DEPARTAMENTO ACADMICO DE CIENCIAS BSICAS

Gua de Seminarios BIOLOGA CELULAR Y MOLECULAR

2012-II

Personal Docente

Bil. Lezama Vigo, Hlmer, MSc. Bil. Nolasco Crdenas, Oscar, MSc. (Coordinador de prcticas) Bil. Murrugarra Bringas, Victoria. (Coordinador de prcticas) Md. Amanzo Lpez, Csar. (Coordinador de seminarios) Md. Mena Navarro, Cecilia. (Coordinador de seminarios) Bil. Quintana Cceda, Milagros, MSc. (Coordinador de tutoras) Md. Lapa Salinas, Yolanda, Mg Bil. Garrido Matta, Diana. MSc. Bil. Ruiz Guevara, Nora. Q.F. Sifuentes Vsquez, Roxana, MSc. Bil. Chauca Caruajulca, Jos. MSc. Bil. Alata Linares, Vicky, Mg Bil. Sandoval Pea, Gustavo. MSc. Bil. La Rosa Loli, Rafael, Mg Q.F. Ramrez Rojas, Luisa Bil. Giovana Vadillo Glvez. Mg Q.F. Barreto Yaya, Danilo Bil. Fujita Alarcn, Ricardo, PhD.

INTRODUCCIN

La gua de seminarios del curso de Biologa Celular y Molecular tiene como objetivo fomentar en el estudiante la lectura cientfica y el razonamiento de casos prcticos y reales relacionados con las bases tericas. Esta gua rene una lista de preguntas relacionadas con cada tema expuesto en la conferencia magistral terica. Dichas preguntas sern resueltas por los alumnos durante cada sesin de seminarios, con la tutora del profesor y valindose de la bibliografa recomendada en el syllabus y sugerida por cada profesor as como de informacin actualizada reunida por el alumno. Al final de cada seminario el alumno debe ser capaz de razonar y resolver cuestionamientos aplicativos similares a los desarrollados en el seminario. La gua se ha dividido en 3 partes de acuerdo a cada evaluacin parcial. La primera parte comprende la clula y componentes celulares. La segunda parte incluye procesos celulares. La tercera parte trata sobre la genmica y las tcnicas moleculares. Se tomar un paso corto al inicio de cada seminario, basado en los temas a tratar ese mismo da. El alumno debe contar con su respectiva bibliografa (libros, artculos cientficos, separatas, etc.) previamente revisada para solucionar cada seminario en forma activa durante la clase. Los alumnos formaran grupos de 4 a 5 personas y deben traer resueltas las preguntas del cuestionario. As mismo, el grupo responsable del tema de la semana debe presentar un resumen del artculo cientfico de revisin y presentarlo en Power Point a sus compaeros de clase. La duracin del seminario es de dos horas acadmicas (45 minutos cada hora).

PAUTAS PARA EL DESARROLLO DE LOS SEMINARIOS

CONCEPTO DE SEMINARIO: El Seminario es una actividad acadmica, que tiene como propsito principal introducir al estudiante de nivel superior en la reflexin y prctica investigativa, al tiempo que contribuye al avance del saber en su rea. El seminario es una actividad de aprendizaje activo y colaborativo, centrada en el trabajo del estudiante. Es una tcnica de capacitacin grupal, en la que participan todos los integrantes y estudian intensivamente un tema en sesiones planificadas recurriendo a fuentes originales de informacin.

OBJETIVOS DEL SEMINARIO: 1. Investigar, analizar y estudiar un tema para sacar conclusiones aprobadas por todos los asistentes. 2. Desarrollar habilidades de bsqueda de informacin, interpretacin y sntesis de la misma. 3. Fomentar el trabajo en grupo. Trabajar en grupo no es realizar varias partes de forma independiente y fusionarlas al final. Es preparar y discutir el esquema, analizar los contenidos, valorar y opinar sobre la literatura revisada e integrar los conceptos obtenidos (todos los miembros del grupo deben conocer todo el tema). 4. Desarrollar la capacidad de comunicacin cientfica, y sustentacin oral de un tema a exponer.

