (10-15%), dar mic de AA diaminomonocarboxilici: zeina (porumb); gliadina (gru), hordeina
(orz).
Glutelinele sunt de natur vegetal (se gsesc n bobul cerealelor), sunt insolubile n ap, dar
solubile n soluii acide i alcaline diluate, sunt bogate n Glu i Liz.
Proteinele conjugate (Proteide):
Nucleoproteine compuse din proteine i acizi nucleici. Componena proteic o alctuiesc histonele,
bogate n Arg i Liz.Rol: constituie baza molecular a unor procese biochimice fundamentale ca:
stocarea, transmiterea i exprimarea informaiei genetice, biosinteza proteinelor, diviziunea celular.
Cromoproteine compuse din protein i partea neproteic colorat cromoproteide porfirinice -
cromoproteide neporfirinice Reprezentanii: clorofila, hemoproteidele (Hb), sistemul de citocromi,
catalaza, peroxidaza.Rolul:particip n fotosintez, transportul oxigenului i CO2, reaciile de oxido-
reducere, senzaiile de lumin i culoare
Fosfoproteine: proteine + acidul fosforic (legate prin legturi esterice- de hidroxiaminoacizi Ser, Tre )
Reprezentani: cazeinogenul (proteina laptelui), vitelina, vitelenina (din glbenuul de ou), ihtulina (din
icre de pete).Rolul:- servesc ca material energetic, plastic n porocesul de embriogenez i cretere
postnatal- alimentar
Lipoproteine proteine + lipide (fosfolipide, acizi grai liberi, colesterol) Rolul: Reprezint constituieni
structurali ai celulelor,intervin n permeabilitatea biomembranelor ,particip la transportul prin snge i
limf a unor substane liposolubile (vitaminelor liposolubile A, D, E, K, unor hormoni,
medicamente),furnizeaz energia,
Metaloproteine -protein +metal (Fe, Cu, Zn, Mg) Exemple: Hb- conine Fe: transportul gazelor Feritina
conine Fe, localizat n ficat, constituie rezerva, depozitul de Fe din organism
Transferina conine Fe, Cu i Zn, se afl n plasma sanguin, transport Fe n oprganism.Mioglobina
conine Fe, se afl n muchi, rol de transportor i rezervor al oxigenului n muchiCeruloplasmina
conine Cu, se afl n plasma sanguin, transportor al Cu n organism i aciune oxidazic asupra
vitaminei C.
Glicoproteine- proteine + glucidic (glucozamin, galactozamin, a. hialuronic, glucozaminglicani) Rolul:
sunt constituieni plastici ai celulei, intr n componena membranelor biologice ,au rol de protecie a
mucoaselor gastrointestinale, ale aparatului respirator i urogenital fa de aciunea enzimelor
proteolitice, a unor compui chimici sau ageni mecanici ,sunt inhibitori ai aglutinrii hematiilor ,sunt
componente specifice de grup sanguin ,particip n reaciile imunologice


C Co ol la ag ge en nu ul l: : c ce ea a m ma ai i r r s sp p n nd di it ta a p pr ro ot te ei in n d di in n o or rg ga an ni is sm m. .
E Es st te e o o p pr ro ot te ei in n e ex xt tr ra ac ce el lu ul la ar r , , f fi ib br ri il la ar r , , c co om mp po on ne en nt ta a m ma aj jo or r a a e es su ut tu ul lu ui i c co on nj ju uc ct ti iv v i i o os so os s. . n n
e es su ut tu ul l c co on nj ju uc ct ti iv v e ea a o of fe er r r re ez zi is st te en n , , i ia ar r n n c ce el l o os so os s c co on ns st ti it tu ui ie e c ca ar rc ca as sa a o or rg ga an ni ic c a a m mi in ne er ra al li iz z r ri ii i. .
P Pa ar rt ti ic cu ul la ar ri it t i il le e s st tr ru uc ct tu ur ra al le e: :
1 1. . F Fi ie ec ca ar re e a al l t tr re ei il le ea a a am mi in no oa ac ci id d d di in n c ca at te en n e es st te e p pr re ez ze en nt ta at t p pr ri in n g gl li ic ci in n ( (3 30 0% %) )
2 2. . F Fi ie ec ca ar re e a al l p pa at tr ru ul le ea a - - p pr ri in n p pr ro ol li in n i i h hi id dr ro ox xi ip pr ro ol li in n ( (2 25 5% %) )
3 3. . C Co on n i in ne e 1 10 0% % a al la an ni in n
4 4. . C Co on n i in ne e h hi id dr ro ox xi il li iz zi in n
5 5. . C Co on n i in nu ut tu ul l t ti io oa am mi in no oa ac ci iz zi il lo or r i i t ti ir ro oz zi in ne ei i e es st te e r re ed du us s
S Se e d de eo os se eb be es sc c c ci in nc ci i f fe el lu ur ri i d de e l la an n u ur ri i p pr ri im ma ar re e: : 1 1I I, , 1 1I II I, , 1 1I II II I, , 1 1I IV V, , 2 2. . P Pr ri in n c co om mb bi in na ar re ea a l lo or r
s se e f fo or rm me ea az z 4 4 t ti ip pu ur ri i p pr ri in nc ci ip pa al le e d de e c co ol la ag ge en n. .
