30/10/2012

INTRODUO

Protenas

Polmeros de aminocidos unidos por ligaes covalentes

Professora: Roberta Schmatz

Construdas a partir de um conjunto de 20 aa , ligados em seqncias lineares caractersticas.

INTRODUO CARACTERSTICAS:

INTRODUO

As protenas so as macromolculas biolgicas mais importantes que ocorrem em todas as clulas e em todas as partes das clulas; - Milhares de espcies diferentes;
-

As clulas podem produzir protenas com propriedades e atividades diferentes unindo os mesmos 20 aminocidos em muitas combinaes e sequncias diferentes. 20 AMINOCIDOS
Diferentes combinaes e sequncias formando diferentes protenas

Pequenos peptdios polmeros enormes; Diversidade de funes biolgicas; So os instrumentos moleculares por meio dos quais a informao gentica expressa ; TODAS constitudas pelo mesmo conjunto de 20 aminocidos;

Enzimas

Hormnios

Transportadores

Anticorpos

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AMINOCIDOS

AMINOCIDOS

Os resduos de aminocidos unem-se por um tipo de ligao covalente especfica LIGAO PEPTDICA PROTENAS 20 aminocidos: 1-Asparagina 1806 20 -Treonina 1938 Nomes comuns e alguns derivados da fonte o qual foram isolados Asparagina aspargo Glutamato glten do trigo Tirosina Tyros (queijo) Glicina Glykos (sabor doce)

20 alfa- aminocidos
GRUPO CARBOXILA GRUPO AMINA

Diferem nas suas cadeias laterais os Grupos R em tamanho, carga eltrica e estrutura.

varia

Influenciam na solubilidade do aminocido em gua

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AMINOCIDOS

Convenes para identificar os carbonos dos aminocidos

Abreviaes de 3 letras e smbolos de uma letra que so usados como sinais caligrficos para indicar a composio e a sequncia dos aminocidos nas protenas. , , , : usados para designar carbonos adicionais em um grupo R. 1, 2, 3, 4,5: numerados a partir de uma extremidade, dando preferncia ao carbono substituinte (de maior nmero atmico)

AMINOCIDOS
CLASSIFICAO DOS AMINOCIDOS

09 - ESSENCIAS Obteno atravs dos alimentos

ENTRE OS 20 AMINOCIDOS CONHECIDOS 11- NO ESSENCIAIS As clulas produzem

C ligado a 4 grupos diferentes exceto GLICINA formando CENTRO QUIRAL

Arranjo tetradrico dos orbitais de ligao em volta do tomo C Os 4 grupos diferentes podem ocupar dois arranjos espaciais nicos: Os aminocidos tem dois possveis estereoismeros: formas D e L Como so imagens especulares no superpostas um do outro so chamados de ENANTIMEROS

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AMINOCIDOS

AMINOCIDOS

Nomenclatura para especificar a configurao absoluta dos quatro substituintes do C: Sistema D,L baseada na configurao do acar de 3 C GLICERALDEDO Conveno de Fischer.

Resduos de aminocidos nas protenas so L

estereoismeros. Os resduos D aminocidos tm sido encontrados apenas em alguns poucos, geralmente pequenos peptdeos

As clulas so capazes de sintetizar especificamente L ismeros. Os stios ativos das enzimas so assimtricos e catalisam reaes estereoespecficas..

-L-aminocidos so aqueles com o grupo alfaamino na esquerda, e D-aminocidos possuem o grupo alfa-amino na direita.

AMINOCIDOS

Classificao dos aminocidos Conforme grupo R

Polaridade e tendncia de interagir com a gua em pH biolgico (pH 7,0) depende do grupamento R.

Grupos Aromticos
Cadeias laterais nopolares e hidrofbicas .
Todos podem participar de interaes hidrofbicas

Grupos alifticos apolares

Aa apolares e

hidrofbicos
Aa se agrupam dentro

Grupos Polares no carregados

Grupo amida

das protenas estabilizando a estrutura por meio de interaes hidrofbicas

Mais solveis em gua( + hidroflicos), pois seus grupos funcionais fazem pontes de hidrognio com a gua.

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AMINOCIDOS

Grupos carregados positivamente (bsicos)

So os mais hidroflicos, como tambm possuem carga positiva em pH 7,0

Aminocidos importantes

incomuns

tambm

possuem

funes

As protenas podem conter resduos criados pela modificao de resduos comuns j incorporados dentro de um polipeptdio.