NORMAS PARA LA REALIZACIN DE UN SEMINARIO: 1. Los seminarios son de realizacin obligatoria. 2. El profesor facilitar la realizacin de cada seminario. 3. Los temas sern propuestos por el profesor, en forma de cuestionarios, los cuales se entregarn resuelto como trabajo escrito por el grupo responsable (cuatro cinco alumnos). Se utilizarn fuentes bibliogrficas editadas y electrnicas. 4. Los temas sern asignados a los grupos de alumnos para ser expuestos y presentados durante la sesin. 5. La presentacin y el desarrollo de los cuestionarios fomentar la discusin con la participacin de los alumnos de la seccin.

MECNICA DEL TRABAJO DE SEMINARIO: 1. Duracin del seminario: dos (02) horas acadmicas (45 minutos cada hora).

DISTRIBUCION DEL TIEMPO DURANTE EL SEMINARIO Tiempo Parte del Seminario (minutos) 10 Registro de asistencia (10 minutos de tolerancia). VoBo de Mapas Conceptuales. 10 Paso corto. 50 Desarrollo de cuestionario y discusin. (Aproximadamente cada pregunta se resolver en 10 minutos). 10 Presentacin y discusin de Lecturas. Entrega de Mapas Conceptuales

GUA PARA LA PRESENTACIN DEL INFORME DE SEMINARIO: El grupo responsable del seminario debe presentar un informe que incluya las siguientes partes: Universidad de San Martn de Porres 1. Portada Facultad de Medicina Humana En el encabezado: Universidad de San Martn de Porres Facultad de Medicina Humana En la mitad de la pgina : Ttulo del seminario Ttulo del seminario Semestre / Ao Semestre / Ao Autores del trabajo Bajo el ttulo y a la derecha: Autores del trabajo Grupo de Seminario Nombre del profesor Grupo de Seminario Fecha de entrega Nombre del profesor
Fecha

2. Resolucin del cuestionario en forma ordenada (manuscrita): El cuestionario deber resolverse en forma ordenada clara, concreta, fundamentado lo expuesto y podr hacerse uso de esquemas, figuras cuadros tablas etc. 3. Resumen del artculo (manuscrita): los alumnos deben de redactar un resumen con los puntos ms relevantes del artculo. 4. Comentario y conclusiones. 5. Referencias bibliogrficas: Los libros, artculos de revisin y otros recursos consultados deben ser citados siguiendo el estilo Vancouver: Comit Internacional de Editores de Revistas Mdicas (ICMJE). Requisitos de uniformidad para manuscritos enviados a revistas biomdicas: Ejemplos de referencia. Actualizado el 27 de Julio de 2010. Biblioteca Nacional de Medicina de los EE.UU. (NLM) Institutos nacionales de Salud. Traduccin al espaol del Uniform Requirements for Manuscripts Submitted to Biomedical Journals: Sample References (Last reviewed: 27 July 2010). http://www.medicc.org/mediccreview/documents/requisitos-deuniformidad-para-manuscritos.pdf 4

Los docentes estn en la obligacin de brindar la ayuda necesaria que requieran los alumnos para que el desarrollo de cada una de las actividades del seminario sean resueltas de la mejor manera posible. PRESENTACIN DEL MAPA CONCEPTUAL: 1. El Mapa Conceptual debe ser elaborado de manera manuscrita, en forma individual y se presentar al iniciar cada sesin para el visto bueno (VoBo) del Docente de Seminario. (Durante el paso corto el Docente coloca una firma en el Mapa conceptual elaborado que permitir reconocer que fue realizado previamente). 2. El Mapa Conceptual se elaborar en una hoja de papel bond A4, empleando colores, una buena caligrafa y ortografa. 3. El tema del Mapa Conceptual es el considerado en las preguntas del seminario y la lectura. 4. El Mapa conceptual pre-elaborado podr ser enriquecido a lo largo del seminario, a medida que se realice la discusin de las preguntas. 5. Al finalizar el Seminario se entregaran los Mapas Conceptuales de elaboracin individual. Para saber ms sobre los Mapas conceptuales:
http://bvs.sld.cu/revistas/ems/vol21_3_07/ems11307.html http://scielo.isciii.es/scielo.php?pid=S1575-18132006000200003&script=sci_arttext http://bvs.sld.cu/revistas/aci/vol15_05_07/aci09507.htm

