Sunteți pe pagina 1din 8

AMINOACIZI, PEPTIDE, PROTEINE Numele de protein provine de la termenul grec proteos (primul), proteinele fiind biomoleculele cele mai

abundente, reprezentnd circa 50% din greutatea uscat a celulelor, care se gsesc n toate celulele i n toate prile celulei. Apar ntr-o mare varietate de form, ndeplinind funcii biologice importante, fiecare fiind sintetizat specific pentru funcia pe care o va ndeplini. Ele sunt expresia informaiei genetice, fiecare gen din macromolecula de ADN determinnd sinteza unei proteine specifice. Din punct de vedere chimic, toate proteinele, indiferent de complexitatea lor, sunt produi de policondensare neramificai ai celor 20 de aminoacizi frecvent ntlnii n proteine, legai covalent prin legturi peptidice. Din aceste crmizi, diferitele organisme pot forma produi extrem de variai ca enzime, hormoni, anticorpi, proteine transportoare, proteine contractile, antibiotice, toxine etc. Aminoacizi La hidroliza proteinelor n diverse condiii de mediu (n cataliz acid sau bazic, enzimatic) rezult aminoacizi, primele tipuri de metode folosite pentru caracterizarea proteinelor bazndu-se pe studiul produilor de hidroliz. Aminoacizii sunt compuii care prin condensare formeaz peptidele i proteinele, resturile de aminoacizi fiind unite prin legturi peptidice realizate dup eliminarea apei ntre grupele amino i carboxil din structura acestora. Primul aminoacid descoperit n sparanghel a fost asparagina, n 1806, iar ultimul a fost treonina, n 1938. Toi aminoacizii au nume comune, n unele cazuri derivate de la sursa din care au fost prima dat izolai: asparagina din sparanghel (asparagus), acidul glutamic din gluten, glicina de la gustul dulce (glykos, dulce n limba greac), tirozina de la grecescul tyros nsemnnd brnz, de unde a fost izolat etc. Caracteristicile generale ale aminoacizilor a. Aminoacizii din structura proteinelor, denumii aminoacizi proteinogeni, sunt aminoacizi, avnd o grup carboxil i o grup amino legate la acelai atom de carbon, atomul de carbon : R H2N C H

COOH L-aminoacid b. Aminoacizii difer ntre ei prin natura radicalului R, ce poate avea structur, mrime i sarcin electric diferit, influennd solubilitatea aminoacizilor n ap; c. Cei 20 de aminoacizi proteinogeni codificai genetic sunt denumii adesea aminoacizi standard pentru a-i deosebi de aminoacizii mai puin comuni (aminoacizi nonstandard) rezultai prin modificarea unor aminoacizi standard dup sinteza unei proteine, precum i de ali aminoacizi ce se gsesc n organismele vii, dar care nu intr n structura proteinelor, aminoacizii neproteinogeni. Fiecrui aminoacid standard i s-a atribuit o prescurtare de trei litere sau un simbol de o liter utilizate pentru a indica pe scurt secvena aminoacizilor ntr-o protein. d. Pentru toi aminoacizii standard, cu excepia glicinei, atomul de carbon este centru chiral, avnd valenele satisfcute de patru grupe diferite (C-asimetric), ce pot ocupa dou aranjamente spaiale diverse care se comport ca obiectul cu imaginea sa n oglind, formnd doi enantiomeri. Ca toi compuii care au centru chiral i aminoacizii sunt optic activi (rotesc planul luminii polarizate spre stnga levogir sau spre dreapta dextrogir). Unii aminoacizi, (treonina, izoleucina) au dou perechi de enantiomeri pentu doi atomi de carbon asimetrici. e. Aminoacizii proteinogeni din organismele superioare au configuraia absolut L, Daminoacizii fiind ntlnii n unele peptide antibiotice i n peptide de origine bacterian. 1

