Chapitre 3 : La cellule eucaryote

3.1 Paroi de la cellule eucaryote 3.2 Membrane cytoplasmique 3.3 Cytoplasme 3.4 Arrangement de lADN chez les eucaryotes 3.5 Rticulum endoplasmique 3.6 Appareil de Golgi 3.7 Lysosomes/protasome 3.8 peroxysomes 3.9 Ribosomes 3.10 Mitochondries 3.11 Hydrognosomes 3.12 Chloroplastes 3.13 Myctes
Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Planche 1

La cellule eucaryote

Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Planche 2

Paroi
Cellule animale : dpourvues de paroi Cellules vgtales : paroi trs variable en composition chimique
-cellulose (glucose)n lis en -1,4 - htropolysaccharides hmi cellulose, polymre ramifi de glucose, mannose, xylose - pectines, trs htrognes, acide polygalacturoniques plus ou moins mthyls) - lignines, structure complexe forme de noyaux aromatiques

Microorganismes
- algues paroi de cellulose, xylane, alginate, mannanes - protozoaires, aucune paroi ou silice, carbonate de calcium - Champignons et levures : chitine (polymre de N-actyl glucosamine li en -1,4)

- Saccharomyces cerevisiae paroi trs composite forme de Glucanes lis en -1,3 et -1,6 Mannanes mannose li en -1,2, -1,3 et -1,6
Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Planche 3

Paroi
Structure essentielle forme cellulaire slectivit

Structure dynamique morphognse bourgeonnement

Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Planche 3.1

Paroi

Composition et structure de la paroi des levures :

(Milieu Extrieur)

Mannoprotines

Paroi
~150 nm

(1,6)glucanes (1,3)glucanes

Chitine Membrane Plasmique

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Planche 3.2

Paroi

Composition et structure de la paroi des levures :

ExtraExtra-Cellular Space

IntraIntra-Cellular Space

Mannoproteins 1,6 Glucans 1,3 Glucans 40% 8% 50% Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Chitin (1-2%)

GPI Anchor

Transmembrane Protein Planche 3.3

Paroi
-glucanes : stimulent le systeme immunitaire probiotiques agent anti-cholesterol protecteur anti-UV pesticides biologiques Mannanes : amliorent la qualit des vins Enzymes de synthse paritale : cibles antifongiques uniques ! Adressage de protines la surface cellulaire : nouveaux vaccins.
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Planche 3.4

Membrane : Structure

Bicouche lipidique (40 %)

Phospholipides 55%,
phosphatidyl choline, lcithine (absente chez procaryotes)

Protines 50 %
Extrinsque Intrinsque 20 000<PM< 215 000

Cholestrol (5 25 %) Glycolipides (18 %) Acides gras 2 %

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Sucres 5 10 %
Planche 4

Membrane : Fonction

Comme pour les procaryotes - transport (mme systme + endocytose) - rception dinformations - reconnaissance cellulaire - inhibition de contact - liaison avec le cytosquelette - fixation de mdicaments/virus/toxines

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Planche

Cytosquelette

Bleu : noyau Vert: microtubules Rouge: actine

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Planche 6

Cytosquelette
Form de trois types de filaments Filament dactine: D 5 9 nm
Impliqus mouvement et changement de forme

Microtubules: D 25 nm
tubuline et assembles en hlice pour former un cylindre (13 sous units par tour)
centrosome

Maintien de la forme cellulaire, mouvement, transport cellulaire de substances

Filaments intermdiaires D 10 nm
Protines fibrillaires assembles en hlice (kratine, neurofilaments) .Variables dune cellule lautre.
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Planche 6

Cytosquelette
Form de trois types de filaments Filament dactine: D 5 9 nm
Impliqus mouvement et changement de forme

Microtubules: D 25 nm
tubuline et assembles en hlice pour former un cylindre (13 sous units par tour)
centrosome

Maintien de la forme cellulaire, mouvement, transport cellulaire de substances

Filaments intermdiaires D 10 nm

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Planche 6

Appareil nuclaire: Noyau

2 membranes : membrane externe continue avec le rticulum endoplasmique; Bicouche lipidique connecte au niveau des pores

