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PHYTOPATHOLOGIE
observations
symptômes
( relations hôte-parasite- environnement) épidémiologie
distribution spatiale et temporelle de la maladie
-expérience personnelle précédents du champ, de la variété (fumure,
arrosages, pesticides….)
-données bibliographiques historique culturale
interprétation LUTTE
maladie parasitaire
DIAGNOSE
maladie "physiologique"
(carence, T°,...)
Symptômes: MODIFICATIONS MORPHOLOGIQUES
DE LA PLANTE
Tâches chlorotiques
Feuilles gaufrées
PARASITES DES VÉGÉTAUX
-Parasites du collet
OR
Pouvoir pathogène
oïdium
Libération d ’enzymes, de toxines, d ’hormones
ADAPTATION À LA VIE PARASITAIRE
plasmalemme
vacuole
paroi
Substances adhésives
Cytoplasme du
champignon
Chytridiales
Pénétration directe chez les champignons non filamenteux
tube
dard
boucho
n Substances adhésives
Revètement épidermique
Cytoplasme de la spore
Plasmodiophorales
Pénétration directe accompagnée de la différenciation
d’appressorium
Appressorium multiple
des Sclerotinia
Appressorium mélanisé
chez Colletotrichum
conidie
Tube germinatif
Cellules épidermiques
mycélium
Appressorium lobé
cuticule
Cellule épidermique
Filament infectieux
Chambre sous-stomatique
Espace intercellulaire
Couche mélanisée
Ultrastructure d’ un appressorium Couche externe
mélanisé Couche interne se prolongeant le long
du coin d‘ infection
mucilage
cuticule
Couche pectique et paroi cellulaire
Coin d ’infection
Souche sauvage
vésicule Souche mutante
Appressorium mélanisé Appressorium non mélanisé
conidie
filament
membrane
STRUCTURES INFECTIEUSES
Coussins d ’infection
Revêtements subérisés
renfoncement
Coin d ’infection
CLÉ DE DÉTERMINATION
2 ordres:
-Peronosporales: presque tous parasites, zoospores
à flagelles latéraux
-Saprolegniales: essentiellement saprophytes,
zoospores à flagelles antérieurs
RÉCAPITULATIF DES CARACTÈRES MORPHOLOGIQUES
DES PÉRONOSPORALES
Péronosporées Albuginées Pythiées
=Cystopées
Caractères
morphologiques du :
sporocyste Caducs, isolés,globuleux Caducs, en chaînes Souvent caducs
sporocystophore Bien différencié, ramifié Bien différencié, simple Peu ou pas différencié
stérigmate
Sporocyste caduc
Oospore en
germination
oocyste
spermatocyste
Tube
de copulation
oospore
Plasmopara viticola
Plasmopara halstedi
CARACTÈRES MORPHOLOGIQUES
- Sporocystes caducs
B, C, D et E: sporocystophores de
Bremia, Peronospora,
Plasmopara,Sclerospora,
respectivement
sporocyste
disjoncteur
sporocystophore
Albugo
Symptômes
Peronospora sur
Stellaire
Sporocystophore à stérigmates
inégaux
Symptôme sur feuille, face
supérieure et inférieure
stérigmate
sporocystophore
sporocyste
Bremia lactucae
SYMPTÔMES
Modification de la plante hôte:
-infection localisée aux feuilles: tâche d ’huile puis point de
tapisserie
-infection systémique. Très fréquente. Pois/ Peronospora pisi
Betterave/ Peronospora
farinosa
Graminée/ Sclerospora
Déformation des organes parasités: tissus épaissis, surface
irrégulière, modification des organes floraux
Organes fongiques:
Sporocystophores externes, forment une pubescence blanche.