R H2N C H H

R C NH2

COOH L-aminoacid R HO C H

COOH D-aminoacid R H C OH

COOH COOH L-gliceraldehida D-gliceraldehida Fig.1.1 Relaia de structur a aminoacizilor cu L i D-gliceraldehida Acest tip de convenie, propus de Fischer, face referire la configuraia absolut a celor patru substitueni n jurul atomului de carbon chiral. Aminoacizii sunt repartizai n seria steric D sau L, n funcie de asemnarea lor cu capii celor dou serii, D-gliceraldehida i Lgliceraldehida (Fig.1.1). Este necesar ca la formarea unei proteine cu o structur stabil, repetabil, s participe doar aminoacizii unei singure serii. Celulele au capacitatea de a sintetiza numai aminoacizii din seria L, deoarece enzimele care catalizeaz reaciile de sintez sunt stereospecifice. Clasificarea aminoacizilor Aminoacizii proteinogeni pot fi grupai n cinci clase, n funcie de natura i proprietile radicalului R, mai ales de polaritatea acestuia sau tendina de a interaciona cu apa la pH fiziologic. Polaritatea radicalului variaz n limite largi, de la total nepolar (hidrofob, insolubil n ap) la puternic polarizat (hidrofil, solubil n ap) (Tabel 1.1, Fig. 1.2). Aminoacizii cu radical alifatic nepolar sunt aminoacizi monoaminomonocarboxilici cu radical hidrofob. Radicalii alaninei (acid -aminopropionic), valinei (acid aminoizovalerianic), leucinei (acid -aminoizocaproic) i izoleucinei (acid -amino-metilvalerianic) tind s se aglomereze n structura proteinelor prin interacii hidrofobe. Glicina sau glicocolul (acid -aminoacetic), un alt membru al acestei clase, avnd un radical foarte mic nu are o contribuie semnificativ la interaciunile hidrofobe. Aceast clas mai cuprinde metionina (acid -amino--metiltiobutiric), un tioaminoacid, cu o grup tioeter nepolar. Aminoacizii aromatici, aminoacizi cu radical relativ nepolar, sunt fenilalanina (acid amino--fenilpropionic), tirozina (acid -amino--parahidroxifenilpropionic) i triptofanul (acid -amino--indolilpropionic). Toi pot s participe la interaciunile hidrofobe. Tirozina i triptofanul, datorit grupei hidroxil, respectiv atomului de azot din inelul indolic, sunt mai polari dect fenilalanina. Acetia pot fi clasificai i ca aminoacizi ciclici cu ciclu omogen (fenilalanina i tirozina) sau heterociclici (triptofanul). Aminoacizii cu radical polar nencrcat electric au un radical mult mai hidrofil, deoarece conin grupe funcionale ce formeaz legturi de hidrogen cu apa. Aceast clas include hidroxiaminoacizii serin (acid -amino--hidroxipropionic) i treonin (-amino-hidroxibutiric), tioaminoacidul cistein (-amino--tiopropionic), iminoacidul prolin (acid pirolidon-2-carboxilic), un aminoacid heterociclic, asparagina i glutamina, amidele a doi aminoacizi monoaminodicarboxilici. Grupele hidroxil ale serinei i treoninei, cea sulfhidril a cisteinei i grupele amido ale asparaginei i glutaminei confer polaritatea. Aminoacizii cu radical polar bazic sunt reprezentai de aminoacizii diaminomonocarboxilici care au sarcin pozitiv la pH 7 i sunt mult mai hidrofili. Acetia sunt lisina (acid ,-diaminocaproic), cu o grup amino n poziia a catenei alifatice, arginina (acid -amino-guanidovalerianic), grupa guanido fiind pozitiv i histidina (acid -amino-2

imidazolpropionic), caracterul bazic fiind determinat de imidazol. Are un radical ionizabil cu o pKa aproape de domeniul neutralitii. Aminoacizii cu radical polar acid sunt aminoacizii monoaminodicarboxilici reprezentai de acidul aspartic (acid -aminosuccinic) i acidul glutamic (acid -aminoglutaric), aminoacizi care au o sarcin negativ net la pH 7. Tabel 1. Caracteristici ale aminoacizilor proteinogeni standard
Aminoacid Simbol Mr pK1(COOH) pK2(-NH3+) pKR pI Apariia n proteine % 7,2 7,8 6,6 9,1 5,3 2,3 3,9 3,2 1,4