C Co ol la ag ge en nu ul l: :
S St tr ru uc ct tu ur ra a p pr ri im ma ar r p pr re ez zi in nt t o o c ca at te en n p po ol li ip pe ep pt ti id di ic c c cu ur rb ba at t a al lc c t tu ui it t d di in n c ci ir rc ca a 1 10 00 00 0
r re es st tu ur ri i d de e a am mi in no oa ac ci iz zi i. .
S St tr ru uc ct tu ur ra a s se ec cu un nd da ar r r re ep pr re ez zi in nt t a al lf fa a c ca at te en ne e s sp pi ir ra al la at te e r r s su uc ci it te e s sp pr re e s st t n ng ga a
3 3 a al lf fa a c ca at te en ne e s sp pi ir ra al la at te e, , r r s su uc ci it te e s sp pr re e s st t n ng ga a f fo or rm me ea az z t tr ro op po oc co ol la ag ge en nu ul l. .
T Tr ro op po oc co ol la ag ge en nu ul l e es st te e s su ub bu un ni it ta at te ea a s st tr ru uc ct tu ur ra al l a a c co ol la ag ge en nu ul lu ui i. .
S St tr ru uc ct tu ur ra a c cu ua at te er rn na ar r : : a a e ez za ar re ea a s su ub bu un ni it t i il lo or r d de e t tr ro op po oc co ol la ag ge en n s su ub b f fo or rm m d de e t tr re ep pt te e, ,
f fi ie ec ca ar re e m mo ol le ec cu ul l f fi ii in nd d d de ep pl la as sa at t c cu u d di in n l lu un ng gi im me e f fa a d de e m mo ol le ec cu ul le el le e v ve ec ci in ne e. .
M Mo on no om me er ri ii i s su un nt t l le eg ga a i i s st ta ab bi il l p pr ri in n l le eg g t tu ur ri i c co ov va al le en nt te e n nc cr ru uc ci i a at te e i in nt te er r i i
i in nt tr ra am mo ol le ec cu ul la ar re e, , c ca ar re e l le e c co on nf fe er r m mi ic cr ro of fi ib br ri il le el lo or r r re ez zi is st te en n m me ec ca an ni ic c . . P Pr ri in n
a as so oc ci ie er re ea a m mi ic cr ro of fi ib br ri il le el lo or r s se e f fo or rm me ea az z f fi ib br ri il le el le e, , i ia ar r d di in n e el le e - - f fi ib br ra a d de e c co ol la ag ge en n. .
C Co ol la ag ge en nu ul l e es st te e p pr ro ot te ei in na a c ca ar re e a ac ct ti iv v f fi ix xe ea az z i io on ni ii i d de e C Ca a2 2+ +. .

P Pr ro ot te ei in ne el le e f fi ix xa at to oa ar re e d de e C Ca a
s su un nt t p pr ro ot te ei in ne e c ce e p po os se ed d a af fi in ni it ta at te e m ma aj jo or r d de e l le eg ga ar re e a a i io on ni il lo or r d de e C Ca a. . T To oa at te e a ac ce es st te e
p pr ro ot te ei in ne e c co on n i in n r re es st tu ur ri i d de e c ca ar rb bo ox xi ig gl lu ut ta am ma at t d de e c ca ar re e s se e f fi ix xe ea az z i io on ni ii i d de e C Ca a. .
c ca ar rb bo ox xi ig gl lu ut ta am ma at tu ul l s se e f fo or rm me ea az z d di in n G Gl lu u s su ub b a ac c i iu un ne ea a e en nz zi im me ei i ( (c ca ar rb bo ox xi il la az za a) ), , c ca ar re e
c ca a c co oe en nz zi im m a ar re e v vi it ta am mi in na a K K. .
E Ex xe em mp pl le e: :
- - c co ol la ag ge en nu ul l( (r ro ol l i in n m mi in ne er ra al li iz za ar re e) )
- - c ca al lm mo od du ul li in na a o o p pr ro ot te ei in n m mi ic c c ce e p po os se ed d p pa at tr ru u l lo oc cu us su ur ri i d de e f fi ix xa ar re e p pe en nt tr ru u
i io on ni ii i d de e C Ca a
- - f fa ac ct to or ri ii i c co oa ag gu ul l r ri ii i s s n ng ge el lu ui i( (I II I, ,V VI II I, ,I IX X, , X X) )
- - f fo os sf fo ol li ip pa az za a C C
G Gl la a p pr ro ot te ei in ne el le e o os so oa as se e( (O Os st te eo oc ca al lc ci in na a) )
Ca2+ - ATP aza