Explorați Cărți electronice
Categorii
Explorați Cărți audio
Categorii
Explorați Reviste
Categorii
Explorați Documente
Categorii
INTRODUCERE
Plantele verzi, autotrofe, sunt furnizori primari de glucide (prin fotosinteza, asimilare
clorofiliana) si folosesc glucidele polimere (amidon, celuloza) in construirea peretilor celulari
sau ca materiale de rezerva.
Animalele, heterotrofe, necesita consumarea unei alimentatii echilibrata in proteine,
glucide, lipide, vitamine, apa, saruri anorganice si oligoelemente.
In general, glucidele si lipidele simple servesc ca sursa de energie; lipidele complexe
in structurarea membranelor celulare si particulelor subcelulare.
Dintre biomacromolecule (biopolimeri), proteinele sunt suportul structurii, functiilor
si specificitatii, iar acizii nucleici sunt purtatori ai informatiei biologice.
Apa si sarurile minerale reprezinta mediul reactiilor biologice, iar oligoelementele
sunt efectori ai acestor reactii.
Cea mai insemnata caracteristica a materiei vii este structura organizata si gradul de
complexitate care creste odata cu dezvoltarea in scara animala, de la o specie la alta, de la un
tesut la altul, de la o celula la alta.
CAPITOLUL I
CELULA ELEMENT ANATOMIC, FIZIOLOGIC SI BIOCHIMIC
care reprezinta
aproximativ
constituentilor
Acizii grasi saturati pot fi redati prin formula generala CH3-(CH2)n-COOH, unde n
este cuprins intre 2 si 28.
Acizii grasi saturati cei mai rasp=nditi in grasimile animale sunt:
Acidul butiric : CH3-(CH2)2-COOH
Acidul capronic : CH3-(CH2)4-COOH
Acidul caprilic : CH3-(CH2)6-COOH
Acidul caprinic : CH3-(CH2)8-COOH
Acidul lauric : CH3-(CH2)10-COOH
Acidul miristic : CH3-(CH2)12-COOH
Acidul palmitic : CH3-(CH2)14-COOH
Acidul stearic : CH3-(CH2)16-COOH
Acidul arahidic : CH3-(CH2)18-COOH
Acidul behenic : CH3-(CH2)20-COOH
Acidul lignoceric: CH3-(CH2)22-COOH
In lipidele de origine vegetala predomina acidul palmitic. La animalele cu s=nge rece
predomina acidul palmitic urmat de acidul miristic, iar in lipidele animalelor cu s=nge cald
(inclusiv la om) predomina acidul palmitic urmat de acidul stearic si in cantitati mici de
acidul miristic.
Acizii grasi saturati cu catena ramificata mai rasp=nditi sunt:
CH3 CH COOH CH3 CH CH2 COOH
CH3
CH3
acidul izobutiric:
,acidul izovalerianic:
Acizii grasi nesaturati cuprind una sau mai multe legaturi etilenice. Acesti acizi sunt
caracterizati prin lungimea catenei hidrocarbonate (Cn) si prin pozitia dublei (sau a dublelor)
legaturi, care este specificata prin numarul atomului de carbon de la care se porneste (C n : m).
Numaratoarea se face incep=nd cu gruparea carboxil: carbonul vecin sau C , C, ........ p=na
la ultimul CH3 care se noteaza cu C sau Cn.
Conventional, numarul si pozitia dublelor legaturi se indica astfel: acidul oleic, de
exemplu (care contine 18 atomi de C si o singura dubla legatura intre C9 si C10) se reprezinta
prin C18:(9.
acidul palmitoleic: C16:9.
HC
H2C
C
H2
CH (CH2) n COOH
n10
in
acidul hidnocarpic;
n12 in acidul chaulmogric.
Acestia au fost izolati din plantele tropicale si folositi in tratamentul leprei.
acizii grasi esentiali.
Organismul uman are nevoie de unii acizi grasi pe care nu ii poate sintetiza sau pe
care ii produce in cantitati insuficiente. Din aceasta categorie fac parte acizii linoleic,
linolenic, arahidonic.
Rolul acizilor grasi esentiali este in special structural, fac=nd parte din alcatuirea
fosfolipidelor celulare, mai ales mitocondriale.
Proprietatile acizilor grasi
Acizii grasi inferiori p=na la C8 sunt lichizi, ceilalti sunt solizi.
Acizii grasi nesaturati sunt lichizi si prezinta izomerie cis-trans. Formele naturale ale
acestor acizi sunt totdeauna izomerii cis.
Acizii grasi sunt pusin solubili in apa, solubilitatea scaz=nd odata cu lungimea catenei
hidrocarbonate.
Din punct de vedere chimic acizii grasi prezinta reactiile gruparii carboxil: formeaza
saruri cu metalele si cu hidroxizii alcalini numite sapunuri, cu proprietati tensioactive;
formeaza esteri cu alcoolii, amide (sfingolipide).
Acizii grasi nesaturati aditioneaza hidrogen, halogeni si sufera procesul de peroxidare.
Peroxidarea este un proces radicalic care necesita un initiator X ce extrage un atom de
hidrogen de la gruparea metilenica din pozitia alilica cu formarea unui radical liber care se
izomerizeaza:
CH CH CH2 CH CH
+X
HX +
.
CH CH CH CH CH
.
CH CH CH CH CH
CH CH CH CH CH
_
O O
CHO
CH2 OH
COOH
CH OH
CH O
CH OH
CH2 OH
CH2 OH
CH2 OH
dihidroxi acetona
aldehida gliceric\
acidul gliceric
CH2O CO R1
CHO CO R2
CH2O CO R3
NH3
etanolamina
(colamina)
CH2 CH2 N
OH
CH3
CH3
CH3
trimetiletanolamina
(colina)
CH2 CH COO
OH
NH3
serina
H
6
OH
5
HO OH H H
4
1
HO
OH
H
HO
2
3
H
CH3
CH3
CH3
HO
CH2 OCOR
CH2 OCOR
CH2 OCOR
CH OH
CH OCOR
CH OH
CH OCOR
CH2OH
CH2OH
CH2OCOR
CH2OCOR
monoglicerid
diglicerid
diglicerid
triglicerid
Triacilglicerolii pot fi simpli sau micsti. In cazul c=nd un singur fel de acid esterifica
cele trei grupari hidroxil ai glicerolului se numesc simple (de exemplu: tristearil-glicerol,
tripalmitil-glicerol, trioleil-glicerol).
Triacilglicerolii micsti contin doi sau mai multi acizi grasi diferiti.
Grasimile naturale sunt compuse aproape exclusiv din trigliceride. Mono- si
digliceridele sunt intermediari in degradarea si sinteza trigliceridelor si se gasesc doar in
cantitati mici in tesuturi. Se formeaza in cursul digestiei grasimilor.
Starea de agregare a trigliceridelor depinde de compozitia lor in acizi grasi: cele
bogate in acizi grasi saturati inferiori sau nesaturati sunt lichide. Cu c=t continutul de acizi
grasi saturati superiori este mai mare cu at=t punctul de topire al unei trigliceride este mai
ridicat. Grasimile naturale sunt amestecuri de diverse trigliceride si nu pot fi caracterizate
prin constante fizice nete. La incalzire ele se inmoaie treptat p=na la topire. Trigliceridele au
densitati mai mici dec=t apa, sunt insolubile in apa av=nd un caracter aproape perfect
nepolar. Puse pe suprafata apei se intind dar nu pot interactiona cu apa.
Trigliceridele care cuprind trei resturi acil diferite, au un atom de C asimetric (C 2 din
glicerol) si vor putea exista sub forma a doi enantiomeri.
Substantele naturale au toate aceeasi configuratie, care este redata cu ajutorul
formulei:
CH2 O COR1
R2OCO C H
CH2 O COR2
CH2 O COR
ROCO
C H
+ 3HOH
CH OH
+ 3 R COOH
CH2 OH
CH2 O COR
care
este
unul
din
cei
noua
stereoizomeri
hexahidroxiciclohexanul:
OH
H H
H HO
O OH
H H
H
O
OH
HO
_
CH2 CH OCOR
CH2 O CO R
Fosfatidil mioinozitol
pe
care
ii
prezinta
Substanta nervoasa alba si fibrele de mielina cuprind cantitati mult mai mari de
fosfatidil-inozitol dec=t substanta cenusie.
Aceste lipide participa la transportul cationilor prin membrane, proces fundamental
pentru functia nervoasa. Sub actiunea fosfolipazei C elibereaza diacilglicerol si inozitol
fosfati, acestia constituind efectori ai unor mesageri extracelulari.
Fosfatidil-glicerolii sunt fosfolipide fara azot si cuprind unul sau doua resturi de acid
fosfatidic legate la glicerol. Difosfatidilglicerolul sau cardiolipina este fosfolipidul cel mai
abundent din mitocondrii si a fost izolat din muschiul cardiac:
O
ROCO
CH2 O CH CH R
ROCO
C H
CH2 O P O alcool
_
O
Fosfatidil colinele (lecitinele) cuprind un rest fosfatidil legat de colina.
CH2 O COR
ROCO
C H
CH3
+
CH2 O P O CH2 CH2 N CH3
_
CH3
O
In molecula unei lecitine exista o functie acida (restul fosforil) si o functie bazica
(baza cuaternara de amoniu) care se neutralizeaza reciproc, fapt ce confera lecitinelor
caracterul de ion bipolar si proprietati tensioactive puternice.
Lecitinele reprezinta categoria de lipide complexe cu rasp=ndirea cea mai larga, ele
sunt reprezentate in toate membranele biologice si in cantitatile cele mai mari. In proportie de
80-90% intra in compozitia surfactantului pulmonar, material ce acopera alveolele pulmonare
si impiedica colapsul la expirare.
Fosfatidiletanolaminele (cefalinele) sunt fosfatide ce cuprind restul fosfatidil legat de
etanolamina:
CH2 O COR
ROCO
C H
O
+
Cefalinele se gasesc in tesuturi alaturi de lecitine dar in cantitati mult mai mici. Sunt
mai abundente in lipidele din tesutul nervos.
Fosfatidil serinele (serincefalinele) contin un rest de serina legat de radicalul
fosfatidil. Fosfatidil serinele insotesc celelalte fosfatide:
CH2 O COR
ROCO
C H
_
CH2 O P O CH2 CH2 COO
_
+ NH
O
3
A1
CH2O CO R1
A2
CHO CO R2
O
C
CH2 O P O CH2 CH2 X
_
D
O
indepartarea
acizilor
din
structura
fosfogliceridelor
se
formeaza
OH NH2
dihidrosfingozin\
sfingozin\
In sfingolipide acidul gras este legat amidic la gruparea NH2 a sfingozinei pentru a
forma un ceramid:
CH3 (CH2)12 CH CH CH OH
CH NH C R
CH2OH
(ceramid)
H
H
OH H
HO
H
H
HO
CH2OH
OH H
HO
H
H
CH2
O
O
CH2
NH
H C
H C
CH2OH
OH C
HC
CH
NH
H C
O
H C
(CH2)22
OH C
HC
CH3
CH
(CH2)12
(CH2)22
CH3
(CH2)12
CH3
CH3
Galactocerebrozid
Glucocerebrozid
Cerebrozidele
se
gasesc in majoritatea tesuturilor dar sunt mai abundente in creier (substanta alba), in nervi.
