Reconstruyendo la historia de la vida

Fundamentos y evolucin de la ciencia sistemtica: comprendiendo la biodiversidad y su historia

Marcela Rodriguero

En efecto, los cientficos se hallan en la situacin de una tribu primitiva que pretendiese reproducir el Empire State Building, habitacin por habitacin, sin haber visto nunca el edificio original, y ni siquiera una fotografa. Por fuerza sus planes de trabajo slo sern una tosca aproximacin a la realidad, concebida sobre la base de diversos informes de viajeros, a menudo contradictorios en cuanto a los detalles. A los efectos de empezar el edificio, cierta informacin debe descartarse por errnea o imposible y las primeras

construcciones son poco ms que parvas de pasto. La creciente sofisticacin, combinada con una acumulacin metdica de datos, obliga a demoler las rplicas primitivas (cada una luego de violentos altercados) para sustituirlas sucesivamente por versiones ms actualizadas. Con toda facilidad podramos dudar que la versin que se tiene despus de slo 300 aos de esfuerzos sea una restauracin muy adecuada del Empire State Building, pero, a falta de conocimientos claros en contrario, la tribu debe aceptarla como tal (y no tener en cuenta algunas versiones de viajeros que no concuerdan).

E.J. Du Praw, Cell and Molecular Biology, academic Press, Inc, New York, 1968.

INTRODUCCION Hasta el momento hemos visto que la Teora de la Evolucin por medio de la Seleccin Natural permite explicar, por un lado, el cambio evolutivo (herencia con modificacin segn Darwin), y por el otro la adaptacin de los organismos al ambiente. Este cambio evolutivo ha generado, en el curso de la historia de nuestro planeta, una increble diversidad de organismos a partir del ancestro de toda la vida o cenancestro, mediante la ramificacin sucesiva de linajes. El campo de la biologa que reconstruye esta historia y que cubre los eventos que han producido la diversidad y distribucin de toda la vida se denomina SISTEMATICA. La sistemtica entonces no es ms que la comprensin de la historia de la vida. Ms all de su importancia intelectual, este campo forma la base de todos los otros campos de la biologa comparada y provee el esquema o CLASIFICACIN, por la cual otros bilogos comunican informacin acerca de los organismos, proveyendo de esta manera la base para la interpretacin de la historia de la vida. La diversidad es uno de los aspectos ms asombrosos del mundo vivo. Hasta el momento los bilogos han descrito aproximadamente 1.75 millones de especies vivientes y 0.25 millones de especies extintas. Es ms, se cree que existen entre 10 y 100 millones de especies an no descriptas. La contemplacin de esta diversidad genera en la mente humana una serie de preguntas que demandan explicacin. Desde la antigedad el hombre ha formulado explicaciones intentando dar cuenta de la misma, las cuales pueden reducirse a dos hiptesis bsicas: la creacionista y la evolutiva. Las preguntas son varias, pero pueden resumirse en tres grupos bsicos que hacen referencia a tres cuestiones: la diversidad, la adaptacin y las jerarquas biolgicas. En este captulo nos ocuparemos de esta ltima cuestin. EL ARBOL DE LA VIDA Cuando hablamos de la jerarqua biolgica, nos referimos a que las especies que nos rodean se ubican en una gradacin de rango, desde las ms sencillas hasta las de organizacin ms compleja. Pero cul es la base de esta gradacin? Existe una relacin de parentesco biolgico entre estos niveles de organizacin, o su relacin jerrquica es simplemente fruto de la casualidad? Para entender esta cuestin debemos abordar un punto importante: Por qu las especies constituyen una jerarqua? Por la sencilla razn de que en el curso de la historia de la vida la evolucin ha producido un patrn arborescente, divergente y jerrquico de similitud entre las especies. El llamado rbol de la vida, hiptesis concebida a partir de los trabajos de morfologa de Geoffroy St Hilaire y de embriologa de MilneEdwards a principios del siglo XIX, y esquematizada por autores como Darwin o Haeckel (Fig. 1), da cuenta de esta jerarqua biolgica; la evolucin no es un proceso lineal, sino (y adoptando la terminologa botnica aplicada a los rboles) que es un proceso de diversificacin de una rama (linaje) en dos o ms ramas hijas (cladognesis), y a su vez de stas, en sucesivas rondas de ramificacin, produciendo un entramado parecido a un rbol, en el que el crecimiento de las ramas es desigual (por la acumulacin de cambio evolutivo en cada linaje o anagnesis) y tambin el nmero de ramificaciones de cada linaje (Fig. 2). Para reconstruir esta historia de la vida apelamos a la inferencia de la filogenia, o sea, la topologa del proverbial rbol de la vida. El concepto de rbol de la vida est sustentado por la estructura del registro fsil, el cual aparece ramificado, y ha

constituido desde 1859 evidencia para la evolucin. El mismo Darwin afirm que el proceso evolutivo produce un patrn de grupos dentro de grupos. Volviendo ahora a nuestras tres preguntas, tanto la cuestin de la diversidad como la de la adaptacin pueden ser respondidas ya sea desde el marco de la Teora Evolutiva, como desde el Creacionismo. Pero es en la interpretacin evolutiva de las relaciones jerrquicas de los organismos donde la hiptesis creacionista es incapaz de dar cuenta de los hechos y queda descartada. Cmo podra, si no, una hiptesis de creacin independiente explicar las estrechas relaciones genticas entre los seres vivos? Si las especies prximas como el gato, el puma y el len, hubieran sido creadas de manera independiente, por qu tendran que parecerse ms entre s que con cualquier otra especie? Este parecido, manifestado en estructuras semejantes pero que presentan pequeas modificaciones propias de cada especie, es la consecuencia de haber derivado de una estructura de una especie ancestral reciente, de modo que el parecido se debe a un proceso de herencia con modificacin, segn palabras del propio Darwin. Este parecido evolutivo es el responsable de que puedan agruparse de manera jerrquica los seres vivos. Las semejanzas y las diferencias entre las especies entonces, no son ms que el resultado de un proceso histrico evolutivo.

La historia de la vida tiene forma de rbol Figura 1a: Diagrama de un rbol evolutivo propuesto por Darwin en su Cuaderno de notas sobre la transmutacin de las especies (1837)

Figura 1b: Primer rbol filogentico propuesto por Ernst Haeckel (1866)

Anagnesis

Cladognesis
Figura 2: Eventos anagenticos y cladogenticos representados en una filogenia hipottica

UN POCO DE HISTORIA El esquema jerrquico de la vida es una idea secular. Ya Aristteles (384-322 a.C.), el primer gran bilogo de la historia, crea que a todos los seres vivos se los poda distribuir en un orden jerrquico. Esta jerarqua se conoci como Scala Naturae (escala natural). La Scala naturae se iniciaba con los minerales, segua con las plantas, continuaba con los animales ms simples, ascenda hasta los vertebrados, llegaba a la especie humana y segua incluso hacia los ngeles y hacia Dios (Fig. 3). Esta gradacin lineal se consideraba como una manifestacin del orden natural, y cada organismo ocupaba un eslabn fijo, inamovible y perfectamente adaptado al entorno. Pero, mientras que para Aristteles los organismos vivos haban existido siempre, los bilogos posteriores (por lo menos los del mundo occidental) opinaban, de acuerdo a las enseanzas del Viejo Testamento, que todos los seres vivos eran obra de una creacin divina. El orden jerrquico entre todos los seres vivos se haba impuesto como una prueba del fijismo de las especies y tambin como una justificacin bblica de la preeminencia de la especie humana sobre las dems especies. Adems, crean que la mayora de las especies haban sido creadas para servicio o placer de la humanidad y que incluso la duracin del da y de la noche haba sido elegida para que coincidiese con la necesidad humana de dormir. Entre los partidarios de la creacin divina estaba Carolus Linneus (Linneo en lenguaje vernculo) (1707-1778), el gran naturalista sueco del siglo XVIII, quien desarroll nuestro sistema actual de nomenclatura para las especies (Fig. 4). En 1753 Linneo public su obra Species Plantarum que, en dos volmenes, describa todas las especies de plantas que se conocan en su poca. Inclusive mientras Linneo preparaba estos volmenes enciclopdicos, los exploradores regresaban a Europa desde frica y el Nuevo Mundo con plantas y animales no descriptos hasta entonces y, al parecer, hasta con nuevos tipos de seres humanos. Linneo revis edicin tras edicin para dar cabida a estos descubrimientos, pero no modific su opinin de que todas las especies que existan haban sido creadas por Dios el sexto da y que permanecieron inmutables desde entonces. No obstante, en la poca de Linneo se empez a vislumbrar que el plan de la creacin era mucho ms complejo de lo que se pens en un principio. Al estudiar la naturaleza con ms detalle continuamente aparecan ms especies, cuya ordenacin en una escala natural se haca cada vez mas complicada. Sin embargo, naturalistas como

