BIOCHIMIE II

BIOCHIMIA
METABOLISMULUI
REGLAREA CILOR METABOLICE PRINCIPII GENERALE

.L. Dr. Biochim. Bogdan Nicolae Manolescu

Facultatea de Chimie Aplicat i tiina Materialelor
Departamentul de Chimie Organic C. Neniescu
Laborator 013, Corp F, Campus Polizu

Principii de reglare a cilor metabolice

Apecte introductive:
cale metabolic = secven de reacii catalizate de enzime
ce
pornete de la metabolitul X i ajunge la
metabolitul Y
metabolit = orice intermediar al unei ci metabolice
metabolomic = studiul tuturor cilor metabolice dintr-o
celul

Principii de reglare a cilor metabolice

SE POATE NVA METABOLISMUL?!

Principii de reglare a cilor metabolice

Principii de reglare a cilor metabolice

Principii de reglare a cilor metabolice

Tipuri de ci metabolice:
ci metabolice lineare:
cele mai simple
exemple: glicoliza, untul pentozofosfailor

ci metabolice ciclice:
permit regenerarea acceptorului din calea metabolic
exemple: ciclul Krebs, ciclul ureogenetic, ciclul glioxilatului

ci metabolice cu aspect de spiral:

o secven de N reacii este repetat de mai multe ori
exemple: spirala Lynen ( oxidarea acizilor grai)

ci metabolice ramificate:
unul dintre intermediari este punct de divergen
exemple: biosinteza nucleotidelor purinice

Principii de reglare a cilor metabolice

Cale metabolic linear

Cale metabolic ciclicCale metabolic cu aspect de spiral

(ciclul Krebs)
(spirala Lynen)

STRUCTURA CILOR METABOLICE ESTE DICTAT DE FUNCIILE LOR!!

Principii de reglare a cilor metabolice

Biosinteza purinelor:
calea metabolic se ramific la
nivelul IMP (inozin-5-monofosfat)
sinteza ATP depinde de GTP
sinteza GTP depinde de ATP
aceast dependen ncruciat
permite meninerea unui echilibru
ntre nucleotidele cu adenin i cel
cu guanin

Principii de reglare a cilor metabolice

Caracteristici ale cilor metabolice:

cile metabolice sunt ireversibile:
orice cale metabolic are o reacie cu G < 0 (exergonic)
reacia cu G < 0 este plasat de regul la nceputul cii
metabolice
reacia cu G < 0 imprim caracter ireversibil ntregii ci
metabolice
E2 catalizeaz o reacie cu G 0

E1

E2

E3

E4

cale metabolic ipotetic

E5

Principii de reglare a cilor metabolice

Caracteristici ale cilor metabolice:

cile metabolice degradative (catabolice) i biosintetice
(anabolice) paralele trebuie s aib cel puin o reacie
diferit
GBZ < 0 i GZB > 0
reglare independent a cilor metabolice cu reacii comune

Principii de reglare a cilor metabolice

Caracteristici ale cilor metabolice:

metaboliii trebuie s fie activai prin:
nucleotidilare
fosforilare
transformare n tioesteri cu ajutorul coenzimei A (CoASH)

Principii de reglare a cilor metabolice

Activarea D-glucozei la UDP~Glc

Principii de reglare a cilor metabolice

Caracteristici ale cilor metabolice:

cile metabolice sunt reglate:
reacii aproape de echilibru:
G 0
permit echilibrarea rapid a reactanilor
sunt catalizate de enzime ce nu sunt supuse unor mecanisme de
reglaj

reacii departe de echilibru:

G < 0
nu permit echilibrarea reactanilor
sunt catalizate de enzime ce sunt supuse unor mecanisme de reglaj

Principii de reglare a cilor metabolice

Mecanisme de reglare a cilor metabolice:

importana reglrii cilor metabolice:
generarea unui rspuns adaptativ la modificri ale mediului
extern (temperatur) sau/i intern (glicemie)
meninerea homeostaziei organismului

clasificarea mecanismelor de reglare:

mecanisme ce opereaz pe termen scurt:
genereaz rapid rspunsul adaptativ (secunde/minute)
permit o adaptare rapid
efectele generate dureaz puin

mecanisme ce opereaz pe termen lung:

genereaz lent rspunsul adaptativ (ore/zile)
permit o adaptare lent
efectele generate sunt persistente n timp

