Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Prezentare Teza Scurtat
Prezentare Teza Scurtat
(tez de doctorat)
Conductor de doctorat: Prof. univ. dr. Ioan I. Ardelean
Doctorand: Popoviciu Dan Rzvan
Obiective
Determinarea caracteristicilor microbiotei bentice (abunden, biomas, diversitate morfostructural) din sedimente nisipoase din diferite staii de-a lungul litoralului romnesc. Determinarea relaiei dintre granulaia sedimentelor i caracteristicile microbiotei pe care o gzduiesc. Studierea variaiilor sezoniere n ceea ce privete abundena, biomasa i diversitatea morfo-structural a bacteriilor bentice, n relaie cu anumii factori de mediu (concentraia pigmenilor clorofilieni ca expresie a densitii productorilor primari, temperatura apei). Determinarea numrului estimativ i studierea prin metode de microscopie a unor grupe funcionale microbiene implicate n unele cicluri biogeochimice importante de la nivelul sedimentelor marine. Studiul impactului polurii cu hidrocarburi asupra caracteristicilor cantitative (abunden, biomas) i a diversitii morfo-structurale a microbiotei bentice, prin experimente de tip microcosmos. Evaluarea potenialului de bioremediere al microbiotei bentice n cazul contaminrii cu amestecuri de hidrocarburi sau uleiuri lipidice, prin cuantificarea microorganismelor potenial degradatoare. Determinarea influenei adiiei de nutrieni azotai i fosfai asupra eficienei procesului de bioremediere (mai precis, a ratei diminurii concentraiei hidrocarburilor) prin experimente pe microcosmosuri de laborator.
Materiale i metode Determinarea caracteristicilor microbiotei din sedimente nisipoase de diferite granulaii de pe litoralul romnesc al Mrii Negre
Materiale i metode Determinarea caracteristicilor microbiotei din sedimente nisipoase de diferite granulaii de pe litoralul romnesc al Mrii Negre
Fixare chimic (formalin 4%) Detaarea celulelor: Tween 80 (1 mg/l), omogenizare mecanic (2400 rpm) Colorare cu SYBR Green I (1:10000) i iodur de propidiu (20 mg/L; pentru celule moarte) Filtrare (0,2 m) Cuantificarea i msurarea manual a celulelor (microscopie de epifluorescen) Conversia biovolumului n biomas uscat (Loferer-Krbacher et al., 1998) Granulometria sedimentului: dispozitiv Endecotts Minor, cu site de 1000, 800, 400, 200, 180, 125, 90, 53 m
Materiale i metode Evoluia microbiotei bentice n microcosmosuri cu sedimente marine de diferite granulaii
A
0-200 m
B
200-400 m
C
400-800 m
D
800-1000 m
Sedimente nisipoase uscate (105C) i sortate pe clase de mrime Ap marin Prelevare carote la dou sptmni Analiz prin microscopie de epifluorescen cu SYBR Green I (1:10000)
Materiale i metode Determinarea variaiilor sezoniere ale caracteristicilor microbiotei bentice litorale
Materiale i metode Determinarea variaiilor sezoniere ale caracteristicilor microbiotei bentice litorale
Prelevare lunar de carote de sediment superficial Analiz prin microscopie de epifluorescen cu SYBR Green I (1:10000) i iodur de hexidiu (10 mg/L; pentru bacterii Gram-pozitive) Calcularea densitii celulare i a biomasei uscate
Materiale i metode Determinarea variaiei sezoniere a concentraiei pigmenilor clorofilieni din sediment
