Explorați Cărți electronice
Categorii
Explorați Cărți audio
Categorii
Explorați Reviste
Categorii
Explorați Documente
Categorii
BIOCHIMIE
Curs 1/06.03.2012
HETEROPROTEIDE
Heteroproteidele sunt cea mai complex clas de protide care se mai numesc i
proteine conjugate deoarece au n structura lor pe lng componenta de natur prioteic
(format numai din aminoacizi) i o component de natur neproteic componenta
prostetic.
Dup natura acestei componente neproteice, heteroproteinele sunt clasificate n 6
clase:
1.Metalproteide: componenta neproteic este un ion metalic: Fe 2+, Fe3+, Cu2+, Co2+,
Mg2+ , Zn2+
Aceti ioni se leag de componenta proteic prin legaturi covalente, dar i covalentcoordinative, formnd o structur de chelat.
Exemple:
feritina = 23% Fe prezent n splin, ficat, maduva osoas, n mucoasa intestinal i
reprezint depozitele de fier din organism;
hemosiderina = 37% Fe se gsete depozitat n sistemul reticulo-endotelial i
contribuie la meninerea n limite fiziologice a nivelului de fier (sideremia);
ceruloplasmina se gsete n plasma sanguin, conine cupru i are rol n transportul
cuprului n organism;
transferina conine cupru, zinc i fier i se gsete n plasma sanguin;
azurina conine cupru i este prezent la bacterii.
2.Fosfoproteidele sunt acele heteroproteide la care componenta prostetic este un
radical (-PO3H2) al acidului fosforic. Acest radical se leag de componenta proteic prin
intermediul a 2 aminoacizi: serina i rezult fosforilserina
treonina i rezult fosforiltreonina
Exemple:
Cazeinele sunt principalele fraciuni proteice din lapte (cele mai importante
heteroproteine din lapte) care se gsesc n proportie de 87%. Au fost separate prin
electroforez 4 fractuni cazeinice : , , si K, cazeine care difer ntre ele prin coninutul
n fosfor. Cazeinele variaza de la o specie la alta din punct de vedere compozitional, nsa la
toate speciile, n lapte, 90% din cazeina se gsete sub form coloidal (micele de cazein),
iar restul de 10% este cazein solubil care se gsete sub form de mici agregate. Aceste 2
forme ale cazeinei se gsesc n permanen ntr-un echilibru meninut de prezena ionilor de
calciu n lapte. Cazeinele la fierbere nu coaguleaz aceasta constituind o particularitate.
Coagularea cazeinelor se face numai sub aciunea bacteriilor lactice sau a unor enzime
cheagul.
Din punct de vedere nutritiv, cazeinele sunt proteine complete deoarece conin toi
aminoacizii eseniali.
Vitelinele sunt fostoprotidele din glbenu i conin foarte mult serin i furnizeaz
fosforul i aminoacizii eseniali necesari dezvoltrii embrionului.
3.Glicoproteidele la care componenta neproteic este o substan de natur glucidic
(oz, diglucid, poliglucid).
TININA (T)
CITOZINA(C)
URACIL (U)
RADICAL AL ACID.
FOSFORIC -PO3H2
PENTOZA
DEOXIRIBOZA
RIBOZA
(ADN)
(ARN)
Biochimie
Curs 3/20.03.2012
Structura acizilor nucleici
Nucleotidele sunt formate din baza azotat + pentoza i aceasta (pentoza) esterificat
cu H3PO4 la atomii de C din poziiile 3 si 5 ( dac sunt deoxicarbonucleotide ) sau
esterificate cu H3PO4 la atomii ce C ai pentozei din poziiile 2, 3, 5 dac sunt
ribonucleotide. De aceea nucleotidele pot fi mono-, di- sau tri- fosforilate. Exemplu de
nucleotid monofosforilat: adenina + deoxiribofuranoza + 3 H3PO4
AcetilCoA este compusul macroergic care se obine ca produs comun att n urma
degradarii glucidelor ct i n urma degradarii lipidelor i proteinelor. Rezult c AcetilCoA
este punctul nodal comun al tuturor celor trei tipuri de catabolism.
Structura, localizarea i rolul AND-ului
AND are doua tipuri de structuri
a) primar
b) secundar
Structura primar este reprezentat de tipul, numrul i secvena de baze azotate
constituente ale mononucleotidelor. Monocucleotidelel d- AMP, d- GDP, d- CMP, d- TMP
Fiecare mononucleotid monofosforilat se leag de urmtoarea printr-o legtur de tip ester
10
11
BIOCHIMIE
Curs 4/27.03.2012
ARN
Spre deosebire de ADN, ARN-ul are doar structur primar fiind format dintr-o
singur caten poliribonucleaotidic, caten care cuprinde un numar variabil de uniti
structurale de baza, respectiv de ribonucleotide.