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Planche 7

Appareil nuclaire: Noyau

Synthse des protines et pissage dans des compartiments spars

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Planche 8

Chromosome eucaryote
Chromatine
constitue de fibres chromatiniennes ADN + protines (histone) enroulement serr (htrochromatine) ou lche (euchromatine)

rpartie en sous unit : les

chromosomes lot de chromosomes identique pour chaque type cellulaire

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Planche 9

Chromosomes eucaryotes
Homo sapiens (human) Mus musculus (house mouse) Zea mays(corn or maize) Drosophila melanogaster (fruit fly) Xenopus laevis (South African clawed frog) Caenorhabditis elegans (microscopic roundworm) Saccharomyces cerevisiae (budding yeast) Canis familiaris (domestic dog) Arabidopsis thaliana (plant in the mustard family) Muntiacus reevesi (the Chinese muntjac, a deer) Muntiacus muntjac (its Indian cousin) Myrmecia pilosula (an ant) Parascaris equorum var. univalens (parasitic roundworm) Cambarus clarkii (a crayfish) Equisetum arvense (field horsetail, a plant)
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46 40 20 8 36 12 32 78 10 23 6 2 2 200 216
Planche 10

Cellules diplodes = 2n chromosomes

(Ex: humain 23 chromosomes de chaque parent)

Cellules haplodes= n chromosomes

Mcanisme de division
Deux modes de reproduction 1. Asexu : mitose
Chaque chromosome est rpliqu en deux copies : les chromatides soeurs

2n

4n

Les copies se sparent et chacune migre dans une cellule

2n

4n

2x (2n)

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Planche 11

Mcanisme de division
Deux modes de reproduction 2. Sexu : miose
Chaque chromosome est rpliqu en deux copies : les chromatides soeurs

2n

4n

Pendant les premires tapes de la miose seulement une copie de chaque paire migre dans une cellule (sparation des chromosomes homologues)

2n

4x (1n)

Gamtes haplodesFusion de deux gamtes = zygote (retour 2n)

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Planche 12

Le cycle cellulaire eucaryote

Prparation pour la division

Synthse ARNm, ARNt, ribosomes et constituants cytoplasmiques

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Planche 12.1

Rticulum endoplasmique

Extension membranaire partir du noyau Rugueux ou lisse Espace luminal 20 30 nm de large)

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Planche 13

Rticulum endoplasmique

Microscopie fluorescence dune culture de cellules animales marques avec un anticorps se liant une protine retenue dans le RE. Marquage de tout le cytosol.
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Planche 14

Appareil de Golgi

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Planche 15

Lysosome et protasome Dgradation de protines aussi essentielle la cellule

que la synthse - production dacides amins pour la synthse de protines
- limination des enzymes en excs - limination des facteurs de transcription non utiliss

2 systmes majeurs impliqus dans la dgradation de protines

- lysosomes (dgradation protines extracellulaires) - protasomes (dgradation protines intracellulaires)

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Planche

Lysosomes

Synthtis par RE ou Golgi Plus ou moins sphrique, taille variable de 50 nm quelques m) Site de digestion intracellulaire, riche en enzymes de dgradation

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Planche 16

Lysosomes
Membrane plasmique Bactrie Phagocytose Vacuole digestive

Appareil de Golgi Vsicule d'endocytose

Corps multivsiculaire

Lysosomes primaires

Lysosomes secondaires

Vsicule autophagique

Rticulum endoplasmique mitochondrie

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Planche 17

Le protasome

Systme de dgradation des protines intracellulaires facteurs de transcription protines codes par des virus protines mal replies protines impliqus dans le cycle cellulaire

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Planche 18.1

Enzymes impliques dans la dgradation de la protine cible

E1: enzyme qui active lubiquitine E2: enzyme catalysant la conjugaison de lubiquitine la protine cible E3: enzyme qui reconnat la protine cible : rsidue de Lysine

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Planche 18.2

Le protasome
190 450 Structure du protasome 20S Structure du protasome 26S

sous units non protolytiques; : sous units protolytiques

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Planche 18.3

Dgradation par le protasome

Peptide (8aa)

