Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Enzimele (din limba greac - zymosis - ferment) sunt proteine sau proteide fr de care celule
vii nu pot nfptui reacii complexe ntr-un timp scurt, la temperatura mediului nconjurtor.Ele sunt
substane care catalizeaz reaciile biochimice din organism, avnd un rol esenial n biosinteza i
degradarea substanelor din materia vie, ntlnindu-se n toate organismele animale, vegetale i n
microorganisme, mai fiind denumite din aceast cauz biocatalizatori.
Fr enzime , procesele biochimice s-ar desfura cu viteze foarte mici.
Reaciile chimice ce au loc n organismele vii,n condiii de presiune i temperatur relativ joase
i pH bine definit nu se pot realiza, la vitezele apreciabile care le caracterizeaz, dect admind
intervenia unor catalizatori
Numrul enzimelor este de ordinul miilor cci, n lumea vie, fiecrei molecule organice,
existente aici, trebuie s-i corespund cel puin o enzim, care s participe la sintez i/sau degradarea
ei.
Nomenclatura
Aceasta se bazeaz pe 2 factori:
Numarul de cod este format din 4 cifre precedate de prescurtarea EC (Enzyme Comission),
acestea indicand:
natura donorului;
natura acceptorului;
Clasificarea enzimelor
1.Dupa structura:
Oxidoreductaze
Transferaze
Izomeraze
Liaze
Ligaze
Hidrolaze
oxydo-reductase (E.C.1) ;
1.1-alcool;
1.2-aldehide sau cetone;
1.3-catene hidrocarbonate;
1.4-amina primara;
1.5-amina secundara;
1.6-formele reduse ale coenzimelor p 313c26d iridinice,
1.7-alti compusi azotati.
Cifra a treia se refera la acceptorul d
Transferaze
AX + B A + BX
enzymes transfera un-carbon group (methyltransferase)
EC 2.2 transfera aldehyde sau cetone
EC 2.3 include acyltransferases
5
lyases (E.C.4)
Scindeaza legaturi carbon-carbon decarboxylases (EC 4.1.1),
aldehyde lyases (EC 4.1.2),
oxo acid lyases(EC 4.1.3) EC 4.2 carbon-oxygen ,dehydratases
EC 4.3 carbon-nitrogen
EC 4.4 carbon-sulfur
EC 4.5 carbon-halide
EC 4.6 phosphorus-oxygen, adenylate cyclase et guanylate cyclase
EC 4.99 include alte lyase, ferrochelatase
isomrases (E.C.5)
EC 5.1 include enzyme care catalyzeaza racemizare (racemases) si epimerizare (epimerases)
EC 5.2 includes enzyme care catalyzeaza isomerizarea geometric isomers (cis-trans
isomerases)
EC 5.3 include intramolecular oxidoreductase
EC 5.4 include intramolecular transferase (mutases)
EC 5.5 include intramolecular lyase
EC 5.99 include alte isomerase (incluzand si topoisomerases)
Structura enzimelor
Enzimele sunt proteine globulare putand avea o structura:
unitara - enzime monocomponente, alcatuite numai din aminoacizi: tripsina, chimotripsina,
pepsina, lipaza, ribonucleaza;
binara - enzime alcatuite dintr-o parte proteica (apoenzima) si o grupa neproteica, definite de
Euler astfel:
Holoenzima = Apoenzima + Cofactor
Studiul structurii enzimelor s-a realizat prin tehnici exacte: difractie de raze X, dicroism circular,
fluorescenta, analize in UV si IR, RMN, spectrometrie Raman etc.
Apoenzima fiind proteina are toate nivelurile structurale. Structura primara este stabila,
determinata de secventa aminoacizilor din lantul polipeptidic. Structura secundara reprezinta procentul
de configuratie spatiala -helix (in special) stabilizat prin legaturi de hidrogen.
Structura tertiara se refera la asamblarea formelor elementare in spatiul tridimensional si plierea
catenelor polipeptidice.
9
Structura cuaternara apare la majoritatea enzimelor care sunt alcatuite din mai multe catene
polipeptidice identice (enzime homomultimerice) sau diferite (enzime heteromultimerice), asocierea
protomerilor facandu-se prin legaturi de hidrogen, interactiuni electrostatice, forte Van der Waals.
