Transcripia[modificare | modificare surs]

Procesul de transcripie necesit prezena unei singure molecule de ADN dublu catenar, numit ADN ablon, molecul care intr n
procesul de iniiere. Aici acioneaz enzima ARN polimeraza, enzim care se leag de o anumit regiune din molecula de ADN, regiune
(denumit promoter), de unde va ncepe transcripia. Pe msur ce ARN polimeraza se leag de promoter, lan urile de ADN vor ncepe sa
se desfac. Urmtorul proces n care intr ADN este procesul de elongaie (alungire a catenei). Pe msur ce ARN polimeraza se mi c
de-a lungul catenei de ADN, are loc sinteza ribonucleotidelor complementare (ARNm - ARN mesager). Acest ARN, dup cum i arat i
numele, se poate deplasa i n alte pri ale celulei cum ar fi reticulul endoplasmatic sau citoplasma.

Gruparea 5' se gsete n captul 5' final al moleculei de ARNm, i este format din guanosin grefat printr-o legtur de tip 5'- 5' de molecula de ARN prin
intermediul unei legturi trifosfat.

. Are loc adiia unei grupri 5', grupare dinucleotidic care are rolul de a asigura stabilitatea ARN i de a-l transforma n ARN matur. O
secven de aminoacizi este grefat n poziia 3' terminal pentru protec ie dar i pentru a sluji drept ablon pentru procesele
urmtoare.Mai departe are loc formarea ARN, care este apoi utilizat in ribozomi pentru sinteza proteinelor. La procariote legarea ARN
de ribosomi are loc dup ce acesta este ndeprtat de nucleoid; n contrast la procariote acest proces are loc chiar nmembrana nuclear i
apoi translocat n citoplasm. Rata sintezei proteic poate ajunge la circa 20 aminoacizi la procariote, mult mai pu in la eucariote.
Translaia[modificare | modificare surs]
n timpul translaiei ARNm transcris din ADN este decodat de ribozomi pentru sinteza proteinelor.Acest proces este divizat n 3 etape:

Iniierea

Elongarea

Faza terminal.

Ribozomul are situsuri de legare care permit altei molecule de ARNt (ARN de transfer), s se lege de o molecul de ARn m, proces nso it
de prezena unui anticodon. Pe msur ce ribozomul migreaz de-a lungul moleculei de ARNm (un codon o dat) o alt molecul de ARNt
este ataat ARNm. Are loc eliberarea ARNt primar, iar aminoacidul care este ataat de acesta este legat de ARNt secundar, care l leag
de o alt molecul de aminoacid. Translaia continu pe msur ce lanul de aminoacid este format. La un moment dat apare un codon de
stop, o secven format din 3 nucleotide (UAG, UAA), care semnaleaz sfr itul lanului proteic. Chiar dup termminarea transla iei
lanurile proteice pot suferi modificri post-translaionale i plierealanului proteic, responsabil de structura secundar i cea teriar.
Modificrile post-translaionale se refer la posibilitatea formrii de legturi disulfidice, sau de ata area la scheletul proteic a diferite grupri
ca rol biochimic: acetat, fosfat etc.
Sinteza chimic[modificare

| modificare surs]

Procesul de sintez chimic poate avea loc n laborator, dar pentru lanuri mici de proteine. O serie de reac ii chimice cunoscute sub
denumirea de sinteza peptidelor, permit producerea de cantiti mari de proteine. Prin sinteza chimic se permite introducerea n lan ul
proteic a aminoacizilor ne-naturali, ataarea de exemplu a unor grupri fluorescente. Metodele sunt utilizate n biochimie i in biologia
celulei. Sinteza are la baz cuplarea gruprii carboxil -COOH (carbon terminus) cu gruparea -amino -NH 2 (segmentul N terminus). Se
cunosc 2 metode de sintez pe cale chimic_

Sinteza n faz lichid, metoda clasic, care a fost nlocuit cu sinteza n faz solid.

Sinteza n faz solid (Solid-phase peptide synthesis SPPS), a crei baz a fost pus de Robert Bruce Merrifield. Prin aceat
metod, se pot sintetiza proteine D, cu aminoacizi D. n prima faz Merrifield a folosit metoda tBoc (ter-butil-oxi-carbonil). Pentru
nlturarea acestuia din lanul peptidic se folosete acidul fluorhidric (HF), care este foarte nociv, periculos, iar din acest motiv, metoda
nu se mai utilizeaz. Atunci cnd este vorba de sinteza analogilor peptidici non-naturali de tip baz (depsi-peptidele) este necesar.

