> Lnergie du

fonctionnement cellulaire : lATP et les mcanismes de sa rgnration

Squence 2 SN03

55

Introduction

.......................................................................................................................................................................

59

Chapitre 1

> LATP, molcule indispensable

la vie cellulaire
A
.......................................................................................................

61

LATP, molcule nergtique essentielle

LATP, compos phosphoryl riche en nergie Le couplage entre lhydrolyse de lATP et les ractions cellulaires endothermiques

Un exemple dactivit cellulaire consommatrice dnergie : la contraction des fibres musculaires

Lorganisation structurale du muscle squelettique Le mcanisme de la contraction musculaire La contraction musculaire : mcanisme consommateur dATP

La ncessit de rgnrer lATP dans les cellules

Chapitre 2

> La rgnration des intermdiaires mtaboliques :

la dgradation des composs organiques
A
.......................

72

Deux voies doxydation des composs organiques

La dgradation des composs organiques par les levures en arobiose La dgradation des composs organiques par les levures en anarobiose Comparaison des rendements nergtiques de la respiration et de la fermentation

Localisation cellulaire de la respiration et de la fermentation

Organisation structurale et mtabolisme quipement enzymatique et mtabolisme Bilan

56

Sommaire squence 2 SN03

La respiration, processus mtabolique permettant la synthse dATP

Les mitochondries, des organites spcialiss Les tapes de la dgradation du glucose Bilan de la dgradation du glucose par respiration

La fermentation, processus peu efficace de synthse dATP

Conclusion

Bilan des squences 1et 2

> Bilan structural et fonctionnel

dune cellule vivante
A B
...............................................................................................

83

Transfert de matire et dnergie Origine de la compartimentation cellulaire caractristique de la cellule eucaryote

Corrig des activits autocorrectives

........................................................................................................

87

Sommaire squence 2 SN03

57

ntroduction

es cellules autotrophes cholorphylliennes sont les seules capables de fabriquer leurs molcules organiques partir de matires minrales : elles convertissent, grce la photosynthse, lnergie lumineuse en nergie chimique. Ainsi la matire organique reprsente de lnergie chimique potentielle. Cest cette nergie chimique potentielle qui permet toute cellule, quelle soit autotrophe ou htrotrophe, de raliser lensemble de ses activits cellulaires.

Problme scientifique
Nous tudierons dans cette squence comment la cellule utilise et rcupre lnergie chimique potentielle des composs organiques.

Squence 2 SN03

59

LATP, molcule indispensable la vie cellulaire

Toute cellule vivante, quelle soit animale ou vgtale, prsente des activits cellulaires. Ces activits cellulaires comme les biosynthses, le transport dions et molcules travers les membranes cellulaires, les mouvements intracellulaires (ex : migration des chromosomes lors des divisions cellulaires, transport de molcules au sein de la cellule) ou les mouvements des cellules elles-mmes (ex : lors de la contraction musculaire) ncessitent de lnergie. Mis part le chloroplaste, organite spcialis des cellules chlorophylliennes, qui utilise lnergie lumineuse pour effectuer la synthse de matire organique partir de carbone minral, toutes les autres activits cellulaires utilisent de lnergie chimique investie dans des molcules organiques. En particulier, la cellule, quelle soit autotrophe ou htrotrophe, animale ou vgtale, utilise presque exclusivement lnergie chimique de ladnosine triphosphate ou ATP.

LATP, molcule nergtique essentielle

LATP, nous lavons vu dans le chapitre prcdent, est form par photoconversion chez les organismes chlorophylliens : lnergie des photons est ainsi convertie en nergie chimique au sein du chloroplaste, qui lutilise ensuite pour la synthse de molcules organiques partir de composs minraux. Les cellules non chlorophylliennes utilisent galement cette molcule.

LATP, compos phosphoryl riche en nergie

Dcouverte en 1929, cette molcule a t mise en vidence dans toutes les cellules animales, vgtales et bactriennes : cest une molcule universelle. LATP est un ribonuclotide form : dadnosine, compose de ribose et dadnine de 3 groupements phosphate

P
adnine adnosine ribose

3 groupements phosphate

Cest une molcule instable dont les liaisons entre les deux derniers groupements phosphate sont des liaisons covalentes faibles. Lhydrolyse dune molcule dATP, catalyse par lenzyme ATPase, avec production dune molcule dadnosine diphosphate (ADP) et dune molcule de phosphate inorganique (Pi), produit une grande quantit dnergie : cest pourquoi on parle de compos phosphoryl riche en nergie. Cette hydrolyse est une raction exothermique, cest--dire saccompagnant dune perte dnergie ; 25 C, la perte dnergie est gale 30,5 kJ par mole dATP hydrolys. ATP + H2O ATPase ADP + Pi - 30,5 kJ
(le signe - indique la perte dnergie)

Squence 2 SN03

61

Le couplage entre lhydrolyse de lATP et les ractions cellulaires endonergtiques

Principe Dans la cellule, les ractions consommatrices dnergie se ralisent uniquement si elles sont couples lhydrolyse de lATP. La molcule dATP participe ainsi au transfert dnergie dans des centaines de ractions cellulaires : cest lintermdiaire nergtique indispensable au fonctionnement cellulaire. A B

ATP

ADP

Exemples Les besoins en ATP des cellules sont levs : lATP est utilis par les membranes cellulaires pour permettre le transport de molcules dun milieu un autre, dun compartiment cellulaire un autre ; il est utilis par les cellules musculaires o son nergie est convertie en nergie mcanique (production de mouvement) ; il est utilis dans le hyaloplasme de toutes les cellules pour des biosynthses varies de macromolcules partir de prcurseurs. Exemples : polymrisation des nuclotides en acides nucliques (rplication de lADN, synthse dARNm) formation de polyholosides partir doses : assemblage de n molcules de glucose en glycogne assemblage des acides amins pour former des chanes polypeptidiques : lnergie libre par lhydrolyse de lATP est utilise pour la formation des liaisons peptidiques entre acides amins.

