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UNIVERSIDAD NACIONAL PEDRO RUIZ GALLO LAMBAYEQUE

FACULTAD DE CIENCIAS BIOLGICAS Anlisis e interpretacin del manual de Bergey


CURSO DOCENTE ALUMNO CODIGO CICLO : : : : : BACTERIOLOGIA OLGA FRANCIA ARANA ROJAS SOSA ALEXANDER B. 071586-I 2011 -I

Lambayeque, setiembre de 2011

Anlisis e interpretacin del Manual de Bacteriologa Determinativa de Bergey


I.-INTRODUCCIN
El Manual de Bergey es un tratado que se ocupa de la identificacin y clasificacin de las bacterias. Su reconocimiento y prestigio mundial lo han convertido en la referencia y consulta obligada de todos los microbilogos interesados en taxonoma e identificacin. El Manual de bacteriologa determinativa de Bergey es una salida de las ltimas ediciones (novena edicin) en el que procuraron combinar la informacin sistemtica y determinativa: y tiene una distribucin generalmente inadecuada ya que esta basada en el anlisis fenotpico. La informacin sistemtica continuar siendo encontrada en el Manual de bacteriologa sistemtica de Bergey, con la porcin de manual determinativo como referencia a la ayuda en la identificacin de bacterias desconocidas. El arreglo del libro en su ltima edicin es terminantemente fenotpico, que no trata de ofrecer una clasificacin natural exacta; mas bien el arreglo elegido es de carcter utilitario y se usa para ayudar en la identificacin de bacterias. Las bacterias se dividen en 35 grupos, que son comparables en parte en la octava edicin y los secciona en los volmenes sistemticos. Esta divisin no significa que van a ser filas taxonmicas formales, sino que son una continuacin a estos grupos de la tradicin de dividir las bacterias en grupos fenotpicos fcilmente reconocidos. El libro fue compilado abstrayendo la informacin fenotpica contenida en los cuatro volmenes de la primera edicin del Manual de bacteriologa sistemtica de Bergey. El material introductorio hace referencia a la identificacin y a los grupos que fueron agregados. La ltima dcada ha considerado una explosin en la descripcin de nuevos taxa de bacterias.

II.-DAVID HENDRICKS BERGEY (1860-1937)


Bergey naci en la ciudad de Shippack, Pensilvania, el 27 de diciembre de 1860. Sus padres eran granjeros. Compatibiliz los trabajos en la granja con los estudios. Comenz medicina en la consulta del mdico local Samuel Wolfe. Fue despus a la Universidad de Pensilvania donde se gradu en 1884. Por entonces los hallazgos de Pasteur y Koch irrumpieron con fuerza en los crculos mdicos. Uno de los profesores, Henry Formad, estuvo en dos ocasiones en el laboratorio de Koch. Bergey recibi formacin en bacteriologa de este profesor. Bergey ejerci la medicina durante diez aos en North Wales, Pensilvania, antes de regresar a la Universidad en 1893 para proseguir sus estudios y ocupar despus una plaza de becario de higiene en el recin inaugurado laboratorio de higiene y bacteriologa. En 1895 fue ayudante de qumica y un ao ms tarde primer ayudante. Imparta clases de bacteriologa e higiene y en 1926 fue nombrado profesor de estas disciplinas. Se dedic tanto a la enseanza como a la investigacin. Entre sus publicaciones destacan sus Principles of Hygiene (1901), que alcanz siete ediciones y, sobre todo, el Manual of

Determinative Bacteriology (1923), que se convirti en obra de referencia hasta hoy. Comenz a redactarla cuando fue presidente de la Society of American Bacteriologists y emprendi la tarea de revisar las viejas clasificaciones para crear otras totalmente renovadas. Pidi que un comit colaborara con l en la redaccin. La obra se public con los auspicios de la propia Sociedad y, a travs de sus cuatro ediciones sucesivas, fue recibiendo el reconocimiento de la comunidad cientfica. Bergey manifest su deseo de que los beneficios obtenidos se dedicaran a la investigacin bacteriolgica. Como la propuesta no funcion en el seno de la Sociedad, le fueron entregados los derechos, con los que nombr unos administradores que garantizaran la elaboracin de sucesivas ediciones del libro. Este texto ha llegado a ser imprescindible para la identificacin y clasificacin en microbiologa. En el primer nmero apareci un interesante artculo titulado Pedagogics of Bacteriology. Para el segundo Bergey prepar otro titulado Early Instructors in Bacteriology in the United States. Despus de su jubilacin sigui interesado en el desarrollo de productos biolgicos como la toxina antitetnica y fue director de investigacin biolgica de la National Drug Company de Filadelfia, hasta el da de su muerte (falleci en Filadelfia en 1937).

Dr. David Hendricks Bergey (1860-1937)

III.-HISTORIA DEL MANUAL DETERMINATIVO DE BERGEY


La primera edicin del Manual de bacteriologa determinativa de Bergey fue iniciada por la accin de la sociedad de Bacterilogos americanos (ahora llamado la sociedad americana para la microbiologa) por la cita de un comit de redaccin que lo integraban David H. Bergey, presidente, Francis C. Harrison, Roberto S., Bernard W., y M. Franco Huntoon. Este tablero, bajo auspicios de la sociedad de Bacterilogos americanos que, entonces como ahora, public el diario de la bacteriologa como servicio a la ciencia, trada la primera edicin del manual en la impresin en 1923. El tablero, con algunos cambios en calidad de miembro y el Dr. David