Aminoacizi cu R alifatic Glicin Alanin Valin Leucin Izoleucin Metionin Aminoacizi cu R aromatic Fenilalanin Tirozin Triptofan Aminoacizi cu R polar(RP) Serin Treonin Cistein Prolin Asparagin Glutamin Aminoacizi cu Rp bazic Lisin Histidin Arginin Aminoacizi cu Rp acid Acid aspartic Acid glutamic

Gly, G Ala, A Val, V Leu, L Ile, I Met, M Phe, F Tyr, Y Trp, W

75 89 117 131 131 149 165 181 204

2,34 2,34 2,32 2,36 2,36 2,28 1,83 2,20 2,38

9,60 9,69 9,62 9,60 9,68 9,21 9,13 9,11 9,39 10,07

5,97 6,01 5,97 5,98 6,02 5,74 5,48 5,66 5,89

Ser, S Thr, T Cys, C Pro, P Asn, N Gln, Q Lys, L His, H Arg, R Asp, D Glu, E

105 119 121 115 132 146 146 155 174 133 147

2,21 2,11 1,96 1,99 2,02 2,17 2,18 1,82 2,17 1,88 2,19

9,15 9,62 10,28 10,96 8,80 9,13 8,95 9,17 9,04 9,.60 9,67

8,18

5,68 5,87 5,07 6,48 5,41 5,65 9,74 7,59 10,76 2,77 3,22

6,8 5,9 1,9 5,2 4,3 4,2 5,9 2,3 5,1 5,3 6,3

10,53 6,00 12,48 3,65 4,25

Proteinele pot s conin i resturi de aminoacizi cu radicali rezultai prin modificarea aminoacizilor dup ncorporarea ntr-o polipeptid. Cei mai importani sunt: aminoacizii abundeni n structura colagenului, 4-hidroxiprolina i 5-hidroxilizina; 3-metilhistidina, 6-N-metillizina din unele proteine musculare (miozina) i din histone, acidul carboxiglutamic din factorii de coagulare i alte proteine capabile s lege calciu (Fig.1.3). n diversele tipuri de celule s-au mai identificat ali 300 aminoacizi adiionali care nu intr n structura proteinelor, dar ndeplinesc funcii biologice importante, denumii aminoacizi neproteinogeni. Mai importani dintre acetia sunt ornitina i citrulina, ce intervin n sinteza argininei i a ureei, acidul -aminobutiric (GABA), important neurotransmitor, penicilamina, constituent al antibioticelor din clasa penicilinelor, homocisteina, homoserina, intermediari metabolici importani, -alanina, aminoacid ce intr n structura carnozinei, a acidului pantotenic din coenzima A i proteina transportoare de grupe acil (Fig.1.4). Ali aminoacizi naturali neproteinogeni din unele plante au efecte toxice (provoac afeciuni hepatice, leziuni musculare, osoase).

CH2 -COOH NH2 glicina CH3 -CH-CH2 -CH-COOH CH 3 leucina CH2 -CH-COOH NH2 NH2

CH 3 -CH-COOH NH2 -alanina

CH3 -CH-CH-COOH CH 3 NH2 valina

CH 3 -CH2 -CH-CH-COOH CH3 -S-CH 2 -CH2 -CH-COOH CH 3NH 2 izoleucina CH2 -CH-COOH NH2 N H NH2 metionina CH2 -CH-COOH NH2

fenilalanina
CH2 -CH-COOH SH NH2 cisteina

triptofan H N CH -COOH CH2 -CH-COOH CH3 -CH-CH-COOH H2 C CH2 OH NH2 OH NH2 CH2
serina treonina prolina

OH tirozina

O=C-CH2 -CH-COOH NH2 NH2 asparagina


H2N-CH2-CH2-CH2-CH2-CH-COOH NH2 lisina

O=C-CH2 -CH2 -CH-COOH NH2 NH2 glutamina


N N H histidina CH2-CH-COOH NH2

H2N-C-NH-(CH2)3-CH-COOH NH arginina NH2

HOOC-CH2 -CH-COOH NH2 acid aspartic

HOOC-CH2 -CH2 -CH-COOH NH2 acid glutamic

Fig. 1.2 Aminoacizi proteinogeni standard


H2N-CH2-CH-CH2-CH2-CH-COOH OH 5-hidroxilizina NH2 H N H2 C H CH -COOH CH2 OH

4-hidroxiprolina CH3-NH-CH2-CH2-CH2-CH2-CH-COOH 6 N-metil lisina NH2 HOOC-CH-CH2-CH-COOH COOH NH2

