Sunteți pe pagina 1din 7

CURS II VIAA DIN SOL

Microflora din ncrengtura procariot cuprinde microorganisme celulare


caracterizate printr-un nucleu distinct n form de sfer, bastona sau halter, foarte mic (0,2 0,4 microni), reprezentnd 5-16 % din volumul celulei, denumit nucleoid, corpuscul cromatic
sau cromozom.
n microflora procariot au fost incluse bacteriile (printre care au fost clasificate i
actinomicetele - alt dat considerate forme de trecere ntre bacterii i fungi - i cianoficeele alt dat clasificate ca alge albastre printre celelalte alge).
Microflora eucariot este reprezentat de microorganisme mono i pluri celulare cu nucleu
distinct.
ncrengtura Procariotae
n aceast ncrengtur sunt cuprinse bacteriile. Winogradsky (1949) a deosebit n
microflora solului dou grupe mari: microflora autohton, humivor, cu activitate
continu, format din coci de 1 , coci de 2 , colonii compacte capsulate de coci de 1 , cu
aspect meristematic, dar mai ales voaluri rezistente compuse din bastonae minuscule
(Bacterioderma), care oxideaz materia humic a solului i microflora zimogen, care atac
i descompune diferite alimente organice din sol i deci, activitatea lor este legat de aportul
acestora n sol. Se observ, deci, c coloniile de microflor autohton sunt nserate la flocoane
de gel organic, n timp ce zimogenele se nmulesc liber n soluia solului.
Clasificarea bacteriilor ntr-un sistem coerent a fost realizat n anul 1923, de un grup
de specialiti din cadrul Societii Bacteriologice Americane condus de D. Bergey. Lucrarea sa bucurat de recunoatere unanim, numindu-se Bergeys Manual of Determinative
Bacteriology. Adncirea cunotinelor n taxonomia bacteriilor a fcut ca acest determinator
s fie mereu actualizat n pas cu nivelul cercetrilor de specialitate ( 8 ediii).
Diviziunea I. Cyanobacteria. Detaliile vor fi date la descrierea algelor.
Diviziunea II. Bacteria cuprinde organisme unicelulare procariote.
Prezentm, n cele ce urmeaz, noua clasificare a bacteriilor, din care a disprut
gruparea lor n ordine i familii, rmnnd clasificarea n: grupe, subgrupe, genuri, specii i
biovarieti. Prezentm selectiv grupele, genurile i speciile care triesc n sol.
Grupa 2. Bacterii Gram-negative, vibrioide / helicoide, mobile, aerobe /
microaerofile, din care remarcm, genul Azospirillum, cu speciile: A. amazonense, A.
brasilense, A. lipoferum. Aceste bacterii sunt recunoscute c sunt slabe fixatoare de azot
molecular i se ncearc utilizarea lor ca biopreparate menite s stimuleze productivitatea
plantelor agricole. Azospirillum lipoferum a fost descoperit de Beijerinck, n 1923, celelalte
specii fiind identificate n ultimii 30 de ani.
Grupa 4. Coci i bastonae microaerofile / aerobe, Gram-negative. Aceasta
cuprinde mai multe genuri:
Genul Agrobacterium, cu speciile: A. tumefaciens (patogen pentru plante) care
formeaz tumori pe rdcini i coletul plantelor i A. radiobacter (nepatogen). Acestea se
izoleaz adeseori, pe medii de cultur, odat cu Bradyrhizobium sp. i Rhizobium sp., care
sunt bacterii simbiotice formatoare de nodoziti pe rdcinile plantelor leguminoase
(Fabaceae).
Genul Azomonas cuprinde speciile: A. agilis, A. insignis, A. macrocytogenes, care
1

fixeaz pn la 10 mg N2 / g de glucoz consumat.


