Pdologie

Pdologie = Science de l'tude de la formation et de l'volution des sols sous l'action naturelle : climat, activit biologique, vgtation dans un paysage donn (plaine, valle, versant, etc.). Sol = Formation naturelle de surgace structure meuble d'paisseur variable rsultant de la transformation de la roche mre du sous-sol sous l'influence de facteurs physiques, biologique et chimiques (les facteurs principaux tant le climat, la nature de la roche mre, la vgtation et le temps et les secondaires correspondant au relief, l'hydrologie et l'Homme).

I. Principaux horizons d'un sol

On dfinit un horizon par une couche qui se diffrencie par certains caractres ou critres des couches sus- et sous-jacentes. Pour les identifier, on cre des fosses pdologiques d'environ 1m3. La succession verticale de couches que l'on obtient est le profil pdologique. [Fig 1] Le sol est divis en trois horizons : le A, le B et le C.

1) Horizon A
Horizon de surface : contenant plus de 25% de matire organique Horizon A00 = Litire qui contient des dbris organisuqes partiellement ou non dcomposs et donc reconnaissables (feuille, branche, excrments...) Horizon A0 F = Couche de fermentation dont les dbris sont en cours d'altration mais ils restent reconnaissables. On observe trs souvent des filaments myceliens qui parcourent la surface des dbris blancs et participent la dcomposition. H = Couche d'humidification dont les dbris sont entirement dcomposs et forment l'humus. Horizon de lessivage ou d'lluviation : modifie cause de l'invasion de l'eau Horizon organominral A1=AH contient moins de 25% de matire vgtale, qui vient de la couche H. On l'appelle aussi l'horizon AP car, une fois labour, il permet la rpartition des ressources minrales. Horizon A2 = E perd des collodes et des hydroxydes cause d'un lessivage maximal. Il possde un aspect gris clair et prsente une importante fertilit. Horizon A'2 est dgrad par la podzolisation ou processus d'appauvrissement.

Horizon de transition A/B = AB

2) Horizon B d'altration ou d'illuviation

Horizon d'accumulation B (B) concentre plus ou moins d'oxydes de fer selon le type de roche mre et est donc couleur rouille B est enrichi par illuviation (processus d'accumulation d'lments qui on migr d'un autre horizon) Horizon de transition B/C ou B3

3) Horizon C
Horizon parental 3 = C correspond un fragment de roche mre Horizon de transition C/R

4) Sous sol
[Cf TP]

5) Engorgement
Horizon pseudogley = Gg avec nappes d'eau temporaires. Le fer prcipite et l'eau s'vapore, il y a donc formation de rouille Horizon gley oxyd = Go avec des tches orcres Horizon gley rduit = Gr Cas particulier : Horizon tourbeux dans les tourbires

Horizons trangers = Tout support gologique n'ayant aucun lien de parent avec le sol au dessus Dchets

II. Les principaux constituants des horizons

1) Fraction minrale
a. Granulomtrie Granulomtrie = Rpartition des minraux par catgorie de grosseur On prend un extrait de sol que l'on place dans une prouvette dans laquelle on ajoute de l'eau. On secoue et on peut observer la redistribution dees particules selon leur densit/taille. Cela donne des renseignements sur la pdognse (= proprits fonctionnelles du sol, prsence de complexes absorbants), en lien avec la fertilit. Un autre processus mcanique permet de faire de la granulomtrie, le tamisage. L'intrt est qu'on peut valuer la masse donc c'est plus prcis. b. Classement des particules

[Fig 2] Il y a des diffrences selon les secteurs. Au niveau des argiles, on peut les diviser en trois couches : grossire, moyenne, fine. MEGA WARNING : Sable = aspect sableux Limon = aspect limoneux c. Classification des textures Diffrents des roches du mme nom