Linneo no podan sustraerse a la idea de que Dios deba haber creado la naturaleza segn un orden establecido. Este orden natural, por lo tanto, debera reflejarse en la clasificacin sistemtica de las especies y a esto se aplic Linneo con gran xito. A l se debe la idea de establecer una clasificacin sistemtica de jerarquas inclusivas, que estableci en cuatro niveles: clase, orden, gnero y especie, categoras an actuales. Pero ya bajo el paradigma evolucionista, la contribucin ms importante de Linneo es la utilizacin de tcnicas de clasificacin y de conceptos biolgicos totalmente innovadores para la poca. Linneo define el concepto de especie como la unidad de reproduccin y es el primero que utiliza las piezas florales de las plantas para la clasificacin, sacando provecho del reciente descubrimiento del papel sexual de las flores. Aunque algunas de estas ideas, como el sexo de las plantas, no eran bien recibidas en los crculos elegantes de la poca, es evidente que Linneo sent las bases de la moderna sistemtica, aunque interpret todo su trabajo bajo el punto de vista fijista y nunca vislumbr la posibilidad de que su clasificacin, sobre la base de semejanzas anatmicas, pudiera ser el resultado de que unas especies procedieran de otras por cambios evolutivos. Con el descubrimiento de nuevas especies y los avances de la anatoma comparada, lo que en principio pareca una sucesin discontinua de especies se transform en una serie continua y gradual, que en algunos casos experimentaba ramificaciones laterales, dejando su carcter escalar para transformarse ms bien en un rbol. As, el concepto de escala natural fue desplazado, sentando las bases de la moderna filogenia y sustituyendo las ideas fijistas por las ideas evolutivas. Desde la publicacin de Sobre el Origen de las Especies en 1859, la ciencia de la taxonoma ha desempeando un importante papel en el desarrollo de la teora evolutiva, sirviendo de base al concepto de especie biolgica y a importantes teoras sobre la especiacin y la macroevolucin. Figura 3: Scala naturae

Figura 4: Parte del legado de Linneo (como el sistema nomenclatural y las categoras taxonmicas) ha persistido hasta nuestros das 5

SOBRE PARECIDOS Y DIFERENCIAS Linneo y todos los taxnomos anteriores a Darwin interpretaron a la jerarqua biolgica como la imagen de la organizacin de los seres vivos en arquetipos o planes diseados de un modo independiente, ajustndose de este modo a un supuesto orden creacionista. Sin embargo, la creacin jerrquica admite perfectamente una explicacin desde la Teora Evolutiva. En efecto, en el rbol de la vida todos los organismos guardan una cierta relacin genealgica, de forma que dos organismos cualesquiera tienen cierto grado de parentesco debido a un antecesor comn del que han derivado hace ms o menos un tiempo y que les hace compartir estructuras denominadas homlogas. Aquellos organismos que tienen un antecesor comn ms reciente presentarn, en promedio, mayor nmero de estructuras compartidas que otros organismos que tienen un ancestro comn ms antiguo. Darwin atribuy la generacin de las diferencias a la presin de seleccin natural en su principio de divergencia (Fig. 5), de manera que el nmero de sucesos evolutivos divergentes mediados por seleccin que han acontecido entre organismos cuyo ancestro comn es ms alejado es mayor que el que ha acontecido entre organismos cuyo ancestro comn es ms reciente. La sistemtica se basa en el anlisis de las homologas para reconstruir el rbol de la vida. Esto no resulta una actividad fcil en muchos casos, ya que las semejanzas pueden deberse no slo a descendencia de un ancestro comn (homologa), sino tambin a la respuesta adaptativa independiente a causas comunes, generalmente ambientales (analogas u homoplasias). Para que sea vlida, la metodologa sistemtica debe poder distinguir aquellas semejanzas fruto de la historia (homologas), de las que derivan de circunstancias comunes de la vida (analogas). Estas ltimas generalmente oscurecen las relaciones genealgicas o filogenticas.

Figura 5: Esquema del Principio de Divergencia, enunciado por Charles Darwin en su obra Sobre el origen de las especies (1859).

PONIENDO UN POCO DE ORDEN: TAXONOMIA Y SISTEMATICA Uno de los objetivos fundamentales de los observadores del mundo natural es percibir orden en la diversidad viviente. A fin de ordenarla, los bilogos estudiosos de esta diversidad la clasifican. Para clasificar, agrupamos a los objetos en clases segn sus atributos comunes. La TAXONOMA es la disciplina referida a la teora y prctica de la clasificacin de los organismos (o cualquier otra entidad, como los libros de una biblioteca o los artculos de un almacn en estantes). Este trmino fue acuado por el bilogo francs Agustn Pirano de Candolle en 1813. Por otra parte, el paleontlogo George Gaylord Simpson propuso el concepto SISTEMTICA para referirse al estudio cientfico de los tipos de organismos, de su diversidad y de todas las relaciones existentes entre ellos. Consciente de que la taxonoma puede reflejar tales relaciones o no y de que el estudio de la biodiversidad es mucho ms que una mera descripcin y catalogacin, bajo esta definicin, la sistemtica se concibi como la ciencia de la biodiversidad, y este nuevo concepto ampliado ha sido aceptado por casi todos los bilogos. El objetivo de la sistemtica entonces no es simplemente describir el mundo vivo, sino adems contribuir a su comprensin. Dijimos antes que el resultado de la clasificacin es la formacin de clases. Una clase es un agrupamiento de entidades similares y relacionadas entre s, de manera que los miembros de una misma clase compartirn uno o ms atributos o caracteres que no son compartidos por miembros de otros grupos. Al referirnos a los seres vivientes, cada clase se denomina taxn. Un taxn no es otra cosa que un grupo de organismos que comparten ciertas caractersticas. Los taxones pueden ser asignados a una determinada categora taxonmica (cada una de las particiones de la jerarqua). El rango taxonmico sera el lugar que ocupa una cierta categora taxonmica en la jerarqua. As, el taxn Mammalia pertenece a la categora taxonmica Clase y ocupa el mismo rango taxonmico que las otras clases, un rango inferior a los tipos o phyla y un rango superior a los rdenes y a las familias. Todo sistema de clasificacin tiene dos funciones principales: facilitar la recuperacin de informacin y servir de base para estudios comparativos. La clasificacin es la clave del sistema de almacenamiento de informacin en todos los campos. A su vez, las clasificaciones jerrquicas permiten almacenar y recuperar informacin de manera eficiente, ya que cuando se describe un taxn de rango inferior, por ejemplo una especie, no es necesario repetir las caractersticas de los niveles superiores a los que pertenece. Por ejemplo, al describir un gorgojo no es necesario mencionar los caracteres presentes en todos los hexpodos (dos pares de alas, tres pares de patas, un par de antenas) o en los dems integrantes del orden Coleptera (primer par de alas muy esclerotizado). Dado que la investigacin taxonmica es indispensable en todas las ramas de la biologa, resulta sorprendente lo olvidada y desprestigiada que ha estado en los ltimos tiempos. El principal mtodo en muchas disciplinas biolgicas es la comparacin, pero ninguna comparacin podr llegar a conclusiones significativas si no est basada en una taxonoma slida. Pero, desde 1859 en adelante, los fundamentos filosficos en los que se basaron las clasificaciones biolgicas han atravesado una serie de cambios. La manera en la que sucesivas generaciones de bilogos han formado los grupos dentro de grupos no fue siempre igual