Sunt alcatuite dintr-un ceramid (un acid gras cu 24 atomi de C, legat la beta-galactoza
(galactocerebrozid) sau mai rar la beta-glucoza (glucocerebrozid).
OH
H
H
_
SO3
H
HO
H
CH2OH
O
O
CH2
NH
H C
H C
OH C
HC
(CH2)22
CH
CH3
(CH2)12
CH3
Gangliozidele sunt glicolipide prezente in cantitati mici in toate tesuturile, dar sunt
mai abundente in creier si nervi. Cuprind un ceramid (in care acidul gras este acidul stearic)
legat de un oligozaharid alcatuit din glucoza, galactoza, N-acetil-galactozamina.
Oligozaharidul este legat la r=ndul lui de unul, doua sau trei resturi de acid sialic (acid
acetil-neuraminic).
Gangliozidele se clasifica si se citesc dupa numarul resturilor de acid sialic, in
monosialo-gangliozide (GM), disialo-gangliozide (GD) si trisialo-gangliozide (GT).
Natura oligozaharidului este desemnata printr-un indice numeric, 5-n, in care n arata
numarul de unitati hexozil.
De exemplu, gangliozidul GM1 are structura simplificata:
ceramid-Glc-Gal-Gal-Nhac-Gal
NANA
NANA
CAPITOLUL III
Pagina 19 din 105
PROTEINELE DE MEMBRAN|
peptidica realizata intre gruparea aminica a unei molecule si gruparea carboxil a altei
molecule formeaza macromolecule proteice. Se cunosc aproximativ 300 aminoacizi dintre
care doar 20 sunt proteinogeni, specificati prin codul genetic, prezenti in toate organismele
vii, de la cele mai simple p=na la om.
Aminoacizii naturali se reprezinta prin formula generala:
sunt alfa aminoacizi.
N
H
COOH
(acid pirolidin alfa-carboxilic)
Simbol
Structura
uzuala
H CH COOHGli
NH2
Denumirea
rationala
acid aminoacetic
Glicina
Ala
CH3 CH COOH
NH2
Alanina
H3C CH CHVal
COOH
NH2
H3C
Valina
H3C CH CH2Leu
CH COOH
NH2
CH3
propionic
izovalerianic
izocaproic
Leucina
CH3 CH2 CHIleCH COOH
NH2
H3C
Izoleucina
Phe
CH2 CH COOH
NH2
Fenilalanina
Pro
N
H
acid pirolidin
COOH
carboxilic
Prolina
N
H
HN
His
CH2 CH COOH
NH2
CH2 CH COOH
NH2
Histidina
Triptofan
Trp
Ser
CH2 CH COOH
OH NH2
Serina
HO
Thr
CH2 CH COOH
NH2
CH3 CH CH COOH
OH NH2
Treonina
Tirozina
Tyr
para-hidroxi fenil
alanina
Cys
CH2 CH COOH
SH NH2
Cisteina
Met
CH3 S CH2 CH2 CH COOH
NH2
Metionina
Asp
COOH CH2 CH COOH
NH2
amino succinic
Acid aspartic
CH COOH
H2N C CH2 Asn
NH2
O
Asparagina
Glu
COOH CH2 CH
2 CH COOH
NH2
alfa amino
glutaric
Acid
glutamic
CH2 CH COOH
H2N C CH2 Gln
NH2
O
Glutamina
Lys2 CH2 CH COOH
CH2 CH2 CH
NH2
NH
alfa -diamino
Lizina
Arg2 CH COOH
CH2 CH2 CH
NH2
NH
caproic
guanidinovalerianic
C NH
NH2
Arginina
OH
HO
N
H
COOH
COOH
N CH3
(CH2)4
CH NH2
COOH
-N-metil Lizina
Pe l=nga cei
20 de alfa aminoacizi care intra curent in constitutia proteinelor se mai gasesc si altii care se
afla in cantitate mica numai in anumite tipuri de proteine specializate prin functiile pe care le
indeplinesc. Astfel
fibrilare colagen, iar N-metil-lizina se gaseste in miozina, proteina importanta din muschi.
Unii aminoacizi neproteinogeni sunt importanti precursori sau intermediari in
metabolism.
Astfel:
CH2 CH2 COOH
beta alanina
coenzimei A
NH2
este component al
NH2
neurotransmitator
intermediar in
biosinteza hemului
citrulina
COOH CH (CH2)3 NH C
NH2
NH2
intermediar in
ureogeneza
ornitina
homocisteina
ia parte la procesul
de ureogeneza
intermediar in
metabolismul
aminoacizilor
Homoserina
intermediar in
metabolismul
aminoacizilor
factor de crestere
pentru bacterii,
component al
acidului folic
Peptidele se formeaza din mai multe molecule de aminoacizi prin legaturi peptidice
CO-NH-.
Polipeptidele sunt lanturi mari contin=nd un numar insemnat de legaturi peptidice si
resturi de aminoacizi p=na la 100.
Exemple de peptide:
Carnozina este un dipeptid prezent in muschi. Este format din histidina si betaalanina:
N
HC
CH3
CH2
CH2
CH
COOH
R2
CH
CH
CH
R1
H O
CH
CH
C
R1
N
H
H O
CH
R3
N
Atomii
legaturii peptidice sunt coplanari, iar resturile aminoacizilor R 1, R2, R3 alterneaza de o parte si
de alta a planului legaturii peptidice:
H H
C
R
Pauling si Corey au stabilit criteriile care stau la baza formarii structurii secundare:
a) atomii legaturii peptidice sunt coplanari si apartin aminoacizilor seriei;
b) formarea unui numar maxim de legaturi de H care asigura o stabilitate maxima;
c) atomul de H din legatura de H sa fie c=t mai aproape de o linie imaginara ce uneste
cei doi atomi ai legaturii peptidice si anume de O din gruparea CO si N din NH.
S-au elaborat doua modele teoretice limita: cel spiralat sau helicoidal (ce se realizeaza
prin rasucirea in spirala a catenei polipeptidice, si care, are la baza legaturile de H
intracatenare si modelul in foaie pliata (realizat prin plierea catenei, av=nd la baza legaturile
de H intercatenare).
Modelul helicoidal sau alfa-helix rezulta prin rasucirea catenei polipeptidice in jurul
unui cilindru imaginar c=nd elicea poate sa apara sub doua forme: cu sensul de insurubare
spre dreapta si spre st=nga. Fiecare spira este formata din 3, 6 unitati de aminoacid. Spiralele
au un ax de simetrie longitudinal, distanta dintre doua spire fiind de 5,4 A. Radicalii R ai
aminoacizilor sunt dispusi in afara helixului si intre ei pot aparea interactiuni, astfel ca
structura helicoidala (secundara) depinde de secventa aminoacizilor (de structura primara).
Elicea alfa dreapta este mai stabila si la ea se refera structura secundara. Aceasta aranjare
spatiala este mentinuta datorita legaturilor de hidrogen. In acest model repetarea resturilor de
aminoacizi se face dupa 5 spire ceea ce repezinta aproximativ 18 aminoacizi.
CH CH2 CH2 C O
NH
CO
CO
CH C
HN
C
H
O
H
S
C
H
O
NH
C
CH
NH
C
- legatura esterica intre un grup COO -- (din acid glutamic sau aspartic) si un grup
OH alcoolic (din serina, spre exemplu:)
NH
NH
CO
NH
CH
C O
HN
C
HN
CH
- legaturi prin forte Van der Waals intre grupe nepolare: spre exemplu, intre gruparea
CH3 a alaninei si gruparile metil din valina sau leucina:
Leucin\
CH
CH3
CH3 Alanin\
CH3
Desi slabe, legaturile de H si Van der Waals sunt foarte numeroase, ele contribuind
intr-o mare masura la consolidarea lanturilor si la imprimarea structurii tertiare a proteinelor.
Dezorganizarea unei astfel de structuri complexe aduce cu sine pierderea
proprietatilor biologice a proteinelor.
Determinarea structurii tertiare se realizeaza prin metoda difractiei razelor X.
Structura cuaternara este cel mai inalt grad de organizare a proteinelor si consta in
agregarea a doua sau mai multe molecule identice sau usor diferite structural. Aceste agregate
sunt unite intre ele prin aceleasi tipuri de legaturi ca si in cazul structurii tertiare, action=nd
intracatenar.
Exemplu tipic de structura cuaternara il ofera hemoglobina si unele protein-enzime.
Hemoglobina are molecula formata din lanturi polipeptidice, fiecare cu structura primara,
secundara, tertiara. Lanturile polipeptidice sunt legate intre ele prin legaturi de H, forte Van
der Waals, legaturi polare.
Nivelele superioare de organizare a structurii proteinelor sunt conditionate de
structura primara.
Stabilirea structurii complete a proteinelor presupune izolarea si purificarea lor,
determinarea masei moleculare, identificarea aminoacizilor si modul lor de legare, deci a
secventei exacte.
Proprietati fizico-chimice
Proteinele au greutate moleculara mare (de la zeci de mii p=na la 1 milion daltoni).
Determinarea greutatii moleculare se poate face prin ultracentrifugare, masurarea presiunii
osmotice a proteinelor, viteza de difuzie, viteza de filtrare prin gel sau a v=scozitatii.
Proteinele au activitate optica data de prezenta C asimetric din structura aminoacizilor
si de asimetria generala a arhitecturii macromoleculare, c=nd proteina are structura
helicoidala.
Caracterul amfoter este dat de aminoacizii constituenti. La valoarea pH egala punctul
izoelectric molecula proteica are solubilitate, v=scozitate, presiune osmotica si reactivitate
chimica minime.
Sarcinile electrice libere determina puncte izoelectrice diferite anumitor proteine
deci mobilitate electrica in functie de pH-ul mediului in care proteinele sunt dizolvate, de
concentratia ionica a acesteia, de intensitatea c=mpului electric, temperatura. Metoda
electroforetica este una din posibilitatile de fractionare a proteinelor serice.
Unele proteine sunt solubile in apa, altele insolubile, iar altele se solva in solutii saline
diluate, in solutii acide sau bazice.
Precipitarea proteinelor ( reversibila, ireversibila) se realizeaza prin adaugarea de
saruri ale metalelor alcaline sau solventi organici miscibili cu apa, la solutia proteinei.
O precipitare ireversibila se realizeaza prin adaugarea de saruri ale metalelor grele:
CuSO4, HgCl2, acizi minerali (azotic, percloric, tungstic) sau unii acizi organici complecsi
(fosfowolframic, tricloracetic, sulfosalicilic). Aceasta precipitare ireversibila are loc cu
producerea unor transformari chimice mai profunde a proteinelor (denaturare).
Denaturarea este modificarea structurala datorata actiunii agentilor fizici (T, pH) si
chimici asupra proteinelor, care este insotita de pierderea activitatii fiziologice. Mecanismul
de actiune consta in formarea complexelor metalice insolubile.
Clasificarea proteinelor
Proteinele se clasifica in: proteine simple (formate numai din aminoacizi) si proteine
conjugate.
Proteinele conjugate se impart la r=ndul lor in:
fosfoproteine, in care gruparea prostetica este acidul fosforic, care esterifica grupari
alcoolice din hidroxiaminoacizi (serina, treonina), ce intra in constitutia componentei
proteice. Fosfoproteinele sunt insolubile in apa si acizi, dar sunt solubile in alcalii (NaHCO 3).