O alt metod este cea introdus de R.C. Sheppard n anul 1971, i are la baz folosirea Fmoc (fluorenil metoxi carbonil), iar pentru
neprtarea acesteia se folosete de obicei mediu bazic asigurat de o soluie 20% piperidin/DMF (dimetil formamid). ndeprtarea gruprii
din lanul proteic se face prin incubare n acid trifluoracetic (TFA).

Aceast grup de protejare cu simetrie ortogonal se folosete n multe sinteze chimice.

Protejarea gruprii prin intermediul Fmoc este de obicei lent, deoarece anionul nitro produs la sfr itul reac iei nu este un produs favorabil
desfurrii reaciei.

Rol[modificare | modificare surs]

Datorit compoziiei, fiind formate exclusiv din aminoacizi se ntlnesc alturi de al i compu i importan i de
tipul polizaharidelor, lipidelor i acizilor nucleici ncepnd cu structura virusurilor, a organismelor procariote, eucariote i terminnd cu

omul.Practic nu se concepe via fr proteine.Proteinele pot fi enzime care catalizeaz diferite reac ii biochimice n organism, altele pot
juca un rol important n meninerea integritii celulare (proteinele din peretele celular), n rspunsul imun i autoimun al organismului.
Nutriia[modificare

| modificare surs]

Majoritatea microorganismelor i plantelor pot sintetiza toi cei 20 aminoacizi standard, n timp ce organismele animale ob in anumi i
aminoacizi din diet (aminoacizii eseniali). Enzime cheie, cum ar fi de exemplu aspartat kinaza, enzim care catalizeaz prima etap n
sinteza aminoacizilor lisin, metionin i treonin din acidul aspartic, nu sunt prezente n organismele de tip animal. La aceste organisme
aminoacizii se obin prin consumul hranei coninnd proteine. Proteinele ingerate sunt supuse ac iunii acidului clorhidric din stomac i
aciunii enzimelor numite proteaze, proces n urma cruia lanurile proteice sunt scindate (denaturate). Ingestia aminoacizilor esen iali este
foarte important pentru sntatea organismului, deoarece fr aceti aminoacizi nu se poate desf ura sinteza proteinelor necesare
organismului. De asemenea, aminoacizii sunt o surs important de azot; unii aminoacizi nu sunt utiliza i direct n sinteza proteic, ci sunt
introdui n procesul de gluconeogenez, proces prin care organismul asigur necesarul de glucoz n perioadele de nfometare (mai ales
proteienele aflate n muchi).
Tipuri de proteine[modificare

| modificare surs]

n funcie de compoziia lor chimic ele pot fi clasificate n:

Holoproteine cu urmtoarele clase de proteine

Proteine globulare (sferoproteine) sunt de regul substane solubile n ap sau n solu ii saline: protaminele, histonele,
prolaminele, gluteinele, globulinele, albuminele.

Proteinele fibrilare (scleroproteinele) caracteristice regnului animal, cu rol de sus inere, protec ie i rezisten mecanic:
colagenul, cheratina i elastina.

Heteroproteinele sunt proteine complexe care sunt constituite din o parte proteic i o parte prostetic; n func ie de aceast
grupare se pot clasifica astfel:

Glicoproteine

Lipoproteine

Nucleoproteine

Proprieti fizico-chimice[modificare | modificare surs]

Mas molecular[modificare | modificare surs]
Datorit formrii aproape n exclusivitate din aminoacizi, putem considera proteinele ca fiind de fapt ni te polipeptide, cu mas molecular
foarte mare, ntre 10.000 i 60.000.000. Masa molecular se determin prin diferite metode, mai ales n cazul proteinelor cu masa
molecular foarte mare ca de exemplu proteina C reactiv. Masa molecular a diferitelor proteine
Denumirea proteinei

Sursa proteinei/Izolat din

Masa molecular

Lactalbumin

lapte

17.000

Gliadina

gru

27.500

Insulina

pancreas

12,000

Hordeina

orz

27.500

Hemoglobina

globule roii

68.000

Hemocianina

molute(snge) ,
artropode(snge)

2.800.00

Miozina

muchi

850.000

Pepsin

stomac

36.000

Peroxidaza

rinichi

44.000

Virusul mozaicului tutunului (capsida) tutun

17.000.000

Deoarece la multe proteine masa molecular apare ca un multiplu de 17,500, mult vreme s-a mers pe ipoteza c particulele proteice sunt
formate prin unirea mai multor molecule de baz ce au masa molecular n jurul valorii de 17,500. Aceste molecule de baz s-ar putea uni
ntre ele prin aa numitele valene reziduale, ducnd la formarea de agregate moleculare. Atunci cnd are loc ruperea acestor valene
reziduale ar avea loc doar modificarea proprietilor fizice ale proteinelor, n timp ce dac are loc ruperea legturilor principale (legturile
peptidice), proteina i modific proprietile fizico-chimice.

