Al7sn12tepa0111 Sequence 04

Squence 4
Lexpression du patrimoine gntique
Sommaire
1. La synthse des protines 2. Phnotypes, gnotypes et environnement Synthse de la squence 4 Exercices de la squence 4 Glossaire des squences 3 et 4
Squence 4 SN12
Cned Acadmie en ligne
La synthse des protines
Introduction Les caractristiques ou le phnotype dun individu sont sous la dpendance dune catgorie de molcules : les protines. Elles sont trs nombreuses et constituent sa bote outils , lui permettant dassurer diffrentes fonctions vitales comme la digestion, la production dnergie, la fabrication de ses constituants Le phnotype dun individu dpend de son gnotype dont lexpression se traduit par la synthse de protines.
Quelques protines et leurs fonctions biologiques :

Protines ADN polymrase, amylase Hmoglobine Ovalbumine Actine, myosine Collagne, kratine Anticorps Oestrognes, insuline Pour sinterroger LADN est le support de linformation gntique, cest--dire de lensemble des gnes (gnotype) qui dterminent les caractristiques (phnotype) dun individu et donc la synthse de protines.
E On
Fonctions Enzymes Protine de transport Protine nutritive Protines contractiles Protines de structure Protines de dfense Protines hormonales
cherche donc comprendre la correspondance entre le message port par lADN (gnotype) et la nature des protines fabriques par un individu (dont dpend son phnotype).
Donnes gnrales sur la nature chimique des protines

Les protines appartiennent la famille des protides qui dsignent des molcules de base : les acides amins et leurs polymres ou polypeptides (enchanement dacides amins).
Squence 4 SN12
Les acides amins

Il existe 20 acides amins diffrents qui ont en commun un groupement fonctionnel acide (COOH) et un groupement fonctionnel amine (NH). Chaque acide amin diffre par un groupement appel radical. Formule gnrale : R (radical variable dun acide amin lautre) (fonction amine) NH2 C H Document 1 Tableau des 20 acides amins
Noms Acide aspartique Acide glutamique Alanine Arginine Asparagine Cystine Glutamine Glycine Histidine Isoleucine Leucine Lysine Mthionine Phnylalanine Proline Srine Thronine Tryptophane Tyrosine Valine Abrviations 3 lettres Asp Glu Ala Arg Asn Cys Gln Gly His Ile Leu Lys Met Phe Pro Ser Thr Trp Tyr Val Abrviations 1 lettre D E A R N C Q G H I L K M F P S T W Y V
COOH (fonction acide)
Squence 4 SN12
Activit 1
Appliquer un modle
La glycine est un acide amin ayant pour formule chimique globale C2H5O2N et lalanine C3H7O2N. Ecrivez leur formule dveloppe en faisant apparatre les groupements fonctionnels. Les acides amins sunissent par des liaisons covalentes appeles liaisons peptidiques. Chaque liaison stablit entre le groupement acide dun acide amin et le groupement amine dun autre acide amin avec perte dune molcule deau. Par additions successives dacides amins, on aboutit une molcule linaire appele polypeptide.
Les polypeptides Activit 2

Comprendre le lien entre les phnomnes naturels et le langage mathmatique.
1 crire toutes les combinaisons possibles de tripeptides (chaines 3
acides amins) en utilisant 3 acides amins diffrents nots A, B et C.
2 En utilisant 3 des 20 acides amins diffrents, combien de tripeptides
peut-on envisager sachant quon peut utiliser plusieurs fois le mme acide amin ? Dfinir alors la notion de squence dun polypeptide.
Les protines:
Ce sont des polypeptides dont le nombre dacides amins est suprieur 20. Certaines protines peuvent tre constitues de plusieurs centaines dacides amins. On imagine donc pour des protines constitues de 100 acides amins limportante diversit de leur squence possible (20100 !)
Activit 3
Caractristiques structurales des protines

Recenser et extraire des informations
Document 2
Dbut de la structure primaire dune protine : la chane de lhmoglobine.
Squence 4 SN12
1 Quentend-on par structure primaire ?
Les acides amins dune squence protique se comportent comme des molcules ionises, charges lectriquement (positivement ou ngativement). Il peut alors stablir des interactions (attractions ou rpulsions) entre diffrents acides amins. Certaines rgions de la squence se replient donnant la protine une configuration spcifique dans lespace. On parle de configuration spatiale ou structure tridimensionnelle de la protine dont dpend sa fonction biologique. Le simple changement dun acide amin peut modifier les interactions entre acides amins et donc la structure tridimensionnelle dune protine. Sa fonction peut alors changer (document3) Document 3 Interactions entre acides amins chargs lectriquement et structure tridimensionnelle dune protine
Moi je suis norme avec un gros cycle Je dteste leau Moi aussi je suis tout petit Moi jai une Pour rpondre ces multiples longue chane contraintes chimiques, physiques, carbonne et lectriques, la protine sadapte au mieux :
Je suis charg ngativement
H bien moi jadore leau Je repousse le 4 mais je suis attir par le 9
Je suis tout petit Je suis aussi charg ngativement
Un acide amin est remplac Je suis charg par un autre et voil le rsultat : positivement
Dautres liaisons chimiques (ponts disulfure) peuvent se former entre acides amins soufrs de plusieurs chaines diffrentes. Il existe donc des protines formes de plusieurs chaines polypeptidiques (document 4). Document 4 Protine forme de deux chaines polypeptidiques
Squence 4 SN12
Lhmoglobine (document 5), protine des hmaties (globules rouges) dont le rle est dassurer le transport des gaz respiratoires dans le sang, est forme de 4 chanes polypeptidiques (2 chanes et 2 chanes ). Elle possde 4 rgions appeles hmes permettant de fixer le dioxygne. Document 5 Structure tridimensionnelle de lhmoglobine
Hme Globine alpha Globine bta
2 Justifier lexpression : lhmoglobine est une protine complexe. retenir Les protines sont des molcules biologiques qui rsultent de la polymrisation dacides amins en une ou plusieurs chanes polypeptidiques. Le nombre, la nature et lordre denchanement des acides amins dfinissent la squence de la protine ou structure primaire. Le repliement dans lespace des chanes polypeptidiques dfinit la structure tridimensionnelle des protines. Des liaisons chimiques peuvent stablir entre diffrents acides amins plus ou moins loigns confrant ainsi la molcule une configuration tridimensionnelle appele structure tertiaire.
La relation entre gne et protine

Cest en 1908 quune relation entre gne et protine fut propose par Archibald Edward Garrod, mdecin britannique. Il tudia une maladie mtabolique hrditaire, lalcaptonurie, rendant les urines des malades noirtres au contact de lair, par oxydation de lacide homogentisique. Il dcouvrit que la maladie tait due un dficit dune enzyme (protine), lacide homogentisique oxydase, qui dgrade lacide homogentisique chez les sujets sains.
Squence 4 SN12
Cette maladie hrditaire fonde ainsi une relation entre la production des protines et linformation gntique.
Activit 4
Un exemple chez un champignon : Neurospora

Recenser et extraire des informations pour formuler une explication ou une hypothse.
Dans les annes 1940, les chercheurs G. Beadle et E. Tatum ont ralis des expriences sur Neurospora, un champignon du groupe des moisissures. Ce champignon peut synthtiser toutes les molcules dont il a besoin, partir des molcules prsentes dans un milieu de culture minimum contenant sels minraux, vitamines, sucres et une source dazote.
Document 6
La voie de biosynthse de larginine chez Neurospora Parmi les substances indispensables Neurospora, on peut citer les acides amins. Neurospora synthtise par exemple son arginine partir dune substance dite molcule prcurseur prleve dans le milieu minimum et qui est transforme selon la chane de ractions suivante : E3 E2 E1
Prcurseur
ornithine
citrulline
arginine
E1, E2 et E3 dsignent les enzymes qui catalysent les diffrentes tapes de la chane de biosynthse. Document 7 Lexprience de Beadle et Tatum Obtention de souches incapables de synthtiser larginine (souches Arg-)
1re tape 2me tape 3me tape
Rayons X
Milieu minimum
Milieu minimum + tous les acides anims Milieu minimum + arginine Irradiation de champignons Neurospora par des rayons X Culture sur milieu total Transfert grce un tampon strile Culture sur milieu slectif
Squence 4 SN12
Beadle et Tatum ont cultiv trois souches de Neurospora Arg (souches A, B et C) sur des milieux diffrents. La souche sauvage correspond au Neurospora dcrit dans lintroduction de lexercice (souche Arg+) capable de synthtiser son arginine.
Type de souche Sauvage A B C + = dveloppement Milieu minimum (MM) + = mort MM + orniMM + citrulline MM + arginine thine + + + + + + + + +
1 Expliquer comment Beadle et Tatum ont obtenu des souches de Neu-
rospora incapables de synthtiser larginine et comment ils ont fait pour reprer ces souches parmi lensemble des souches. Entourez sur le document les colonies correspondant aux souches Arg .
2 Montrer que les phnotypes des souches A, B et C peuvent sexpliquer
chacun par labsence de lune des enzymes de la voie de biosynthse de larginine.