Cele mai importante fosfoproteine de origine animala sunt caseina din lapte, vitelina si
fosvitina din galbenusul de ou.
glicoproteinele au grept grupare prostetica glucidele, sub forma de monozaharide:
manoza, galactoza, xiloza, glucoza, fructoza, acizi uronici (D-glucuronic), aminozaharuri
(glucozamina, galactozamina) sau derivati ai aminozaharurilor: acid neuraminic si acid sialic
proveniti din manozamina.
CH2OH
CH2OH
HO CH
HO CH
HO CH
H
O
H
H2N H
HO
HO CH
H
COOH
OH
O
H
H3C C HN H
O
Acid neuraminic
HO
COOH
OH
Acid sialic
porfirinice:
hemoglobina,
mioglobina,
citocromii,
enzimele
Acizii nucleici sunt cele mai mari biomolecule si rolul lor consta in inmagazinarea
informatiei genetice si a transcrierii sale in biosinteza tuturor proteinelor din organism.
Acizii nucleici sunt rasp=nditi sub forma a doua tipuri principale: ADN si ARN.
Hidroliza cu acizi, baze, enzime, arata ca acizii nucleici contin trei categorii de
componente: acidul fosforic, pentoze (riboza in ARN si 2-deoxiriboza in ADN) si o baza
azotata de tip purinic si pirimidinic. Pentoza este D-riboza sub forma furanozica, cu structura:
HO
CH2 OH
H H
OH
OH
N
N
CH2 OH
H H
OH
OH
N
N
H2N
O
N
N
N
N
H
HN
N
N
N
H
OH
O
N
N
N
HO
HN
N
H
Hipoxantin\
xantin\
OH
OH
HO
N
N
HO
(6-oxipurina)
OH
(2,6 dioxipurina)
(2,6,8 trioxipurina)
OH
O
HN
N
HO
H
H
N
H
OH
CH3
N
HO
CH3
H N
O
si timina
pirimidina):
Timina a fost izolata din timus si este considerata ca baza pirimidinica a ADN.
NH2
NH2
N
N
HO
N
H
Se gaseste at=t in ADN c=t si in ARN, in unele nucleotide (citidinfosfati) si are rol
important in biosinteza fosfolipidelor.
OH
N
N
HO
orotic
COOH
apar
in
cantitati
mici
si
libere,
spre
deosebire
de
dezoxiribonucleozide.
Nucleozidele formate din baze azotate si pentoze sunt: adenozina, guanozina, citidina,
uridina, timidina.
NH2
OH
N
N
N
N
H
N
O
CH2 OH
H H
OH
OH
H2N
N
H
Adenozin\
O
H
H H
OH
OH
Guanozin\
CH2 OH
NH2
N
N
N
H H
OH
OH
CH3
NH2
Un nucleozid important in
NH2
O
CH2 O P OH
H H
OH
OH
OH
N
H
CH2 O P OH
H H
OH
OH
OH
Pirimidin nucleotidele cu riboza sunt: acidul uridilic (UMP), acidul timidilic (TMP),
acidul citidilic (CMP).
OH
N
HO
N
H
CH2 OH
H H
OH
Prin esterificarea a doua grupari oxidril din acidul fosforic cu doua grupari oxidril ale
ribozei din pozitia 3/ si 5/ se obtin nucleotide ciclice:
3/, 5/ AMP ciclic si
3/, 5/ GMP ciclic cu rol important ca al doilea mesager in activitatea hormonilor.
Acizii nucleici sunt polinucleotide realizate prin stabilirea de legaturi covalente intre
nucleotidele ce se succed in lant.
Gruparea 5/ -hidroxi a unui nucleotid este legata de gruparea 3/ -hidroxi a
ribonucleotidului urmator prin legatura fosfat diesterica.
O
N
5'
CH2
O
P
NH
N H2N
CH2
O
H H
H
NH2
H
H
P
O
H3C
H H
CH2
O
H
H
H
P
NH
O
CH2
O
H H
H
O
O
NH2
H
H
P
A N
O
H H
H
H
3' H
P
O
catena
I
catena
II
A...................T
A...................T
3' G...................C
A...................T
T...................A
5' C...................G
C...................G
G...................C
catena
I
5'
3'
catena
II
A
A
3' G
A
T
5' C
C
G
C
G
G
A
T
C
T
T
5'
3'
At=t ADN c=t si ARN pot fi hidrolizati de enzime numite nucleaze. Sunt doua tipuri
de nucleaze:
endonucleaze care hidrolizeaza legaturile fosfat diesterice din interiorul catenei
polinucleotidice si
exonucleaze care hidrolizeaza legatura nucleotidica terminala de la capatul 5/ sau 3/.
Acizii dezoxiribonucleici sunt polidezoxiribonucleotide cu masa moleculara mare in
structura carora intra obligatoriu patru baze azotate: adenina, guanina, timina si citozina.
ADN contin informatia genetica completa pentru a specifica structura proteinelor din
organism.
Prin analiza cromatografica efectuata pe molecule de ADN izolate din diverse specii
s-a stabilit ca in toate tipurile de ADN numarul de resturi de adenina este egal cu cel al
resturilor de timina, iar cel a resturilor de guanina cu cel de citozina; numarul de baze
purinice este egal cu cel al bazelor pirimidinice (AG TC).
Prin difractia cu raze X, efectuata pe cristale de ADN, s-a demonstrat existenta a doua
perioade de identitate de-a lungul axei lungi a moleculei: una mare de 3,4 nm si una mica de
0,34 nm.
Pornind de la aceste date, Watson si Crick au elaborat un model tridimensional al
moleculei de ADN cu urmatoarele caracteristici:
doua lanturi polidezoxiribonucleotidice se rasucesc helicoidal si in acelasi sens in
jurul unui ax comun, form=nd o dubla helice cu orientare dreapta;
- inelele glucidice, legate prin resturi fosfat, constituie scheletul extern al dublului
helix, iar bazele azotate, hidrofobe sunt orientate spre interior si perpendicular pe axa
helixului;
- toate gruparile fosfat la pH 7 sunt ionizate si incarcate negativ;
cilindrul ce incadreaza dublul helix are un diametru de 2 nm;
distanta dintre planurile a doua baze adiacente este de 0,34 nm;
perioada de identitate este de 3,4 nm, deci structura se repeta dupa 10 baze azotate;
Stabilitatea dublului helix este asigurata de interactiunile hidrofobe dintre bazele
azotate si de legaturile de hidrogen ce se stabilesc intre bazele azotate de pe o catena si cele
complementare de pe cealalta catena.
Legaturile de hidrogen se stabilisc intre o baza azotata purinica de pe o catena si una
pirimidinica de pe cealalta catena. Bazele pereche sunt A T si G C, deoarece numai
acestea pot stabili numarul maxim de legaturi de hidrogen, asigur=nd configuratia cu energia
libera cea mai mica, deci cea mai stabila pentru molecula de ADN.
Adenina se leaga de timina prin doua legaturi de hidrogen, iar guanina de citozina
prin trei legaturi de hidrogen.
Cele doua catene polinucleotidice ale dublului helix nu sunt identice ci
complementare, in sensul ca adeninei dintr-o catena ii va corespunde totdeauna timina de pe
cealalta catena, iar guaninei, citozina.
Succesiunea bazelor azotate dintr-o catena dicteaza succesiunea bazelor azotate din
cea de a doua catena; o catena este replica celeilalte.
CH3
dR
H
H N
O
NH
O
H
dR
C
O
N H
N
N
dR
O
HN
H N
H
G
N
N
dR
Din secventa bazelor azotate din catenele ADN rezulta si informatia genetica cu
privire la biosinteza de proteine.
ADN stocheaza si transmite informatia genetica de-a lungul generatiilor.
Acizii ribonucleici sunt produsi macromoleculari formati prin policondensarea
ribonucleotidelor prin legaturi fosfat diesterice intre gruparea OH din pozitia 3/ a unui
nucleotid si gruparea OH din 5/ a nucleotidului succesiv.
Bazele azotate care intra in structura ARN sunt: A, G, U, C.
Moleculele de ARN sunt monocatenare.
O
N
CH2
O
5'
CH2
3' H
NH2
N H2N
O
H
NH
H
OH
3' H
H
OH
CH2
O
O
NH2
O
CH2
O
H
3' H
H
OH
O
3'
H
H
H
OH
P
3'
5'
P O
O
O
O
O
O
O
O
OO
O O O O O O OO
O
O
O
O O OO
O O O O
OO
O
O
O
O
O
O
O
O O
A
C
C
O
O
O
O
O
O
O
O
OO
O O O O
O O O
O
O
O
OOOOO
O O
O
O
O
O
O
O
O
O
O
O
O
O
O
O O
O
O
O
O
O
O
anticodon
rest guanilic, iar la capatul 3/ toti au secventa nucleotidica CCA. La capatul buclei se gaseste
anticodonul.
Toate tipurile de ARNt contin un mare numar de baze minore: tiouridina, inozina,
pseudo-uridina, ribotimidina.
In biosinteza de proteine ARNt are doua functii:
1. transportul aminoacizilor, activati in faza solubila, la ribozomi, sub forma de
complexe aminoacil-ARNt.
Fiecarui dintre cei 20 de aminoacizi care intra in structura proteinelor ii corespunde
cel putin un ARNt specific.
2. adaptarea aminoacidului transportat in dreptul codonului de pe ARNm care-l
specifica. Aceasta racordare este posibila prin recunoasterea codon-anticodon.
ARN ribozomal (ARNr) sunt molecule mari, flexibile si deformabile.
In functie de constanta de sedimentare (S) care depinde de forma si marimea
particulei, se impart in:
ARNr 23S, 16S, 5S la procariote
ARNr 28S, 18S, 5,8S si 5S la eucariote.
ARN ribozomal este tipul de ARN cel mai abundent (aproximativ 75% din totalul
ARN celular) si cel mai stabil metabolic.
CAPITOLUL IV
ENZIME
Enzimele sunt catalizatori proteici pentru reactiile chimice care se petrec in sistemele
biologice. In absenta enzimelor, majoritatea reactiilor din celula vie s-ar petrece cu viteze
foarte mici.
Spre deosebire de catalizatorii neproteici (ioni metalici, H , OH--) fiecare enzima
catalizeaza un numar mic de reactii, de cele mai multe ori una singura.
Exista un numar foarte mare de enzime; pentru fiecare compus organic c=t si pentru
multi compusi anorganici exista macar o enzima capabila sa reactioneze cu acesta si sa
catalizeze o anumita modificare chimica.
Mult timp s-a crezut ca activitatea enzimatica exista numai in celulele intacte; ulterior
multe enzime au fost extrase fara pierderea activitatii lor biologice, ceea ce a permis studiul
lor extracelular.
Extractele enzimatice sunt utilizate in studiul reactiilor metabolice, a structurii si
mecanismului lor de actiune si chiar in calitate de catalizatori in sinteza industriala de
compusi biologic activi: hormoni, medicamente.
Activitatea diferitelor enzime este str=ns legata de localizarea lor celulara; exista un
aranjament spatial si o compartimentare a enzimelor, coenzimelor si substratelor.
In citoplasma sunt localizate enzimele glicolitice. Mitocondriile, centrale de energie
ale celulei capteaza energia furnizata de procesele oxidative sintetiz=nd ATP din ADP si Pa.
In mitocondrii sunt localizate enzimele ciclului Krebs, cele ale oxidarii acizilor grasi.