Genul Azotobacter, cea mai eficient bacterie fixatoare de azot molecular dintre
bacteriile nesimbiotice fixeaz cel puin 10 mg N2 / g de glucoz consumat fiind foarte
rspndit n solurile fertile.
Genul Bradyrhizobium cuprinde, din 1994, ca specie definit taxonomic, numai
specia B. japonicum (pentru soia). Celelalte specii recunoscute au primit, deocamdat, numele
dup planta gazd: B. vigna (pentru fasoli), B. lupini (pentru lupin). Aceste bacterii
formeaz nodoziti pe rdcinile plantelor leguminoase specifice cu care stabilesc relaii
simbiotice i fixeaz azot molecular (atmosferic).
Genul Flavobacterium este rspndit n sol, ape, alimente i spitale. Speciile din sol
sunt saprofite.
Genul Pseudomonas, cu speciile: Ps. aeruginosa, Ps. fluorescens, cu 5 biovarieti i
Ps. stutzeri. Alte specii sunt i patogene.
Genul Rhizobium cuprinde speciile de bacterii simbiotice din nodozitile unor plante
leguminoase (cu specificitate de grup), fixatoare de azot molecular: Rh. leguminosarum
(pentru mazre), cu biovarietile: viciae (mzriche), trifolii (trifoi) i phaseoli (fasole);
Rhizobium loti (ghizdei) i Rhizobium meliloti (lucern).
Grupa 7. Bacterii care dezasimileaz sulfaii sau reduc sulful. Acestea au rol n
circuitul sulfului n sol, n anaerobioz.
Grupa 12. Bacterii aerobe chemolitotrofe care oxideaz sulful, avnd rol n
circuitul sulfului din sol, n condiii aerobe.
Subgrupa 1. Genul Thiobacillus, specia T. thioparus triete n sol, n condiii de
anaerobioz, unde sulful oxidabil este abundent (ca H2S din sedimente sau n suprafeele
tratate cu ape uzate).
Subgrupa 3. Bacterii nitrificatoare.
Secia A. Bacterii care oxideaz nitrii, cu genurile: Nitrobacter, cu specia N.
winogradskyi; celelalte genuri triesc n mri i oceane: Nitrospira gracilis; Nitrococcus
mobilis, Nitrospira marina.
Secia B. Bacterii care oxideaz amoniacul.
Genul Nitrosococcus nitrosus triete n sol i n apa mrilor;
Genul Nitrosospira briensis triete n sol i poate utiliza ureea ca surs de NH3.
Grupa 15. Bacterii curgtoare care nu fructific, nefotosintetizante.
Subgrupa 1. Bacterii unicelulare, form de bastona care se prelinge
(alunectoare) cu:
Genul Cytophaga. In sol se gsete C. hutchinsonii.
Genul Sporocytophaga. In sol se gsete S. myxococcoides.
Grupa 18. Coci i bastonae Gram-pozitive care formeaz endospori.
Genul Bacillus, cu specii din sol: B. subtilis i B. Cereus.
Genul Clostridium. Se apreciaz c cuprinde 100 de specii pe care determinatorul nu
le descrie. Aceste bacterii sunt uor de recunoscut datorit formei celulei, n stadiul de
sporulare, cnd celulele sunt umflate la captul unde se formeaz sporul.
Grupa 20. Bastona e neregulate, Gram-pozitive, care nu sporuleaz.
2

Genul Arthrobacter, cu specia A. globiformis, care trieste n sol.


Genul Cellulomonas, cu specia C. flavigena, care de asemenea triete n sol.
Grupa 21. Mycobacteria. Genul Mycobacterium, a crui specii sunt greu de
difereniat de alte genuri ca: Corynebacterium, Nocardia, Rhodococcus, care au asemnare cu
Mycobacterium tuberculosis.
Grupele 22 - 29 cuprind Actynomicetes.
Grupa 22. Actinomicete nocardioforme.
Subgrupa 1. Bacterii care con in acizi micolitici.
Genul Nocardia este larg rspndit n sol prin specia N. asteroides. Unele specii sunt
oportunist-patogene.
Genul Rhodococcus cu specia R. rhodochrous, care este larg rspndit n sol.
Subgrupa 2. Pseudonocardia.
Genul Actinobispora, n sol este specia A. yunnanensis
Genul Actinopolyspora, n sol este specia A. thermophila.
Subgrupa 3. Nocardioides i Terrabacter
Genul Nocardioides. n sol se gsete N. albus.
Genul Terrabacter. n sol se gsete T. tumescens
Grupa 25. Streptomycetes
Genul Streptomyces. n sol este S. albus. Alte specii sunt patogene pentru om i
animale. Diferenierea este dificil ntre specii.
Grupa 31. Methanogenes
Subgrupa 1. Genul Methanobacterium. In sol i sedimente este specia M.
formicicum. Amoniacul poate fi ca unic surs de azot i sulfurile ca surs de sulf. Sulful
poate fi redus la sulfur. Bacteriile sunt strict anaerobe.
O nou ncercare de clasificare a bacteriilor a fost dat publicitii, prima dat n
1982, de Margulis. Ediia a treia, aprut sub denumirea de Five Kingdoms = 5 regnuri, n
1998 avnd ca autori pe Margulis i Schwartz. n acest nou determinator de bacterii s-a
asimilat denumirea de Bacteria n locul celei de Procariotae sau Monera, folosite n prima i
a doua ediie. Noua clasificare se bazeaz numai pe compararea secvenei genelor n molecula
ribozomal a ARN, pentru a distinge legturile dintre speciile de bacterii. Aceast a treia
ediie clasific speciile deja catalogate i larg recunoscute, cuprinse n Determinatorul Bergey
din 1994, care a inut seama la clasificare, pe lng o serie de nsuiri morfologice i
biochimice i de caracteristicile genetice.
n clasificarea Five Kingdoms, Kingdom Bacteria (Regnul bacterii) cuprinde toate
organismele cu structur procariot i se mparte n :
- subregnul Archaea, cu 3 diviziuni: 1. Mendosicutes; 2. Gracilicutes; 3. Firmicutes.
Diviziunea Mendosicutes cuprinde 2 filumuri ( ncrengturi):
B-1. Euryarcheota (bacterii metanogene i halofite), cu exemple de genuri: Methanobacillus,
Methanobacterium, Methanococcoides, Methanococcus etc.
B-2. Crenarchaeota (bacterii termoacidofile), cu exemple de genuri: Desulfurococcus,
Thermophilum, Thermoplasma etc.
Diviziunea Gracilicutes cuprinde 6 filumuri:
B-3. Proteobacteria (bacterii purpurii), cu exemple de genuri: Acetobacter, Actinobacillus,
Agrobacterium, Alcaligenes (Achromobacter), Azotobacter, Beijerinckia, Bradyrhizobium,
3