3 Indiquer les arguments qui ont conduit Beadle et Tatum formuler
lhypothse selon laquelle un gne contrle la synthse dune enzyme (donc dune protine). Dans les annes 80, les techniques de transgnse se sont dveloppes. Ainsi par exemple, il est possible disoler partir de lADN humain le gne contrlant la synthse de lhormone de croissance humaine (HGH), situ sur le chromosome 17, et de le multiplier. Les multiples copies du gne sont alors injectes dans des cellules ufs de souris (partie 1 du document 8) et les ufs traits sont ensuite implants dans lutrus de souris femelles mres porteuses. Aprs la naissance, quelques souris (pas plus de 5 %) des souris issues de ces ufs expriment le gne de lHGH. Llectrophorse, technique de laboratoire qui permet de sparer les diffrentes protines prsentes dans un liquide biologique (plasma, lait) (partie 2 du document 8), permet de reprer ces individus.
4 Indiquer lorganisme donneur du gne et lorganisme receveur.
Squence 4 SN12
Technique exprimentale
Le principe de llectrophorse Llectrophorse permet de sparer ou trier molcules en solution en fonction de leur taille et de leur charge lectrique. Le mlange que lon veut trier est soumis un champ lectrique et la vitesse de dplacement dpend de la taille de la molcule. En pratique, un gel dagarose dpos dans une cuve dlectrophorse est creus de puits. Dans ces puits, on dpose le mlange de protines que lon veut analyser.
On soumet lensemble un champ lectrique. Les protines charges ngativement migrent alors vers lanode (+). Les petites protines migrent plus vite que les grosses.
10
Squence 4 SN12
Document 8
Micro injection de gnes de lhormone de croissance dans des ufs de souris 1. Les outils de la transgense directe
Pipette qui maintient lovule
Ovule de souris avec noyau dovocyte et noyau de spermatozode
Seringue avec aiguille trs fine et contenant des gnes intressants dupliqus
La transgense directe en action
Injection des fragments dADN extrieurs
Obtention dun ovule ayant ventuellement intgr le nouveau gne dans son gnome. Il va donner un nouvel individu exprimant ventuellement le nouveau gne.
2. Electrophorse des protines du lait des souris femelles nes de la mre porteuse
Hormone de croissance humaine Lait de souris
.............
Lait de souris
.............
Squence 4 SN12
11
5 Comparer les rsultats des trois lectrophorses ralises afin de d-
terminer laquelle est celle dune souris transgnique et laquelle est celle dune souris normale.
6 Utiliser ces rsultats pour indiquer en quoi la transgnse prouve la
relation un gne une protine .

retenir Les gnes, fragments dADN gouvernent (codent) la synthse des protines, molcules polymres dacides amins responsables du phnotype exprim par un individu.
E Quel E O
est le lien fonctionnel entre gnes et protines?
et comment seffectue la synthse des protines?
Du gne la protine
1. Localisation de la synthse des protines
Technique exprimentale : lautoradiographie
Principe de lautoradiographie : une cellule est place dans un milieu contenant une molcule de son mtabolisme dont un atome est remplac par un de ses isotopes radioactifs (3H, 14C). La prsence de ces isotopes ne modifie en rien lutilisation des molcules marques par les cellules mais permet de les localiser dans la cellule. En effet, les substances radioactives mettent un rayonnement bta qui peut impressionner une mulsion photographique maintenue quelque temps au contact du matriel biologique. Il y a alors prcipitation de grains dargent qui apparaissent sombres aux endroits prcis o se trouvent les isotopes radioactifs. La mise en vidence du devenir dans lorganisme de substances ingres
Si on donne manger un individu un sandwich radioactif (faiblement)...
Document 9
t1
t2
t3
...on peut suivre avec des clichs photographiques le devenir de ces substances. Ici on voit que la radioactivit aprs stre stocke dans le foie (t2) passe dans tout le corps (t3). Cette tude peut se faire avec toutes sortes de substances que lon aura rendues radioactives. Elle peut se faire sur les plantes aussi. Elle peut aussi tre pratique lchelle cellulaire. On ntudie plus alors par quels organes passent les substances mais comment les substances se dplacent dans le cytoplasme.
12
Squence 4 SN12
Activit 5
Donnes exprimentales sur la synthse des protines

Exploiter et interprter des rsultats exprimentaux ; noncer un problme
Pour chercher le lieu o seffectue la synthse des protines, on utilise des Actabulaires, algues unicellulaires de grande taille.
Exprience 1:
Les algues sont mises en prsence dun acide amin radioactif, la mthionine. Aprs 30 minutes lautoradiographie montre le schma de la figure a. Le rsultat serait identique si les algues taient ensuite replaces 3 heures dans un milieu froid , cest dire non radioactif. NB : le noyau nest jamais radioactif.
1 A partir de ces rsultats, retrouvez le lieu de synthse des protines.
Exprience 2:
Des Actabulaires sont mises en culture dans un milieu contenant de la thymine radioactive (une des 4 bases azotes de lADN). Au bout de 30 minutes dans ce milieu, lautoradiographie donne les rsultats de la figure b. Aprs avoir t replaces dans un milieu froid pendant 3 heures, la localisation de la radioactivit ne change pas.
2 Montrez que ces rsultats, et ceux qui prcdent, posent un problme
biologique que vous noncerez.

figure a Les Actabulaires sont des algues vertes unicellulaires. Elles sont accroches aux rochers par un pied et elles dveloppent un chapeau circulaire au sommet d'un pdoncule. Le noyau cellulaire est situ dans le pied. figure b
On peut cultiver ces algues dans un aquarium d'eau de mer que l'on claire. On peut apporter l'eau de l'aquarium diffrentes substances radioactives pour voir o va se localiser la radioactivit dans l'algue.
Actabulaire cultive avec de la mthionine (un acide amin) radioactive.
Actabulaire cultive avec de la thymine (un des bases de l'ADN) radioactive.
Les points noirs reprsentent la radioactivit.
Comment et sous quelle forme linformation gntique passe-t-elle du noyau dans le cytoplasme, lieu de son expression ?
Activit 6
Recherche de lintermdiaire entre le noyau et le cytoplasme

Extraire des informations Il existe dans les cellules des molcules qui appartiennent au mme titre que lADN la famille des acides nucliques. Ces molcules appeles ARN (acide ribonuclique) ont une structure voisine de lADN. Il est possible de reprer lADN et lARN dans la cellule grce deux colorants spcifiques : le vert de mthyle colore spcifiquement lADN en vert et la pyronine colore spcifiquement lARN en rose. Le schma du document 10 prsente des cellules qui produisent beaucoup de protines, colores par un mlange de vert de mthyl-pyronine.
Squence 4 SN12
13
Document 10
Cellules aprs coloration
noyau color en vert cytoplasme color en rose
Mettre en relation les parties cellulaires colores et la localisation des molcules identifies.
Activit 7
Synthse exprimentale de protines in-vitro

Recenser, extraire et organiser des informations
A partir de cellules vivantes dont la synthse protique est active, il est possible dobtenir des extraits cellulaires contenant tous les types dorganites cytoplasmiques (lments fonctionnels de la cellule) mais sans ARN ni ADN. De mme, on peut prparer partir du cytoplasme des extraits de solution dARN. On a ajout in-vitro aux extraits cellulaires obtenus des acides amins et une certaine quantit dARN. On a mesur la quantit dARN prsent et la quantit dacides amins incorpors dans les protines fabriques en fonction du temps. Les rsultats sont illustrs par le graphique du document 11 :
Document 11
Quantit dARN ou dacides amins
Quantit dARN Quantit dacides amins incorpors Temps en minutes
10
20
30
1 Donner un titre au graphique et lexploiter pour expliquer la variation
de la quantit dacides amins incorpors dans les protines synthtises.
14
Squence 4 SN12
2 En dduire une proprit de lARN que lexprience met en vidence.
Des autoradiographies de cellules cultives en prsence duracile radioactif (prcurseur de lARN) sont prsentes dans le document 12. Document 12
Une cellule est cultive durant 15 minutes en prsence dun prcurseur radioactif de lARN.
Aprs 15 minutes on recherche la radioactivit.
Aprs 15 minutes de culture sur milieu radioactif on cultive la cellule sur milieu non radioactif. On recherche la radioactivit au bout dune heure et demie.
3 Indiquer quels renseignements sont fournis par cette exprimentation ? 4 On qualifie les ARN dARN messager. Justifier ce terme.
Les deux tapes majeures de lexpression dun gne sont la transcription de lADN en ARN messager (ARNm) dans le noyau et la traduction de lARNm en protine dans le cytoplasme.
5 Proposer une dfinition de ces deux tapes. retenir Bien que lADN, support de linformation gntique, soit dans le noyau des cellules eucaryotes, la synthse des protines seffectue dans le cytoplasme. Des molcules dacide ribonuclique (ARN) fabriques par transcription de lADN, permettent la traduction en protines du message gntique port par lADN. Les molcules dARN sont synthtises dans le noyau et migrent ensuite dans le cytoplasme : on les appelle des ARN messager ou ARNm.
E Par
quel mcanisme seffectue le transfert de linformation de lADN lARNm ?
2. La transcription de lADN en ARNm

a) La structure de lARNm
Nous avons dj signal prcdemment que lARN est un acide nuclique, molcule voisine de lADN. En quoi les deux molcules diffrent-elles ?
Squence 4 SN12
15
Activit 8
Comparaison de lARN et de lADN