Lizozomii, organite subcelulare, contin enzimele digestiei celulare care degradeaza grasimile,
proteinele, acizii nucleici si alte molecule mari in molecule mai mici care sunt apoi
metabolizate de sistemele enzimatice ale mitocondriei.
Multe celule au un sistem de membrane interne in citoplasma (reticulul endoplasmatic
format din lipoproteine). Pe suprafata interna a reticulului endoplasmatic se gasesc
numeroase granule bogate in ARN, numite ribozomi si care sunt sediul sintezei proteinelor.
Nucleul contine o cantitate mare de cromatina cu un continut mare din ADN-ul celular.
Clasificarea si nomenclatura enzimelor.
Comisia pentru enzime a Uniunii Internationale de Biochimie a stabilit un sistem de
clasificare zecimala care tine seama de reactia catalizata si de natura substratului si serveste
at=t pentru clasificare c=t si pentru nomenclatura. In acest sistem fiecare enzima este notata
cu un numar de cod format din patru cifre, numar care permite identificarea enzimei, a
substratului asupra caruia actioneaza si a reactiei catalizate. Prima cifra a numarului de cod
indica clasa si se refera la tipul reactiei catalizate. Din acest punct de vedere enzimele sunt
grupate in sase clase:
1. Oxidoreductaze catalizeaza reactii de oxidoreducere;
2. Transferaze catalizeaza transferul de grupari de pe un substrat (donor) pe alt
substrat (acceptor);
3. Hidrolaze catalizeaza reactiile de scindare in prezenta apei;
ADH
CH3 CH2 OH
NAD+
CH3 CHO
NADH+H+
LDH
CH3 CH COOH
CH3 C COOH
OH
O
NAD+
NADH+H+
1.4. Enzime ce actioneaza asupra gruparii CH-NH2 ca donor de electroni.
1.4.13. L-glutamat: NAD(P) -oxidoreductaza (glutamat dehidrogenaza).
L-glutamat + H2O +
NAD(P)+
GlDH
Alfa+
Cetoglutarat + NH4 + NAD(P)H+H+
CoA O-acetilcolina
fosforilaz\
(glucoz\)n-1 + G-1-P
HK
ADP + G-6-P
3. Hidrolaze
Sunt enzime ce catalizeaza ruperea unor legaturi organice cu participarea apei, dupa
reactia:
A-B ( H2O (( AH ( BOH
Legaturile care pot fi desfacute prin hidroliza sunt legaturile esterice, eterice,
peptidice, anhidride, C-N (altele dec=t C-N din legatura peptidica), C-X, P-N.
Caracteristic pentru aceasta clasa de enzime este lipsa coenzimelor. Ele necesita
prezenta unor ioni metalici pentru activare. Din aceasta clasa fac parte in general enzimele
digestive.
3.1. Esterazele scindeaza legaturile esterice: carboxi esteraze, tio esteraze, fosfo
esteraze, sulfo esteraze.
3.1.1.8. Acetilcolin-acil hidrolaza (pseudocolin-esteraza)
CH3 CO O
+ H2O
CH3 COOH +
R2
R3
R4
H2N CH CO NH CH CO.................... NH CH CO NH CH COOH
C C
X Y
Y +
Aceasta clasa include enzimele care actioneaza asupra legaturilor C-C, C(O, -C(N,
(C(S, -C-X.
4.1.2. Aldehid-liaze:
4.1.2.7. Cetoz-1-fosfat-aldehid-liaza (aldolaza) scindeaza legatura C-C din fructoza
fosforilata:
Fructoz-1,6-Difosfat
Aldolaza
4.2. Carbon-oxigen-liaze
4.2.1.2. L-Malat-hidro liaza (fumaraza)
Pagina 50 din 105
L-Malat
Fumarat H2O
5. Izomeraze
Cuprinde enzimele care catalizeaza interconversiunea izomerilor optici, geometrici si
de catena.
5.1. Racemaze si epimeraze
5.1.1.1. Alanin-racemaza:
L-Alanina
Alaninracemaza
D-Alanina
5.2. Cis-trans-izomeraze
5.2.1.3. All-trans-retinol:11-cis-trans-izomeraza (retinen-izomeraza)
All-trans-retinol
11-cis-retinol
CH2OH
C O
TI
CH2 O P
Aldehid\ 3-P-gliceric\
6. Ligaze
Clasa ligazelor cuprinde enzimele care catalizeaza legarea a doi compusi, cuplata cu
ruperea unei molecule de ATP (utilizeaza aceasta energie pentru realizarea noii legaturi). In
acest mod se realizeaza legaturi C-O, C-S, C(N, C-C.
6.3. Enzime care catalizeaza formarea legaturii C-N
6.3.1.2. L-Glutamat amoniac-ligaza (ADP) (glutamin sintetaza):
L-Glutamat + NH4
Glutaminsintetaz\
ATP
Glutamin\
ADP+Pa
Acetil-CoA
ATP
Malonil-CoA
ADP+Pa
Structura enzimelor
Specificitatea mare a unei enzime este str=ns legata de structura ei fizica si chimica.
Din punct de vedere chimic, o enzima este formata dintr-o parte proteica - apoenzima si o
parte neproteica - coenzima sau cofactor.
Partea proteica este termolabila iar coenzima este termostabila si dializabila.
Tipurile de reactii care necesita pentru cataliza participarea coenzimelor sunt reactii
de transfer de grupari, de izomerizare, de oxido reducere (transfer de H) si cele care au drept
rezultat formarea de legaturi covalente (clasele 1, 2, 5, 6).
Spre deosebire de acestea, reactiile litice, incluz=nd si pe cele hidrolitice (reactiile
catalizate de enzimele digestive) nu au nevoie, pentru actiune de coenzime (clasele 3 si 4).
Apoenzima. Enzimele simple si apoproteinele enzimelor complexe sunt formate din
catene lungi polipeptidice, av=nd aceleasi nivele de organizare structurala ca si alte proteine:
primara, secundara, tertiara si cuaternara.
Desi toate enzimele au structuri primare, secundare si tertiare, structura cuaternara nu
este obligatorie.
Fiecare nivel de organizare structurala are o anumita semnificatie biologica. De
exemplu, o enzima care are o structura primara corecta, dar celelalte structuri incorecte, nu
este catalitic activa. La fel, subunitatile cu structura primara, secundara si tertiara corecte, dar
fara structura cuaternara corecta, sunt inactive.
Structurile secundara, tertiara si cuaternara pot fi dictate de structura primara. desi o
proteina poate avea mai multe conformatii, forma biologica activa este aceea cu nivelul
energetic cel mai scazut, aceea cu cea mai mare stabilitate structura tridimensionala. Un
argument in favoarea acestui fapt il constituie capacitatea multor enzime, a caror conformatie
activa a fost distrusa prin denaturare bl=nda, de a-si reface activitatea prin pastrarea in
conditii care favorizeaza ruperea si refacerea legaturilor secundare.
Coenzime. Frecvent, coenzimele contin in structura lor vitamine din grupul B. Astfel,
vitamina B6 , vitamina PP, vitamina B1, B2, acidul pantotenic si acidul lipoic participa la
reactiile de oxido reducere, iar acidul folic si vitamina B12 intervin in metabolismul
fragmentelor de un atom de C.
Coenzimele sunt considerate ca al doilea substrat pentru enzima sau cosubstrat.
Dupa taria legaturilor dintre apoenzima si cofactor, deosebim:
grupari prostetice care sunt molecule organice fixate pe apoenzima si care disociaza
greu. Gruparea prostetica determina mecanismul dupa care se desfasoara unele procese
enzimatice, cum ar fi transportul de hidrogen, de electroni, de grupari NH2, -CH3, acetil.
coenzimele (se separa de apoenzima prin dializa si trec usor de la o apoenzima la alta)
sunt reprezentate de: NAD, NADP, NADHH, NADPHH, ATP, CTP, FMN, FAD, acidul
lipoic etc.
cofactorii anorganici sunt reprezentati de ioni ai diferitelor metale (Mg 2, Mn2, Cu2,
Zn2) care sunt indispensabili activitatii metal-enzimei. Acesti ioni metalici sunt furnizati in
cantitati mici prin alimentatie.
Nu se poate face, uneori, o delimitare neta intre coenzima si gruparea prostetica.
Acestea pot aduce enzima intr-o stare activa sau se pot comporta ca un al doilea substrat care
fixeaza temporar grupari, radicali sau electroni ce vor fi transferati de pe un substrat pe altul.
Coenzimele pot fi clasificate dupa tipul reactiei la care participa in doua categorii:
A. Coenzime ce participa la transferul hidrogenului:
1. Coenzimele piridinice (NAD, NADP)
2. Coenzimele flavinice (FMN, FAD)
3. Acidul lipoic
4. Coenzima Q
B. Coenzime care participa la transportul de grupari (altele dec=t H):
1. Glucide fosforilate
2. CoA-SH
3. Tiamin pirofosfat (TPP)
4. Piridoxal-5-P
5. Acizii folinici
6. Biotina
7. Coenzimele vitaminei B12
8. Acidul lipoic
Se constata ca in structura multor coenzime intra AMP, de aceea aceste coenzime pot
fi considerate derivati ai AMP care difera in privinta substituentilor R 1; R2; R3 si ai numarului
de grupari fosfat legate la carbonul 5/ din riboza.
NH2
N
N
N
O
CH2
N
O
O P O R1
OH n
H H
H
H
R2O OR3
Izoenzimele sunt forme moleculare multiple ale aceleiasi enzime. Ele catalizeaza
aceeasi reactie enzimatica, dar difera intre ele in privinta proprietatilor fizice, chimice si
imunologice.
Interesul medical pentru izoenzime a fost stimulat prin descoperirea in 1957, in serul
uman, a mai multor izoenzime LDH, a caror proprietati relative se modifica semnificativ in
anumite stari patologice.
Existenta izoenzimelor a fost relatata si in alte tesuturi ale mamiferelor, ca si la pasari,
pesti, insecte.
Cele 5 izoenzime LDH difera intre ele in ceea ce priveste structura cuaternara.
Molecula activa de LDH este un tetramer format din doua tipuri de subunitati H si M luate
c=te patru (fiecare subunitate av=nd 34.000 daltoni).
Subunitatea H (heart) este caracteristica muschiului inimii si in general tesuturilor cu
metabolism aerob, iar subunitatea M (muscle) este caracteristica muschiului scheletic si in
general organelor si tesuturilor cu metabolism anaerob. Exceptie fac ficatul si eritrocitul.
Clement Markert a utilizat fenomenul de distrugere si refacere a structurii cuaternare,
pentru a clarifica structura izoenzimelor LDH. Efectu=nd experiente cu LDH 1 si LDH5, a
ajuns la concluzia ca acestea sunt formate din subunitati de acelasi tip. Amestec=nd LDH 1 si
LDH5 purificate prin recombinare, a obtinut inca trei izoenzime hibride : LDH2, LDH3 si
LDH4. Structura celor 5 izoenzime LDH este:
LDH1 H4
LDH2 H3M1
LDH3 H2M2
LDH4 H M3
LDH5 M4
Sinteza celor doua tipuri este coordonata de doua gene diferite.
Ulterior au fost evidentiate izoenzime si pentru alte enzime: creatinkinaza CK 1(BB);
CK2(MB) si CK3 (MM), hexokinaza, fosfataza alcalina etc.