Prelevare lunar de carote de sediment superficial (staiile A i C, august 2011-iulie 2012) Stocare la -20C Extracie cu aceton 90%, centrifugare la 3000 rpm Spectrofotometrie Calcularea concentraiei clorofilelor A, B, C pe baza absorbanei la 664, 647, 630 nm, utiliznd ecuaiile tricromatice (Jeffrey & Humphrey, 1975, Mitchell & Kiefer, 1984) Calcularea coeficientului de corelaie Pearson
Materiale i metode Cuantificarea unor grupe fiziologice microbiene din sedimentele litorale
Prelevare de carote de sediment superficial (staiile A i C, aprilie-mai 2012) Inoculare diluii seriale pe medii de cultur specifice Fixatoare de azot aerobe (Hanson & Gundersen, 1976, Zuberer & Silver, 1978, Jones & Betaieb, 1986, Shieh et al., 1988, Tejera et al., 2005, Torpee, 2009) Reacia cu TTC Amonificatoare (Goa et al., 2008) Test cu reactiv Nessler Nitrificatoare (oxidatoare de amoniu; Goa et al., 2008) Test cu reactiv Nessler Denitrificatoare (Britton & Greeson, 1987, Saitoh et al., 2003) Reacia cu albastru de bromtimol Sulfat-reductoare (Chandrika et al., 1990) Coloraie specific Estimarea numrului microorganismelor prin metoda MPN (MPN Calculator)
Rezultate i discuii Caracteristicile microbiotei din sedimente nisipoase de diferite granulaii de pe litoralul romnesc al Mrii Negre
100% 90% 80% 70% 60% >1000 800-1000 400-800 0-400
Proporia diferitelor fracii ale sedimentelor prelevate de-a lungul litoralului (septembrie 2010)
Rezultate i discuii Caracteristicile microbiotei din sedimente nisipoase de diferite granulaii de pe litoralul romnesc al Mrii Negre
12 10
*107 celule/cm3
7
6 5
g/cm3
8 6
4 3 2 1 0
4 2
0 I II III IV Staia V VI VII VIII
II
III
IV
Staia
VI
VII
VIII
Densitatea populaiei microbiene i biomasa microbian uscat pentru fiecare staie (biovolum celular mediu 0,10-0,13 m3)
Rezultate i discuii Caracteristicile microbiotei din sedimente nisipoase de diferite granulaii de pe litoralul romnesc al Mrii Negre
80
70 60 50
60% 50%
40% 30% 20% 10% 0% I II III IV V Staia VI VII VIII
Filamente
Bacili Coci
% 40
30 20 10 0
II
III
IV
Staia
VI
VII
VIII
Proporia procentual a principalelor grupe morfologice bacteriene i proporia procentual a bacteriilor viabile (IP-negative)
Rezultate i discuii Evoluia microbiotei bentice n microcosmosuri cu sedimente marine de diferite granulaii
30 25
*107 celule/cm3
16 14
14 zile
g/cm3
12
10 8
20 15 10
14 zile
28 zile 42 zile
56 zile 70 zile
6
4 2 0
5
0 0-200 m 200-400 m 400-800 m 800-1,000 m
0-200 m
Rezultate i discuii Evoluia microbiotei bentice n microcosmosuri cu sedimente marine de diferite granulaii
14 zile
25
*107 celule/cm3
*107 celule/cm3
28 zile
30 25
*107 celule/cm3
42 zile
30
25 20 15 10 5 0 0 200 400 m 600 800 1000
20
15 10 5
20 15
10
5 0
0
0 200 400 600 800 1000
200
400
m
600
800
1000
56 zile
30
*107 celule/cm3
*107 celule/cm3
70 zile
30 25
20 15 10 5 0
25 20 15 10 5
0
0 200 400 600 800 1000
200
400
m
600
800
1000
14
8 7 6
g/cm3
12
*107 celule/cm3
10 8 6 4 2 0 Apr. Mai Iun. Iul. Aug.Sept. Oct. Nov. Dec. Ian. Feb. Mar.
Staia A Staia B Staia C
5 4 3 2 1 0
Apr. Mai Iun. Iul. Aug.Sept. Oct. Nov. Dec. Ian. Feb. Mar.
