Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Cursuri 6 si 7
CUPRINS
I. Caracteristici generale ale ENZIMELOR
Nomenclatura. Clasificare.
Proprietati si particularitati structurale
Specificitatea de reactie si de substrat
II. Reactii enzimatice
Cinetica reactiilor enzimatice. Factori de influenta
Inhibitia enzimelor
Enzime alosterice. Reglarea cailor metabolice prin
retroinhibitie.
III. Mecanisme de actiune in cataliza enzimatica
I. Caracteristici generale
ENZIME
Sunt proteine (in general globulare) ce
catalizeaza r. biochimice din organismele vii
= BIOCATALIZATORI.
Proteine fara de care celulele vii nu pot
realiza reactii complexe intr-un timp scurt.
Intervin in majoritatea functiilor
organismului. Au rol esenial n
BIOSINTEZA (r. anabolice) si DEGRADAREA
(r. catabolice) biomoleculelor din organism.
Se gasesc in organismul uman, animal,
alimente (vegetale, fructe) dar si in
microorganisme.
Lacaza (Enzima din morcovi,
sfecla, ciuperci, fructe)
I. Caracteristici generale
Fara ENZIME viata NU poate exista:
Enzimele sunt implicate in mii de procese biochimice ce se desfasoara in
organismul uman (~ 3 000 ENZIME diferite care impreuna cu alte coenzime formeaza > 100 000 BIOCATALIZATORI).
Alimentele nu ar putea fi digerate (substantele nutritive prezente in
alimente nu ar fi absorbite).
Pepsina
I. Caracteristici generale
Enzimele digestive:
enzime digestive proprii (produse de organism);
enzime digestive preluate din alimente (fructe,
legume, cereale etc.).
Exemple de alimente ce contin enzime:
masline, miere, varza, struguri, cereale germinate
crude, nuci, smochine i curmale proaspete, banane,
ananas, kiwi, mango etc.
Tripsina
I. Caracteristici generale
A. Enzime digestive
I. Caracteristici generale
B. Enzime metabolice
Enzime care catalizeaza reactiile chimice din celule
(ex: r. de biosinteza ale Glucidelor, Lipidelor si Proteinelor).
I. Caracteristici generale
Nomenclatura ENZIMELOR
Oxidoreductaze
Transferaze
Hidrolaze
Liaze
Izomeraze
Ligaze
I. Caracteristici generale
Nomenclatura enzimelor
Denumire ENZIMA
Activitate/Reactia catalizata
Exemple:
1. OXIDO-REDUCTAZE
Lactat -dehidrogenaza:
Acid lactic Acid piruvic
D-Glucozil-oxidaza:
D-Glucoza Acid D-gluconic
Alcool-dehidrogenaza:
Alcool etilic Etanaldehida
2. TRANSFERAZE
Exemple:
Transaminaze:
AA 1 + a-Cetoacid 1 a-Cetoacid 2 + AA 2
Transfosfataze:
D-Glucoza Glucozo-6-fosfat
I. Caracteristici generale
Denumire
ENZIMA
Activitate/Reactia catalizata
3. HIDROLAZE
Glucidaze
Arginaza
(Arg Ornitina + Uree)
I. Caracteristici generale
Denumire
ENZIMA
Activitate/Reactia catalizata
Catalizeaza:
o r. de aditie (la leg. duble: > C = C <, > C = O, > C = N-) sau
o r. de eliminare (cu form. de leg. duble).
Exemple:
4. LIAZE
Fumaraza:
Acid fumaric
Aspartaza:
Asp Acid fumaric + NH3
Aminoacid-decarboxilaza:
AA Amina + CO2
5. IZOMERAZE
Catalizeaza r. de izomerizare
Epimeraze (Oxo-izomeraza)
D-Glucopiranoza-6-fosfat D-Fructofuranoza-6-fosfat
6. LIGAZE
I. Caracteristici generale
Nomenclatura enzimelor
Principiul III (1956, EC-xxxx). Fiecarei ENZIME ii este atribuit un numar
de cod format din 4 cifre precedate de prescurtarea EC (Enzyme
Comission)*.
EXEMPLE:
EC 1.1.1.1 (Alcool dehidrogenaza) = catalizeaz oxidarea etanolului, acceptorul de hidrogen
fiind NAD+:
CH3CH2OH + NAD
CH3CHO + NADH, H
*OPTIONAL
OH
_
CH 3COCOO + NADH + H+
I. Caracteristici generale
Nomenclatura enzimelor
CH3
_
COO
COO
CO
CO
(CH2)2
_
COO
CH3
_
COO
+
H3N C H
_
+
(CH2)2
_
COO
CH3
*OPTIONAL
COO
H C
OH
CH3
I. Caracteristici generale
Proprietati si caracteristici structurale
A + B
C +
a. Reactii chimice
b. Reactii enzimatice
+ S
Enzima Substrat
ES E + P
Complex
Produsi
Enzima-Substrat
PROCESUL ENZIMATIC se
desfasoara numai in anumite zone
ale moleculei de enzima, alcatuite
din 2-4 AA care au o dispozitie
spatiala corespunzatoare.
fixarea E de un S G,L, P)
S se lega la
E cu form.
complexului
ES
Centru
activ
Produsi de reactie
Enzimele sunt
formate din
lanturi lde AA.
