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Replicacin del DNA.

Complejos enzimticos
Empecemos con unas preguntas abiertas :D Cmo funcionan los antibiticos? - Hay distintos tipos de funciones. Unos afectan a la membrana celular, otros inhiben la replicacin, etc. SON ESPECFICOS. Por qu afectan a los organismos patgenos y no afectan a los humanos? - Por diferencias metablicas, por genes diferentes expresados en uso y en otros no, por la secuencia que finalmente define una estructura diferente. Tambin, aquello antibiticos que actan a nivel de ribosomas en procariotes no actan sobre los ribosomas de eucariotes. Cmo fueron desarrollados? - Dependiendo del tipo de antibitico y el proceso que se est inhibiendo, se desarrollaron de distinta manera. Cmo funcionan los antirretrovirales? - Impide la formacin de DNA a partir de RNA. Cmo se logr obtener la secuencia del genoma humano? - Mediante el estudio de los mecanismos que estn dentro de lo que llamamos el flujo de informacin gentica. Desde la informacin que est en el DNA pasando por el RNA, por protenas; en los procesos de replicacin, traduccin, transcripcin, entre otros. A travs del estudio y anlisis de como se dan estas reacciones y las diferencias a este nivel entre los patgenos y los eucariontes superiores, se pudo determinar la secuencia del genoma del ser humano. Con sta informacin se pueden crear antibiticos especficos para las enzimas de una bacteria en particular. Sin embargo, existi todo un proceso por el cual se pas para llegar a stos resultados.

Esa es un poco la idea de comenzar a estudiar a los mecanismos que ocurren, las diferencias entre eucariontes y procariotes, y luego se ir avanzando poco a poco en cada cosa. Para sta clase se revisarn los mecanismos de reaccin, los elementos necesarios para la replicacin del DNA o sntesis en general de cidos nucleicos, el sistema o replisoma (complejo enzimtico), las DNA polimerasas (autocorreccin de errores), otras polimerasas (transcriptasa reversa, virales, antivirales), replicacin (telmeros, mitocondrias, viruses, DNA, RNA).

Actividad de la polimerasa

La polimerasa es la encargada de sintetizar una cadena nueva copiando una cadena parental o templada. Entonces, si se tiene el DNA templado G, A,C, T (leyndose de 3a 5), la cadena nueva que se sintetiza va de izquierda a derecha de 5a 3.

En la cadena templada se puede ver que las bases se encuentran pareadas formando la cadena nueva. En el caso de la adenina, se puede observar cmo ingresa su par como tiamina trifosfato, luego existe un ataque del grupo hidroxilo al primer grupo fosfato (alfa), esto genera la formacin del enlace fosfodister, se libera el grupo pirofosfato. Luego se observa que queda un nuevo grupo hidroxilo en la ltima posicin de la cadena listo para recibir a otra base. La reaccin fundamental aqu es la transferencia de un grupo fosforilado. En ste caso se puede ver una cadena que est creciendo; sin embargo, es importante reconocer que se necesita un iniciador o primer. Este iniciador puede ser un pedazo pequeo de nucletidos que sea complementario a la secuencia del templado y que tenga un OH al final para que pueda darse la reaccin. Las DNA polimerasas no pueden simplemente comenzar a colocar nucletidos de la nada, siempre tienen que colocar nucletidos, agregando de uno anterior, por lo tanto ellos s necesitan un iniciador. Si no tuviesen estos, no tendran a quin juntar el nuevo nucletido. Si bien es cierto que la sntesis del DNA como del RNA tiene el mismo mecanismo, las RNA polimerasas, s pueden hacer sntesis sin necesidad de primer, contrario a las DNA polimerasas. Ahora, si para meter una base, se necesita una base ya sintetizada, Cmo se sintetiza la primera? La nica polimerasa que puede sintetizar un primer es la RNA polimerasa, entonces, existe una enzima que se llama primasa (la que coloca los primers) y esa enzima esde tipo RNA polimerasa. Ahora, al ser el primer sintetizado por RNA este tendra que tener uracilo. Entonces?... (se responder ms all) El mecanismo base para toda sntesis de cidos nucleicos en general (DNA o RNA), siempre va a ser dependiente de magnesio. Se van a tener dos iones magnesio importante. El primero, est relacionado con la forma con la cual se puede hacer el ataque el oxidrilo del extremo 3 del ltimo