CARACTÈRES BIOLOGIQUES
Parasites obligatoires
Pénétration directe/ organes intactes, au niveau des stomates
Dissémination
Par les sporocystes caducs, attaquent les organes aériens
Conservation
oospores en dormance l ’hiver
Dépendance du milieu
Hygrométrie élevée
CYSTOPÉES
Suçoirs intracellulaires
OOMYCÈTES
B, C, D et E: sporocystophores de
Bremia, Peronospora,
Plasmopara,Sclerospora,
respectivement
sporocyste
disjoncteur
sporocystophore
Albugo
sporocystophore
sporocyste
-Organes fongiques
Inter- ou intracellulaire
2 genres: Pythium
Phytophthora
OOMYCÈTES
Pythium debaryanum
sporocyste
BIOLOGIE
- Pouvoir pathogène variable selon les espèces
Parasites facultatifs (souvent chez Pythium)
Pénétration directe
-Dissémination
Sporocystes caducs, voie aérienne
sporocystes non caducs, plus ou moins inféodés au sol.
-Conservation
Oospores, mycélium, saprophyte sur résidus de plantes
infectées
-Dépendance du milieu
Besoin en eau très important
4-Division des Ascomycètes
Ce sont des champignons à mycélium septé. La classification suivante est basée sur la disposition et l’organisation
structurale des asques, avec la différenciation de six classes.
xClasse des Plectomycètes : asques inclus dans une fructification close (cléistothèce)
xxOrdre des Eurotiales (Plectascales) : disposition non organisée des asques dans la fructification
Eurotium amstelodami
xxOrdre des Erysiphales = Périsporiales : disposition organisée des asques dans la fructification
xxxFamille des Erysiphacées (Périsporiales) Mycélium blanc ; agents de l’oïdium des végétaux.
Anamorphes : Oïdium (sauf mention)
Erysiphe graminis =Blumeria graminis (oïdium des
graminées), Leveillula taurica (sur Composeae ; anamorphe Oïdiopsis), Uncinula necator (vigne), Microsphaera
alphitoïdes (chêne), Podosphaera leucothrica (Rosacées), Sphaerotheca pannosa (pêcher), Phyllactinia corylea et P.
suffulta(noisetier et frêne ; anamorphe : Ovulariopsis).
xxxFamille des Périsporiacées Mycélium brun ou noirâtre ; Seraient plus saprophytes que parasites
Capnodium sp. (fumagine des feuilles)
xClasse des Loculoascomycètes : asques bituniqués, contenus dans des loges stromatiques ouvertes (périthèce)
xxOrdre des Myriangiales :un seul asque dans un ascostroma Elsinoë ampelina (Sphaceloma ampelinum ;
anthracnose de la vigne)
xxOrdre des Dothidéales :asques en bouquet, renflés dans leur partie supérieure, absence de pseudo-
paraphyses.
Dothidella ulmi, Mycosphaerella fragariae (Ramularia
tulasnei).
xxOrdre des Pléosporales : asques tapissant le fond de la loge, renflés dans leur partie inférieure présence de
pseudo-paraphyses
Pleospora (Stemphylium), Venturia inaequalis
(Cylindrosporium hiemale-Spilocea pomi ; tavelure du pommier), V. pirina (Fusicladium pirinum ; tavelure du
poirier), Leptosphaeria lindquistii, L. maculans , Cochliobolus sativus (Bipolaris), Drechslera teres (Pyrenophora
teres), Lewia (Alternaria), Guignardia bidwellii (Phyllosticta ampelicida)
xClasse des Pyrénomycètes : asques unituniqués inclus dans une fructification ouverte (périthèce) doublée ou non d'un
stroma
xxOrdre des Sphaeriales : périthèce à paroi carbonacée
xxSous-Ordre des Ophiostomales :
Ophiostoma ulmi (Graphium ulmi ) graphiose de l’orme
xxSous-Ordre des Microascales :
xxxFamille des Ceratocystidaceae :
Ceratocystis fimbriata (Chalara fimbriata )graphiose du platane
xClasse des Discomycètes : asques inclus dans une fructification présentant généralement une forme de coupe
(apothécie)
•asques operculés
xxOrdre des Pézizales
xxxFamille des Ascobolacées : apothécies rudimentaires, très petites
ex : Ascobolus
xxxFamille des Pézizacées : apothécies cupuliformes, stipitées ou sessiles
ex : Peziza, Sarcoscypha coccinea
xxxFamille des Helvellacées : apothécies stipitées, capitées
ex : Helvella, Morchella esculenta.