Nitrobacter, Pseudomonas, Rhizobium, Nitrosomonas etc.


B-4. Spirochaetae - nu sunt specifice solului.
B-5. Cyanobacteria (bacterii fotosintetizante).
B-6. Saprospirae, cu exemple de genuri: Cytophaga, Flavobacterium, Sporocytophaga
B-7. Chloroflexa, nu se regsesc ca bacterii de sol.
B-8. Chlorobia, nu se regsesc ca bacterii de sol.
Diviziunea: Firmicutes, cu filumurile:
B-9. Aphragmabacteria (Mycoplasmas), nu se regsesc n sol.
B-10. Endospora, cu exemple de genuri: Bacillus, Clostridium, Lactobacillus,
Sporolactobacillus, Sporosarcina, Streptococcus.
B-11. Pirellulae, nu se regsesc n sol.
B-12. Actinobacteria, cu exemple de genuri: Actinomyces, Arthrobacter, Cellulomonas,
Corynebacterium, Mycobacterium, Mycococcus, Streptomyces.
ncrengtura Eucaryotae
Morfologia i taxonomia micromicetelor
Micromicetele din sol, cunoscute i sub numele de ciuperci de mucegai, fungi, sau
ciuperci inferioare, prezint o varietate extraordinar de forme.
Clasa Hyphomycetes este o clas fals, deoarece reunete toate ciupercile superioare
ale cror fructificaii perfecte nu sunt nc cunoscute. In clasificarea lui Kreisel sunt cuprinse
aici subdiviziuni ale claselor Endomycetes, Ascomycetes i Basidiomycetes. In aceast clas se
gsesc cele mai multe ciuperci izolate din sol. Dintre Ascomycetes, va fi menionat numai
genul Chaetomium, mai frecvent n sol.
Clasa Hyphomycetes cuprinde 11 serii de micromicete. Vom prezenta numai seriile i
genurile de interes pentru viaa solului.
1.Seria Aleuriosporae este caracterizat prin conidii (aleuriospori) formate terminal
prin umflarea apexului celulei sporogene. Mai multe conidii i-au natere sub conidia
terminal, formnd un mnunchi apical. Din aceast serie se gsesc n sol genurile:
a). Botryotrichum, care printre alte specii cuprinde i specia Botryotrichum
piluliferum (forma imperfect a speciei Chaetomium piluliferum, clasificat ca form perfect
n clasa Ascomycetes). Epicoccum, cu unica specie Epicoccum purpurascens, avnd miceliul
galben sau portocaliu, cnd este izolat pe mediul nutritiv sau pe hrtie de filtru, dnd colonii
sterile. Acestea formeaz conidii pe ap-geloz. Acest gen a fost semnalat i n rizosfera
gramineelor i leguminoaselor, producnd un efect de rizosfer negativ. Degradeaz celuloza,
pectinele, xilanele i ligninele, cu producere de substane humice.
b). Genul Humicola cuprinde specii celulozolitice, deseori confundate cu speciile
genurilor Botryotrichum i Gilmaniella. Hifele sunt iniial hialine sau pigmentate, producnd
conidii izolate sau n lanuri scurte. Aceste specii sunt frecvente n solurile bogate n materie
organic i cu reacie neutr i n general, n gunoiul de grajd, n timpul compostrii aerobe.
Genul Humicola a fost de asemenea semnalat n rizosfera plantelor.
2. Seria Blastosporae este identificat n sol prin genurile: Cladosporium i Monilia.
Cladosporium apare, pe medii nutritive bogate, ca miceliu colorat diferit, de la verde
pn la msliniu-negricios sau cenuiu, iar la baza coloniei, negru. Acest gen este foarte
rspndit n sol, mai ales dup administrarea resturilor vegetale. A fost izolat i din sol
rizosferic. n experiene de laborator s-a demonstrat contribuia miceliilor acestui gen de
4