Ejemplos de mapas conceptuales:

CALIFICACIN DE LA PARTICIPACIN ORAL: Un grupo de alumnos presentara el tema de la sesin y dirigir la discusin. Se resolvern las preguntas del cuestionario con la participacin de los asistentes. La intervencin es personal, se responde a la pregunta, se argumenta, se cuestiona, o se corrige, se fomenta una discusin sobre la misma. Se valorar: 1. Presentacin. Claridad y orden. Capacidad de sntesis en la presentacin del tema. (Respecto al tiempo designado). 2. Discusin, claridad, orden, vocabulario. 3. Actitud y motivacin durante el desarrollo del seminario. 4. Puntualidad, consultas realizadas al profesor, integracin del equipo. 5. Conducta durante el desarrollo del seminario.

EVALUACIN DE LOS PASOS CORTOS: 1. Al inicio de cada sesin se tomar una Prueba Escrita de 4 5 preguntas sobre el tema del seminario, la que incluir conceptos de las clases tericas relacionadas al tema. 2. Se calificar con cero (00) al alumno que no est presente, as como tambin se calificar con cero (00), toda prueba escrita no rendida. No se podr recuperar un PASO CORTO no rendido.

CALENDARIO Y TEMAS DE SEMINARIOS Mes Semana 1 2 3 4 5 Setiembre 6 7 8 9 Fecha

MIE-01/MAR-07 MIE-08,LUN-13 MIE-15/MAR-21 MIE-22/MAR-28 MIE-29/MAR-04

MIE-05/MAR-11 MIE-12/MAR-18 MIE-19/VIE-21 LUN-24

10 Octubre

LUN-01/VIE-05

11 12 13 14

MAR-09/VIE-12 LUN-15/VIE-19 LUN-22/VIE-26 LUN-29/VIE-02 LUN-05/VIE-09 LUN-12/VIE-16 LUN-19

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Tema Introduccin y organizacin de grupos. Origen y evolucin de la clula. Fundamentos de la Biologa Molecular. Microorganismos patgenos y beneficiosos. Bacterias, virus y priones Membrana celular. Transporte. Desrdenes generados por defectos en el transporte y la absorcin. Citoesqueleto, matriz extracelular y contactos celulares. Bases moleculares de la contraccin muscular Muerte celular, apoptosis y necrosis. ADN mitocondrial, aplicaciones en medicina forense. Mitocondriopatas EXAMEN PARCIAL Semana de la Medicina. Repaso Grupos de lunes, martes y jueves: ADN mitocondrial, aplicaciones en medicina forense. Mitocondriopatas. Desrdenes en receptores celulares. Hipercolesterolemia Cncer. Oncogenes y protooncogenes. Tcnicas en Biologa Molecular. Aplicacin en medicina Transcripcin y Traduccin; regulacin. Genmica. Terapia gnica. Clulas madre. Repaso Grupos de lunes y jueves: Terapia gnica. Clulas madre EXAMEN FINAL

Noviembre

Agosto

SEMINARIO SEMANA N 1 Introduccin y Organizacin de grupos

SEMINARIO SEMANA N 2

ORIGEN DE LA VIDA, TEORIAS. EVOLUCION BIOLOGICA 1. Qu condiciones atmosfricas presentaba la tierra primitiva y cmo estas condiciones fueron cambiando hasta permitir el surgimiento del primer protobionte? 2. En qu consiste el experimento de Miller y Urey y qu trataron de explicar? 3. Qu principios o razones sustentan la hiptesis del mundo ARN? 4. Qu explica la teora endosimbitica y en qu se sustenta? 5. En qu se fundamenta el Lamarkismo y el Darwinismo y cules son las semejanzas y diferencias entre ambas teoras?