Evoluia densitii i biomasei microbiene uscate n fiecare staie (aprilie 2011-martie 2012) Biovolum celular mediu: 0,07-0,14 m3
Bacili Gram-negativi
Coci Gram-negativi
Bacili Gram-pozitivi
Coci Gram-pozitivi
90%
80%
70%
Filamente Gram negative Bacili Gram negativi
Coci Gram negativi
60%
50%
40%
Coci Gram pozitivi
30%
20%
10%
0%
A B Apr. C A B Mai C A B Iun. C A B Iul. C A B Aug. C A B Sept. C A B Oct. C A B Nov. C A B Dec C A B Ian. C A B Feb. C A B Mar C
Proporia procentual a principalelor grupe morfo-structurale bacteriene n fiecare staie (aprilie 2011-martie 2012)
Staia A 0.25
1.4 1.2
Staia C
1
g/cm3
g/cm3
Clorofila A Clorofila B
0.8 0.6
Clorofila C
0.4
0.2
0.05 0
0
Aug.Sept. Oct. Nov. Dec. Ian. Feb. Mar. Apr. Mai Iun.
Aug. Sept. Oct. Nov. Dec. Ian. Feb. Mar. Apr. Mai Iun.
Rezultate i discuii Variaii sezoniere ale caracteristicilor microbiotei bentice litorale Matrice de corelaie Pearson: A = abundena microbian, V cel. = biovolumul celular mediu, B =
biomasa microbian, % coci = procentul bacteriilor sferice, % Gram+ = procentul bacteriilor Gram-pozitive, Chl A/B/C = concentraia clorofilei A/B/C, Total Chl = concentraia total a clorofilelor, Temp. = temperatura apei la recoltare
A V cel. B % coci % Gram+ Chl A Chl B Chl C Total Chl Temp.
1,00
0,25 1,00
V cel.
% coci
% Gram+
1,00
-0,40
-0,49
-0,50
-0,52
-0,84
Chl A
1,00
0,45 1,00
Chl B
Chl C
Total Chl
1,00
0,36
Temp.
1,00
Rezultate i discuii Cuantificarea unor grupe fiziologice microbiene din sedimentele litorale
Numrul estimativ de microorganisme cultivabile ( 103) per cm3 de sediment din fiecare grup fiziologic studiat, n cele dou staii
Grup fiziologic Staia A Staia C
Fixatoare de azot
3,7
11
Amonificatoare
5,3
16
Nitrificatoare
3,7
Denitrificatoare
4,4
8,8
Sulfat-reductoare
3,5
170
Rezultate i discuii Cuantificarea unor grupe fiziologice microbiene din sedimentele litorale
Altele
Coci Gramnegativi
Altele
Bacili Grampozitivi Coci Gramnegativi
Altele
Bacili Gramnegativi
Filamente Grampozitive
Bacili Grampozitivi
Bacili Gramnegativi
Bacili Grampozitivi
Bacili Gramnegativi
Amonificatoare
Altele Coci Bacili GramGramnegativi pozitivi
Bacili Grampozitivi
Nitrificatoare
Bacili Gramnegativi
Coci Grampozitivi
Filamente Grampozitive
Bacili Gramnegativi
Denitrificatoare
Sulfat-reductoare
100%
90% 80% 70% 60% Filamente Gram-negative Coci Gramnegativi Bacili Gramnegativi Filamente Gram-pozitive Coci Grampozitivi Bacili Grampozitivi
100% 90% 80% 70% Filamente Gram-negative Coci Gramnegativi Bacili Gramnegativi Filamente Gram-pozitive Coci Grampozitivi Bacili Grampozitivi
60%
50% 40% 30% 20%
50%
40% 30% 20% 10%
10%
0% 0 zile 2 zile 4 zile 6 zile 8 zile 10 zile12 zile14 zile
Evoluia densitii populaiei microbiene i a proporiei procentuale a grupelor morfostructurale n cele dou microcosmosuri (martor i contaminat)
Ulei de in (1%)
1,7
4,5
9000
8000 7000 6000
ppm
Microcosmos 1 1
M. 1
Microcosmos 2 0,9
M. 2
5000
M. 3 M. 4
M. 5 M. 6
Microcosmos 3
2,6
4000
3000 2000 1000 0 7 zile 14 zile 21 zile 28 zile 35 zile 42 zile 49 zile 56 zile 63 zile
Microcosmos 4
2,1
Microcosmos 5
8,8
Microcosmos 6
11
Evoluia concentraiei hidrocarburilor totale n sedimentele din microcosmosuri i numrul estimativ de microorganisme degradatoare de hidrocarburi ( 103) per cm3 (dup 35 de zile)
Concluzii