nucletido, sobre el fosfato alfa del siguiente nucletido. Para que se d este ataque, se necesita un ion magnesio. Tambin se necesita un segundo ion magnesio que ayude a la liberacin del pirofosfato. Estos magnesios se asocian a aspartatos. Todas las DNA polimerasas contienen aspartatos, algunas dos y otras 3. Estos aspartatos han sido bien conservados y son los ms importantes ya que estn asociados con el magnesio y permiten que la reaccin se lleve a cabo. Entonces una vez que se ha dado la reaccin, se forma el enlace fosfodister. Esto ocurre tanto para DNA polimerasa como para RNA polimerasas. Ahora (continuando con la ronda de preguntas) , Cmo es la estructura de un dideoxinucletido trifosfato? (ddNTP) Recuerdan la diferencia entre el ATP y el dATP? El dATP es desoxi, es decir, sin OH en el carbono 2. Al igual que en el ATP, los nucletidos trifosfato. Un dideoxinucletido no tiene OH ni en el carbono 2 ni en el 3.

ATP

dATP

Entonces, luego de conocer el mecanismo con el cual se sintetizan los cidos nuclicos, qu pasara si en lugar de tener un nucletido se tuviese un dideoxinucletido? En el momento de la sntesis, en fosfato alfa (el primero) debe atacar nucleoflicamente al oxgeno del carbono 3, en este momento (y con la ayuda del cofactor magnesio) se forma el enlace fosfodister. La pregunta es ingresa o no el dideoxinucletido? El dideoxinucletido s ingresa, ya que el receptor o el

nucletido anterior s tiene el O en el carbono 3, lo que pasara es que en ese momento dejara de sinterizarse. Una vez que ingresa el dideoxinucletido ya nada ms puede ingresar porque los siguientes nucletidos no tendran de donde formar el enlace fosfodister. Cabe resaltar que no importa si el OH del carbono 2 no est. El importante para la formacin del enlace es el 3, si el dos est desoxigenado, el nucletido ingresa igual a la cadena y no la afecta en nada. Por otro lado, si el nucletido tuviese solo 2 fosfatos o uno, ste podra ingresar a la cadena? ste s no podra ingresar ya que necesita OBLIGATORIAMENTE 3 fosfatos para ingresar. Uno que ataque nucleoflicamente al OH y forme el enlace fosfodiester con el cofactor Mg y otros dos que puedan ser liberados. Ese efecto del dideoxinucletido entra pero no deja que contine la sntesis, es el efecto que tienen los antirretrovirales. Los antirretrovirales tienen otro grupo unido al carbono 3 pero no tienen un grupo hidroxilo, por ende evitan que la sntesis contine. Los antirretrovirales entran al DNA viral y truncan la replicacin del virus. Pero Qu hace que solo reaccione este dideoxinucletido con las enzimas virales y no con las enzimas humanas? La especificidad que est dada por la diferencia de la estructura de la enzima. La estructura de la enzima viral y la estructura de la enzima humana probablemente son muy parecidas, pero siempre hay algunas diferencias, lo que le da la especificidad. Igual existen algunos efectos con los pacientes que consumen estos antirretrovirales. Tienen la piel seca, se les cae un poco el pelo, etc. esto ocurre justamente porque la eficiencia y la especificidad no necesariamente son 100 una u otra. Siempre va a haber un porcentaje de interaccin y va a haber un porcentaje de bases tambin incorporadas en el DNA humano. Hay muchos anti cancergenos que tienen este tipo de principio.