Bergey como presidente, public una segunda edicin del manual en 1925 y una tercera edicin en 1930. En 1934, durante la preparacin de la cuarta edicin, el Dr. Bergey solicit que la sociedad de Bacterilogos americanos haga disponible los derechos pagados al tesorero de la sociedad de la venta de las ediciones anteriores para pagar el costo de preparar la cuarta edicin para la publicacin. La sociedad hizo tal disposicin, pero el uso indebido de la maquinaria fiscal de la sociedad incomod a la sociedad y al comit de redaccin. Posteriormente, fue convenido por la sociedad y el Dr. Bergey que la sociedad transferira al Dr. Bergey todo de las sus derechos, ttulo, e inters en el manual y que el Dr. Bergey, alternadamente, creara una confianza educativa a la cual todas los derechos seran transferidos. El Dr. Bergey era entonces el dueo nominal del manual y l ejecut un contrato de confianza que sealaba el 2 de enero de 1936 David H. Bergey, la casta de Roberto S., y E.G.D. Murray como los administradores iniciales, y transfirindolos a los administradores y a sus sucesores la propiedad del manual, de su copyright, y del derecho de recibir la renta que se presentaba de su publicacin. Los administradores han publicado, sucesivamente, el cuarto, el quinto, el sexto, el sptimo, y las octavas ediciones del manual (1934, 1939, 1948, 1957, y 1974, respectivamente). En 1977 la publicaron una versin abreviada de la octava edicin, esto contuvo la clasificacin del contorno de las bacterias, las descripciones de todos los gneros y taxa ms altos, todas las llaves y tablas para la diagnosis de la especie, todas las ilustraciones, y dos de los captulos introductorios; sin embargo, no contuvo las descripciones detalladas de la especie, la mayor parte de los comentarios taxonmicos, la taxonoma de nombres, y referencias a los autores.

IV.- EDICIONES DEL MANUAL DE BERGEY


Manual de bacteriologia determinativa de Bergey

La primera edicin en 1923 La segunda edicin en 1925 La tercera edicin en 1930 La cuarta edicin en 1934 La quinta edicin 1939 La sexta edicin 1948 La sptima edicin 1957 La octava edicin 1974 Novena edicin 1994

V.- CONTENIDO DEL MANUAL DETERMINATIVO DE BERGEY (9 EDICIN- 1994)


Capitulo I: Introduccin y uso del Manual
Aunque la novena edicin del manual determinativo de Bergey contiene mucha informacin derivada de los cuatro volmenes del manual sistemtico de Bergey no debera ser considerada una versin resumida de ste ltimo. En cambio, trata especficamente de un aspecto de Taxonoma bacteriana como lo es la identificacin de las bacterias. Este libro ha sido diseado especialmente para aquellas personas que estn comprometidas inicialmente en la identificacin de las bacterias, y a las cuales no concierne la clasificacin (ordenacin de microorganismos en taxones). Adems, ha sido actualizado con vistas a los diversos cambios de nomenclatura y nuevos taxones que han sido descritos desde que los volmenes del manual sistemtico de Bergey fueron publicados. Aunque este libro contiene muchos datos necesarios para la identificacin bacteriana, no contiene la abundancia de informacin descriptiva sobre gneros y especies que proporciona el Manual sistemtico de bacteriologa de Bergey. Por ejemplo, no contiene informacin detallada de las especies, ni informacin concerniente a la clasificacin o nomenclatura de las bacterias, o mtodos para el enriquecimiento o aislamiento de diversas especies. Adems, no incluye esquemas de identificacin para ciertos grupos de gneros o especies porque alguno de ellos requiere mtodos muy sofisticados para el cultivo y/o identificacin. (Ej. Las rickettsias) o carecen de suficientes caractersticas diferenciales (Ej. especies de Bacillus). Cmo usar el manual determinativo de Bergey? Asumiremos que cuando se tenga una bacteria aislada y se deseara identificarlo se tomar en cuenta: 1) Saber la naturaleza de los esquemas de identificacin bacteriana, es decir conocer los principios generales usados en identificacin bacteriana que se encuentran en el captulo II de este libro. 2) Tener la certeza de que el microorganismo (bacteria) aislado se tratase de un organismo procariota y no de un organismos eucariota. El captulo III proporciona una tabla de caractersticas que diferencian procariotas de eucariotas. 3) Conocer la categora al que pertenece el microorrganismo. De forma prctica, las bacterias pueden dividirse en cuatro grandes categoras: I. Eubacterias Gram-negativas que tienen pared celular II. Eubacterias Gram-positivas que tienen pared celular III. Eubacterias carentes de pared celular IV. Arqueobacterias El captulo IV proporciona caractersticas que permiten la diferenciacin de estas cuatro categoras. 4) Cual es el grupo al que pertenece la bacteria aislada? Tras la correcta asignacin de la bacteria a su categora, se puede determinar en que grupo se puede encuadrar la bacteria