Specificitatea enzimelor
Majoritatea enzimelor fac parte din clasa proteinelor complexe, fiind compuse dintr-o
parte proteica - apoenzima si o parte prostetica - coenzima. Prin unirea celor doua parti se
formeaza holoenzima sau enzima propriu-zisa, forma sub care ea este activa.
In partea proteica este situata specificitatea enzimei, de actiune, dar mai ales de
substrat.
Dupa specificitatea de actiune enzimele pot fi grupate astfel:
a) enzime cu specificitate absoluta;
b) enzime cu specificitatea absoluta de grup;
c) enzime cu specificitate relativa de grup;
d) enzime cu specificitate optica sau stereochimica
a) Specificitatea absoluta. Unele enzime actioneaza numai asupra unui singur substrat,
cataliz=nd o singura reactie, de exemplu ureaza:
H2N C NH2 + H2O ureaz\
O
2 NH3 + CO2
Aceasta enzima este total inactiva fata de compusi foarte asemanatori structural cum
este tioureea: H2N-CS-NH2. De asemenea, arginaza, enzima care hidrolizeaza L-arginina la
uree si ornitina nu poate hidroliza esterul metilic al argininei sau scindarea agmatinei
(rezultata prin decarboxilarea argininei.
NH CH2 CH2 CH2 CH COOH
HN C
NH2
NH2
Arginaza
SDH
HOOC CH CH COOH
c) Specificitatea relativa de grup. Multe enzime sunt specifice numai pentru anumite
tipuri de legaturi chimice indiferent de structura moleculelor respective.
Din acest grup fac parte ligazele sau esterazele care fac posibila scindarea mono-, disi trigliceridelor si chiar alti esteri cu structura chimica mult mai complicata. De exemplu,
acetilcolinesteraza, specifica pentru acetil-colina, poate scinda si alti esteri ai colinei cu acizii
propionic, butiric etc. Butiril-colina pare a fi substratul de electie, fiind hidrolizata mai rapid
dec=t alti esteri ai colinei.
Enzimele proteolitice care hidrolizeaza legaturile peptidice din proteine si din alti
compusi neproteici, fac parte tot din acest grup.
d) Specificitatea optica. Enzimele catalizeaza transformarea numai a unui
stereoizimer; aceasta specificitate optica este de obicei absoluta, celalalt antipod ram=n=nd
neschimbat. De exemplu, L-serin-hidroliaza si D-serin-hidroliaza enzime care catalizeaza
dezaminarea serinei la piruvat:
CH2 OH
CH NH2
COOH
CH2
C NH2
H2O COOH
CH3
C NH
COOH
H2O
NH2
CH3
C O
COOH
Fumaraza
HOOC C C COOH
H
H2O
OH
x
R
E
k1
k3
k2
(E-A)
E-A
Din numarul foarte mare de resturi de aminoacizi numai un numar limitat (un segment
limitat de enzima) participa la interactiunea cu substratul. Pe aceasta portiune exista grupari
functionale capabile sa atraga si sa fixeze molecula substratului intr-o pozitie privilegiata si
intr-un loc (situs) strict determinat. Ansamblul acestor grupari chimice functionale alcatuiesc
centrul catalitic al enzimei. In segmentul polipeptidic al centrului catalitic se deosebesc trei
grupe de aminoacizi:
- aminoacizi implicati in prima etapa a catalizei enzimatice deci cei care constitue
locul sau situsul de specificitate si asigura recunoasterea substratului pentru reactia ES
E-S sa poata avea loc;
- aminoacizi care participa la transformarea chimica a substratului in produs de reactie
conform ecuatiei E-S EP. acesti aminoacizi alcatuiesc partea catalitica a centrului
activ;
- aminoacizi necesari mentinerii conformatiei adecvate a centrului catalitic, a situsului
alosteric (care regleaza functionarea centrului activ) si pozitionarea adecvata a enzimei in
interiorul celulei (de exemplu, asocierea enzimei cu alta enzima pentru formarea unui
complex multienzimatic sau legarea de membrana).
Centrul catalitic cuprinde aminoacizi din primele doua grupe.
Uneori centrul catalitic este reprezentat de unele catene laterale ale lanturilor
peptidice din structura enzimei.
De exemplu, in cazul pseudocolinesterazei, centrul catalitic contine acid glutamic,
serina, alanina. S-a sugerat ca la nivelul acidului glutamic (la gruparea carboxil) se fixeaza
gruparea bazica a colinei (-N(CH3)3 iar la nivelul gruparii OH din serina s-ar fixa radicalul
acetil. Prin aceasta, molecula de acetilcolina se leaga labil de enzima, iar legatura esterica se
desface. Produsii care rezulta (colina si acetatul) parasesc centrul catalitic al enzimei care va
fixa o noua molecula de acetilcolina.
Deci reactia enzimatica poate fi conceputa ca av=nd loc in doua etape: formarea
complexului enzima - substrat, urmata de modificarea substratului si desprinderea produsului
de reactie de pe enzima.
Centrul catalitic a fost conceput multa vreme ca un tipar rigid, preformat, substratul
potrivindu-se in enzima ca si cheia in broasca (lock and key) sau template (modelul
Fischer). Desi in acest model centrul activ este rigid, el se mai foloseste inca pentru
explicarea unor proprietati enzimatice, cum ar fi legarea intr-o anumita ordine a substratelor
sau curba de saturare cu substrat.
E+P
ES
E+S
S
S
E+P
ES
E+S
cel imaginat de Koshland, numit induced fit (fixare indusa), modelul cu cel mai puternic
suport experimental. Principala caracteristica a acestui model este flexibilitatea centrului
activ. In absenta substratului, gruparile catalitice si de legare a substratului sunt situate la
departare unele de altele, separate de mai multe resturi de aminoacizi. Apropierea substratului
induce o modificare conformationala a enzimei inc=t gruparile care participa la legarea
substratului sau la reactia catalitica se apropie spatial.
Situsul (centrul) activ dintr-o enzima poate fi pus in evidenta prin tratarea cu anumite
substante ce au capacitatea de a se combina specific cu aminoacizii centrului catalitic,
inactiv=nd enzima.
Astfel, di-izo-propil-fluorfosfatul se combina specific cu serina din centrul activ al
majoritatii hidrolazelor (ex. colinesteraza).
CH3
HC O
CH3
H3C HC O
CH3
O
P
CO
HO CH2 CH
CH3
HC O
CH3
NH
-HF
H3C HC O
CH3
O
P
CO
O CH2 CH
NH
HS CH2 CH
NH
CO
_ HCl
Hg S CH2 CH
NH
COOH
COOH
CO
R As O
HS CH2 CH NH HS CH2
CH2 CH CH2
OH SH SH
CH NH CO
- H2O
R As
S CH2 CH NH S CH2 CH NH CO
(P)
1
t0
0
t1
t
Daca se reprezinta grafic cantitatea de
substrat transformat in produs, in unitatea de timp, se obtine o curba care comporta o parte
rectilinie in care viteza este constanta si una curba in care viteza scade pentru ca in final sa
devina nula.
Prima parte a curbei indica viteza initiala a reactiei v o, definita prin panta maxima a
curbei (unghiul dintre abscisa si tangenta la curba vo tg o
Viteza reactiei (v) la un timp dat (t) este egala cu dP/dt. Pentru a cunoaste viteza, este
suficient sa se masoare unghiul pe care il face tangenta la curba, la timpul t.
Tangenta la origine da viteza initiala a reactiei, v o. Viteza de reactie este influentata de
o serie de factori: concentratia enzimei, concentratia substratului, temperatura, pH, agenti
redox, presiune, radiatii etc.
Influenta concentratiei enzimei
Daca se utilizeaza concentratii cresc=nde de enzima (E1, E2, E3) cantitatea de substrat
transformat in unitatea de timp creste proportional cu concentratia enzimei (1X, 2X, 3X)
numai pentru un interval de timp si numai pentru portiunea rectilinie a curbei.
Proportionalitatea dispare c=nd este depasit un anumit timp t2 pentru concentratiile E2
si E3.
V
E3
E2
E1
3x
2x
1x
t0 t1
t2
E
0
S
Km
ES
K1
K2
ES
K3
E+ P
(1)
E + S
ES
E + P
(2)
Un
studiu
cantitativ
variatiilor vitezei unei reactii enzimatice in functie de concentratia de substrat a fost efectuat
de Michaelis si Menten si care se bazeaza pe relatia:
Obtinerea unui echilibru intre E, S si ES este un proces rapid in comparatie cu reactia
ES ( E(P (3).
Viteza reactiei enzimatice este proportionala cu concentratia complexului ES, deci v
( K3 ES (4).
La vmax., concentratia de substrat este cea la care toata enzima este legata de substratul
sau.
ET
vmax = K3 ET
(5)
Valoarea maxima a ES este egala cu concentratia
totala in enzima:
v
vmax
Km = Ks =
K ES
K ET
K2
K1
ES
(6)
ET
E . S
(7)
ES
ET _ ES . S
(8)
ES
= Km + S
sau
ES =
ET . S
Km + S
(9)
ES
ET
ES
ET
(10)
Km + S
sau inca:
vmax
vmax
dar
(11)
Km + S
S . vmax
(12)
ET + S
v =
vmax
2
obtinem
Km + S =
2 S vmax
=2 S
vmax
si Km = S
(13)
S
Km + S
S
Km
vmax
iar v tinde spre vmax.. Daca, din contra, S este foarte mica in raport cu Km, v devine egal
cu
ES
care implica recunoasterea substratului de catre centrul activ al enzimei, etapa caracterizata
prin Km egal cu
care este caracterizata de vmax. Deoarece este dificil de reprezentat viteza reactiei pentru
concentratii mici de substrat, unde precizia este destul de mica, s-a incercat o linearizare a
ecuatiei Michaelis care a fost realizata de Lineweaver si Burk.
Ecuatia Michaelis si Menten se poate scris sub forma:
v =
vmax S
Km + S
(14)
sau
Km + S
1
=
v
vmax S
(15)
sau inca
1 + 1
vmax
S
1 = Km
v vmax
(16)
1
v
Km
v max
care
1
v max
si
1
S
si
1
v
sunt constantele a si b.
1
v
1
vmax
1
v max
vitezele invers
- 1
Km
1
Km
in functie de
sau
deci:
1
S
Reprezent=nd grafic
Km
1
1
+ vmax
0= v
x
max
S
(17)
v
1 =- 1
x max
v
Km
max
S
(18),
1 = 1
S
Km
(19)
1
v =0
V Curba de Curba de
denaturare activare
Temperatura
optim\
20o
40o
60o
4 6
pH
SH
SH
S
oxidare
E
reducere
S
Potentialul
redox al
mediului
influenteaza
starea
gruparilor care intra in constitutia enzimelor, ele put=nd fi oxidate sau reduse. Astfel
gruparile SH din dehidrogenaze pot fi modificate prin reactii de tipul:
Enzim\
SH + ICH2
COOH
HI + Enzim\
S CH2 COOH
CH3
CH3
Enzim\ CH2OH + F P
O CH CH3
CH3
O CH
CH3
CH3
CH2O P
O CH CH3
CH3
O
HF + Enzim\
O CH
ES
EP
EI
_
1
V
Inhibi]ie
competitiv\
1
1
- __
- __
Km
1/Vmax
F\r\
inhibitor
Km
1
S
dreapta corespunzatoare inhibitiei competitive taie axa absciselor intr-un punct 1/K m care
permite calculare valorii K/m.