ESCUELAS DE CLASIFICACION Dado que la evolucin ha producido un rbol de la vida, las clasificaciones biolgicas deben ser jerrquicas. Adems, otro objetivo perseguido por el bilogo estudioso de la diversidad es la representacin del orden natural expresado en la genealoga de los grupos de organismos. Ahora bien cmo se construyen estas clasificaciones? Las clasificaciones son elaboradas por los taxnomos, pero como ya hemos adelantado, en la historia de la clasificacin biolgica diferentes taxnomos han seguido distintas filosofas, produciendo distintos sistemas de clasificacin. Durante buena parte del siglo XX, los taxnomos estuvieron divididos en tres escuelas principales: la escuela evolutiva, la escuela fentica (o taxonoma numrica), y la escuela cladstica (o sistemtica filogentica). La escuela de pensamiento que ha persistido hasta nuestros das y que permite reconstruir la historia de la vida (con ciertas limitaciones) es la SISTEMTICA FILOGENTICA. Es interesante conocer las principales caractersticas de cada una de ellas, para as entender la evolucin de la taxonoma y de la sistemtica hasta nuestros das. TAXONOMA EVOLUTIVA Esta escuela de pensamiento, que predomin hasta mediados de los 80s, fue desarrollada principalmente por el ornitlogo Ernst Mayr (1904-2005) y por el paleontlogo de mamferos George Gaylord Simpson (1902-1984). Los taxnomos evolutivos postulaban que un sistema de clasificacin slido debera basarse en dos criterios: la genealoga o relaciones de ascendencia comn (representadas por los eventos de cladognesis) la cantidad de cambio evolutivo acumulado en un linaje por divergencia adaptativa (representado por los eventos de anagnesis) Ya Darwin, en su obra cumbre Sobre el origen haba sealado que la genealoga por s sola no proporciona una clasificacin por lo que la cantidad de cambio evolutivo acumulado no puede hacerse a un lado, ya que las ramas divergentes de un rbol filogentico experimentan diferentes grados de modificacin y esto se expresa en la ordenacin de las formas en diferentes gneros, familias, secciones u rdenes. Pero porqu Darwin considerara al cambio evolutivo acumulado en un linaje importante para la clasificacin, ms all de los puntos de ramificacin? Porque la ramificacin (o cladognesis) y la divergencia adaptativa (o anagnesis) no estn correlacionadas. Esto puede entenderse si pensamos que cuando los dinosaurios conquistaron el nicho areo, tuvieron que adaptarse al nuevo modo de vida, resultando en una modificacin drstica del fenotipo. Las ramas de la familia que permanecieron en el nicho ancestral apenas han cambiado. Esta consideracin de los factores ecolgicos y su impacto sobre el fenotipo es caracterstica de la clasificacin evolutiva. Es decir que los taxnomos evolutivos proponen separar en taxones diferentes a aquellos descendientes que se diferencian por una gran cantidad de cambio evolutivo y por ocupar zonas adaptativas distintas. Aquellos taxones que experimentan un cambio fenotpico tan grande que les permite conquistar una nueva zona adaptativa (como las aves con respecto a los reptiles o el hombre respecto a los otros primates) constituyen un grado (Fig. 6), y merecen ser

incluidos en una categora taxonmica diferente. En consecuencia, los taxones delimitados pueden ser tanto clados o grupos monofilticos (i.e. incluyen al antecesor comn y a todos sus descendientes) como grados o grupos parafilticos (i.e. incluyen al antecesor comn y a algunos de sus descendientes, pero no todos) (Fig. 7). Al final de este apartado, cuando hayamos completado nuestro viaje por la historia de las escuelas clasificatorias comprender mejor esta distincin (vea PARA PENSAR). Vale la pena resaltar que los taxnomos evolutivos adheran a la postura del realismo evolutivo, es decir que las especies se consideraban entidades reales de la naturaleza ms all de la capacidad del taxnomo para reconocerlas, y constituan unidades de evolucin. Entre los conceptos realistas propuestos por los taxnomos evolutivos se pueden citar el concepto biolgico de especie, propuesto por Mayr en 1970, el concepto cohesivo de especie, propuesto por Slobodchikoff en 1976 y el concepto evolutivo de especie, propuesto por Simpson en 1961 y modificado por Wiley en 1978. La representacin grfica tpica de la Taxonoma Evolutiva es el rbol filogentico, esquema en el que la longitud de las ramas es proporcional a la cantidad de cambio acumulado en cada uno de ellas. Tambin se denomina filograma. (Fig. 8a). En estos rboles se ven reflejadas las relaciones de grupos hermanos (o sea, dos taxones que estn ms cercanamente relacionados el uno con el otro que con un tercer taxn), por ejemplo los taxones E y F, y las relaciones de ancestro-descendiente. El rol de la Teora Evolutiva es muy importante en este tipo de clasificaciones, que pretenden reflejar tanto los patrones como los procesos evolutivos. Las principales crticas a esta escuela se basaban en que no haba un mtodo unificador ni conceptual, por lo que la autoridad sistemtica se centraba en un pequeo grupo de investigadores para cada grupo; se careca de procedimientos formales para corroborar o refutar una clasificacin propuesta; no haba una medida uniforme para comparar las clasificaciones de grupos taxonmicos; faltaba una orientacin filosfica clara sobre qu aspectos de la evolucin se reflejan en una clasificacin particular.

Figura 6: Esquema de los clados (grupos monofilticos) y de los grados (grupos parafilticos) Es importante notar que las clasificaciones evolutivas, dado que se basan al menos en

parte en las relaciones genealgicas, reconocen grupos mono y parafilticos pero desechan los grupos polifilticos (aquellos grupos formados por dos linajes que han evolucionado convergentemente hacia estados de carcter similares; de esto se desprende que el ancestro comn de ambos linajes no est contenido en el grupo) ya que forma los grupos dentro de grupos en base a caracteres homlogos, descartando los homoplsticos. Al otorgar una categora taxonmica diferente a los organismos altamente divergentes, el grupo que incluye a aquellos otros que no se han diferenciado tanto se reconocer por la posesin de caracteres primitivos, con lo que esta corriente taxonmica no distingue las homologas derivadas (sinapomorfas) de las homologas primitivas (simplesiomorfas).

Figura 7: Grupo mono y parafiltico esquematizados en la clasificacin de los tetrpodos

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ESCUELA FENTICA O TAXONOMA NUMRICA Esta corriente surgi a mediados de los aos 50 a partir de los escritos de varios investigadores. En 1963 dos de ellos, Robert Sokal (entomlogo de la Universidad de Kansas) y Peter Sneath (bacterilogo londinense y primer investigador en utilizar una computadora con fines taxonmicos), publicaron un libro que rene la justificacin y los procedimientos de esta escuela de pensamiento, Principios de Taxonoma Numrica. La taxonoma numrica naci como un intento de obtener clasificaciones objetivas. Sus seguidores crean que las tcnicas utilizadas por los taxnomos evolutivos para distinguir los caracteres filogenticos de los no filogenticos eran sumamente subjetivas, y evitando tal distincin crean sortear el gran problema de la subjetividad. De esta manera, la clasificacin fentica (o numrica) ignora la distincin entre caracteres filogenticos y no filogenticos y los mezcla a fin de definir los grupos dentro de grupos. Es por ello que los feneticistas incluan en sus anlisis toda clase de caracteres: homlogos ancestrales, homlogos derivados y homoplsticos. La filosofa que enmarca a esta forma de construir clasificaciones es radicalmente diferente de la de la escuela ya vista. Baste saber que los feneticistas eran nominalistas, es decir que para ellos en la naturaleza slo existan organismos individuales. Plasmaban estas ideas mediante conceptos de especies tales como el morfolgico (propuesto por Cain en 1954), el paleontolgico (propuesto por Simpson en 1961) y el fentico (propuesto por Sokal en 1973). Por otra parte, los feneticistas opinaban que si la clasificacin de los organismos se basa en un nico carcter se pueden producir conflictos en funcin de la caracterstica elegida para agruparlos. Pensemos en los grupos que formaramos si clasificramos a las especies de animales tomando en cuenta la presencia de columna vertebral, y en los grupos a los que llegara otro investigador si pusiera nfasis en la posesin de ojos! Los feneticistas creyeron solucionar este problema contemplando un gran nmero de caracteres en sus anlisis y promedindolos. Este promedio se lleva a cabo utilizando estadsticos de agrupamiento (ms conocidos en la literatura como cluster statistics). El primer objetivo es definir las distancias entre las especies (i.e. el promedio de las diferencias entre una especie y otra para cada uno de los muchos caracteres incluidos en el anlisis taxonmico). A partir de la matriz de distancias, y utilizando un estadstico de agrupamiento, se van formando los clusters con los taxones incluidos en el anlisis. Estos agrupamientos se expresan a travs de un diagrama llamado fenograma, que permite visualizar las relaciones de similitud global entre los taxones bajo estudio (Fig. 8b). En teora este proceso debera ser perfectamente repetible: cualquier taxnomo, si mide una gran cantidad de caracteres, debera llegar a la misma estimacin de la distancia entre especies, y por ende a la misma clasificacin. La subjetividad se haba eliminado de la taxonoma! Pero L.A.S. Johnson, un taxnomo australiano, ech por la borda las aparentes bondades de la taxonoma numrica al identificar varias fuentes de subjetividad que no pudieron ser eliminadas. La escuela fentica nunca se repuso de esta estocada mortal. El gran problema de la taxonoma numrica estaba constituido por la gran cantidad de posibles criterios para confeccionar la matriz de distancias entre las especies y la gran cantidad de estadsticos de agrupamiento (para una revisin de los mismos consulte Introduccin y Prctica de la Taxonoma Numrica, Crisci JV y Lpez Armengol MF, Sec. Gral. OEA, 1983). Dado que ninguno de estos estadsticos forma grupos que sean ms reales o ms naturales que otros, las pretensiones de objetividad de la taxonoma numrica sucumben. El taxnomo numrico puede elegir qu tipo de distancia o qu estadstico

