deceniu al progresului Jill L. Maron si Diana W. Bianchi Abilitatea de a detecta celule libere de acizi nucleici la femeile insarcinate a avut o evolutie semnificativa in ultimul deceniu. O gramada de studii au explorat domeniul biologic, genetic si semnificanta clinica a celulelor fetale libere de ADN si ARN mesager in circulatia materna. Ca rezultat, intelegerea deplina asupra circulatiei acizilor nucleici fetali a evoluat. Pana in prezent, 2 aplicatii, determinarea sexului si tipul Rh-ul fetal, s-au translatat la nivelul medicinii clinice. In orice caz, cu ajutorul tehnicilor moleculare avansate cum ar fi spectrofotometria, reactia cantitativa in lant in timp-real (RT-PCR), distributia expresiei genice, usurinta cu care genele fetale pot fi detectate din cadrul mamei, s-au imbunatatit considerabil. Noile transcriptii plancetare si fetale de ARN mesager cat si modificarile epigenetice ale markerului placentar de ADN, maspina, prezinta o aplicabilitate universala. Analiza expresiei globale a ARN-ului mesager fetal atat in lichidul amniotic cat si in sange asigura o noua intelegere de ansamblu fetal si patologic. Diagnosticul prenatal este impins a evolua de la detectia aneuploidiilor la detectia deviatiilor dintr-un ansamblu normal, care ar trebui sa asigure oportunitati incredibile pentru tratamentul fetal. INTRODUCERE A trecut un deceniu de la prima detectie a celulelor fetale libere de ADN in circulatia materna.[Lo et al. , 1997]. Raportul original, care a descris in premiera identificarea SRY-ului in plasma femeilor insarcinate cu feti de sex masculin, a extins campul non-invaziv al diagnosticului ante-natal. Urmarind aceasta descoperire marcanta, principiile similare folosite pentru a detecta ADN-ul fetal din circulatia materna au stat la baza identificarii ARN mesager-ului fetal.[Poon et at., 2000]. Faptul ca celulele libere fetale de acizi nucleici au fost destul de stabile pentru a fi izolate si masurate in plasma materna, au invins ignoranta totala asupra aspectului molecular din timpul sarcinii. Tesutul sursa, mecanismele de producere si cinetica atat a ADN-ului fetal si a ARN-ului mesager din cadrul mamei au fost necunoscute in 1997. Probabil ca cea mai mare semnificatie a fost constituita din limitarea
intelegerii privind rolul procesului de circulatie in timpul sarcinii si efectele
posibile asupra sanatatii mamei si fatului. In timpul ultimilor 10 ani, cunostiitele biologice atat asupra ADN-ului fetal cat si a ARN-ului mesager fetal au cunoscut o extindere vasta. De la publicarea articolelor despre embrionii timpurii, o gramada de studii au explorat semnificatia biologica si clinica a acizilor nucleici fetali circuland printre cei materni. Acum, revizuim intelegerea noastra despre biologia acizilor nucleici fetali la nivelul mamei si examinam aplicatiile clinice prezente si viitoare pentru diagnosticul antenatal din cadrul complicatiilor sarcinii sau dereglarile genetice. Exploram de asemenea potentialul impact al analizei expresiei genice in vederea unei mai bune intelegeri de ansamblu la nivel fetal din cadrul fiziologiei si patologiei. CELULELE LIBERE DE ADN IN PLASMA SI SERUL MATERN Biologie Sursa de tesut. Atat sursa cat si mecanismul prin care ADN-ul fetal este eliberat in circulatia materna au constituit subiecte de speculatii. Placenta, celulele fetale hemtopoietice, cat si insusi fatul au fost considerate surse pentru ADN-ul fetal[Bianchi, 2004]. Majoritatea studiilor au ajuns la concluzia ca placenta reprezinta sursa predominanta de ADN fetal in circulatia materna. Ratele detectiei secventei de SRY in monstrele de ser matern ale femeilor aflate in cursul tehnicii reproducerii asistate (ART), si care sunt insarcinate cel putin un fat de sex masculin, au descoperit faptul ca la 28 de zile de la transferul post-embrionar, 80% din toti subiectii studiati prezinta nivele detectabile de ADN fetal.[Guibert et al., 2003] Avand in vedere ca circulatia feto-placentare nu este realizata pana in ziua 20-30 post-conceptiva, este sugerat faptul ca ADN-ul fetal e derivat din trofoblast. Un alt studiu, examinand nivelul celulei libere fetale de ADN in plasma materna din cursul alegerii primului semestru medical terminat cu misoprostol a relevat faptul ca ADN-ul fetal poate fi detectat la femei dupa nastere in timpul unei proceduri de 11 zile.[Wataganara et al., 2005a]. Dat fiind faptul ca aceste terminatii au fost un rezultat medical, mai bun decat cel chirurgical, s-a teoretizat faptul ca bucatile reziduale placentare au contribuit la bazinul circulatiei fetale de ADN.
