Bioqumica I: Macromolculas I. Fracionando a vida: Os bioqumicos fracionam um organismo e analisam os componentes individuais.

1) Qual a composio atmica das clulas vivas/organismos? H: 60% O: 25% C: 12% N: ~5% P, S, Mg, Mn, Se, tambm esto presentes em quantidades menores Em certos nveis de estudo, a maioria dos organismos parece igual especialmente a nvel celular. 2) Qual a composio molecular das clulas? Principalmente gua: ~80% O restante: Lipdios, gordura: 10% Carboidratos: 15% Protenas: 50% cidos Nuclicos: 15% ** As protenas so as macromolculas-chave, tm diversos papis estruturais e funcionais nas clulas) ** cidos Nuclicos (DNA, RNA; DNA armazena as informaes hereditrias na clula) At certo nvel, foras qumicas determinam a forma das molculas e a forma determina a funo. Que foras fornecem s molculas suas propriedades? II. Foras Covalentes Ligaes e interaes qumicas mantm as molculas juntas: 1) Ligaes Covalentes - tipo mais importante de ligaes - tipo de ligaes mais fortes fora ~80 kcal/mol Uma ligao covalente o compartilhamento de um par de eltrons:

A energia trmica (vibracional) mdia em temperatura ambiente em mdia ~5 kcal/mol. Considerando-se que so necessrios ~80 kcal/mol para quebrar uma ligao covalente, pode-se dizer que elas so relativamente estveis temperatura ambiente. Tipos de ligaes covalentes: Simples C-C (um par de eltrons) Dupla C=C (dois pares de eltrons) Tripla C=C (trs pares de eltrons) Fora 80 kcal/mol 150 kcal/mol 200 kcal/mol

Existe uma rotao livre ao redor de uma ligao covalente simples, porm isso no ocorre com as ligaes duplas e triplas. As ligaes covalentes tambm possuem um ngulo fixo. Algumas ligaes covalentes envolvem o compartilhamento desigual de eltrons. Alguns tomos esto ligados aos eltrons de forma mais forte do que outros tomos. A tendncia para atrair eltrons a chamada medida de eletronegatividade de um tomo. Observe algumas ligaes com compartilhamento desigual de eltrons:

As ligaes polares apresentam movimentos bipolares; possuem polaridade O oxignio um tomo mais eletronegativo quando comparado com o hidrognio e, portanto, uma ligao O-H considerada uma ligao polar. Carbono e hidrognio possuem eletronegatividades semelhantes. Dessa forma, uma ligao C-H considerada uma ligao apolar. 2) Ligaes de Hidrognio

atrao entre uma carga levemente positiva em um tomo de hidrognio e uma carga levemente negativa em um tomo prximo fora da ligao ~ 5 kcal/mol (relativamente fraca) mais forte quando o doador, o hidrognio, e o receptor esto a uma distncia de mais ou menos 0,25nm as ligaes de hidrognio fornecem ordem e estrutura s molculas uma nica ligao de hidrognio fraca, mas a maior parte das molculas so compostas por diversas ligaes de hidrognio, fato esse que proporciona fora geral molcula

As propriedades da gua so determinadas por interaes de ligaes de hidrognio. A gua muito bem estruturada, mesmo sendo um lquido. A formao do gelo deve-se ao conjunto de redes de ligaes de hidrognio.

3 Ligaes de hidrognio entre regies diferentes de uma molcula de protena:

NA gua, essas regies iro formar ligaes de hidrognio com as molculas da gua. Essas molculas adotam uma conformao mais favorvel, quando elas interagem com gua.