Solubilitatea proteinelor[modificare | modificare surs]

Proteinele sunt substane solide, macromoleculare, solubile n general n ap i insolubile n solven i organici nepolari. Unele proteine sunt
solubile n ap dar insolubile n alcool, altele sunt solubile n soluii apoase de electroli i, acizi organici. Datorit gradului diferit
de solubilitate n diferii solveni, proteinele se pot izola, identifica i separa. Solubilitatea lor depinde foarte mult de legturile care se
stabilesc ntre gruprile libere de la suprafaa macromoleculelor i moleculele solventului. La suprafa a macromoleculelor proteice se
gsesc grupri libere de tip polar,-COOH, -NH2, -OH, -SH, -NH, grupri cu caracter hidrofil care favorizeaz dizolvarea proteinelor n ap.
De asemenea exist grupri de tip apolar, hidrofobe, de regul radicali de hidrocarburi -CH 3, -C6H5, -C2H5, care favorizeaz dizolvarea
proteinelor n alcool. ns n marea lor majoritate predomin gruprile polare, determinante pentru caracterul hidrofil. n contact cu apa
proteinele greu solubile manifest fenomenul de gonflare, datorit tendinei de hidratare datorat gruprilor polare. Gelatina de exemplu se
mbib foarte puternic cu apa dnd natere prin rcire la geluri. La dizolvarea proteinelor n ap, are loc fenomenul de formare a coloizilor
hidrofili. S-a constatat c n soluii diluate se gsesc macromolecule proteice izolate, iar n cazul solu iilor concentrate se formeaz

agregate de macromolecule proteice. Soluiile coloidale ale proteinelor, coaguleaz prin nclzire, prezint efectul Tyndall (dispersia
fasciculului de lumin).

Punctul izoelectric i caracterul amfoter[modificare | modificare surs]

Caracter amfoter[modificare | modificare surs]
Proteinele, la fel ca i aminoacizii, sunt substane amfotere i formeaz n soluii apoase

amfioni:

, n prezena H2O

n mediu acid proteinele se comport ca baze slabe, ele primind protoni i

formnd cationi proteici:

, cation al

proteinei. Reacia st la baza electroforezei proteinelor, datorit incrcrii pozitive cationii migreaz spre catod, fenomen numit cataforez,
proteina fiind n acest caz electropozitiv.
n mediu bazic proteinele se comport ca acizii slabi, ele cednd protoni, se formeaz astfel anioni proteici, care migreaz spre anod
fenomenul fiind denumit anaforez, proteina avnd ncrcare

electronegativ.

, anion al proteinei.

Datorit caracterului amfoter proteinele pot neutraliza cantiti mici de substan acid sau bazic, avind n acest fel rol de solu ie tampon,
prin acest lucru contribuind la meninerea echilibrului acido-bazic al organismului. n general caracterul amfoter este imprimat de cele
gruprile -NH2 i -COOH libere care nu sunt implicate n legaturile peptidice. Dac n molecula proteinei exist mai mul i aminoacizi
dicarboxilici atunci molecula se va comporta ca un acid slab, iar n cele n care predomin aminoacizii diamina i se comport ca baze slabe.
Chiar dac ntr-o molecul exist un numr egal de grupri amino si carboxil, deci teoretic molecula ar trebui sa fie neutr, n realitate

datorit gradului de ionizare mult mai mare a gruprii carboxil fa de gruparea amino, molecula proteinei va avea un caracter slab acid, n
soluia ei ntlnindu-se amfiioni proteici, anioni proteici i protoni (H + ).
Punct izoelectric[modificare

| modificare surs]