Un exemple dactivit cellulaire consommatrice dnergie : la contraction des fibres musculaires

Les muscles squelettiques permettent, par leur activit contractile, les dplacements de segments osseux les uns par rapport aux autres, et ainsi la ralisation de mouvements.

Lorganisation structurale du muscle squelettique

a) De lorgane la cellule
la dissection, le muscle apparat constitu de fibres musculaires regroupes en faisceaux ; ceux-ci sont spars par des parois conjonctives dans lesquelles sont logs les muscles et les vaisseaux sanguins. Aux extrmits du muscle, les cloisons conjonctives sunissent pour former les tendons qui attachent les muscles aux os.

62

Squence 2 SN03

Document 1

Schma de la structure dun muscle squelettique

La fibre musculaire est une cellule gante (de quelques cm plus de 30 cm de longueur sur 10 100 mm de largeur) qui possde plusieurs noyaux (cellule plurinucle = syncitium), limite par une membrane (sarcolemme). Au microscope chaque fibre prsente une striation transversale caractristique, do le nom de muscle squelettique stri.

Document 2

Observation microscopique de muscle squelettique Aspect stri du muscle squelettique Fibre musculaire strie (x 180)

Une fibre musculaire

Le cytoplasme de la fibre musculaire (ou sarcoplasme) contient de trs nombreuses structures longitudinales parallles : les myofibrilles. Chaque fibre comprend des milliers de myofibrilles groupes en faisceaux. Entre les myofibrilles, de nombreuses mitochondries et des grains de glycogne sont prsents.

Document 3

Structure dune fibre musculaire strie (MET x 48 000)

Une myofibrille

Squence 2 SN03

63

b) Structure dune myofibrille

Chaque myofibrille est forme dune succession dunits structurales appeles sarcomres, spares par des stries Z. Chaque sarcomre est lui-mme constitu dune bande sombre mdiane (bande A) et de deux demibandes claires ses extrmits ; la strie Z traverse la bande claire (bande I). La striation transversale de la fibre musculaire rsulte dun alignement des bandes sombres et des bandes claires qui alternent sur chaque myofibrille. Au milieu de la bande sombre A de la myofibrille au repos, on distingue une bande plus claire, la bande H.

Document 4

Structure dune myofibrille (MET x 100 000)

Strie Z

Sarcomre

Bande H

Bande sombre (A)

Bande claire (I)

Mitochondrie

1 myofibrille

Au microscope lectronique, les myofibrilles apparaissent constitues de deux types de filaments : les myofilaments : des myofilaments pais constitus de myosine (diamtre 16 nm) des myofilaments fins constitus dactine (diamtre 5 nm)

64

Squence 2 SN03

Document 5

Coupe longitudinale dune myofibrille (MET x 90 000)

Myofilament fin dactine

Myofilament pais de myosine

Document 6

Coupe transversale dune myofibrille (MET) au niveau dune bande A

Myofilament pais

Myofilament fin

Les filaments fins dactine sont fixs sur la strie Z ; ils traversent la bande claire et sinsrent entre les filaments pais de myosine, sans atteindre la partie mdiane des bandes sombres, mnageant ainsi une bande moins sombre (bande H). Ainsi : les bandes claires ne contiennent que des filaments dactine, les bandes sombres sont constitues de filaments de myosine entours de filaments dactine, sauf dans la bande H o il ny a que des filaments de myosine.

Squence 2 SN03

65

Document 7

Schma dorganisation gnrale

Strie Z Bande I Filament fin dactine

Filament pais de myosine

Bande A

Bande H

Bande I Strie Z

Le mcanisme de la contraction musculaire

Ltude dlectronographies de fibres musculaires au repos ou en tat de contraction permet de comprendre leur fonctionnement. Document 8

Sarcomre relch et contract (MET x 50 000)

Sarcomre relch

Sarcomre contract

La comparaison montre une diffrence daspect entre les deux tats ; la contraction se traduit par : une diminution de la longueur des myofibrilles, un raccourcissement des sarcomres (les stries Z se rapprochent),

66

Squence 2 SN03

 une diminution de la longueur des bandes claires ; les bandes H disparaissent, une constance de la longueur des bandes sombres. La constance de la longueur des bandes sombres indique quil ny a pas modification de la longueur des myofilaments. Le raccourcissement des sarcomres est d un coulissage des myofilaments les uns par rapport aux autres : les filaments dactine glissent entre les filaments de myosine.