3) Ligaes Inicas interao eletrosttica entre dois grupos de cargas opostas em uma molcula causa limitante do compartilhamento desigual de eltrons; um tomo fica com o eltron NaCl Na+ + Cl- compartilhamento desigual de eltrons, Cl fica com ambos os eltrons. Em soluo, esse grupo torna-se ionizado, perde um prton e fica com carga negativa:

4 tomos carregados podem ser atrados por tomos de carga oposta:

a fora da ligao inica de aproximadamente 3-7 kcal/mol, mais forte quando os dois tomos esto a uma distncia de aproximadamente 0,28mm

4) Interao de Van Der Walls fora de atrao no especfica que est presente quando qualquer um dos dois tomos chega a uma distncia menor mais favorvel quando os tomos esto a uma distncia de aproximadamente 0,2-0,3 nm polaridade transitria induziu entre tomos uma ligao apolar que leva atrao dos tomos prximos interao muito fraca fora ~ 1 kcal/mol. No entanto, a soma de diversas interaes de Van Der Walls leva a um aumento da fora e estabilidade Exemplo: Um ligante interagindo com seu receptor completado por diversas interaes no-covalentes tais como as interaes de Van Der Walls. 5) Interaes Hidrofbicas / Entropia De maneira geral, a estrutura de uma molcula mantida por diversas interaes. Uma molcula tem uma forma particular porque adota o estado de menor energia (minimiza entropia) Ao adotar essa forma, as conformaes alternativas so selecionadas e os grupos que no podem formar pontes de hidrognio com a gua (hidrofbicos) tendem a aglomerar-se dentro da molcula (longe da gua). Hidrofbico: (odeia gua) molculas sem carga, apolares, no interagem com a gua Hidroflico: (ama gua): molculas com carga ou polares, de ligaes de hidrognio com gua A forma que as macromolculas biolgicas podem adotar depende de um grande nmero de interaes moleculares. III. Principais Macromolculas A. Lipdios, Fosfolipdios Estrutura de um carboidrato: CH3 (CH2 )3 CH3

Se adicionarmos um grupo hidroxila (OH) a um carboidrato, teremos um lcool: CH3 (CH2 )4 OH

lcoois de cadeia curta so solveis em gua. Podemos criar um cido graxo adicionando um grupo carboxila (COOH) ao grupo dos carboidratos: CH3 (CH2 )3 COOH

Um cido graxo uma molcula anfiptica contm tanto pores hidrofbicas quanto pores hidroflicas. Um cido graxo tambm pode ser representado por:

6 Trs cidos graxos e uma molcula de glicerol podem ser combinados em uma sntese de desidratao para formar um lipdio (um triglicride). Triglicrides so formas principais de armazenamento de cidos graxos dentro das clulas.

Fosfolipdeos: Um subgrupo de lipdios que desempenha um papel-chave na estrutura celular. Fosfolipdios so formados por dois cidos graxos e um grupo fosfato:

7 Os fosfolipdeos tambm podem ser representados como:

em soluo, os fosfolipdios iro se reunir para formar micelas

Uma micela

Os fosfolipdeos formam uma bicamada em soluo aquosa. Uma clula tpica englobada por uma membrana plasmtica, que composta de uma bicamada de fosfolipdeos (2 camadas de molculas de fosfolipdeos dispostas em uma bicamada lipdica) O interior hidrofbico da membrana plasmtica impermevel s molculas carregadas ou polares.

B. Acares, Carboidratos 1) Frmula geral de um acar: (CH2 O)n ex.: Glicose C6 H12 O6

Em todos os acares, n-1 dos carbonos possuem um grupo hidroxila (OH) e o Carbono C1 possui um grupo carbonil (C=O). A localizao do grupo carbonil e a orientao dos grupos hidroxila determinam o tipo de acar. Se o grupo carbonil estiver no final (um grupo aldedo), ento o acar uma aldose (ex.: glicose) Se o grupo carbonil estiver no meio da cadeia (um grupo cetona), ento o acar uma cetose (ex.: frutose) Acares compostos por seis tomos de carbono so chamados de hexoses (ex.: glicose) Acares compostos por cinco tomos de carbono so chamados de pentoses (ex.: ribose)