Por medio de un listado de los grupos que existen en cada una de las cuatro categoras y una breve descripcin de los tipos de bacterias contenidos en cada grupo. 5) Conocer las caractersticas que pueden ser usadas para diferenciar los gneros dentro del grupo La mayora de los grupos descritos en el Manual proporcionan una o ms tablas o claves indicando las caractersticas que pueden ser usadas para diferenciar los gneros dentro del grupo. 6) Saber la diferenciacin de las especies contenidas en los gneros. Capitulo II: La naturaleza de los esquemas de clasificacin bacterianos Los esquemas de identificacin no son los esquemas de clasificacin, aunque pueda existir una cierta similitud. Un esquema de identificacin para un grupo de microorganismos ser establecido solo despus de que el grupo haya sido clasificado inicialmente (es decir, siendo reconocido como diferente de otros microorganismos); est basado en uno o ms caracteres o sobre un patrn de caracteres que todos los miembros del grupo tienen y que otros grupos no tienen. Los caracteres usados no son generalmente aquellos que se utilizan en la clasificacin del grupo; por ejemplo, la clasificacin puede estar basada en un estudio de hibridacin del DNA/DNA, mientras que la identificacin puede basarse sobre caracteres fenotpicos que se correlacionan bien con la informacin gentica. En general, los caracteres escogidos para un procedimiento de identificacin deben ser fcilmente determinables, mientras que aquellos que son usados para la clasificacin pueden ser bastante difciles de determinar (tales como los valores de homologa del DNA). Los caracteres estudiados deberan ser tambin pocos en cantidad, mientras que la clasificacin puede involucrar un gran nmero de caractersticas, tal y como sucede en el estudio de la taxonoma numrica. Estas particularidades ideales de un sistema de identificacin no siempre pueden ser posibles, particularmente con gneros o especies que no son susceptibles de ser caracterizados por los tradicionales test bioqumicos o fisiolgicos. En tales casos, puede ser necesario acudir a procedimientos relativamente complicados para conseguir una identificacin correcta procedimientos tales como la electroforesis de protenas celulares en gel de poliacrilamida (PAGE), la composicin lipdica celular o la hibridacin de cidos nucleicos. Las reacciones serolgicas, que generalmente tienen un valor limitado en la clasificacin, a menudo tienen enorme valor para la identificacin. Los test de aglutinacin en porta, las tcnicas de anticuerpos fluorescentes, y otros mtodos serolgicos, pueden ser realizados sencilla y rpidamente y generalmente suelen ser muy especficos; por esta razn ofrecen los medios necesarios para la identificacin presuntiva y rpida de las bacterias. Su especificidad no es del 100%, y es necesaria la confirmacin de la identificacin por test bioqumicos o fisiolgicos adicionales. Capitulo III: procariota o eucariota? Las bacterias al ser procariotas cuentan con estas principales caracteristicas: 1. Su material gentico (DNA) no est rodeado de una membrana. 2. Carecen de organelos membranosos. 3. Su DNA no est asociado a protenas de la clase de las histonas 4. Sus paredes celulares contienen casi siempre pptidoglucano, un polisacrido complejo. 5. Suelen dividirse por fisin binaria. En este proceso se copia el DNA y la clula se divide en dos.

Capitulo IV: Las cuatro mayores categoras. Eubacterias Gram-negativas que tienen pared celular Eubacterias Gram-positivas que tienen pared celular Eubacterias carentes de pared celular Arqueobacterias

Capitulo V: Grupos dentro de las cuatro categoras mayores de las bacterias. Capitulo VI: Glosario de algunos trminos usados en el capitulo II y IV

VI.- RESUMEN DEL MANUAL DETERMINATIVO DE BERGEY


Categoria I Eubacterias Gram-negativas que tienen pared celular. (Grupos 1-16)
1. Grupo Espiroquetas 2. Grupo Bacterias Gram-negativas aerbicas o microaerofilas, mviles, helicoidales o Vibrioide.

3. Grupo Bacterias Gram-negativas curvadas de mviles raramente mviles


4. Grupo Cocos y bacilos Gram-negativos aerbicos o microaerofilos 5. Grupo Bacilos Gram-negativos anaerobicos facultativos

6. Grupo Bacilo. Gram-negativos, anaerobicos, rectos, curvados y helicoidales


7. Grupo Bactrias desasimiladoras de azufre o reductoras de sulfatos 8. Grupo Cocos anaerobicos Gram-negativos 9. Grupo Riekettsias y Chlamydias 10. Grupo Bacterias fotosintticas anoxignicas 11. Grupo Bacterias fotosintticas oxignicas (cianobacterias)

12. Grupo Bacterias quimiolitotrficas aerbicas y microorganismos relacionados 13. Grupo Bacterias con apndice y/o que geman (yemas) 14. Grupo Bacterias con vaina
15. Grupo Bacterias deslizantes no fotosintticas, no frutescentes 16. Grupo Bacterias deslizantes frutescentes: Myxobacteriales

Categora II Eubacterias Gram-positivas que tienen pared celular. (Grupos 17-29)


17. Grupo Cocos Gram-positivos

18. Grupo Cocos y bacilos Gram-positivos formadores de esporas 19. Grupo Bacilos Gram-positivos no formadores de esporas con morfologa regular
20. Grupo Bacilos Gram-positivos no formadores de esporas con morfologa irregular 21. Grupo Mycobacterias 22. Grupo Actinomycetos nocardioformes

23. Grupo Gneros con esporangio multilocular 24. Grupo Actinoplanetos


25. Grupo Streptomycetos y gneros relacionados 26. Grupo Maduromycetos

27. Grupo Thermomonospora y gneros relacionados 28. Grupo Thermoactinomycetos . 29. Grupo Otros Gneros Categoria III Eubacterias carentes de pared celular. Mycoplasmas o Mollicutes (Grupo 30)
30.- Grupo Mycoplasmas

Categoria IV Archaeobacteria (Grupos 31-35)


31. Grupo Metangenos 32.- Grupo Archaeal reductoras de sulfato 33 - Grupo (Halobacteria) Archaeobacteria extremadamente halofilicas 34 - Grupo Archaeobacteria sin pared celular 35 - Grupo Metabolizadoras de sulfuto extremadamente termofilicas e hpertemfilicas

VII.- CUADRO COMPARATIVO DE LAS LTIMAS EDICIONES DEL MANUAL DE BACTERIOLOGA DETERMINATIVA DE BERGEY
8va Edicin Dividida en 4 volmenes y 33 secciones. La seccin 4 no incluye a los microaerfilos. La seccin 12 abarca los Cocos Gram positivos. Toma en cuenta las caractersticas de la pared celular, su composicin, lo cual le permite diferenciar entre las eubacterias y las arqueobacterias. En la seccin 13 se encuentras los bacilos y Cocos Gram. positivos. En la seccin 19 se encuentran las bacterias fototrficas oxignicas. En la seccin 20 se encuentran las bacterias quimiolitotroficas aerobias. En la seccin 18 se encuentran las bacterias fototrficas anoxignicas En la seccin 16 se encuentran las mixobacterias y en la seccin 24 las bacterias fructificantes. 9na Edicin Dividido en 35 secciones: El grupo 4 incluye a los microaerfilos. El grupo 12 se encuentran las bacterias quimiolitotrficas aerbicas Compuesto por 35 grupos las cuales se hayan asociados fenotpicamente con caracteres fcilmente reconocibles. En el grupo 18 se encuentran los bacilos y Cocos Gram. positivos, formadores de esporas. En el grupo 11 se encuentran las bacterias fototrficas oxignicas. En el grupo 10 se encuentran las bacterias fototrficas anoxignicas. Incluidos en el grupo 16 como bacterias fructificantes: Myxobacteria.