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Planche 18.4

Action concerte RE/Golgi/Lysosomes

RE
Vsicule intermdiaire

RE Citerne cis Vsicule navette

Citerne trans

Vers les lysosomes Vsicule scrtoire

Lysosomes

Vsicule d'endocytose

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Planche 18.5

Circulation des protines

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Planche 18.6

Translocation post-traductionnelle

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Planche 18.7

Translocation Co-traductionnelle
Peptide signal SRP
GDP GTP

cytosol

translocon Protines foldes SR Signal peptidase Lumire du RE

BiP

- Fixation SRP sur ribosome et peptide signal/ Arrt Synthse protique /Interaction SRP avec rcepteur (SR)/Hydrolyse du GTP engendre libration du ribosome/ Insertion chane polypeptidique dans le pore du translocon/ BiP est relargu / Passage du polypeptide dans la lumire du RE/ peptide signal coup (BiP aussi chaperon empchant le polypeptide de sagrger)
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Planche 18.8

SRP (Signal recognition particule)

SRP : ribonucloprotine qui reconnait le PS ds sa sortie du ribosome. SRP se fixe galement au ribosome et bloque la traduction vitant laccumulation de protines membranaires ou scrtes dans le cytosol.

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Planche 18.9

Modifications des protines dans le RE

Formation des Ponts disulfures (intra ou inter-molculaire) Arrangement tri-dimensionnel Assemblage des sous-units Addition et maturation des oligo-saccharides Clivages protolytiques spcifiques (plutt golgiennes)

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Planche 18.10

La glycosylation
Les protines eucaryotes membranaires ou scrtes peuvent tre glycosyles. O-glycosylation sur l'oxygne des groupe hydroxyle de SER et THR. Pas de squence consensus. Cytosol et voie de scrtion.

N-glycosylation sur l'azote du groupe amide de ASN des squences ASN-X-SER/THR (X PRO). N-X-S/T

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Planche 18.11

La N-Glycosylation

Cytosol

OST

OST dolichol phosphate N-acetylglucosamine mannose

ASN Lumire du RE

glucose

Nombreux rles: Transport (vers le lysosome) Mise en conformation tridi

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Protection contre la protolyse Adhsion cellulaire

Planche 18.12

Maturation des glycosylations (RE)

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Planche 18.13

Maturation des glycosylations

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Planche18.14

Peroxysomes

Structure membranaire 0,5 m

Site de dgradation des acides gras ou acides amins par rduction de O2 et formation de H2O2 H2O2 rduite en H2O et 02 par la catalase

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Planche 19

Ribosomes

Proprits
Taille globale Petite sous-unit Nombre de protines Taille de lARN Grande sous-unit Nombre de protines Taille de lARN

Procaryote
70S 30S environ 21 16S (1500) 50S environ 34 23S (2900)

Eucaryote
80S 40S environ 30 18S (2300) 60S environ 50 28S

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Planche 20

Mitochondrie
Taille: 0,3 1 m sur 5 10 m

Membrane interne Matrice

Crtes Membrane externe

Possde son propre ADN Intervient dans la production dnergie

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Planche 21

Cycle des acides tri-carboxyliques

Pyruvate

Dans la matrice mitochondriale

CoA NAD+ NADH + H+ CO2

Actyl-CoA (2 carbones) Oxaloactate

NADH + H+ NAD+
Malate

Citrate H2O Cis-asconitate H2O

H2O

6 carbones Fumarate
Isocitrate

FADH2 FAD

4 carbones 5 carbones Succinate

CoASH GTP GDP -ctoglutarate

NAD+

CO2
CoASH

SuccinylCoA

NAD+ NADH + H+ CO2

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Planche 22

Chane de transport des lectrons

Dans la membrane interne
Transfert dlectrons du NADH jusqu loxygne grce des transporteurs protiques Transfert bloqu par le cyanure, le monoxyde de carbone et les rotnones
nergie libre par rapport O2 (kcal par mole)

Cyanure

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Planche 23

La phosphorylation oxydative

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Planche 24

La chimiosmose
ATP synthase
Le long de la chane de transport dlectrons: expulsion de H+ = gradient de protons Retour par des pores permet ATP synthase de rcolter cette nergie potentielle et de former de lATP (chimiosmose)