9 Os acares compostos por trs tomos de carbono so chamados de trioses (ex.: gliceraldedo) 2) Conformao dos acares a) Monossacardeos A glicose encontrada com mais freqncia em forma de anel em soluo:

A orientao do grupo OH no carbono C-1 pode ser tanto alfa (abaixo do plano do anel) ou beta (acima do plano do anel) b) Dissacardeos Os dissacardeos so formados por dois monossacardeos unidos por uma ligao covalente:

Lactose (forma) (Galactose (1 4) Glicose) A enzima lactase quebra a lactose em glicose e galactose. Muitos indivduos adultos param de sintetizar a enzima lactase. Como resultado, uma grande porcentagem de certas populaes torna-se intolerante lactose. c) Polissacardeos Polissacardeos so formados por diversas unidades de monossacardeos (geralmente monmeros de glicose) ligados para formar cadeias longas. ex.: amido, glicognio, celulose Polissacardeos so usados como uma forma de armazenar energia e tambm para funes estruturais. Amido um polmero de Glicose (1 4) ligao

10 Celulose desempenha um papel importante nas plantas, uma das molculas mais abundantes na terra. um polmero no ramificado de glicose em ligao (1 4). As unidades alternantes de glicose possibilitam que as molculas adjacentes de celulose formem ligaes de hidrognio umas com as outras. A capacidade das ligaes de hidrognio da celulose leva fora das paredes celulares e de fibras tais como a madeira. Bioqumica II: Protenas Protenas

possuem diversas funes nas clulas papis estruturas e funcionais 105 tipos diferentes de protenas so produzidas por clulas eucariticas

As protenas so polmeros de blocos de construo conhecidos como aminocidos 20 aminocidos diferentes podem resultar em 20n combinaes de protenas de extenso n cidos Nuclicos armazenam e transferem material gentico quatro diferentes blocos de construo chamados de nucleotdeos podem resultar em 4n combinaes diferentes de cidos nuclicos de extenso n 1. Amino cidos e Ligaes Peptdicas Frmula Geral dos Aminocidos:

O grupo R (cadeia lateral) varia ao longo de 20 aminocidos diferentes. Os 20 aminocidos diferentes compem todas as protenas. Peptdeos so oligmeros de aminocidos formados: atravs de uma reao de desidratao quando o grupo carboxila do peptdeo est ligado ao grupo amino de um segundo aminocido.

11

A ligao peptdica plana, tem carter parcial de dupla ligao. No h rotao ao redor da ligao amida. A estrutura real da ligao peptdica um hbrido das duas formas apresentadas abaixo:

No entanto, existe a rotao ao redor das ligaes adjacentes ligao peptdica. Uma unidade peptdica uma disposio plana de quatro tomos. Um polipeptdeo longo composto por diversos aminocidos chamado de protena. Cada protena possui uma ordem especfica de aminocidos e adota uma forma particular determinada pela seqncia de aminocidos. 2. Os Vinte Diferentes Aminocidos a. Cadeias laterais polares porm sem carga As cadeias laterais desses grupos podem foram ligaes de hidrognio com outros grupos polares

b. Cadeias laterais polares e carregadas

12 As cadeias laterais desses aminocidos podem formar ligaes de hidrognio ou ligaes inicas 1. Com cargas positivas

2. Cargas negativas

c. Cadeias laterais hidrofbicas (apolares, sem carga) As cadeias laterais da maior parte dos aminocidos no pode formar ligaes de hidrognio ou ligaes inicas e comportam-se melhor em ambientes apolares. Tais aminocidos preferem ficar no interior das protenas em uma soluo aquosa.

