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Mecanismos que conducen a la evolucin de los genomas bacterianos: 1. Mutacin y seleccin 2. Transferencia lateral de genes: transformacin, transduccin, conjugacin. 3. Re-arreglos internos del ADN 4. Transposicin de elementos genticos mviles (IS, Tn)
Mutaciones
Mutacin: Cambio heredable en la secuencia de ADN. Pueden causar alteraciones en el fenotipo. Espontneas: originadas por infidelidad en replicacin, inestabilidad qumica de bases. Inducidas: generadas por mutgenos qumicos, radiaciones.
Mutaciones polares Afectan genes ro abajo. Ocurren en los operones (bacterias o arqueas).
Mutaciones condicionales. El producto codificado es activo a la temperatura permisiva e inactivo a la temperatura restrictiva
Mutaciones supresoras
Modo Replicacin en crculo rodante (): fagos (M13), plsmidos Gram +, plsmido F.
Puede generar concatenados que contienen varias unidades del genoma. Son posteriormente procesados (fago lambda)
Plsmidos
Son replicones. Tamao variable (1-200 kbp) Generalmente circulares. Algunos lineales. Una copia/clula o varias copias/clula. Por recombinacin generan dmeros, multmeros o monmeros Modos de replicacin: o Controlan su replicacin y nmero de copia mediante control negativo del inico de la replicacin Poseen: - Mdulo bsico: un orgen de replicacin vegetativo (oriV), genes para la replicacin. - Sistemas de particin (segregacin a las clulas hijas) - Secuencias de insercin (IS) y/o transposones (Tn) - Genes de resistencia a antibiticos u otras funciones bioqumicas (degradacin, virulencia, bacteriocinas, etc) - Funciones de transferencia (plsmidos conjugativos)
Mantenimiento de los plsmidos 1. Plsmidos de alto nmero de copia particionan al azar. 2. Plsmidos de bajo nmero de copia (1-2/cel). Deben contener sistemas de particin
Sistemas de Particin verdaderos: Aseguran que dos plsmidos generados luego de la divisin celular sean segregados a las clulas hijas. Poseen funciones codificadas en cis y trans necesarias para la particin (parA, parB, parS)
Antdoto-veneno producidos por el plsmido. El veneno es estable, el antdolo (bloquea la accin del veneno) es inestable. En plsmido F, antdoto y veneno son protenas. En pR1, el antdoto es un mRNA antisentido que bloquea el mRNA de la toxina
Compatibilidad Dos plsmidos son incompatibles si sus orgenes no pueden ser distinguidos durante algn proceso necesario para su mantenimiento (iniciacin de la replicacin y/o segregacin).
Control del nmero de copia. El ori ColE1 es controlado por un RNA regulador
S. pneumoniae
Artificial. Ej. E. coli, Pseudomonas. Varios mtodos: Cloruro de Calcio, electroporacin, formacin de protoplastos+PEG (arqueas).
Conjugacin
Un plsmido o cromosoma es transferido de una bacteria a otra por contacto entre clulas
Mapa gentico del plsmido F de E.coli. oriV: origen de replicacin vegetativo; Rep; funciones para la replicacin; IS, Tn: elementos mviles oriT: origen de transferencia; genes tra: funciones para la conjugacin.
Clulas F+: dador Clulas F-: aceptor Clulas Hfr: alta frecuencia de recombinacin de F en cromosoma Episoma: plsmido que se replica autnomamente o se integra al cromosoma Fo R: plsmido derivado de cepa Hfr que lleva genes cromosomales. Plsmidos autotransmisibles: (conjugativos): Poseen funciones completas para la conjugacin (oriT y genes tra) Plsmidos no-autotransmisibles (movilizables): Poseen oriT y funciones incompletas para la conjugacin (genes mob, codifican funciones necesarias para el inicio de su propia transferencia ). Para ser transferidos requieren de un plsmido helper conjugativo que aporte las funciones que le faltan.