Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
PROTEINELE:
STRUCTURA,
CLASIFICAREA, ROLUL
BIOLOGIC
Silvia Stratulat
Confereniar universitar
OBIECTIVELE:
1.Rolul biochimiei n sistemul de instruire a medicului
5) Colagenul
6) Proteinele fixatoare de Ca
7) Clasificarea proteinelor
BIOCHIMIA:
pentru
DEOSEBIM:
Biochimia
ROLUL BIOCHIMIEI
n domeniul practicii promoveaz progresul :
- cercetrilor medicale;
- diagnosticului clinic de laborator;
- al farmacologiei i farmaceuticii;
- al microbiologiei, virusologiei i imunologiei.
Studiaz:
-compoziia chimic a esuturilor i lichidelor
biologice n condiii fiziologice i patologice,
-corelaiile dintre modificrile metabolice ale diferitor
organe, esuturi i lichide biologice;
-dinamica indicilor metabolici n diverse stri
fiziologice (mbtrnire, efort fizic) i n patologii
PROTEINELE
protos
- primul, de prima
importan
sunt substane organice azotate,
macromoleculare polimere,
monomerii crora sunt aminoacizii unii ntre ei prin
legturi peptidice
PRINCIPALELE
CARACTERISTICI:
1.
2.
3.
4.
5.
ROLUL BIOLOGIC AL
PROTEINELOR:
1.
2.
3.
4.
5.
ROLUL BIOLOGIC AL
PROTEINELOR:
6. reglator i hormonal - reglarea creterii i
diferenierii celulelor (insulina, proteinelerepresor);
7. imunologic: de protecie fa de corpi
strini, virui, bacterii (imunoglobuline);
8. homeostatic meninerea constantelor
sngelui (albuminele determin presiunea
oncotic cantitatea, volumul lichidului n
vasele sanguine);
9. de rezerv, trofic proteinele alimentare.
AMINOACIZII (AA)
sunt
PRINCIPIILE DE CLASIFICARE
A AA:
1.
2.
3.
AA MODIFICAI
AA NEPTOTEINOGENI
-alanina
component al CoA
rnitina - intermediar al ciclului
ureogenetic
Citrulina - intermediar al ciclului
ureogenetic
Homocisteina, Homoserina - intermediari
n metabolismul AA
GABA - neuromodulator
GRADELE DE ORGANIZARE
ALE MOLECULEI PROTEICE
Structura:
primar secundar
teriar
cuaternar
STRUCTURA
PROTEINELOR
STRUCTURA PRIMAR
succesiunea
AA din
lanul polipeptidic
determinat genetic.
este stabilizat de
legturile peptidice
covalente, care se
formeaz la interaciunea
grupei -carboxilice a
unui AA cu -aminogrupa
urmtorului AA.
FRAGMENT AL STRUCTURII
PRIMARE
PROPRIETILE
LEGTURII PEPTIDICE:
este o legtur covalent
coplanarea toi atomii grupelor peptidice se afl
ntr-un singur plan
PROPRIETILE
LEGTURII PEPTIDICE:
2
forme de rezonan
(ceto sau enol)
PROPRIETILE
LEGTURII PEPTIDICE:
poziia
leg C-N
PROPRIETILE
LEGTURII PEPTIDICE:
DETERMINAREA
STRUCTURII PRIMARE
2
etape:
A. determinarea compoziiei AA
B. determinarea succesiunii AA
DETERMINAREA
COMPOZIIEI AA N
PROTEIN
1.
2.
3.
PRINCIPIILE DE DESCIFRARE
A SUCCESIUNII AA-ETAPELE:
Determinarea
acidului N i C terminal
hidroliza selectiv a proteinei (prin metodele
enzimatice (tripsina, chimotripsina, pepsina) sau
chimice (cu bromura cianidic))
identificarea succesiunii AA n fragmentele obinute
prin metoda Edman.
restabilirea structurii primare a proteinelor prin
suprapunerea diferitor segmente de peptide
stablindu-se astfel segmentele de coinciden
(metoda amprentelor digitale sau metoda hrilor
de peptid
SUPRAPUNEREA DIFERITOR
SEGMENTE DE PEPTIDE
PRINCIPIILE DE DESCIFRARE A
AA N I C TERMINAL:
La determinarea AA N-terminal se utilizeaz:
1.