13

Apesar do fato da Tirosina ser fortemente apolar, sua cadeia lateral possui um grupo hidroxila que polar e pode formar ligaes de hidrognio. Algumas protenas so chamadas de protena transmembrana. Uma regio de protenas transmembrana atravessa a membrana da clula ou o compartimento celular no qual elas so encontradas

14

d. Casos especiais

3. Estrutura das Protenas Para entendermos a estrutura das protenas uma combinao de foras determina a estrutura: efeito hidrofbico ligaes inicas ligaes de hidrognio ligaes de dissulfeto

15

Dcada de 30: Linus Pauling props que o grupo NH em um aminocido, e o grupo C=O em outro aminocido(s) podem interagir para formar uma ligao de hidrognio. Ele previu que esses grupos iriam interagir, resultando em uma estrutura polipeptdica (polipetdica) chamada de hlice a (hlice alfa). EM uma hlice a ()o grupo CO do aminocidos n liga-se ao hidrognio (no do) grupo NH do aminocido(s) (n+4). Estrutura da a -hlice:

Pauling previu tambm outro tipo de estrutura polipeptdica (polipetdica) chamada de folha beta pregueada (folha pregueada). Na estrutura pregueada, existem atraes intermoleculares entre duas ou mais cadeias polipetdicas:

(NR)* Cadeias antiparalelas so cadeias opostas, so paralelas mas em direo contrria. No so no paralelas como se se apresentam na figura acima.

16 Nveis de Estrutura de Protena: a) Estrutura primria:

A seqncia linear de aminocidos (ex.: NH3 +..met-cis-leu-lis-gluCOO-)

b) Estrutura secundria A disposio local dos aminocidos prximos na cadeia linear para formar estruturas como hlices, - folhas pregueadas e alas e molas aleatrias.

c) Estrutura terciria Disposio espacial de aminocidos afastados na cadeia do polipeptdio (polipetdeo) linear para formar a estrutura tridimensional completa (dobrada) da protena. Tambm inclui ligaes de dissulfetos :

d) Estrutura quaternria Interao de mais de uma cadeia polipeptdica (polipetdica); associao entre protenas diferentes para formar complexos como dmeros, trmeros, tetrmeros:

4. Estrutura e Funo das Protenas A estrutura determina a funo das protenas. Veja um exemplo de protena que catalisa uma reao bioqumica. Triose fosfato isomerase (TFI) TFI uma protena dimrica composta (um dmero de protena composto) de duas cadeias polipeptdicas (polipetdicas) de 247 aminocidos cada uma. O polipeptdio (polipetdeo) dobra-se para formar uma enzima em forma de cesta com um poo no centro. APENAS O DMERO ENZIMATICAMENTE ATIVO! A TFI catalisa a seguinte reao:

17 Apesar de essa protena possuir 247 aminocidos, apenas trs deles (Glu165, His95 e Lis12) so importantes na funo cataltica da TFI. O stio cataltico (ativo) formado quando a protena dobra-se em sua forma 3-D final e os trs aminocidos ficam prximos. Observe o stio ativo da TFI:

Mecanismo: 1) G 3-P liga-se ao stio ativo da TFI (N de His95) 2) Lys12 estabiliza G 3-P no stio ativo 3) Glu165 age como um catalisador bsico (B-) pega um H+ do grupo C2 (o carbono prximo ao carbonil) do G 3-P 4) His95 doa um a H+ para o grupo C1 (carbonil) de G 3-P para formar o grupo OH em C1. (e facilita a formao do enediol intermedirio) 5) Glu165 pega o H+ do grupo C1 do intermedirio. 6) His95 pega o prton do grupo OH no grupo C2 do intermedirio TFI estabiliza (diminui a energia do intermedirio) o intermedirio fortemente desfavorvel, que possui uma energia livre positiva bem maior do que o G 3-P ou o DHAP (uma energia livre bem mais positiva do que G 3-P ou DHAP).