Inhibitia competitiva exista la toate enzimele. Un analog structural al substratului,
nemetabolizabil, este in general un inhibitor competitiv.
De exemplu, succindehidrogenaza, inhibata de diferiti analogi structurali ai acidului
succinic:
COOH
COOH
CH
+ AH2
HC
(acceptor,
COOH form\ redus\)
CH2
+ A
(acceptor,
form\ oxidat\)
COOH
CH2
Acid succinic
Acid fumaric
COOH
COOH
acid
oxalic
COOH
CH2
COOH
acid
malonic
COOH
CH2
CHOH
COOH
acid
malic
COOH
CH2
C O
COOH
acid
oxalacetic
COOH
(CH2)3
COOH
acid
glutaric
H2N
COOH
H2N
SO2 NH2
sulfonamid\
Efectorii alosterici
Activitatea catalitica a enzimelor poate fi alterata si de compusi care se fixeaza pe
enzima in locuri indepartate de centrul activ (loc alosteric). Acesti compusi pot creste
activitatea catalitica si se numesc efectori pozitivi, sau pot reduce activitatea catalitica si se
numesc efectori negativi. Acestia sunt deci modulatori metabolici sau efectori enzimatici.
Enzimele alosterice se deosebesc de alte enzime prin faptul ca au un raspuns atipic al
vitezei de reactie in functie de S iar curba obtinuta are o forma sigmoida (in forma de S)
ceea ce demonstreaza ca aceste enzime au un efect cooperativ, adica legarea primei molecule
de substrat la centrul catalitic al enzimei favorizeaza legarea celei de a doua molecule, marind
capacitatea catalitica a enzimei.
Vmax
Km'
KmKm'
Vmax
2
Zimogenii (proenzime) sunt secretate in forme inactive, iar prin ruperea unor
legaturi peptidice specifice sunt transformati in catalizatori activi, printr-un proces ireversibil.
Activarea zimogenilor este un proces catalitic, alteori autocatalitic gener=nd o activare in
cascada. Astfel de cascade activatoare sunt int=lnite la digestia proteinelor, coagularea
s=ngelui, functionarea sistemului complementului.
Antienzime (antiproteaze)
Unele enzime proteolitice provin din zimogeni prin procese activatoare declansate de
anumite semnale. Pentru a bloca, a intrerupe actiunea acestor proteaze este utilizat un
mecanism inhibitor la care participa unele proteine reglatoare denumite antiproteaze
(antienzime). Proteina antienzima se leaga prin forte necovalente la enzima, bloc=ndu-i
centrul activ. Mai cunoscuta este o familie de antienzime care blocheaza actiunea unor
proteaze care cuprind resturi de serina in centrul activ si sunt denumite serpine. Din aceasta
familie fac parte inhibitorul pancreatic al tripsinei, antitrombina, 1-antitripsina, 2macroglobulina.
Inhibitorul pancreatic al tripsinei este o proteina mica care se leaga foarte str=ns la
tripsina prevenind astfel activarea prematura a cascadei de enzime proteolitice.
NH CH CO
NH CH CO
oxidare
CH2
CH2
ComplexeCH
multienzimatice
CH2 S CH3
2 S CH3
O
Cresterea eficientei globale a unui proces care implica parcurgerea
unui sir mai lung
Metionin\
Metionin\
sulfoxid
de reactii se realizeaza prin asamblarea diverselor proteine catalitice intr-un complex
multienzimatic sau prin localizarea fiecarei activitati catalitice pe un domeniu structural al
unei proteine mari, rezult=nd o enzima multifunctionala.
Integrarea structurala a mai multor enzime intr-o unitate functionala face posibila
cataliza coordonata a unei succesiuni de reactii.
Intermediarii de reactie trec pe r=nd de la un centru activ la altul, nu are loc difuzia si
diluarea lor in mediu. Pentru o enzima multifunctionala, codificata de o singura gena, sinteza
proteica asigura si raportul optim cantitativ intre diversele activitati catalitice.
Ca exemple de enzime multifunctonale amintim: piruvat-dehidrogenaza, (cetoglutarat dehidrogenaza, acid gras sintetaza.
Diversele activitati catalitice sunt localizate pe acelasi lant polipeptidic organizat in
mai multe domenii structurale.
Distributia intracelulara a enzimelor.
Separarea organitelor celulare prin ultracentrifugare urmata de identificarea cu
ajutorul tehnicilor histochimice si biochimice a permis elaborarea unui tablou al distributiei
intracelulare a enzimelor.
Orice celula specializata dispune numai de enzime care catalizeaza reactii in celula
data.
Unele enzime cum sunt cele implicate in biosinteza proteinelor si a acizilor nucleici,
glicoliza, ciclul Krebs etc. se afla in toate tipurile de celule specializate. Fara functionarea
acestor cai nici un tip de celule nu poate exista.
Pe de alta parte, fiecare tip de celula specializata dispune de seturi de enzime care
catalizeaza reactii din caile metabolice particulare. Asa sunt enzimele din sinteza ureei care se
afla numai in ficat, creatinkinaza care se afla aproape in totalitate in muschi, enzimele
implicate in biosinteza hormonilor tiroidieni sunt localizate numai in tiroida etc.
Intr-o celula data, locul unde se afla unele enzime coincide cu locul de desfasurare a
unei cai metabolice sau a unei secvente metabolice din care face parte reactia pe care o
catalizeaza. Astfel, glicoliza se desfasoara numai in citoplasma, deci toate enzimele glicolizei
sunt in citoplasma. Biosinteza ureei are loc in mitocondria hepatica si in citoplasma, astfel ca
unele enzime a acestei cai metabolice sunt citoplasmatice, altele mitocondriale. Enzimele
implicate in sinteza ARN-ului sunt localizate in nucleul celular care este sediul sintezei.
Unele
enzime
au
localizare
dubla:
izocitric
dehidrogenaza,
glutamic-oxal-acetic
transaminaza, pot fi at=t mitocondriale c=t si citoplasmatice. Multe enzime sunt legate de
membrana celulara sau sunt incluse in aceasta membrana, cu localizare spre citoplasma sau
spre exterior. In cazul mitocondriilor, enzimele pot fi legate de membrana interna, de
membrana externa sau se gasesc in matricea mitocondriala.
In plasma se afla un numar foarte mare de enzime functionale (cele implicate in
coagulare si fibrinoliza, pseudocolinesteraza, lipoprotein lipaza) si nefunctionale a caror
activitate se determina in relatie cu bolile de metabolism (glucidic, lipidic si protidic). Aceste
enzime nefunctionale au o provenienta multipla (hepatica, cardiaca, musculara, renala,
osoasa).
Kinurenin
intermembranar
Adenilat kinaza,
Nucleozid difosfat-
Matrix
Succinat
Piruvat
dehidrogenaza,
dehidrogenaza,
F1-ATPaza,
Citrat sintetaza,
hidroxilaza,
kinaza
Nucleozid difosfat-
NADH-
Izocitrat
kinaza,
dehidrogenaza,
dehidrogenaza,
Fosfolipaza A,
-OH-
Aconitaza,
dehidrogenaza,
Acid gras-CoA
Citocromii b, c1,c,
Fumaraza,
sintetaza,
a,a3,
NADH.cit.c
Carnitin-acil-CoA
Succinil-CoA
reductaza,
transferaza,
sintetaza,
Colin
Adenin nucleotid
Malat-
fosfotransferaza,
translocaza,
dehidrogenaza,
Mono-, di- si
Glutamat-
tricarboxilat
dehidrogenaza,
translocaza,
Glutamat-aspartat
Glutamat-
translocaza
oxalacetat
transaminaza,
Ornitin
transcarbamilaza,
Sistemul oxidarii acizilor
grasi
Dupa T.M.Devlin:
Biochemistry, 1992
Unele enzime sunt considerate markeri pentru anumite organite.
Astfel:
glutamic dehidrogenaza este marker pentru mitocondrie,
glucoza-6-fosfataza pentru reticulul endoplasmic,
fosfataza acida pentru lizozomi,
Na/K-ATP-aza si 5 nucleotidaza pentru membrana plasmatica,
catalaza, acid uric oxidaza pentru peroxizomi,
galactozil transferaza pentru aparatul Golgi, iar
lactat dehidrogenaza pentru citoplasma.
Enzime imobilizate
Enzimele imobilizate sunt importante din punct de vedre teoretic pentru modelarea
membranelor biologice naturale c=t si din punct de vedre practic datorita duratei de viata
prelungita. Au aplicatii in cromatografia de afinitate, in terapie si in tehnologia industriala ca
agenti biologici. Ca aplicatii terapeutice, importante sunt protezele interne enzimatice (prin
implantarea permanenta a unei enzime imobilizate) pentru tratamentul erorilor enzimatice
innascute si membranele de oxigenare utilizate in dializa renala (purtatoare de catalaza si
anhidraza carbonica).
Un sistem important pentru terapie este si cel reprezentat de lizozomi, in care se
includ enzime lizozomale pentru tratamentul substitutiv in tezaurismozele sfingolipidozice.
Enzimele se includ in membrane lipidice artificiale sau in membrane de eritrocit.
O trasatura caracteristica, importanta pentru aplicatiile practice si care decurge din
imobilizare, este aceea ca cinetica acestor sisteme se indeparteaza de legile cineticii in sistem
omogen si se apropie mai mult de cinetica enzimelor alosterice care prezinta interactii
cooperative. Factorul important care determina cinetica reactiei in interiorul structurii
enzima-suport este difuzia speciilor moleculare.
Imobilizarea mareste durata de viata a enzimelor si micsoreaza probabilitatea de
distrugere ireversibila sau a denaturarii termice, scaz=nd capacitatea de autoliza.
Prepararea sistemelor de enzime imobilizate se realizeaza prin:
- absorbtia pe suport inert (sticla, colodiu, nylon) sau pe rasini schimbatoare (carboximetil-celuloza, DEAE celuloza, sefaroza activata cu bromura de cianogen), suporturi derivati
de polistiren, peptide artificiale, polimeri micsti de polilizina si anhidrida maleica, siliconi;
- legarea incrucisata covalenta a protein-enzimei de un suport insolubil in apa prin
grupari functionale neesentiale pentru activitatea sa biologica;
O
H Ozele
sau semicetonic, alaturi de functii alcoolice primare si secundare. Dupa numarul atomilor de
carbon pot fi trioze, tetroze, pentoze, hexoze, heptoze etc.
ciclu piran
aldehidice (
H OH
1C
H 2C OH
HO 3C H O
H 4C OH
H 5C
CH2OH
CH2OH
O
O OH
H
H
H
H
H
;
H
OH
H
OH
HO
OH HO
H
OH
OH
H
H
6CH2OH
H OH
C
H C OH
HO C H O
H C OH
H C
CH2OH
-D-glucopiranoz\
(tip Tollens)
-D-glucopiranoz\
OH
O
HO 3C H
H C OH
4
H 5C
HOH2C 5
C
H
H
HO
OH
CH2OH
OH
CH2OH
-D-fructofuranoz\
Inelul piranozic poate exista in doua conformatii: forma scaun si forma baie.
formabaie
formascaun
Forma scaun a inelului piranozic este mult mai stabila predomin=nd in solutiile
hexozelor.