Document 9

Schmas explicatifs

Certaines lectronographies de fibres contractes montrent des ponts entre les filaments dactine et de myosine : il stablit entre ces filaments des interactions qui sexpliquent par leur structure. Ces ponts sont visibles sur llectronographie dun sarcomre contract (voir document 5 : ponts entre filaments pais et fins). Les filaments dactine sont forms par la polymrisation de molcules dactine globulaire assembles en hlice, associes deux autres protines (troponine et tropomyosine). La myosine musculaire est une molcule prsentant deux ttes et une longue queue en btonnet. Elle est compose de 4 chanes polypeptidiques lgres et de 2 chanes lourdes : chaque tte est constitue de 2 chanes lgres et dune extrmit de chane lourde; le btonnet correspond une superhlice forme de lenroulement lune autour de lautre des autres extrmits des chanes lourdes. Chaque myofilament pais est form de quelques centaines (200 300) de molcules de myosine disposes en quinconce, les ttes de myosine faisant saillie rgulirement le long du filament; les ttes de myosine sont tournes dans des directions opposes de chaque ct de la partie centrale dun myofilament.

Document 10

Schma dune molcule de myosine

Squence 2 SN03

67

Document 11

Schmas de lorganisation des myofilaments

Myofilament pais

Organisation gnrale

Dtail

Myofilament fin

68

Squence 2 SN03

La contraction musculaire : mcanisme consommateur dATP

a) La mcanique du glissement des myofilaments
La contraction de la myofibrille est lie linteraction entre les ttes de myosine et les filaments dactine : formation dun complexe actine-myosine. Les ponts transversaux visibles dans une myofibrille en contraction sont les ttes de myosine attaches sur les filaments dactine. Dans un premier temps, les ttes de myosine sattachent sur une molcule dactine. Puis les ttes de myosine pivotent vers le centre du sarcomre entranant un dplacement denviron 10 nm des filaments dactine. Comme ce phnomne se droule simultanment lautre extrmit du sarcomre, celui-ci se raccourcit de 20 nm. Enfin les ttes de myosine se dtachent. La contraction musculaire, au niveau molculaire, comprend un cycle 3 temps : attachement, pivotement, dtachement. Il y a environ 5 cycles par seconde pendant une contraction rapide ce qui correspond une vitesse de glissement de 15 mm par seconde.

Document 12

Cycle de contraction : schma simplifi

b) Le couplage entre lhydrolyse de lATP et le fonctionnement du complexe actine-myosine

Pour que le glissement des filaments de myosine sur les filaments dactine et le raccourcissement du sarcomre aient lieu, il faut que les ttes de myosine sattachent sur les molcules dactine : les sites de fixation des ttes de myosine sur lactine, normalement masqus au repos, sont librs grce larrive dions calcium. Les ttes de myosine doivent pivoter. Elles ont une activit ATPasique : elles sont capables dhydrolyser lATP en ADP + Pi. LATP fix sur la tte de myosine est hydrolys : lnergie ainsi libre permet le pivotement de la tte de myosine. Ainsi une partie de lnergie libre par lhydrolyse de lATP est couple la production de mouvement. Les schmas du document 13 sont des schmas explicatifs qui illustrent les diffrentes phases dun cycle de contraction.

Squence 2 SN03

69

Document 13

Schmas explicatifs des mcanismes raliss au cours dun cycle

Tte de myosine attache sur une molcule dactine.

ATP

Fixation dATP sur la tte de myosine : ceci provoque un dtachement de la tte de myosine.

Hydrolyse de lATP en ADP et Pi qui restent lis la tte de myosine : il y a activation de la tte de myosine qui change de forme et se dplace le long du filament dactine.

Attachement : fixation de la tte de myosine active sur une nouvelle molcule dactine.

Pi

Glissement du filament dactine

ADP

Pi

Phase active : libration dADP et Pi La tte de myosine retrouve sa forme initiale (pivotement), ce qui entrane le glissement du filament dactine

Dbut dun nouveau cycle.

70

Squence 2 SN03

La ncessit de rgnrer lATP dans les cellules

LATP, on la vu prcdemment, est consomm en permanence par toutes les cellules. Exemple de la cellule musculaire

Concentration musculaire et quantit dnergie correspondante

[ATP] musculaire en mmol 46 Quantit dnergie correspondante en KJ

Par kg de muscle Chez un individu de 70 kg : 30 kg de muscles

Chez lHomme, 37 C, lhydrolyse dune mole dATP permet de librer 42 kJ.

Dpense dnergie totale de lorganisme au cours de quelques activits physiques

Type dexercice Marche 36 km/h Course 15 km/h 100 mtres 36 km/h Bicyclette 50 km/h Puissance dpense en J/sec 160 1190 13000 2090

Activit autocorrective n 1

Calculer la quantit dATP stocke dans les muscles chez un individu de 70 kg et la quantit dnergie correspondante. valuer, daprs ces donnes, la dure dexercice permise par les rserves musculaires dATP pour chaque type dexercice. Commenter.
Les rserves dATP sont faibles au regard de lnergie dpense lors de la ralisation dexercices physiques. Elles reprsentent une nergie potentielle denviron 5 kJ alors que les besoins, selon les exercices, varient de 130 2100 kJ. LATP doit donc tre renouvel trs rapidement dans les cellules.

Composition chimique dun muscle avant et aprs contraction

Les dosages ont t effectus sur des biopsies de muscle de la cuisse (quadriceps).
Avant contraction Quantit dATP Glycogne 4 6 mmol/kg de muscle 1,6 g/100 g de muscle Aprs contraction 4 6 mmol/kg de muscle 0,6 g/100 g de muscle

La quantit dATP est la mme avant et aprs contraction, bien quil y ait consommation au cours de lexercice pour assurer les besoins en nergie : ceci confirme que lATP est restaur rapidement. La quantit de glycogne baisse : du glycogne a donc t utilis ; on peut supposer que lutilisation du glycogne (compos organique) sert la rgnration de lATP consomm au cours de lexercice.