Fiecare ribonucleotid are n loc de deoxiriboz riboza i n loc de baz azotat timin
are uracil.
Legarea bazei azotate de -riboz se face n aceai manier la C 1 ca i la ADN, iar
legarea ribonucleotidului de un altul dup el se face tot n poziia 3, 5 fosfodiester.
Cele 4 ribonucleotide prezente ntr-o catena de ARN sunt : AMP, GMP, CMP, UMP,
etc. (ADP, ATP)
Localizarea, tipurile de ARN i funcia lor:
-ARN-urile se gsesc localizate n citoplasm i o cantitate mic i n nucleu.
Orice celul de la orice specie include trei tipuri de ARN:
-ARN ribozomal ARNr reprezint 75% - 85% din masa ARN-ului celular. Se
gsete combinat cu proteinele sub form de complexe numite ribozomi. Ribozomii conin
65% ARN si 35% proteine i reprezint locul de biosintez a proteinelor, contribuind astfel la
traducerea mesajului ereditar adus de la ADN de ctre ARN mesager. Prin traducerea acestui
mesaj din citoplasm de ctre ARN transport i care vor forma proteinele noi sintetizate.
-ARN mesager ARNm (ARNi) este o macromolecul monocatenar n care
secvena bazelor azotate, respectiv a nucleotidelor este similar cu cea de pe o catena de
ADN. ARNm este sintetizat n nucleul celular prin transcrierea (copierea) secvenei de
nucleotide de pe ADN cu deosebirea ca T va fi inlocuit cu U n ARNm. Rezult c una din
cele doua catene ale ADN-ului funcioneaz ca matrice (tipar) pentru sinteza ARNm.
Prin sinteza acestui ARNm mesajul ereditar codificat n secvena de nucleotide din
ADN este transcris n secvena de nucleotide a ARNm (fenomenul se numete transcripie).
Pentru scurt timp va exista o molecula hibrid ADN-ARNm dublu spiralat, helicoidal,
unde informaia ereditar de pe ADN a fost copiat pe ARNm pe baza legii
complementritaii bazelor azotate.
Catena de ARNm format va transmite informaia ereditar din ADN la ribozomi unde
se afl locul de biosintez a proteinelor i unde secvena de nucleotide din ARNm este
tradus n secvena de aminoacizi care vor forma o protein.
-ARN transport ARNt (ARN transfer) reprezint poliribonucleotide cu molecule
mici, mult mai mici dect ARNm si ARNr. Structura lui este tot monocatenar i nu este
asociat cu proteinele, este solubil n citoplasm i rolul lui e acela de a lega specific
aminoacizii liberi din citoplasm i de ai transporta (transfera) la ribozomi.
O molecul de ARNt poate s lege cca. 20-22 aminoacizi. Se spune c ARNt
functioneaz ca izoreceptor pentru diferii aminoacizi din citoplasm, dar i ca adaptor, adic
12
13
14
BIOCHIMIE
Curs 5/10.04.2012
Enzime allosterice (reglatoare)
Sunt enzime care pe lng situsul catalitic de pe apoenzim conin i un situs
allosteric, de care se cupleaz anumii efectori ce pot fi activatori sau inhibitori pentru
enzim.
Dac la situsul allosteric se ataeaz un efector activator, acesta va determina (va
modula) tranziii spaiale optime ale moleculei de enzima, astfel nct substratul de reacie s
se potriveasc ct mai bine la situsul catalitic i s fie transformat n produi.
Dac la situsul aloosteric se cupleaz un efector inhibitor pentru enzim, acesta va
determina distorsiuni ale conformaiei spaiale ale enzimei astfel nct substratul nu se mai
potrivete la situsul catalitic al enzimei i astfel nu mai este posibil reacia.
Schema de funcionare a efectorilor allosterici:
Mecanismul prin care un efector allosteric acioneaza ca activator sau inhibitor pentru
o enzim allosteric se numete mecanism de feed-back (retroinhibiie sau inhibiie prin
produs final). El const n: fie un ir de reacii n care substratul A este transformat n B , B n
C i C n D, numai prima reacie de transformare a lui A n B este catalizat de o enzim
allosteric:
A EA B E1 C E2 D
Dac celula unde are loc reacia constat c s-a produs prea mult compus D atunci
acest produs D devine inhibitor allosteric (efector) pentru enzima EA, aceasta i va modifica
conformaia spaiala, substratul A nu va mai accede la situsul ei catalitic i nu va mai fi
transformat n B.
15
complex
enzima-substrat
dS
dt
=+
dP
dt
= K[S]n
16
-pH-ul. S-a constatat c fiecare enzim are un pH optim la care activitatea ei este
maxim i n afara cruia activitatea enzimatic este mult diminuat.