Los dideoxinucletidos tambin han sido usados para el secuenciamiento del genoma humano. Ya entonces, repasando un poico. Se tiene la cadena templado de 5 a 3. E la primera parte de esta cadena se tiene el primer, lo importante es que este primer tenga un grupo hidroxilo en el carbono 3 para que la sntesis pueda darse a cabo. Entonces entra un nucletido, forma un enlace fosfodiester con en fosfato alfa del nucletido, esto se da en presencia de magnesio, luego se libera el pirofosfato (tambin con magnesio) y el proceso se repite. La sntesis siempre se dar de 5 a 3. En este caso la cadena sera de ribonucletidos, porque ha sido hecha por una primasa que es un tipo de RNA polimerasa. La cadena templado proviene de una clula madre doble. Esta cadena se tiene que abrir y uno de los lados de esta va a ser justamente el templado (el molde) para poder hacer la nueva que es siempre complementaria. Continuando con la clase.

La replicacin se dice que es semi-conservativa, semi-discontinua y bidireccional. Con semiconservativa quiere decir que de las dos cadenas originales, se conserva solo una y la otra es nueva. Este es el experimento que hizo Meselson y Stahl. En este experimento, se marca un DNA con nitrgeno pesado N15. Las bases nitrogenadas tienen nitrgeno pesado. Luego se pone en un cultivo a bacterias con nitrgeno pesado. Aqu todo su DNA sera pesado. Pesara ms de lo normal porque sus bases tienen N15, el cual pesa ms que el N14. Qu pasara si despus se sacan estn bacterias, se lavan, se ponen en un medio con N14 y se dejan uno o dos das? Si la parental tiene sus dos hebras N15, las sucesorias tendrn N15 con N14. Por lo tanto, la densidad y el peso sern intermedios. Y qu pasara en la siguiente generacin? Una ser N15, N14 y la otra ser N14, N14. Lo que se quiere ver es si cuando se centrifuga el DNA original, parental, totalmente con N15 tiene esta banda en el tubo, despus de la centrifugacin se encuentra una banda al medio, ya no es tan pesada, es intermedia, por lo tanto tiene N14 y N15. En la siguiente generacin se tienen una segunda banda que pesa aun menos porque es solo de N14. En la siguiente generacin se tendran 8 cadenas (2 hbridas y 6 N14, N14). Entonces, en el tubo se encontrarn 2 bandas. Una hbrida y otra ligera; si embrago, la ligera sera ms ancha porque tendra ms cadenas. Ahora, decimos que la replicacin es semi-discontinua. Esto quiere decir que una de las cadenas es continua y la otra es discontinua. Decimos que la cadena lder es la que se sintetiza de manera continua y la rezagada, de manera discontinua (en fragmentos). Si se tiene aqu las cadenas que se van abriendo, si esta va de 5 a 3 de izquierda a derecha, la replicacin de abajo ira tambin de 5 a 3 pero de derecha a izquierda.

Por lo tanto, la cadena debe esperar un rato a que la hebra se abra para poder seguir sintetizando. Por ende, esta se replicar por fragmentos. Se coloca un primer, se sintetiza y luego se espera a que la hebra se abra un poco ms. Luego se vuelve a colocar otro primer, se sintetiza y se espera. As sucesivamente, se va replicando la cadena. A esos fragmentos cortos se les llama fragmentos de Okasaki. La nueva cadena que se forma siempre va de 5 a 3. Decimos que la replicacin es bidireccional. Esto se dice no por el hecho de que una va de 5a 3 y la otra de 3 a 5. Se dice que es bidireccional porque a partir de un mismo origen de replicacin se abren dos horquillas de replicacin que corren en sentido contrario. Esto explica un poco la confusin que se poda tener a un inicio en saber quine es la cadena libre y quin es la rezagada. Entonces, a partir del origen de replicacin se abren dos horquillas que corren en sentidos opuestos. Supongamos que se mira el lado derecho. Se tiene el primer inicial y, ya que la cadena azul va de 3 a 5, la cadena que se forma (la roja) debe ir de izquierda a derecha de 5 a 3. Entonces, si vemos lo que ocurre al otro lado, esto es distinto. Como no puede ir en la misma direccin de la apertura de la horquilla de replicacin, tiene que ir simplemente por pedazos hacindose de 5 a 3. Si se sigue abriendo, se tendra que colocar otro primer para poder formar otro pedazo. Ahora, cmo sabemos qu cadena es la discontinua y cul es la continua? Si la horquilla de replicacin se abre hacia la derecha, aquella cadena que vaya en la misma direccin