Mesure du taux de glucose sanguin lentre et la sortie du quadriceps

Muscle au repos 15,5 mg/kg de muscle.min Muscle en activit (sprint prolong) 190 mg/kg de muscle.min

Le muscle en activit consomme plus de glucose quau repos. On peut supposer que lutilisation accrue du glucose par le muscle permet de renouveler les rserves dATP. Ainsi le muscle rgnre lATP quil utilise lors de la contraction partir de composs organiques tels que le glycogne stock ou le glucose apport par le sang. La rgnration de lATP est lie la dgradation de composs organiques (chapitre 2).
71

Squence 2 SN03

La rgnration des intermdiaires mtaboliques : la dgradation des composs organiques

Toute cellule vivante, isole ou non, animale ou vgtale, consomme de lATP pour raliser ses diverses activits cellulaires, mais les stocks dATP tant trs limits, elle doit en permanence et rapidement les rgnrer (voir chapitre 1) La rgnration de lATP cellulaire se fait grce des processus doxydation de molcules organiques par respiration ou par fermentation.

Deux voies doxydation des composs organiques

Les levures sont des champignons unicellulaires; il en existe de nombreuses espces dont lune delles, la Levure de bire (Saccharomyces cerevisiae) est trs utilise dans la boulangerie et lindustrie de la bire. Ce sont des cellules immobiles, plus ou moins sphriques, dun diamtre de 6 8 m, constitues dun noyau, de cytoplasme limit par une paroi cellulaire rigide et contenant des inclusions de glycogne.

Document 14

Photographie de levures observes au microscope photonique

Document 15 a

lectronographie dune levure MEB (x 13 000)

72

Squence 2 SN03

Document 15 b

Schma de lultrastructure dune levure

Paroi Membrane plasmique

Mitochondrie

Noyau Vacuole

Glycogne Cytoplasme

Quelles soient en arobiose (prsence de dioxygne) ou en anarobiose (absence de dioxygne), elles se multiplient par bourgeonnement. Cette activit de bourgeonnement traduit des synthses, ractions consommatrices dnergie. Les levures produisent donc lATP ncessaire ces synthses.

La dgradation des composs organiques par les levures en arobiose

Exprience 1

Une suspension de levures 10 g/L est fortement oxygne laide dun bulleur daquarium pendant plusieurs heures (ceci a pour effet dpuiser les rserves de glycogne). On place ensuite 5 mL de cette suspension dans une enceinte munie dun agitateur et on mesure par EXAO lvolution des concentrations de dioxygne et de dioxyde de carbone du milieu au cours du temps. Au temps t1, on injecte dans lenceinte contenant les levures 0,1 mL de glucose 5 %.

Document 16

Concentrations de dioxygne et de dioxyde de carbone dun mileu contenant des levures

Squence 2 SN03

73

Activit autocorrective n 2
Exprience 2

Analysez et interprtez ces graphes

On peut suivre lvolution de la quantit de glucose dun milieu bien oxygn contenant des levures grce des bandelettes ractives (bandelettes hmoglucotest).

Document 17

Montage exprimental
air

Bain-marie 35 C Suspension de levures + solution glucose

bulleur

Rsultats des dosages effectus au cours du temps Le milieu contient 20 mL de levures 10 g/L et 200 mL de glucose 5g/L t0; la temprature est gale 25 C.
Temps (min) 0 50 60 70 [glucose] en g/L 5 2,31 0,65 < 0,2

Activit autocorrective n 3

Que pouvez-vous dduire de ces rsultats ? Faites la relation avec les rsultats de lexprience 1.

Bilan : les levures, en prsence de dioxygne, dgradent le glucose et rejettent du dioxyde de carbone;
ceci traduit un processus doxydation du glucose : la respiration cellulaire. Il sagit dune oxydation totale du glucose : il y a minralisation de la matire organique sous forme de dioxyde de carbone. Cette oxydation correspond un ensemble de ractions chimiques catalyses par des enzymes. Le bilan de ces transformations ralises au cours de la respiration peut scrire : C6H12O6 + 6 *O2 + 6 H2O Glucose 6 CO2 + 12 H2*O

La dgradation des composs organiques par les levures en anarobiose

Exprience

Des levures sont places dans un milieu contenant du glucose hermtiquement ferm.

Document 18

Montage exprimental

Eau de chaux Bain-marie Suspension de levures + solution glucose

74

Squence 2 SN03

Grce un tube de prlvement, on peut effectuer des prlvements rgulirement et doser la quantit de glucose prsente dans le milieu au cours du temps :
Temps (min) 0 30 40 [glucose] en g/L 5 0,61 < 0,2

Par ailleurs on observe que leau de chaux se trouble et on peut mettre en vidence la prsence dthanol dans le milieu grce un thylotest. Activit autocorrective n 4

Que pouvez-vous dduire de lensemble de ces observations ?

Bilan : les levures, en absence de dioxygne, dgradent le glucose; cette dgradation du glucose produit
un compos minral, le dioxyde de carbone, et un nouveau compos organique, lthanol. Il sagit cette fois dune oxydation incomplte du glucose puisquelle produit un dchet organique : il sagit dune fermentation. Le dchet organique ici produit tant lthanol, on parle de fermentation alcoolique. Le bilan des transformations au cours de cette fermentation peut scrire : C6H12O6 Glucose
N.B.

2 CO2 + 2 C2H5OH thanol

Il existe dautres fermentations, dfinies par le type de dchet organique produit (exemples : fermentation lactique qui produit de lacide lactique, fermentation actique qui produit de lacide thanoque encore appel acide actique).

