Chapitre II : tude de la structure des bactries

I. la morphologie gnrale des bactries ................................................................................ 2 1. taille, forme et arrangement ............................................................................................... 2 2. organisation gnrale de la cellule bactrienne.................................................................. 2 II. lultrastructure bactrienne ............................................................................................... 3 1. la paroi bactrienne ............................................................................................................ 3 2. la membrane plasmique...................................................................................................... 5 3. le cytoplasme...................................................................................................................... 5 4. 5. 6. 7. 8. le gnome bactrien........................................................................................................ 5 les inclusions cytoplasmiques ........................................................................................ 6 les flagelles ..................................................................................................................... 6 les pilis............................................................................................................................ 7 les endospores ................................................................................................................ 7

9. les enveloppes supplmentaires ......................................................................................... 8

Chapitre II : tude de la structure des bactries I. la morphologie gnrale des bactries

1. taille, forme et arrangement Taille La taille moyenne dune bactrie est de 1 6 m de longueur et 1 2 m de diamtre. Les plus petites bactries ont une taille qui se situe entre 100 et 200 nm. Les plus grandes bactries atteignent 500 m de longueur et 7 m de diamtre. Morphologie 3 catgories coques : bactries de forme rondes (petite volumineuse, parfaitement ronde, ovalaire) bacilles : (long, court, fin, pais, extrmit ronde, extrmit carr) coccobacilles

On peut avoir des bactries spirales : spirilles : spirale rigide spirochtes : spirale flexible carr toile en forme de rosette possdant en pdoncule

Certaines bactries changent de formes selon leur ge ou les conditions physico-chimiques : on les appelle bactries polymorphes. Mode de groupement Les coques : seules, par 2, en chanette, ttrade ou amas Les bacilles : seule, chanette

Le mode de groupement va dpendre du plan de division de la bactrie. Le mode de groupement nest pas essentiel la survie de la bactrie. 2. organisation gnrale de la cellule bactrienne Les lments permanents de la cellule bactrienne

Paroi : donne la forme la bactrie. Protge la bactrie contre la pression extrieure. Selon le type de bactrie, la composition change. On distingue les bactries Gram + et le Gram -. Membrane cytoplasmique : structure classique ayant u rle trs important car il nexiste pas de membrane plasmique interne. Cytoplasme : ribosome et des incluions ADN bactrien ou chromosome bactrien : 1 mm de long galement appel nuclode, flotte dans un cytoplasme.

Elments facultatifs de la cellule bactrienne Les flagelles : de 10 20 m de long. Filament fin et flexible. Nexiste que chez les bactries mobiles. Les coques sont toujours immobiles. Les pilis : poils Communs : servent adhrer certaines surfaces Sexuels : permet le transfert dADN dune bactrie mle vers une bactrie femelle. La capsule ou glycocalyx : substance visqueuse synthtise par la bactrie qui sort et entoure la bactrie. Permet ladhrence et protge les bactries contre la phagocytose. Les corps dinclusion Les endospores : lorsque les conditions deviennent dfavorables, certaines bactries peuvent sporuler et devenir trs rsistante II. lultrastructure bactrienne

1. la paroi bactrienne La plupart des bactries possdent une paroi compose de peptidoglycane. Dfinition : Structure rigide qui assure lintgrit de la bactrie et qui la protge des variations de pression osmotiques. La structure de base est le peptidoglycane except pour les archobactries et les bactries halophile (qui aiment le sel). Cette paroi nexiste pas chez certaines bactries : molcules. Structure du peptidoglycane Polymre compos de 2 parties : Glucides N-actylglucosamine N-actylmuramique Peptide