Anlisis e interpretacin del Manual de Bacteriologa Sistemtica de Bergey


I. INTRODUCCIN
EL Manual sistemtico de bacteriologa es un trabajo ms detallado que contiene descripciones de todas las especies procariotas actualmente identificadas; y mientras el objetivo principal de manual determinativo es la identificacin de las bacterias, el manual sistemtico de Bergey est orientado hacia la clasificacin de las especies bacterianas este manual contiene en abundancia la informacin descriptiva sobre gneros y especies adems, contiene informacin detallada concerniente a su esquema de identificacin para ciertos grupos de gneros o especies por que alguno de ello requiere de mtodos muy sofisticados para su cultivo y clasificacin ( ejm, las Rickettsias ) o carecen de suficientes caractersticas diferenciales (ejm, especies de bacillus) LA PRIMERA EDICIN SISTEMTICA DE BERGEY DEL MANUAL DE BACTERIOLOGA

En 1984, se pblico la primera edicin del manual sistemtico bacteriolgico de Bergey, esta publicacin constaba de 4 volmenes que se fueron publicando en 5 aos siguientes.

La primera edicin del manual era principalmente fentico es decir toma en cuenta caractersticas tanto genotpicas para su clasificacin adems los taxones no son homlogos desde un punto de vista filogentico. El primer volumen del manual publicado en 1984 que titulaba bacterias Gramnegativas de importancia mdica y comercial el cual inclua las espiroquetas, espirilos, bacilos Gramnegativos aerobios y aerobios facultativos, anaerobios obligados Gramnegativos, cocos Gramnegativos aerobios y anaerobios bacterias reductoras de sulfato y azufre, (Rickettsias, Chlamidias y Micoplasmas). El segundo volumen fue publicado en 1986 bajo el titulo Bacterias Grampositivas de importancia mdica y comercial, incluye cocos Grampositivas , bacilos Grampositivos formadores y no formadores de esporas (Micrococcus y Corynebacterium). En el volumen 3 publicado en 1989 bacterias Gramnegativas restantes bacterias deslizantes fototrficas cubiertas formadores de yemas y apendiculadaz (cianobacterias, bacterias litotrficas, arqueobacterias). En el volumen 4 publicado en el mismo ao contiene a los actinomicetos: filamentosas y bacterias relacionadas.

En este manual todas las bacterias se agrupan a un solo reino el Procariotae en el cual se van a reconocer cuatro divisiones. Gracilicutes (Procariotas con pared celular Gramnegativas) Firmicutes (Procariotas con pared celular Grampositivas) Tenericutes (Procariotas sin pared) Mendosicutes (Procariotas filogenticamente anteriores a las divisiones mencionadas ejemplo: Arqueobacterias y otras) Esta primera edicin del manual se distribuye en 33 secciones los cuales contienen caractersticas fciles de determinar. Los ttulos que aparecen en el manual expresan nombres informales de bacterias incluidas en ellas y adems describe algunas propiedades de ellas. La organizacin sistemtica de los grupos de bacterias esta dado de acuerdo a varias caractersticas: Tincin Gram El porcentaje de G-C Temperaturas de crecimiento Habilidades para formar endosporas estables al calor Aceptores de electrones en la recepcin Habilidad fotosinttica Movilidad Habilidad para usar carbono o nitrgeno Requerimientos nutritivos especiales De todas estas caractersticas la ms importante es la tincin Gram., ya que desempea un papel importante en la clasificacin fentica y determina el volumen del manual en el que aparecer una especie dada por lo tanto sirve como primera edicin del manual. Sin embargo estas caractersticas a los que confiere mayor peso la primera edicin del manual, no son importantes desde el punto de vista filogentico; ejemplo:

Las bacterias fotosintticas se encuentran en diversos grupos filogenticos con bacterias


no fotosintticas estrechamente relacionadas.

Por lo tanto puede no ser apropiado separar a las bacterias que realizan fotosntesis de los que no realizan fotosntesis tal y como esta en la primera edicin.

Los micoplasmas se han situado en una divisin independiente: Mollicutes, en la


primera edicin del manual. Sin embargo el estudio del ARN muestran que se encuentran estrechamente relacionados con las bacterias Grampositivas.

