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Communication Scientique INSA 3BiM


Introduction la recherche documentaire M. Bailly-Bechet, daprs un document de S. Charles
Universit Claude Bernard Lyon 1 Laboratoire de Biomtrie et Biologie Evolutive Bt. Mendel 2me tage, ct rouge

Document disponible : http://pbil.univ-lyon1.fr/members/mbailly

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Que cherche-t-on ?

Premire question se poser Aide xer le cadre de la recherche Notions essentielles :


Profondeur des informations Quantit dinformations Nature de linformation Temporalit de linformation Public envisag Langue employer

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O chercher ?

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Comment chercher ? Avec un moteur de recherche !

Le plus souvent, vous allez employer un moteur de recherche. Google est le plus utilis, mais il en existe dautres, avec certaines spcicits (discrtion, indexage des sites dirent). Bien dnir ses mots-clefs (les penser hors-contexte) Attention au nombre et lordre des mots-clefs Attention la mthode dindexation par le site (Google bomb, mthodes publicitaires. . . )

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Comment chercher ? Sur un site collaboratif ou un forum !


Les exemples les plus connus sont Wikipdia et Yahoo Questions/Rponses. Attention de bien vrier linformation sur ce type de site, notamment les forums. En ce qui concerne linformatique et notamment la programmation, les forums Internet sont la meilleure source dinformations, mme pour des travaux sur des donnes sensibles. Dans les deux cas prcdents, il faut faire attention la temporalit de linformation (les actualits sont exponentiellement sur-reprsentes) et aux problmes de censure (locale sur les sites collaboratifs, parfois nationale ou organisationnelle selon le cadre de la recherche).

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Comment chercher ? Sur une base de donnes ddie !


Il en existe de nombreuses, dpendant des domaines. En particulier, en ce qui concerne les articles scientiques, on trouve : Pubmed Mdecine et biologie MathSciNet Mathmatiques ScienceDirect Gnraliste ArXiV Physique HAL Gnraliste, franais Ces bases de donnes vont donner accs aux rsums des articles, ainsi quaux rfrences ncssaires pour les trouver dans une bibliothque ou sur le site du journal. Elles ne donnent accs aux PDF, en gnral, que pour les utilisateurs autoriss.

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Un document particulier : larticle scientique

crit le plus souvent par un ou plusieurs chercheurs Peut avoir un but de vulgarisation, de rcapitulation ou de description dune nouvelle dcouverte Quasiment toujours en anglais (les revues nationales sont trs dconsidres, sauf dans quelques domaines particuliers) Publi dans un journal scientique (mais les journaux uniquement en ligne se dveloppent grandement)

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Composition dun article


Les principales parties dun article scientique sont : Abstract Le rsum succint de larticle Keywords Les mots-clefs essentiels (thmatiques, mthodes) Material and Methods Une description thoriquement dtaille de tout ce qui est ncessaire pour reproduire les rsultats en question Results Les expriences faites et les rsultats obtenus les faits Discussion Linterprtation de tout ce qui prcde Supplementary Materials Tout ce qui peut tre dintrt sans quil ny ait la place de le mettre dans le corps de larticle
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Parcours dun article scientique


1. La premire version de larticle est crite. Elle est frquemment envoye de manire informelle des collgues, pour avoir leur avis. 2. Larticle est soumis un journal scientique, de manire gnralement exclusive. 3. Un des diteurs du journal rpond si larticle a le niveau scientique requis, et correspond la ligne ditoriale du journal. 4. Lditeur envoie larticle a plusieurs referee. Ce sont dautres chercheurs, anonymes, qui connaissent bien le sujet. Ils doivent donner un avis circonstanci sur larticle. 5. En se basant sur les remarques des referee, lditeur va donner sa dcision concernant larticle : accept, rejet, ou un intermdiaire. 6. Les auteurs apportent les modications ncessaires, et renvoient un version dnitive lditeur. 7. Larticle est format par le journal, puis publi. Dlai total : de quelques mois plusieurs annes. . .

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Comment accder un article scientique ?


