Consideraii generale.
Biochimia se concentreaz n principal pe studiul proteinelor. Aceasta decurge din
faptul c proteinele sunt implicate n cele mai diverse procese celulare mai mult dect ali
biopolimeri. Proteinele se difereniaz prin structura i funcia lor. Cu toat diversitatea
prezint i unele caracteristici comune. Sunt formate din aminoacizi (monomeri) care se
leag prin intermediul legturii peptidice. Ansamblul astfel format se numete polipeptid. Dac depete 50 de uniti este o protein. ntrct aminoacizii sunt componeni
fundamentali este normal s trecem n revist principalele proprieti ale lor. Importana
biologic a aminoacizilor const n funciile specifice pe care le ndeplinesc i a metabolismului individual al fiecrui aminoacid.
AMINOACIZI I POLIPEPTIDE.
n natur numrul aminoacizilor este de @ 300. Muli dintre acetia se gsesc numai n
anumite organisme sau chiar numai n unul.Organismul uman utilizeaz un numr de @
20 de aminoacizi n sinteza proteinelor. n organism pot exista sub forma unei molecule,
dizolvat n protoplasm sau prin legturi covalente cu ali sub form de peptide sau
proteine.
a
Formula general structural a unui aminoacid este: HOOC-RC H-NH2 ,deci formula
unui a- aminoacid conine o grup funcional amino (-NH2) i o grup funcional
a
carboxil (-COOH) legate de acelai atom de carbon C . a- aminoacizi se deosebesc unul
de altul prin structura grupei R. Aceasta poate s fie H ( pentru glicin) sau o grupare mai
a
complex (cum este guanidina n cazul argininei) legat de acelai atom de carbon C .
a- aminoacizi se deosebesc unul de altul prin structura grupei R (vezi i tabelul cu aminoacizi).
n principal pot fi clasificai dup: structura chimic a gruprii R; caracterul polar sau
apolar al gruprii R; caracterul ionic al gruprii R (acid, bazic sau neutru). n unele
proteine se ntlnesc i aminoacizi modificai. Un exemplu major cel al cisteinei n cistin prin oxidarea a dou grupe -SH i formarea unei puni disulfidice -S-S- .
Clasificarea dup structura chimic. (pentru exemple vezi tabelul anex).
1).Alifatici (R este o hidrocarbur pur, nepolari, fr grupri funcionale);
2). Aminoacizi cu grupe hidroxil;
3). Aminoacizi cu grupe -SH;
4).Aminoacizi cu grupri aromatice;
5).Aminoacizi acizi (amino-dicarboxilici), conin o grupare -COOH n plus;
6).Aminoacizi bazici (diamino-monocarboxilici), conin o grupare -NH2 n plus;
7).AMINOACIZI iminici, conin grupa funcional imin.
Proprieti fizice.
Aminoacizii sunt substane solide care se descompun nainte de topire, se dizolv aproximativ n ap, insolubile n solveni polari.
a
Stereoizomeria. Cu excepia glicinei n toi aminoacizii atomul C are patru substitueni
diferii (chitralitatea atomului de carbon). Darorit aceast particulariti structurale
aminoacizii pot s existe n diferite forme izomere care se deosebesc una de alta prin
a
orientarea spaial a grupelor care sunt legate de C . Pentru fiecare atom de carbon
asimetric, n cazul aminoacizilor, se deosebesc dou conformaii (excepie fac treonina i
izoleucina care au mai mai multe), corespunztoare celor dou forme izomere L i D
(care se suprapun numai prin oglindire). Aceast clasificare are importan biologic. n
structurile proteinelor intr numai L-aminoacizi. Forma D apare n aminoacizi liberi.
Dac D i L sunt n echilibru avem forma racemic.
Factorii care prezint importan din punct de vedere structural sunt: grupele ionizabile;
polaritatea, interaciunea (legtura) hidrofob Legtura hidrofob apare cnd structuri
apolare se afl ntr-un mediu polar -de ex. ap- i const n tendina de aglomerare a
moleculei ( restrngere) pentru a reduce la minimum contactul cu apa ( solventul polar).
Echilibrul acidobazic. Disocierea aminoacizilor are loc n modul urmtor:
+
HOOC-(RCH)-NH2 OOC-(RCH)-NH3
Aminoacizi sunt amfioni (ion bipolar, conine att sarcini pozitive ct i sarcini negative).
Din aceast cauz au momente dipolare mari, conin sarcini electrice mari, de semn contrar n regiuni diferite ale moleculei. Funcia acid n cazul formei ionizate este gruparea
+
-NH3 ,conform schemei:
+
Funcia bazic este ionul carboxilat -COO dup schema: -COO --COOH . Pentru
caracterizarea aciditii i bazicitii se folosesc exponeni de aciditate (notai cu pK).
Cantitativ expresia lui pK se obine plecnd de la reacia:
+
forma acid (conjugat) forma bazic (conjugat) +H . Constanta de reacie are forma
+
K=[BAZ][H ]/[ACID]. Prin logaritmare i notnd pK= -log K se obine relaia dintre
pH i pK ( relaia Henderson)
pH=pK+log [BAZ]/[ACID].
Prin dizolvare n ap aminoacizi disociaz att ca baz ct i ca acid. Un aminoacid
prin funciile acid i bazic pe care le cuprinde poate reaciona cu baze cednd protoni i
cu acizi acceptnd protoni. ncrcarea electric a unui aminoacid depinde de pH-ul
soluiei. Dac un aminoacid se afl ntr-o soluie puternic acid gruprile acceptoare de
protoni sunt protonate n totalitate. La titrarea cu o baz tare protoni sunt eliberai n
ordine descresctoare a aciditii funciilor acide. Curba de titrare acid cu baz duce la
+
dou valori ale pK-ului (una pentru gruparea -COOH i alta pentru gruparea -NH3 ); pK
+
@ 2 (pentru gruparea -COOH) i pK@ 9-10 (pentru gruparea NH3 ). (vezi i figura). n
cazul n care disocierea grupelor acide i bazice este egal sarcina total net este zero.
Valoarea respectiv a pH-ului definete punctul izoelectic. Cantitativ pIeste definit de
relaia: pI= (pK1 + pK2 )/2 .
Caracterul acido-bazic al aminoacizilor are o importan deosebit pentru a nelege
multe proprieti ale proteinelor. Aceste proprieti sunt utilizate pentru separarea, identificarea i dozarea aminoacizilor, precum i pentru stabilirea succesiunii lor n proteine.
Propiretile chimice ale aminoacizilor.
La aminoacizi proprietile chimice sunt condiionate n primul rnd de grupele
funcionale caracteristice, carboxil (-COOH) i amino (-NH2), dar i de catenele laterale
(aciclice sau ciclice) pe care pot fi grupate n unele cazuri i alte grupe funcionale.