Un caz interesant publicat in 2004 a asigurat dovezi si mai
convingatoare in faptul ca ADN-ul fetal isi are originea in placenta. O femeie, cunoscuta drept purtatoare de homofilie A, a fost insarcinata cu un fat mozaicat 45, X/46, X [Flori et al., 2004]. Aceasta rara anomalie genetica a fost diagnosticata doar dupa ce screening-ul serului matern nu a putut identifica nicio secventa SRY in ciuda faptului ca, la ultrasunete fatul prezenta organe genitale masculine neambigue. Urmand stadiul de terminare al sarcinii, doar citotrofoblastul a aratat un cariotip 45,X in timp ce toate tesuturile fetale examinate au relevat mozaicismul incluzand linia celulara isodica (Yp). Odata ce-a fost descoperit cromozomul Y in tesuturile fetale, dar care nu e prezent nici i citotrofblast, nici in serul matern, s-a constatat ca circulatia ADN-ului fetal acelular isi are originea din celulele citotrofoblastului. Detectia ADN-ului placentar din 3 cazuri sigure de mozaic placentar sustin in continuare ca celulele libere de ADN provin din placenta[Masuzaki et al., 2004]. In acest studiu, 3 cazuri sustin ca mozaicul placentar este compus dintr-o linie celulara diploida si o linie celulara cu trisomie pentru 22,7 sau 2. In timp ce placenta contribuie la circulatia materna a celulelor libere fetale de ADN, probabil aceasta nu este singura sursa. Celulele hematopoietice fetale pot avea totusi o mica contributie in cadrul bazinului de ADN. Este bine sustinut din punct de vedere documentar ca eritrocitele fetale sunt prezente in plasma femeilor insarcinate [Cheung et al., Bianchi et al., 1997; Al-Mufti et al.,2000]. Desi un studiu comparativ a expus faptul ca nu exista nici o legatura intre numarul eritroblastelor si nivelul celulelor libere fetale de ADN atat in cazurile normale de sarcina cat si in cele patologice, aceeasi prezenta de eritrocite fetale in circulatia materna le sugereaza potentialul, chiar daca intr-o masura mai mica, de a elibera celulele libere fetale de ADN in plasma materna. Mecanismele care evidentiaza eliberarea celulelor libere fetale in circulatia materna. Mecanismele in cadrul carora celulele libere fetale sunt eliberate in circulatia materna sunt necrozarea si/sau apoptoza celulelor fetale si/sau a celulelor placentare, secretia activa de ADN fetal sau diferentierea finala [Bischoff et al., 2005]. Dintre aceste 3 procese, apoptoza este candidatul principal. Apoptoza e caracterizata prin fragmentarea ADN-ului genomic. Acest proces este nerandomizat, iar rezultatele in generatia prevazuta indica fragmente masurabile de ADN. Fragmentarea nucleara poate fi masurata folosind deoxinucleotidil transferaza (TdT)- mediata dUTP, analiza etichetata final (TUNEL). Cateva studii au utilizat tehnica TUNEL pentru a ilustra faptul ca multe dintre celulele fetale intacte din circulatia materna ajung in procesul de apoptoza activa [Sekizawa et al., 2000; van Wijk et al.,