Bases de donnes avec reconnaissance IP : en se connectant depuis lINSA ou une BU BD avec reconnaissance par compte (Athens) : en ayant un compte (payant. . . ) En pratique, noubliez pas que cest lIP de la machine depuis laquelle vous avez lanc Internet qui compte, pas celle de la machine sur laquelle vous travaillez. . . Les BU sont couvent un bon point daccs pour les journaux scientiques : http://docinsa.insa-lyon.fr/ http://portaildoc.univ-lyon1.fr/68084453/0/fiche___ pagelibre/&RH=1182169959168

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Organiser sa recherche darticles scientiques


Le plus important est de se faire une ide des auteurs et laboratoires qui travaillent sur le sujet, ainsi que de leurs approches (cela peut prendre du temps. . . ). Commencer par faire une liste des mots-clefs dintrt ; si vous en avez une ide, intgrer galement cette liste les autreurs et les laboratoires travaillant sur le sujet. Un point ne pas oublier est de bien dnir au dpart les limites de ce qui vous intresse vous pourrez toujours trouver des choses nouvelles au cours de votre recherche, mais il vous faut dnir lavance ce qui est essentiel.

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Recherche sur PubMed ou Arxiv

partir des mots-clefs, trouver un ou plusieurs articles de revue sur le sujet. Identier les auteurs. Dans ces revues, et surtout dans leur bibliographie, trouver les articles et les auteurs parlant spciquement des points intressants. Lancer une nouvelle recherche pour obtenir ces articles intressants. Bien noter la temporalit des articles trouvs, pour viter des eets "actualit" ou "vieille bilbiographie".

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Recherche auteur- ou quipe-centre


Les auteurs darticle de revue sont souvent de bonnes pistes pour lancer cette recherche. Une fois une quipe ou un auteur identi comme travaillant spciquement sur le sujet, on peut chercher directement ses publications sur la base de donnes. Il est souvent possible daccder au moins la liste des publications dun auteur en cherchant sur sa page web professionnelle, ou sur le site de son laboratoire. Quand un sujet est abord par plusieurs quipes de manire indpendante, ou dans des domaines connexes, il arrive que les articles ne se citent jamais entre eux : se mer si on obtient un seul "l bilbiographique" sur un sujet.

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Trucs et astuces
Une publication inaccessible sur le site du journal (problme dabonnement) peut tre accessible sur :
un site de pr-publications comme ArxiV google Scholar le site web de lauteur

Si vraiment la publication est inaccessible et semble trs intressante, vrier si les autres publications de lauteur des dates proches ne reprennent pas les rsultats. En fonction de leur laboratoire dappartenance, vos collgues ont peut-tre accs des articles auxuquels vous navez pas accs. . . Sil vous semble que rien ne correspond ce que vous cherchez, vriez votre liste de mots-clefs, et essayez de trouver les bons dans un article assez proche.
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lments importants dune citation

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JabRef et la gestion de ressources bibliographiques


JabRef est une interface graphique de base de donnes BibTeX, le format standard des rfrences bibliographiques de LaTeX. JabRef est indpendant du systme dexploitation Il permet dditer et de grer correctement des rfrences bibliographiques au format BibTex http://sourceforge.net/projects/jabref/ Pour utiliser le logiciel en franais, cest facile : Menu options, sous-menu prfrences, onglet gnral, option langue et choisir franais. Tutorial : http://stephlefevre.free.fr/logiciels/JabRef.php

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Import de donnes bibliographiques

Jabref permet limport de donnes bibliographiques dans un chier .bib prxistant. Vous pouvez ajouter les donnes la main, mais aussi copier-coller directement du texte au format BibTeX, ou encore importer depuis une BD en ligne des rfrences. Lavantage de cette dernire mthode est quelle permet de rcuprer des informations le plus souvent ngliges. Les BD accessibles depuis JabRef sont : Medline (quivalent PubMed), CiteSeer, ArxiV, IEEExplore.

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A Exercice de synthse LTEX

1. Cherchez un article de Paul Sharp (Univ. Nottingham) parlant du virus HIV (le virus du SIDA). 2. Importez la rfrence de cet article dans un chier BibTeX laide de JabRef.
A 3. crivez un court document LTEX dans lequel vous citez cet article.

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