Aunque carecen de pared celular Chlamidia es agrupada con las Rickettsias en la


seccin 9 que parece estar relacionada con el gnero Planctomicetos que se encuentra en un grupo independiente. LA SEGUNDA EDICIN BACTERIOLGICO DE BERGEY. DEL MANUAL SISTEMTICO

Fue tras la publicacin del primer manual de Bergey en el ao de 1984 que el campo de la taxonoma experimento un gran progreso, el nmero de especies bacterianos nombradas se ha duplicado y hay ms de 170 nuevos gneros descritos, en particular la secuenciacin del RNA y del DNA y de las protenas ha hecho posible el anlisis filogentico de las bacterias en la segunda edicin en vez de fentica y por consiguiente muy diferente de la primera edicin. La segunda edicin ha sido publicada en 5 volmenes contiene mayor informacin ecolgica acerca de los taxones individuales. Tambin esta segunda edicin no agrupa todas las bacterias de importancia clnica como lo haca la primera edicin, en cambio las especies patognicas se situarn filogenticamente y por consiguiente dispersas en cinco volmenes, a continuacin se resume la cobertura de los 5 volmenes: Volumen I (2001): Archaea, Cianobacterias. Prottrofos verdes y gneros muy ramificados Volumen II (2001): Proteobacterias Volumen III (2002): Grampositivas con bajo contenido en G+C Volumen IV (2002): Grampositivas con alto contenido en G+C Volumen V (2003): planctomicetos, espiroquetas. Fibrobracter, Bacteroides y Fusobacterias. El volumen 5 tambin contiene una seccin que realiza las descripciones y las estructuraciones filogenticos que se hayan revisado desde la publicacin del volumen I. Los 5 volmenes de la segunda edicin tienen una organizacin diferente a la de la primera. El principal cambio en la organizacin de los volmenes guarda relacin con las bacterias Gramnegativas. La primera edicin ubica todas las bacterias Gramnegativas en 2 volmenes. El volumen 1 contiene bacterias Gramnegativas de importancia general mdica e industrial; el volumen 3 que describe las Arqueobacterias , las cianobacterias y los restantes grupos de bacterias Gramnegativas en 3 volmenes y reserva el volumen 2 para las Proteobacterias. Las 2 ediciones tratan de forma similar a las bacterias Grampositivas, aunque el volumen 2 de la primera edicin contiene algunas bacterias con alto contenido G + C. El volumen 4 tanto de la primera como el de la segunda edicin son muy similares aunque el nuevo volumen tiene informacin de cobertura ms amplia como era de esperarse. Por ejemplo Micrococcus y Corynebacterium se encuentra en el volumen 2 de la primera edicin y constituirn el volumen 4 de la segunda edicin.

RESUMEN DEL MANUAL DE BACTERIOLOGIA SISTEMTICA DE BERGEY (2da Edicin-2001)

VOLUMEN 1. ARCHAEA, CIANOBACTERIAS, FOTTROFOS Y GNEROS MUY RAMIFICADOS. Archaea Seccin I: Thermoprotei, sulfolobi y basfilos Seccin II: Metangenos Seccin III: Halobacterias Seccin IV: Termoplasma Seccin V: Ternococos Gneros Muy Ramificados Bacterias (Eubacterias) Seccin VI: Aquifex y afines Seccin VII: Thermotogas y Geotogas Aquifex., Hydrogenobacter Thermotogae, Geotoga, Thermodesulfabacterium Deinococcus Thermus, Magnetobacterium Chrysiogenes Chloroflexus, Hepertosiphon Thermomicrobium Nitrospira, Thermodesulfovibrio Gneros representativos Thermoproteus. Sulfolobus Methanobacterium Halobacterium, Halococcus Termoplasma, Picrophilus Archaeoglobus, Thermococcus

Seccin VIII: Deinococos Seccin IX: Thermus y gneros relacionados Seccin X: Crisiogenos Seccin XI: Cloroflexos y Herpetosifones Seccin XII: Termomicrobios Seccin XIII: Nitrospira y gneros relacionados. Seccin XIV: Deferribacter y Gneros Defferribacter, Flexistipes, Synergistes relacionados. Seccin XV: Las Cianobacterias Chamaesiphon, Chroococcus Seccin XVI: Clorobios y otros fottrofos Chlorobium, Heliobacterium anxignicos verdes VOLUMEN 2. LAS PROTEOBACTERIAS Seccin XVII: Las Proteobacterias Seccin XVIII: Las - Proteobacterias Seccin XIX: Las - Proteobacterias Seccin XX: Las Proteobacterias Seccin XXI: Las - Proteobacterias Rhodospira,Rickettsia, Bartonella, Nitrococcus Neisseria, Nitrosomonas,Methylobacillus Nitrosococcus, Thiobacterium, Aeromonas Desulfococcus, Geobacter, Myxococcus Arcobacter, Campylobacter, Helicobacter

VOLUMEN 3. BACTERIAS GRAM POSITIVAS CON BAJO G + C Seccin XXII: Las Clostridia y gneros Clostridium, Sarcina, Heliobacillus relacionados Seccin XXIII: Los molicutes Mycoplasma, Mesoplasma, Anaeroplasma

Seccin XXIV: Los bacilos y lactobacilos

Halobacillus, Lactococcus, Listeria

VOLUMEN 4. BACTERIA GRAM POSITIVAS CON ALTO G + C Seccin XXV: Las actinobacterias Rubrobacter, Actinomyces, Nocardia

VOLUMEN 5. LOS PLANCTOMICETOS, LOS EPIROQUETES, LAS FIBROBACTERIAS, LOS BACTEROIDES Y LAS FLAVOBACTERIAS Seccin XXVI: Los planctomicetos y clamidias Seccin XXVII: Los espiroquetes Seccin XXVIII: Las fibrobacterias Seccin XXIX: Los bacteroides Seccin XXX: Las flavobacterias Seccin XXXI: Las esfingobacterias Seccin XXXII: Los fusiformes Seccin XXXIII: Gnero Verrucomicrobium y gneros relacionados Gemmata, Isosphaera, Chlamydia Borrelia, Spirochaeta, Leptospira Fibrobacter, Holophaga Megamonas, Acetothermus Flavobacterium, Myroides, Polaribacter Sphingobacterium, Cytophaga, Toxothrix Fusobacterium, Streptobacillus,Cetobacterium Verrucomicrobium, Prosthecobacter