A TFI tambm acelera 10 vezes a reao. O aminocido que estabiliza o estgio de transio o Glu165. Se substituirmos Glu165 em TFI pelo cido asprtico (que apenas um carbono mais curto do que a glu), reduzimos a atividade da enzima em 1000 vezes (TFI torna-se 1000 vezes menos eficaz)
ARTIGOS DO WASHINGTON POST, 21/5/93 pg. A3 Influenzas Burglary Tools de Boyce Rensberger e NY TIMES, 21/5/93 Breakthrough on Flu Viruses Reported de Warren E. Leary

18 Bioqumica III: Energia Livre e Reaes cinticas (Reao Cintica) TFI catalisa a seguinte reao:

Diagrama de Energia Livre para a Reao Acima:

TFI diminui a energia de ativao (Ea) da reao. TFI faz isso ao estabilizar o estgio de transio (cis-enediol) TFI (como com todas as enzimas) no afeta os (dos) valores de G' de uma reao qumica. 1.Equlbrio da Reao, Keq e Energia Livre Em equilbrio, as molculas tendem a permanecer em seu estado energtico mais baixo. Dois estgios, S1 e S2 com diferenas de energia entre os dois expressas como G' = variao na energia livre sob as condies padronizadas (as condio normais).

A equao que relaciona G s concentraes de S1 e S2:

G = Diferena de Energia Livre na Reao G= Energia Livre em condies padronizadas especficas RT = constante de gs x T (em Kelvins) [S1]/[S2] = razo entre os produtos e os reagentes

19 Em equilbrio para a reao,?G = 0 ( no h variao lquida de energia livre ) (no h reao lquida)

RT = 0,59 kcal/mol a 25C, RT = 0,61 kcal/mol a 37C ento RT ~0,6

Keq = razo das constantes

razo da reao dianteira = K1 [S1 ] razo da reao reversa = K2 [S2 ] K1 [S1 ] = K2 [S2 ]

Exemplo: G3P DHAP (G0 = -1,86 kcal/mol)

Em equilbrio

Keq = 22 Em equilbrio haver 22x mais DHAP do que G3P Dado G3P puro: A reao prossegue DHAP (sntese lquida de DHAP) Dado DHAP puro: A reao prossegue para formar G3P (sntese lquida de G3P) Quando G3P = DHAP G Rxn = 0 (no h variao lquida) Is 22:1

20 ~ 7:1 A reao prossegue para a direita DHAP A direo de uma reao depende de: 1) diferena da energia intrnseca entre os produtos e os reagentes 2) as concentraes das reaes e dos produtos Isso descrito pela equao:

21 Se G de rxn < 0, rxn prosseguir adiante (reao exergnica) Se G de rxn > 0, rxn prosseguira reversamente (reao endergnica) Se G = 0, rxn est em equilbrio, no h variao lquida de energia livre Exemplo: SE a razo de DHAP: G3P fosse 7,4:1, qual seria o G do rxn e em qual direo prosseguiria? G = G 0 + RT In

G = -1,86kcal/mol + 0,60kcal/mol In 7,4 G = -0,66 (G<0) Portanto, a reao prosseguir adiante para produzir DHAP 2. Reaes Acopladas Observe a reao A B A reao tender a prosseguir na direo da molcula que apresenta a menor energia livre. Como impulsionamos uma reao para frente que possui um G0 > 0? possvel acoplar uma reao desfavorvel ( G>0) com uma reao favorvel ( G<0) Algumas vezes o acoplamento pode resultar em condies desfavorveis, mas geralmente mais favorvel que a reao original no acoplada. Rxn 1: AB G0 > 0 Rxn 2: CD G0 < 0 A+CB+D G0 < 0 (poderia ser inferior a 0 ou prximo de 0) Exemplo: A + X B C D +X A + C B+ D (reao geral) As clulas usam esses mecanismos de acoplamento de reaes desfavorveis com reaes favorveis para que as reaes possam prosseguir adiante. Exemplo: 1) Glicose + Pi Glicose 6-Fosfatase + H2 O G0 = 3,3 kcal/mol 2) ATP + H2 O ADP + Pi H2 O = -7,3 kcal/mol Glicose + ATP Glicose 6-P + ADP G0 = -4,0 kcal/mol As clulas usam a energia da hidrlise do ATP para dirigir a reao 1 energeticamente desfavorvel. Pi = PO4 3 - fosfato inorgnico O ATP uma fonte principal de energia. O ATP armazena energia aproximando cargas negativas em ligaes altamente energticas e libera essa energia quando a ligao quebrada.