Elle est matrialise par un triangle tenant compte du pourcentage de sable, de limon et d'argile. Le deuxime triange de la Fig 3 est moins prcis. Il existe 4 grandes classes de texture : Sableuse : bien ar, facile travailler, pauvre en eau et en lments nutritifs, faible capacit

d'changes en anions et cations Limoneuse = excs de limon, insuffisance d'argile : structure massique avec des mauvaises proprits physiques. Cette tendance est corrige par une teneur suffisante en humus et en calcium. Argileuse : chimiquement riche mais mauvaises proprits physiques, quasiment impermable, mal ar donc un obstacle la pntration des racines. Cette tendance est corrige par un ajout d'humus. Equilibre = Franche : prsente les qualits mais pas les dfauts 25% argile, 30 35% de limon et 40 45% de sable d. Origine de la fraction minrale

Les minraux :

Quartz : Silice cristallis, il est considr a tort comme inaltrable. On peut le dissoudre. Entre 15 a 20 % de quartz dissout dans les climats humides et chauds. Gravier fabriqu en quartz. Silicate : Assemblage de silice sous forme de ttradre et d'aluminium sous forme d'octadre lot isol : pridot En chane, en bande : pyroxne, amphibole Sous forme de feuillets (phyllosilicate) : mica noir (biotite), mica blanc (muscovite) Organisation tridimensionelle (tectosilicate) : feldspaths Les lots isoles et les lments en chane contiennent du ferromagnsium, cela signifie qu'ils s'altrent facilement et rapidement. Quand on les rencontre, on sait que le sol contient du fer, du magnsium et du calcium. Les minraux sous forme de feuillets comme les micas s'altre par transformation, par des stades intermdiaires. Il perdent du potassium et du fer. Il se transforment en paillette de vermiculite Les diffrents types de feldspaths offrent une rsistance variable selon la teneur en silice. L'orthose, riche en silice, est peu altrable tandis que le plagioclase, riche en calcium mais pauvre en silice est altrable. L'altration forme des produits amorphes en climat froid tempr. En climat chaud, on obtient des argiles de noformation. Si on connait les minraux et le climat, on peut dterminer la teneur en mineraux du so. Les minraux accessoires :

Ils jouent un rle important dans la fertilit des sols. Ex : l'apatite (riche en phosphore) et la pyrite (riche en silice) etc... Certains fournissent des oligo-lments. Les minraux issus des roches sdimentaires sont les mmes que les minraux primaires des roches magmatiques mais contiennent beaucoup d'argile rsultant d'une altration antrieure. Les carbonates de calcium contiennent des calcites. Le carbonate de magnsium porte le nom de dolomite issu de la roche la dolomie. Les carbonates ont une utilisation biologique, ils ont pris naissance dans les eaux douces et sals. Ils s'altrent par dissolution de l'eau charge en CO 2 et donnent des bicarbonates. Les roches

Fig 4 : Elles peuvent tre magmatiques (volcaniques, plutoniques), sdimentaires ou

mtamorphiques. Roches magmatiques : cf TP

Axe suprieur : Roches tectoniques avec du verre volcanique et des minraux de petites taille (olivine amphibole...). La structure de la roche est microlitique. Axe infrieur : Roches volcaniques avec peu de verre et structure granulleuse. Fig 3 : Roches sdimentaires : possdent trois proprits pour la formation des sols : la composition minralogique, la granulomtrie et la duret. Les roches sont avec des morceaux de minraux roches clastiques. Marne : contient de l'argile et du calcaire Loess : dpt fin de limon contenant de la silice Calcaire : riche en carbonate Mixte Fig 6 : Roches mtamorphiques : Elles s'altrent comme les roches magmatiques. Ex : schiste, clogite e. Processus de formation du complexe d'altration

Pour les sols, il existe des complexes d'altration, ce qui consiste comparer la composition minralogique des horizons du profil du sol, surtout en prsence d'horizon de type B, et on compare les composition minralogique du sol et de la roche mre (horizon R, C). Cette comparaison est particulirement dmonstrative pour les sols forms sur des roches magmatiques (ex : granite). On trouve deux types : Minraux primaires morceaux hrits (ex quartz) Minraux secondaires (ex argile) processus physiques ou chimiques :

Ils peuvent tre altrs par des phnomnes biochimiques : intervention d'animaux comme le lombric, formation d'argile en particulier. Il peut aussi s'agir d'une altration gochimique : intervention de l'eau et des processus chimiques typiques des minraux. Un certain nombre de minraux primaires sont dtruits puis recomposs, c'est la noformation, la majorit sont des argiles. Pour dterminer la fraction minrale d'un sol, on commence par dterminer le complexe d'altration du sol. f. Les argiles

Ce sont des silicates d'aluminium plus ou moins hydrats, micro-cristallins en feuillets. Leur nom scientifique est : phyllites.