•asques inoperculés
xxOrdre des Lécanorales : asques inoperculés, champignons lichenisants
xxOrdre des Phacidiales : apothécies incluses dans le substra, asques inoperculés, champignons non
lichenisants
xxxFamille des Hypodermatacées : asques mucronés
ex : Rhytisma acerinum, Lophodermium, Coccomyces
xxxFamille des Cryptomycétacées : asques en massue
ex : Phacidiella
xxOrdre des Hélotiales : apothécies superficielles
xxxFamille des Hyaloscyphacées : apothécies poilues
ex : Sclerotinia=Monilinia fructicola (Monilia laxa ;
moniliose sur arbres)
xxxFamille des Sclérotiniacées : apothécies non poilues, pédicellées, naissant sur sclérote
ex : Sclerotinia sclerotiorum (pourriture du collet),
Sclerotinia=Botryotinia fuckeliana (Botrytis cinerea)
xxxFamille des Mollisiacées : apothécies non poilues sessiles, absence de sclérote
ex : Drepanopeziza, Pseudopeziza trifolii, Fabraea
maculata (Entomosporium maculatum; entomosporiose du cognassier), Diplocarpon rosae (Marssonina rosae),
Higginsia hiemalis (=Coccomyces hiemalis) (Cylindrosporium), Pseudopeziza tracheiphila (Brenner de la vigne)
xxOrdre des Tubérales : champignons hypogés
ex : Tuber melanosporum
Taphrina deformans
Balai de sorcière Fruits en pochette Cloque du Peuplier
asque
Mycélium
n+n,
intercellulaire
Cloque sur Cerisier
PLECTOMYCÈTE
A) Erysiphales= Périsporiales
Caractères morphologiques:
-Thalle: filamenteux, septé, haploïde, hyalin superficiel (se développe
à la surface des organes parasités)
Fulcres indifférenciés
hiver
Cycle de
Sphaerotheca pannosa
Uncinula necator
périthèces
fulcres
Blumeria graminis
Phyllactinia corylea
Microsphaera alfitoïdes
BIOLOGIE
ASCOMYCÈTES
LOCULOASCOMYCÈTE
Venturia pirina
BIOLOGIE
-Pas de spermatie
Conidies
Elles sont petites (5 à 6 µm par 3 à 4 µm) et ovoïdes.
Elles sont capables de germer immédiatement
(Sphacelia typhina).
Périthèces
Leur formation coïncide avec le jaunissement de la
quenouille. Les conceptacles sont ovoïdes et mesurent
environ 300 µm. Leur col sort légèrement du manchon
(ce qui donne à celui-ci un aspect rugueux).
Chaque conceptacle renferme un grand nombre d'asques
étroits. Asques, ascospores libérées par gélification
DISCOMYCÈTES
Caractères morphologiques et classification
infection
Évolution des symptômes
à partir des infections.
2a, 2b: double attaque
à partir des fruits et
des rameaux
Contamination par les ascospores Colonisation des tissus par
sur bourgeon,feuille ou capitule le mycélium. Développement
d ’une pourriture blanche
1 2
Destruction du bourgeon
terminal
ASCOMYCÈTES
Sclerotinia sclerotiorum Germination, fructification
et formation de spores
Asque et ses 8 ascospores
Germination mycélienne
1 2 Tâches sur la tige
ou le capitule
Formation
des sclérotes
Conservation
Germination du sclérote Sous forme de sclérotes libres dans le sol
et formation des apothécies ou les débris de culture
Conservation
Sous forme de sclérotes libres dans le sol ou les débris de culture
CARACTÈRES MORPHOLOGIQUES
-Le thalle: faculté à former des sclérotes. Le mycélium
mélangé aux tissus de l ’hôte est à l ’origine des momies.
