Indicatorii 

biologici sunt specii folosite pentru
a monitoriza starea de sănătate a unui
mediu sau ecosistem. Ele sunt reprezentate de
orice specie biologică sau grup de specii a căror
funcţie, populaţie, sau statut poate fi utilizat pentru a
determina integritatea  ecosistemului sau a
mediului. Un exemplu de un astfel de grup
sunt copepods şi alte crustacee mici de apă prezente în
componenta apelor . Aceste organisme sunt monitorizate
pentru determinarea
unor modificări (biochimice, fiziologice, sau comportament
ale), care pot indica o problemă în
cadrul ecosistemului lor. Bioindicatori ne poate spune des
pre efectele cumulative de diferiţi poluanţi în ecosisteme
şi despre cât timp o problemă să fi fost prezentă,fapt nu
pote fi descoperit prin testarea fizica si chimica. 
Un monitor biologice, sau biomonitor, este definit ca un
organism care furnizează
informaţii cantitative privind calitatea mediului aflata în
jurul ei. Prin urmare, un bun biomonitor
va indica prezenţa substantelor poluante şi, de
asemenea,va pute sa ofere informaţii
suplimentare despre valoarea şi intensitatea expunerii la
acesti poluanti.
Un bioindicator este un  organism sau o reactie biologic
care indică prezenţa  poluanţilor prin prezenta simptomelor
tipice sau sau a reactiilor măsurabile, şi este, prin
urmare,mai calitativă. Aceste organisme (sau comunităţi de 
organisme) oferă informaţii despre
modificări în mediu sau cantitatea de poluanţi de
mediu prin schimbarea într-unul din următoarele
moduri: fiziologic, chimic sau comportamental. Informaţiile 
pot fi deduse prin studierea:
1.continutului lor de anumite elemente si compusi;
2.structura lor morfologica si celulara;
3.proceselor metabolice si biochimice;
4.comportament;
5.structura populatiilor.
Importanţa şi relevanţa biomonitorilor, mai
degrabă decât aceea a echipamentelor facute de
oameni, este justificata prin declaraţia: ". Nu există nici
un indicator mai bun al statutului unei specii sau a
unui sistem decât o specie sau un sistem de sine" .
Utilizarea unui biomonitori este descrisă ca fiind o
monitorizare biologică şi este utilizarea proprietatilor unui
organism pentru a obţine informaţii privind anumite
aspecte ale biosferei. Biomonitorizarea de poluanţi din
aer pote fi pasiva sau activa.Prin metodele pasive
se observa cresterea plantelor in mod natural din zona de
interes.Metodele active detecteaza prezenţa de poluanţi
atmosferici prin plasarea de plante in vedera testarii
răspunsului acestora şi genotipului în zona de studiu.
Indicatorii bioacumulativi sunt frecvent considerati ca
fiind biomonitori.
În
funcţie de organismul selectate şi utilizarea acestuia, exist
ă mai multe tipuri de bioindicatori. 
 Indicatori plante:
Prezenţa sau absenţa anumitor plante sau alte forme de
viaţă vegetativă într-un
ecosistem poate furniza indicii importante despre starea de
sănătate a mediului:conservarea mediului.
Există mai multe
tipuri de biomonitori plante, inclusiv muşchi, licheni, scoart
a de copac, inele de copac, frunze, şi ciuperci.
Lichenii sunt organisme care cuprind atât ciuperci
cat şi alge. (Acestea nu sunt plante.)lichenii se
găsesc pe stânci şi trunchiuri de copaci, şi ei răspund la
schimbările de
mediu în păduri, inclusiv schimbări în structura biologica
a padurii - privind conservarea,calitatea aerului, şi
schimbarile climatice. Dispariţia lichenilor într-o pădure po
ate indica schimbari de mediu, cum ar fi niveluri ridicate de
dioxid de sulf, pe bază de sulf poluanţi, şi oxizi de azot.
Compoziţia şi biomasa totala de specii de alge în mediul
acvatic serveşte ca un parametru
important pentru poluarea organică şi de încărcare de
nutrienţi, cum ar fi azot şi fosfor.
Există organisme modificate genetic, care ne ajută prin
indicarea nivelurilor de toxicitate în mediul înconjurător; de
exemplu, un tip de iarba
modificata genetic care creste avand o culoare diferită în
cazul în care există toxine în sol.