Utiliser les technologies de linformation, extraire des informations
Tlcharger le logiciel Rastop sur le site de lINRP (Institut National de Recherche pdagogique). Lien : http://acces.inrp.fr/acces/logiciels/externes/rastop Si le lien ne fonctionne pas, tapez rastop + INRP sur un moteur de recherche. Tlcharger les fichiers de molcules sur acadmie en ligne. Stocker ces fichiers dans un dossier sur votre ordinateur que vous pouvez nommer molcules squence 4 chapitre1 . Ouvrir le logiciel Rastop et ouvrir les fichiers ARN et ADN de votre dossier molcules squence 4 chapitre1 . Placer les deux fentres cte cte et afficher les deux molcules en sphres. Les colorer par chane.
Aide Pour ouvrir un fichier, cliquer sur fichier / ouvrir pour avoir accs la banque de molcules. Pour observer les fentres cte cte, cliquer sur licne mosaque de fentres (icne cascade).
Affichage en cascade sphres
16
Squence 4 SN12
1 Comparer la structure de la molcule dARN celle de lADN.
Colorer les molcules par forme.

2 Prciser les diffrences dans la constitution des deux molcules.
Aide :
1 : nom de la molcule affiche. 2 : nom de la chane de la molcule sur laquelle la souris est positionne. 3 : nom de la sous-unit sur laquelle la souris est positionne et numro dordre dans la chane.
3 Ecrire la squence nuclotidique de lARN.
Activit 9
Modalits de la transcription
Mobiliser ses connaissances, extraire des informations et formuler des hypothses explicatives.
1 Rappeler la dfinition dun gne, o seffectuent la transcription et la
traduction de linformation gntique. On cherche dcouvrir quelques modalits de la transcription du gne de lalpha globine. Document 13 Comparaison du dbut et de la fin des squences nuclotidiques du gne de lalpha globine et de lARNm correspondant.
2 Noter le nombre de nuclotides de chaque brin du gne et de lARNm
correspondant.
Squence 4 SN12
17
3 Recopier les dix premiers et les dix derniers nuclotides du gne et de
son ARNm. Numroter le premier et le dernier nuclotide (attention lchelle de graduation !)

4 Comparer les squences de lalpha ARNm cod avec lalphabrin1 puis
avec lalphabrin2.
5 En tenant compte de vos connaissances sur la structure de lADN, pro-
poser 2 processus de synthse de lARNm partir du gne En fait, il a t dmontr que lARN se forme en ngatif dun des deux brins dADN servant de matrice, par complmentarit de bases. Ce brin dADN est appel brin transcrit (lautre est appel brin non transcrit). LARN est une chane linaire de nuclotides monobrin beaucoup plus courte que lADN. Effectivement une molcule dADN comprend plusieurs milliers de gnes alors quun ARNm correspond la transcription dun seul gne. Document 14 Structure dune molcule dARN
acide phosphorique G A U C uracile adnine cytosine guanine ribose
BASES AZOTES
A C G
A U
un ribonuclotide
E Quels
sont les mcanismes de la transcription ?
b) Les mcanismes de la transcription

La transcription correspond la synthse de molcules dARNm partir de lADN. Elle peut tre observe au microscope lectronique transmission. Sur le document, un gne prsente une activit de synthse dARNm. Chaque filament hriss de part et dautre du fragment dADN correspond une molcule dARNm en cours de synthse.
18
Squence 4 SN12
Document 15
Schma dinterprtation dun gne en phase de synthse dARN
unit de transcription ADN sens de transcription signal de fin de transcription ARN polymrase ARN en cours de synthse ARN termin
Document 16
Mcanismes de transcription de lARN En un site prcis de lADN (site dbut de transcription), les liaisons entre bases se brisent sous laction dun complexe enzymatique : lARN polymrase. Les deux brins (brin transcrit et brin non transcrit se sparent). ce niveau, des ribonuclotides libres assimils par la cellule se placent le long du brin transcrit de lADN par complmentarit des bases, selon un sens de transcription. LARN polymrase se dplace le long du brin transcrit de lADN depuis le site de dbut de transcription jusquau site de terminaison et lie les nuclotides progressivement (50 la seconde environ). la fin du message, lARN polymrase se dtache de lADN ainsi que lARN et les deux brins de lADN se referment. Plusieurs ARNm sont synthtiss en mme temps, ce qui ncessite de lnergie cellulaire. Puis lARN quitte le noyau pour le cytoplasme en passant par des pores de lenveloppe nuclaire.
Activit 10
Schmatiser les mcanismes de la transcription

Extraire des informations pour lgender et annoter un schma partir des informations du document 16, lgender et annoter le document 17.
Squence 4 SN12
19
Document 17
Schma du mcanisme de transcription de lADN en ARN.
c) La maturation de lARN
La transcription de lADN naboutit pas directement la synthse dun ARN mature prt tre traduit en protine. La transcription dun gne est en fait la fabrication dune molcule dARN pr-messager, complmentaire du brin codant du gne considr. Ce nest quaprs maturation que lARNm peut-tre traduit en protine. Voyons en quoi consiste de faon simplifie cette maturation Chez les eucaryotes, un ARN pr-messager transcrit partir de lADN dun gne subit une srie de coupures et ressoudures qui aboutissent llimination de certains fragments dans lARNm mature. Ce processus est appel pissage. On appelle exons les fragments conservs et introns ceux qui sont limins. Les exons sont donc les parties transcrites des gnes qui seront au final traduites en protines. Les gnes sont ainsi constitus dune succession dexons et dintrons qui alternent et lpissage de lARN pr-messager en ARNm mature ne contenant plus que les exons est qualifi dpissage alternatif. Document 18 Schmatisation de lpissage alternatif
pr-ARN
exon
intron
exon
intron exon
ARNm
20
Squence 4 SN12
Combien dARNm matures diffrents peut-on obtenir partir de lARN pr-messager du document 18 ? Rponse : 3. LARNm peut avoir ligatur 3, 2, ou 1 exon. Des mcanismes cellulaires complexes rgulent lpissage et peuvent permettre un ARN pr-messager dtre piss en plusieurs ARNm matures diffrents. Un mme gne peut donc tre lorigine de la traduction de protines diffrentes. Lpissage alternatif joue donc un rle dterminant dans le dveloppement des cellules, lorganisation des tissus et donc dans le dveloppement dun individu. Ainsi, dans lespce humaine, sur les 30000 gnes du gnome, 70 % subissent un pissage alternatif. Ainsi on estime quun seul gne peut tre lorigine de 100000 ARNm matures diffrents et donc autant de protines diffrentes. Ladage 1 gne-1 protine est donc caduque.
retenir Dans le noyau, la transcription est le mcanisme par lequel lARNm (acide ribonuclique) est synthtis. Cette synthse se ralise partir de lun des deux brins dADN appel brin transcrit ; lautre brin dADN non transcrit correspond au gne. Sous laction dun complexe enzymatique (ARN polymrase), la molcule dADN souvre et par complmentarit de bases, les ribonuclotides libres sassocient en une squence complmentaire du brin dADN transcrit. Au niveau de lARN, la thymine est remplace par luracile. La synthse dune molcule monobrin dARN ncessite de lnergie. Chez les eucaryotes, la transcription est en fait la fabrication, dans le noyau, dune molcule dARN pr-messager qui aprs pissage des parties non codantes est transform en ARNm mature pouvant tre traduit en protines dans le cytoplasme.
E Problme
: quelle est la correspondance entre le code port par lARNm (squence de nuclotides) et les protines (squence dacides amins)?
3. Le systme de correspondance entre nuclotides et acides amins ou code gntique