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de agrupamiento utilizar en sus anlisis, pero esta eleccin es completamente subjetiva. Sin importar cuantos caracteres mida, an de manera completamente objetiva, el taxnomo seguidor de esta filosofa deber optar por la mejor metodologa de anlisis, y de esta manera, basar su eleccin en algn criterio superior, que desafortunadamente no existe. Este criterio superior podra ser un plan de la naturaleza que provea un punto de referencia externo y objetivo para la clasificacin fentica. Pero en ausencia de una jerarqua natural de similitudes fenticas, este tipo de clasificacin cae en la trampa de la subjetividad. Las clasificaciones fenticas trataban de agrupar a las especies de acuerdo a una relacin que la evolucin no produce. La evolucin no produce una jerarqua fentica particular privilegiada que sea ms real que otras jerarquas. Por otra parte, dado que esta corriente se basaba en la idea de semejanza entre los taxones (el nmero de caracteres que comparten), y no en compartir un ancestro comn ms reciente, el conjunto de estados compartidos es muy grande y puede ser de tipo homlogo u homoplstico. Por lo tanto, es muy probable que las relaciones evolutivas entre los taxones no se vean reflejadas por estas clasificaciones y los errores sern considerables cuando la contribucin de las simplesiomorfas y las homoplasias sea muy grande. Veamos un ejemplo Los percebes adultos (los crustceos que constituyeron el objeto de estudio de la gran tesis de Darwin), tienen una apariencia parecida a la de las lapas (un tipo de molusco). Si clasificramos a un percebe adulto, a una lapa y a un langostino fenticamente, agruparamos al percebe con la lapa, an cuando el percebe y la langosta comparten un antecesor comn ms reciente, lo que nos conducira a su agrupamiento si tomramos en cuenta las relaciones filogenticas. Hoy por hoy, la filosofa feneticista ha cado en el olvido, aunque la metodologa concebida bajo este marco de pensamiento ha sobrevivido hasta nuestros das y ha sido adoptada para resolver problemas relativos a la delimitacin de especies, al estudio de la variacin infraespecfica y al estudio de las relaciones filogenticas cuando se utilizan caracteres moleculares, como veremos en un prximo apartado. ESCUELA CLADISTICA O SISTEMATICA FILOGENETICA Los fundamentos de la escuela cladstica de clasificacin fueron presentados por el entomlogo alemn Willi Hennig (1913-1976) en su libro Grundzge einer Theorie der phylogenetischen Systematik (1950). Precisamente por el hecho de haber publicado su obra en ese idioma, esta pas desapercibida por algunos aos. En 1953 se citaron dos de sus prrafos en la revista Systematic Zoology (hoy Systematic Biology, la publicacin ms leda dentro de la disciplina) en los que se enfatizaba la necesidad de contar con un sistema general de referencia para la biologa. En 1965 apareci un resumen de las principales ideas de Hennig en ingls, y en 1966 se public su libro traducido a ese mismo idioma con el nombre de Phylogenetic Systematics, momento en el cual las ideas del entomlogo comenzaron a popularizarse ante el resto de la comunidad cientfica. Hasta ese momento, el libro haba sido editado en tres idiomas: alemn, ingls y castellano (este ltimo por iniciativa de un profesor de esta universidad, el Dr. Osvaldo Reig, con el nombre de Elementos de una Sistemtica Filogentica). En su obra, Hennig consideraba que no haba manera de representar todos los parmetros de la filogenia de un grupo en un sistema tan simple como la clasificacin jerrquica. Por lo tanto, en lugar de elegir representar vagamente varios factores en la clasificacin, se concentr en las relaciones de grupos monofilticos, enfatizando el grado de ancestralidad comn.

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Hennig formaliz sus ideas sosteniendo que los puntos de ramificacin (eventos cladogenticos) deban basarse en las sinapomorfas. Los grupos que comparten sinapomorfas son los grupos hermanos anteriormente citados, y stos, que se originan en un mismo momento, deben pertenecer a categoras taxonmicas de un mismo rango. Es interesante comentar, de acuerdo a los conceptos recin detallados, que el trmino cladista y todos sus derivados (del griego klados, rama), fue acuado por el taxnomo evolutivo Ernst Mayr, quien utiliz este apelativo en forma despectiva para referirse a los seguidores de la sistemtica filogentica, aludiendo al inters de los mismos en los eventos de ramificacin (eventos cladogenticos), en detrimento de los eventos anagenticos (recuerde lo aprendido hasta aqu!). La cladstica ha desarrollado diversos algoritmos para la reconstruccin filogentica, basados en el principio de simplicidad o parsimonia (que comentaremos en el prximo apartado), cuyos resultados se expresan grficamente en diagramas arborescentes llamados cladogramas (Fig. 8c). Los cladogramas representan relaciones cladsticas o de parentesco entre taxones, debidas a la presencia de un antecesor comn (teniendo en cuenta lo aprendido hasta aqu, como cree que ser el largo de las ramas de un cladograma?). Las clasificaciones hennigianas se basan en la reconstruccin de las filogenias de los organismos en base exclusivamente a la utilizacin de caracteres homlogos derivados (o sinapomorfas). La utilizacin de otro tipo de semejanzas (como las similitudes homoplsticas o las similitudes homlogas primitivas) puede conducir a reconstrucciones filogenticas errneas. Para entender la diferencia entre los distintos tipos de similitudes, discutamos el tema de la pentadactilia (Fig. 9a). El hecho de poseer cinco dedos no sita al hombre ms prximo a una rana que a una vaca, sino que simplemente es un estado que se ha preservado en buena parte de los tetrpodos a partir del ancestro de todos ellos, aunque algunos descendientes (como la vaca), hayan evolucionado hacia un solo dedo. Es ms, tener un estado nico, caracterstico de un linaje (autapomorfa) no ayudara a resolver la situacin filogentica de la vaca respecto a otros taxones que no posean ese carcter (recuerde lo aprendido sobre la escuela evolutiva!!). De esta manera vemos que tanto los caracteres homlogos compartidos primitivos o simplesiomorfas (cinco dedos en la rana y en el hombre) y los caracteres derivados nicos o autapomorfas (un solo dedo en la vaca) no son tiles en la tarea de la reconstruccin filogentica. La clave estara en los caracteres homlogos derivados compartidos por un grupo de organismos o sinapomorfas. Estos organismos constituiran un grupo monofiltico.

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Un ejemplo de sinapomorfa es la placenta. Los mamferos descienden de un ancestro comn que la tena, y ste a su vez desciende de otro ancestro que no la tena (Fig. 9b). La falta de placenta como estado ancestral no nos puede decir nada de la mayor proximidad entre pjaros, reptiles, insectos (todos ellos no placentarios) o de cualquiera de ellos con respecto a los mamferos placentarios, pero en cambio s podramos utilizar a la placenta para formar el grupo monofiltico Mamferos. De acuerdo a lo ya visto, los grupos de las clasificaciones cladsticas entonces son monofilticos; esta escuela rechaza a los grupos parafilticos y a los polifilticos. Esto se debe a que slo los grupos monofilticos son definidos de manera no ambigua por sus relaciones de ramificacin. Contienen todas las ramas que salen del ancestro dado, y nada se debe decir o conocer acerca de la evolucin fentica de las especies que descienden de cada ancestro. Analicemos un cladograma Observando el cladograma de la Fig. 10, se desprende la hiptesis de que Prorodon teres y Prorodon marina constituyen un grupo hermano y comparten un ancestro comn ms reciente entre s que con respecto a Coleps; pero los prorodontidos (P. teres + P. marina + Coleps) comparten un ancestro comn ms reciente entre s que con respecto a Placidae (Placus + Spathidiopsis). Estos rboles no hipotetizan explcitamente relaciones de ancestro descendiente. En otras palabras, el presente rbol hipotetiza que Prorodon y Coleps estn relacionados, pero no que Prorodon evolucion a partir de Coleps o que Coleps evolucion a partir de Prorodon. Los ancestros, para esta escuela, son hipotticos.