2000; Hristoskova et al.,2001]. Celulele fetale intacte, reprezinta totusi o
mica fractie din totalul circulant de celule libere fetale de ADN. Confirmarile ulterioare cum ca celule libere fetale de ADN isi au originea in placenta versus apoptoza, provin dintr-un studiu recent dintr-un model in vitro ce examineaza efectele stresului oxidativ in tesutul trofoblastic. Punand sub intrebare prelungirile normalului, termenul de placenta normal oxigenat( 10% oxigen) urmat de conditiile culturii hipoxice(0.5% oxigen), Tjoa et al. [2006a] a aratat ca concentratia de -hemoglobina a celulelor libere fetale de ADN in tesutul supernatant a crescut semnificativ in urmatoarele 20 de ore dupa hipoxie-reoxigenare. Apoptoza crescuta a celulelor a fost confirmata de cresterea activitatii caspazei 3. interesant este faptul ca amandoua procesele, eliberarea celulelor libere fetale de ADN si apoptoza, pot fi reduse semnificativ prin aditia de antioxidanti, vitamina C si E in cultura medie. Acest articol sugereaza ca nivelul circulant de ADN in sarcina a fost un marker semnificativ al homeostaziei sincitio-trofoblastului. Se considera ca majoritatea ADN-ului fetal circula prin legaturi membrano-veziculare, cunoscute drept corpuri apoptotice. Halicka et al.[2000] a aratat ca exista o impachetare separata de ADN si ARN in corpuri apoptotice in timpul apoptozei. Folosind un dispozitiv de filtru centrifugal Microcon pentru a maximiza refacerea tuturor formelor posibile de ADN fetal( acizi nucleici> 10 perechi de baze), apoi supunand bilele de acid nucleic la analiza cu microscopul electronic, Bischoff a aratat ca ADN-ul fetal, gasit deseori sub forma de nucleozomi, a fost inghitit de corpurile apoptotice. Aceasta descoperire explica stabilitatea de scurta durata a celulelor libere fetale de ADN in circulatia materna. Dovada faptului ca celule libere fetale de ADN sunt eliberate in circulatia materna prin apoptoza provine din fragmentele masurabile de ADN fetal si detectia corpurilor apoptotice ce contin ADN fetal. Pana la ora actuala au existat 2 articole in cadrul carora s-a studiat marimea distriutiei de ADN matern si fetal. In amandoua studiile, fragmentele de ADN fetal au fost gasite semnificant de reduse ca dimensiune in comparatie cu cele de ADN matern. Folosind un panou cantitativ PCR, analizele cu diferite dimensiuni ale ampliconului urmarind gena leptina, Chan et al. a demonstrat de asemenea ca femeile insarcinate nu mai prezinta fragmente ADN in comparatie cu controalele femeilor neinsarcinate. Motivul acestei descoperiri ramane neclar. Totusi, fragmentele mai mici de ADN fetal sunt sugestive pentru apoptoza iar usurinta prin care aceste fragmente pot fi distinse din ADN-ul matern este de folos aplicatiilor clinice.