Un gne code pour une protine spcifique. Cest donc la squence nuclotidique dun gne (et donc de son ARN transcrit) qui dtermine la squence des acides amins dune protine. Le problme est de comprendre comment une molcule forme de 4 nuclotides diffrents permet la synthse dune molcule forme partir de 20 acides amins diffrents. Autrement dit comment partir dun alphabet 4 lettres on peut crire 20 mots diffrents.
Squence 4 SN12
21
Activit 11
Dcouverte du code gntique

prouver des hypothses. Comprendre le lien entre le langage mathmatique et les phnomnes naturels.
1 Parmi les hypothses suivantes, lesquelles sont invalider et laquelle
peut-on thoriquement retenir ? Justifier la rponse. Hypothse1 : un nuclotide de lARN code pour un acide amins. Hypothse 2 : deux nuclotides de lARN codent pour un acide amin. Hypothse 3 : trois nuclotides de lARN codent pour un acide amin. Document 19
A A U G C A U
Correspondance entre lARN et les acides amins

U G C A U G G C A U C G C 1re base, 4 possibilits. 2me base, 4 nouvelles possibilits. 3me base, 4 nouvelles possibilits. ....CCC, 64me combinaison possible
AUGC AUGC AUGC AUGC AUGC AUGC AUGC AUGC AUGC AUGC AUGC AUGC AUGC AUGC AUGC AUGC
AAA, premire combinaison possible...
En fait, cest en 1961 que deux biologistes, Niremberg et Matthi ont valid lhypothse quune combinaison de trois nuclotides code pour un acide amin. Pour cela, ils ont synthtis in-vitro, un ARNm uniquement compos de nuclotides U (le poly U). Ils ont mlang des molcules de poly U en prsence de tous les acteurs cellulaires de la synthse protique ainsi quun seul type dacide amin. Dans leurs expriences, seul le mlange contenant la phnylalanine comme acide amin a permis la synthse dun polypeptide uniquement constitu dune squence de plusieurs phnylanines. Ils ont ainsi dmontr que le triplet UUU de lARNm code pour lacide amin phnylalanine. Quatre ans plus tard, la signification des 63 autres triplets ou codons de nuclotides tait lucide. Elle constitue aujourdhui ce que lon nomme le code gntique.
E Comment
expliquer lexistence de 64 codons diffrents alors quil nexiste que 20 acides amins?
Activit 12
Document 20
Signification des diffrents codons

Extraire des informations pour formuler des explications
Comparaison du dbut et de la fin de la squence de lARNm de lalpha globine et de la squence peptidique correspondante.
22
Squence 4 SN12
1 Retrouve-t-on plusieurs fois le mme acide amin dans la squence
peptidique ? Donner des exemples.

2 Mettre en relation ces acides amins avec leur codon. Que constate-t-on ?
En dduire une proprit du code gntique.

3 Comparer la fin de la squence de nuclotides et celle en acides amins.
Donner une explication.

4 Quelle autre proprit du code gntique mettent en vidence les ex-
priences de transgnse ? Document 21 Comparaison du dbut de la squence de lARNm de deux protines diffrentes et de leur squence peptidique correspondante.
5 Que constate-t-on ?
Document 22
Le code gntique
2me base
U U
PHE PHE LEU LEU LEU LEU LEU LEU ILE ILE ILE MET VAL VAL VAL VAL
C
SER SER SER SER PRO PRO PRO PRO THR THR THR THR ALA ALA ALA ALA
A
TYR TYR STOP STOP HIS HIS GLN GLN ASN ASN LYS LYS ASP ASP GLU GLU
G
CYS CYS STOP TRP ARG ARG ARG ARG SER SER ARG ARG GLY GLY GLY GLY
U C A G U C A G U C A G U C A G
3me base
C
1re base
Squence 4 SN12
23
Le document 22 permet ainsi de constater que sur les 64 codons il y en a 61 qui codent pour un acide amin. Trois codons ne dsignent aucun acide amin. Ils marquent la fin de synthse protique et on les appelle codons stop ou non-sens. Certains codons codent le mme acide amin et indiquent que le code gntique est redondant ou dgnr.
Remarque
Chez les eucaryotes, la transcription de lADN naboutit pas systmatiquement la synthse dARNm codant. Les scientifiques ont montr que seulement 1.2 % de lADN gnomique dune espce est traduit en protines. La majeure partie de lARN transcrit est donc non codant et est alors qualifie dARNnm (non messager). Cest le cas par exemple de lARN ribosomal (constituant principal des ribosomes, organites impliqus dans la synthse protique) et de lARN de transfert ncessaire la polymrisation des acides amins en polypeptide lors de traduction.
Schma bilan:
Activit 13
Mobiliser ses connaissances pour annoter un schma

Complter le schma bilan illustrant la correspondance entre ADN et protine.
Aide On attend les annotations suivantes : protine ADN ARNm transcription traduction.
E Problme : comment lARNm est-il traduit en protines ? Quels en sont
les mcanismes et les outils ?
24
Squence 4 SN12
4. Les outils et les mcanismes de la traduction

On sait que la transcription de lADN a lieu dans le noyau et la traduction (synthse des protines) dans le cytoplasme. Document 23 Ultrastructure dune cellule sige dune synthse protique
cytoplasme noyau pore nuclaire rticulum endoplasmique
Remarque
Dautres organites non schmatiss ici sont associs au rticulum : les ribosomes. On peut sinterroger sur les organites ncessaires la traduction.
Activit 14
Importance du rticulum dans la synthse des protines

Extraire des informations pour rpondre un problme
1 Relever les arguments qui attestent que le REG est le lien de synthse
des protines.
1 : Les glandes salivaires sont formes de cellules dont la synthse protique est active. Elles synthtisent des enzymes digestives. 2 : En microscopie lectronique, on peut observer dans le cytoplasme des zones avec des feuillets granuleux. Elles correspondent deux organites : le rticulum endoplasmique (systme de cavits communicantes limites par une membrane et les ribosomes organites granuleux accols la membrane du rticulum. Lensemble forme le rticulum endoplasmique granuleux (REG). 3 : En prsence dacides amins radioactifs, les enzymes produites sont ellesmmes radioactives. On constate aprs autoradiographie que la radioactivit se concentre dans le REG.
Squence 4 SN12
25
a) Le rticulum endoplasmique et les ribosomes: organites ncessaires la synthse des protines

Cest au niveau du rticulum endoplasmique (systme de cavits communicantes limites par une membrane) et des ribosomes (organites accols la membrane du rticulum) qua lieu la synthse des protines. Document 24 Microphotographie de rticulum et de ribosomes au MET (x 40000) et interprtation schmatique
Membrane du rticulum endoplasmique granuleux Ribosomes
x 40 000
On peut suivre plus prcisment les relations entre ces acteurs de la synthse protique par des observations en microscopie lectronique. Le document 26 montre que la synthse fait intervenir un ensemble de ribosomes associs en une sorte de chapelets appels polysomes. Une molcule dARNm (repre par une che sur la photographie C) relie entre eux les ribosomes.
26
Squence 4 SN12
Document 25 A x 75 000
Microphotographies de polysomes au MET et schma dinterprtation
Polysome
Ribosome
x 40 000
B x 240000
Ribosome ARNm
x 240 000
C x 400000
Ribosome ARNm
x 400 000
Squence 4 SN12
27
Document 26
Structure dun ribosome
Un ribosome est un organite globulaire form de deux sous-units de taille diffrente (elles sont non lies sil ny a pas de synthse). Le rle dun ribosome est de traduire lARNm codon par codon et dassembler la squence dacides amins par des liaisons peptidiques. Un mme ARNm peut tre traduit plusieurs fois et simultanment par plusieurs ribosomes avec un sens de lecture unidirectionnel grce lexistence dun codon initiateur (AUG) et dun codon stop.
Document 27
Microphotographie dun polysome en activit au MET
b) Les mcanismes de la traduction

