BIOCHIPS

Poseen alto grado de precisin, que emplea material biolgico gentico (ADN o ARN) llamado Biochips o Microarrays, que pertenece a la disciplinas cientficas denominadas biocomputacin y bioinformtica. Antecedentes A finales de los aos ochenta, los investigadores de una compaa llamada Affymax que trabajaban en las sntesis sobre superficies slidas de pptidos crearon la plataforma GeneChip (desarrollada posteriormente por la compaa Affymetrix). La importancia de estas compaas radica en la extraordinaria capacidad de miniaturizacin de estas matrices. Usando esta tecnologa han aparecido nuevas compaas que han permitido el desarrollo actual de los biochips. Biochips Entendemos por biochip la disposicin ordenada y conocida de miles de fragmentos de material biolgico (bio), tales como ADN, ARN, o protenas, y almacenado sobre un soporte slido (chip). Etimolgicamente biochip se descompone en Bio (vida) y Chip (dispositivo de tamao muy pequeo construido mediante tcnicas de fotolitografa o robots piezoelctricos). Por lo tanto, un biochip es un dispositivo de un tamao muy reducido (varios micrmetros, un micrmetro 1m=10-6 es la millonsima parte de un metro) compuestos por un material biolgico conocido dispuesto sobre una matriz de silicio, plstico o cristal, que se emplea para obtener informacin sobre determinadas secuencias genticas. As existen biochips comerciales y biochips personalizados o home-made-chips segn las necesidades para la investigacin. los biochips son dispositivos en los que se deposita e inmoviliza el material biolgico, ADN o protenas, en forma de matriz sobre una superficie slida, y en el que se realiza un ensayo de afinidad entre el material inmovilizado, conocido como sonda y el material biolgico que se desea analizar.

Cmo funciona el biochips? Se toma una muestra de material gentico de un paciente o de un experimento que sea complementaria a la secuencia dispuesta en el chip, de tal forma que se hibriden y eliminen todas las cadenas de ADN que no sean complementarias al chip, que posteriormente sern ledas por un escner arrojando como resultado un patrn de luz caracterstico, que luego ser interpretado por un computador. Esta interpretacin se efecta mediante un complicado software diseado para tal fin, en la que se puede conocer las posibles deficiencias o mutaciones que hay en un individuo o una clula especfica en su material gentico.

El patrn de colores indica las caractersticas afines del material gentico de la muestra con la dispuesta sobre el biochip, los colores tenues, indican deficiencias o incompatibilidades genticas atribuidas a algn tipo de enfermedad. Aplicaciones La tecnologa en biochips tiene un amplio campo de aplicaciones, ya sea a nivel experimental (in vitro), a nivel industrial (ex vivo) o a nivel humano (in vivo). As: - Medicina preventiva y/o personalizada: se emplea para el conocimiento de rasgos genticos de las poblaciones, con el fin de prevenir algunas predisposiciones a padecer ciertas enfermedades, antes que se manifiesten sus sntomas (epidemiologa gentica). - Seguimiento de terapia: permite valorar determinados rasgos genticos que podran tener incidencia directa en la respuesta de una terapia gentica. - Monitorizacin de expresin gnica: permite cuantificar de manera simultnea la expresin de un gran nmero de genes, para ello se emplea como complemento sistemas robticos de alta precisin (por ejemplo la monitorizacin empleada en el proyecto genoma humano). Tambin la monitorizacin se usa para la cualificacin de determinados patrones de expresin genticas, con el fin compararlos con otros que presenten deficiencias expresas a travs de patologas descubiertas en una persona. - Secuenciacin: se emplean los biochips para comprobar o actuar como sistema de control de calidad sobre la compatibilidad y/o complementariedad de largas secuencias de ADN in vitro. - Deteccin de mutaciones y polimorfismos: permite el estudio de un gran sinnmero de de polimorfismos (elemento o sistema que puede tener diferentes formas) y deteccin de mutaciones en secuencias genticas complejas correlacionndolas con enfermedades especficas e infecciosas. - Diagnstico molecular y/o clnico: deteccin de microorganismos mediante la identificacin de marcadores genticos patgenos y sus mecanismos protenicos asociados, al igual que se emplean para el diagnstico de diferentes tipos de tumores a travs de sus patrones moleculares. Tambin se emplean los biochips para comprender la resistencia de los microorganismos ante los antibiticos e identificar dianas genticas con valor teraputico, estudiar su biologa interna, identificacin de cepas y desarrollo de medidas preventivas frente a las enfermedades infecciosas. - Screening y toxicologa de frmacos (farmacogenmica): anlisis en los cambios de las expresiones gnicas presentes durante la administracin de un frmaco y efectos toxicolgicos asociados, al igual que la localizacin de nuevas dianas teraputicas. - Nanosensores: empleados en nanomedicina, neogentica y nanobiotecnologa, como sistemas de deteccin yrastreo de trazas o fragmentos genticos con fines teraputicos, militares e industriales in vivo e in vitro (por ejemplo, para mejorar el procesamiento de productos qumicos y alimenticios). - Memorias de computadora basadas en bacteriorodopsina: molculas de bacteriorodopsina para aplicaciones de computacin de ADN y biochips de protenas (empleados para detectar microbios especficos, clulas enfermas o productos qumicos peligrosos o teraputicos en forma rpida y barata). - Biochips para prtesis artificiales: se pretende crear retinas artificiales para visin robtica y visin humana, interponer clulas nerviosas con semiconductores para crear Donde las ventajas de estos dispositivos son mayores que sus desventajas , como son:

alto rendimiento y capacidad de procesamiento de material gentico alta especificidad y sensibilidad en el momento del anlisis los ensayos son fcilmente reproducibles y transportables poseen alto paralelismo a la hora de efectuar mediciones simultneas de muestras diferentes (permiten realizar simultneamente numerosos ensayos

utilizando muestras distintas o mltiples ensayos con una nica muestra.)

el coste de reactivos no es muy elevado y es eficaz permite la posibilidad de almacenamiento de la informacin en sistemas de computo confiables

No se precisa un plan de gestin de residuos, tal como ocurre actualmente en muchos laboratorios de investigacin, principalmente debido a la utilizacin de material radiactivo.

Sin embargo, la falta de estandarizacin de los procesos y la inversin inicial en las infraestructuras necesarias para llevar a cabo ensayos con biochips generan un coste muy elevado que todava es de difcil amortizacin.

OTRAS APLICACIONES:

Un equipo de ingenieros de la Universidad de Brown, en Estados Unidos, ha diseado un dispositivo biolgico capaz de medir las concentraciones de glucosa presentes en la saliva humana, un medio en el que la glucosa se encuentra mucho ms diluida que en la sangre. Se trata de un biochip que podra resultar de gran ayuda para los diabticos, porque les evitara tener que hacerse anlisis de sangre para controlar sus niveles de glucosa. Pero, segn los cientficos, el biochip, adems, podra servir para la deteccin de otras sustancias, desde ntrax a compuestos biolgicos, en organismos y entornos. Por Yaiza Martnez.

http://www.fisiotraining.com/cordoba/analisisgeneticos_biochip.htm http://www.tendencias21.net/Crean-un-biochip-que-mide-los-niveles-de-glucosa-en-lasaliva_a9677.html http://www.unicrom.com/article_read.asp?id=545&titulo_articulo=Biochips,%20la%20integraci% F3n%20de%20lo%20org%E1nico%20con%20lo%20inorg%E1nico