[REAGENTES ]

[PRODUTO ]

22 Todas as reaes que ocorrem nas clulas (1000) possuem G < 0 * As enzimas aumentam a taxa de reaes; no entanto, elas no alteram as concentraes de equilbrio ou G para a reao. 3.1 Taxas de Reao e o Papel das Enzimas Para a reao G3P DHAP Observe o perfil energtico da reao

Energia de ativao (Ea) = barreira energtica ou energia livre de ativao para a reao. Enzima (TFI) reduz a Ea estabilizando (reduzindo a energia livre de) estado de transio (intermedirio).

Na presena de TFI, a Ea para a reao de 3 kcal/mol Em equilbrio G = 0, a energia de ativao de 26 kcal/mol

Em equilbrio, existem ~1019 mais G3P do que cis-enediol (ou 10-19 menos cis-enediol do que G3P). Portanto, a reao prossegue lentamente na ausncia da enzima. Na presena da enzima, G = 13 kcal/mol. TFI estabiliza a cis-enediol intermediria, reduzindo assim sua energia livre de 26 kcal/mol para 13 kcal/mol. Em equilbrio G=0; a energia de ativao de 13 kcal/mol:

23 Em equilbrio, existe ~1010 mais G3P do que cis-enediol (ou 10-10 menos cis-enediol do que G3P). A razo de [cis-enediol] para [G3P] 109 vezes melhor na presena da enzima TFI. Mas como sabemos que as enzimas reduzem a Ea para a reao ligando-se ao estgio de transio? Porque os anlogos do estgio de transio (molculas estveis) que se parecem com o estgio de transio ligam melhor as enzimas do que qualquer reagente ou produto. Papel das Enzimas nas Reaes Qumicas: Uma reao pode ser exergnica, mas ter muita Ea; portanto, precisamos de uma enzima para reduzir a Ea Uma reao pode ser endergnica e no prosseguir a no ser que esteja acoplada a uma reao exergnica. Uma enzima pode catalisar a reao acoplada, permitindo, portanto, que a reao prossiga Reaes exergnicas ( G<0), reaes endergnicas ( G>0) 4. Cintica das Enzimas (Cintica de Michaelis-Menten 1913) Podemos obter um modelo do mecanismo da reao enzimtica da seguinte forma:

S = substrato E = enzima ES = complexo enzima substrato P = produto K1 = Constante de taxa de reao adiante K2 = Constante de taxa de reao reversa K3 = Taxa de reao adiante

K1= ((# moles/L de ES formado.)/seg)/((# moles/L de E)(# moles de S)) = 1/ (mol/L x seg) unidades K2= ((# moles/L de S formado.)/seg)/((# moles/L de ES) = 1/seg unidades K3= ((# moles/L de P formado.)/seg)/((# moles/L de ES) = 1/seg unidades

24 1) Taxa Cataltica A taxa cataltica igual ao produto das concentraes de ES e K3 V = K3[ES] V = velocidade ou taxa de reao 2) A frao (f) da enzima ligada ao substrato :
f =

[ES ] [ET ]
[S ] [S ] + K

[ET] = Concentrao total da enzima [ET] = Concentrao da enzima ligada f = frao da enzima ligada ao substrato
m

f =

[ES ] = [ET ] [S ] [S ] + K m

km =

k2 k 3 = Constante de Michaelis K1

1 1 + moles k m = sec sec = units 1 1 (moles) ( sec ) Km uma medida da afinidade de uma enzima por seu substrato