micromicete la agregarea particulelor de sol. Ele sunt celulozolitice, pectinolitice, amilolitice


i produc melanin (pigmentul negricios care d culoarea humusului).
Monilia prezint colonii albe, catifelat-lnoase. Blastosporii sunt ca un irag de
mrgele. Monilia sitophila invadeaz frecvent solul sterilizat din sere.
3. Seria Phialosporae cuprinde numeroase genuri i specii cu ciclu vital n sol.
Genul Aspergillus prezint aspecte variate ale coloniilor, prin coloritul
fructificaiilor, al miceliului vegetativ. La partea superioar i inferioar, produce peritecii sau
scleroi, are structura catifelat sau lnoas, aspectul de cutare sau zonare a coloniei.
Diversitatea mare a caracterelor morfologice (macro- i microscopice) a determinat pe
sistematicieni s creeze grupe n cadrul genului i apoi s descrie genuri i specii n cadrul
grupelor.
Genul Aspergillus dezvolt n sol activiti complexe i importante pentru viaa
solului. Specii ale acestui gen descompun lignina i sintetizeaz substane fenolice cu rol n
humificare. Aspergillus fumigatus este o specie frecvent n solul rizosferic i n soluri de tip
cernoziomic, smolni, brun-glbui acid, brun-rocat de pdure, argilo-iluvial cenuiu i
lcovite.
Genul Fusarium cuprinde specii numeroase, rspndite n sol i rizosfer, fiind
potenial i patogene. Altele, ca de exemplu, Fusarium oxisporum var. orthoceras i
Fusarium gibbosum, stimuleaz creterea porumbului, producnd gibereline (stimulatoare de
cretere).
Genul Gliocladium cuprinde specii comune n sol. Coloniile sunt lnoase, dar zona
central este intens fructificat, devenind adeseori pulverulent i pigmentat n verde sau n
nuane de roz. In solurile romneti, speciile de Gliocladium catenulatum (verde) i
Gliocladium roseum (roz) au fost frecvent izolate de Papacostea din solurile eubazice i
mezobazice, dar nu i din solurile acide, alpine.
Genul Myrothecium. Speciile acestui gen sunt prezente n solurile eubazice i
mezobazice i se izoleaz frecvent pe mediile pentru microflor celulozolitic.
Genul Penicillium este cel mai bine reprezentat n solurile romneti. Aceast
observaie este valabil, n general, pentru zona temperat i rece, dar arealul su de
rspndire cuprinde tot globul pmntesc. Majoritatea speciilor se dezvolt i n solul
rizosferic, participnd uneori la alctuirea micorizelor ectotrofe. Datorit unor activiti
biotice controlabile i mai ales capacitii anumitor specii de a produce antibiotice, genul
Penicillium a fost cercetat mult i numeroase tulpini au fost selecionate pentru scopuri
industriale. Coloniile pot fi: catifelate, cnd conidiosporii se ridic direct de pe miceliul
submers n mediul de cultur; lnoase, cnd exist un miceliu aerian bine dezvoltat, pe care
iau natere conidioforii; funiculoase, cnd hifele miceliene sunt asociate n cordoane, dnd un
aspect caracteristic coloniei; fasciculate, cnd conidioforii sunt asociai cu formaiuni speciale
numite coremii. Culorile fructificaiilor i cele ale miceliilor sterile prezint o gam extrem de
bogat n nuane; uneori, aspectul coloniei poate fi influenat de prezena unor exudate de
diferite culori i de prezena scleroilor i a periteciilor. Un caracter important l constituie
pigmentarea prii inferioare a coloniilor i difuzarea pigmentului n mediul de cultur. Un alt
caracter important este viteza de cretere. Se consider cretere nceat cnd colonia nu
depete 2-2,5 mm dup 14 zile i rapid, n caz contrar. Caractere mai puin importante sunt
cutarea i zonarea coloniei. Unele specii se caracterizeaz prin prezena unui miros specific,
5