Para Hennig las especies eran las unidades bsicas del proceso evolutivo y tambin las unidades de la clasificacin. Para esta corriente de pensamiento, evolucin y clasificacin convergen al nivel de especie. Para el fundador de esta escuela, paradigma sistemtico actual, y al igual que para los taxnomos evolutivos, las especies eran entidades reales. Los seguidores de la filosofa cladstica utilizan definiciones de especie tales como el concepto filogentico, propuesto por Nixon y Wheeler en 1990, el concepto autapomrfico, propuesto por de Queiroz y Donoghue en trabajos publicados en los aos 1988 y 1990, y por ltimo el concepto monofiltico de especie, planteado por Mishler y Brandon en 1987. La propuesta de la escuela cladstica no se limita slo a la metodologa para la reconstruccin filogentica, sino que conlleva una postura filosfica para la clasificacin de los organismos vivientes. En resumen, el mtodo enunciado por Willi Hennig se basa en la bsqueda de caracteres que posean estados homlogos 14

compartidos que den lugar a grupos monofilticos, que de forma jerarquizada, y partiendo desde los caracteres que posean los estados derivados ms antiguos hasta los ms recientes, permitan la reconstruccin de la historia de la vida. La aplicacin de esta filosofa en sistemtica difiere de algunas clasificaciones establecidas, algunas de ellas procedentes de la escuela evolutiva. Desde un punto de vista cladstico la tradicional clase Reptilia debera ser eliminada (ver PARA PENSAR), ya que no constituye un grupo monofiltico. Estas clasificaciones filogenticas agrupan a las especies en base a lo reciente del ancestro comn. La jerarqua de relaciones ancestrales es una jerarqua nica, que se extiende hasta el principio de la vida y la incluye por completo. Esta jerarqua se puede transformar fcilmente en una clasificacin. La ventaja de la clasificacin cladstica tiene la ventaja de la objetividad, ya que la jerarqua filogentica existe independientemente de las metodologas utilizadas para descubrirla, y es nica en su forma, ya que la vida surgi una sola vez. Aunque diferentes tcnicas (tema que abordaremos ms adelante) arrojen diferentes soluciones o hiptesis filogenticas, siempre hay un punto de referencia externo al cual referirse. Sabemos que la solucin existe. Con el sistema fentico, tal solucin no existe, no hay una nica jerarqua fentica anloga a la jerarqua filogentica. La principal ventaja de la clasificacin filogentica es terica, ya que los problemas de ndole prctica que plantea esta visin de la clasificacin y de la historia de la vida son varios. Uno de ellos es que en realidad no conocemos las relaciones filogenticas. Slo las podemos inferir a partir de una reconstruccin (pues fue la vida misma quien las ha construido; nosotros slo somos capaces de reconstruirlas y de llegar, humildemente, a una aproximacin de lo que realmente ha ocurrido). Otro problema que surge al aplicar esta filosofa es la inestabilidad de la clasificacin, ya que el resultado obtenido puede cambiar ante la adicin de nueva evidencia (nuevas especies o nuevas fuentes de caracteres). Al cambiar la filogenia, tambin cambia la clasificacin, y con el advenimiento de las nuevas tecnologas, tanto en al campo prctico como en el terico, podemos afirmar que estamos viviendo una era de rpido cambio en lo que se refiere a las clasificaciones formales que estudiamos en nuestros cursos de grado. Hoy por hoy, la mayora de los bilogos aceptan que la sistemtica filogentica es el sistema mejor justificado en trminos tericos para la clasificacin de los organismos vivientes. La escuela cladstica es objetiva, y sin duda alguna las clasificaciones objetivas son preferibles a las subjetivas. La incerteza de las inferencias filogenticas hace que las clasificaciones cladsticas se vean sujetas a frecuentes revisiones, aunque los principales defensores de este sistema sostienen que a raz de sus anlisis proponen hiptesis filogenticas, y cualquier hiptesis saludable puede ser modificada ante la adicin de nueva evidencia. La clasificacin cladstica se ha vuelto popular slo recientemente. La clasificacin evolutiva fue la escuela ortodoxa por excelencia desde la sntesis moderna (aos 30), y quizs desde la publicacin de Sobre el origen, hasta los aos 80. La taxonoma numrica tuvo su esplendor desde finales de los 50 hasta principios de los 70. Pero actualmente estas dos escuelas han sucumbido ante la cladstica. PARA PENSAR La clasificacin tradicional (i.e. taxonoma evolutiva) otorg el rango de clase a mamferos, aves y reptiles. Dos de estos grupos, aves y mamferos, han sufrido independientemente un rpido cambio evolutivo y se han convertido en animales muy diferentes a los reptiles. En los distintos linajes reptilianos la tasa de cambio evolutivo

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ha sido ms lenta, por lo que han permanecido ms parecidos entre s. Los cocodrilos y las lagartijas, por ejemplo, son ms parecidos entre s que respecto a las aves. No obstante, los cocodrilos comparten un ancestro comn ms reciente con las aves que con las lagartijas. Los caracteres que se utilizan para agrupar a los miembros de la clase Reptiles, como las escamas, son ancestrales (o simplesiomrficos), resultando en la formacin de un grupo parafiltico. Los grupos parafilticos se vuelven peligrosos cuando uno o ms subgrupos han evolucionado rpidamente y han dejado a los otros miembros del grupo por detrs. Los grupos parafilticos se definen por caractersticas fenticas (caracteres ancestrales), y por lo tanto su reconocimiento es subjetivo. La clase Reptilia es descartada por la clasificacin cladistca. Un subgrupo de los ex - Reptiles llamado Archosauria, incluye cocodrilos y aves (y por consiguiente dinosaurios). Lepidosauria contiene a las lagartijas, las vboras y probablemente a las tortugas (Fig. 11). Hay muchos otros grupos parafilticos en las clasificaciones tradicionales que hemos venido estudiando en los cursos bsicos de Botnica y Zoologa: invertebrados (se excluyen los vertebrados), peces (se excluyen los tetrpodos), gimnospermas (se excluyen las angiospermas), son slo algunos de ellos

Figura 11: Clasificacin tradicional y filogentica de los Vertebrados SISTEMATICA FILOGENETICA: DISTINTAS ESCUELAS DE PENSAMIENTO Mucha agua ha corrido bajo el puente desde que Willi Hennig dio a conocer sus ideas mediante su libro, y varias modificaciones han enriquecido su legado. Por otra parte, el advenimiento de la sistemtica molecular ha propiciado la formulacin de nuevas metodologas (basadas en principios totalmente diferentes) para la reconstruccin filogentica en base a esta fuente de atributos. En este apartado seguiremos bajo el marco de la sistemtica filogentica, aunque exploraremos las 16

distintas escuelas de pensamiento dentro de esta corriente que actualmente domina la clasificacin de los organismos. Adems de la Cladstica, hoy contamos con mtodos probabilsticos (que reconstruyen la filogenia ms probable de acuerdo a un modelo particular de evolucin, en el caso del mtodo de Mxima Verosimilitud, o de acuerdo a los propios datos, en el caso del Anlisis Bayesiano) y con mtodos de distancia (que lentamente estn cayendo en el olvido). METODO CLADISTICO A continuacin, veremos los fundamentos de la escuela cladstica, a fin de entender la filosofa que sustenta a esta manera de encarar el estudio de la diversidad. Ms adelante, se dedicar un captulo completo a cada uno de sus detalles metodolgicos. A partir del trabajo seminal de Willi Hennig a mediados del siglo pasado, punto de partida para el establecimiento de la escuela de la sistemtica filogentica, muchos investigadores hicieron importantes aportes para el desarrollo de la cladstica moderna. Algunos de los ms dedicados estudiosos de la cladstica que trabajan activamente en los aspectos metodolgicos y tericos de este campo son James Farris (probablemente el que ms ha contribuido al desarrollo de las tcnicas cuantitativas aplicadas a la cladstica, residente en Suecia), Ward Wheeler (entomlogo, EEUU), James Carpenter (entomlogo, EEUU), Kevin Nixon (botnico, EEUU), Pablo Goloboff (aracnlogo, Argentina), Marc Siddall (malaclogo, EEUU) y Diana Lipscomb (protozologa, EEUU). Los sistemticos seguidores de esta escuela estn interesados en proponer clasificaciones filogenticas, considerando a la filogenia como la principal causa de las similitudes y diferencias entre los organismos. Por lo tanto, si dos especies cercanas comparten varias caractersticas similares, es ms probable que esto se deba a haberlas heredado de un ancestro comn que a haberlas adquirido de manera independiente. Estas adquisiciones independientes idnticas no son otras que las homoplasias de las que hemos estado hablando desde el comienzo del captulo. La formulacin ms moderna del mtodo cladstico consiste en buscar aquellos cladogramas que requieran considerar como homoplsticas la menor cantidad posible de similitudes. De esta manera hemos enunciado el famoso principio de parsimonia (aproximacin epistemolgica enunciada hace ms de 650 aos por William Ockman, pluralitas non est ponenda sine necessitate, o la multiplicidad no debera ser invocada innecesariamente) e introducido al campo de la inferencia filogentica en los trabajos que publicaron Luca Cavalli-Sforza y Anthony Edwards en 1964 y Joseph Camin y Robert Sokal en 1965. Por medio de este principio, cuando dos ms hiptesis existan, aquella que requiera la menor cantidad de supuestos o hiptesis ad-hoc ser preferida. Es decir que el principio de parsimonia en realidad acta como un criterio de optimalidad, ya que permite seleccionar entre varias hiptesis en competencia aquella que satisfaga una cierta condicin. En este caso, se preferirn los cladogramas que expliquen la mayor cantidad posible de similitudes por relaciones de ancestralidad comn. La consecuencia lgica de la aplicacin de este principio es el agrupamiento de organismos en base a sinapomorfas. Una hiptesis filogentica puede explicar por qu todas las aves tienen alas hoy en da: porque descienden de un ancestro comn; sin embargo no puede explicar cmo ese ancestro las ha adquirido. Por lo tanto, los cladogramas reflejan un patrn evolutivo, mientras que los filogramas producidos por la taxonoma evolutiva daban cuenta tanto de los patrones como de los procesos evolutivos. Por otra parte, cuando las especies que