acid -carboxiglutamic Fig.1.3 Aminoacizi proteinogeni nonstandard

H2N-CH2-CH2-COOH alanina

H2N-CH2-CH2-CH2-CH-COOH ornitina NH2

H2N-C-NH-(CH2)3-CH-COOH O citrulina NH2

H2N-CH2-CH2-CH2-COOH HS-CH2-CH2-CH-COOH acid - aminobutiric

HO-CH2-CH2-CH-COOH NH2 homoserina

NH2 homocisteina Fig.1.4. Aminoacizi neproteinogeni

Aminoacizi eseniali i neeseniali O parte dintre cei 20 aminoacizi nu pot fi sintetizai de ctre toate organismele, ei fiind denumii aminoacizi eseniali. Principalii aminoacizi eseniali sunt valina, leucina, izoleucina, treonina, metionina, lisina, fenilalanina i triptofanul, necesarul acestor aminoacizi fiind furnizat prin alimentaie. Cile prin care se sintetizeaz aceti aminoacizi la bacterii, fungi i plante difer semnificativ. Ali doi aminoacizi, histidina i arginina, sunt considerai semieseniali, organismele tinere trebuind s i ia din alimente. Ceilali aminoacizi sunt neeseniali, organismele prezentnd diverse ci de sintez a acestora. Aminoacizi glucogeni i cetogeni Aminoacizii pot fi clasificai n glucogeni i cetogeni dac scheletul lor de carbon d natere la precursori ai gluconeogenezei (procesul de sintez a glucozei din precursori neglucidici) sau la precursori ai corpilor cetonici. Aminoacizi glucogeni:glicin, alanin, cistein, serin, treonin, tirozin, asparagin, acid aspartic, arginin, glutamin, acid glutamic, histidin, prolin, metionin, valin, fenilalanin, triptofan, izoleucin. Aminoacizi cetogeni: leucina, lizina fenilalanin, triptofan, tirozin, izoleucin; Proprietile fizice i ionice ale aminoacizilor Aminoacizii sunt substane solide, cristaline, incolore, solubilitatea lor n ap fiind variabil. Sunt uor solubili n alcool i insolubili n solveni nepolari (benzen, hexan, eter). Au puncte de topire ridicate (> 200oC) care reflect energia mare necesar scindrii forelor ionice ce stabilizeaz reeaua cristalin. Aminoacizii pot s acioneze att ca acizi, ct i ca baze. Cnd un aminoacid este dizolvat n ap se formeaz un ion dipolar sau amfiion. Acesta poate ceda sau accepta protonul (Fig.1.5).
+

-H R

+ +

H3N-CH-COOH +H

+ H3N-CH-COO R

-H +H

+ +

H2N-CH-COO R

Fig.1.5. Caracterul amfoter al aminoacizilor Aminoacizii au caracter amfoter (sunt amfolii). Pentru fiecare aminoacid exist o valoare a pH-ului (denumit punct izoelectric (pI) sau pH izoelectric) la care aminoacidul nu are sarcin electric net, fiind prezent ca amfiion. La valori de pH mai mici dect pI, aminoacidul este ncrcat pozitiv i se va deplasa n cmp electric spre polul negativ (catod), iar la pH mai mare dect pI va fi negativ, deplasndu-se spre polul pozitiv (anod). Proprietile chimice ale aminoacizilor Aminoacizii pot s prezinte reacii chimice determinate de existena grupelor carboxil i amino, precum i reacii caracteristice diferitelor grupe funcionale coninute (-OH, -SH, radical fenil n fenilalanin, tirozin i triptofan, grupa guanido a argininei, etc). 5

A. Reacii datorate prezenei grupelor COOH. Aminoacizii pot da reaciile prin care se
formeaz derivai ai grupei funcionale (amide, amide substituite, esteri) i amine. Reacia cu amoniacul
R-CH-COOH + NH2 aminoacid NH3 R-CH-C NH2 amid O NH2 + H 2O