Principii de reglare a cilor metabolice

Mecanisme de reglare a cilor metabolice:

mecanisme ce opereaz pe termen scurt:
controlul calitativ al enzimelor reglatorii
controlul accesibilitii substratelor
controlul cu ajutorul substrate cycles

mecanisme ce opereaz pe termen lung:

controlul cantitativ al enzimelor reglatorii

Principii de reglare a cilor metabolice

Controlul calitativ al enzimelor reglatorii:

caracteristici generale:
nu este afectat cantitatea de enzim
este modulat doar activitatea enzimelor reglatorii
exemple:
modificri allosterice ale enzimelor
modificri covalente reversibile ale enzimelor

modificri allosterice ale enzimelor:

au loc sub aciunea efectorilor allosterici:
produsul final al cii metabolice
intermediari ai cii metabolice
ali metabolii cu mas molecular mic

efectorii allosterici modific parametrii cinetici ai enzimei

reglatorii

Principii de reglare a cilor metabolice

Efectorii allosterici:
clasificare:
efectori allosterici pozitivi stimuleaz activitatea enzimei
reglatorii
efectori allosterici negativi inhib activitatea enzimei reglatorii

modele de reglare prin intermediul efectorilor allosterici:

feed-back inhibiia:
mecanism frecvent
un metabolit (produsul final) inhib enzima reglatorie a unei ci
metabolice
este prevenit acumularea n exces a produsului final atunci cnd nu
mai este necesar

feed-forward stimularea:
mecanism foarte rar n sistemele biologice
permite anunarea altor enzime c va urma o cretere a fluxului n
calea metabolic
creterea activitii enzimelor respective permite meninerea
constant a concentraiei intermediarilor metabolici

Principii de reglare a cilor metabolice

feed-back inhibiie

feed-forward stimulare

Principii de reglare a cilor metabolice

Controlul calitativ al enzimelor reglatorii:

modificri covalente reversibile ale enzimelor:
cea mai frecvent este FOSFORILARAEA/DEFOSFORILAREA
procesul necesit un cuplu de enzime:
KINAZ transfer gruparea Pa de pe ATP
FOSFATAZ hidrolizeaz legtura fosfat esteric

enzimele reglate prin acest mecanism exist n dou forme:

FOSFO
DEFOSFO

Principii de reglare a cilor metabolice

Controlul calitativ al enzimelor reglatorii:

compartimentarea celular:
specific celulelor eukariote
cile metabolice antagonice sunt localizate n compartimente
distincte:
catabolismul acizilor grai mitocondrie
biosinteza acizilor grai citosol

Principii de reglare a cilor metabolice

Controlul calitativ al enzimelor reglatorii:

controlul fluxului de metabolii ntre compartimentele
celulare:
intrarea D-glucozei n celulele esuturilor glucoindependete este
controlat de insulin
intrarea acizilor grai din citosol n mitocondrie este blocat de
prezena malonil~CoA

Principii de reglare a cilor metabolice

Intrarea glucozei n esuturi:

esuturile se clasific n dou categorii n funcie de
dependena de glucoz:
esuturi glucoindependente (insulinodependente):
muchiul scheletic, miocardul, esutul adipos, diafragma

esuturi glucodependente (insulinoindependente):

esutul nervos, eritrocitul

esuturile glucoindependente exprim n membrana celulelor

transportorul pentru glucoz GLUT4
POSTPRANDIAL, insulina determin creterea numrului de
molecule GLUT4 n membrana celular i permite intrarea
glucozei n esuturi

Principii de reglare a cilor metabolice

Intrarea glucozei n celulele esuturilo

glucoindependente este mediat de
transportorul GLUT4.

Transportorul GLUT4 este translocat

din citoplasm (vezicule de stocare)

ctre membrana celular sub aciune

insulinei.

Principii de reglare a cilor metabolice

Malonil~CoA inhib intrarea moleculelor de acil gras~CoA n mitocondrie, ceea ce faciliteaz

sinteza acizilor grai n citoplasm !

Principii de reglare a cilor metabolice

Controlul cantitativ al enzimelor reglatorii:

cantitatea enzimelor reglatorii depinde de:

rata de sintez (rata de transcriere a genei specifice)

rata de degradare a proteinei
rata de degradare a ARN-ului mesager corespunztor

cantitatea de enzim este controlat de statusul hormonal:

faza postprandial:

concentraie crescut de INSULIN

crete sinteza de glucokinaz, 6-fosfofructo-1-kinaz, piruvat kinaz
este stimulat glicoliza

faza interprandial:

concentraie crescut de GLUCAGON

crete sinteza de fosfoenolpiruvat carboxikinaz, fructozo-1,6bisfosfataz
este stimulat gluconeogeneza

expresia unei gene poate fi controlat de mai muli hormoni