sera la cadena lder. Mientras que aquella cadena que se sintetiza justamente hacia el otro lado, de 5 a 3, sera la que se hace por fragmentos, la rezagada, la discontinua. Vemos microfotografas de cmo se da la replicacin, tenemos stas que se estn recin abriendo, continua, hasta que termina la replicacin y se separan los dos cromosomas circulares en este caso en la bacteria y cada una va a una clula hija. De esa manera tenemos un origen de replicacin en procariontes se abre para ambos lados tanto derecha a como izquierda y luego se sigue abriendo hasta que se completa. Se hace la aclaracin de pese a tener solo un origen (Puede explicarse porque es un cromosoma circular y pequeo) es BIDIRECCIONAL, en comparacin que tiene muchos orgenes de replicacin en eucariontes.

Durante la replicacin cuando se va a dando la apertura de cadenas se origina torsin, se tiene que liberar la torsin, para no truncar la replicacin; para esto existen unas enzimas llamadas toposoimerasas topo = topologa isomerasas = ismeros, Porque van a cambiar a la misma molcula solo de una forma a otra.

Tipo 1 si corta 1 sola cadena Tipo 2 si corta 2 (ambas) cadenas En el ejemplo isomerasa tipo 1 que tiene grupo tirosina que se une al DNA ,le hace un corte a la cadena y hace que gire sobre s misma, liberndola en 1 vuelta, luego puede volver a sellar, por el contrario con una topoisomerasa tipo 2

corta ambas cadenas por lo cual libera mayor torsin( libera ms vueltas).

LA ACCIN DE LAS TOPOSOIMERASAS ES UN SISTEMA CONTROLADO Bruno pregunta sobre el ADN tipo z Los DNA tipo z, no estn todo el tiempo, en todo el DNA solo algunas zonas ricas en guanina citosina, hay zonas con DNA tipo z esto se ve ms en PROCESOS DE transcripcin NO de replicacin. La helicasa corta los puentes de hidrgeno pero llega a un punto donde hay torsin, all necesitas la toposoimerasas. Por qu es importante esto? Porque las enzimas pueden ser target para antibiticos. Existen inhibidores por ejemplo la novobiocina y la cumermicina, inhiben subunidades ATPasas que son codificadas por girasas B la girasa b es una toposoimerasas de tipo 2 dependiente de ATP como tiene una subunidad ATPasas, han generado drogas para que sean especfica para las ATPasas de la girasas. Otro es el ac. Nalidxico es una droga que se usa en qumica como medicamento que acta sobre las subunidades pivotales codificadas por girasa A que es la otra subunidad de la girasas, que es aquella que permite la rotacin del ADN para que pueda liberar la torsin. Sea para 1 u otra toposoimerasas, ya se tiene este tipo de drogas para contrarrestar la infeccin. Que pasas con el ADN de la bacteria que esta afectndonos. Ya no podra replicarse, por lo tanto se mata a esa bacteria Alonso pregunta solo una o ambas drogas? En este caso solo se utilizara una droga. Pero por ejemplo en el caso de antirretrovirales estn interactuando con la transcriptasa reversa, se ha visto que a partir de que empezaron a utilizarse estos antirretrovirales. Se vio que existan cepas con resistencia y el paciente ya no responda y seguan los virus aumentando. Los virus tienen sistemas que durante la replicacin no tienen autocorreccin por lo cual tienen mutaciones enormes, esto permite modificar un poco la estructura de su ADN polimerasa, y de esa forma evitan el efecto del uso de algunas drogas (medicamentos), o sea ya no

son susceptibles a este tipo de antirretrovirales, entonces en este caso s sera necesario, para pacientes de HIV el uso de ambos tratamientos, un antirretroviral y una antiproteasa. Una antiproteasa importante en HIV que cuando se elimina una y se coloca el antirretroviral de esa manera el paciente responde mucho mejor. Ya hemos visto los elementos que se requieren La cadena templada. El iniciador /primer Los dNTPs desoxinucletidos trifosfatados. N es para cualquiera (A C G T) ADN Polimerasas