SEMINARIO SEMANA N 3 MICROORGANISMOS PATGENOS Y BENEFICIOSOS. BACTERIAS, VIRUS Y PRIONES

1. Qu tipo de microorganismos sobreviven en condiciones letales para cualquier otro ser vivo?, explicar y dar ejemplos. 2. Mencione las diferencias moleculares entre una bacteria gram positiva y otra gram negativa. 3. Qu son los virus? Cul es su estructura general? Explique el ciclo de crecimiento lisognico y el ltico de los virus 5. Acerca de los priones: a. Qu son los priones y cuntos tipos se conocen? b. Cumplen los priones con el dogma central de la biologa molecular? c. Investigar acerca de una enfermedad producida por los priones en seres humanos.

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SEMINARIO SEMANA N 4 MEMBRANA CELULAR. TRANSPORTE 1. La membrana plasmtica es muy impermeable a todas las molculas cargadas. Explique por qu 2. Las propiedades de la bicapa lipdica estn determinadas por las estructuras de sus molculas lipdicas. Predecir cuales seran las propiedades de la bicapa lipdica si sucediera lo siguiente (cada una en forma independiente): a. Todas las cadenas de cidos grasos fueran saturadas. b. Todas las cadenas de cidos grasos fueran insaturadas. 3. Los rafts contienen gran cantidad de colesterol y esfingolpidos y se piensa que el colesterol juega un rol principal en la formacin de rafts pues aparentemente los rafts no se forman en ausencia del colesterol. Por qu cree que el colesterol es esencial en la formacin de rafts lipdicos?
(SUGERENCIA) Los esfingolpidos (a parte de la esfingomielina) tienen una cabeza muy grande compuesta por varias molculas de azcares.

4. Si un huevo de rana y un glbulo rojo se colocan en agua destilada, el glbulo rojo se hinchar hasta reventar, pero el huevo de rana permanecer intacto. Aunque el huevo es casi un milln de veces el tamao del glbulo rojo, ambos tienen concentraciones idnticas de iones por lo que las fuerzas osmticas trabajando son las mismas. Por qu cree usted que el glbulo rojo se rompe y el huevo no? 5. Los canales de K+ tpicamente transporta iones de K+ ms de 1000 veces mejor que los iones de Na+. Sin embargo ambos iones tiene la misma carga positiva y son casi del mismo tamao (0.133nm para el K+ y 0.095nm para Na+). Describa brevemente cmo un canal de K+ logra discriminar los iones de Na+.

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SEMINARIO SEMANA N 5

DESRDENES GENERADOS POR DEFECTOS EN EL TRANSPORTE Y LA ABSORCIN 1. Qu sucede con las clulas del pulmn (clulas alveolares) de una persona que se ahoga en el mar? 2. Qu sucede a nivel de la bomba sodio-potasio ATPasa en una intoxicacin con monxido de carbono?. 3. Defina que es transcitosis y explique el mecanismo implicado en la secrecin de IgA secretoria en la leche materna. 4. Qu son las uniones GAP?, explique su estructura y funcin. Cmo intervienen en el mecanismo de contraccin del msculo cardiaco?

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SEMINARIO SEMANA N 6

CITOESQUELETO, MATRIZ EXTRACELULAR Y CONTACTOS CELULARES. BASES MOLECULARES DE LA CONTRACCIN MUSCULAR

1. Qu es el colgeno? Explique su estructura y en que tejidos se encuentra. Explique brevemente las bases moleculares de la Osteognesis imperfecta. 2. Explique la estructura de la unidad funcional del msculo esqueltico y los acontecimientos moleculares implicados en la contraccin muscular. 3. Explique las bases moleculares de la diapdesis. 4. Qu son los desmosomas? Cul es su estructura? Explique las bases moleculares del Sndrome Estafiloccico de piel escaldada. 5. Explique detalladamente la estructura y funcin de los cilios y flagelos. Qu sucede a nivel molecular en el Sndrome de kartagener o Sndrome de los cilios inmviles?