DESCRIPCIN GENERAL DE LA FILOGENIA Y DIVERSIDAD BACTERIANA La segunda edicin del manual de Bergey esta distribuida en 35 secciones de los cuales solo algunos mencionaremos, las que tiene mayor relevancia para nuestro trabajo. En esta descripcin recurdese que los organismos se pueden situar en uno de los tres dominios o imperios as pues nos ocuparemos exclusivamente de los dominios Procariotas: Archeae y Eubacteria o bacteria. El volumen 1: contiene una amplia diversidad de bacterias en dos dominios: Archaea y Eubacteria, Archaea diferente de Eubacteria en muchos aspectos. En la actualidad se dividen en dos reinos en funcin de sus secuencias de rRNA: el reino Crenarchaeota contiene organismos termfilos e hipertermfilos que metaboliza el azufre de los rdenes Thermoproteales y Sulfolobales. No obstante recientemente se han descubierto muchas otras Crenarchaeota. Algunas son inhibidas por el azufre, otras crecen en ocanos a bajas temperaturas. Se trata de un reino claramente mas variado de lo que se pens en el principio; el segundo reino, Euryarchaeota contiene principalmente bacterias metangenas y halofilas: a este reino pertenecen tambin organismos termofilos reductores del azufre (termoplasma y termococos). Los dos reinos se encuentran divididos en tres clases y diez ordenes y se describen en las cinco primeras secciones: Thermoproteus, Sulfolobus y barfilos, los metangenos, las halobacterias, los termoplasmas, y los termococos. Las eubacterias son un conjunto extraordinariamente variado de procariotas con ms de una docena de grupos diferentes segn el anlisis del rRNA. En el volumen 1 se ubican los grupos de eubacterias y las cianobacterias. Se describen en las secciones VI a XIV.

1. Seccin VI: Aquifex y afines. El reino Aquificae contiene bacterias auttrofos como
Aquifex e Hidrogenobacter capaces de utilizar el hidrogeno para producir energa. Aquifex que significa fabricante de agua, produce agua utilizando el hidrogeno para reducir el oxigeno. Este grupo contiene algunos de los organismos ms termfilos conocidos y es la rama ms profunda o precoz de las bacterias.

2. Seccin VII: Thermotogas y Geotogas. Esta seccin se compone de dos clases y siete
gneros, Thermotoga y otros miembros de clase Thermotogae son bacterias anaerobias

Gramnegativas termfilas y fermentadoras que tiene cidos grasos poco comunes y que se asemejan a Aquifex en relacin con sus lpidos con enlaces eter.

3. Seccin VIII: Los Deinos. El reino Deinococci contiene bacterias que son
extraordinariamente resistentes a la radiacin. El gnero Deinococcus es grampositivo mientras que Deinobacter es a menudo Gramnegativo. Tiene elevadas concentraciones de pigmentos. Carotenoides que pueden protegerlo de la radiacin y lpidos exclusivos.

4. Seccin XI: Chloroflexi y Herpetosinphon. El reino Chloroflexi se compone de una


clase y 2 ordenes. Muchos miembros de este grupo Gramnegativas se denominan bacterias verdes no del azufre. Chloflexus lleva acabo la fotosntesis anoxignica y es una bacteria deslizante: en cambio Herpetosiphon es una bacteria no respiratoria deslizante. Ambos gneros contienen peptidoglucanos poco comunes y carecen de lipopolisacridos en sus membranas externas.

5. Seccin XIII: Prochloron y Cianobacterias. Las bacterias fotosintticas oxignicas se


ubican en el reino Cyanobacteria, que contiene la clase Prochlorophyta y 6 ordenes. El orden 1 Prochlorate se compone de gnero Prochloron y afines. Las cianobacterias se ubican en las otras cinco rdenes (Chroococcales, Pleurocapsales, Oscillatoriales, Nostocales y Stigonematales). Las cianobacterias tiene clorofilas a y b. y carecen de ficobilinas. Estas bacterias pueden ser unicelulares o filamentosas ramificadas o no, las cianobacterias incorporan CO2 fotosintticamente mediante el uso del ciclo de Calvin, como las plantas y muchas bacterias fotosintticas prpuras.

6. Seccin XIV: Chlorobia. El reino clorobia contiene bacterias fotosintticas


anoxignicas conocidas como bacterias verdes del azufre, incorporan CO 2 a travs del ciclo reductor de los cidos tricarboxilicos en vez de utilizar el ciclo de Calvin y oxidan el sulfuro a grnulos de azufre, que se acumula fuera de la clula. El volumen 2: de la segunda edicin esta dedicado en su totalidad a las proteobacterias Gramnegativas a menudo denominadas bacterias prpuras. El reino Proteobacteria es un grupo extenso y extremadamente complejo que en la actualidad contiene ms de 1300 especies en 332 gneros. Auque todos estn relacionados, el grupo es bastante variado en cuanto a morfologa, fisiologa y estilo de vida. Todos los tipos nutricionales principalmente estn representados: Fototrofia, heterotrofa y quimiotrofa de diversas variedades. Muchas especies importantes para la medicina, la industria y la investigacin biolgica son proteobacterias. Son ejemplos evidentes los gneros Escherichia, Neisseria, Pseudomonas, Rhizobium, Reckettsia, Salmonella y Vibrio. El reino est dividido en cinco grupos en funcin del los datos del rRNA y cada uno se describe en una seccin diferente del manual de Bergey debido a que las bacterias fotosintticas se encuentran en los grupos , , y , de las proteobacterias muchos consideran que todo el grupo se origino de un antecesor comn. Probablemente muchas cepas perdieron la fotosntesis al adaptarse metabolitamente a nuevos nichos ecolgicos. 1. Seccin XVII: -Proteobacterias. La subdivisin de las -proteobacterias incluye la mayora de las formas oligotrofas (formas capaces de crecer con niveles bajos de nutrientes). Rhodospirillum y otras bacterias prpuras no del azufre son fotosintticas. Algunos tcnicos se caracterizan por modos metablicos poco frecuentes: metilotrofa (ejemplo Methilobacterium), quimiotrofa (Nitrobacter) y fijacin del nitrgeno (Rhizobium), Rickettsia y Bricella son patgenos importantes. Aproximadamente la mitad de los microorganismos de este grupo presenta una morfologa caracterstica, como por ejemplo prostecas (Cautobacter, Hyphomicrobium)