Boyer et Walker, Prix Nobel de chimie 1997 http://www.nobel.se/chemistry/laureates/1997/illpres/boyerwalker.html

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Planche 25

Mitochondrie : centrale lectrique

lectrons transports par 2 NADH lectrons transports par 2 NADH lectrons transports par 6 NADH et 2FADH2

Cytosol
Glycolyse Glucose 2 Pyruvate 2 Actyl CoA Cycle de Krebs Chane de transport des lectrons

ATP
+2
Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

ATP
+2

ATP
+34
Planche 26

Oxydation arobie du glucose

Voie emprunte ATP form

Voie de la glycolyse Phosphorylation au niveau du substrat Phosphorylation oxydative Conversion de 2 pyruvates en deux actyl-CoA Phosphorylation oxydative avec 2 NADH Cycle des acides tricarboxyliques Phosphorylation au niveau du substrat (GTP) Phosphorylation oxydative avec 6 NADH Phophorylation oxydative avec 2 FADH2. Rendement final
Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

2 ATP 6 ATP

6 ATP 2 ATP 18 ATP 4 ATP 38 ATP

Planche 27

Hydrognosomes
Structure membranaire Taille mitochondrie Pas dADN ni de ribosomes Pyruvate
CO2 H2

Actyl-CoA
ADP ATP

Pyruvate:ferredoxine oxydorductase

ATP

Actate

Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Planche 28

ATP/ADP
NH 2 OO P O OO P O O- CH 2 N O N N N

ADP

OH

OH

NH 2 O O- P O OO P O OO P O O- CH 2 N O N N N

ATP
OH OH

ATP= 7,3 Kcal/mole

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Planche 29

Mitochondrie : centrale lectrique

glucose pyruvate Acide gras

H+ H+

pyruvate Acetyl-CoA Cycle de Krebs

Acide gras

H+ ATP ADP+Pi
H+

O2 H2O H+ H2O

FADH2 O2

NADH

e-

e-

H+

Chane respiratoire
H+ H+ H+ H+
Planche 30

Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Chloroplaste
Membrane interne Stroma
Thylacode

Membrane externe

Taille: 2 4 m sur 5 10 m

Grana: empilement de thylacodes

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Planche 31

Photosynthse
Equation globale:
6CO2 + 6H2O + lumire C6H12O6 + 6O2

Phase claire: nergie lumineuse transforme en nergie chimique grce aux photosystme I et II Phase obscure: nergie utilise pour rduire le CO2 et produire des sucres
Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Planche 32

Pigments
Tous les organismes photosynthtique possde des pigments (chlorophylle ou autres) Pigments assembls en antenne = capteur de photons Photosystme I: absorbe >680 nm, transfert lnergie P700 Photosystme II: Transfert lnergie P680

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Planche 33

Phosphorylation cyclique et non cyclique

Phosphorylation cyclique:
2 photons, 2 e-, 1 ATP P700*

-1.4 (V) -1.2 -1.

A ou FeS FeS

Phosphorylation non cyclique: 2 photons, 2 e-, 1 ATP, 1 NADPH

P680* Pheo a

-0.8 -0.6 -0.4

2 e-

Cyclic
Cyt b53 Cyt b6
FeS Cyt f ATP

Fd

NADP+ -0.2

2 photons

2 e2 photons H2O O2 + 2H+

PQ

PC

2 e- P700

0.0 +0.2 +0.4 +0.6 +0.8

2 eP680

+1
Planche 34

Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Phase Claire et obscure

Claire
H2O CO2

Obscure

NADP+ ADP Cycle de calvin ATP NADPH

O2

CH2O (sucre)

Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Planche 35

Cycle de Calvin
Ribulose biphosphate carboxylase=RubisCo

Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Planche 36

Diversit des organismes photosynthtiques Organismes eucaryotes

Plantes suprieures Algues multicellulaire vertes et brunes Algues unicellulaires

Organismes procaryotes
Bacteries vertes sulfureuses Bactries vertes non sulfureuses Bacteries pourpres sulfureuses Bactries pourpres non sulfureuses

Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Planche 37

Les myctes
noyau noyau

Organismes eucaryotes (rgne des fungi) porteurs de spores la nutrition se fait par absorption dpourvus de chlorophylle reproduction sexue ou asexue.

