Sunteți pe pagina 1din 32

ENZIME

Definitie:
Proteine globulare care catalizeaz reaciile
biologice desfurarea proceselor chimice
necesare vieii

Nomenclatur i clasificare

a) denumire uzual - nu indic tipul reaciei catalizate


(pepsin, tripsin etc.)
b) pentru enzimele care catalizeaz reacii de hidroliz:
numele substratului + sufixul az (peptidaz; ureaz;
fosfataz)
c) numele substratului urmat de cel al reaciei catalizate +
az (malat dehidrogenaz, lactat dehidrogenaz etc.)
d) n 1961 - clasificare i nomenclatur sistematic: 6
clase - subclase - sub-subclase
* numr de cod din 4 cifre -EC abcd- , unde a = clasa, b
= subclasa, c = sub-subclasa, d = numrul de ordine al
enzimei n sub-subclas

1. OXIDO-REDUCTAZE catalizeaz reacii de oxidoreducere


2. TRANSFERAZE catalizeaz transferul unor grupe
funcionale
3. HIDROLAZE catalizeaz reacii de scindare a unor
legturi cu ajutorul apei
4. LIAZE (SINTAZE) catalizeaz reacii de adiie sau de
eliminare

5. IZOMERAZE catalizeaz reacii de izomerizare


6. LIGAZE (SINTETAZE) catalizeaz reacii de sintez prin
condensarea a dou molecule, simultan cu hidroliza unei
legturi fosforice din ATP sau din alt compus macroergic

Exemplu:
lactat dehidrogenaza:
EC 1.1.1.27
1 clasa: oxido-reductaze;
1

subclasa:
oxidoreductaze ce acioneaz
asupra substraturilor de tip
R2CH-OH;
1 sub-subclasa: acceptorul
de hidrogen este NAD+ sau
NADP+;
27 numrul de ordine al
enzimei

Proprietile enzimelor
- se regsesc neschimbate la sfritul reaciilor
- nu modific echilibrul reaciilor - permit atingerea lui
ntr-un timp foarte scurt, mrind vitezele ambelor reacii
- nu modific termodinamica reaciilor cataliznd numai
reacii termodinamic posibile
- sunt de natur proteic
- eficien catalitic f.
mare: cresc foarte mult
vitezele reaciilor
biochimice prin
micorarea energiilor de
activare ale acestora =>
timpi de reacie foarte
mici (ps = 10-12s)

Ex: * hidratarea CO2 - vitez de 36 milioane


molecule/min.
* descompunerea apei oxigenate:
- fr catalizator:
18Kcal/mol;
- n prezen de Pt coloidal: 11,7 Kcal/mol;
- n prezena enzimei catalaz:
2 Kcal/mol

- specificitate: fa de reacie i fa de substrat absoluta,


relativa de grup, larga; specificitate stereochimica
-evit formarea produilor secundari de reacie (datorit
eficienei catalitice i a specificitii ridicate)
- permit atingerea unor randamente de 100%
- acioneaz n concentraii foarte mici (cca 10-6 moli)
- acioneaz n condiii blnde de temperatur
(~ 37 C) i la pH neutru
- activitatea reglat i
autoreglat: viteza reaciilor
biochimice este controlat de
necesarul celulei, cantitatea
de produi este controlat
prin reglarea aciunii
enzimelor

Centrul activ
* regiune restransa din molecula enzimei in care se desfasoara
actiunea catalitica - geometrie tridimensionala variata fctie de
natura si pozitia AA componenti
*legarea substratului - situs/centru de legare
*cataliza (transformarea chimic) situs/centru catalitic
* formarea centrului activ posibila datorita conformatiei native a
moleculei proteice care prin infasurari si plieri specifice aduce
in pozitii apropiate spatial anumite grupari chimice ale unor
aminoacizi distantati ca structura primara => interactiunea AA
Ex: Tripsina: Hys 57 (ciclul imidazolic), Ser 195 (OH),
Asp 102 (COO-)

Enzime alosterice situs alosteric legarea unor


efectori enzimatici influeneaz activitatea situsului
catalitic (prin modificarea conformatiei)=> activatori sau
inhibitori

Proprietile situsului catalitic


* este localizat n poriunea intern, hidrofob a moleculei proteice
exist condiii favorabile pentru transferul de electroni, de protoni sau
de grupe chimice ntre enzim i substrat
* are o geometrie spaial perfect ordonat
*este alctuit dintr-un numr mic de resturi de aminoacizi ce
contin grupe functionale reactive

resturile de aminoacizi includ grupe funcionale active:


-OH (Ser, Tyr), -NH2 (Lys, Arg), -SH (Cys), -COOH (Glu, Asp),
ciclu imidazolic (Hys) etc. particip la legarea substratului
la enzim i la procesul chimic (ruperea legturilor chimice
din substrat si formarea legaturilor din produsi)

Tipuri de interaciune situs substrat: interacii hidrofobe


(chimotripsin), interacii ionice (tripsin)

Proprietile substratului:
poate forma cu enzima un complex activat (instabil)
produs de reacie

E + S

(ES)

E+P

-satisface necesitatea de specificitate a enzimei prin anumite


particulariti structurale

- conformaie bine definit care-i permite accesul la centrul


activ al enzimei
=> manifest
complementaritate
structural i
conformaional cu
centrul activ al enzimei
cel puin trei puncte
de interaciune specific
- se asociaz cu enzima
pe baza unei orientri
strict specifice care-i
permite ptrunderea n
centrul activ