Qual a frao (f) da enzima ligada quando: 1) [S] = Km frao da enzima ligada =

2) [S] << Km frao de enzima ligada depende da afinidade da enzima por seu substrato

3) [S] >> Km frao ligada 1 (enzima limitada toda ligada com o substrato)

A Taxa de Reao V = K3 [ES]; substituindo na equao:

25 A taxa mxima de reao (Vmax) obtida quando a enzima saturada com o substrato [S] aproxima-se de 1 (f =1) (quando [S]>> Km) and [S] + K m V = K3 [ET ] (1) Vmax= K3 [ET ] Ento V =

Vmx [S ] Equao de Michaelis-Menten [S ] + K m

Observe a representao grfica da velocidade de reao como uma funo da concentrao do substrato [S], para um enzima que obedece cintica de MichaelisMenten

1) [S] baixa 2) [S] alta 3) [S] = Km

([S] no denominador no mais importante) (Valor de Km no denominador no importante) ento V= Vmax (j que Km = [S]) ento V = Vmax

Km a [S] na qual metade da enzima est ligada ao substrato Qual a velocidade da formao do produto: Per [E], per [S] Quando [S] pequena, a maior parte da enzima est livre[E] = [ET]

26

Kcat = # transferncia; # do molcula transferida pela enzima por unidade de tempo para formar um produto

V = K3 / Km = Kcat Para a Triose Fosfato Isomerase: K1 = 108 l/(moles x seg) K2 = 430/seg K3 = 430/seg K3 / Km = Kcat = ~ (108 produtos)/(reagentes x enzima x seg)

A taxa da reao de TFI limitada apenas pela difuso; sempre que a TFI encontra a G3P, a TFI converte a G3P em DHAP A taxa de difuso de ~108 (portanto a enzima raramente encontra o substrato) TFI , portanto, cineticamente perfeita sempre que encontra o substrato, converte o mesmo em seu produto

7.012 Material Suplementar sobre Cintica das Enzimas (de 10/9/97). suplemento para o Captulo 6 de Purves et al. Bioqumica IV: Metabolismo Energtico Reviso de Cintica Estrutura do ATP em pH 7.0:

27

existe uma grande repulso eletrosttica entre os grupos fosfato com cargas negativas. A hidrlise do ATP para ADP + Pi libera energia livre e reduz a repulso Como se produz ATP (energia para as clulas)? Atravs de um processo conhecido como Gliclise (glico acar, lise quebra) Na gliclise, 1 molcula de glicose convertida em 2 molculas de piruvato

Eficincia energtica desse processo: Com Oxignio: C6 H12 O6 + 6H2 O 6CO2 + 6CO2 + 6H2 Oproduz 686 kcal/mol

28 Sem Oxignio: C6 H12 O6 2 lactatos 2 ATPs C6 H12 O6 2 etanol + CO2 2 ATPs A gliclise ocorre no citoplasma das clulas, no necessita de oxignio e ocorre em todos os organismos ~ h 3,5 bilhes de anos: no havia oxignio suficiente portanto os organismo possuam um metabolismo anaerbico ~ h 2,5 bilhes de anos: havia oxignio suficiente para realizar metabolismo aerbico A gliclise pode ser realizada nos extratos de leveduras (i.e. as leveduras vivas no so necessrias, apenas as enzimas. O termo enzima significa na levedura) A gliclise possui duas fases: 1) Fase de investimento de energia (usa ATP) 2) Fase de gerao de energia (produz ATP) Resumo das Reaes da Gliclise: Composta por 10 etapas: 1 acar de 6-carbonos convertido em molculas de 2 3carbonos.