-metoda Sandger (cu fluordinitrobenzol)
2.
- metoda Edmann (cu fenilizotiocianat)
3.
-metoda cu dansyl
4.
- metoda enzimatic (cu aminopeptidaza)
Determinarea AA C-terminal se efectueaz prin:
1.
metoda chimic cu hidrazina (metoda Acabori)
2.
metoda enzimatic (carboxipeptidaz)
3.
folosind reductori: NaBH4 sau LiBH4
METODA EDMANN
Repetarea
metodei: 30-40
AA
Metoda a fost
automatizat cu ajutorul
secveniatorului Edmann.
STRUCTURA SECUNDAR
STRUCTURA SECUNDAR
Dup
PARTICULARITILE DE
BAZA ALE -SPIRALEI:
1.
2.
3.
4.
5.
PARTICULARITILE DE
BAZA ALE -SPIRALEI:
6. regularitatea i
identitatea spirelor:
h unei spire=0,54 nm (5,4A)
i cuprinde 3,6 resturi
de AA
(nlimea unui AA este de
0,15 nm sau 1,5 A).
PARTICULARITILE DE
BAZA ALE -SPIRALEI:
7. Periodicitatea regularitii
-spiralei este egal cu 5
spire sau cu 18 AA.
Lungimea unei perioade
este de 2,7 nm.
AMINOACIZII CE DIMINUIEAZ
FORMAREA ELICEI:
Prezena:
prolinei (atomul de N nu are H i nu e capabil s
formeze legturi de hidrogen intracatenar se
formeaz o ndoire, o ncovoiere n lan)
radicalilor voluminoi (Val, Ile; Asn confer o
strngere steric a elicei)
Ser, Thr gr. OH pot forma puni de H pot servi
ca factori destabilizatori
Glu, Lyz, His, Arg apar fore electrostatice de
respingere sau atragere
-STRUCTUR
are
1.
-structur poate fi
de 2 tipuri:
cross form particip
un singur lan
-structur complet
particip 2 sau mai multe
catene, care poate fi:
paralel (N-terminaiile
catenelor polipeptidice
sunt ndreptate n aceeai
direcie)
antiparalel (N-terminaiile
snt ndreptate n diferite
direcii).
DEOSEBIRILE DE ALFA
SPIRAL :
are form plat
distana ntre 2 resturi de AA este de 3,5 A
punile de H sunt intercatenare dar nu
intracatenare ca la spiral
radicalii AA se orienteaz n ambele pri
ale structurii beta
Met, Val, Ile favorizeaz formarea
structurii plisate, Lys, Ser, Asp - o
destabilizeaz
STRUCTURA TERIAR
reprezint
FORMELE FIBRILAR I
GLOBULAR ALE STRUCTURII
TERIARE A PROTEINELOR
catalase
keratin
collagen
STABILIZEAZ STRUCTURA
TERIAR:
se
I. Legturile covalente:
disulfidice (Cys-SH + HS-Cys --- Cys-S-SCys,
Esterice (Glu-COOH + HO-Ser ----- Glu-CO-OSer
Pseudopeptidice - Glu-COOH + H2N-Lys --Glu-CO-HN-Lys
LEGTURILE CE STABILIZEAZ
STRUCTURA TERIAR:
II. Legturi
necovalente,
slabe
- de hidrogen,
- hidrofobe,
- ionice,
- -forele Van der
Waals (doi atomi
se apropie la o
distan de 3-4 A)
Anume
organizarea n structur
tridimensional confer
proteinelor activitate biologic.
Radicalii AA, care posed
rotaie liber interacioneaz,
catena ciudat se curbeaz n
diferite locuri.
Radicalii
STRUCTURA DOMENIC
domeniu al unei proteine
multidomeniale corespunde unei
poriuni
continue
n
structura
primar a lanului polipeptidic care
este mpachetat ntr-o entitate
funcional i are o organizare
proprie secundar i teriar.
Un
reprezint
DOMENIILE:
regiuni
compacte, rigide cu
organizare teriar
(globular) , separate
ntre ele de
segmente mai puin
rigide care permit
micarea unui
domeniu n raport cu
altul.