Proprits : charges ngativement, elles retiennent des cartions sous forme changeable elles peuvent absorber de l'eau entre leur feuillets gonflables elles peuvent se retrouver dans le sol l'tat disperc ou l'tat flocul elles peuvent former des laisons avec la matire organique (=ciment)

Il en existe trois types selon le nombre de couches : Deux couches Te Oc : Premire couche forme par des ttradres (1Si encadr par 3H) qui

sont assembls par leur sommet format un rseau hexagonal. Deuxime couche octadrique : atomes d'Al encadrs par des OH (liaison ttradre-octadre par les oxygnes). Il s'agit d'un feuillet lectriquement neutre ( + 12 (Al) - 6 (Si) 6 (HO-)). EX : Le kaolin Trois couches Te Oc Te : Le feuillet est lectriquement neutre avec la prsence de l'ion

magnsium. Elle peut fixer des cations. EX : la smectite dans le SMECTA, les vermiculites Trois couches Te Oc Te Oc :

Une structure intressante : Illite (3 couches) + vermiculite + vermiculite g. Les oxyhydroxydes

Il en existe trois : dsoxyhydroxyde de fer, de magnsium et d'aluminium. Il forment un ciment avec les argiles. On dit que le sol a une structure grumeleuse. Ils peuvent tre altrs de deux faons : biochimiquement (ils se transforment en sorte de gels amorphes) ou gochimiquement (ils cristallisent et donnent deux minraux : l'hmatite et la goetite). h. Les processus bioclimatiques de l'altration et cologie de l'altration

Il n'y a pas que la composition du matriau qui joue mais aussi les facteurs bioclimatiques (influence du climat sur la vgtation), et le facteur temps. Ex : un mme granite ne s'altre pas de la mme faon dans trois zones compltement diffrentes : une zone borale, une zone tempre, et une zone tropicale (sols compltement diffrents). Deuxime impact : il ne donne pas le mme complexe d'altration s'il s'agit d'un sol jeune (quelques milliers d'annes [un sol trs vieux : plusieurs centaines de milliers d'annes]). Les deux facteurs runis permettent de caractriser cinq zones d'altration l'chelle mondiale (fig 12) : Tous les dserts et les zones froides comme l'Arctique Canada et Sibrie : peu de transformations et formation de podzols (sol appauvri)

Europe moyenne : milieu acide Asie mineure, sud est amrique du sud ? Domaine de la noformation : sols qui ont des turnovers gigantesques, en particulier les

zones quatoriales et tropicales. Des grandes zones sont dfinies mais il y a des conditions de station plus locales : pH du sol nature de l'humus le plus important : conditions de drainage

Ces conditions modifient l'orientation gnrale de l'altration.

2) La fraction organique
a. Origine de la fraction organique et humidification

* Les diffrents types de matire organique La matire organique est divise en deux grands types : la matire organique vgtale riche en polysaccharides et en composs phnoliques et la matire organique animale (sans les djections) pauvre en polysaccharide, sans composs phnoliques car rapidement biodgradable, mais elle est trs riche en azote. Qui aime bien l'azote ? Les bactries !!! Cela dveloppe le monde microbien qui nous entoure et qui va raliser la destruction de la matire organique vgtale. Cette richesse en azote dtermine la dgradation et la transformation de la matire organique. On peut calculer un rapport Carbone/Azote (C/N), ce qui permet de voir l'tat de la matire organique du sol qu'on tudie. On distingue dans le sol la matire organique de surface ( horizon A00 ) et une matire organique dans le sol qui peut avoir plusieurs origines c'est--dire qu'elle peut provenir par exemple des lombrics qui enfouissent une grande partie de cette matire organique en profondeur. On peut faire un classement en fonction de l'humus : fig 16 savoir. [Exsudat foliaire = ce que produisent certains paquets de cellules dans les feuilles] Mga warning : Humus = matire organique non humifie ou en cours et la matire organique humifie. Fig 17 : C'est au niveau des racines qu'il y a un maximum d'change entre la plante et le milieu