Sedimentele nisipoase prelevate din diverse staii de-a lungul litoralului romnesc au prezentat diferite densiti ale populaiei microbiene, toate de ordinul a 107-108 celule/cm3 (valorile extreme ntlnite fiind de 4,32-12,64 107 celule/cm3) Biomasele microbiene din sedimentele studiate au nregistrat valori cuprinse ntre 1,63 i 6,99 g/cm3 Bacteriile baciliforme Gram-negative sunt dominante n sedimentele litorale (38-60%), iar biovolumul mediu celular variaz ntre 0,07 i 0,14 m3. Din totalul celulelor cuantificate, ntre 30 i 42% aveau integritatea membranei celulare afectat (nu erau viabile) Se confirm existena unei relaii negative ntre densitatea microbiotei bentice i granulaia sedimentelor n care se gsesc, fr ca aceast relaie s fie una absolut sau proporional. Granulometria influeneaz i distribuia diferitelor grupe morfo-structurale bacteriene (proporia bacteriilor sferice tinde s creasc odat cu granulaia sedimentului) i procentajul celulelor viabile (mai mare n sedimentele grosiere) n condiiile microcosmosurilor de laborator, colonizarea bacterian a sedimentelor sterile decurge extrem de rapid, ceea ce pare a indica o origine planctonic a majoritii microorganismelor bentice S-a demonstrat existena unor variaii sezoniere ale densitii, biomasei i compoziiei microbiobentosului litoral. Densitatea celular i biomasa au prezentat corelaii pozitive semnificative cu temperatura apei i cu concentraia pigmenilor clorofilieni din sediment (ca indicator al densitii productorilor primari de la acest nivel)
Concluzii
Condiiile de mediu nefavorabile (temperaturi sczute, producii primare sczute, sedimente cu granulaie mai mare) sunt asociate cu o cretere a procentului bacteriilor Gram-pozitive i al cocilor Gram-negativi de talie mic Concentraia pigmenilor clorofilieni este dependent de caracteristicile sedimentului, iar raportul dintre diferitele tipuri de clorofile studiate confirm rolul diatomeelor ca principali productori primari la nivelul sedimentelor litorale Prin metoda MPN s-a reuit izolarea i cuantificarea unor microorganisme implicate n diferite fazel ale ciclului biochimic al azotului din sedimentele litorale: fixatoare de azot aerobe, amonificatoare, nitritbacterii i denitrificatoare, totaliznd sub 0,05% din totalul celor cuantificabile direct. Densitatea relativ sczut a amonificatoarelor indic existena unor surse alternative de amoniu la nivelul sedimentelor. Analiza microscopic a artat c bacteriile fixatoare de azot i cele nitrificatoare cultivabile sunt predominant Gramnegative, n timp ce amonificatoarele i denitrificatoarele sunt mai ales Gram-pozitive Densitatea bacteriilor sulfat-reductoare (predominant Gram-negative) difer mult n funcie de tipul de sediment, atingnd valori foarte ridicate n nisipurile fine i slab oxigenate Dei evident afectat de contaminarea experimental cu hidrocarburi, revenirea relativ rapid a microbiotei bentice, ca i prezena a unor microorganisme capabile s degradeze diferite tipuri de amestecuri de hidrocarburi sau uleiuri lipidice indic un important potenial de bioremediere n cazul acestui tip de poluare
Concluzii
Experimentele de tip microcosmos au artat c, dei adiia de nutrieni azotai i fosfai duce la o cretere a densitii microorganismelor potenial degradatoare de hidrocarburi, aceasta nu se traduce neaprat ntr-o degradare mai rapid a hidrocarburilor, efectul putnd fi chiar advers. De aceea, n cazul biostimulrii trebuie s se in cont i de ali factori, cum ar fi gradul de oxigenare al sedimentelor