Les momies peuvent être assimilées à des sclérotes.
CARACTÈRES MORPHOLOGIQUES
Multiplication végétative: 2 types conidiens:
Monilia : (Fs Monilinia) Conidies hyalines unicellulaires en
chaîne.
Monilia Botrytis
-Conservation: par les sclérotes et momies, par mycélium dans les organes
pérennes, dans le sol sur les résidus de culture.
MULTIPLICATION VÉGÉTATIVE
Spores non flagellées, non formées dans des sporocystes: conidies
2 formes de phialide chez As pergillus
Formation itérative
Conidies et conidiophores à
l’air libre Phi alide de Penicillium
Acervule/pycnide
Conidiophores enfermés dans une pycnide
Botrytis de la féverolle
Botrytis: (Fs Botryotinia): conidiophores en arbuscules, bruns,
bien différenciés. Conidies hyalines unicellulaires, naissent sur les
ramifications terminales
Biologie
La conservation du champignon se fait sous forme de sclérotes qui
sporulent pour donner des conidies au printemps, par temps humide.
Les conidies contaminent tous les organes de la plante et déterminent
les taches-chocolat.
Epidémiologie
L'optimum thermique de progression de la maladie est de 15-20 C.
Une humidité relative importante (> 80 p. cent) est nécessaire pour qu'il
y ait sporulation de conidies sur les taches. Les conidies se disséminent
par le vent. Il n'est pas nécessaire qu'il y ait de l’eau libre sur les
feuilles pour que la contamination par les conidies soit possible, une
forte hygrométrie (> 90 p. cent) suffit.
Par temps sec, le champignon reste à l'état latent dans les tissus de
l’hôte ou croît lentement. Par temps humide, croissance rapide de façon
intra et extra cellulaire.
Sympômes:
En début de végétation, nombreuses ponctuations appelées "taches-
chocolat", de quelques millimètres, de forme circulaire sur les
folioles, les pétales et les gousses et de forme plus ovalisée sur les
tiges.
Coalescence et évolution des taches en nécrose de couleur brun-
rouille et de forme irrégulière sur tous les organes de la plante.
Chute précoce des feuilles et verse des plantes.
Helminthosporium graminearum
Helminthosporiose
Biologie
Le stade parfait ne semble jouer aucun rôle dans la reproduction massive
du champignon. Le stade imparfait développe un mycélium avec des
conidiophores sur lesquels sont produites les conidies.
Les conidies sont disséminées par le vent et les pluies et entraînent après
germination, de nouvelles infections.
Le champignon hiberne sous forme de mycélium sur les plantes infectées
et sur les résidus végétaux et il est aussi transmissible par les semences.
Epidémiologie
Hygrométrie et températures élevées, · Résidus de cultures en surface, ·
Variétés sensibles·
Symptômes
Ramulariose de l’orge:
Ramularia collo-cygni
Biologie
La biologie de ce Fusarium le différencie des autres espèces
responsables de dépérissements. Ses attaques restent localisées au-
dessus du sol et ne touchent pas les racines.
Le champignon se conserve dans le sol sous forme de chlamydospore.
Les agglomérats (= sporodochies) de microconidies sont pigmentés de
rouge. Le champignon produit également des
macroconidies.
Epidémiologie
L’infection est favorisée par des stress thermiques
(fortes ou faibles températures).
PHOMA DU COLZA
(TÉLÉO. LEPTOSPHAERIA MACULANS)
PHOMA DU COLZA
PHOMA DU TOURNESOL
Coryneum beijerenckii
Criblure du cerisier et de l’abricotier
Biologie
Le champignon se conserve dans les chancres et les bourgeons des
rameaux atteints où il survit d'une année sur l'autre. Il continue
d'ailleurs à se développer pendant la saison hivernale si les conditions
lui sont favorables.