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SEMINARIO SEMANA N 7 MUERTE CELULAR. APOPTOSIS Y NECROSIS 1. Defina y explique lo que sucede a nivel molecular en la apoptosis. 2. Defina y explique lo que sucede a nivel molecular en la necrosis. 3. Explique las 2 formas de activacin de la apoptosis. 4. La apoptosis y necrosis son procesos fisiolgicos o patolgicos?. Fundamente su respuesta. 5. En qu consiste la necroptosis?

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SEMINARIO SEMANA N 8

ADN MITOCONDRIAL. APLICACIONES EN MEDICINA FORENSE. MITOCONDRIOPATAS

1. Mencione las diferencias estructurales y funcionales entre la membrana mitocondrial interna y externa. Mencione las caractersticas del ADN mitocondrial que lo diferencian del ADN nuclear y explique cmo se hereda. 2. Mencione las caractersticas comunes de las mitocondriopatas: investigue las bases moleculares de una enfermedad producida por estos defectos. 3. Si existe un dao en las mitocondrias de una persona cul de los siguientes procesos se veran directamente afectados?, explquelos brevemente a cada uno de los procesos afectados: a. Glucolisis. b. Ciclo de krebs. c. Transporte de electrones. d. Fosforilacin oxidativa. e. Fermentacin. 4. La medicina forense y el ADN mitocondrial. Aplicaciones. 5. Explique la fusin y fisin mitocondrial y cmo influyen en la vida y muerte de la clula.

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SEMINARIO SEMANA N 9 EVALUACIN

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SEMINARIO SEMANA N 10

Semana de la Medicina. Repaso

Grupos de lunes, martes y jueves: ADN MITOCONDRIAL. APLICACIONES EN MEDICINA FORENSE. MITOCONDRIOPATAS

6. Mencione las diferencias estructurales y funcionales entre la membrana mitocondrial interna y externa. Mencione las caractersticas del ADN mitocondrial que lo diferencian del ADN nuclear y explique cmo se hereda. 7. Mencione las caractersticas comunes de las mitocondriopatas: investigue las bases moleculares de una enfermedad producida por estos defectos. 8. Si existe un dao en las mitocondrias de una persona cul de los siguientes procesos se veran directamente afectados?, explquelos brevemente a cada uno de los procesos afectados: a. Glucolisis. b. Ciclo de krebs. c. Transporte de electrones. d. Fosforilacin oxidativa. e. Fermentacin. 9. La medicina forense y el ADN mitocondrial. Aplicaciones. 10. Explique la fusin y fisin mitocondrial y cmo influyen en la vida y muerte de la clula.

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SEMINARIO SEMANA N 11

DESRDENES EN RECEPTORES CELULARES. HIPERCOLESTEROLEMIA FAMILIAR

1. Defina y de ejemplos de: primer mensajero, segundo mensajero y transduccin de seal. 2. La Protena G: tipos, estructura y funcin. 3. GMPc (Guanil Monofosfato Cclico) como segundo mensajero y su relacin con el xido ntrico en la dilatacin de los vasos sanguneos. 4. Analice el siguiente grfico y responda: a. Cul es la estructura del receptor LDL? b. Qu eventos ocurren, a nivel de la membrana plasmtica y citoslicamente, en la internalizacin y degradacin del LDL?. c. Qu es la Hipercolesterolemia Familiar y que alteracin a nivel molecular se presenta? d. Qu elementos participan?