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comparten una caracterstica dada se ubican en dos grupos muy separados (los taxones A y B en la Fig. 12), dicha similitud no podr atribuirse razonablemente al ancestro comn de esos dos grupos (C). La condicin slo podr atribuirse al ancestro comn C si se considera que tanto C como todas las especies intermedias entre los grupos A y B la tenan tambin. Pero esto significara que todas las especies que descienden de los ancestros intermedios y tienen la condicin alternativa habran adquirido esta condicin independientemente (la similitud en la condicin no se debe a ancestralidad comn). Por lo tanto, los casos de similitudes no atribuibles a la descendencia de un ancestro comn sern ms numerosos (7 pasos), y por lo tanto es preferible considerar que lo que no se debe a ancestralidad comn son algunas similitudes en la condicin (2 pasos). La ltima hiptesis de relaciones es la ms parsimoniosa, y por ello la preferiremos por sobre la otra hiptesis.

Grupo A

C = 2 pasos C = 7 pasos

Grupo B

Figura 12: Hiptesis filogenticas ms y menos parsimoniosa Al aplicar el criterio de parsimonia a la inferencia filogentica, los sistemticos cladistas consideran que la mejor aproximacin a la filogenia real es aquella reconstruccin filogentica que requiera el menor nmero de cambios evolutivos. Se puede justificar la aplicacin de este principio si consideramos que el cambio evolutivo es improbable. Si una especie actual y su ancestro presentan una misma caracterstica, la parsimonia sugerir que todos los estados intermedios que conectan a la especie en consideracin y a su ancestro presentaron esa misma caracterstica. Realmente podra haber ocurrido un nmero muy grande de cambios entre el ancestro y la especie actual, pero un cambio seguido de una reversin no es tan probable. Cada cambio requiere una mutacin en un gen o en un conjunto de ellos, y adems esa sustitucin se debe fijar en la poblacin por un evento de deriva o de seleccin. Todo esto es muy improbable. Es mucho ms probable que la misma caracterstica haya sido pasada de ancestros a descendientes hasta llegar a la especie actual siguiendo las leyes de la herencia (de hecho, sabemos que esto es muy probable, ya que ocurre cada vez que un padre da origen a una progenie). Si pensamos en los rganos complejos compartidos entre 18

humano y chimpanc, como los ojos, el cerebro o el corazn, es fcil pensar la evolucin de inicial de cada una de estas caractersticas ha requerido la ocurrencia de una serie de mutaciones, de por s muy improbables, y la actuacin de la seleccin natural operando durante millones de generaciones. Es casi imposible que los mismos cambios hayan evolucionado independientemente en los dos linajes a partir de la divergencia de su ancestro comn. En contraste, no hay nada improbable al postular que esas caractersticas podran haber pasado sin modificacin alguna desde el ancestro comn al chimpanc y al humano. Este argumento es muy convincente cuando nos referimos a caracteres morfolgicos complejos, pero se vuelve menos poderoso cuando consideramos otras fuentes de caracteres, por ejemplo los caracteres moleculares. Pero en algn punto, el cambio evolutivo es muy improbable en todos los caracteres, si lo comparamos con la herencia simple, y el principio de parsimonia encuentra as su justificacin en trminos evolutivos. En conclusin, es ms probable que una caracterstica sea compartida por descendencia comn que por evolucin convergente. Por lo tanto, para cualquier conjunto de especies, una filogenia que requiera una menor cantidad de cambio evolutivo ser ms probable que otra que requiera ms. Cabe aclarar que el criterio de parsimonia no produce automticamente la verdadera filogenia del grupo en cuestin. De hecho, nunca llegaremos a conocer la verdadera filogenia de ningn grupo! (recuerde el prrafo citado al comienzo del captulo). El criterio de parsimonia no garantiza encontrar una solucin correcta, sino que provee la explicacin ms simple para las observaciones realizadas. Sirvan estas palabras como introduccin al anlisis cladstico solamente. En el prximo captulo Ud. podr profundizar en los fundamentos y las particularidades de esta metodologa. Por ahora, veamos brevemente qu fuentes de caracteres pueden ser utilizadas para descubrir las sinapomorfas que delimitarn los grupos dentro de grupos en nuestros estudios. Tradicionalmente las tres escuelas hasta aqu mencionadas han utilizado caracteres morfolgicos para agrupar a las especies en consideracin. Dentro de esta clase de caracteres tambin podramos incluir a los caracteres comportamentales y a los caracteres fisiolgicos por ejemplo (seguimos clasificando!). Pero existe otra fuente de caracteres, ms novedosa: los caracteres provenientes de las macromolculas biolgicas (ADN y protenas). Los aos transcurridos entre los 60 a los 80 fueron testigo del desarrollo explosivo de las tcnicas de electroforesis de isoenzimas primero, y de la secuenciacin de protenas y ADN despus. La reconstruccin filogentica en base a caracteres moleculares, principalmente los provenientes del ADN, est atravesando un momento de gran popularidad, y provee un camino ms hacia la comprensin de la historia de la vida. En los ltimos 20 aos los anlisis filogenticos basados en caracteres moleculares han revolucionado la clasificacin de los organismos y hasta la propia concepcin que de nosotros mismos tenamos! Como ejemplo baste saber que el genoma de los eucariotas es en realidad una quimera con respecto a los otros grandes dominios en que se divide la vida en el planeta Tierra: Bacteria y Archaea; o que el parentesco cercano de artrpodos y anlidos postulado en tantos libros de texto de Zoologa podra ser espurio, puesto que los artrpodos compartiran un antecesor comn ms reciente con los nematodes, formando el clado conocido como Ecdysozoa. Por otra parte, la utilidad de los datos morfolgicos en la sistemtica moderna ha sido puesta en tela de juicio, ya que se estima que fuertes presiones de seleccin podran conducir a patrones de evolucin convergente. Seguramente se sorprender al saber que se ha postulado que la foca comparte su ancestro comn ms reciente con la nutria y que

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el lobo marino comparte su ancestro comn ms reciente con el oso (Fig. 13). El grupo Pinnipedia, por lo tanto, est formado en base a caracteres homoplsticos. Por ello resulta polifiltico, y por lo tanto artificial.