Au printemps, les conidies produites au niveau de cette source
d’inoculum, entraînées par les eaux de pluies, contaminent les fleurs
puis les jeunes feuilles.
Entomosporium maculatum
Biologie
Au milieu de la tache foliaire engendrée par le champignon
apparaissent les acervules du champignon formant des conidies dont
les cellules sont disposées en croix.
Au printemps, des apothécies produisant des asques se forment sur
les feuilles tombées. Les ascospores et les conidies sont
responsables de l'attaque de la plante.
Epidémiologie
Le champignon attaque surtout la poire et le coing, particulièrement
les sauvageons en pépinière. Les espèces nobles sont moins
touchées. Des pluies fréquentes au printemps et en été favorisent
l'attaque par les conidies qui se trouvent sur les branches.
Symptômes
Petites taches foliaires irrégulières de couleur rouge foncé qui se rejoignent
et deviennent marron à noir en formant une croûte. Elles se forment
également sur la face inférieure des feuilles.
Chute précoce des feuilles lors d'une attaque plus importante.
Sur fruit, taches arrondies et irrégulières,brunes à noires, provoquant, en
cas d'attaque intense, des déformations et des crevasses sur fruits.
Cela engendre des arrêts dans le développement de l'arbre et se répercute
sur le travail de greffage des yeux, car l'écorce se détache difficilement.
LA SEPTORIOSE DU BLÉ
Septoria tritici (téléo Mycosphaerella graminicola) : Nord de la France,
sur gaines et feuilles
Septoria nodorum (téléo Leptosphaeria nodorum) : Midi de la France,
attaque aussi épis et grains
Effet de la présence d ’eau : effet de la pluie dans la dissémination
BASIDIOMYCÈTES
CARACTÈRES GÉNÉRAUX COMMUNS AVEC LES
ASCOMYCÈTES
phragmobasidiomycète ustilaginomycète
PHRAGMOBASIDIOMYCÈTES
Rhizoctonia Solani
Hyphe vieillissant
Structure sexuée
rare
basidiospores
Jeune hyphe
mycélium
graine
débris tomate
chou
Le mycélium ou les sclérotes passent Pomme de terre
l ’hiver dans les débris de pante, sol, graines Pourriture de la graine
Nécrose et sclérote sur et dans les
tissus de la plante
URÉDINIOMYCÈTES
CYCLE DE PUCCINIA GRAMINIS
CARACTÈRES MORPHOLOGIQUES
Puccinia triticina:
rouille brune du blé
CLASSIFICATION
Pucciniacées: téleutospores pédicellées, disséminées. Nombre
variable de cellules.
Gymnosporangium Phragmidium
SYMPTÔMES
-Conservation:
par téleutospores à paroi épaisse.
Par les urédospores, mais la longévité est plus courte.
Leur rôle est important parfois, surtout chez les espèces hétéroxènes.
Par le mycélium pérennant dans les organes lignifiés.
BASIDIOMYCÈTE
USTILAGINOMYCÈTE M
F
Ustilago Ustilago
avenae tritici
Sphacelotheca reiliana a b d
c
b
a
Entyloma ranonculi c
Tilletia caries
a b 3 2 1
téliospore
BASIDIOMYCÈTE-USTILAGINOMYCÈTE
Ustilago maydis
Contamination II Basidiospores
compatibles
Pénétration du mycélium dicaryotique
Infection des plantules dans un grain à travers les téguments
ou des tissus en croissance
Le grain infecté
grossit et produit
basidiospores une galle
Infection sur Contamination
feuille III
baside
germination
Mycélium
Chlamydospore=téliospore dicaryotique
zygote
Galles remplies de Dans la galle le mycélium
chlamydospores dicaryotique se transforme
en chlamydospore
USTILAGINOMYCÈTE
CARACTÈRES MORPHOLOGIQUES
-Thalle: n, levuriforme, saprophyte et n+n, mycélien et parasite.
Intercellulaire, peut former des suçoirs.
•Hypertrophie localisée