Comparaison des rendements nergtiques de la respiration et de la fermentation

a) Les rendements de production
Respiration et fermentation sont deux processus doxydation de la matire organique qui permettent aux cellules de produire lnergie dont elles ont besoin pour crotre et se multiplier. Lnergie libre par ces ractions doxydation permet la synthse dATP, intermdiaire nergtique indispensable aux cellules.
Expriences

Au cours de ses tudes sur la fermentation alcoolique de lorge pour la fabrication de la bire, Pasteur a ralis des expriences de cultures de levures dans diffrentes conditions :
Dure de lexprience (jours) 3 9 19 90 Oxygnation du milieu Riche Moins riche Pauvre nulle Volume du milieu Teneur en glucose Masse de levures de culture du milieu de culture formes (mL) Masse initiale (g) Masse finale (g) 200 10 0,0 0,44 3000 150 0,0 1,970 3000 150 4,5 1,360 3000 150 105 0,25

Activit autocorrective n 5

Calculez, en grammes de levure produite par gramme de glucose consomm, le rendement de production obtenu dans les diffrentes conditions de culture. Concluez.

Bilan : Loxydation totale dune mole de glucose, par respiration, libre 2860 kJ tandis que loxydation incomplte, par fermentation, ne libre que 138 kJ. Dans le premier cas, toute lnergie chimique potentielle du glucose est libre tandis que dans le second cas, une faible partie
75

Squence 2 SN03

de lnergie chimique potentielle est libre, la plus grande partie se retrouvant dans le dchet organique produit. On peut donc penser que la quantit dATP qui est synthtis lors de la respiration est plus importante que celle synthtise lors de la fermentation.

b) Le rendement des conversions nergtiques de la respiration et de la fermentation

On a mesur les quantits de glucose utilis et les quantits dATP produit par des levures places en arobiose ou en anarobiose :
Millimoles de glucose utilis par g de protine de levures et par heure 1,1 42 Millimoles dATP produit par g de protine de levures et par heure 40 84

Arobiose Anarobiose

Activit autocorrective n 6

Sachant que lnergie chimique potentielle dune mole de glucose est gale 2860 kJ et que la valeur nergtique dune mole dATP est gale 31 kJ 25 C, calculez les rendements nergtiques de la respiration et de la fermentation. quantit dnergie sous forme dATP Rendement = quantit dnergie chimique potentielle du glucose

Le rendement de la respiration est nettement suprieur celui de la fermentation car la dgradation du substrat organique est complte alors quelle est partielle au cours de la fermentation, le rsidu carbon contenant encore de lnergie chimique potentielle. Toute lnergie chimique potentielle contenue dans une molcule de glucose nest cependant pas convertie en ATP, mme lors de la respiration : prs de 50 % de cette nergie, dans le cas de la respiration, est dissipe sous forme de chaleur.

Localisation cellulaire de la respiration et de la fermentation

Organisation structurale et mtabolisme
Les levures peuvent dgrader le glucose par respiration ou par fermentation selon les conditions du milieu. La comparaison de leur organisation structurale et de leur mtabolisme dans ces deux situations apporte des informations sur la localisation de ces deux types de mtabolisme.

76

Squence 2 SN03

Document 19

lectronographies de levures dans un milieu oxygn (a) et dans un milieu priv de dioxygne (b)
(a) (b)

En milieu arobie, les levures prsentent de nombreuses mitochondries bien dveloppes, tandis quen milieu anarobie celles-ci sont rares et atrophies. Or en milieu arobie les levures respirent tandis quen milieu anarobie elles fermentent. On peut donc supposer que la respiration a lieu dans les mitochondries tandis que la fermentation se droule dans le hyaloplasme.

quipement enzymatique et mtabolisme

Il est possible de sparer par lectrophorse les diffrentes protines de levures. Document 20

Zymogrammes de levures qui fermentent (a) ou qui respirent (b) sur milieu contenant du glucose
(a) (b)

Les taches entoures correspondent aux enzymes ; celles dsignes par une flche correspondent aux enzymes spcifiques des levures qui respirent.
Les quipements enzymatiques dune levure qui respire et dune levure qui fermente sont diffrents : une cellule qui respire possde un quipement enzymatique complet qui lui permet de dgrader compltement le glucose alors que lquipement enzymatique dune levure qui fermente ne permet quune dgradation partielle du glucose. Certaines enzymes sont prsentes dans les deux situations, ce qui laisse penser que certaines ractions partir du glucose sont communes aux deux processus.

Squence 2 SN03

77

Bilan
On peut supposer que les enzymes permettant la fermentation sont localises dans le hyaloplasme tandis que celles qui sont spcifiques la respiration se trouvent dans les mitochondries. On peut galement penser que la dgradation du glucose dbute toujours dans le hyaloplasme, quil sagisse de la respiration ou de la fermentation, grce un quipement enzymatique commun, et que cette dgradation se poursuit dans les mitochondries dans le cas de la respiration grce des enzymes spcifiques. La voie de dgradation du glucose commune la respiration et la fermentation est la glycolyse.

La respiration, processus mtabolique permettant la synthse dATP

Les mitochondries, des organites spcialiss
a) Mise en vidence de la respiration mitochondriale
Il est possible disoler des mitochondries dun organe vgtal (ex : feuilles de Lis) par simple broyage dans un milieu tamponn suivi dune filtration. On obtient ainsi une suspension de mitochondries. On peut alors mesurer, par EXAO, la consommation de dioxygne par cette suspension de mitochondries isoles dans diffrentes conditions.

