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Ecologa Microbiana

El crecimiento microbiano forma poblaciones Las poblaciones metablicamente relacionadas se denominan gremios (guilds) Los conjuntos de poblaciones o gremios forman comunidades Las comunidades interaccionan con otras comunidades microbianas y el ambiente que es lo que define un determinado ecosistema

Energa en Ecosistemas
Materia orgnica Luz Compuestos qumicos

Principales recursos y condiciones que regulan el crecimiento microbiano


Recursos (Nutrientes y energa)
C (orgnico, CO2) N (orgnico, inorgnico: NH3,N2,NO3-, NO2-) Macronutrientes (S, P, K, Mg) Micronutrientes (Fe, Mn, Co, Zn, Cu, Ni) Aceptores de electrones (O2 NO3-,H2,SO42- ) Donadores de electrones (O2,,NH3, H2,Fe3+,SH2 NO2- ) T pH2O pH pO2 Luz P osmotica

Condiciones ambientales

Los organismos oligotrficos se desarrollan a bajas concentraciones de nutrientes, al contrario que los copiotrficos.

Biofilms
Microcolonias revestidas de un film de oligo o polisacridos adhesivos secretados por las clulas Quorum sensing (Homoserina lactonas)

Microbiologia de ambientes terrestres


Suelos minerales y orgnicos Disponibilidad agua y estado nutricional Mltiples microambientes Rizosfera

Microbiologa de agua dulce


Lagos, estanques, ros y manantiales Disponibilidad de oxigeno y luz Algas bentnicas y fitoplacton son productores primarios de (CH2O)n

Columna de Winogradsky
Constituye un microcosmo donde los microorganismos y nutrientes interactan a lo largo de un gradiente vertical :
Se mezcla una capa de fango reducido con sulfato sdico, carbonato sdico y tiras de papel de peridico (celulosa) y se coloca ms fango y agua en la columna La poblacin microbiana se va repartiendo en zonas. Los productos de la fermentacin (Clostridium) y los sulfuros (Desulfovibrio) migran hacia arriba desde la zona inferior reductora, favoreciendo, en la zona superior de la columna, con oxgeno el crecimiento de quimiolittrofos (Beggiatoa y Thiothrix). En este gradiente de SH, como fuente de e-, los fotoauttrofos (Chlorobium, verde, y Chromatium, roja) se desarrollan como color verde oliva y prpura. Por encima crecen bacterias prpuras no del azufre (Rhodospirillum) que utilizan ya materia orgnica como dador de e- en zona anaerbica El oxgeno difunde desde la superficie, creando condiciones similares a las que existen en un lago con sedimentos ricos en nutrientes. Con luz se reproduce la penetracin de la luz solar en la regin inferior anaerbica, para facilitar el desarrollo de los microorganismos fotosintticos anoxignicos. En la zona ms alta se pueden ver diatomeas y cianobacterias. La T y la Presin controlan la cantidad de oxgeno disponible por los microorganismos

Water pollution

Eutrophication caused by the over enrichment of a body of a body of water with nutrients, resulting in excessive growth of organisms and depletion of oxygen concentration

Eutrofizacin
Demanda Bioqumica de Oxgeno (DBO): Cantidad de oxgeno necesario para que los microorganismos oxiden la materia orgnica disuelta en el agua (a 20C y en oscuridad, durante 5 das). Demanda Qumica de oxgeno (DQO): Cantidad de oxgeno necesario para oxidar toda la materia orgnica en el agua (tanto la biodegradable como la no biodegradable). Siempre tiene niveles superiores a la DBO

Microbiologa de ambientes marinos


97% del agua del planeta La mayor parte est por debajo de los 100 metros, por lo que constituye una fuente de vida a alta presin y baja temperatura. Escasos recursos (N, P, Fe) Cianobacterias (proclorofitos, Trichodesmiun) o en zonas costeras las Algas (Ostreococcus) son productores primarios de (CH2O)n

Comunidades bacterianas en ambientes acuticos


Fotoauttrofos: Chlorobium (verde del azufre), Chromatium (roja del azufre). Fotohetertrofos: Chloroflexus (verde no del azufre), Rhodospirillum (roja no del azufre). Quimiohetertrofos: Sphaerotilus (bacterias con vaina), Caulobacter (con prosteca), Flexibacter (deslizantes aerbicas). Aprovechan los gradientes de nutrientes. Quimiolitoauttrofos: Beggiatoa (deslizante oxidantes de SH), Gallionella (oxidadora de hierro). - Tambin se pueden encontrar diatomeas (constituyen fuente de carbono para otros microorganismos), protozoos (estos ltimos, se alimentan de otros microorganismos y aumentan la recirculacin de los nutrientes), hongos microscpicos y hongos filamentosos (que pueden esporular bajo el agua). Estos hongos se pueden adherir a hojas y proceder a su descomposicin.