Figura 13: Grupo Polifiltico A partir de estas apreciaciones, algunas autoridades en el campo de la sistemtica moderna han sugerido excluir a los caracteres morfolgicos de todos los anlisis, o al menos de aquellos en los que entran en conflicto con los caracteres moleculares. Pero hay otra corriente de sistemticos que opinan que la exclusin de datos no constituira una buena estrategia para solucionar el problema. Ms bien pasaramos a ignorarlo. Numerosos factores pueden crear sesgos tanto en los caracteres moleculares como en los morfolgicos. Hay quienes opinan que no se debera hacer generalizaciones sobre una clase entera de caracteres, pues ninguna generalizacin resultar universalmente cierta. Por lo pronto, lo nico que podemos decir hoy sobre la eliminacin de los datos morfolgicos en la investigacin filogentica (al igual que hace casi 150 aos en el famoso debate de Oxford) es que EL TIEMPO LO DIRA. A propsito de los caracteres moleculares, hay algunas consideraciones a tener en cuenta. Aunque las mutaciones estn fijas en el genoma, existe la posibilidad de que, en el curso de la historia, se hayan superpuesto varios cambios en una posicin dada, y que hoy no seamos capaces de notarlo. Por ejemplo, si dos especies de moscas de la fruta poseen una A en la posicin 23 del gen estudiado, quiere decir que han permanecido as desde la divergencia de su ancestro comn? Pues no necesariamente. Puede haber ocurrido la siguiente secuencia de cambios en la especie 1: C T G A, y la siguiente serie de cambios en la especie 2: G C T A. El estado A observado en ambas especies permaneci as desde la divergencia del ancestro comn, o fue adquirido por ambas especies independientemente (homoplasia)? A este tipo de cambio se lo denomina cambios mltiples (ms conocido en la literatura como multiple hits). Los multiple hits pueden enmascarar cambios previos en ese sitio, por lo que pueden acumularse homoplasias, de manera que la estima de la filogenia por mxima parsimonia subestimar la cantidad de cambio. No obstante, este problema puede ser corregido. La correccin puede aplicarse en cualquier tcnica que contemple un modelo de evolucin. En esta categora entran las metodologas abordadas en las prximas secciones.

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METODO DE MAXIMA VEROSIMILITUD El mtodo de Mxima Verosimilitud para la inferencia filogentica fue aplicado por primera vez por Luca Cavalli-Sforza y Anthony Edwards, pero al no utilizar datos de secuencias nucleotdicas, su trabajo pas desapercibido. Fue Joseph Felsenstein (Universidad de Washington), quien aplic el anlisis de mxima verosimilitud a los datos de secuencias de ADN en la dcada del 80, aduciendo que la reconstruccin filogentica deba ser vista como un problema estadstico. Este mtodo se basa en un concepto proveniente del campo de la estadstica general elaborado por Ronald Fischer (supervisor de Cavalli-Sforza y Edwards a quien Ud. ya conoci en el captulo de Gentica de Poblaciones). El concepto de verosimilitud (likelihood en ingls) se refiere a la probabilidad de obtener los datos observados de acuerdo a una hiptesis. La verosimilitud (L) de una hiptesis (H) entonces, para un grupo de datos (D), es proporcional a la probabilidad condicional de observar esos datos (D) dado que la hiptesis (H) es correcta: L = P(D/H). Supongamos que un amigo nos dice que ha tirado una moneda 50 veces, y que las 50 veces ha salido cara. Probablemente nos sorprenderemos al or semejante cosa, a menos que nuestro amigo nos revele que la moneda tena dos caras. Sabiendo esto, nadie se sorprender al ver que en las 50 tiradas haya salido cara! Aunque no nos hayamos percatado de ello, hemos utilizado dos modelos diferentes, antes y despus de saber que la moneda estaba trucada. El primer modelo supona que la moneda usada tena cara y ceca, y que las tiradas eran independientes unas de otras. El segundo modelo supona que la moneda estaba trucada (dos caras). Bajo el primer modelo, los datos (las 50 caras), son muy improbables. La probabilidad sera, aproximadamente, de uno en un trilln, y estaramos lgicamente sorprendidos. Bajo el segundo modelo, la probabilidad de los datos es de 1, y no deberamos sorprendernos en absoluto. El nivel de sorpresa cuando observamos los datos, entonces, est inversamente relacionado con la probabilidad de los datos bajo el modelo considerado. Estos dos modelos son dos puntos a lo largo de un continuo de posibles modelos. Por ejemplo, podramos tener una moneda con dos cecas, de manera que la probabilidad de obtener una cara sea de 0. O tener una moneda intermedia, de manera que la probabilidad de obtener cara sea de 0.5. De hecho, la variacin en el proceso de fabricacin de las monedas hace que la probabilidad de obtener cara no siempre sea de 0.5. En general, no nos referimos a este continuo como a una infinidad de distintos modelos, sino a un nico modelo con un parmetro p. En la reconstruccin filogentica por mxima verosimilitud basada en modelos de evolucin, el modelo incluye toda la informacin necesaria para calcular la probabilidad de los datos. El mtodo de mxima verosimilitud trabaja esencialmente dicindonos cun sorprendidos deberamos estar de haber obtenido esos datos. La implementacin de este mtodo har que prefiramos el modelo que hace a los datos menos sorprendentes. En nuestro caso, los datos seran el conjunto de secuencias nucleotdicas y la hiptesis estara representada por el rbol (topologa y largos de rama) y un modelo de evolucin de secuencias. Es decir que para aplicar esta metodologa es requisito elegir un modelo probabilstico de evolucin molecular de los muchos que han sido propuestos, y que d cuenta de la transformacin de una secuencia en otra, tomando en cuenta parmetros tales como la tasa de sustitucin nucleotdica y las frecuencias de los distintos nucletidos (recuerde el modelo de Jukes-Cantor estudiado en el captulo Neutralismo). Estos modelos pueden contemplar, por ejemplo, problemas como el que crean las sustituciones mltiples (multiple hits). De este modo, se evala la

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probabilidad de que el modelo evolutivo elegido haya generado las secuencias observadas (o sea, la probabilidad de los datos bajo el modelo), teniendo en cuenta el orden de ramificacin (topologa) y la cantidad de cambio que se haya acumulado en las ramas del rbol (largo de ramas). La filogenia se estimar a partir de los rboles que tengan la mayor verosimilitud. Por lo tanto, al igual que en la escuela cladstica, estamos otra vez frente al uso de un criterio de optimalidad. Si tenemos en cuenta que la verosimilitud se evala en cada posible topologa, comprenderemos que este mtodo es computacionalmente muy intenso. Es importante comprender que la verosimilitud de un rbol se refiere a la probabilidad de los datos dado un rbol. No es correcto pensar a la verosimilitud como a la probabilidad de que un rbol particular sea el correcto, ya que las probabilidades se refieren a las frecuencias relativas de los resultados particulares de un proceso aleatorio. Mientras que un rbol y sus largos de rama asociados pueden ser pensados como el resultado de un proceso aleatorio (la historia pasada y la direccin evolutiva de cualquier grupo es contingente a travs de multitudes de eventos estocsticos), estamos muy lejos de ser capaces de describir adecuadamente el proceso estocstico subyacente a la generacin de las filogenias en la naturaleza. En cambio, somos capaces de modelar los procesos que producen las secuencias a partir de los rboles. La verosimilitud nos permite elegir entre diferentes rboles en base a las predicciones que esos rboles implican. La topologa del rbol de mxima verosimilitud nos har sorprender menos al inspeccionar nuestras secuencias que cualquier otra topologa. Adems, es tambin importante distinguir entre la probabilidad de obtener los datos observados a partir de un modelo de evolucin y la probabilidad de que el modelo subyacente sea correcto. El mtodo de Mxima Verosimilitud no dice nada sobre la probabilidad del modelo en s misma. El filsofo de la biologa Elliot Sober lo ejemplifica de la siguiente manera: supongamos que escuchamos un ruido muy fuerte en un cuarto del piso de arriba. Podramos sugerir que el ruido es causado por gremlins jugando a los bolos. Dada esta hiptesis, nuestra observacin (el ruido en el cuarto de arriba) tiene una alta verosimilitud; si los gremlins estuvieran jugando a los bolos sobre nosotros, con seguridad que los oiramos! Sin embargo, la probabilidad de que nuestra hiptesis sea cierta (o sea, que los gremlins produzcan el ruido, en lugar de cualquier otra causa) es otra cosa; cun probable es que encontremos gremlins en nuestra casa? Ciertamente que esta probabilidad es escasa. As, en este caso, nuestra hiptesis confiere una alta verosimilitud a los datos, pero es altamente improbable. Los mtodos de mxima verosimilitud producirn buenas estimaciones de la filogenia toda vez que los modelos evolutivos sean los correctos. Pero si los modelos asumidos no se corresponden con la realidad, las estimaciones producidas por mxima verosimilitud sern poco fiables. La seleccin del modelo evolutivo es entonces un paso crtico. Hasta el ao 2000, la eleccin del modelo adecuado constituy el taln de Aquiles de esta metodologa. El desarrollo de un algoritmo para seleccionar el modelo ms adecuado para nuestras secuencias evita la eleccin subjetiva del modelo, problema que pasa a resolverse de un modo estadstico, aunque algunos problemas han sido detectados. Veamos ahora algunos problemas que pueden llevarnos a estimas filogenticas espurias Bajo ciertas condiciones, el criterio de mxima parsimonia llevar a error. El caso ms conocido es el propuesto por Joe Felsenstein en 1978. Supongamos tres especies A-C y el rbol de la Fig. 14a. Supongamos adems que cada uno de los caracteres observados puede tener un nmero limitado de estados posibles (por ejemplo A, C, G y T), que existe un nmero no muy grande de caracteres, y que la probabilidad