Lanturile sunt
pliate pentru a
forma centrul
activ
Reactie
completa: sunt
eliberati
produsii de r.,
cu regenerarea
Enzimei
I. Caracteristici generale
Particularitati structurale ale
HETEROENZIMELOR
Enzima alosterica
SITUSURI
(determina
activitatea
biologica)
Situs catalitic
Parte a proteinei
formata din resturi
de AA ce sunt
responsabili de
legarea propriu-zisa
a Substratului.
Situs alosteric
Parte a proteinei
(diferita de situsul
catalitic), care dupa
legarea unui efector
alosteric, modifica
activitatea
enzimatica a Enzimei.
(controleza indirect
activitatea enzimatica)
Activator alosteric = activeaza act. enzimatica; Inhibitor alosteric = inhiba act. enzimatica
I. Caracteristici generale
Clasificarea enzimelor functie de particularitatile structurale
HOLOPROTEINE Structura unitara, alcatuita numai din aminoacizi.
(Holoenzime)
I. Caracteristici generale
1. Particularitati structurale ale
Apoenzimei
Structura primara
Determinata de secventa AA din lantul polipeptidic;
I. Caracteristici generale
1. Particularitati structurale ale Apoenzimei
I. Caracteristici generale
2. Particularitati ale Co-factorilor
Co-factor
Tipul r. catalizate
Adenozin
trifosfat
(ATP)
Catalizeaza r.
transfer fosfat
(ex: Kinaze)
Coenzima A
(CoA)
Catalizeaza r. de
transfer gr. acil
(ex: Transferaze)
Flavin adenin
dinucleotida
(FAD)
Catalizeaza
r. redox (ex:
Reductaze)
*Structurile co-factorilor
- OPTIONAL
Structura
Nicotinamid
adenin
dinucleotida
(NAD+)
Hem c
Catalizeaza r. redox
(ex: Dehidrogenaza)
Activeaza
substraturile
I. Caracteristici generale
Specificitatea enzimelor
I.
Specificitate de reactie
I. Specificitatea de reactie
Intalnita atunci cand o ENZIMA catalizeaza un anumit tip de r. biochimica.
Sta la baza clasificarii enzimelor in cele 6 clase (Oxido-reductaze,
Transferaze, Hidrolaze, Liaze, Izomeraze, Ligaze).
Multe enzime digestive prezinta acest tip de specificitate:
Exemplu: Proteaze, Amilaze i Lipaze (catalizeaza hidroliza P, G si L
din produsele alimentare).
Prezinta o specificitate destul de larga
n substratele lor*.
I. Caracteristici generale
II. Specificitatea de substrat
Se intalneste cand o ENZIMA poate cataliza un singur substrat sau un nr.
restrans de substraturi asemanatoae structural.
1. Absoluta Caz in care Enzima actioneaza strict asupra unui singur substrat.
Exemple:
UREAZA
Uree
Arginina
Ornitina
Uree
Alcool
dehidrogenaza
CH3CH2OH + NAD
CH3CHO + NADH, H
Exemple:
Acid succinic
Acid fumaric
fara ENZIMA
Reactiile enzimatice au loc intr-un singur sens, fara reactii secundare, fara
descompunerea compusilor instabili, cu formarea P si eliberarea E initiale.
K+1
K+2
E + S ES E + P
K-1
I. Coditii SUBSTRAT
1.
2.
3.
cu Pt
cu ENZIMA
1. Concentratia substratului
2. Concentratia enzimei
3. pH-ul
4. Temperatura
5. Prezenta activatorilor si a inhibitorilor
Este fundamentala pentru analiza cantitativa a tuturor aspectelor cineticii si inhibitiei enzimatice;
A fost dezvoltata pentru cazul simplu de reactie cu un singur substrat;
Presupune ca E se combina cu S, cu formarea complexului ES; acesta se descompune, cu formarea
P si eliberarea E:
K+1
K+2
E + S ES E + P
K-1
[S]
v
v
max
[S] mare
[S]
[S]
v v max
[S] 0
KM
Variatia activitatii enzimatice
cu concentratia substratului
v = vmax
v
v max
2
[S] = KM
2. Concentratia enzimei
y = ax +b
3. pH
Optim: 40-50oC.
Un inhibitor necompetitiv se
fixeaxa in mod aleator atat la E libera,
cat si la complexul ES.
Intre I si S nu exista o analogie
structurala, I se leaga la situsuri
specifice, altele decat situsul catalitic.
B. Inhibitia irreversibila
Cand o E sufera modificari
ireversibile in urma r. cu un I (care
blocheaza permanent o gr. functioanala
esentiala pentru activitatea catalitica),
enzima devine inactiva.
Tip de inhibitie care NU respecta
principiul Michaelis-Menten de
reversibilitate a proceselor.
Situs alosteric
Situs catalitic
1. Controlul
disponibilitatii enzimei
2. Controlul activitatii
enzimatice
Activitatea catalitica a
ENZIMEI poate fi direct
controlata prin asa
numita alterare
structurala.
Aceste modificari
structurale influenteaza
afinitatea E fata de S.
Reprezentarea
bidimensionala a
modelului Koshland
Functiile
biochimice ale
Enzimelor
Functiile
biochimice ale
Enzimelor