Microorganismos de las fuentes submarinas


Thiobacillus, Thiomicrospira, Thiotrix, Beggiatoa. Hipertermfilos ( Methanopyrus)
Donador de electrones
HS-, S0, S2O32NH4+, NO2H2 H2 H2 Fe2+, Mn2+ CH4, CO

Quimiolitotrofos
Oxidadores del azufre Nitrificantes Sulfato reductores Metangenos Oxidadores del hidrgeno Oxidadores de hierro y manganeso Metilotrofos

Aceptor de electrones
O2, NO3O2 S0, SO42CO2 O2, NO3O2 O2

Producto a partir del donador


S0, SO4NO2-, NO3H2S CH4 H2O Fe3+, Mn4+ CO2

Proteorodopsina
La proteobacteria SAR11, la ms pequea clula conocida y probablemente la ms abundante de los mares. La SAR11 usa retinal, empleado por los ojos de animales y humanos para detectar luz Sin embargo su proteorodopsina es evolutivamente distinta de las de eucariotas y de Arqueobacterias ( Halobacterium) Sorprendentemente, la bacteria SAR11 crecen normalmente tanto si dispone de luz como si no, lo cual indic a los investigadores que la clula no depende de esta fuente de energa en condiciones normales. Es posible que sirva como sistema de "emergencia" para obtener energa cuando las clulas sufren periodos de inanicin en mar abierto, donde a menudo los nutrientes son muy limitados. El inters en la SAR11 es alto porque domina la vida microbiana de los ocanos, sobrevive donde la mayora de otras clulas mueren, y desempea un papel principal en el ciclo del carbono. Esta bacteria pudo haber prosperado hace unos mil millones de aos o ms, pero tiene la menor estructura gentica conocida entre las clulas individuales y no fue descubierta hasta 1990.

Bioluminiscencia
Alteromonas hanedai - only obligate aerobe emitting light; grows at 4C not at 35C ?? (Photobacterium) leiognathi - fish light organs; no growth at 4C; growth at 35C Vibrio fischeri - yellow-orange growth at 30C; no growth at 4C; emits light weakly Vibrio (Photobacterium) phosphoreum growth at 4C, no growth 35C; brightest light emiter of all bacteria; isolated from fish light organs and seawater

Vibrio fischeri

Vibrio (Photobacterium) phosphoreum Contienen luciferasa que cataliza la oxidacin del FMNH2 y un aldehdo, en presencia de oxgeno, produciendo FMN, cido, agua y LUZ

The lux operon in Vibrio fischeri


The genes responsible for the bioluminescent system are organized into two operons. The genes coding for the bacterial luciferase subunits (luxA and luxB) as well as the genes for the fatty acid reductase polypeptides (luxCDE) are organized in the right lux operon. At the front of the right operon is luxI, the gene responsible for synthesizing the autoinducer. Recently, another gene has been identified downstream of luxE called luxG. The function of luxG and its gene product remains a mystery because mutations made in the luxG domain do not seem to disrupt expression of the lux phenotype. LuxG has not been identified in any terrestrial luminescent bacteria so it is believed that luxG is related to a specific function required by marine luminescent bacteria . The amino acid sequence of the luxG gene product has recently been shown to be related to that of a flavin reductase and other enzymes in electron transport. This implicates luxG as a component in producing FMNH2 for the luminescent reaction. The left operon is responsible for the expression of luxR, which encodes for the receptor protein for the autoinducer. The receptor-autoinducer complex binds a specific sequence of DNA in front of the right operon and activates the expression of the lux structural genes

Homoserina lactonas

Ciclos biogeoquimicos

Microbial involvement in cycles of elements: Major Elements in Living Systems Element Chemical symbol Carbon C Hydrogen H Oxygen O Nitrogen N Sulfur S Phosphorus P Potassium K Calcium Ca Iron Fe Sodium Na Magnesium Mg

Ciclo del Carbono

Carbon Cycle Microbial processes: autotrophy (photosynthesis) primary production CO2 + H2O-----------------> CH2O (organic material) heterotrophy CH2O + O2-----------------> CO2 + H2O methanogenesis (as primary production) CO2 + H2 -----------------> CH2O (cell material) + CH4

Plants, algae and photosynthetic bacteria absorb inorganic phosphate dissolved in water Microbial decomposition of organic phosphate returns it to the soil in an inorganic (mineralized) form

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