Ahora cuando hablamos de ADN polimerasa tambin hablamos de un concepto importante la procesesividad. Hay diferentes DNA polimerasas, la polimerasa puede colocar una base, un par de base y listo de all se va, entonces tiene una procesividad de una o dos bases (baja procesividad). Pero puede ingresar una, por ejemplo aquella que ingresa en el primer de la cadena lder, ingresa y se va de largo, se sigue abriendo la cadena y se va de largo, porque va de 5 a 3 de forma continua, esta enzima (polimerasa) ingresa y hace 500 000 nucletidos de corrido, por lo cual esta tiene una alta procesividad. Entonces procesividad es el nombre que se le da a la actividad de polimerizar por cada vez que ingresa, se une al DNA hace la sntesis y se separa, entonces cunto hace antes de separarse antes de la cadena, a eso se le llama procesividad. Como la ADN polimerasa 1 que ingresa y puede hacer 4 bases. 16 bases, 40 bases, su procesividad es baja.

Qu pasa si la ADN polimerasa coloca un nucletido equivocado? Ocurre una mutacin, pero El ADN puede corregir este error y eso depende del tipo de polimerasa que tenga.

Por otro lado que sucede con los iniciadores que sabemos que son de RNA, hemos dicho que la primasa coloca los primers pero son de RNA (ribonucletidos) Se pueden crear estos pedacitos de RNA formando parte de DNA? NO, tiene que eliminarse ese pedacito de RNA y colocarle DNA, para poder tener toda la cadena de DNA, Quin hace este trabajo? Quin hace el trabajo de remover el RNA (PRIMERS)? La funcin exonucleasa, tenemos una funcin exonucleasa de 3 a 5, esto significa que va al revs, por lo tanto si es que la enzima DNA polimerasa est haciendo su trabajo y va de 5 a 3 y se equivoca retrocede de 3 a 5 y va quitando los ltimos nucletidos que coloc y nuevamente regresa de 5 a 3 a colocar los nucletidos correctos. Entonces ella misma la DNA polimerasa puede avanzar de 5 a 3 y si se equivoca regresar y corregir su error de 3 a 5 como una funcin exonucleasa, exo quiere decir que empieza desde afuera, desde el que se dio cuenta de que se equivoc (puede darse cuenta porque la estructura formada no es la esperada) , no necesariamente comienza donde hubo un error, esto debido a que acta velozmente, por eso ella va haciendo una revisin de lectura. Supongamos que ha puesto 8 nucletidos, pero se equivoc en el 3, entonces saca todo hasta corregir su error, podra pensarse que gasta mucha energa, pero es la forma en que se asegura que la secuencia sea fidedigna. Esta accin lo puede hacer cualquier DNA polimerasa que tenga la actividad exonucleasa de 3 a 5, la DNA polimerasa puede tener una subunidad aparte o puede estar dentro de ella la actividad exonucleasa.

Cuando se habla de nucleasas en general es una enzima que degrada nucletidos, pero de all vienen dos nombres DNAsas si es que degradan DNA, RNAasas si degradan RNA. Endonucleasas si tiene un corte al medio o exonucleasas si empieza desde un extremo. Ahora tenemos la eliminacin de los iniciadores, los primers que estn en el extremo de la cadena, que han empezado a hacer la sntesis de 5 a 3 , cmo lo sacamos?, con una funcin exonucleasa de 5 a 3, entonces esto lo hace una enzima especializada que tambin es una DNA polimerasa, en este caso la DNA polimerasa 1 en caso de procariotes, y tenemos que esta exonucleasa va en la misma direccin de sntesis. Si nosotros regresamos a esta misma grfica, cmo podramos hacer para sacar este primer, aqu viene la DNA polimerasa y empieza a sintetizar, cuando llega aqu se detiene porque ya no puede avanzar porque hay un fragmento de okazaki anterior, y ahora ingresa la DNA polimerasa 1, que es la que tiene funcin exonucleasa de 5 a 3, y como est en esta direccin de 5 a 3 saca el nucletido (que est en negrito) que es el ribonucletido, pero tambin tiene funcin polimerasa de 5 a 3 por lo tanto utiliza el ltimo nucletido de este fragmento de okazaki y de all une el nucletido, saca ribonucletido y coloca el desoxinucletido, al final canjea todos los ribos por desoxi ( ESTO LO HACE EN LOS GRUPOS OH, EN EL GRUPO HIDROXI SE HACE EL CAMBIO DE RIBO POR DESOXI) y el primer ya queda ahora s de DNA. OJO SE EST TOMANDO COMO EJEMPLO LA E.COLI (PROCARIOTE).