Ca orice proteina, enzimele se pot denatura ca urmare a unor modificari la nivelul structurilor
secundara si tertiara.
Componenta proteica a enzimelor se caracterizeaza prin urmatoarele:
sunt termostabili;
sunt dializabili;
sunt indispensabili pentru desfasurarea activitatii enzimei;
confera specificitatea de reactie pentru o enzima;
intervin in reactie inducand conformatia optima a enzimei, favorizand aranjamentul
adecvat reactiei sau transferand electroni sau grupe chimice.
10
Sisteme multienzimatice
Exista cai metabolice in care toate enzimele ce catalizeaza reactii individuale sunt asociate sub
forma unor sisteme multienzimatice (enzime polifunctionale). Acestea sunt sisteme proteice
complexe capabile sa foloseasca mai multe coenzime diferite. Sunt fixate prin legaturi slabe, in ordinea
corespunzatoare intrarii in actiune, pe o proteina centrala, ce poate fi chiar una dintre enzime.
Izoenzime
O parte din enzimele care au structura cuaternara se prezinta sub mai multe forme moleculare,
denumite izoenzime. Toate catalizeaza aceeasi reactie, dar cu viteze diferite.
Structural difera prin raportul in care sunt asociate lanturile de baza. Acestea sunt codificate de
gene diferite si se sintetizeaza in cantitate diferita in diferite tesuturi.
De exemplu, lactat dehidrogenaza este un tetramer ce prezinta cinci izoenzime care pot fi
separate prin electroforeza. Exista doua tipuri de lanturi polipeptidice M (muscle=muschi) si H
(heart=inima). Are doua forme parentale cu toate cele patru catene identice LDH1 (H4) si LDH5 (M4) si
trei forme hibride rezultate prin combinarea catenelor: LDH2 (H3M), LDH3 (H2M2), LDH4 (HM3). Tipul
de asociere a monomerilor este in functie de localizarea celulara a enzimei si de calea metabolica
particulara in care este integrata in tesuturi.
LDH1 predomina in miocard, LDH5 in ficat si musculatura scheletica, in timp ce formele hibride
sunt distribuite diferit la aceste niveluri si in alte tesuturi (plamani, rinichi, elemente figurate, splina,
creier, etc).
Mecanismul reactiei
Enzima formeaz cu substratul un produs intermediar
reactiv, cu o via scurt. Sub aceast form intermediar,
substratul intrat n reacie sufer modificri electronice sub aciunea centrilor activi ai enzimei, rezultnd
produsul de reacie.
11
12
Situs activ
Van
grupe
Exista mai multe ipoteze referitoare la recunoasterea moleculara dintre substrat si enzima:
13
Enzimele allosterice prezinta doua situsuri: situsul catalitic la care se leaga substratul si
situsul allosteric la care se leaga efectorul allosteric, activator sau inhibitor
Specificitatea enzimelor
Specificitatea de actiune a enzimelor este o caracteristica esentiala a acestora conferita de
componente. Aceasta este unul dintre cele mai remarcabile atribute biologice care stau la baza
coordonarii proceselor biochimice.
Diversele forme de manifestare a specificitatii enzimelor pot fi incadrate in doua categorii:
specificitatea de reactie;
specificitatea de substrat.
14
Temperatura
pH
Concentratia substratului
Concentratia enzimei
Concentratia ionilor
15
Influenta temperaturii
Efectul temperaturii asupra activitatii enzimelor este rezultanta actiunii a doi factori opusi,
cresterea vitezei de reactie cu temperatura si denaturarea termica a enzimelor. Activitatea oricarei
enzime variaza cu temperatura,
Influenta pH-ului
activ
pH-
Pentru enzimele din organismul uman, pH-ul optim de actiune este pH-ul
normal al mediului in care ele isi manifesta actiunea catalitica Centrul
al enzimelor contine grupe ionizabile, acide sau bazice, deci modificarea
ului are ca efect modificarea gradului de disociere si, implicit,
modificarea vitezei de reactie.
Mecanismul de actiune al enzimelor
Enzimele actioneaza
activare si nu prin cresterea
combinandu-se cu substratul
trecerea acestuia in starea de
formate ES si EP sunt
punctelor minime in diagrama
si P.