Trois phases ncessitent des enzymes et de lnergie : Initiation de la traduction. Elle dbute toujours au niveau dun codon AUG appel codon initiateur qui dtermine lassemblage dun ribosome sur lARNm.
28
Squence 4 SN12
Document 28
Reprsentation schmatique de linitiation
Elongation : le ribosome dfile le long de la molcule dARNm, ce qui permet la mise en place des diffrents acides amins suivant lordre des codons de la squence de nuclotides de lARNm. Document 29 Reprsentation schmatique de llongation
Terminaison : Lorsque le ribosome arrive au niveau dun codon stop, la synthse sachve. Ce codon dclenche la dissociation du ribosome, la libration dans le cytoplasme du polypeptide et llimination de la mthionine si le premier acide amin du polypeptide nest pas la mthionine.
Squence 4 SN12
29
Document 30
Reprsentation schmatique de la terminaison
Remarque : une molcule dARNm permet la synthse de 10 20 protines puis elle est dgrade (les nuclotides librs peuvent tre recycls et participer la synthse de nouvelles molcules dARN).
retenir La traduction correspond lexpression dans le cytoplasme de linformation gntique porte par lARNm en squence dacides amins (polypeptide). Elle ncessite : Des ribosomes, organites de lecture des codons de lARNm et dassemblage des acides amins. Des acides amins libres du cytoplasme et leur transfert au niveau des ribosomes. Des enzymes (et de lnergie). La traduction comporte trois phases : linitiation, llongation et la terminaison.
Bilan du chapitre
Linformation gntique contenue dans les chromosomes sous forme de gnes est matrialise par la squence de nuclotides. Lors de la synthse des protines, ce message est transcrit en ARNm (dans le noyau) qui va transporter linformation jusquaux ribosomes (dans le cytoplasme) o seffectue lassemblage des acides amins en polypeptides lors de la traduction. La correspondance entre squence de nuclotides et squence dacides amins se fait selon le code gntique universel.
30
Squence 4 SN12
Schma bilan du chapitre
Squence 4 SN12
31
Phnotypes, gnotypes et environnement
Pour sinterroger la question Que regardez-vous en premier chez un inconnu ? , la rponse majoritaire est les yeux . Leur couleur est un lment incontournable pour dcrire lapparence dautrui Le biologiste parle de caractristique phnotypique. Noisette, bleu acier, vert, bronze Autant de nuances pour dfinir la couleur de liris. On parle de phnotypes alternatifs. Pour ce caractre exprim et pour tous les autres, nous avons appris que le phnotype est sous la dpendance dune catgorie de molcules : les protines, dont les gnes gouvernent la synthse. Les individus dune mme espce sont reconnaissables leurs caractres communs. Ils sont cependant tous diffrents. Chaque individu possde des caractristiques (morphologiques, anatomiques ou physiologiques) qui lui sont propres.
E Quelles
sont les diffrentes chelles de dfinition des phnotypes? est lorigine des phnotypes alternatifs? phnotype se rsume-t-il la seule expression du gnotype?
E Quelle E Le
Les diffrentes chelles de dfinition du phnotype

Lexemple dune maladie hrditaire, la drpanocytose ou anmie falciforme (maladie du sang) va nous permettre de dfinir les diffrentes chelles du phnotype.
Quelques caractristiques de la drpanocytose (ou anmie falciforme)

La drpanocytose est une maladie hrditaire qui provoque une mortalit infantile importante dans certaines rgions du monde (elle atteint plusieurs centaines de milliers denfants). Elle est frquente dans certaines rgions en Afrique, au Moyen-Orient, en Asie du sud. Une personne atteinte prsente des symptmes caractristiques : essoufflements, lvres bleues, palpitations cardiaques.
32
Squence 4 SN12
Il en existe deux formes : Une forme dite majeure, lorsque chacun des deux parents dun individu atteint leur a transmis chacun lallle responsable. Une forme dite mineure, compatible avec la vie, lorsque seulement un des parents a transmis lallle responsable. Chez une personne non malade, les hmaties, de forme biconcave, circulent dans les plus petits capillaires ce qui permet un transport continu des gaz respiratoires (dont le dioxygne) au niveau de toutes les cellules. Chez une personne drpanocytaire, les hmaties (globules rouges), sont rigides et clatent facilement. Il en rsulte une mauvaise oxygnation des cellules et une anmie lie leur destruction. Elles sont dformes en forme de faucille (falciformes) et bloquent la circulation sanguine dans les plus petits capillaires. Larrt de la circulation peut tre lorigine de lsions dans les tissus (os, muscles, poumons) qui saccompagnent de douleurs. Dans la forme majeure, labsence totale dhmaties normales entrane une mortalit infantile prcoce (vers lge de 5 ans). Dans la forme mineure, la prsence dhmaties normales compense celle dhmaties drpanocytaires. Elle est compatible avec la vie. Document 1 Aspect des hmaties chez une personne normale ( gauche) et drpanocytaire ( droite)
On trouve dans les hmaties une protine quelles seules synthtisent : lhmoglobine. Elle est normalement dissoute dans le cytoplasme. Elle comprend quatre chanes polypeptidiques : deux chanes de 141 acides amins lies deux chanes de 146 acides amins. Chaque chane est associe avec une rgion de la molcule appele hme capable de fixer le dioxygne. La solubilit de lhmoglobine des malades drpanocytaires est beaucoup plus faible que celle de lhmoglobine normale. Leur hmoglobine (HbS pour sickle = faucille) est modifie par rapport lhmoglobine normale (HbA). Plusieurs molcules anormales peuvent sagglutiner formant des agrgats fibreux.
Squence 4 SN12
33
Document 2
Hmatie drpanocytaire observe au MET et modle molculaire
Assemblage de molcules dhmoglobine Hbs
21,5 nm
prcipit fibreux
On a dtermin la squence des acides amins de la chane de lhmoglobine. Les sept premiers acides amins de la squence primaire de HbS sont : HbA : Val-His-Leu-Thr-Pro-Glu-Glu HbS : Val-His-Leu-Thr-Pro-Val-Glu
Remarque : la valine est un acide amin qui tablit des liaisons avec la leucine ce qui nest pas le cas de lacide glutamique.
HbA HbS
Acide glutamique
valine
34
Squence 4 SN12
HbA
HbS
Chane de lhmoglobine HbA
Val His LeuThr Pro Glu Glu Lys Ser
Chane de lhmoglobine HbS
Val His Leu Thr Pro Val Glu Lys Ser
Activit 1
Les diffrentes chelles de phnotypes lies la drpanocytose

Recenser, extraire et organiser des informations en relation avec le problme pos. 1 Indiquer les trois diffrentes chelles de dfinition dun phnotype ? 2 Construire un tableau comparaAide tif des trois niveaux de phnotypes chez un individu sain et Construire un tableau un individu malade. double entre : une entre 3 tablir un lien de cause effet pour les niveaux de phnoentre les diffrents niveaux de types et une entre pour les phnotype en partant de la moindividus sains et malades. lcule concerne. 4 Indiquer la diffrence entre HbA et HbS. Expliquer les consquences structurales qui en dcoulent.
retenir Lobservation morphologique, anatomique, physiologique et comportementale permet ltude du phnotype macroscopique (ce qui est accessible par une observation extrieure). Ltude microscopique rvle le phnotype cellulaire. Les protines sont responsables des caractres exprims lchelle molculaire. Elles dfinissent le phnotype molculaire. Les diffrents niveaux de dfinition du phnotype sont lis entre eux : le phnotype molculaire conditionne le phnotype cellulaire qui a des rpercussions sur le phnotype macroscopique. Ainsi une molcule anormale (ou absente) peut-tre lorigine dune anomalie de structure et/ ou de fonctionnement pouvant entraner des troubles au niveau de lorganisme. Pour un caractre donn, il existe plusieurs phnotypes qualifis dalternatifs. Les phnotypes alternatifs sont dus des diffrences dans les protines concernes : Des diffrences qualitatives (squence et/ou structure tertiaire diffrente). Des diffrences fonctionnelles (activit biologique diffrente). Les caractristiques phnotypiques dun individu sont donc lies aux protines que les cellules sont capables de produire. Squence 4 SN12
35
Du gnotype au phnotype
1. Phnotype sous la dpendance dun couple dallles
Activit 2
Dterminisme gntique des groupes sanguins du systme ABO

Recenser, extraire et organiser des informations. Raisonner avec rigueur
Rappel
La synthse des marqueurs sanguins a un dterminisme gntique (voir document 3). Dterminisme gntique de la synthse des marqueurs sanguins
Document 3
Synthse dune molcule A
Globule rouge du groupe A
Synthse dune molcule B
Globule rouge du groupe B
O Chromosome n9 portant un gne (il en porte dautres) Trois allles pour ce gne
Pas de synthse
Globule rouge du groupe O
Les hmaties ont un aspect identique chez tous les individus, sauf chez ceux atteints de drpanocytose. Elles diffrent cependant par la prsence ou labsence leur surface, de molcules marqueurs A et B. Selon que lon possde ou non ces molcules, on est de phnotype A (prsence du marqueur A), B (prsence du marqueur B), AB (prsence du marqueur A et B) ou O (aucun marqueur nest prsent). Lidentification dun groupe peut tre ralise par un test dagglutination. Il consiste mlanger une goutte de sang dun individu un srum test contenant des anticorps capables de se lier spcifiquement lun des marqueurs caractristiques des groupes sanguins et dentraner une agglutination (ou prcipitation) des hmaties.
36
Squence 4 SN12
Identification des groupes sanguins par un test dagglutination.