Cinetica. Detectia initiala a celulelor libere fetale de ADN s-a bazat pe
prezenta sau absenta cromozomului Y specific secventei, cum ar fi SRY, din cadrul circulatiei materne. Cu folosirea tehnici RT-PCR, sensibilitatea detectiilor s-a imbunatatit. ADN-ul fetal a fost gasit in serul si plasma materna in stadiu timpuriu, cum ar fi a 7-a saptamana de gestatie. ADN-ul fetal reprezinta 3.4% si respectiv 6.2% din totalul celulelor libere fetale de ADN din plasma materna in sarcina timpurie si tarzie, iar nivelele de celule libere fetale de ADN aproape 1,000 mai crescut decat ADN-ul prezent in celulele fetale intacte circulante din plasma materna. Studii substantiale au confirmat o crestere generala a ADN-ului fetal in timpul gestatiei[Ariga et al., 2001; Honda et al., 2002; Chan et al., 2003; Birch et al., 2005]. Mai precis, are loc o crestere de 21% pe saptamana de gestatie in primul trimestru[Wataganara et al., 2005a], o mica stabilizare in al doilea trimestru, iar apoi o crestere rapida in cele 8 saptamani, prioritara nasterii[ Bianchi, 1998; Lo et al., 1998a]. Concentratia fractionata de ADN fetal in serul matern este oricum, mai scazuta decat in plasma materna, posibil indicator al eliberarii ADN-ului din celulele sangvine materne in timpul procesului de incapsulare[Lo, 2000]. La temperatura camerei, ADN-ul fetal e stabil in tubul de sange recoltat pana la 24 de ore de la colectare[Angert et al., 2003]. Studind diviziunile de plasma materna luate din acelasi tub original din ultimele 24 de ore, Angert et al., a descoperit ca totalul de celule libere de ADN a crescut, in timp ce nivelele de ADN fetal, raman constante. In calculul mediei jumatatii de viata pentru celulele libere fetale de ADN circulante, Lo et al.a facut 2 asumptii critice. In primul rand, s-a presupus ca toate celulele libere fetale de ADN detectate au fost din sarcina curenta, si nu din celulele fetale care pot persista timp de decenii dupa nastere la mama[Bianchi et al., 1996]. In al doilea rand, cu asa o rapida curatire din circulatia materna, celulele libere fetale de ADN trebuie eliberate in mod continuu in aceasta. In orice caz, in 2002 a aparut o controversa privind aceste asumptii. Intr-un raport publicat Invernizzi et al. [2002] a descoperit ca celulele libere fetale de ADN pot fi prezente in plasma materna la decenii dupa sarcina. In cadrul unei revizuiri amanuntite a metodelor folosite pentru obtinerea plasmei in acest studiu s-a constatat ca sa efectuat o singura centrifugare. Intr-un stadiu anterior al sangelui revizuit prin protocoale, Chiu et al.[2001] a descoperit ca o singura centrifugare trebuie sa fie urmata fie de o filtrare sau o microcentrifugare subsecventa pentru a obtine intr-adevar plasma de celule libere. Esuand realizarea centrifugarii aditionale, e probabil ca ADN-ul fetal detectat in studiul lui Invernizzi et al. sa fie rezultatul contaminarii cu
rezidurile circulatiei celulelor fetale intacte din sarcinile precedente[Benachi
et al., 2003; Rijnders et al., 2004a]. Prin realizarea unei singure centrifugari a probelor control de sange de la femei insarcinate si neinsarcinate, au fost raportate variatii zilnice dramatice in celulele libere de ADN din plasma probelor. Oricum, o reevaluare a propriilor studii a fost combatuta de autori dupa realizarea faptului ca orice contaminare de compartiment celular poate contribui semnificativ la totalul bazinului de ADN. Subiectii ulteriori, a caror plasma a fost supusa fie unei filtrari subsecventiale sau unei microcentrifugari au expus ca media variatiilor zilnice in celulele libere de ADN au avut o variatie medie de 3.8 legaturi cu un maxim de 5.4 legaturi. Aceasta descoperire a fost mai putin