Document 21

Mesure de la concentration dO2 dun milieu contenant des mitochondries isoles

mmol.L-1 140 120 100 80 60 40 20 0 0 t1 1 t2 2 3 4 5 min Conc.O2 mmol.L-1 71 5:0 21 C

t1 : addition dune petite quantit de glucose, t2 : addition de pyruvate. Activit autocorrective n 7

Analysez et interprtez ce graphe.

Les mitochondries ne peuvent utiliser directement le glucose. Celui-ci est pralablement dgrad dans le hyaloplasme en pyruvate qui est ensuite utilis par les mitochondries : cest la respiration cellulaire. Ltape de dgradation du glucose en pyruvate est la glycolyse.

78

Squence 2 SN03

Document 22

b) Structure et composition des mitochondries

lectronographie de mitochondrie (MET x 40 000)

Document 23

Schma de la structure dune mitochondrie

Membrane externe Membrane interne Matrice Crte mitochondriale

La mitochondrie est un organite cellulaire clos de quelques micromtres de long sur 0,5 1 m de diamtre, limit par une double membrane qui isole un espace interne, la matrice, du hyaloplasme. La membrane interne met de nombreux replis transversaux dans la matrice, appels crtes mitochondriales. Document 24

Composition chimique de la mitochondrie

Membrane externe Membrane interne Composition proche de celle de la membrane plasmique (60 % protines, 40 % lipides) 20 % lipides 80 % protines dont : ATP synthases et enzymes catalysant des oxydorductions. Pyruvate, ATP Enzymes : dshydrognases, dcarboxylases.

Matrice

Lquipement enzymatique des mitochondries permet la dgradation complte du pyruvate en relation avec une synthse dATP, le pyruvate rsultant dune dgradation pralable du glucose dans le hyaloplasme.

Squence 2 SN03

79

Les tapes de la dgradation du glucose

a) Premire tape dans le hyaloplasme : oxydation du glucose en pyruvate
Cette tape est la glycolyse : il sagit dune suite de ractions catalyses par des enzymes spcifiques prsentes dans le hyaloplasme, dont des dshydrognases. Elle aboutit la production de deux molcules de pyruvate partir dune molcule de glucose. Cette raction est une dshydrognation et correspond une oxydorduction : le glucose est oxyd tandis quun compos R (proche des composs R impliqus dans la photosynthse) est rduit en RH2. Cette oxydorduction libre de lnergie utilise la synthse dATP par couplage des ractions. C6H12O6 + 2 R glucose
dshydrognation

2 CH3COCOOH + 2 RH2 pyruvate

2 ADP + 2 Pi

2 ATP

Le bilan de la glycolyse est donc : 2 molcules de pyruvate, 2 molcules dATP et 2 molcules RH2 produites partir de loxydation dune molcule de glucose. Pour que la glycolyse puisse se poursuivre, il est ncessaire que les composs R soient rgnrs.

b) Deuxime tape dans la matrice mitochondriale : dgradation complte du pyruvate

Grce aux enzymes de la matrice (voir document 11), le pyruvate est totalement oxyd : du dioxyde de carbone est libr et des composs R sont rduits en RH2. Il sagit globalement dune dcarboxylation oxydative qui correspond une succession de ractions saccompagnant dune synthse dATP : une molcule dATP est produite par molcule de pyruvate dgrad. La dgradation du glucose produisant deux molcules de pyruvate lors de la glycolyse, il en rsulte la production de deux molcules dATP au cours de cette deuxime tape. 2 CH3COCOOH + 10 R + 6 H2O
Dcarboxylation oxydative

6 CO2 + 10 RH2

2 ADP + 2 Pi

2 ATP

c) Troisime tape dans les crtes de la membrane interne des mitochondries : oxydation des composs RH2 par le dioxygne
Les composs rduits RH2 forms au cours des tapes prcdentes sont rgnrs grce des molcules spcialises de la membrane interne formant une chane respiratoire : il sagit de transporteurs dlectrons qui assurent une srie doxydorductions partir des composs rduits RH2, laccepteur final tant le dioxygne. 12 RH2
oxydation rduction

12 R

6 O2

12 H2O

(12 RH2 = 2 RH2 produits lors de la glycolyse + 10 RH2 produits dans la matrice)

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Squence 2 SN03

Lnergie libre au cours de ces ractions doxydorduction sert la synthse dATP partir dADP et Pi : il y a couplage nergtique. Ceci est possible car coexistent au sein de la membrane interne des mitochondries des enzymes catalysant les ractions doxydorduction et des ATP synthases (voir document 11). Au cours des ces ractions doxydorduction, il y a synthse de 32 molcules dATP. 12 RH2 + 6 O2 12 R + 12 H2O

32 ADP + 32 Pi

32 ATP

Bilan de la dgradation du glucose par respiration

Pour une molcule de glucose dgrade, il y a : 2 molcules dATP produites par glycolyse 2 molcules dATP produites lors de ltape se droulant dans la matrice 32 molcules dATP produites par couplage avec les oxydorductions au niveau des crtes mitochondriales. Soient : 36 molcules dATP
Document 25

La production dATP par respiration

C6 H12 O6 2 R' 2 R'H2 2 CH3 CO COOH

2 ADP + 2 Pi 2 ATP

Hyaloplasme

Matrice

32

ATP

12 H2O 12 R' 2 CH3 CO COOH 2 ADP + 2 Pi 2 ATP 6 CO2 6 CO2 6 O2 10 R' 10 R'H2 12 R'H2 6 O2 32 ADP + 32 Pi 6 H2O crte mitochondriale

Squence 2 SN03

81

La fermentation, processus de synthse dATP peu efficace

La dgradation dune molcule de glucose par fermentation dbute galement par la glycolyse qui aboutit la production de deux molcules de pyruvate, deux molcules de composs rduits RH2 et la synthse de deux molcules dATP.

