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Analisis de datos. Clampfit y SigmaPlot.

Empezando por el principio, una vez que tens instalada la suite del pClamp el programa que vamos a usar es el Clampfit, que es con el que visualizamos los archivos binarios del Axoscope, la ganancia la manejamos igual en los dos programas. Una vez que tengas un segmento que quieras analizar, lo tenemos que pasar al Sigmaplot, agarramos esta porcin por ejemplo:

Ahora tenemos que agarrar y encerrar el segmento que queramos pasar al Sigmaplot entre dos cursores, para hacer esto vamos hasta Tools Cursors Bring Cursors, y le damos OK a la ventanita que aparece. Ahora vamos a tener centrados en el rango que estemos viendo 4 cursores, movemos el 1 hasta el inicio de donde queramos extraer y el 2 al final. Una vez que marcamos lo que queremos exportar vamos a File Save As, nos fijamos que el formato en el que lo guardemos sea Axon Text File y vamos a Options y le decimos que guarde Between cursors 1 and 2:

Una vez que guardamos eso vamos al Sigmaplot e importamos el archivo: File Import - Import File filtramos por tipo de archivo Axon text y le damos a importar. Bueno, ahora que lo tenemos en el SigmaPlot podemos hacer lo que queramos, podemos graficar las dos cosas con Graph Create Graph y aparece la ayuda para hacer graficos, y modificando las propiedades del grfico una vez que lo tens hecho y buscar en que tiempo est un solo latido.

En esa imagen coloqu el solo el grfico del registro de tensin, y fui a Graph Properties Axes Scaling, y puse que inicie la escala desde 0 hasta 2, entonces tenemos menos latidos y podemos separar uno ms fcilmente.

Ah se ve el efecto del reescalado y filtrando mas fino vemos que un latido va desde aproximadamente 0,45 hasta 1, y solo la fase de ascenso lineal va hasta 0,75. Sabiendo eso podemos ir a la hoja con los datos que importamos y seleccionar y copiar los datos solo de ese perodo de tiempo.

En el grfico de abajo est solo la fase de ascendente de la primer contraccin, copi los datos de tiempo (columna 1) y tensin (col 2) desde el valor de t=0,45 hasta t=0,75. Luego tenindolo pegado en otras dos columnas lo pude graficar solo a eso, y le damos clic derecho sobre la lnea del grfico y vamos a Fit curve, y aparece un asistente para aproximar la curva a una ideal del tipo que elijamos, en este caso una lineal estndar, cuando ejecutamos el asistente nos queda en las siguientes dos columnas la curva a la que se ajusta y si vamos a Graph Add Plot, habiendo seleccionado previamente el segundo grfico y dando como coordenadas los datos de las dos nuevas columnas tenemos los dos grficos juntos y podemos ver la pendiente del ascenso. Lo mismo podemos hacer para el descenso y lo que recomend Gonza fue tipificar los datos de contracciones seguidas, as las podemos confrontar con las M y todo eso. Creo que esto es todo lo que pas Gonza los otros das, con esto podemos ir viendo las caractersticas de las M en las distintas concentraciones que va a llevar un rato considerable hacerlo para todas las concentraciones de todos los experimentos. Un Abrazo. Huguito.

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