Uma observao importante: A reao G3P DHAP apresenta G = -1,86 kcal/mol No entanto, na gliclise DHAP convertido em G3P. Dessa forma G dessa reao + 1,86 kcal/mol! Como a reao prossegue nas clulas?? Uma vez que o G3P usado em reaes posteriores, a [G3P] diminui, o que direciona a reao para a direita, produzindo mais G3P. Mesmo que G> 0, o valor de G < 0 em virtude da razo de produtos/reagentes

29

G = G 0 + RT In

[REAGENTES ]

[PRODUTO ]

Na clula, todas as reaes prosseguiro adiante uma vez que G < 0 (obtido mantendo-se uma razo tima de produtos / reagentes) TABELA DE valores de G e G das reaes na gliclise. Observe que grande parte de G > 0, mas todos os valores de G so < 0 Portanto, a reao prossegue formando o piruvato! A Quinase uma enzima que adiciona um grupo fosfato molcula. Regulao das Vias O objetivo da gliclise produzir ATP. O ATP produzido usado em outras reaes na clula (reaes biossintticas, transporte, etc.) A clulas sente a razo de ATP/ADP por exemplo: quando os msculos esto trabalhando intensamente, o ATP convertido em ADP

se a [ATP] for alta, a gliclise baixa se a [ATP] for baixa, a gliclise iniciada (aumento de ADP ativa a gliclise)

possvel variar as velocidades de reao (v) das enzimas na gliclise trocando-se as variveis na equao:

Para Aumentar a Taxa de Gliclise: 1) Aumentar [ET]; produzir mais enzimas por exemplo: aps a ingesto de altos nveis de carboidratos os nveis de piruvatoquinase aumentam 2) Aumento da [S]; se aumentarmos a quantidade de substrato, aumentaremos a frao (f) da enzima que ocupada pelo substrato:

3) Se Km for alterado poder afetar a taxa da reao se Km for mais alto taxa mais lenta se Km mais baixo taxa mais rpida possvel alterar Km de uma enzima variando-se a forma do stio ativo (stio cataltico) da enzima

30 Exemplo:

A ligao dos reguladores no stio alostrico leva a uma variao da forma da enzima o que afeta o Km da enzima.

Se diminuirmos Km a taxa (v) aumenta porque f ser aumentado tambm Se aumentarmos Km a taxa (v) diminui porque diminumos f

A ligao dos reguladores no stio ativo altera o stio a posio de alguns aminocidos muda em alguns angstroms suficiente para inativar a enzima. Regulao das Vias: Regulao de Feedback e Feed-Forward A maior parte das enzimas que catalisa reaes nas vias bioqumicas regulada. Exemplo de Via

1) F pode agir como um inibidor de feedback da enzima que catalisa a etapa C D (primeira etapa comprometida na sntese de F 2) I pode agir como um inibidor de feedback da enzima que catalisa a etapa C G para reduzir a velocidade daquela etapa 3) Tanto I quanto G juntos ou sozinhos podem agir como inibidores de feedback da etapa A B 4) A pode agir como um inibidor feed forward da etapa B C para aumentar a velocidade daquela reao Por exemplo: se tivermos muito A (A est construindo), possvel ir para a etapa de limitao de velocidade, diminuir Km da enzima e acelerar a reao

31 Normalmente, o produto final de uma via geralmente regula a primeira etapa comprometida da via (ou primeira etapa que necessita de enzimas) Na gliclise, certas enzimas so reguladas de forma que a velocidade da gliclise possa ser aumentada ou diminuda dependendo das exigncias energticas da clula. Regulao da enzima hexoquinase:

G6-P inibe a hexoquinase se a gliclise for bloqueada ou freada. Regulao da enzima fosfofrutoquinase (enzima PFRK)

ATP age como um regulador negativo da enzima PFK.

Em alto [ATP] , ATP liga-se ao stio alostrico e altera a atividade cataltica da PFK (aumenta Km ) Em baixo , ATP liga-se ao stio ativo da PFK e ativa PFK Alto [ADP] ativa a PFK