Ac Groupe Groupe A Groupe O Groupe B Groupe AB Anti B Anti A Anti AB
Pas dagglutination
Agglutination
Agglutination
Pas dagglutination Pas dagglutination Pas dagglutination Agglutination Agglutination Pas dagglutination Agglutination Agglutination Agglutination
Le gne responsable du caractre groupe sanguin a t identifi et localis sur le chromosome 9. Nos cellules (dont les hmaties) possdent donc sur la paire de chromosomes 9 deux allles parmi les trois (A, B et O). NB : un individu qui possde pour un gne donn, les mmes allles sur les chromosomes dune mme paire, est homozygote pour ce gne. Sil possde des allles diffrents, il est htrozygote.
1 Dterminer les gnotypes associs au phnotype AB dune part et au
phnotype O dautre part.

Conventions dcriture : le phnotype scrit entre crochets [ ] (exemple
le phnotype A scrit [A]) ; le gnotype entre parenthses ( ) chaque barre symbolisant un allle dun chromosome, que lon nomme par une lettre (ici A et/ou B ou O).
2 Montrer pour les groupes sanguins A et B, que chacun de ces phnotypes
correspond plusieurs gnotypes possibles que vous identifierez. Nous savons que de nombreux gnes possdent plusieurs allles. On peut alors se demander si chaque couple dallles dfinissant le gnotype dun individu correspond un phnotype particulier.
Activit 3
Le polymorphisme des gnes de lhmoglobine, drpanocytose et thalassmies

Mobiliser ses connaissances. Organiser sa rponse sous forme dun tableau.
Les thalassmies sont comme la drpanocytose des maladies du sang pouvant provoquer des anmies svres et ont pour origine labsence de production de chanes de globines compltes.
Squence 4 SN12
37
Document 4
Brin non transcrit du gne codant pour la globine normale
Le tableau suivant montre les diffrentes modifications observes chez des sujets, qui affectent le gne lorigine des diffrentes pathologies.
triplets de squences squences nombre dacides ani- consquences phnotymutation muclotides normales modifies ms dans la chane piques et signes cliniques (ADN) 1 2 3 4 5 6 7 8 9 2 6 6 17 39 71-72 102 103 121 CAT GT G G-G 146 146 17 16 38 71 146 146 146 diminution de laffinit pour lO2 augmentation de laffinit pour lO2 Hb fonctionnelle Aide Rpondre sous forme dun tableau avec une colonne pour le numro des mutations, une colonne pour lexpression du codon mut, une colonne pour le phnotype molculaire, une colonne pour le phnotype cellulaire et une colonne pour le phnotype macroscopique. Thalassmie (anmie grave) Hb fonctionnelle Hb en fibres, hmaties dformes; drpanocytose
T AG T AG
TTTT AGT AC C
C TC TTC
1 Quelles remarques faites-vous
sur les triplets 0 et 147 ?

2 Complter le tableau. 3 Envisager les consquences des
mutations 1, 2, 4 et 9, pour des individus homozygotes, au niveau des phnotypes molculaire, cellulaire et macroscopique. On notera HbA lallle mut1 ; HbS lallle mut 2 ; HbT lallle mut 4 ; HbA lallle mut 9. 38
Squence 4 SN12
2. Des phnotypes sous la dpendance de plusieurs gnes

Activit 4 Synthse des molcules lorigine des groupes sanguins
Extraire et organiser des informations. Raisonner avec rigueur. Les marqueurs lorigine des groupes sanguins diffrent entre eux par une chane glucidique associe aux marqueurs. La synthse de cette chane glucidique est effectue en plusieurs tapes, chacune delles tant catalyse par une enzyme. Seules les dernires tapes sont concernes dans la distinction entre les diffrents marqueurs.
Lavant dernire tape est sous la dpendance dun gne dont on connat deux allles : H qui code pour une enzyme fonctionnelle (enzyme H) et h qui code pour une enzyme non fonctionnelle (enzyme h). La dernire tape est sous la dpendance dun autre gne (celui du systme ABO. Rappelons que lallle A code pour une enzyme A fonctionnelle, lallle B code pour une enzyme B fonctionnelle et lallle O code pour une enzyme non fonctionnelle.
Document 5
Dernires tapes de la chane de biosynthse des marqueurs sanguins du systme ABO

Molcule lipidique N actyl galactosamine Galactose Fucose enzyme H enzyme A
Prcurseur
Marqueur H
Marqueur A
Molcule lipidique N actyl galactosamine Galactose Fucose enzyme H enzyme B
Prcurseur
Marqueur H
Marqueur B
Molcule lipidique N actyl galactosamine Galactose Fucose enzyme H enzyme O Aucun radical fix
Prcurseur
Marqueur H
Squence 4 SN12
39
1 Montrer que les phnotypes prsents rsultent de lexpression de
plusieurs gnes.
2 Dterminer, en justifiant la rponse, les diffrents gnotypes qui
conduisent au phnotype O.
3 Un homme et une femme ont t classs dans le groupe sanguin O.
Ce couple a eu deux enfants, lun de groupe A et lautre de groupe B. Indiquer les gnotypes possibles de ces parents de phnotype O.
retenir Dans les cellules possdant des paires de chromosomes, il y a deux allles pour chaque gne. Pour tous les gnes polyallliques, un individu peut donc possder deux allles identiques ou diffrents du mme gne : Dans le premier cas, lindividu est dit homozygote pour ce gne cest--dire quil ne produit quun type de protine. Dans le deuxime cas, lindividu est dit htrozygote pour ce gne : il peut produire alors 2 types de protine.
E Le
phnotype dun individu est-il sous la seule dpendance de son gnotype?
Des facteurs de lenvironnement contribuent au phnotype

Dans certains cas, lenvironnement na pas dinfluence sur le phnotype, comme par exemple celui des groupes sanguins. Pour certains phnotypes, on peut mettre en vidence un rle important de lenvironnement sur lexpression du phnotype. Nous avons appris prcdemment que lenvironnement peut provoquer par des agents mutagnes lapparition de nouveaux allles. Ces derniers peuvent alors modifier un ou plusieurs caractres phnotypiques. Quen est-il des interactions entre environnement et phnotype pour un gnotype donn ?
Activit 5
Relations entre phnotype, gnotype et environnement. Ex : La drpanocytose

Mobiliser ses connaissances. Extraire et organiser des informations Le document 6 prsente llectrophorse de lhmoglobine de trois individus X, Y et Z, prsentant ou non des signes cliniques de la drpanocytose.
40
Squence 4 SN12
Document 6
Electrophorse de lhmoglobine
sujet X
sujet Y
sujet Z
1 Aprs avoir rappel le principe de llectrophorse, retrouver le ou
les type(s) dhmoglobine(s) possd(s) par les diffrents sujets.