2. Seccin XVIII: -Proteobacterias. Este grupo se superpone metablicamente con la


sub divisin. Sin embargo las -Proteobacterias tienden a utilizar sustancias que procedan de la descomposicin orgnica en la regin anaerbica de los hbitats. Algunos de estas bacterias utilizan sustancias tales como hidrgeno (Alcaligenes), amoniaco (Nitrosomas), metano (Methybacillus) o cidos grasos voltiles (Burkhoideria)

3. Seccin XIX: -Proteobacterias. Esta subdivisin se compone de 1 grupo grande y

complejo de 13 ordenes y 19 familias. A menudo son quimioorganotrfos, anaerobios facultativos y fermentadores, sin embargo existe una diversidad considerable entre las proteobacterias en relacin con el metabolismo energtico. Algunas familias importantes como Enterobacteriaceae, Vibroneceae y Pasteurellaceae utilizan la va de Embden Meyerbhof y la va de la pentosa fosfato. Otras familias como Pseudomonadaceae y Azotobacteriaceae son aerobias y utilizan las vas de Entner-Doudorof y de las pentosas fosfato. Algunas son fotosintticas (ejemplo; Chromatium y Ectothiordospira) metilotrofas (Methylococcus) u oxidantes del azufre (Beggiatoa).

4. Seccin XX: -Proteobacterias. Las -Protobacterias contiene 1 clase, 2 ordenes y

10 familias, muchas de estas bacterias puede situarse en uno de tres grupos. Algunas se nutren de otras bacterias, como implica el nombre de su clase (Bdellovidrio). El orden Myxococcales contiene mixobacterias formadoras de cuerpo fructferos como Myxococcus, Stigmatella y Pyangium. Las micobacterias a menudo se nutren tambin de otras bacterias. Finalmente esta seccin contiene diversos aerobios que genera sulfuro a partir del sulfato y el azufre, mientran oxidan nutrientes orgnicos (Desulfovibrio)

5. Seccin XXI: -Proteobacterias. Esta seccin se compone de solo 1 clase


Campylobacteres, 1 orden y 2 familias. A pesar de su pequeo tamao, dos importantes gneros pertenecen a esta subdivisin: Campylobacter y Helicobacter).

El volumen 3: contiene a las bacterias Grampositivas con DNA de bajo contenido de G + C. La lnea divisoria es aproximadamente el 50% de G + C, las bacterias con un % mol inferior a este valor se encuentra en el volumen 3 no obstante debido a su estrecha relacin con las bacterias Grampositivas de bajo contenido G + C los micoplasmas se ubica aqu a pesar de que carecen de paredes bacterianas y la tincin de Gram es negativa. Existe una variacin considerable en la morfologa: algunos son bacilos, otros son cocos y los micoplasmas son pleomrficos. Pueden existir endosporas. El volumen contiene 3 secciones:

1.

Seccin XXII: Clostidrios y afines. Esta seccin contiene una clase Clostidrio, 2 ordenes y 8 familias. Aunque son de morfologa y de tamao variable, los miembros tienden a ser anaerobios. Los gneros tales como Clostidrium, Desulfotomaculum y Sporohalobacter formas esporas bacterianas verdaderas, muchos otros gneros no lo hacen. Clostidrium tiene ms de 120 especies y es uno de los gneros bacterianos ms extensos.

2.

Seccin XXIII: Mollicutes. La clase Mollicutes contiene, 1 orden y 3 familias. Estas bacterias carecen de pared celular y no son capaces de sintetizar peptidoglucano ni sus precursores. Debido a que los micoplasmas estn limitados por la membrana plasmtica son: pleomrficos y su forma vara, desde cocos a formas helicoidales o a filamentos ramificados, normalmente son inmviles y Gramnegativos debido a la ausencia de pared celular. A diferencia de prcticamente todas las dems bacterias, la mayora requiere esteroles para su crecimiento. Los gneros Mycoplasma y Spiroplasma contiene varios patgenos importantes para las plantas y los animales.

3.

Seccin XXIV: Bacilos y Lactobacilos. Esta amplia seccin se compone de una gran variedad de bacilos y cocos Grampositivos, aerobios o anaerobios facultativos. La clase Bacillus consta de dos rdenes Bacillales y Lactobacillales, y de 15 familias. Al igual que los miembros de la seccin XXII, algunos gneros; ejemplo; Bacillus, Sporosarcina, Paenibacillus y Sporolactobacillus) forman endosporas verdaderas. Esta seccin contiene numerosos gneros importantes para la medicina y la industria: Bacillus, Lactobacillus Streptococcus, Lactococcus, Enterococcus, Listeria y Staphylococcus.

El volumen 4: est dedicado a los Grampositivos en alto contenido de G + C bacterias con un % mol por encima de 50 55%. Existe una diversidad morfolgica enorme entre estos procariotas. Algunos son cocos otros son bacilos regulares o irregulares. Los Grampositivos con alto contenido de G + C denominados actinomicetos forman hifas de ramificacin compleja. Aunque ninguna de estas bacterias producen endosporas verdaderas, muchos gneros forman diversas esporas asexuales y algunas tiene ciclos vitales complejos.