semnificativa comparativ cu diferenta de 13.567.9 legaturi in circulatia celulelor libere de ADN, reportata mai devreme. Consideratii tehnice Procesarea, imbogatirea si detectia ADN-ului fetal. Din colectia initiala de probe materne pana la ultima analiza cuantificabila, masurarea acurata a celulele libere fetale de ADN e dependenta de cativa factori. Probele de sange obtinute fie in EDTA, heparina sau anticoagulante citrare nu indica diferente in concentratiile de -globina ADN in cele 24 ore dupa recoltarea colectiei. Oricum, peste 24 ore, EDTA arata cea mai mica variatie timpurie comparativ cu heparina sau citratul. EDTA este asadar, anticoagulantul principal de ales pentru procesarea intarziata a sangelui. Protocoalele procesarii monstrelor afecteaza in mod evident cuantificarea ADN-ului fetal in plasma materna. Dupa colectarea sangelui si centrifugarea initiala, o filtrare subsecventiala sau o microcentrifugare este esentiala pentru a obtine intr-adevar plasma de celule libere[Chiu et al., 2001]. Tehincile alternative, cum ar fi procesarea printr-un gradient separator Percoll, au ca rezultat imbogatirea plasmei, cresterea concentratiilor totale de ADN. Odata cu detinerea plasmei, protocoalele extrase pot varia gradul detectarii ADN-ului fetal. Majoritatea studiilor folosesc un manual, sistem de capatai, pentru extractia totalului de ADN. Un articol recent a comparat o metoda automata cu una manuala pentru obtinerea ADN-ului extras. In timp ce tehnica extractiei manuale beneficiala cu 23.4% mai mult din totalul celulelor libere de ADN, sistemul automat beneficiaza cu 40.7% mai multe celulele libere fetale de ADN[Huang et al., 2005]. Oricum, ADN-ul obtinut dupa extractia manuala s-a dovedit a fi mai bun pentru analizele PCR, in special la concentratii mai mici. O evaluare similara a intregii extrageri automate si detectia sistemului nu a descoperit inter-contaminari intre
probe[Costa and Ernault, 2002a]. Amandoua articolele au pus in evidenta
potentialul intensiv scazut al travaliului al analizelor bine determinate pe o scara mai ampla a utilizarii de celulele libere fetale de ADN in diagnosticul ante-natal non-invaziv. In general, amplificarea si cuantificarea ADN-ului fetal se bazeaza pe o sensibilitate si specificitate particulara de la laborator pentru detectarea ADN-ului fetal. Incercarile de a optimiza detectia ADN-ului fetal, in special in primul si al doilea trimestru au implicat o analiza care amplifica o secventa fetala prezenta in copiile multiple din genomul fatului de sex masculin[Zimmermann et al., 2005]. Prin urmarirea de DYS 14 in locul SRY-ului, autorii au demonstrat ca o rata de 10 falduri prezinta o detectie mai buna si limite cuantificabile pentru ADN-ul fetal. Prin incercarea evaluarii reproducerii rezultatelor, o comparatie a studiilor intre laboratoare a fost desfasurata, in care 5 centre participante au primit fractiuni de plasma inghetata obtinute si procesate din aceeasi proba[Johnson et al., 2004]. Sensibilitatea pentru detectia ADN-ului fetal a variat peste centru de 31-97%, in timp ce specificitatea a fost mai putin consistenta(93-100%). In ultima instanta, lipsa de acuratete a cuantificarii ADN-ului fetal peste centre va limita aplicabilitata detectarii ADN-ului fetal pentru diagnosticele non-invazive prenatale. Acest lucru a fost demostrat de Birch et al., [2005], care a evidentiat acuratetea cuantificarii si variatia concentratiilor de ADN prin gestatie. Din cauza faptului ca analiza cantitativa prin RT-PCR este atat de acurata de asemeni standardelor ADN folosite pentru calibrare, metoda folosita pentru prepararea seriilor diluate ADN. Este principala pentru asigurarea stabilitatii, in special la concentratii mici. Folosind o analiza de baza, exponentiala, cvasi-Newton, pentru a creste acuratetea nivelelor cuantificate scazute, valori normale ale celulelor libere fetale de ADN au fost stabilite in saptamanile 5-41 de gestatie. Aceste valori sunt esentiale pentru analiza in aplicatiile de rutina clinice ale incorporarii celulelor libere fetale de ADN. Au fost incercate tehnici variabile de a mari procentul de celulele libere fetale de ADN obtinute din circulatia materna. Notabil e faptul ca Dhallan et al.