Grupos carregados negativamente (cidos)

Possuem carga negativa e pH 7,0

4-hidroxiprolina derivado da prolina e 5-hidroxilisina derivado da lisina: encontrados no colgeno 6-N-metil-lisina constituinte da miosina carboxiglutamato protena de coagulao do sangue Desmiosina derivado de 4 resduos de lisina. Encontrado na elastina Selenocistena introduzido durante a sntese de protenas em vez de ser criado por uma modificao ps sinttica

AMINOCIDOS

Os aminocidos podem atuar como cidos e bases

Em soluo, um aminocido existe como um on dipolar, ou zwitterion;

Um aa simples, monocarboxlico e monoamnico um cido diprtico, quando totalmente protonado.

Atua como um cido (doador de prtons)

Atua como uma base (receptora de prtons)

Substncias possuindo essa natureza dupla so anfteras e chamadas de anflitos

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AMINOCIDOS

AMINOCIDOS

Titulao cido-base = remoo ou adio gradual de prtons.

Titulao de aminocidos diprotonados Diagrama com dois estgios diferentes:
1 - pH baixo predomina espcie completamente protonada; Ponto mdio da titulao Ponto de inflexo: completa remoo do primeiro prton e incio da remoo do segundo prton Presena do on dipolar Sem carga eltrica lquida = Ponto isoeltrico (PI). 2 - pH alto predomina espcie desprotonada. OBS:
pH designa a concentrao de H+ em uma soluo e pKa a tendncia de um grupo

Curva de titulao da forma diprtica da glicina

Curva de titulao para aminocidos com grupos R no-ionizveis.
1 - pH baixo predomina espcie completamente protonada; Ponto mdio da titulao Ponto de inflexo: completa remoo do primeiro prton e incio da remoo do segundo prton Presena do on dipolar Sem carga eltrica lquida = Ponto isoeltrico (PI). 2 - pH alto predomina espcie desprotonada.

oferecer um prton.

Cada grupo ionizvel apresenta um ponto de inflexo (pH=pKa). Duas regies de poder tamponante resistem a mudanas de pH quando pequenas quantidades de cidos ou base so adicionadas.

Quanto mais distante o pH do seu PI, maior a carga eltrica lquida da populao de

molculas.

AMINOCIDOS

Aminocidos com grupos R ionizveis possuem curvas de titulao mais complexas, com trs estgios de ionizao possveis GLUTAMATO E HISTIDINA. PIs refletem a natureza dos grupos R ionizantes. Somente histidina possui grupo R (pKa = 6,0) com poder tamponante prximo ao pH neutro encontrado nos fludos intra e extracelulares.

PEPTDEOS E PROTENAS Polmeros de aminocidos Ocorrncia biolgica Variam em tamanho de pequeno a grande( de 2 ou 3 at milhares de resduos de aa).
Protena (polmero)

(monmero) aminocido

COO + H3 N C H a R

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PEPTDIOS E PROTENAS

PEPTDIOS E PROTENAS

Dipeptdio formado por dois aminocidos unidos de forma covalente por ligao amida substituda.
LIGAO PEPTDICA

Equilbrio reao favorece aminocido em vez do dipeptdio Grupo carboxila deve ser quimicamente modificado ou ativado de forma que o grupo hidroxila possa ser mais facilmente eliminado.

Remoo de elementos da gua de um grupo -carboxila de um aminocido e o grupo - amino de outro.

Ligao peptdica

Dipeptdio

PEPTDIOS E PROTENAS

PEPTDIOS E PROTENAS

Classificao: Oligopeptdio- poucos aa; Polipeptdio muitos aa- PM-abaixo de 10000; Protenas- milhares de aa- PM acima de 10000. Uma unidade de um aminocido em uma protena chamado de resduo.
Amino ou N-terminal PENTAPEPTDEO Resduos Terminais Carboxila ou C-terminal

Peptdios contm apenas os grupos -amino e -carboxila livres nas extremidades Ionizam-se como os aminocidos. Grupos -amino e -carboxila no-terminais no se ionizam No contribuem para comportamento cido-base total dos peptdios. Grupos R dos resduos de aminocidos podem se ionizar.

Ligaes peptdicas nas protenas so bastante estveis- meia vida de 7 anos sob a maioria das condies intracelulares

Peptdios possuem curvas de titulao caractersticas e um pH isoeltrico onde eles no se movem em um campo eltrico.

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PEPTDIOS E PROTENAS

PEPTDIOS E PROTENAS

Peptdios podem ser distinguidos pelo seu comportamento de ionizao

Comportamento cido-base pode ser predito pelo seu grupo -amino e -carboxila livres bem como da natureza e o nmero dos seus grupos R ionizveis. Da mesma forma que os AA livres, os peptdios possuem curvas de titulao caracterstica e um pH isoeltrico (pI)

Mesmo os menores peptdios podem ter efeitos biolgicos importantes, como hormnios.

Aspartame-dipeptdio Polipeptdeos menores ou oligopeptdios Glucagon 29 aa Corticotropina 30 aa Insulina 2 cadeias (30 aa e a outra 21 aa) Quanto longas so as cadeias polipeptdicas nas protenas?