Para que no queden huequitos acta a ese nivel la DNA ligasa que une y sella el DNA. ENTONCES LO QUE HA HECHO LA DNA POLIMERASA 1 ES CANJEAR RIBOS POR DESOXIS. En el caso para la autocorreccin tenemos aqu el fragmento de klenow, es una DNA polimerasa 1 de E.coli que se le ha quitado la funcin exonucleasa de 5 a 3, entonces tiene la funcin polimerasa y tiene la funcin exonucleasa de 3 a 5, por la tanto si se equivoca, puede retroceder y volver a sintetizar la cadena. La forma de que la DNA polimerasa puede dar cuenta que hay un error, es porque tiene una especie de abrazadera hacia en DNA, y va pasando el DNA y va revisando de que est bien hecho y que tenga toda la estructura normal; si ve una estructura rara entonces regresa y corrige el error, colocndole los nucletidos normales. Esto es bsicamente por estructura Tenemos DNA POLIMERASA 1 DNA POLIMERASA 2 DNA POLIMERASA 3 , pero se han encontrado 2 polimerasas ms aunque no se sabe exactamente su funcin.

RESUMEN EN LA IMAGEN

La primera en encontrarse fue DNA POLIMERASA 1, es un solo pptido que tiene la funcin de polimerizar, pero tambin tiene funcin exonucleasa de 3 a 5 y exonucleasa de 5 a 3, pero de procesividad baja y lenta, y cuando empezaron a ver cada cuanto tiempo se duplica una bacteria que es aproximadamente de 20 minutos se duplica todo su DNA que son 6 millones de bases y cuando vieron que esta iba tan lenta, dijeron de que ella no poda haber hecho toda la duplicacin as que encontraron la DNA polimerasa 3, la que tiene la procesividad de 500 mil bases continuas y es muy rpida entonces luego encontraron DNA POLIMERASA 2 que acta en sistemas de reparacin. Existen otras DNA POLIMERASAS pero an no se saben su funcin, pero al momento son 5. Comparando el tipo de subunidades entre las DNA POLIMERASAS, el DNA polimerasa 1 es la ms sencilla, la DNA POLIMERASA 3 tiene hasta 10 subunidades para que funcione correctamente, la DNA POLIMERASA 2 tiene 4 subunidades. Proofreading (autocorreccin) tienen las tres polimerasas 1 2 y 3 TODAS PUEDEN CORREGIR SUS ERRORES. Pero solo la polimerasa 1 tiene funcin exonucleasa de 5 a 3, la funcin de sacar a primer y canjearlos por desoxirribonucletidos. La procesividad va as Poli 3 > poli 2 > poli 1

Si vemos como es la DNA POLIMERASA 3, vemos una DNA polimerasa grande, que tiene muchas subunidades, el centro cataltico est conformado bsicamente por

subunidades alfa, psilon y teta, de las cuales la polimerizacin la formacin del enlace fosfodister, la catlisis de la reaccin per se lo hace la subunidad alfa, que es la principal, la psilon es la que tiene la actividad de proofreading y adems se tienen 2 subunidades conocidas como b clamp o abrazaderas deslizantes. Imagnense que tienen dentro del ncleo en el caso de eucariontes o dentro de la clula en procariontes todo el DNA, pero no solo con las enzimas DNA polimerasas sino tambin enzimas del metabolismo. Uno puede pensar que el DNA esta desordenado, y que puede ser catico hacer desenrollar todo para replicarlo hacerlo rpido para no equivocarte