2 Complter le tableau suivant : Phnotype de lindividu Gnotype X sain Y sain Z anmi
Allles et chromosomes homologues (schmatiser les chromosomes et positionner les allles)
Document 7
Le dclenchement des crises drpanocytaires Lhmoglobine peut se combiner de faon rversible au dioxygne selon la raction : Hb + 02 Hb02 La formation dagrgats fibreux dHbS (et donc la dformation caractristique des hmaties) se fait quand elle est dsoxygne. Ce processus dagrgation faisant diminuer loxygnation du sang, il en rsulte une croissance rapide des agrgats. Une augmentation de la temprature interne favorise galement lagrgation. Ces deux facteurs (cumuls ou non) peuvent donc favoriser le dclenchement dune crise drpanocytaire.
HbA dans une hmatie normale
HbA dans une hmatie falciforme (dans certaines conditions de milieu)
Squence 4 SN12
41
Tout facteur de lenvironnement qui tend faire diminuer loxygnation du sang est donc viter chez un individu malade. Ces facteurs favorisant une crise drpanocytaire sont de plusieurs ordres : La dshydratation qui fait perdre de leau aux cellules et donc aux hmaties. Dans ce cas, le sang est moins fluide et donc moins oxygn. Le drpanocytaire urine davantage quun individu sain. Il doit donc boire beaucoup. Le ralentissement de la circulation sanguine qui peut bloquer les hmaties dans les plus petits capillaires sanguins. Des vtements trop serrs, une fivre, le froid qui fait diminuer le diamtre des vaisseaux sanguins sont quelques facteurs ralentissant la circulation. La consommation excessive de dioxygne : Les efforts musculaires font produire de lacide lactique qui favorise la formation de bouchons dhmaties. Un environnement appauvri en dioxygne : En altitude la pression atmosphrique plus faible fait diminuer le taux de dioxygne dans lair. Le tabac fait diminuer loxygnation du sang. Lalcool dshydrate lorganisme.
3
a) quelles conditions les hmaties dune personne subissent-elles la dformation caractristique de la drpanocytose ? Quel(s) sujet(s) est (sont) susceptible(s) de la prsenter ici ? b) Quels conseils donneriez-vous un drpanocytaire pour minimiser le risque de dclenchement dune crise ? c) Quel que soit lenvironnement, lexpression du gne codant lhmoglobine nest pas modifie. Dans cet exemple lenvironnement agit-il sur lexpression de lallle HbS ou sur les proprits de lHbS ?
retenir Le phnotype repose en grande partie sur la combinaison des allles des gnes impliqus. Outre les facteurs gntiques qui dterminent directement ou non le phnotype, des facteurs de lenvironnement le modulent le phnotype est donc multifactoriel.
Bilan du chapitre
Lensemble des protines prsentes dans une cellule dpend du patrimoine gntique de la cellule. Une mutation peut tre lorigine dun allle qui code une protine diffrente.
42
Squence 4 SN12
Le phnotype macroscopique dpend du phnotype cellulaire, lui-mme induit par le phnotype molculaire. Le phnotype molculaire des tres vivants dpend souvent de lexpression de plusieurs gnes qui agissent en cascade. Lenvironnement peut agir au niveau du gnotype en modulant son expression. La diversit phnotypique au sein dune espce est donc le rsultat dinteractions complexes entre la variabilit gntique et des facteurs environnementaux.
Schma bilan
Complexit des relations entre gnotype et phnotype
1 allle
1 phnotype
Plusieurs allles 1 phnotype prcurseur enzyme A phnotype molcule A enzyme B molcule B phnotype 1 phnotype
gne
protine fonctionnelle
des gnotypes diffrents Allle A Allle A phnotype A Allle A
1 phnotype Allle a phnotype A
un gnotype influenc par le milieu Environnement phnotype
Squence 4 SN12
43
ynthse de la squence 4
Les gnes, squences dADN, sont le support matriel de linformation gntique. Ils codent pour la synthse de protines, molcules de structure et de fonction responsables de lexpression du phnotype dun individu. Le code gntique est le systme universel de correspondance entre la squence de nuclotides dun gne et la squence en acides amins dune protine. La synthse des protines passe par deux tapes fondamentales : la transcription dans le noyau de lADN codant en ARNm et la traduction dans le cytoplasme de lARNm en protines. Les protines fabriques par une cellule (phnotype molculaire) dpendent :
E du
patrimoine gntique de la cellule. Une mutation efficace peut tre lorigine dune protine diffrente ou de labsence dune protine. la nature des gnes qui sy expriment sous leffet de facteurs de lenvironnement.
E de
Il est possible de caractriser les diffrentes chelles dun phnotype : le phnotype macroscopique est la consquence du phnotype cellulaire lui-mme dpendant du phnotype molculaire. Il y a donc des interactions entre les rles de lenvironnement et du gnotype dans ltablissement dun phnotype.
44
Squence 4 SN12
E
Exercice 1
xercices de la squence 4
Mobiliser ses connaissances
1 Dfinir brivement les termes suivants :
Codon Transcription Ribosome Traduction ARNm

2 Rdiger une phrase correctement construite en associant les termes
suivants : a) Code gntique Traduction Brin dADN transcrit Transcription Gne ARN polymrase ARNm Protine b) Traduction Codon initiateur Initiation Codon stop Terminaison
3 QCM : Entourer la ou les affirmation(s) exacte(s)
a) Les ribosomes permettent la transcription b) Les ribosomes permettent la traduction c) Les ribosomes sont dans le noyau d) Les ribosomes sont des cellules e) Les protines sont traduites dans le noyau f) Les protines dterminent le gnotype g) Les protines dterminent le phnotype h) Les protines codent la synthse de lARN i) Le code gntique est universel j) Les 64 codons correspondent 64 acides amins diffrents k) Un mme phnotype peut correspondre plusieurs gnotypes l) Lenvironnement ne peut pas modifier le phnotype m) Un individu htrozygote pour un gne en possde 3 allles n) Un individu homozygote possde 2 allles de 2 gnes diffrents
Exercice 2
Appliquer ses connaissances

1 Utiliser le document pour :
a) Reconstituer, en exposant votre dmarche, la portion de gne correspondant. b) Reconstituer, en exposant votre dmarche, la squence des premiers acides amins correspondante.
Squence 4 SN12
45
Document
Squence de nuclotides dune molcule dADN dont seule une portion du brin non transcrit est reprsente ci-dessous :
1 G 2 G 3 T 4 A 5 T 6 T 7 G 8 T 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 T C A A C A A T G A
a) Une molcule de cytosine remplace la thymine en position 6. Quelle consquence aura cette mutation sur le polypeptide traduit ? b) Mme question si une guanine remplace ladnine en position 11. c) Mme question si une thymine remplace la cytosine en position 13. d) Mme question si une guanine sintercale entre la neuvime et la dixime base.
Exercice 3
Extraire et organiser des informations. Raisonner. Appliquer une dmarche dductive

Une protine protectrice des poumons : l-antitrypsine. Llastine est une protine prsente dans la paroi des alvoles pulmonaires. Elle assure llasticit des alvoles pendant les mouvements ventilatoires (inspiration et expiration).Llastine est protge par une autre protine fabrique par le foie : l-antitrypsine. Lemphysme pulmonaire est une maladie caractrise par la destruction des alvoles pulmonaires. Lair reste alors pig dans les poumons et est difficilement renouvel. Les poumons perdent de leur lasticit et la ventilation devient trs difficile. Cette maladie est due des anomalies de lantitrypsine. Huit molcules d antitrypsine ont t identifies : M1, M1, M2, M3, S, Z, NULL1 et NULL2. La squence en acides amins est prsente ci-dessous. Attention pour chaque variante, on a reprsent le dbut, la fin et 6 extraits intermdiaires de leur squence.
46
Squence 4 SN12
Quantit dantitrypsine dans le sang (en mg.dL-1) Variante M1 Variante M1 Variante M2 Variante M3 Variante S Variante Z Variante NULL1 Variante NULL2 Protines fonctionnelles mais partiellement dtruites par les cellules hpatiques. Protines non fonctionnelles, trs instables et rapidement dtruites. Protines fonctionnelles. 150 350 150 350 150 350 150 350 100 200 15 50
Risques de maladie Non Non Non Non Non Oui (aprs 50 ans) Oui (avant 30 ans) Oui (avant 30 ans)
0 0
1 Identifier les phnotypes macroscopique et cellulaire associs lem-
physme pulmonaire ? Sur quelle molcule reposent-ils ?