Ex. sinteza amidelor acizilor glutamic (glutamina) i aspartic (asparagina). Reacia de decarboxilare
R-CH-COOH NH2 aminoacid R-CH2-NH2 + amin CO 2

n organism prin decarboxilare, catalizat de enzime denumite decarboxilaze, se pot forma amine biogene sau toxice (Tabel 2). Tabel 2 Amine biogene i toxice Aminoacid Amina rezultat la decarboxilare Histidina Histamin (vasodilatator, reacii alergice) Cistein Cisteamin (precursor al taurinei din acizi biliari conjugai) Serin Colamin (precursor al acetilcolinei, lecitinei, sfingomielinei) Acid aspartic -alanin (aa. proteinogen) i -alanin (aa.neproteinogen) Acid glutamic Acid -aminobutiric (GABA) (neurotransmitor inhibitor) Lisin Cadaverin (amin toxic, procese de putrefacie) Ornitin Putrescein (amin toxic, procese de putrefacie, precursor al unor compui cu rol n mpachetarea ADN) B. Reacii datorate grupei NH2. n organism aminoacizii pot da reacii alchilare (introducere de radicali alchil, mai ales metil), acilare, dezaminare, transaminare. Aminoacizii pot forma sruri cu acizii minerali i organici: clorhidrai, sulfai sruri solubile n ap, picrai, fosfowolframai sruri insolubile, folosite la izolare. Reacia de alchilare + CH3I CH3I (CH3)3 -N-CH2 -COOH H2 N-CH2 -COOH CH3 -NH-CH2 -COOH SAM SAM glicocol (in vivo) sarcozin (in vivo) betain SAM = S-adenozilmetionin, donor de grupe metil. Sarcozina i betaina au funcii biologice importante. Reacia de acilare (conjugare) n organism glicocolul poate participa la reacii de conjugare, cu rol n detoxifierea organismului, permind transformarea unor compui puin solubili n forme mai uor eliminabile. H2 N-CH2 -COOH C 6H5 -CO NH-CH2 -COOH + CoASH + C 6H5 -CO ~ SCoA glicocol benzoil CoA acid hipuric Dezaminarea oxidativ n organism dezaminarea oxidativ este catalizat de enzime denumite aminoacid oxidaze. dezaminare oxidativ R-C = O + NH3 R-CH-NH2 COOH COOH cetoacid aminoacid Reacia face legtura ntre metabolismul glucidic i cel proteic. 6

Transaminarea. Prin aceast reacie grupa amino de pe un aminoacid este transferat pe un cetoacid rezultnd cetoacidul corespunztor aminoacidului iniial i un nou aminoacid sub aciunea unor enzime denumite transaminaze.
R1-CH-COOH

+ R2-C-COOH O

transaminaze

R2 C COOH + O

R1-CH-COOH NH2

NH2

Cei mai importani donori de grupe amino sunt acidul aspartic i acidul glutamic, iar acceptori de grupe amino sunt acidul piruvic, acidul -cetoglutaric i acidul oxalilacetic. Transaminaza ALT (GPT, TGP) catalizeaz urmtoarea reacie:
GPT
H3C-CH-COOH

NH2

+ HOOC-CH2 -CH2 -C-COOH O

H3C C COOH + HOOC-CH2 -CH2 -CH-COOH O NH2

ALT = alanin aminotransferaza GPT = glutamat piruvat transaminaza TGP = transaminaza glutamic piruvic Transaminaza AST (GOT, TGO) catalizeaz reacia:
GOT HOOC-CH2-CH-COOH + HOOC-(CH2)2-C-COOH NH2 O HOOC-CH2-C-COOH + HOOC-(CH2)2-CH-COOH O NH2

