Proteinele membranare integrale (PIM) acioneaz ca pori ctre celule.
Ele sunt porti de intrare i cile de evacuare pentru mai multi ioni, substante nutritive, produse reziduale, hormoni, medicamente i molecule mari, cum ar fi proteinele i ADN-ul. Proteinele membranare sunt, din pcate, foarte dificil de manevrat i de studiat, deoarece acestea sunt concepute pentru a sta n mediul hidrofob. Ele tind s fie instabile atunci cnd extrase din mediul lor nativ i trebuie s adugam anumite substante pentru a asigura suprafaa hidrofoba. Pentru a nelege i controla funcia acestor proteine este esenial s avem informaii privind structura lor tridimensionala, care se obine de obicei prin cristalografie cu raze X. Cu toate acestea, dificultatea de manipulare a acestor proteine a fcut dificil de rezolvat structurile, i pn n prezent exist mai mult de 300 de structuri de proteine membrana cunoscute, mai puin de 0,5% din toate structurile cunoscute. Proteinele membranare sunt, prin urmare, una dintre cele mai importante frontiere de cercetare ale biologiei structurale.
Importan medical: Importana medicala din aceast familie colosala de proteine nu poate fi subestimata. Mutatiile in proteine membranare sunt implicate in multe boli comune, inclusiv boli de inima, unde canale de ioni defecte sunt adesea implicate. Medicamente specifice pentru canalele de calciu pot controla aspecte, cum ar fi hipertensiunea arteriala si angina pectorala. Proteinele membranare sunt implicate n cancer, n cazul n care erorile din cile de semnalizare poate conduce la divizarea celulelor de sub control. Adesea, proteinele membranare specifice sunt supraproduse in celulele canceroase i sunt, prin urmare, obiective pentru terapia de medicamente. Boli ale creierului, cum ar fi migrena, depresia i boala Alzheimer sunt toate legate de problemele cu transportatorii i canalele. Deoarece multe proteine membranare stau la suprafata celulelor, acestea sunt usor disponibile la medicamente care circula in sange. Prin urmare, nu este surprinztor faptul c peste 50% din molecule mici de medicamente se leaga de proteine membranare. Sperm c prin rezolvarea structurilor acestor proteine, intelegerea biochimica de baz i interaciunea cu substraturi i inhibitori, putem oferi mai multe tratamente eficiente pentru multe boli. SGC (Structural Genomics Consortium) i proteinele membranare integrale:
SGC are o vast experien n rezolvarea structurilor de proteine
umane solubile utiliznd sisteme extrem de eficiente. n ultimii doi ani s-au adaptat acestei metode pentru rezolvarea structurilor de proteine membranare umane. Au fost ecranate 186 de proteine membranare umane din familii diferite, selectnd o serie de construcii pentru fiecare proteina, identificarea detergentilor pentru purificare i apoi sporire a purificarii i cristalizarea acestor proteine. S-au cristalizat 3 membrane de proteine i sa rezolvat prima structur, un proces care a durat mai mult de doi ani de la prima clon de structura. S-a rezolvat prima structur a unui transportor ABC uman, o clas de proteine care sunt implicate n transportul molecul mic, rezisten multipl la medicamente i boli cum ar fi fibroza chistic i diabet. Prima int de succes este transportorul mitocondrial uman ABC, ABCB10, care este ncorporat n membrana interioar a mitocondriei. Exist dovezi c, atunci cnd expresia ABCB10 este redus n celule, ele sunt mai sensibile la stres oxidativ i care ABCB10 pot fi implicate n protejarea inimii n timpul unui atac de cord. S-au stabilit metode de mare cristalizare NanoDrop de transfer i manipulare de cristale de protein de membran. S-au dezvoltat sisteme eficiente de depistare de cristale de proteine cu membrana de calitate difractie ca o metod de optimizare conditiei de cristalizare. S-a optimizat, de asemenea, colecia de date si analiza datelor de difracie cum ar fi Diamond Light Source Ltd , n Oxfordshire. Ori de cte ori este posibil cristalizarea se realizeaz cu liganzi legati i inhibitori pentru a captura o singur conformaie . De asemenea s-a propus generarea de fragmente de anticorpi mpotriva proteinelor noastre purificate pentru a fi utilizate ca reactivi de afinitate i ajutoare de cristalizare.