PEPTDIOS E PROTENAS

Algumas protenas consistem de uma cadeia polipeptdica nica, outras chamadas SUBUNIDADES MLTIPLAS, possuem dois ou mais cadeias polipeptdicas associados de forma no covalente Protena Oligomrica: pelo menos duas subunidades idnticas Protmeros Ex: Hemoglobina -4 subunidades polipeptdicas -2 cadeias alfa idnticas -2 cadeias beta idnticas N aproximado de resduos de aminocidos em uma protena simples = peso molecular/110. Peso molecular mdio dos 20 aminocidos = 138 predominam aminocidos pequenos peso molecular prximo a 128, menos 18 da perda de gua = 110.

Tetrmero de 4 subunidades polipeptdicas ou um dmero de protmeros.

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PEPTDIOS E PROTENAS

PEPTDIOS E PROTENAS

Os polipeptdios possuem composio de aa caractersticas.

A hidrlise de peptdios produz uma mistura de aminocidos livres Cada protena produz uma proporo de diferentes aminocidos. Alguns aa podem ocorrer apenas 1 vez ou mesmo nenhuma; outros podem ocorrer em grandes quantidades.

Protenas simples contm apenas resduos de aminocidos. Protenas conjugadas: alm dos aa elas contm permanentemente associado outros componentes qumicos. Grupos prostticos -Lipoprotenas -Glicoprotenas -Metaloprotenas

PEPTDIOS E PROTENAS

PEPTDIOS E PROTENAS

H 4 nveis de estrutura protica:

Ligaes covalentes (peptdicas) unindo resduos de aminocidos em uma cadeia polipeptdica. Sua importncia est na sequncia dos aminocidos. Arranjos particularmente estveis de resduos de aminocidos dando origem a padres estruturais recorrentes.

Primria

Secundria

Aspecto do enovelamento tridimensional de um polipeptdio.

Terciria

Quaternria

Arranjo no espao de uma protena com duas ou mais subunidades polipeptdicas.

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A ESTRUTURA COVALENTE DAS PROTENAS

A ESTRUTURA COVALENTE DAS PROTENAS

A estrutura primria de uma protena determina como ela se enovela em uma nica estrutura tridimensional, e isso por sua vez determina a funo da protena.
Diferentes sequncias de aminocidos Diferentes estruturas tridimensionais Diferentes funes

Famlias proticas que compartilham caractersticas funcionais podem ser identificadas nas semelhanas da sequncia de aminocidos.

A sequncia de aminocidos no absolutamente fixa 20 a 30% das protenas nos humanos so polimrficas, possuindo sequncias de aminocidos variantes. Variaes com pouco ou nenhum efeito na funo da protena. H regies cruciais na protena que so essenciais para a sua funo e cuja sequncia conservada.

Certas sequncias de aminocidos funcionam como sinais que determinam a localizao celular, modificao qumica e meia-vida de uma protena.

SEQUNCIAS DE PROTENAS E A EVOLUO

SEQUNCIAS DE PROTENAS E A EVOLUO

As sequncias de aminocidos divergem crescentemente medida que a distncia evolucionria entre dois organismos cresce.
As sequncias de protenas podem ser utilizadas para rastrear a histria biolgica. Os resduos que so menos importantes para a funo protica podem variar com o tempo Nem toda substituio dos aminocidos ocorre ao acaso. Protenas evoluem em velocidades diferentes. Transferncia gnica lateral: transferncia rara de um gene ou um grupo de genes de um organismo para outro.

Protenas homlogas ou homlogos: membros das famlias de protenas. Parlogos: duas protenas dentro de uma mesma famlia esto presentes em uma mesma espcie. Ortlogos: homlogos de espcies diferentes. Os homlogos so identificados usando programas de computadores. Pesquisa eletrnica deslizamento de uma sequncia sobre a outra at boa concordncia. Quando dois segmentos no alinham-se espaos programas incluem penalidades para cada espao introduzido diminui pontuao alinhamento global.

Programa seleciona alinhamento com pontuao tima

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Protenas podem ser definidas como polmeros compostos de n unidades monomricas, os aminocidos, ligados entre si por ligaes peptdicas

Protena (polmero)
Aminocido 1 Aminocido 2

(monmero) aminocido

COO + H3 N C H a R Frmula geral de um a aminocido: os grupos amino e carboxila esto no carbono a. R a cadeia lateral R diferencia os aminocidos entre si

um dipeptdeo A ligao peptdica ocorre entre o grupo a-carboxila de um aminocido e o grupo a-amino de outro aminocido.

At 100 aminocidos (10 kDa) Mais de 100 aminocidos

peptdeo protena

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