-efectorii enzimatici sunt substane chimice ce pot fi activatoare sau inhibitoare
pentru enzime. Ex: ionii Cl si Mg sunt activatorii, iar metalele grele sunt inhibitori.
Clasele de enzime
In nomenclatura internaional, ca urmare a hotrrii luate de Comisia de enzime a
Uniunii Internaionale de Biochimie, enzimele au primit un numar de cod de forma :
EC W. XYZ
Unde: EC = Comisia de Enzime
W = clasa enzimatic
X = subclasa enzimatic
Y = numrul substratului specific asupra cruia acioneaz enzima (nr. coenzimei)
Z = numrul de ordine al enzimei.
In funcie de substratul asupra cruia acioneaz, exist 6 clase mari de enzime:
1.Oxidoreductaza: catallizeaz reacii de oxidoreducere care decurg cu transfer de
hidrogen, de electroni sau de oxigen, ntre un reductor i un oxidant.
2.Transferazele: catalizeaz reacii de transfer a unor grupari chimice de la un substrat
donor la un substrat acceptor.
3.Hidrolaze: catalizeaz reacii de rupere a moleculelor de substrat sub aciunea apei.
4.Liaze: catalizeaz reacii de scindare a legturilor C-C, C-O, C-N, C-S fr
participarea apei.
5.Izomeraze: catalizeaz reacii de izomerie de regrupare intramolecular a atomilor
sau grupelor de atomi din moleculele unui substrat.
6.Ligazele sau sintetazele: catalizeaz reacii de formare a unor legturi chimice cu
consum de ATP.
17
BIOCHIMIE
Curs 6/22.05.2012
Oxidoreductaze
Oxidoreductazele sunt acea clas de enzime care catalizeaz reacii de oxido-reducere,
adic reacii prin transfer de:
a) hidrogen se numesc dehidrogenaze;
b) electroni se numesc transelectronaze;
c) reacii de combinare a unui substrat cu oxigenul se numesc oxigenaze.
a) Dehidrogenazele
Sunt acea clasa de oxidoreductaze care transfer hidrogen ntre substrat i produsul
final, acest lucru fcndu-se prin intermediul unor coenzime.
Coenzimele dehidrogenazelor sunt:
-derivai de la vitamine care conin n plus o pentoz i o baz azotat adenina.
Aceste coenzime sunt:
1. NAD+ - forma oxidata i NADH(H+) forma redus.
N = vitamina PP (niacina)
A = adenina
D = dinucleotid
Reacia general catalizat de o oxidoreductaz (dehidrogenaza) care are drept
coenzima NAD este:
SH2 + NAD+
substrat coenzima
redus
f.oxidat
dehidrogen
aza
S
+
substrat
oxidat
NADH(H+)
coenzima
f.redus
18
dehidrogen
aza
S
+ FADH2
substrat
coenzima
oxidat
f.redus
Structura chimica a FAD este: adenin, riboz, 2 acizi fosforici (H 3PO4) + vitamina
B2.
19
b) Transelectronazele
Sunt acea clas de oxidoreductaze a cror coenzim transport electroni de pe un
substrat donor pe un substrat acceptor. Structura chimic a acestei coenzime deriv de la
hem, avnd ioni de Fe2+ si Fe3+ i putnd astfel s accepte i s cedeze electroni.
Exemple de astfel de coenzime: citocromii (cit). Citocromii sunt foarte importani n
metabilism, n procesul de respiraie celular (lanul transportor de electroni i H) cnd aceti
citocromi transport electroni de pe substraturi reduse (SH 2) pe oxigenul molecular (O2) pe
care-l activeaz i care cu H tot de pe substraturile reduse formeaz ap i o cantitate mare de
energie pe care celula o convertete n ATP. Acest proces de respiraie celular este n
continuarea ciclului Krebs care este punctul comun al celor 3 forme de catabolism: lipidic,
glucidic i protidic.
Reacia general catalizat de o transelectronaz care are drept coenzim citocromii
este:
cit(Fe3+) + 1 ecit(Fe2+) 1ecoenzima substrat
coenzima substrat
redus
oxidat
oxidat
redus
c) Oxigenazele
Sunt oxidoreductaze care catalizeaz ncorporarea de O 2 de ctre o molecula de
substrat, sau pot realiza transferul de electroni direct pe O2 i se numesc oxidaze.
Exemple de astfel de oxigenaze sunt:
-superoxid dismutaza (SOD) catalizeaz trasformarea sau dismutaia anionului
superoxid O 2 n H2O2 (ap oxigenata) i O2;
-catalaza
} sunt oxigenaze care catalizeaz reacii de transformare a H2O2 n
-peroxidaza
} H2O i O2