Prin acidulare echilibrul reaciei se deplaseaz spre formarea de cationi proteici. La o anumit concentra ie a H +, proteina devine neutr
deoarece gruparea aminic i cea carboxilic sunt la fel de disociate i deci molecula este neutr din punct de vedere electric. n acel
moment se vor gsi n soluie amfiioni, H+, ioni hidroxil -HO; pH-ul la care soluia unei proteine conine anioni i cationi n propor ie egal
poarta denumirea de punct izoelectric, se noteaz cu pHi, fiind o constant foarte important a proteinelor. Fiecare protein la punctul
izoelectric are un comportament specific, avnd o solubilitate si reactivitate chimic minim; de asemenea hidratarea particulelor coloidale,
vscozitatea i presiunea osmotic sunt de asemenea minime. Precipitarea proteinei la punctul izoelectric este n schimb maxim, dar nu
se deplaseaz sub influena curentului electric. De obicei valorile punctului izoelectric variaz ntre 2,9 i 12,5

[1] [2]

i se determin prin

diferite metode: poteniometrice, electroforetice.

Precipitarea proteinelor[modificare

| modificare surs]

Sub aciunea diferiilor factori fizici (ultrasunete, radiaii cu diferite lungimi de und, cldur), factori chimici (acizi, baze, diferi i solven i
organici), sau mecanici (agitare), are loc fenomenul de precipitare a proteinelor, precipitarea care poate fi reversibil sau ireversibil.
Precipitare reversibil[modificare | modificare surs]
Precipitarea reversibil se poate produce sub aciunea soluiilor concentrate ale srurilor alcaline dar i n prezen a unor dizolvan i organici
miscibili cu apa n orice proporie, cum sunt de exemplu acetona i alcoolul. n cadrul acestei precipitri molecula proteinei sufer unele
modificri fizico-chimice, dar nu are loc afectarea structurii moleculare. Puterea de precipitare a proteinelor de ctre diferi i ioni este data de
seria liofil a lui Hofmeister [3]. Dac anionul rmne acelai, puterea de precipitare a cationilor scade n urmtoarea ordine: Li +>Na+>NH4+>
cnd cationul ramne acelai anionii se comport astfel: SO42->PO43->CH3COO->Citrat->tartrat->Cl->NO3->ClO3->Br->I->SCN-. Solvenii de
tipul alcoolului sau acetonei, n funcie de concentraia lor, pot forma fie precipitate reversibile, fie ireversibile. Srurile alcaline au un
comportament diferit fa de proteine, n soluii diluate mrind solubilitatea proteinelor, iar n solu ii concentrate determinnd precipitarea lor
reversibil. De altfel soluiile srurilor alcaline de diferite concentraii se folosesc pentru precipitarea frac ionat a proteinelor din
amestecuri.
Precipitare ireversibil[modificare | modificare surs]

n cursul acestei precipitri molecula proteinei sufer modificri fizico-chimice ireversibile avnd loc i modificarea structurii moleculare. De
regul se produce la adugarea de soluii ale metalelor grele (Cu,Pb, Hg, Fe), a acizilor minerali tari (HNO3, H2SO4) acidul tricloracetic, a
soluiilor concentrate de alcool sau aceton, sau, n cazul anumitor proteine, n prezen a cldurii. Prin precipitare ireversibil proteinele i
pierd activitatea biologic (enzimatic, hormonal, etc.), are loc o descretere a solubilit ii, modificarea activit ii optice i, de asemenea,
sunt mai uor de degradat sub aciunea unor enzime proteolitice. Prin ndeprtarea factorilor care au dus la precipitare, proetienele nu
revin la forma lor iniial i nu ii pot reface structura molecular. Proteinele precipitate i pierd din propriet ile hidrofile "ob nnd"
proprieti hidrofobe.

Proprieti chimice[modificare | modificare surs]

Aminoacizi standard[modificare | modificare surs]
Din punct de vedere chimic, proteinele sunt heteropolimeri constituii din 20 de L- aminoacizi (a a numi ii aminoacizi standard, vezi
tabelul), n care gruprile carboxil se pot combina cu gruprile amino formnd legturi peptidice i rezultnd lan urile peptidice. Aminoacizii
standard au proprieti variate, proprieti care sunt direct responsabile de structura tridimensional a proteinei, dar i de propriet ile
acesteia.
Denumirea
(Residue)

cod 3-litere

cod 1 liter
code

Abunden />(%) E.C.