Viteza de reactie se masoara prin cantitatea de substrat transformata in produsi de reactie intr-o
unitate de timp
Afinitatea enzimei pentru substrat este data de constanta Km, Michaelis Menten ( in cazul
enzimelor cu un singur situs activ)si reprezinta concentratia de substrat pentru care viteza de reactie
este din viteza maxima
16
Cu cat Km este mai mare , cu atat afinitatea pentru substrat a enzimei este mai mica
( ex. Proteazele )
Cu cat Km este mai mica , cu atat afinitatea pentru substrat a enzimei este mai mare
( ex. Peroxidazele )
Reglarea activitatii enzimatice
Activarea sau inactivarea activitatii enzimatice se poate face prin fosforilare sau defosforilare
( ex. In prezenta ATP sau GTP )care modifica conformatia enzimei
Activatori ai unor proenzime. Forma inactiva a enzimei se numeste proenzima sau zimogen, in care
centrul activ al enzimei este mascat. Prin eliminarea unei parti din molecula, centrul activ este
demascat, enzima devenind activa
Inhibitori enzimatici
Reprezinta acele substante care diminueaza viteza catalizata de enzima, fie legandu-se de
enzima impiedicand legarea substratului la situsul enzimatic, fie determina modificarea conformationala
a enzimei care astfel devine inactiva.
17
Inhibitia enzimatica
Inhibitia enzimatica a fost clasificata in moduri diferite:
Efectul net al inhibitiei ireversibile este scaderea concentratiei enzimei active. Inhibitia
ireversibila este de tip incompetitiv.
Afinitatea inhibitorului pentru enzima se exprima prin Ki, constanta de inhibitie si care reprezinta
din numarul situsurilor active care au fost ocupate de inhibitori.
Se exprima in mol/litru
Inhibitie reversibila competitiva---->
Inhibitia competitiva
Inhibitorul competitiv prezinta analogie structurala cu substratul, avand
astfel afinitate pentru situsul catalitic al enzimei si deci apare o competitie intre
enzima si substrat pentru ocuparea situsului catalitic. Legatura prin care se
leaga inhibitorul este de aceeasi natura cu cea prin care se leaga substratul.
Este o inhibitie reversibila, deoarece prin cresterea concentratiei de
substrat se indeparteaza inhibitorul competitiv de la situsul catalitic, legarea
inhibitorului competitiv la enzima fiind reversibila.Actiunea unor medicamente se
datoreaza faptului ca sunt inhibitori competitivi De exemplu, sulfanilaminda isi
exercita actiunea bacteriostatica prin inhibitie competitiva. Sulfanilamida este
asemanatoare structural cu acidul p-aminobenzoic, pe care il poate inlocui in
timpul sintezei acidului folic de catre bacterii pentru care este factor de crestere.
In lipsa acidului folic bacteriile mor. In terapia cancerului se utilizeaza analogi
structurali ai bazelor purinice si pirimidinice, ce inhiba sinteza acizilor nucleici,
impiedicand diviziunea celulara care este mult mai rapida la celulele tumorale.
18
Inhibitor necompetitiv
Inhibitorul se leaga de enzima dupa fixarea substratului
Legarea substratului de enzima determina modificari
conformationale ale enzimei, creand-se un sit de legare pentru
inhibitor
Legarea inhibitorului produce modificari ale enzimei impiedicand
formarea produsilor de reactie
fiind
Inhibitie mixta
Reprezinta o combinare dintre inhibitiile precedente, caracterizata prin aceea ca inhibitorul se
poate lega concomitent atat de enzima libera cat si de complexul enzima substrat, dar cu afinitati
diferite
Inhibitie ireversibila
19
Retroinhibitia
Este un caz special al inhibitiei allosterice in care
inhibitorul este chiar produsul final al caii metabolice (inhibitie
feed-back). In cazul unei succesiuni de reactii de tipul
prezentat, o acumulare excesiva de produs final in celule
determina, prin mecanism allosteric, inhibitia enzimei E1 ce
actioneaza in prima etapa. Procesul este oprit la restabilirea
concentratiei normale de produs final.
Feed back inhibitia
Produsul final inhiba calea metabolica de sintetizare a
acestuia negativ feed back, sau o poate accelera, pozitiv feed
back
20