H
HO
HO
CH2OH
CH2OH
HO
HO
OH
OH
H
H
OH
OH
-D-glucopiranoz\
-D-glucopiranoz\
Structura
CH3
4
H
HO
OH
HO
OH
OH
-L-fucoz\
O OH
CH3
4
OH
HO
HO 1
H
-L-ramnoz\
Acesti doi compusi sunt componente importante ale peretelui celular bacterian.
Importanta deosebita prezinta 2-dezoxi-D-riboza, o pentoza care deriva din D-riboza
prin inlocuirea gruparii hidroxil de la C2 printr-un atom de hidrogen:
5
HO H2C
OH
4H
H 3
H1
2 H
H
Aceasta pentoza intra in structuraOH
acizilor
dezoxiribonucleici.
-D-deoxiriboz\
CH2OH
CH
CH2OH
2OH
(2
dezox
i-D-riboz\)
O
O
H
OH
H
H
HO
H
i
H
H
;
H
;
H
OH
H
OH
HO
NH2
OH
H2N
OH
HO
OH
NH C CH3
OH
O
D-galactozamin\
D-manozamin\
N-acetil-D-glucozamin\ Ozaminele
sunt derivati ai ozelor la care gruparea hidroxil de la C2 a fost substituita printr-o functie
amino (-NH2), frecvent acetilata. Importante sunt patru hexozamine reprezentate de:
galactozamina, manozamina, glucozamina, acid muramic:
CH2OH
H
HO
H
OH
H3C
H
C
H
_
COO
OH
H
OH
NH C CH3
O
acid N-acetil-muramic
(-lactil-N-acetil-glucozamin\)
D-galactozamina este componenta glicolipidelor si a polizaharidelor din cartilagii
(condroitin-sulfatul).
D-glucozamina este prezenta in multe din polizaharidele tesuturilor de vertebrate si
este componentul major al chitinei, un polizaharid structural al tegumentelor exterioare ale
insectelor si crustaceelor.
Acidul N-acetil muramic este elementul major din structura peretelui celular bacterian
si se afla legat cu N-acetil-glucozamina. Legatura intre acesti doi compusi poate fi usor
desfacuta de lizozim, o enzima prezenta in gura si cavitatea nazala care constituie un
mecanism de aparare nespecific.
Acizii uronici sunt derivati ai aldozelor in care functia de alcool primar este oxidata la
functie carboxilica, cu conservarea functiei aldehidice.
Mai rasp=ndit este acidul D-glucuronic. Participa la procesele de detoxifiere prin care
unii compusi sunt eliminati, sub forma conjugata, din organism. Se formeaza prin
conversiunea D-glucozei.
COOH
H
HO
OH
H
OH
OH
OH
acid D-glucuronic
H
H
HO
COOH
OH
H
OH
H
HO
H
OH
H
OH
H
OH
OH
H
OH
OH
acid galacturonic
acid iduronic
OH
COOH
H
C
H3C C HN
O
C
H C OH
H
C
OH
H C OH
CH2OH
Derivatii acidului neuraminic sunt numiti acizi sialici. Acizii sialici sunt distribuiti in
toate tesuturile. Cei din tesuturile umane contin o grupare N-acetil, iar cei din celelalte specii
contin o grupare N-glicozil.
Unii compusi, precum acidul L-ascorbic, L-sorbitolul, D-manitolul, glicerolul,
mioinozitolul sunt derivati ai ozelor.
CH2OH
HO C
H C OH
HO C
H C
HO C H
H C OH
CH2OH
H C OH
HO C H
CH2OH
CH2OH
acid L-ascorbic
H C OH
CH2OH
HO
OH
OH
H
OH
H
H
OH
OH
H
glicerol
mio-inozitol
L-sorbitol
chimice
sunt
determinate
de
prezenta
gruparilor
functionale
In prezenta unor agenti alcalini si sulfat sau iodura de metil, gruparile hidroxil libere
pot fi inlocuite cu grupari metoxi (OCH3). Metilarea se foloseste pentru determinarea pozitiei
puntii de oxigen din structura moleculei sau a locului in care se face legatura ozidica in
structurile poliozidice.
Cu alcoolii, aldozele sau cetozele, in prezenta de acid clorhidric, formeaza si
heterozide:
CH2OH
H
HO
H
OH
CH2OH
OH
H
[i
HO
OCH3
OH
H
OH
H
O OCH3
H
OH
-metilglucozid
-metilglucozid
OH
CH
HOH2C C
H
OH
CH
O
CH C
H
HO
H2SO4
(cald)
HC
HOH2C C
CH
O
C C
O
H
hidroximetilfurfural
D-glucoz\
Cei doi compusi, in prezenta unor derivati fenolici (rezorcina, orcina) dau derivati de
condensare colorati, cu care se pot identifica diferite cetoze, pentoze, metilpentoze si se pot
diferentia aldozele de cetoze.
Actiunea fenilhidrazinei in exces, la cald, se finalizeaza prin formarea unor osazone
caracteristice pentru fiecare tip de glucid.
O
C
H C OH
C N NH
CH2OH
C N NH
C O
HO C H
H C OH
HO C H
H C OH
HO C H
H C OH
H C OH
H C OH
H C OH
CH2OH
CH2OH
D-glucoz\
CH2OH
D-fructoz\
osazon\ comun\
glucozei [i fructozei
Global, se prezinta
astfel:
H C OH
HO C H
H C OH
H C OH
H2
CH2 OH
CHO
CHO
CH2 OH
H C OH
HO C H
HO C H
H C OH
HO C H
H C OH
H C OH
H C OH
H2
HO C H
HO C H
H C OH
H C OH
CH2OH
CH2OH
CH2OH
CH2OH
sorbitol
glucoz\
manoz\
manitol
Oxidarea aldozelor se poate efectua cu oxidanti mai energici (HNO 3 concentrat) sau
oxidarea se poate efectua cu protejarea gruparii carbonil c=nd se obtin acizi uronici cu
importanta biologica in detoxifierea organismului.
COOH
H C OH
oxidare
energetic\
HO C H
H C OH
CHO
COOH
H C OH
H C OH
H C OH
oxidare
bl=nd\
HO C H
H C OH
COOH
Acid D gluconic
HO C H
H C OH
H C OH
H C OH
CH2OH
CH2OH
Acid D-gluconic
COOH
Glucoz\
cu protejarea
grupei -CHO
HO
OH
H
OH
OH
OH
Acid D-glucuronic
Epimerizarea ozelor
Se numesc epimeri doua substante care nu difera dec=t prin conformatia spatiala a
unui singur centru de asimetrie moleculara, intr-o molecula care contine mai multi centri
asimetrici. Sunt epimeri D-glucoza si D-galactoza, in raport cu atomul de carbon 4, iar Dglucoza si D-manoza in raport cu atomul de carbon 2;
CH2OH
HO
H
4
OH
H
H
OH
H
CH2OH
H
OH
OH
D-galactoz\
HO
H
OH
H
OH
H
OH
OH
D-glucoz\
CH2OH
H
HO
H
OH
H
OH
HO
OH
D-manoz\
Trecerea unui epimer in altul (epimerizare) se poate practic realiza pe cale chimica
sau enzimatica.
Ozidele sunt glucide care, prin hidroliza acida sau bazica, genereaza una sau mai
multe oze. Acestea cuprind: holozide, care contin numai molecule de oze si heterozide care se
desfac, prin hidroliza, in oze si o componenta neglucidica (numita aglicon).
Holozidele mai studiate sunt diholozidele, triholozidele, poliholozidele.
Diholozidele naturale pot fi reducatoare (c=nd functia semi-acetalica a unei oze este
angajata intr-o legatura ozidica cu hidroxilul alcoolic a celei de a doua oze) si nereducatoare
(c=nd cele doua oze sunt legate prin cele doua functii semiacetalice).
Dintre diholozidele reducatoare fac parte maltoza formata din doua molecule de (-Dglucoza unite (-1,4 glicozidic), lactoza (rezultata prin unirea unei molecule de D-galactoza
angajata prin functie semiacetalica si o molecula de D-glucoza angajata prin hidroxilul din
pozitia 4) si trehaloza rasp=ndita in ciuperci si formata din doua molecule de (-glucoza unite
(-1( glicozidic:
CH2OH
H
HO
H
OH
CH2OH
OH
H
H
O
OH
H
OH
CH2OH
OH
H
HO
;
OH
OH
H
OH
H
CH2OH
H
H
HO
H
OH
H
CH2OH
H
HO
H
OH
H
OH
HO
HO
HO
H
OH
H
OH
H
OH
H
OH
OH
OH
H
HO
HOH2C
O
C H HO C
H
CH2OH
OH H
O
H
H
OH
H
lactoza
maltoza
CH2OH
CH2OH
zaharoza
(1 -D-glucoz\
2 -D-fructoz\)
Trehaloza
Dintre holozidele nereducatoare, mai rasp=ndita este zaharoza formata prin unirea
unei molecule de D-glucoza, cu o molecula de D-fructoza, ambele angajate prin functiile lor
semiacetalice in legatura ozidica.
Dintre triholozide, mai rasp=ndita este rafinoza, obtinuta din sfecla de zahar si care
contine glucoza, galactoza si fructoza. Este un triholozid nereducator.
Laptele de femeie este bogat in oligozide derivate din lactoza, unele av=nd un rol
fiziologic important favoriz=nd activitatea florei intestinale a sugarului. Laptele contine
oligozide cu acizi sialici.
Poliholozidele sau polizaharidele sunt formate dintr-un numar mare de oze, fie
identice (homopoliozide), fie de tipuri diferite (heteropoliozide).
Homopoliozidele (glucozani, poliozide homogene) sunt formate numai din unitati de
glucoza. Din aceasta categorie face parte amidonul cu cei doi constituienti (amiloza,
amilopectina), glicogenul, celuloza, dextranii, chitina.
Amidonul este polizaharidul de rezerva din vegetale. Contine aproximativ 20%
amiloza si 80% amilopectina. Sursa principala din care se obtine amidon este reprezentata de
tuberculi, cartofi, boabe de gr=u, porumb. Este o macromolecula formata din unitati de (glucoza legate ( 1(4 si ( 1(6 glicozidice. Amidonul da solutii coloidale iar in lumina polarizata
reprezinta caracterul de birefringenta. Cu iodul da o culoare albastra.
Glicogenul, polizaharidul de rezerva din organismele umane, are o structura
asemanatoare amilopectinei dar mult mai ramificata. Cu iodul da o culoare brun-roscata.
Detranii sunt poliozide formate din unitati de ( glucoza legate 1-6 glicozidic. Se
gasesc la diferite bacterii. Sunt utilizati pentru cromatografie pe gel sau unii sunt utilizati in
terapeutica ca inlocuitori ai plasmei sanguine.
Chitina este polimer de N-acetilglucozamina a carei molecule sunt unite prin legaturi
-1,4. Asociata cu saruri minerale si cu proteine constituie exoscheletul artropodelor.
Arabanii insotesc de foarte multe ori materiile pectice int=lnite in peretii celulelor, in
pulpa si invelisul fructelor.
Xilanii se gasesc in lignina vegetalelor si sunt formati din unitati de xilopiranoza.
Fructozanii, cum este inulina formata din unitati de fructofuranoza, se gasesc in
tuberculii unor plante. Inulina este utilizata in explorarile functionale ale rinichiului.