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SEMINARIO SEMANA N 12 CNCER. ONCOGENES Y PROTOONCOGENES

1. Mencione las diferencias entre un tumor benigno y uno maligno. 2. Explique las bases moleculares de las siguientes caractersticas de un tumor maligno: invasin, adhesividad celular, angiognesis, metstasis y motilidad celular 3. Defina: proto-oncogen y gen supresor de tumor. Discuta en qu genes, ocurren mutaciones de ganancia de actividad y en qu casos ocurren mutaciones de prdida de funcin, relacionados con el cncer. 4. Mencione 2 oncogenes y 2 genes supresores de tumores y los cnceres a los que se les ha asociado. 5. Explique la estructura y el rol de la telomerasa. Por qu se relaciona el cncer con la actividad de sta?.

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SEMINARIO SEMANA N 13 TCNICAS EN BIOLOGA MOLECULAR, APLICACIN EN MEDICINA

1. Explique la tcnica PCR (Reaccin en cadena de polimerasa). Aplicaciones en medicina. 2. Explique la tcnica de ELISA (Enzyme-Linked Inmuno Sorbent Assay) directo y sus aplicaciones en medicina. 3. Explique la tcnica de ELISA (Enzyme-Linked Inmuno Sorbent Assay) indirecto y sus aplicaciones en medicina. 4. Explique la tcnica de microarrays y sus aplicaciones en medicina. 5. Marcadores celulares: protena verde fluorescente.

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SEMINARIO SEMANA N 14 TRANSCRIPCIN Y TRADUCCIN. GENMICA ESTRUCTURAL Y FUNCIONAL 1. 2. Defina genmica estructural y funcional. El gen que codifica la calcitonina en la tiroides y a la protena relacionada con la calcitonina en el cerebro (CGRP) es el mismo. Cmo es posible que un mismo gen pueda codificar estas 2 protenas diferentes? (emplee el siguiente dibujo para su anlisis)

3.

Una enzima presente en el hgado de rata tiene una cadena polipeptdica de 452 aminocidos y est codificada por un gen de 1896 pares de bases (pb). Interpretar la relacin existente entre el nmero de residuos de aminocidos de la protena y el nmero de pares de bases del gen. La Hb de las clulas falciformes tiene un residuo Val en la posicin 6 de la cadena de globina, en vez de un residuo de Glu encontrado en la Hb A normal Qu cambio se produce en el codn que codifica para el aminocido en cuestin? Mediante que mecanismo se explica que la apolipoprotena B (Apo-B) en el hgado no tenga el mismo tamao que la apolipoprotena B en el intestino. Emplee el siguiente dibujo para evaluar su respuesta.

4.

5.

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SEMINARIO SEMANA N 15 TERAPIA GENICA Y CELULAS MADRE 1. Cules son las 2 caractersticas ms importantes para reconocer una clula madre? Explquelas. 2. Seale las caractersticas de las clulas madre totipotentes, pluripotentes, multipotentes, unipotentes?. Relacione los conceptos sealados con las caractersticas propias de clulas madres embrionarias, fetales y adultas. 3. En la mdula sea existen una gran variedad de clulas madre. Describa las Hematopoyticas, Mesenquimales y VSEL. 4. Qu es un marcador celular? Explicar brevemente la Protena verde fluorescente (GFP). 5. Cules son las diferencias entre: a. Terapia Regenerativa. b. Ingeniera de Tejidos c. Terapia Gnica

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SEMINARIO SEMANA N 16 REPASO

Grupos de lunes y jueves: TERAPIA GENICA Y CELULAS MADRE 1. Cules son las 2 caractersticas ms importantes para reconocer una clula madre? Explquelas. 2. Seale las caractersticas de las clulas madre totipotentes, pluripotentes, multipotentes, unipotentes?. Relacione los conceptos sealados con las caractersticas propias de clulas madres embrionarias, fetales y adultas. 3. En la mdula sea existen una gran variedad de clulas madre. Describa las Hematopoyticas, Mesenquimales y VSEL. 4. Qu es un marcador celular? Explicar brevemente la Protena verde fluorescente (GFP). 5. Cules son las diferencias entre: a. Terapia Regenerativa. b. Ingeniera de Tejidos c. Terapia Gnica

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SEMINARIO SEMANA N 17 EXAMEN FINAL

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