Indicatorii-animale şi toxinele

O creştere sau o scădere într-o populaţie de
animale poate indica afectarea
ecosistemelor, cauzate de poluare. De exemplu, daca polua
rea cauzeaza epuizarea
surselor alimentare importante, specii de animale
care depind de aceste surse de alimente vor fi, de
asemenea, reduse ca număr: declinul
demografic. Suprapopularea, poate fi rezultatul creşterii
unor specii oportuniste . În plus
faţă de monitorizarea dimensiunii şi numărului de anumite
specii, alte mecanisme de indicaţie in ceea ce
priveste animalele include monitorizarea
concentraţiei de toxine în
ţesuturile animale, sau monitorizarea ratei
la care deformarile apar în populaţiile de animale.
Indicatori microbieni şi poluanţi chimici

Microorganismele pot fi utilizate ca indicatori ai sanatatii

ecosistemului acvatic sau
terestru. Găsite în cantităţi mari, microorganisme sunt mai
usor de verificat decât alte
organisme. Unele microorganisme vor produce noi
proteine,atunci când sunt expuse la contaminanţi, cum ar
fi cadmiu şi benzen. Aceste proteine de stres pot fi folositi
ca un sistem de avertizare timpurie pentru a detecta un
nivel ridicat de poluare.
Indicatorii microbiene în exploatarea de petrol şi gaze

Prospectarea de Petrol şi Gaze (MPOG) microbiene este
adesea folosit în bazine de frontieră pentru a identifica
zonele potenţiale pentru existenta de petrol şi gaze. În
multe cazuri de ulei şi de gaze este cunoscut să se
prelingă spre suprafaţă ca un rezervor de hidrocarburi se
va scurge, de
obicei, sau au scurs spre suprafaţă prin forţele
deflotabilitate depăşirea presiunilor de
etanşare. Aceste hidrocarburi se pot modifica
chimic şi microbiene apariţiile găsite în solurile de
suprafaţă în apropierea sau pot ficulese direct. Tehnicile
utilizate pentru MPOG includ analiza ADN-ului, contează si
mplubug după cultivarea unui eşantion de sol într-
un mediu pe bază de hidrocarburi sauuitandu-se
la consumul de gaze de hidrocarburi într-o celulă cultură.
Macroinvertebrate bioindicatori 

Macronevertebratelor sunt indicatori utili şi favorabili a

sănătăţii ecologice a unui râu, acestea sunt aproape
întotdeauna prezente, şi sunt uşor de probat şi de
identificat.. Sensibilitatea gamei de macronevertebratelor
găsite vor permite o apreciere obiectivă a stării ecologice
care urmează să fie făcute. 
În Australia, metoda semnalului a fost dezvoltata şi este
folosit de către comunitatea de cercetători şi de grupuri de
supraveghetori ai apelor pentru a monitoriza sănătatea
apei.
În Statele Unite, Agenţia pentru Protecţia Mediului (EPA) a
publicat Rapid Bioassessment Protocols , pe baza macronevertebratelor,
precum şi perifiton şi peşte. Aceste protocoale sunt
utilizate de către multe state federale, şi agenţiile locale de
proiectare side evaluare a calităţii apei. Voluntarii
organizaţiilor de monitorizeaza fluxul în jurul Statelor Unite,
care lucrează în colaborare cu agenţiile guvernamentale, de
obicei folosesc metode macroinvertebrate. [8]
specie procedurile de identificare sunt efectuate în
domeniu, fără utilizarea de echipamente specializate, şi
tehnici pot fi predate cu uşurinţă în sesiuni de formare de
voluntari.