Enzimele: acioneaz singure => apoenzime, sau n


prezena unor cofactori (se formeaz un complex catalitic
activ) => holoenzime

Cofactori (f. de natura chimica si modul de legare la apoenzima)


- coenzime: molecule organice de dimensiuni mici, de obicei legate
slab <-> co-substrate (ex. coenzimele reaciilor de oxido-reducere sunt i
acceptoarele / donoarele de hidrogen: NAD+/NADH (Niacina = vit B3),
FMN/FMNH2 (Riboflavina = vit.B2), FAD+/FADH2 (vit.B2)

- grupri prostetice: cofactori strns legai de molecula apoenzimei


prin legturi covalente; rol important in exercitarea functiilor
biologice (ex: hemul component a citocromilor)
- ioni metalici: Zn2+, Fe2+, Mg2+, Cu2+, Ni2+ etc. (mijloc de legare a
substratului sau activatori)

Organizarea structural a enzimelor

* monomer M < 30 000 D (ex: tripsina, ribonucleaza)


* oligomeri 2-6 resturi polipeptidice asociate; M > 30 000 D (ex:
alcooldehidrogenaza = 4 protomeri)
* izoenzime (izozime) forme ale aceleeasi enzime pt. care difer
protomerii i esutul/organul n care acioneaz (ex: lactat
dehidrogenaza, creatin kinaza)
* sisteme multienzimatice

Mecanisme implicate n cataliza enzimatic


I. Mecanismul lact cheie
- complementaritate structural perfect ntre substrat i
centrul activ
- la reaciile enzimatice cu specificitate absolut de substrat
- legarea prin 3 tipuri de catene: de legatura propriu-zisa, de
orientare sterica si de activare a substratului legat

II. Mecanismul ajustrii induse


- flexibilitate a conformaiei centrului activ
- cazul enzimelor care n stare liber nu se afl n
conformaie optim pentru cataliz
- legarea substratului sau a cofactorului ajustarea
centrului activ geometrie optim pentru ES

III. Mecanism prin cataliz covalent


- legarea reversibil a substratului la centrul activ prin
legturi covalente (prin intermediul unor grupe funcionale
nucleofile din aminoacizii ce alctuiesc situsul)

Cataliz covalent mecanismul catalitic al chimotripsinei:

Efectori enzimatici - modific cinetica reaciilor


enzimatice
Inhibitorii enzimatici anularea definitiv sau
temporar a activitii enzimatice => inhibiie ireversibil sau
inhibiie reversibil
Inhibiia reversibil:
- nu modific structura
molecular a enzimei;
- competitiv
- incompetitiv
- necompetitiv

a) Inhibiia reversibil competitiv - inhibitori


competitivi = substane cu analogie structural cu
substratul => manifest afinitate pentru centrul activ al
enzimelor => competiie pentru ocuparea situsului
catalitic al enzimei
- creterea concentraiei de substrat conduce la
anularea inhibiiei => viteza maxim a reaciei nu se
modific

Exemple:
acidul malonic (malonatul) inhibitor competitiv cu acidul succinic
(succinatul)
n
reacia
de
dehidrogenare a acestuia la acid
fumaric

COOH

COOH

NH CH CH2
SO2NH2

CH2

COOH

C O
Acid tetrahidrofolic (FH4)

NH2

OH

Acid p-aminobenzoic
NH2
p-Aminobenzensulfonamida

NH CH2

H
N
N
H

N
N

NH2

sulfonamidele (sulfamidele): paminobenzensulfonamida inhibitor competitiv cu acidul paminobenzoic (necesar


biosintezei coenzimei FH4)

b) Inhibiia reversibil incompetitiv - inhibitorul incompetitiv se


fixeaz numai la complexul enzim-substrat
=> complexul ESI este inactiv
=> viteza reaciei nu se apropie niciodat de viteza maxim

c) Inhibiia reversibil necompetitiv - inhibitori (necompetitivi) nu prezint analogie structural cu substratul se fixeaza fie la
enzim, fie la complexul enzim-substrat => scade concentratia de
enzima activa
=>viteza maxim a reaciei este diminuat

Exemplu: enzimele care au


drept cofactori metale grele
(ioni) inhibate necompetitiv de
EDTA

Inhibiia ireversibil - inhibitori ireversibili - formeaz legturi


covalente cu anumite grupe funcionale ale enzimelor eseniale
pentru activitatea catalitic => enzima devine inactiv
- prin ndeprtarea inhibitorului enzima nu i mai recapt
funcia catalitic - util n identificarea grupelor funcionale cu rol
catalitic din situsul activ al enzimelor

Exemple:
penicilinele modifica covalent transpeptidazele (implicate in
formarea peretelui celular bacterian)
ionul CN- - acioneaz asupra enzimei citocromoxidaz, cu rol in
respiratia celulara (conine Fe)
* ca antidot tiosulfatul de sodiu => CN- SCN ionii metalelor grele (Hg2+, Pb2+) - se combin cu grupele SH din
enzime => denaturare
*ca antidot sarea de calciu a EDTA
CaEDTA2- + Pb2+ Ca2+ + PbEDTA2- solubil n fluidele din
organism i se elimin prin urin

Zimogeni
* precursori ai enzimelor inactivi fa de substraturile
specifice enzimelor respective stabili; numai n celulele
secretoare (ferii de aciunea enzimelor proteolitice)
* sunt transformai enzimatic ireversibil n formele active
prin hidroliza selectiv a unor legturi peptidice din
molecul

Exemple:
pepsinogenul, tripsinogenul i
chimotripsinogenul, protrombina
etc.