Alanin

ALA

13.0

Arginin

ARG

5.3

Asparagin

ASN

9.9

Aspartat

ASP

9.9

Cistein

CYS

1.8

Acid glutamic

GLU

10.8

Glutamin

GLN

10.8

Glicin

GLY

7.8

Histidin

HIS

0.7

Isoleucin

ILE

4.4

Leucin

LEU

7.8

Lizin

LYS

7.0

Metionin

MET

3.8

Fenilalanin

PHE

3.3

Prolin

PRO

4.6

Serin

SER

6.0

Treonin

THR

4.6

Triptofan

TRP

1.0

Tirosin

TYR

2.2

Valin

VAL

6.0

(4) n lanul polipeptidic aminoacizii formeaz legturile peptidice prin cuplarea grupei carboxil cu o grup amino; odat legat n lan ul
proteic aminoacidul se "transform" n aminoacid "rezidual" iar atomii de carbon, azot, hidrogen i oxigen implica i n legturi formeaz
"scheletul" proteinei. Atunci cnd lanul proteic se tremin cu o grup carboxil poart denumirea de carboxi-terminus (sau C -terminus), n
timp ce, dac se termin cu gruparea amino, devine amino-terminus (N-terminus).
Responsabile de proprietile chimice sunt aceleai grupri carboxil i amino libere, neimplicate n formarea legturilor peptidice, ns mai
intervin i diferiii radicali grefai pe scheletul proteinei.

Datorit gruprilor carboxil i amino libere ele dau aceleai reac ii ca i la aminoacizi.

Caracterul amfoter este responsabil de formarea de sruri att cu bazele ct i cu acizii

Legtura peptidic este responsabil de formarea de combinaii complexe denumie chela i.

Prezena diferiilor radicali alchilici, sau arilici determin formarea unor derivai ai substan elor proteice (deriva ii halogena i i nitrici
sunt cei mai importani).

Reacii de culoare[modificare | modificare surs]

Datorit existenei anumitor aminoacizi n molecula proteinelor, a legturilor peptidice formate n molecula proteinei dar i gruprile
funcionale libere sunt responsabile de reaciile de culoare.
Denumirea reaciei

Xantoproteic

Millon

Sulfurii de plumb

Sakaguchi

Adamkiewicz-

Reactivul folosit

Culoarea rezultat

Tipul de aminoacid identificat

acid azotic,hidroxid de amoniu

portocalie

azotat de mercur n acid

precipitat rou crmiziu sau

azotic/azotit

coloraie roie

Acetat sau azotat de plumb n

precipitat negru de sulfur de

aminoacizi cu sulf n molecul : cistein,

mediu alcalin

plumb

metionin cistin

roie carmin

arginin cu grupare guanidinic

violet

aminoacid cu nucleu indolic (triptofan)

naftol i hipoclorit de sodiu n

mediu bazic

acid acetic glacial/acid glioxilic/acid

aminoacizii aromatici (formeaz nitroderivai)

aminoacizi ciclici cu grupare hidroxil (tirosina)

Hopkins

Pauly

Ninhidrinei

Biuretului

sulfuric fumans

carbonat de sodiu i acid

diazobenzen sulfonic

ninhidrin

soluie diluat de sulfat de cupru n

mediu bazic

Biuretului

nichel n mediu bazic

Nitroprusiatului de

nitroprusiat de sodiu n soluie

sodiu

amoniacal

roie viinie

albastr

albastr violet

histidin i tirosin

caracteristic att pentru aminoacizi ct i

pentru proteine

legatura peptidic i se datoreaz formrii de

combinaii complexe

portocalie

legtura peptidic

roie

aminoacizi cu grupre tiol (-SH) liber

Structura tridimensional

Structura proteinelor[modificare | modificare surs]

Dup cum s-a vzut mai sus lanurile peptidice sunt formate de gruprile carboxil i aminice a aminoacizilor; exist de fapt 2 forme pentru
fiecare protein, numite forme de rezonan:

una datorat dublei legturi care asigur rigiditatea i nu permite rotaia n jurul axei sale;

a doua form de rezonan este dat de unghiul diedru (planul atomilor C'-N-C -C'), (planul atomilor N-C-C'-N), (planul
atomilor C-C'-N-C), unghiurile i pot avea diferite valori fiind responsabile de gradul de libertate a proteinelor, controlnd structura
tridimensional a lanului proteic.

Structura substanelor proteice este nc insuficient cunoscut datorit dinamicit ii structurii proteinelor, deoarece ele sunt n permanen
supuse unor procese de sintez i de degradare. Pentru evidenierea succesiunii aminoacizilor n structura proteinelor se folosesc 2
metode:[4]

Degradarea Edman

Prin degradarea Edman se poate identifica o secven de pn la 30 aminoacizi, cu o eficien de 98%/aminoacid. Un alt avantaj ar fi cantitatea de numai 10100 picomoli de peptid necesari pentru determinare.