DOMENIILE:
sunt
FOLDINGUL
Dup
MOLECULELE CHAPERON
(NOIUNE)
Reprezint
MOLECULELE CHAPERON
(CLASIFICARE)
Dup
CHAPERONINELE:MECANISM DE ACIUNE
-CREAZ UN SPAIU NCHIS UNDE ARE
LOC ASAMBLAREA PRIMAR
- URTILIZEAZA ENERGIA SCINDRII
ATP-ULUI
PROTEINELOR N STRUCTURA
TRIDIMENSIONAL DUCE LA
FORMARE DE PROTEINE:
- toxice - prionii ageni cauzai ai encefalopatii
spongiforme transmisibile, boala CreutzfeldtJacob la om; scarpia la ovine, encefalopatia
spongiform la bovine (boala vacii nebune).
- inactive, care se acumuleaz sub form de
amiloizi amiloidoze - apariia unor structuri
fibrilare lungi asamblate sub form de foi pliate ,
peptidele se agreg genernd amiloidul din
parenhimul cerebral i din jurul vaselor sanguine
(boala Alzheimer, diferite cardiopatii i
polineuropatii)
- care se scindeaz rapid - egal cu insuficiena
unor proteine.
STRUCUTRA
CUATERNAR
aranjarea
MOLECULA HEMOGLOBINEI
CONST DIN 4 PROTOMERI
LEGTURILE CE DETERMIN I
STABILIZEAZ STRUCTURA
CUATERNAR:
legturile
COLAGENUL
1.
2.
PARTICULARITI
STRUCTURALE:
1. Fiecare al treilea AA din caten este
prezentat prin glicin (30%)
2. Fiecare al patrulea - prin Pro i hidroxiPro
(25%)
3. Conine 10% Ala
4. Conine hidroxilizin
5. Coninut redus de Tyr, absena Trp i Cys
Se
(I)PARTICULARITILE
STRUCTURII PRIMARE:
A. Alpha-helix
B.Collagen helix
PARTICULARITILE STRUCTURII
COLAGENULUI (III)
nu posed structur teriar tipic
3 alfa catene spiralate, rsucite mpreun
sub forma unei spirale comune formeaz
tropocolagenul
Tropocolagenul - unitatea structural a
colagenului
este stabilizat de legturi de hidrogen
ntre grupele peptidice din diferite catene
COLAGENUL:
COLAGENUL:
Structura
cuaternar:
aezarea subunitilor de
tropocolagen sub form de
trepte, fiecare molecul fiind
deplasat cu din lungime
fa de moleculele vecine.
Monomerii sunt legai stabil
prin legturi covalente
ncruciate inter i
intramoleculare, care le
confer microfibrilelor
rezisten mecanic.
COLAGENUL:
Prin
asocierea
microfibrilelor se
formeaz fibrilele, iar
din ele - fibra de
colagen.
Colagenul este
proteina care activ
fixeaz ionii de Ca2+.
ORGANIZAREA STRUCTURAL A
COLAGENULUI
CLASIFICAREA
PROTEINELOR
SIMPLE
CONJUGATE
PROTEINELE SIMPLE
(HOLOPROTEINE)
Histonele
localizate n nucleu,
conin AA bazici pn la 30% (Arg,
Lys).
au sarcina pozitiv,
sunt legate electrostatic cu AN.
Rolul: reglarea metabolic a activitii
genomului, funcie structural
ALBUMINELE
principalele P plasmatice.
Albuminele:
1.
mas molecular mic,
2.
PI 4,7,
3.
sarcin negativ,
4.
solubile n ap.
Rolul: determin presiunea oncotic, particip la
transportul substanelor.
-
PROTEINELE CONJUGATE
(HETEROPROTEINE,
PROTEIDE):
1.
2.
3.
4.
5.
6.
Nucleoproteine
Cromoproteine
Fosfoproteine
Lipoproteine
Metaloproteine
Glicoproteine
NUCLEOPROTEINELE
compuse
CROMOPROTEINELE COMPUSE
DIN PROTEIN I PARTEA
NEPROTEIC COLORAT.
Reprezentanii: hemoproteidele (Mb; Hb), sistemul
de citocromi, catalaza, peroxidaza, clorofila.