Como funciona este sistema la DNA POLIMERASA est asociada con la helicasa, como su nombre lo dice rompe las hlices, la helicasa rompe los puentes de hidrgeno entre las cadenas, entonces ella va abriendo la cadena y esta va asociada a las subunidades catalticas de la ADN polimerasa, para que no se escape la DNA polimerasa cada vez que ingresa necesita de una protena que abrace, que enrede al DNA y no lo dejen escapar para que pueda hacer toda la sntesis eso lo hacen los b clamps , entonces entra la ADN polimerasa el clamp lo abraza y se va deslizando como un tubo y el DNA pasa por el medio, entonces de esta manera uno puede utilizar estos b clamps para poder asociarse. Si tengo estos dos dmeros uno puede estar asociado a la cadena templada (lder) y el otro a la otra cadena rezagada y el tercer dmero se en la cadena rezagada, se va formando una especie de loop, en el momento que se arregla como que se detiene la sntesis, para que esto no ocurra y se siga haciendo la sntesis y no haya una pausa (para que se d de forma continua), se utiliza este tercer dmero. Adems si nosotros vemos quienes son los que actan tenemos.

Todas estas son protenas que actan en el complejo que es el replisoma.

Cmo inicia la sntesis? En el sistema de iniciacin bsicamente tenemos lugares que van a ser reconocidos como sitios de origen de replicacin, hemos dicho que en el genoma de bacteria, circular hay un punto de origen de replicacin, ese punto tiene que ser reconocido por protenas entonces ay secuencias de consenso en este caso 3 secuencias , que van a ser reconocidas por el DNA A que cuando se une forma como un loop, como un lazo en ese momento aqu se da la apertura de la cadena entran las

helicasas y luego puede ingresar all ya todo el sistema hacer el primer y de all arranca ya todo el sntesis de DNA.

Si nosotros comparamos la replicacin en eucariontes tiene mucha mayor complejidad tiene menor velocidad y tiene un genoma ms grande por lo tanto se demora ms en duplicar y hay muchos orgenes de replicacin, como nuestras cromosomas son iguales se van abriendo horquillas en ambos sentidos. Bruna pregunta si el tiempo, la complejidad tiene que ver con el tamao de DNA basura (que no tiene funcin definida) NO necesariamente tiene que ver por la diferente complejidad y velocidad, la complejidad tiene que ver con la evolucin que ha hecho que el proceso sea ms fino y preciso este proceso en eucariontes. Cmo haran para arreglar el problema del primer del extremo? En los extremos de los cromosomas hay telmeros, la telomerasa es una enzima encargada de la elongacin y replicacin de los telmeros, tiene una actividad DNA POLIMERASA, la telomerasa es un sistema que va a permitir elongar la cadena pero va a sintetizar DNA usando un molde interior que la telomerasa ya tiene insertada. Entonces es una enzima, especficamente ribonucleoprotena (RNA+ protenas) es una enzima que tiene asociada un RNA, que es un RNA COMPLEMENTARIO a la secuencia de los extremos de los telmeros, por lo tanto cuando se tenga la zona de los telmeros va a ser usada la

RNA para poder sintetizar DNA que le falta al sistema. La telomerasa y la transcriptasa reversa tienen una cosa en comn ambas van a traducir de RNA a DNA, hacen un proceso inverso entonces la transcriptasa reversa polimeriza ADN Polimerasa dependiente de RNA. Y LA TELOMERASA ES LO MISMO, va a elongar los extremos de DNA del cromosoma por lo tanto es una ADN polimerasa, pero va a copiar a un RNA por lo tanto es un RNA dependiente. Por lo tanto tienen la misma actividad. RNA POLIMERASA que hace la transcripcin RNA POLIMERASA DNA DEPENDIENTE DNA POLIMERASA 3 es una DNA POLIMERASA DNA DEPENDIENTE, porque copia DNA REPLICASA (enzima que puede replicar un virus de RNA en otro RNA) DEPENDIENTE RNA POLIMERASA RNA

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