Degradarea Edman folosete ca reactiv izotiocianatul de fenil care evideniaz selectiv aminoacidul. Grupa amino terminal se adi ioneaz
la izotiocianat trecnd printr-un derivat de tiouree. Dup ce se trateaz cu un acid slab, aminoacidul marcat sub form de feniltiohidantoin
se detaeaz de restul polipeptidei. Aceasta cu noul su aminoacid terminal poate fi supus la un nou ciclu de tratri pentru identificarea
urmtoarei grupe amino.
[5]

Degradarea Sanger are la baz tratarea polipetidei cu fluoro-2,4-dinitrobenzen, avind loc atacul reactivului asupra gruprii amino a
aminoacidului N-terminal. Metoda Sanger are dezavantajul degradrii complete a polipeptidei.

Unghiul legturii ntre C1 i N este aproape de 1800, similar cu unghiul valenei din molecula apei

S-a ajuns la concluzia c exist 4 niveluri (structuri), care alctuiesc edificiul proteic.

Structura primar[modificare | modificare surs]

Structura primar este dat de aminoacizii care intr n lantul proteic prin formarea legturilor pepetidice.

n structura primar se observ lanul de aminoacizi

n proteinele naturale legtura peptidic se stabilete ntre gruparea carboxilic de la C1 i gruparea aminic de la C2, nct lan ul peptidic
va fi format dintr-o succesiune de uniti CO-NH-CH, legate cap-cap.

La unul din capetele lanului peptidic se gsete o grupare -NH2liber, iar la cellat capt seafl o grupare -COOH liber

Legtura peptidic -CO-NH- se gsete n acelai plan, iar carbonul -CH- se poate roti, putnd s apar n planuri diferite. Datorit lungimii
relativ mici a catenelor laterale, ele se pot aranja de o parte i de alta a lanului proteic, astfel c lan ul proteic nu este ramificat.

Datorit deplasrii altrenative a unui electron de la gruparea -NH la C=O se produce oscilarea dublei legturi de la atomul de carbon i oxigen la atomul de azot,
fomrndu-se astfel cele 2 forme mezomere.

Datorit numrului relativ mic de aminoacizi care intr n structura proteinelor, teoretic ar trebui s se formeze proteine cu masa molecular
n jur de 4200. ns n realitate masele moleculare ale proteinelor au valori de peste 10,000 ceea ce a dus la concluzia c cel pu in o parte
de aminoacizi se repet de mai multe ori n cadrul unei molecule. Ipoteza c proteinele sunt formate din lan uri lineare de aminoacizi a fost
fomulat pentru prima dat n anul 1902, la a 74-a reuniune a Societii Oamenilor de Stiin din Germania, inut n oraul Karlsbad, de
ctre Franz Hofmeister (innd cont de reacia biuretului) i Emil Fischer (care aduce clarificri asupra scheletului proteic). Ipoteza c n
molecula proteinelor exist legturi amidice fusese elaborat de chimistul francez E Grimaux nc din anul 1882. n ciuda evidenelor care
demonstrau faptul c proteinele supuse aciunii proteolitice se scindeaz n oligopeptide, ideea c lan ul proteic este liniar, au fost idei greu
de "digerat". n perioada respectiv, numeroi savani (William Astbury, Hermann Staudinger), punnd la ndoial acest lucru, prin
argumentarea c legturile amidice nu sunt ndeajuns de puternice pentru a sus ine o molecul proteic lung.
Cu timpul au aprut diverse ipoteze:

Ipoteza coloidal care susinea ca proteinele sunt ansambluri moleculare coloidal formate din molecule mai mici - ipotez
contrazis de msurarea ultracentrifugrii de ctre Svedberg care arat faptul c proteinele sunt molecule bine definite, au greutate
molecular, iar prin electroforez Arne Tiselius demonstreaz c proteinele sunt molecule unice.

Ipoteza a 2-a, numit ipoteza ciclol, avansat de Dorothy Wrinch, are la baz 3 elemente:

Ciclol reaction n care gruparea carbonil i gruparea amino a 2 peptide se incruci eaz C=O + HN C(OH)-N (a a numita
legtur n cruce); aceste legturi sunt de tip covalent, similare cu legturile covalente de hidrogen propuse de William Astbury,
pentru a explica stabilitatea structurii proteice.