de la cel tipic de mucegai sau pivni, pn la cel de flori sau fructe. Aspectul microscopic cel
mai tipic l prezint fructificaia asexuat, terminat ntotdeauna printr-un mnunchi de
fialide, n form de pensule. Conidioforul poate fi simplu (secia Monoverticillata), ramificat
n mod repetat, neregulat (secia Assymmetrica) sau regulat (secia Symmetrica). Prin urmare,
genul Penicillium este mprit n cele 3 secii menionate mai sus. Acestea, la rndul lor, sunt
mprite n serii sau, mai nti n subsecii i apoi n serii (secia Assymmetrica). Prezentm
cteva specii mai importante: Penicillium frequentans este intens pectinolitic, proteolitic i
descompune acizii humici. Prin acizii organici pe care i produce poate s solubilizeze
potasiul din silicai. n Romnia, apare n numr mare, mai ales n solurile alpine, cu pH de
circa 4. Penicillium pulvillorum este rspndit frecvent n solurile argilo-iluviale,
pseudogleizate sau nu. Apare mai rar n solurile eubazice. Penicillium lilacinum este o specie
stimulat de ngrmintele minerale. Este gsit, relativ frecvent, n solurile eubazice i
mezobazice. Penicillium janthinellum face parte din speciile dominante din solurile
romneti. Penicillium nigricans a fost izolat din diferite tipuri de sol, mai ales din cele
moderat acide. Penicillium brevi-compactum prezint colonii cu cretere nceat; sporuleaz
intens. Fr a se gsi n numr mare, se afl n multe tipuri de sol. Exercit un efect inhibitor
asupra mazrii i grului. Cnd crete frecvena acetei specii, solul devine toxic pentru
cereale.
Genul Stachyboptris este frecvent izolat din sol, mai ales pe medii speciale pentru
microflora celulozolitic , unde atrage atenia prin masele negre de conidii i aspectul prfos
al coloniilor. Acest gen este frecvent mai ales n soluri bogate n resturi vegetale.
Genul Trichoderma prezint colonii invadante pe mediile de izolare. Coloniile sunt
colorate n verde, uneori albe sau verzui-glbui. Se gsete n toate solurile, dar le prefer pe
cele acide. Joac un rol foarte activ n crearea unei zone fitosanitare n jurul rdcinilor, fiind
antagonist fa de numeroase micromicete fitopatogene. In solurile acide din Romnia,
Papacostea a izolat frecvent Trichoderma viridis i Trichoderma album.
4. Seria Porosporae. Porosporii sunt conidii, n general, cu perei groi. Toate
formele izolate din sol au conidii septate i colorate n brun. Menionm dou genuri:
Alternaria i Torula.
Genul Alternaria, reprezentat prin specia Alternaria alternata, este rspndit n
soluri foare diferite geografic. Specia este celulozolitic, capabil s descompun i pectina
sau xilanele, contribuind la agregarea particulelor de sol.
Genul Torula este prezent n diferite tipuri de sol din Romnia.
Seria Sympodulosporae cuprinde micromicetele cu conidii formate la apexul unor
conidiofori simpli sau ramificai, care cresc simpodial (se umfl dup producerea conidiilor).
Genul Arthrobotrys cuprinde specii care atac nematodele cu ajutorul unor capcane
formate din hife.
Clasa Ascomycetes cuprinde genul Chaetomium, care este nelipsit pe resturile
vegetale n descompunere n sol, avnd o capacitate celulozolitic foarte ridicat. Apare
frecvent pe plcile cu ap + geloz i granule de sol. Coloniile se recunosc uor datorit
periteciilor verzi-mslinii, pn la brun-negricioase. Specia Chaetomium globosum a fost
semnalat frecvent n rizosfera diferitelor plante.
Rolul micromicetelor n sol predomin prin descompunerea celulozei i a ligninei.
Particip la formarea substanelor humice. Prin producia de antibiotice contribuie la
6

echilibrul microbian n sol, pe microzone. Unele ficomicete i fungi imperfeci pot folosi ca
hran protozoarele (ciliate sau rizopode) i nematodele. n cursul atacului, hifa ptrunde
peretele celular al animalului, i degradeaz coninutul celular i-i asimileaz produii de
degradare. n cazul nematodelor, hifa nconjoar animalul producndu-i moartea, dup care i
degradeaz corpul i i asimileaz coninutul. Micromicetele se pot hrni cu eubacterii Gramnegative. Micromicetele formeaz asociaii simbiotice cu plantele superioare (micorize).