Hyphes coenocytiques

Hyphes septs

Myctes unicellulaires : levure : reproduction asexue par bourgeonnement ou sexue par sporulation. Pas de flagelles. moisissure : filaments longs, fins et ramifis structure cellulaire appels hyphes qui forment un myclium

septum Pore unique Pores multiples

Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Planche 38

Reproduction asexue des myctes

Les modes de reproduction division en deux cellules filles par constriction centrale et formation dune nouvelle paroi cellulaire. bourgeonnement des cellules vgtatives production de spores par une mitose suivie dune division cellulaire

Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Planche 39

Reproduction asexue des myctes

Scission formant une nouvelle paroi Arthroconidies

Chlamidospores terminales

Fragmentation des hyphes

Chlamidospores dans un hyphe Sporangiospores Conidiospores Blastospores

Sporangiophore
Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Conidiophore

Cellule mre vgtative

Planche 40

Reproduction sexue des myctes

Passage des cellules ltat haplode par la miose Union de noyaux compatibles par association de gamtes fongiques sur le
mme mycelium Croisement entre des mycliums diffrents mais compatibles sexuellement. Selon les espces la fusion sexue peut se produire 1 entre des gamtes haplodes 2 entre des corps producteurs de gamtes appels gamtanges 3 des hyphes. Parfois production de spores (le zygote se transforme parfois en une zygospore, une ascospore ou une basidiospore)

Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Planche 41

Cycle biologique des myctes

Le stade haplode : utilis pour produire des spores et aider la dissmination de lespce Le stade diplode : utilis pour produire des spores qui aident la survie dans des conditions adverses

zygote Fusion nuclaire

Stade dicaryote (n+n)

Stade diplode (2n)

miose

Fusion cytoplasmique

Stade haplode (n)

Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Planche 42

La levure Saccharomyces cerevisiae

cultive par l'homme depuis plus de 9000 ans pour fabriquer le vin (en Asie Mineure), plus de 6000 ans pour fermenter la bire ( Babylone) plus de 2000 ans pour faire le pain (en Egypte).

* XIX

sicle Pasteur l'a utilise pour montrer que les processus de fermentations sont dus des microorganismes

* En 1897, Buchner a montr que des extraits acellulaires de levure

pouvaient convertir le glucose en thanol et CO2

* La levure a t introduite pour des tudes de gntique

au cours des annes 1930
Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Planche 43

Levures et bactries

Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Planche 44

Cellule de levure

Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Planche 45

Cellule de levure

Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Planche 46

Cellule de levure: microscopie lectronique

Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Planche 47

Les cycles de la levure

Diplode Fusion haplode Diplode avec un jeu de chromosomes dsorganiss

haplode

Migration le long des fibres du fuseau vers le bourgeon

Nouvelle mitose Paroi

Assemblage des chromosomes (cellule quadriplode) Environnement favorable : cellules sexue (a ou alpha) peuvent se reproduire par mitose

Dbut de la division miotique : copie du jeu de chromosomes Migration des chromosomes aux extrmits
Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

4 cellules haplodes dans une mme coque spare par dpaisses parois Division des jeux de chromosomes
Planche 48

Les cycles de la levure

Le diplode commence bourgeonner Cellule nouveau diplode Cytoplasme et noyau convergent

Extension des cellules lune vers lautre

Cellule a scrte un hormone laquelle la cellule alpha rpond Cellule a rpond une hormone scrte par alpha. a alpha

Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Planche 49

Cycle de vie de Saccharomyces cerevisiae

Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Planche 50

Division cellulaire: mitose

Migration du noyau Formation du fuseau

Rplication dADN

Sgrgation des chromosomes: division nuclaire

Emergence du bourgeon cytodirse Point de dpart croissance

Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Planche 51

Cycle biologique de Rhizopus stolonifer

Microbiologie, Prescott-Harley-Klein, DeBoek University

Biologie cellulaire des microorganismes/Chapitre 3

Planche 52