Lanurile beta vecine au la baz o serie de reacii de tip ciclol

Structura proteinelor mici corespund aa numitelor "solid de tip Platon", fr ca s existe col uri libere.

Alte ipoteze au fost lansate de ctreEmil Abderhalden (modelul dicetopiperazinic),sau Troesengaard n anul 1942 (modelul pirol/piperidin).
Toate aceste modele au fost infirmate de Frederick Sanger care reuete s identifice secvena aminoacizilor din insulin, dar i de
determinrile cristalografice efectuate de Max Perutz i John Kendrew asupra mioglobinei i hemoglobinei.

Structura secundar[modificare | modificare surs]

Imaginea alfa helixurilor mioglobinei, a crei structur a fost determinat de ctre Max Perutz iSir John Cowdery Kendrew n 1958folosind cristalografia cu raze X

Structura secundar se refer la forma i la lungimea lanurilor polipeptidice, propriet i induse de legturile de hidrogen. Cele mai ntlnite
tipuri de structura secundar sunt alpha helixul i lanurile beta.

Elicea alpha se formeaz prin rotaia unui lan polipeptidic n jurul propriei axe

Alte helix-uri cum ar fi helixul 310 i helixul sunt, din punct de vedere energetic, favorabile formrii legturilor de hidrogen, dar sunt
rareori observat n proteinele naturale exceptnd prile terminale ale helixului n timpul formrii scheletului proteic (de obicei centrul
helixului). Aminoacizii au un comportament diferit vis-a-vis de posibilitatea formrii structurii secundare. Prolina i glicina sunt cunoscui ca
aa numiii "helix breakers" (sprgtori de helix), deoarece afecteaz configuraia scheletului proteic; ambii aminoacizi au abilit i
conformaionale neobinuite i de regul se gsesc n colurile scheletului proteic. Aminoacizii care prefer s adopte conforma ia helixului
proteic fac parte din aa numita serie MALEK (codurile formate din 1 liter a aminoacizilor: metionin, alanin, leucin, acid
glutamic i lizina); prin contrast aminoacizii aromatici (triptofanul, tirosina i fenilalanina, dar i aminoacizii cu legare prin carbonul beta
(izoleucina, valina itreonina, adopt configuraia .
Structura secundar cunoate cteva ipoteze privind formarea ei:

Teoria polipeptidic formulat de ctre E. Hoffmeister n 1902 i dezvoltat ulterioe de ctre E.Fischer, are la baz conceptul
conform cruia moleculele proteice sunt formate din lanuri polipeptidice foarte lungi. Teoria are cteva dezavantaje:

nu explica diferenierea biologic a anumitor proteine

unele proteine sunt rezistente la aciunea enzimelor proteolitice (dei datorit lungimii lan ului nu ar trebui)

Teoria plierii i rsucirii lanului polipeptidice a fost elaborat de ctre Corey i Pauling n 1943 i a fost confirmat
prin spectrele de difracie cu raze X, microscopului electronic , prin msurarea unghiurilor de valen, a distanelor interatomice, au
confirmat faptul c lanul polipeptidic se gsete sub form pliat.

Structura n foaie pliant. Plierea catenei are loc prin formarea legturilor de hidrogen ntre gruparea carboxilic a unui
aminoacid i gruparea aminic a aminoacidului vecin. Lanul polipetidic pliat se prezintz ca o panglic ndoit alternativ la dreapta
i la stnga, plierea avnd loc n dreptul carbonilor metinici. Mai multe lanuri pliate polipeptidice pliate dau na tere unei re ele, ntre
aceste lanuri pliate putndu-se de asemenea forma legturi de hidrogen, acestea fiind n numr mai mare cnd gruprile terminale
a 2 lanuri sunt aranjate diferit (-NH2 i COOH, sau HOOC-i -NH2). Catenele polipeptidice pliate predomin n proteinele fibrilare i
mai puin n cele globulare. Dup valoarea perioadei de identitate se cunosc mai multe tipuri de proteine cu structur pliat. Prin
perioada de identitate se nelege distana cea mai mic la care se repet aminoacizii identici din molecul.