Existe una variacin considerable desde el punto de vista qumico en las paredes celulares de los grampositivos con alto contenido G + C. Ejemplo; la composicin de peptidoglucano vara notablemente. Las micobacterias producen cidos miclicos de gran tamao que distinguen sus paredes celulares de las de otras bacterias. La taxonoma de estas bacterias es muy compleja y bastante diferente de la recogida en la primera edicin. Hay una clase. Actinobacterias, 5 subclases, 6 ordenes, 9 subrdenes y 35 familias. Los gneros como Actinomicetes, Arthrobacter, Corynebacterium, Micrococcus, Mycobacterium y Propionibacterium se ubican anteriormente en el volumen 2 junto con la bacteria grampositivas distintas de los actinomicetos. Ahora se encuentra en el nuevo volumen 4 dentro de los subrdenes Actinomicineae, Micrococcineae y Corynebacterineae, por que los estudios de rRNA han demostrado que estn relacionados con los actomicetos. Este volumen tambin contiene gneros a menudo clasificados como actinomicetos nocardiformes (Nocardia, Rhodococcus) y diversos grupos de actinomicetos como los actinoplanos y los estreptomicetos. Aunque muchos gneros siguen siendo familiares, las categoras taxonmicas de mayor tamao han sido extremadamente revisado. Como anteriormente el gnero de mayor tamao y ms complejo es Streptomyces que contiene ms de 500 especies.

El volumen 5: describe una variedad de grupos filogenticos muy ramificados que se ubica aqu por motivos de conveniencia: los reinos Plactomycetes, espiroquetas, Fibrobacter, Bacteroides y fusobacteria. La inclusin de estos grupos en el volumen 5 no implica que estn directamente relacionados. Aunque son todas bacterias Gramnegativas, existe una variabilidad considerable en morfologa fisiologa y patrn de ciclo vital. Diversos gneros son de importancia biolgica y mdica. Este volumen consta de siete secciones:

1. Seccin XXVI: Planctomicetos, Clamidias y afines. Los planctomicetos estn


relacionados con las clamidias y ambos son bastante diferentes de otras bacterias, segn sus consecuencias de rRNA. Se agrupan juntos en el reino Planctomycetes, pero se incluye en ordenes independientes. Planctomycetales y Clamidiales. Los planctomicetos son clulas cocoides muy ovoides o con forma de pera que carecen de peptidoglucano. Aunque normalmente son unicelulares el gnero Isosphaera forma cadenas. Se dividen por gemacin y pueden producir apndices no prostecados denominados tallos. Muchos se

desplazan mediante flagelos o por deslizamiento. El gnero Chamydia, orden Chamydiales, parece ser bastante diferente, mientras que los planctomicetos se multiplican en habitats acuticos, Chamydia es un parsito unicelular obligado con un ciclo vital nico que consta de dos fases bien diferenciadas: los cuerpos elementales y los cuerpos reticulados. Estas bacterias se asemejan a los planctomicetos en que carecen de peptidoglucano. Son organismos cocoides de pequeo tamao desprovisto de apndices. Las clamidias son importantes patgenos que causan numerosas enfermedades en el ser humano.

2. Seccin XXVII: Espiroquetas. El reino Spirochetes Contiene bacterias gramnegativas


mviles de forma helicoidal que se caracteriza por una morfologa y un mecanismo de motilidad nicos. El lmite exterior de esos organismos consiste en una membrana externa especial que rodea el cilindro protoplsmico que contiene el citoplasma y el nucleoide. Los flagelos periplsmicos se localizan entre el cilindro protoplsmico y la membrana externa. Los flagelos rotan y mueven la clula a pesar de que no establecen contacto directo con el medio externo. Estos quimiohetertrofos pueden ser de vida libre, simbiticos o parsitos. Por ejemplo los gneros Treponema y Borrelia contienen diversos patgenos importantes para el ser humano. El reino tiene una clase Spirocheates 3 familias y 13 gneros.

3. Seccin XXXI: Esfingobacterias, Flexibacterias y Cythopaga. Esta seccin es una de


las tres dedicadas al reino Bacteroide. Este reino tiene tres divisiones Bacteroides y Shingobacteria, que tiene una clase, 1 orden y 3 familias gneros Flexibacter y Cytophaga se ubica en la familia Flexibacteriaceae. XI.- CUADRO COMPARATIVO ENTRE LA PRIMERA Y SEGUNDA EDICIN DEL MANUAL SISTEMTICO DE BERGEY Primera edicin Proporciona una clasificacin principalmente fenotpica y muchos taxones contenidos en este no son homogneos desde el punto de vista filogentico. Se basa principalmente en la tcnica de tincin Gram Consta de 4 volmenes Todas las bacterias se agrupan en un solo reino el Procariota con sus cuatro divisiones: Gracilicutes, Firmicutes, Tenericutes, Mendosicutes) Las bacterias ms antiguas (arqueobacterias) estn en el volumen III. Los Actinomicetos estn dispersos en el volumen II y IV. Ubica a las bacterias Gramnegativas en 2 volmenes (I y III) Segunda edicin Proporciona una clasificacin filogentico es decir se basa en la genealoga bacteriana. Se basa en el estudio de comparaciones del RNA 16S. Consta de 5 volmenes Las bacterias se agrupan en 2 dominios : Archaea y Eubacteria. Las bacterias ms antiguas estn en el volumen I. Los actinomicetos estn solo en el volumen IV. No agrupa si no distribuye en todo el trabajo a las bacterias de importancia clnica.

REFERENCIAS BIBLIOGRAFICAS

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Prentice Hall, Madrid-Espaa.

Lansing, M.Prescott, (1999) Microbiologa, cuarta edicin, editorial Mc Graw Hill.


Espaa.

Stanier, Roger.1996.Microbiologia.2 ed. editorial Revert. Koneman,E.2002.Diagnostico Microbiologico.2ed

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