Exemple de la fermentation alcoolique

Le pyruvate est ensuite dcarboxyl dans le hyaloplasme : 2 CH3COCOOH pyruvate 2 CO2 + 2 CH3CHO actaldhyde

Puis lactaldhyde est rduit en thanol, cette raction tant couple loxydation du compos rduit RH2 : il sagit dune oxydorduction. 2 CH3CHO + 2 RH2 actaldhyde 2 CH3CH2OH + 2 R thanol

Cest ainsi que les composs R qui ont t rduits en RH2 lors de la glycolyse sont rgnrs. Par contre, lnergie libre au cours de cette oxydorduction est insuffisante pour permettre la synthse dATP ; elle est dissipe sous forme de chaleur. Par fermentation, la dgradation dune molcule de glucose permet ainsi la synthse de deux molcules dATP seulement, ce qui est trs faible en regard de la quantit dATP produite par respiration. Cependant, ce processus tant anarobie (nutilisant pas dO2), il permet une rgnration des composs rduits et une production dATP dans des cellules vivant dans des conditions o le dioxygne est absent.

Conclusion
Respiration et fermentation sont deux processus diffrents qui permettent aux tres vivants de produire lnergie ncessaire leurs activits vitales. Ces deux aspects du catabolisme correspondent un transfert de lnergie chimique des composs organiques aux molcules dATP, forme dnergie utilisable par les cellules. Ce sont deux processus exothermiques qui se droulent par tapes et font intervenir des enzymes spcifiques. Le rendement de conversion nergtique est plus lev dans le cas de la respiration (environ 40 %) que dans celui de la fermentation (environ 2 %), mais reste cependant relativement faible, une grande partie de lnergie chimique des mtabolites tant perdue sous forme de chaleur.

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Squence 2 SN03

ilan des squences 1 et 2

Bilan structural et fonctionnel dune cellule vivante A Transfert de matire et dnergie
Un cosystme est un systme fonctionnel dans lequel on retrouve toujours une production, une circulation, une accumulation et une transformation de matires organiques. Les organismes autotrophes permettent lentre dnergie dans le systme par conversion de lnergie lumineuse en nergie chimique des composs organiques grce la photosynthse. Les organismes htrotrophes, qui consomment directement ou indirectement la matire organique produite initialement par les organismes autotrophes via les rseaux trophiques, et les organismes autotrophes oxydent les composs organiques par respiration ou par fermentation ; cest ainsi que lnergie chimique des composs organiques est finalement convertie en molcules dATP, seule forme dnergie utilisable par les cellules. Ainsi, toute cellule vivante est soumise un bilan dentre et de rejet de matire quaccompagnent des conversions nergtiques. Les ractions mtaboliques caractristiques de ces diffrents processus se droulent, dans la cellule eucaryote, dans des compartiments spcifiques, au niveau dorganites spcialiss (chloroplastes, mitochondries) ; ceux-ci prsentent une organisation structurale et un quipement enzymatique caractristiques permettant le droulement des ractions mtaboliques. La synthse de ces enzymes spcifiques est dirige par linformation gntique contenue dans le noyau.

Voir page suivante

Squence 2 SN03

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Document 26

Schma fonctionnel dune cellule eucaryote chlorophyllienne

TRANSCRIPTION TRADUCTION

tapes de la synthse protique

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Squence 2 SN03

Origine de la compartimentation cellulaire caractristique dune cellule eucaryote

Les Eucaryotes se sont dvelopps il y a environ 1,4 milliards dannes ; lune des caractristiques essentielles les diffrenciant des Procaryotes est la mise en place de systmes membranaires intracellulaires, dans le hyaloplasme, limitant de nombreux organites aux structures et fonctions spcialises, dont les chloroplastes et les mitochondries. Actuellement, on pense que lapparition de cette compartimentation intracellulaire caractristique est due une volution partir de prcurseurs ressemblant aux bactries : il sagit de lhypothse de lorigine endosymbiotique des mitochondries et des chloroplastes. Dans cette hypothse, la mitochondrie rsulterait de lassociation dune cellule phagocytaire primitive et dune bactrie arobie (Bactrie pourpre) qui aurait t internalise, tandis que le chloroplaste rsulterait de la capture dune cyanobactrie par une cellule phagocytaire dj munie de mitochondries et tablissant une relation symbiotique avec son hte. Cette hypothse repose sur de nombreuses ressemblances existant entre les bactries et ces organites : les chloroplastes et les mitochondries renferment de lADN qui pourrait reprsenter le chromosome initial dune bactrie arobie ou dune cyanobactrie. De plus, comme chez les Procaryotes, cet ADN nest pas associ des histones (protines). Ainsi, chloroplastes et mitochondries contiennent leur propre gnome ; les ribosomes prsents dans ces organites ont la taille de ceux des Procaryotes ; les ARNr cods par lADN de ces organites ont une taille comparable aux ARNr prsents dans les Procaryotes, trs rduite par rapport celle des ARNr cods par lADN du noyau. Par ailleurs, il existe des organismes eucaryotes actuels qui ne possdent pas de mitochondries mais abritent dans leur hyaloplasme des bactries arobies avec lesquelles ils cooprent et tablissent une relation symbiotique (ex : amibe Pelomyxa palustris). De mme, on observe souvent actuellement la prsence de cyanobactries lintrieur de cellules eucaryotes (ex : protiste unicellulaire flagell Cyanophora paradoxa).