Heteropoliozidele elibereaza prin hidroliza monozaharide neutre, acizi uronici,
ozamine, acizi sialici..
Acesti polimeri, liniari sau ramificati, se gasesc in peretele citoplasmatic al bacteriilor
si in capsula. Sunt substante care deternina specificitatea diferitelor tipuri de bacterii. La
bacterii, aceste poliozide asigura rigiditatea si soliditatea germenului.
La animale, poliozidele se int=lnesc ca mucopolizaharide de structura, iar in s=nge
sub forma de mucopolizaharide de secretie.
H
OH
H
O
H
O
H
HO
H
OH
NH
C O
CH3
N-acetil glucozamin\
acid glucuronic
Acidul hialuronic are o functie importanta de a fixa usor moleculele de apa in spatiile
intracelulare ale tesutului conjunctiv. Hialuronidaza depolimerizeaza lantul lung al acidului
hialuronic si functioneaza ca un factor de difuziune permit=nd patrunderea mai usoara in
organism a unor produsi straini.
Condroitina are structura asemanatoare cu a acidului hialuronic fiind formata din acid
glucuronic si o molecula de N-acetil galactozamina:
CH2OH
COOH
O
H
OH
H
HO
O
H
H
OH
O
H
H
H
NH
C O
CH3
acid glucuronic
N-acetil galactozamin\
COOH
OH
H
OH
H
O
NH SO3H
H
OH
H
OH
H
OSO3H
heparina
H
OH
H
C O
NH C CH2 CH
NH C
CH3
NH
OH
H
O
NH C CH3
OH
O
HC
CH3 CH NH C O
COOH
CH2OH
HO
H
OH
H
OH
NH
R
O CH
unde R = H (serin\)
R = CH3 (treonin\)
NH
CH
C O
C O
CH3
CAPITOLUL VI
Citosol
Glutamat
Oxal-acetat
Aspartat
GOT
Translocaz\
Matrix
Glutamat
Aspartat GOT
Oxal-acetat
H+ +NADH
H+ +NADH
MDH -cetoglutarat
Malat
Translocaz\
-cetoglutarat MDH
Malat
NAD+
NAD+
NAD+
FMN
protein\
Substrat
cit.c
cit.a
Cu2+
Fe-S
protein\
cit.a3
cit.b
CoQ
Fe-S protein\
cit. c1
O2
NAD+
FpH2
Fe2+
CoQ
citocromi
S
NADH.H+
Fp
CoQH2
Fe3+
1/2 O2
_
O2
2H+
H2O
Substratul de baza este NADH care provine in urma oxidarii diferitelor substrate: OH butirat, -OH acil-CoA, glutamat, malat, izocitrat, piruvat, -cetoglutarat. Oxidarea
NADH de catre coenzima Q este catalizata de un complex de proteine NADH-dehidrogenaza
(simbolizate Fp1). Unele substrate sunt legate de lantul respirator prin intermediul
flavoprotein dehidrogenazelor (FAD, succinat, glicerol-3-fosfat) la coenzima Q.
De la nivelul coenzimei Q protonii trec in solutie, iar electronii sunt transferati
sistemului citocromic. Coenzima Q (ubichinona) este un compus lipidic, cu o molecula mica,
solubila in stratul lipidic al membranei mitocondriale, si se deplaseaza usor. CoQ formeaza
chinone relativ stabile capabile sa accepte un electron transform=ndu-se in semichinona sau
in chinol:
O
H3CO
CH3
H3CO
CH3
chinon\
_
+2 (+ H+ +2e )
+ H+ +2e
O.
OH
H3CO
CH3
H3CO
CH3
H3CO
H3CO
OH
OH
ubichinol
ubisemichinon\
_
+e
_
-e
cit Fe2+
Mitocondriile cuprind citocromii a, a3, b, c si c1. Citocromii difera intre ei prin natura
hemului, natura lantului polipeptidic si a modului de asociere dintre hem si proteina.
Citocromul c difera de hemul din hemoglobina sau mioglobina prin legarea covalenta
la resturile vinil din pozitiile 2 si 4 cu doua resturi cys (cys 14 si cys 17) din lantul
polipeptidic.
protein\
CH3
protein\
CH3
S CH
H3C
Fe
H3C
S protein\
CH CH3
N
N
CH3
CH2
CH2
CH2
CH2
COOH
HOOC
protein\
Citocromul c
Citocromii de tip a (a si a3) au in pozitia 8 gruparea CHO iar la restul vinil este
atasata o catena izoprenica cu 15 atomi de carbon.
CH3
CH3
CH3
CH2
C
CH2
CH2
C
C
CH2
CH
CH CH2
CH2
CH3
CH
CH3
HO CH
H3C
O C
H
Fe
CH CH2
N
N
CH2
HOOC CH2
CH3
CH2
CH2 COOH
III
I citocromii b,
c1, Fe-S
FMN,
Polipeptide
Polipeptide
cit.c
I cit.a, a , Cu
IV
3
FMN,
Fe-S
Polipeptide
Polipeptide
alte
proteinflavine
H -52 Kcal
Energia eliberata partial se pierde sub forma de caldura sau o parte se inmagazineaza
temporar in legaturile macroergice ale ATP, care este utilizata in functie de necesitatile
energetice ale celulei.
Fosforilarea oxidativa este procesul de sinteza a ATP din ADP si fosfat anorganic
cuplat cu lantul respirator.
ADP ( Pa ( energie libera ( ATP ( H2O
Capacitatea de fosforilare se apreciaza prin c=tul de fosforilare , P/O, care corespunde
numarului de moli de fosfat anorganic ce trec din stare minerala in ATP pentru un atom de
oxigen consumat.
Pentru NADH raportul P/O ( 3 iar pentru coenzimele FMNH2 sau FADH2, sau pentru
metaboliti care furnizeaza atomi de hidrogen acestor coenzime, raportul P/O ( 2.
Sinteza de ATP in mitocondrii este catalizata de o enzima oligomera numita ATP
sintetaza. Aceasta are capacitatea de a utiliza energia libera mobilizata in lantul respirator
pentru sinteza de ATP. Asupra mecanismului fosforilarii oxidative s-au emis mai multe
ipoteze: ipoteza cuplarii chimice, conformationala si ipoteza cuplarii chemiosmotice. Cea mai
larg acceptata este teoria cuplarii chemiosmotice a lui P.Mitchell (1961) potrivit careia
energia proceselor oxidative este conservata sub forma unui potential electrochimic
transversal membranei interne mitocondriale. Rezultatul procesului este realizarea unui
gradient de concentratie protonica intre cele doua fete ale membranei interne, gradient dublat
de un potential electric datorita distributiei inegale a sarcinilor pe cele doua fete ale
membranei. Acest potential electrochimic este utilizat de ATP sintetaza pentru sinteza de ATP.
Regiunea transmembranara functioneaza ca un canal protonic prin care curg protonii
in sensul gradientului electrochimic, din exterior in spatiul matriceal, energia mobilizata
permit=nd legarea fosforului anorganic la ADP cu sinteza de ATP.
Au fost identificate in lantul respirator trei locuri furnizoare de energie pentru
fosforilare: un loc situat intre NAD si coenzima Q, altul intre citocromul b si c si al treilea
intre citocromul a si oxigen:
Fp2
NAD+
Fp1
CoQ
acid succinic
cit.b
1/2 O2
cit.c
ADP+Pa
ADP+Pa
ATP
Fp2
acil-CoA
ATP
cit.aa3
ADP+Pa
ATP
O2-
Sinteza de ATP in toate cele trei puncte de fosforilare este un proces enzimatic.
Multi compusi chimici, naturali sau sintetici, au calitatea de a decupla lantul respirator
de fosforilarea oxidativa si anuleaza total sau partial gradientul protonic. Unul din primii
compusi recunoscuti ca decuplant al respiratiei de fosforilare este 2,4 dinitro-fenolul.
Inhibitorii lantului respirator impiedica fluxul de electroni si translocarea de protoni
care in consecinta inhiba consumul de oxigen.
Alti inhibitori, precum oligomicina, inhiba ATP-aza care transloca protoni sau
consumul de ADP.
Unele substante cu caracter lipofil leaga specific cationii stimul=nd transportul lor
prin membrane. Este exemplul valinomicinei care fosforileaza transportul K in afara
mitocondriei. Asemenea substante se numesc ionofori.
Citocromii au si alte localizari in afara lantului respirator mitocondrial.
Astfel citocromul b5 si citocromul P450 sunt amplasati in reticulul endoplasmatic si sunt
componente ale lantului transportor de electroni microzomial, nefosforilant. Acesti citocromi
sunt implicati in metabolizarea unor compusi endogeni, xenobiotice, inclusiv medicamentele.
Citocromul P450 este o hemoproteina terminala a catenei respiratorii microzomiale
nefosforilante cu rol de monooxigenaza cu functie mixta. Catalizeaza introducerea unui atom
de oxigen in diferiti compusi, celalalt atom de oxigen fiind redus la H2O. Monooxigenazele
functioneaza cuplat cu un sistem redox care furnizeaza doi electroni:
O2
H2O
SH
SOH
Red.
Ox.
Functia oxigenata primara este cel mai adesea gruparea OH, dar produsul oxigenat
poate avea si alta structura: epoxid, aldehida, sulf-oxid, N-oxid etc.
Toate monooxidazele utilizeaza ioni metalici (fier, cupru), care participa la ciclul
catalitic, ca transportori intermediari de electroni.
Prolil- si lizil- hidroxilaza actioneaza asupra procolagenului transform=nd resturi
prolil- si lizil- in derivatii lor hidroxilati:
H2O
O2
OH
O
N
Prolil
O
HN
-cetoglutarat
succinat + CO2
Hidroxi prolil
H2O
O2
C O
CH C
O
HN
CH C
CH2
CH2
-cetoglutarat
CH2
CH2
CH2
succinat + CO2
HC
OH
CH2 NH2
CH2 NH2
Hidroxilizil
Lizil
SH + O2
O
N
H2 N
H
N
CH2 CH CH3
CH3
H2 N
Tetrahidrobiopterin\
Dihidropterin
reductaz\
CH2 CH CH3
CH3
Dihidrobiopterin\
NADPH.H+
NADP+
H2O
O2
S-OH
SH
NADPH.H+
NADP+
P450-Fe3+
H2O
2H+
P450-Fe3+
P450-Fe3+
2-
O2
1e
1e
P450-Fe3+
_
O2.
S
P450-Fe2+
S
O2
P450-Fe2+
S
O2
Cei doi electroni furnizati de NADPH sunt transferati spre citocrom astfel: primul
electron permite legarea oxigenului si formarea radicalului superoxid, iar al doilea electron
reduce mai departe oxigenul molecular permit=nd scindarea moleculei si inserarea unui atom
in molecula produsului final (S-OH).
Sunt hidroxilaze cu citocromi P450 multe enzime implicate in sinteza hormonilor
steroizi din colesterol: enzima de clivare a colesterolului, -17, -11, 21-, 18-hidroxilazele, 25si 1 -calciferol hidroxilazele.
Monooxigenazele cu citocrom P450 sunt abundente in reticulul endoplasmatic din ficat.
Transferul electronilor din lantul respirator din reticulul endoplasmatic este folosit
numai pentru modificarea substratelor. Nu este asociat nici cu captarea energiei eliberata in
timpul reactiilor de oxidare si nici cu fosforilarea.