2 Construire un tableau pour comparer la squence des 8 variantes de
l-antitrypsine. Prendre comme rfrence M1.

3 Montrer quun phnotype macroscopique sain peut tre associ des
phnotypes molculaires diffrents.

4 Montrer quun phnotype macroscopique malade peut tre associ
des phnotypes molculaires diffrents.

5 Que peut-on en dduire sur la relation structure/fonction dune protine.
Squence 4 SN12
47
lossaire des squences 3 et 4

Acide amin : Molcule possdant une fonction acide (radical COOH) et une fonction amine (radical NH2). Addition : Mutation dun gne par ajout (insertion) dun nuclotide dans la squence. ADN : Acide dsoxyribonuclique. Macromolcule forme de 2 brins. Chaque brin est une squence de 4 nuclotides diffrents caractriss par leur base azote : A, C, T et G. Les 2 brins sont associs sur toute leur longueur par complmentarit de bases : A en face de T et C en face de G. ADN polymrase : Complexe enzymatique ncessaire la rplication de lADN lors de la phase S de linterphase. Allle : Version dun gne localis sur le mme site dun chromosome. Les allles dun mme gne se diffrencient par leur squence de nuclotides. ARNm : Acide ribonuclique messager. Macromolcule forme dune squence de 4 nuclotides diffrents caractriss par leur base azote : A, C, G et U. ARN polymrase : Complexe enzymatique ncessaire la transcription du brin transcrit de lADN. Autoradiographie : Technique permettant de localiser des molcules dans une cellule par la rvlation datomes radioactifs incorpors dans ces molcules. La prparation est place sur une pellicule photographique qui est impressionne par les rayonnements lendroit o se trouvent les molcules radioactives. Brin transcrit : Brin de lADN qui sert de matrice la formation de lADN lors de la transcription. Caryotype : Garniture chromosomique dune cellule. Cellule germinale : Cellule sexuelle ou gamte. Cellule somatique : Cellule autre quun gamte. Centromre : Zone de jonction entre les 2 chromatides dun mme chromosome. Chromatide : lment issu de la duplication dun chromosome et form dune molcule dADN. Chromatine : tat dcondens de lADN lors de linterphase. Chromosome : Structure condense de lADN. Un chromosome est form dune ou deux chromatides selon le moment du cycle cellulaire.
48
Squence 4 SN12
Code gntique : Systme de correspondance entre la squence de nuclotides dun gne et la squence dacides amins de la protine quil code. Le code gntique est redondant et universel. Codon : Squence de 3 nuclotides ou triplet, porte par lARNm correspondant un acide amin ou un codon stop ou non-sens. Il existe 64 codons diffrents. Cycle cellulaire : Ensemble des tapes se droulant dans une cellule depuis sa formation jusqu sa division. Il comporte une interphase durant laquelle il y a rplication de lADN et une mitose correspondant sa division en deux cellules filles. Dltion : Perte dune partie du matriel gntique. Elle peut concerner la perte dun couple de bases ou dune portion plus large dun chromosome. Drpanocytose : Maladie hrditaire du sang se caractrisant par la synthse dune hmoglobine anormale rigidifiant les hmaties. galement nomme anmie falciforme. lectrophorse : Technique permettant de sparer les molcules dun mlange plac dans un champ lectrique. Le dplacement des molcules entre cathode et anode dpend de leur charge lectrique et de leur masse molculaire. longation : tape de la traduction correspondant lassemblage des acides amins dune protine. pissage : tape de maturation dun ARNm. Elle correspond llimination des introns (squences non codantes) dun ARM pr-messager et la soudure des exons (parties codantes). Eucaryote : Type de cellule possdant un noyau diffrenci et des organites intracytoplasmiques. On loppose la cellule procaryote sans noyau ni organites. Gne : Squence dADN situ un endroit prcis dun chromosome (locus) appele tre transcrit en ARNm puis traduit en protine. Gnotype : Ensemble des gnes port par les chromosomes. Lexpression du gnotype est responsable du phnotype. Htrozygote : Individu possdant 2 allles diffrents pour un mme gne. Homozygote : Individu possdant 2 allles identiques pour un mme gne. Initiation : tape de dbut de traduction dune protine. Linitiation dbute toujours par un codon AUG qui code la mthionine. Insertion : Voir addition. Interphase : tape du cycle cellulaire correspondant ltat dcondens de lADN sous forme de nuclofilaments constituant la chromatine diffuse. Durant linterphase a lieu la rplication de lADN.
Squence 4 SN12
49
Inversion : Cassure dun morceau de chromosome suivie de sa ressoudure au mme endroit mais de faon inverse. Mitose : tape de la division dune cellule mre en deux cellules filles succdant linterphase. Elle comporte 4 tapes (prophase, mtaphase, anaphase, tlophase) permettant une conservation qualitative et quantitative de linformation gntique dans les cellules filles. Mutation : Modification spontane ou provoque de la squence nuclotidique dun gne. Une mutation conserve dun gne est lorigine dun nouvel allle de ce gne. Nuclotide : Molcule unitaire dun acide nuclique. Il en existe 4 qui diffrent par la nature de leur base azote : A, C, G et T pour lADN ou U pour lARN. il de rplication : Zone dans laquelle lADN est rplique au sein dune plus grande zone o il ne lest pas encore. En fin de rplication, tous les yeux de rplication se sont rejoints et il en rsulte 2 molcules dADN unies par un centromre. PCR : Polymerase Chain Reaction = raction de polymrisation en chane. Technique qui partir dune seule squence dADN permet dobtenir un clone de plusieurs millions de squences identiques. Phnotype : Caractres dun individu rsultat de lexpression du gnotype. Il sexprime au niveau molculaire, cellulaire et macroscopique. Polyalllisme : tat dun gne qui existe sous diffrents allles issus de mutations de ce gne. Polypeptide : Molcule forme dun assemblage dacides amins relis par des liaisons peptidiques. Polysome : Ensemble de ribosomes relis par une molcule dARNm en cours de traduction. Protine : Polypeptide de plus de 20 acides amins. Rplication : Processus de copie conforme de linformation gntique porte par lADN. Elle est dite semi-conservative car les 2 molcules filles issues de la rplication dune molcule mre possdent un brin de la molcule mre et un brin noform. Reticulum endoplasmique granuleux (REG) : Systme membranaire du cytoplasme formant des cavits communicantes associ des ribosomes. Le REG intervient dans la synthse des protines. Ribosome : Organite cytoplasmique de lecture de lARNm. Il permet la traduction codon par codon et lassemblage des acides amins au cours de la traduction. Structure primaire : Squence linaire dacides amins dune protine. Structure tertiaire : Configuration spatiale ou tridimensionnelle dune protine par interaction entre diffrents acides amins la constituant.
50
Squence 4 SN12
Substitution : Mutation dun gne par remplacement dun nuclotide dans la squence. Terminaison : tape de la traduction correspondant la fin de la synthse dune protine par lecture dun codon stop. Thalassmie : Maladie sanguine hrditaire svre dont les symptmes sont proches de ceux de la drpanocytose. Traduction : Dcodage de linformation gntique porte par un ARNm en une protine. Transcription : Copie du brin transcrit dun gne en une squence complmentaire dARNm. Translocation : Transfert dun chromosome ou dune partie de celui-ci sur un autre chromosome. Elle est quilibre quand la totalit du matriel gntique est conserve et dsquilibre dans le cas contraire. n
Squence 4 SN12
51

Al7sn12tepa0111 Sequence 04

Încărcat de

Informații document

Drepturi de autor

Formate disponibile

Partajați acest document

Partajați sau inserați document

Opțiuni de partajare

Vi se pare util acest document?

Este necorespunzător acest conținut?

Drepturi de autor:

Formate disponibile

Al7sn12tepa0111 Sequence 04

Încărcat de

Drepturi de autor:

Formate disponibile

Squence 4

Lexpression du patrimoine gntique

Cned Acadmie en ligne

La synthse des protines

Quelques protines et leurs fonctions biologiques :

Donnes gnrales sur la nature chimique des protines

Cned Acadmie en ligne

Les acides amins

COOH (fonction acide)

Cned Acadmie en ligne

Les polypeptides Activit 2

acides amins) en utilisant 3 acides amins diffrents nots A, B et C.

2 En utilisant 3 des 20 acides amins diffrents, combien de tripeptides

Caractristiques structurales des protines

Dbut de la structure primaire dune protine : la chane de lhmoglobine.

Cned Acadmie en ligne

1 Quentend-on par structure primaire ?

Je suis charg ngativement

H bien moi jadore leau Je repousse le 4 mais je suis attir par le 9

Je suis tout petit Je suis aussi charg ngativement

Cned Acadmie en ligne

La relation entre gne et protine

Cned Acadmie en ligne

Un exemple chez un champignon : Neurospora

Cned Acadmie en ligne

1 Expliquer comment Beadle et Tatum ont obtenu des souches de Neu-

chacun par labsence de lune des enzymes de la voie de biosynthse de larginine.

Cned Acadmie en ligne

Cned Acadmie en ligne

Pipette qui maintient lovule

Ovule de souris avec noyau dovocyte et noyau de spermatozode

La transgense directe en action

Injection des fragments dADN extrieurs

Cned Acadmie en ligne

5 Comparer les rsultats des trois lectrophorses ralises afin de d-

relation un gne une protine .

est le lien fonctionnel entre gnes et protines?

et comment seffectue la synthse des protines?

Technique exprimentale : lautoradiographie

Cned Acadmie en ligne

Donnes exprimentales sur la synthse des protines

biologique que vous noncerez.

Actabulaire cultive avec de la mthionine (un acide amin) radioactive.

Actabulaire cultive avec de la thymine (un des bases de l'ADN) radioactive.

Les points noirs reprsentent la radioactivit.

Recherche de lintermdiaire entre le noyau et le cytoplasme

Cned Acadmie en ligne

Cellules aprs coloration

noyau color en vert cytoplasme color en rose

Synthse exprimentale de protines in-vitro

Quantit dARN ou dacides amins

Quantit dARN Quantit dacides amins incorpors Temps en minutes

1 Donner un titre au graphique et lexploiter pour expliquer la variation

de la quantit dacides amins incorpors dans les protines synthtises.

Cned Acadmie en ligne

2 En dduire une proprit de lARN que lexprience met en vidence.

Aprs 15 minutes on recherche la radioactivit.

quel mcanisme seffectue le transfert de linformation de lADN lARNm ?

2. La transcription de lADN en ARNm

Cned Acadmie en ligne

Comparaison de lARN et de lADN

Affichage en cascade sphres

Cned Acadmie en ligne

1 Comparer la structure de la molcule dARN celle de lADN.