environnant. * L'action des tres vivants Fig 18 : (Milieu qui contient le plus d'tre vivants : le sol.) * Le devenir de la matire organique du sol Fig 19 : rsume ce qu'on doit savoir 1 Litire dpose au niveau du sol. Cette MOF s'incorpore au sol soit par l'action des lombrics, soit par le travail de l'Homme. Trois catgories de substances une fois que c'est incorpor dans le sol. 2 90% de cette matire incorpore se dcompose rapidement : minralisation primaire qui donne des molcules simples. 3 Les molcules simples se perdent dans l'atmosphre (a), sont absorbes par les plantes (b), sont fixes par l'argile et l'humus (c ) formant le complexe argilo-humique, sont perdues par lessivage (d), sont utilises par les microbes (e). 4 Les composs vgtaux base de lignine, qui sont plus difficilement dcomposs, vont donner deux types de constituants soit au centre des composants phnoliques solubles soit des rsidus peu transforms en caca. 5 Les rsidus caca organiques peu transforms se mlangent plus ou moins bien aux matires minrales notamment par brassage dans le tube digestif du lombric. Cela donne de l'humine rsiduelle (ou hrite) d'o le nom du processus : humification par hritage. 6 Les composs de caca phnoliques solubles subissent la polymrisation (oxydation plus condensation) et donc vont donner des molcules de plus en plus grosses. Elles sont d'abord solubles puis vont devenir encore plus grosses et insolubles. Ce processus de polymrisation se termine par une sorte de pte : l'humine de solubilisation, totalement insoluble. C'est l'humification par l'insolubilisation. 7 Les micro organismes mangent ces molcules. A leur mort, il va rester des substances fortement lies la matire minrale et qui sont insolubles (l'humine de nosynthse microbienne ou l'humine microbienne). => L'ensemble des ces trois humines forme la partie la plus insoluble, la plus stable et de qualit de l'humus qu'on appelle humine de caca. 8 Il y a d'autres micro-organismes qui vont attaquer ces composs de l'humus et les

retransformer en molcules simples. Ce processus est appel la minralisation secondaire. Question type partiel : De quoi est compos l'humus ? * Constituants de l'humus Fig 19 * Principaux types d'humus On va se limiter aux humus du climat tempr sinon ce serait trop long. Fig 20? 29 b. Le complexe argilo-humique

= un ensemble de molcules associes avec en particulier prsence d'argile, d'humus, de cations et d'eau. Lorsqu'ils sont prsentes ces CAMs, ils permettent d'augmenter la stabilit de la structure du sol, et augmentent la capacit d'change cationique. Fig 31 : Humus, feuillets d'argile chargs ngativement. Pour faire la liaison entre eux, il faut soit des cations (Calcium), soit des oxyhydroxydes (en particulier de fer ou d'aluminium). Il se peut aussi que certains argiles voient leurs feuillets chargs positivement leurs extrmits. Si on gorge d'eau un sol, les ions calcium n'assurent plus le contact entre l'argile et l'humus (problme de structuration d'un sol). A l'inverse, lorsqu'un sol est charg d'humus, a permet une association plus importante argile-humus et la structure du sol devient plus rsistante. Donc les deux facteurs influenant la structuration du sol sont la quantit d'eau et d'humus.

III. Les proprits globales du sol : organisation des particules, structure, aration
Structure = Mode d'assemblage des particules. La structure s'observe et se dcrit deux niveaux : chelle macroscopique, chelle microscopique (microstructure). Au niveau microscopique, la structure dtermine la rpartition dans l'espace de la matire solide et des pores (= vides) dans le sol, certains occups par de l'eau et d'autres occups par de l'air. En fonction de cette rpartition, a conditionne l'ensemble des proprits physiques fondamentales du sol c'est--dire aration (respiration des racines), rtention d'eau, rserve d'eau. Diffrence entre rtention et rserve : certains sols possdent de l'eau mais la perde en priode sche, d'autres sols possdent la mme quantit d'eau mais en priode sche en on de disponible.