Structure complexe : chane glucidique compose de lalternance de N-actylglucosamine et de N-actylmuramique. Sur chaque N-actylmuramique, il y a fixation de ttrapeptide. Les ttrapeptides de 2 chanes glucidiques adjacentes sont relis par un pont interpeptidique. Ce pont interpeptidique est diffrent chez les Gram + et les Gram-. Chez les Gram +, le pont est compos de 5 glycines alors que chez les Gram cest une liaison directe. Structure de la paroi des bactries Gram+ Chez les bactries Gram+, le peptidoglycane est trs pais. Dans cette paroi on trouve des acides techoques et lipotechoques. Structure de la paroi des bactries Gram Dans cette paroi, on trouve une fine couche de peptidoglycane, priplasme, membrane lipidique du ct externe. La membrane plasmique externe on a : Des lipopolysaccharides localises la surface et compose de 2 parties : Lipide A situ dans la membrane externe Glucide : polysaccharide O. Cet antigne O est utilis pour identifier les bactries et les lipides A es tune toxine. Lors de la mort de la bactrie, il y a dgradation de la membrane externe et libration de lipide A. Ce lipide A, une fois librer, provoque de la fivre, avortement, mort. Ce lipide est une endotoxine. Des protines de transport : servent aux transports des molcules travers la membrane externe Lespace priplasmique : dans lequel on trouve des protines solubles, ainsi que des enzymes de dgradation, enzymes de dtoxification.

La coloration de Gram (1884) Permet de classifier les bactries en 2 groupes : Les bactries violettes : Gram + Les bactries roses : Gram-

Plusieurs tapes : Coloration des bactries Fixation au lugol Dcoloration lalcool : les Gram + rsistent la dcoloration grce la paroi Contre coloration la safranine

La paroi des mycobactries La paroi est diffrente des Gram + et Gram -. On retrouve du peptidoglycane et de lacide mycolique : acide gras trs longue chane qui va former une barrire hydrophobe. La coloration de Gram ne fonctionne pas. Chez les archobactries, la paroi est galement diffrente, le N-actylmuramique est remplac par le NAT.

2. la membrane plasmique La plupart des fonctions sont portes par la membrane plasmique. Composition chimique Chez les bactries, les acides gras qui composent les phospholipides sont plus courts. Pas de prsence de cholestrol qui est remplac par les opanodes. Le taux de protines est de 70% chez les bactries. Fonction Barrire impermable et slective. Rle dans la bionergtique de la cellule. Tout le systme de production de lATP est localis dans la membrane. Le systme photosynthtique des bactries est galement localis dans la membrane plasmique. 3. le cytoplasme Contient principalement des ribosomes ainsi que des protines solubles et des inclusions. La membrane plasmique + cytoplasme = protoplasme.

4. le gnome bactrien LADN est directement dans le cytoplasme. On les appelle galement lADN, nuclode. Taille des gnomes Le gnome est plus important chez les bactries que chez les virus mais plus petit que celui des champignons. Taille moyenne : 3000 4000 kilos de paires de bases La taille de lADN varie selon les bactries. Plus une bactrie est dpendante de son hte, plus son gnome est petit. Topologie du gnome bactrien En gnral, le gnome est circulaire et unique, cependant chez certaines bactries, le gnome est fragment en 2 ou 3 morceaux. On pense que cet ADN est li la membrane plasmique. La rgion ou lADN est li la membrane plasmique sappelle le msosome. Organisation du gnome bactrien 2 types de gnes : gnes de structure gnes de rgulation

Ces gnes sont regroups en une structure appele opron. 5 10% de squence non codante dans le gnome. Le gnome prsente une plasticit importante, il peut tre modifi rapidement grce 3 processus : Conjugaison Transformation Transduction