Voir page suivante

Squence 2 SN03

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Document 27

Origine endosymbiotique des mitochondries (a) et des chloroplastes (b)

Lvolution des membranes internes est alle de pair avec la spcialisation de la fonction membranaire. Ainsi chez certaines bactries actuelles il existe des rgions spcialises de la membrane plasmique dans la fonction photosynthtique; chez certaines, ces rgions se sont mme transformes en vastes invaginations de la membrane plasmique tandis que chez dautres ces invaginations se sont dtaches formant des vsicules limites par une membrane et spcialises dans la photosynthse. On peut supposer que les thylakodes des chloroplastes rsultent dune telle volution.

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Squence 2 SN03

orrig des activits autocorrectives

Activit n 1
Par kg de muscle Chez un individu de 70 kg : 30 kg de muscles [ATP] musculaire en mmol 46 120 180 Quantit dnergie correspondante en KJ 0,17 0,25 5,1 7,5

Lhydrolyse d1 mole dATP permettant la libration denviron 42 kJ, 37 C, la quantit dnergie correspondant aux rserves dATP musculaire dun individu de 70 kg est comprise entre 120.10-3 x 42 soit environ 5,1 kJ et 180.10-3 x 42 soit environ 7,5 kJ. Une marche 36 km/h consomme 160 J/sec : les rserves dATP musculaires permettent cet exercice physique durant 5,1.103/160 soit environ 32 sec jusqu 7,5.103/160 soit environ 47 sec. De mme, les rserves dATP musculaire permettent une course 15 km/h pendant 4,3 6,3 secondes, un 100 mtres 36km/h pendant 0,39 0,57 secondes et un exercice bicyclette 50 km/h pendant 2,44 3,58 secondes. On remarque que les rserves dATP sont trs faibles au regard de lnergie dpense lors de la ralisation dexercices physiques. LATP doit donc tre sans cesse et rapidement renouvel dans les cellules musculaires. Activit n 2

De t0 t1, les quantits de dioxygne et de dioxyde de carbone du milieu sont constantes : aucun change gazeux nest ralis entre les levures et leur milieu. partir de t1, moment o on a ajout du glucose dans le milieu, la quantit de dioxygne du milieu baisse progressivement tandis que celle de dioxyde de carbone augmente. Ces variations indiquent que les levures absorbent le dioxygne du milieu et rejettent du dioxyde de carbone. On peut en dduire que les levures nutilisent le dioxygne du milieu que sil y a prsence de glucose : il y a une relation entre la prsence de glucose dans le milieu et la consommation de dioxygne par les levures.

Activit n 3

La quantit de glucose du milieu diminue au cours du temps : les levures places dans un milieu bien oxygn consomment le glucose.

Activit n 4

La quantit de glucose baisse au cours du temps : il est consomm par les levures. Leau de chaux se trouble : il y a production de dioxyde de carbone par les levures. De lthanol est produit. On peut donc penser que les levures dgradent le glucose consomm, en absence de dioxygne, cette dgradation produisant du dioxyde de carbone et de lthanol.

Activit n 5

Dans le milieu 1 : R1 = 0,44/10 = 0,044 g de levure/g de glucose consomm. Dans le milieu 2 : R2 = 1,970/150 = 0,013 g de levure/g de glucose consomm Dans le milieu 3 : R3 = 1,360/150-4,5 = 1,360/145,5 = 0,009 g de levure/g de glucose consomm Dans le milieu 4 : R4 = 0,25/150-105 = 0,25/145 = 0,0017 g de levure/g de glucose consomm Plus le milieu est riche en dioxygne, plus le rendement de production est lev : lnergie produite en prsence de dioxygne est plus importante quen absence de dioxygne. Or en prsence de dioxygne les levures respirent tandis quen absence de dioxygne elles fermentent. Lnergie libre lors de loxydation du glucose par respiration est plus importante que celle libre par fermentation.

Squence 2 SN03

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Activit n 6

En arobiose, il y a production de : 40/1,1 = 36 millimoles dATP/milimole glucose utilis ; en anarobiose, il y a production de : 84/42 = 2 millimoles dATP/millimole de glucose utilis. Or en arobiose les levures respirent tandis quen anarobiose elles fermentent ; la dgradation du glucose par respiration produit beaucoup plus dATP que par fermentation. Rendement nergtique de la respiration : 40.10-3 x 40 1,1.10-3 x 2860 Rendement nergtique de la fermentation : 84.10-3 x 40 42.10-3 x 2860 = 0,028 = 2,8 % = 0,508 = 50,8 %

Activit n 7

Sur milieu glucos, le taux de dioxygne du milieu reste constant : il ny a aucun change de dioxygne entre les mitochondries et leur milieu. Ds quon ajoute du pyruvate, le taux de dioxygne du milieu baisse au cours du temps : les mitochondries consomment le dioxygne du milieu. On en dduit que les mitochondries ne respirent pas quand le milieu ne contient que du glucose, par contre elles peuvent respirer sil y a du pyruvate ; elles ne peuvent directement utiliser le glucose.

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Squence 2 SN03