Structura elicoidal, ipotez lansat de Corey i Pauling, ipotez conform creia lan ul polipeptidic se poate prezenta i
nfurat sub form de spiral. n acest model, fiecare spir conine de obicei 27 aminoacizi, iar distan a ntre spire este de 5,44 A0.
Fiecare aminoacid mrete spira cu 1,47 A0. n faa fiecrei grupri -CO- va apare la o distan de 2,8A 0. o grupare NH de la al
treilea aminoacid. ntre aceste grupri se stabilesc punile de hidrogen care asigur stabilitatea helix-ului. n acest model lan ul
polipeptidic se prezint sub forma unui surub cu pasul fie spre dreapta, fie spre stnga. n cazul proteinelor naturale, acestea
datorit coninutului n L-aminoacizi, pasul helixului va fi spre dreapta, catenele laterale ies n afara corpului propriu-zis putnd
reaciona fie cu moleculele solventului fie cu alte catene polipeptidice. Canalul format n interiorul helixului este foarte ngust, n el
nu poate ptrunde molecula solventului. Legturile peptidice sunt plane, iar 2 planuri consecutive -CO-NH- formeaz un unghi de
1800, rotirea lanului se face la carbonul (metinic).

Structura teriar[modificare | modificare surs]

Prin intermediul cristalografiei cu raze X s-a dovedit faptul c macromoleculele proteice au o conforma ie tridrimensional, realizat de
obicei prin intermediul cuplrii mai multor lanuri polipeptidice scurte ntre ele, cuplare care duce la formarea fibrelor proteice;legturile
intercatenare pot fi principale sau secundare:

Legturi de hidrogen, sunt legturi coordinativ heteropolare care se stabilesc cu u urin ntre gruparea carbonil C=O
(electronegativ) i gruparea NH- (electropozitiv), din 2 lanuri polipeptidice alturate, sau n cazul formelor lactam-lactim ntre
gruparea -OH i azotul iminic =NH

Legturile de hidrogen au lungimea cuprins ntre 2,7-3,1A i energia de 3-7Kcal/mol la peptide, iar la ap 2-3Kcal/mol
[6]

.Legturile de hidrogen se pot stabili i ntre catenele lateralecare au grupri carboxil, hidroxil, amino sau tiolice. Din punct de vedere

energetic legtura de hidrogen nu este puternic dar datorit rspndirii relativ uniforme de-a lungul scheletului proteic ofer proteinei
stabilitatea necesar.

Legturi disulfidice

Legtura disulfidic este foarte puternic ,50-100kcal/mol i are un rol foarte importantn stabilizarea arhitecturii spaiale a moleculei proteice

. Legtura este rezistent la hidroliz, ns se poate desface iar prin reducere formeaz tioli(SH), iar prin oxidare formeaz acizi. n
general legtura sulfidic se ntlnete la proteinele transformate, care au o rezisten mecanic mare.
n afar de aceste legturi se mai pot stabili alte tipuri de legturi: legturi ionice (stabilite de obicei ntre gruprile aminice i cele
carboxilice ionizate), legturi de tip van der Waals (legturi electrostatice slabe care se stabilesc ntre radicalii hidrofobi), legturi
fosfodiesterice (ntre 2 resturi de serin i acid fosforic), legturi eterice (stabilite la nivelul aminoacizilor cu grupri hidroxilice).

Structura cuaternar[modificare | modificare surs]

Structura cuaternar se refer la modul n care se unesc subunitile proteice. Enzimele care catalizeaz asamblarea acestor subunit i
poart denumirea de holoenzime, n care o parte poart denumirea de subunit i reglatoare i subunit i catalitice.

Vedere 3 D a hemoglobinei cele 4 subuniti rou i galben, iar unitatea hemic verde.numele de hemoglobin vine este format din hem i globin, denumire ce
denot faptul c hemoglobina are la bazproteine globulare cuplate cu o grupare hem

. Proteine care au structura cuaternar :hemoglobina, ADN polimeraza i canalele ionice, dar i nucleozomi i nanotubuli, care sunt
complexe multiproteice.Fragmentele proteice pot suferi transformri n structura cuaternar, transformri care se reflect fie n structurile
individuale fie n reorientrile fiecrei subuniti proteice. Numrulsubunitilor din oligomerice sunt denumite prin adugarea sufix-ului -mer
(grecescul pentru subunitate), precedat de numele subunitii.

1 = monomer

7 = heptamer

13 = tridecamer

19 = nonadecamer

2 = dimer

8 = octamer

14 = tetradecamer

20 = eicosamer

3 = trimer

9 = nonamer

15 = pentadecamer*

21-mer

4 = tetramer

10 = decamer

16 = hexadecamer

22-mer

5 = pentamer

11 = undecamer

17 = heptadecamer*

23-mer

6 = hexamer

12 = dodecamer

18 = octadecamer

etc.