Dans une mme espce, la variabilit gntique peut atteindre 10 20 %. 5. les inclusions cytoplasmiques Dfinition : Granules pouvant tre dlimit par une membrane et localises dans le cytoplasme. Elles peuvent contenir de la matire organique ou inorganique. Diffrents types dinclusions inclusion contenant du glycogne soit du PHB inclusion contenant des lipides cyanophycine : substance de rserve chromatophore : contenant des pigments magntosomes : bactries aquatiques qui sont anarobies strictes. Ce sont des cristaux qui permettent aux bactries de sorienter grce aux champs magntiques terrestres. Vsicules gazeuses 6. les flagelles Caractristiques gnrales du flagelle Structure trs fine (20nm de diamtre) et trs longue (15 20 m). Invisible au microscope optique mais visible au microscope lectronique. Distribution des flagelles bactries monotriches : bactries possdant quun seul flagelle bactries lophotriches : bactries possdant plusieurs flagelles chaque extrmit bactries amphitriches : bactries possdant 1 seul flagelle chaque extrmit bactries pritriches : toute la surface de la bactrie est recouverte de flagelles

Lultrastructure du flagelle 3 parties : filament : partie la plus longue, tube creux, compos de protines (flagellines)

crochet : lien entre le filament et le corps basal et peut tre anim dun mouvement de rotation. Corps basal

La synthse du flagelle ncessite le fonctionnement de 20 30 gnes. La flagellines et fabrique par les ribosomes et vont sautos assembler pour former le filament. La bactrie ne synthtise le flagelle que si elle a besoin de se dplacer. Le mode de fonctionnement Les flagelles font ente 40 60 tours /s. Permet aux bactries de se dplacer de plusieurs m/s. Les flagelles tournent dan le sens oppos des aiguilles dune montre alors que la bactrie tourne dans le sens des aiguilles dune montre. De temps en temps, les flagelles changent de direction, ce qui permet la bactrie de changer de direction. Le fonctionnement du flagelle ncessite de lnergie. 7. les pilis Les pilis non sexuel Recouvre toute la surface de la bactrie. Diamtre de 3 10 nm et une longueur de quelques m. Permet aux bactries de se fixer certains supports. Les pilis sexuels 1 et 0 par cellule. 9 10 nm de diamtre et plusieurs m de long. Utilis pendant le processus de conjugaison. La bactrie male transfre de lADN la bactrie femelle. 8. les endospores Certaines bactries Gram + sont capables de sporuler lorsque les conditions deviennent dfavorables. Structure dune endospore Structure plus petite quune bactrie. De lextrieur vers lintrieur : lexosporium tunique ou manteau : couche paisse interne externe cortex : trs pais paroi sporale membrane sporale core : gnome + cytoplasme

Trs rsistante aux fortes chaleurs, aux UV la disscation, aux dsinfectants chimiques. Cette rsistance est due une molcule : le dipicolinate de calcium. 7

La phase de sporognse Cette phase dure 10 heures. Plusieurs tapes : formation dun filament axiale membrane plasmique se replie vers lintrieur : invagination et forme un septum formation de diffrentes couches la spore est forme dans la bactrie libration de la spore et les reste est lys

Les diffrents types de spores 3 critres : forme position dformation

Observation des spores au microscope optique Coloration de Gram : les spores apparaissent non colores. Coloration des spores : vert de malachite. Colore la spore avec le vert et le reste en rose La coloration se fait chaud ou a froid

La germination Lorsque les conditions redeviennent favorables, la spore se transforme en cellule vgtative. Dure de la germination : 1h 3 tapes Activation : choc thermique, choc mcanique, choc osmotique Initiation : rhydratation de la spore Libration de la cellule vgtative 2 cycles de vie : Cycle vgtatif Cycle de sporulation et de germination 9. les enveloppes supplmentaires La capsule Couche bien organise dorigine polysaccharidique que lon ne peut pas enlever facilement. Localise dans le milieu extracellulaire. Cette capsule et mise en vidence par une coloration lencre de chine. Les capsules sont trs riches en eau donc vont servir de rserve, protge la bactrie contre la phagocytose.

Le glycocalix Constitu de sucre, prsent dans le milieu extracellulaire mais moins bien organis. Protge les bactries contre la dessiccation, permet aux bactries dadhrer des surfaces et permet de rsister aux antibiotiques.

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