Rolul:
1.
particip n fotosintez
2.
transportul oxigenului i CO2
3.
reaciile de oxido-reducere
4.
senzaiile de lumin i culoare
MIOGLOBINA
STRUCTUR:
Mb
HEMOGLOBINA
STRUCTUR:
Hb:
STRUCTURA HEMULUI
4
inele
pirolice + Fe
2+ +puni
metinice (,
, , )
4 radicali
metil
2 vinil
2 resturi de
a propionic
MB I HB
Mb protein monomeric
Hb heterotetramer (a2b2)
myoglobin
hemoglobin
FOSFOPROTEINELE: P + ACIDUL
LIPOPROTEINE - PROTEINE +
LIPIDE (FOSFOLIPIDE, ACIZI
GRAI LIBERI, COLESTEROL)
1.
2.
3.
4.
1.
2.
3.
4.
Rolul:
Reprezint constituieni structurali ai celulelor
intervin n permeabilitatea biomembranelor
particip la transportul prin snge i limf a unor
substane liposolubile (vitaminelor liposolubile A, D, E,
K, unor hormoni, medicamente)
furnizeaz energia
n plasma sanguin lipoproteinele se difereniaz n 4
fraciuni pe baza densitii lor:
- chilomicronii (d mai mic ca 0,95)
- cu densitate foarte mic (VLDL) (d mai mic ca
1,006)
- cu densitate mic (LDL) (d mai mic ca 1,065)
- cu densitate mare (HDL) (d mai mic ca 1,2)
GLICOPROTEINELE PROTEINE +
GLUCIDIC (GLUCOZAMIN,
GALACTOZAMIN, A. HIALURONIC,
Rolul:
GLUCOZAMINGLICANI)
1.
2.
3.
4.
5.
Receptori
sunt constituieni plastici ai celulei, intr n
componena membranelor biologice
au rol de protecie a mucoaselor
gastrointestinale, ale aparatului respirator
i urogenital fa de aciunea enzimelor
proteolitice, a unor compui chimici sau
ageni mecanici
sunt componente specifice de grup
sanguin
particip n reaciile imunologice
METALOPROTEINE:
PROTEIN +METAL (FE,
CU, ZN, )
Feritina
II. CLASIFICAREA
PROTEINELOR
proteine
II. CLASIFICAREA
PROTEINELOR
proteine
/b -segmentele i b alterneaz
in structura teriar;
e.) proteine fr organizare secundar
sau b , plierea lanului fiind hotrat numai
de interaciunile intre R;in general sunt
proteine mici ce cuprind un numr relativ
mare de puni disulfurice
PROTEINELE FIXATOARE DE
CA
1.
2.
3.
4.
5.
PEPTIDELE ACTIVE:
Renin/Angiotensina
Peptidele natriuretice
Leptina
Endotelinele
ENDOTELINELE
1.
2.
3.
ENDOTELINELE
Rolul:
1. regleaz
tonusul vaselor
2. particip n patogenia HTA eseniale
3. ET-1 i ET-3 posed efecte
neurologice (n esutul nervos
intensific sinteza
fosfoinozitolfosfatului), provoac
modificri n reaciile de comportare,
efect central cardiorespirator.
4. regleaz starea funcional a
endoteliului, stratului intim arterial i
venos din diferite vase
ENDOTELINELE
PEPTIDELE
NATRIURETICE
1.
2.
3.
SINTEZA:
Primar
ACIUNI FIZIOLOGICE:
vasodilataie
i efect hipotensor,
producerea de natriurez i diurez,
inhibarea sistemului nervos simpatic,
1.
2.
1.
2.
1.
2.
3.
1.
2.
a. ANP
este produs predominant n atriile cardiace
nivelele sanguine sunt ridicate la pacienii cu volum intravascular
ridicat i insuficien cardiac congestiv.
b. BNP
la oameni prezint o concentraie mai mare n cord (mai ales
ventriculi), dect n creier.
BNP este sintetizat ca rspuns la stresul ventricular i creterea
presiunii intraventriculare.
Att ANP ct i BNP:
vasodilataie
reduc tonusul nervos simpatic
induc natriurez prin aciunea asupra vaselor renale i
tubulilor renali.
c. CNP
este distribuit predominant n SNC, rinichi i celulele endoteliale.
are proprieti vasodilatatorii i de inhibiie a factorilor de cretere.