AST = aspartat aminotransferaza GOT = glutamat oxalilacetat transaminaza TGO = transaminaza glutamic oxalilacetic Repartizarea transaminazelor n esuturi i organe este diferit: ALT= ficat, rinichi, inim, muchi, pancreas, iar AST= inim, ficat, muchi, rinichi, splin. C. Reaciile date de anumite grupe de la nivelul radicalului pot fi reacii de esterificare cu acid fosforic (fosforilare) pentru grupele OH ale serinei, tirozinei i treoninei, reacii de oxidare pentru grupele SH, reacii specifice aminoacizilor aromatici (reacia xantoproteic), reacii de condensare cu diveri compui folosite pentru identificarea aminoacizilor (de ex. reacia cu acid 5, 5-ditiobis-2nitrobenzoic, reactivul Ellman, pentru identificarea cisteinei). Proprietile spectrale ale aminoacizilor Multe detalii despre structura i proprietile aminoacizilor au fost elucidate din determinri spectroscopice. Aminoacizii nu absorb n vizibil, absorb n infrarou, iar fenilalanina, tirozina i triptofanul absorb semnificativ n ultraviolet, cu maxime ntre 250 -280 nm (Fig. 1.6). De asemenea, aminoacizii aromatici produc i o relativ fluorescen.

Fig.1.6. Spectrele de absorbie n UV ale aminoacizilor aromatici (dup Wetlaufer D.B., 1962) 7

Aminoacizii n terapie Multe preparate farmaceutice au n compoziia lor unii aminoacizi prevzui de Farmacopeea Romn drept compui cu aciune trofic i protectoare n concentraii variate. Acidul aspartic este folosit ca protector al parenchimului hepatic i ca amoniacofixator n tratamentul hepatitelor, n coma hepatic, encefalopatia portal, sub forma unor preparate care mai conin i diferite vitamine din complexul B.Mai este utilizat i ca protector miocardic care scade excitabilitatea crescut a inimii i atenueaz senzaia de oboseal sub form de Aspacardin (aspartat de K i Mg). Metionina este folosit, n asociere cu diferite vitamine, ca hepatoprotector cu aciune lipotrop, n tratamentul unor forme de hepatit i a degenerescenei grase a ficatului. Arginina i ornitina, datorit capacitii de fixare a amoniacului, se folosesc cu rol de detoxifiere n protecia hepatic. Glicocolul este trofic muscular i vasodilatator coronarian (soluie injectabil 1%). Corelaii clinice Aminoacidopatii Concentraia aminoacizilor liberi n snge este de 5-8 mg/100 ml i prezint variaii diurne, fiind mai ridicat postprandial. Aminoacizii sanguini sunt filtrai la nivel renal, dar sunt reabsorbii din urina primar prin mecanisme active. Eliminarea urinar a aminoacizilor poart numele de aminoacidurie, putnd fi primar sau secundar, nsoind diferitele aminoacidopatii (tulburri ale metabolismului aminoacizilor i derivailor metabolici ai acestora) (Tabel 3). Aminoaciduriile primare sunt determinate genetic, fiind implicate mutaii ale genelor ce codific diferite enzime implicate n metabolizarea unor aminoacizi sau n reabsorbia renal a acestora. Se vor acumula substraturile proprii ale enzimelor sau unii intermediari metabolici, putnd aprea simptome variate, n funcie de gravitatea afeciunii respective. Diagnosticarea acestor afeciuni se bazeaz pe evidenierea tulburrii metabolice, prin identificarea i dozarea urinar a aminoacizilor sau a intermediarilor rezultai. Tabel 3. Aminoacidurii primare Enzima absent Aminoacizi Aminoacizi excesivi n excesivi n snge urin Hiperfenilalaninemie Fenilhidroxilaz Phe Phe,fenilpiruvat, fenilacetat Tirozinemie Fumarilacetoacetat Tyr, Met Tyr i metabolii hidroxilaz Aminoacidurie Simptome

Retardare mintal Ciroz hepatic, Boli renale Alcaptonurie Homogentizat Acid Acid Artrit, oxidaz homogentizic homogentizic pigmentare Homocistinurie Cistationin HomoCys,Met HomoCys, Met Tulb. vasculare -sintaz osoase, oculare Boala urinii cu miros Cetoacid decarbo- Leu, Val, Ile Leu, Val, Ile i Acidoz, de sirop de arar xilaz pt catene cetoacizii lor vom Maple syrup disease ramificate Aminoaciduriile secundare afecteaz mai muli aminoacizi i pot s apar n cazul unor afeciuni renale sau hepatice, organele respective fiind implicate n metabolismul aminoacizilor, n inaniie.