[2004] a condus un studiu format din 2 faze in care probele de sange s-au recoltat pe EDTA sau in tubi tratati cu formaldehida. Folmaldehida e o substanta chimica cunoscuta prin faptul ca are rolul de a stabiliza membrana celulelor si a impiedica liza celulara. Cuantificand ADN-ul fetal cu o rata de copii de SRY si CYS, in care numarul de copii pentru fiecare gena a fost determinat prin observarea celei mai mari serii diluate, autorii au aratat ca procentul mediu de celulele libere fetale de ADN in probele cu formaldehida este de 20.2% (comparat cu 7.7% din probele netratate). Autorii au presupus ca acea
crestere a ratei detectiilor celulelor libere fetale a fost multifactoriala.
Stabilizarea membranei celulare prin formaldehida, inhibitia a deoziribonucleazelor cu formaldehida si o centrifugare fina initiala pentru a scadea liza celulara, joaca un rol important in cresterea castigurilor de celulele libere fetale de ADN. Aceste descoperiri au fost considerate initial promitatoare[Simpson and Bischoff, 2004]. Totusi, cele 2 studii sus-amintite, au generat rezultate conflictuale[Benachi et al, 2005; Chung et al., 2005]. Datele in cauza sunt considerate imbatabile in tehnica dilutiei pentru ADNul fetal cuantificat folosit de Dhllan et al. Studiile viitoare trebuie conduse pentru a determina data exista vreo utilitate in stabilizarea celulelor in formaldehida pentru detectarea ADN-ului fetal. Metodele alternative pentru detectarea ADN-ului fetal. Pana in prezent, majoritatea studiilor privind ADN-ul fetal circulant au folosit secvente de cromozom Y ca biomarker fetal. Pentru implementarea universala a investigarilor clinice, este necesar un marker fetal dependent unisex. Markerii fetali epigenetici, cum ar fi metilarea ADN-ului ofera alta alternativa. Modificarea epigenetica implica modificarea post-translationala a secventei ADN si fenotipuri alternative consecutive fara modificarea secventei ADN-ului acual[Herman et al., 1996]. Identificand metilarea ADN-ului diferential dintre fat sau placenta si mama, detectia atat a celulelor fetale materne cat si paterne mostenite s-a detectat in plasma materna[Poon et al., 2002]. Aceasta tehnica se bazeaza pe identificarea locilor care au metilari diferite, paterne si materne, pattern-uri mostenite genetic. Realizand o conversie binsulfidica pe ADN-ul extras si amplificat, rezidurile nemetilate de citozina devin uracil si rezidurile metilate de citozina raman neschimbate[Frommer et al., 1992]. Urmarind metilarea specifica PCR, ADN-ul este secventializat. In cazurile in care amandoua mostenirile fetale si materne ale unui marker particular sunt nemetilate, se poate realiza un test pentru primer-ul evaluator de extensie pentru a imbunatati sensibilitatea. Desi aceasta metoda este facila, se bazeaza pe loci imprimati, care nu sunt in mod neaparat fetal-specifici, si pe polimorfismul genetic, a detine discriminarea dintre detectiile ADN-ului fetal si matern. Studiul subsecvent a indentificat un marker plancetar epigenetic, maspina, considerat primul marker universal al ADN-ului fetal in plasma materna[Chim et al., 2005]. Maspina este metilata in leucocitele materne si hipometilata in placenta.