On classe les pores en plusieurs catgories : Pores grossiers occups par de l'air (diamtre suprieur 50m) aprs passage des pluies. Pores moyens (diamtre entre 50 et 10m) ressuys de faon trs progressive et tantt

occups par de l'eau, et tantt par de l'air selon les conditions mtorologiques. Les pores fins (diamtre entre 10 et 0,2m) qui retiennent l'eau capillaire (eau absorbable

par les racines) Les pores trs fins (diamtre infrieur 0,2m) occups par de l'eau lie (non absorbable

par les racines) On peut comparer deux types de structures qui seraient opposes pour deux sols avec la mme granulomtrie (ex : deux sols limoneux) : Une structure agrgats dans un milieu ayant une forte activit biologique (vivante), ces

agrgats sont dits construits . Une structure particulaire dans laquelle aucun agrgat n'a pu se former. Dans ce cas, la

quasi-totalit des pores grossiers a disparu.

1) Origine des structures

a) tat des collodes : formation de ciments Les collodes sont des argiles et des composs humiques qui sont lctrongatives. Ca reprsente dans le sol la fraction essentielle des ciments. En fonction des conditions du sol, c'est--dire prsence d'eau, type de roche mre et quantit d'humus, on aura plusieurs types de structure. b) La structure Dans certains sols, on a une microflore (en particulier les champignons ) extrmement prsente qui favorise la formation de ciments organo-minraux permettant l'tablissement d'agrgats. Il y a galement une mso-faune et une macrofaune qui peuvent agir sur ces ciments. Comment ? Par exemple, le lombric mange des petits lments qui sont agglomrs dans leur tube digestif. On appelle cela des micro-agrgats. c) Structures ciment d'origine chimique

Ils sont prcipits, ou forms par prcipitation partir de composs l'tat soluble. CaCO3, oxyhydroxydes, silice...

Suivant la nature et l'tat du ciment chimique, la structure obtenue est soit de qualit, soit elle est meuble, soit elle est massive (ou durcie). d) Les structures d'origine physique et mcanique (fragmentation) Elles rsultent du changement de volume des argiles li aux changements saisonniers. Les deux grandes priodes entranent des structures en retrait (avec des fentes de retrait voire dessiccation) ou gonfls o le sol est quasiment impermable (peu d'intrt agricole).

2) Classification des structures

Classification gntique (mode de formation) Structure particulaire, ou meuble : sols riches en sable ou en sable et en limon (structure trs

grossire) Structure massive ou cohrente : texture fine, que des limons, mais insuffisance en ciment. Il

y a souvent quelques dpts de minraux en pellicules d'lments chimiques, en particulier des oxydes de fer et d'aluminium. mre. Structure par fragmentation : sols qui schent trs vite et qui prsentent trs souvent des Structure construite : prsence de ciments organo-minraux qui sont d'origine biologique Structure prcipite : activit faible au niveau biologique et impact trs important de la roche

fentes de dessiccation (rgions semi-dsertiques) Structure mixte : mlange de plusieurs structures

3) Contrle de l'tat de la structure : la porosit

Dfinition de la porosit : Volume des vides (pores) exprim en pourcentage du volume total. Divis par deux, on obtient la capacit en air et capacit en eau. La densit relle est note D (fraction solide du sol). L'appareil qui permet de mesurer cette densit est un pycnomtre. On fait une correction soustractive : on calcule la densit apparente D' (densit du sol sec). Elle varie entre 1 et 2. Porosit totale = D x D' / 100 La porosit totale se subdivise en deux : la porosit fine qui retient l'eau et porosit grossire qui correspond de l'air principalement. Capacit au champ = eau utile + eau lie (non utilise par la plante) & point de fltrissement = expression en volume de l'eau lie.

Fig 32 36. [Fig 36 : profil II le plus intressant]

FIN
partiel : question sur les horizons, les types d'humus, a quoi correspond le complexe d'altration, qcm, analyse d'un sol (td)