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de cambio para todos los caracteres es igual a lo largo de una rama del rbol de la Fig. 14a. Supongamos adems que la probabilidad de cambio en las ramas que dan a A y B es muy alta (y la misma para cada carcter), mientras que en la rama interna del rbol y en la rama que da a C, es muy baja (observe las ramas). En estas condiciones, es muy probable que haya ms caracteres compartidos por A y B que por B y C, con lo que el anlisis de parsimonia producira la genealoga equivocada de la Fig. 14b. Las ramas que dan a A y B se dice que son muy largas (i.e. tienen una gran probabilidad de cambio), y entonces se ha invocado este modelo, conocido como atraccin de ramas largas para indicar que, bajo el criterio de parsimonia, las ramas largas se atraen (i.e. aparecen juntas cuando deberan ir separadas). Debido a la gran probabilidad de cambio de las ramas largas, y a la escasa cantidad de estados (A, C, G y T), muchos de los cambios pueden coincidir por azar, es decir que la G en la posicin mucleotdica 15 de la secuencia correspondiente a A se corresponde con otra G en la posicin mucleotdica 15 de la secuencia correspondiente a B; la C en la posicin mucleotdica 27 de la secuencia correspondiente a A se corresponde con otra C en la posicin mucleotdica 27 de la secuencia correspondiente a B, y as sucesivamente. Pero estos cambios, que en realidad seran homoplasias, sern cuantificados como sinapomorfas por el criterio de mxima parsimonia, dando lugar a una filogenia espuria. Considerando que el criterio de mxima parsimonia produce hiptesis filogenticas que minimizan la cantidad de cambio evolutivo requerido para explicar los datos, y que el criterio de mxima verosimilitud intenta estimar la cantidad real de cambio evolutivo de acuerdo a un modelo de evolucin de secuencias, ser fcil entender porqu la atraccin de ramas largas significa un problema para el primer mtodo (a propsitoqu tipo de rbol representa la reconstruccin filogentica para esta escuela? ). Los mtodos de mxima verosimilitud presuponen que para estudiar evolucin, uno debe primero saber en detalle como opera la evolucin. Los seguidores de la cladstica sugieren que el camino debera ser el inverso: el conocimiento que uno pueda tener sobre los mecanismos de evolucin, deber basarse en nuestros conocimientos de filogenia, y estos, por lo tanto no debern presuponer un mecanismo evolutivo dado, siempre que sea evitable, sino que deben estar basados solamente en observaciones que puedan efectivamente hacerse en el presente. No obstante, hay quienes consideran que tambin existe un modelo subyacente al implementar el criterio de mxima parsimonia. El mtodo de mxima verosimilitud representa, en cierta forma, un enfoque filosfico distinto de la reconstruccin filogentica. La controversia principal entre los seguidores de ambas escuelas no est resuelta en forma definitiva. METODO BAYESIANO Esta es la ms reciente de las metodologas propuestas para la reconstruccin filogentica. Esta variante del mtodo de Mxima Verosimilitud tambin requiere postular un modelo de evolucin, pero en lugar de buscar un rbol con la mayor probabilidad de observar los datos, produce el mejor conjunto de rboles, dados los datos y el modelo evolutivo especificado. Por lo tanto, este mtodo postula la probabilidad de que la hiptesis evolutiva sea correcta dados los datos de secuencias (P(H/D)). El teorema enunciado por Thomas Bayes (1702-1761) nos posibilita calcular la probabilidad de un modelo (o sea, la topologa del rbol y el largo de cada rama) a partir de los resultados que se han producido (las secuencias).

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Los principales investigadores que han impulsado el desarrollo de esta metodologa son Frederik Ronquist (Suecia), John Huelsenbeck (USA), y Bruce Rannala (USA).

B C

L = 22 pasos

L = 14 pasos

Figura 14a: Filogenia hipottica de tres especies que difieren en la probabilidad de cambio Figura 14b: Filogenia espuria producto de la atraccin de las ramas largas

METODOS DE DISTANCIA Hasta ahora hemos conocido tcnicas para la reconstruccin filogentica en base a caracteres discretos, o sea que las posiciones nucleotdicas son tomadas como tales durante el anlisis. Pero tambin es posible, a partir de un grupo de secuencias, calcular las distancias evolutivas entre ellas. Si se conoce la distancia evolutiva entre las especies en estudio (representadas por las secuencias de un cierto gen), se puede reconstruir la historia evolutiva de las mismas. Esta familia de mtodos se basa en la idea de aproximar un rbol a la matriz de distancias calculadas entre pares de especies (distancias pareadas) que en general son corregidas de acuerdo a algn modelo de evolucin (los mismos que se utilizan en los mtodos vistos ms arriba). Estas distancias corregidas son estimas de las distancias evolutivas, que reflejan el nmero medio real de cambios por sitio que ha ocurrido entre un par de secuencias desde la divergencia de su ancestro comn. La mejor manera de interpretar las distancias es considerarlas como estimas de la longitud de las ramas que separan a un par de especies dadas. Entre los investigadores que se han dedicado a desarrollar este tipo de aproximaciones figuran los japoneses Masatoshi Nei, Fujio Tajima y Naruya Saitou, entre otros, y los americanos Walter Fitch y Emanuel Margoliash. Existen varios algoritmos para computar rboles de distancia, basados o no en criterios de optimalidad. Podemos citar los mtodos de cluster, dentro de los cuales podemos citar el algoritmo de UPGMA, el mtodo de Neighbor Joining, conceptualmente relacionado al anterior, el mtodo de Mnima Evolucin y el mtodo de Mnimos Cuadrados de Fitch y Margoliash (estos dos ltimos aplican un criterio de optimalidad, en pocas palabras, cambio mnimo). Esta familia de mtodos posee una gran desventaja respecto a los ya vistos: al transformar las sustituciones nucleotdicas en distancias se pierde informacin. Varios sets de secuencias pueden dar una misma matriz de distancias, pero a partir de estas matrices, no es posible recuperar los sets de datos originales. Claramente, los mtodos de distancia son aproximaciones menos deseables que las otras, aunque son muy rpidos. 24

CONSIDERACIONES FINALES Dado que no somos capaces de observar ningn evento histrico directamente, debemos hacer inferencias a partir de la evidencia circunstancial, a menudo incompleta (secuencias que obtenemos hoy en da), para comprender la historia evolutiva de un grupo de organismos. O sea que, a pesar de la naturaleza determinstica de los algoritmos estudiados, estos no hacen ms que proveernos de una serie de reglas para llegar a una estima de la filogenia, que puede o no coincidir con la verdadera. La calidad de la estima de la filogenia depender de la calidad de los supuestos que se hicieron para arribar a ella. Es imposible hacer estima alguna sin hacer supuestos!! Por lo tanto, como los bilogos evolutivos y los sistemticos infieren eventos histricos pasados, no tienen manera de determinar con certeza la efectividad de ningn criterio (ya sea mxima parsimonia, mxima verosimilitud o cualquier otro) para recuperar la filogenia verdadera. De hecho, NUNCA se recuperar. O es que se puede viajar en el tiempo? Por lo tanto, la eleccin de un criterio por sobre otro es, en el fondo, una decisin filosfica. APLICACIONES DE LAS TECNICAS DE RECONSTRUCCION FILOGENETICA A OTROS PROBLEMAS DE LA BIOLOGIA La revolucin en la tecnologa de la secuenciacin de genes y los avances en el campo de la teora de la reconstruccin filogentica estn resultando en la produccin de filogenias o genealogas de genes cada vez ms agudas. Estas pueden ser utilizadas para entender procesos biolgicos que ocurren en niveles muy diferentes de la jerarqua biolgica. La gentica, el desarrollo, el comportamiento, la epidemiologa, la ecologa, la biologa de la conservacin y el estudio de las adaptaciones son slo algunos de los campos que se nutren de esta informacin para responder algunos de sus muchos interrogantes. La teora coalescente (sucintamente, todos los alelos de un gen de herencia uniparental, como los genes mitocondriales, los cloroplsticos o los del cromosoma Y, en una generacin coalescen hacia un nico ancestro comn) se aplica con frecuencia en el campo de la gentica de poblaciones, ms especficamente en la disciplina conocida como filogeografa, fundada por John C. Avise en la pasada dcada del 80. La filogeografa es el estudio de los procesos que gobiernan la distribucin geogrfica de los linajes de genes, y algunas de sus aplicaciones son el descubrimiento de especies crpticas, es estudio de la dispersin de las plagas y los vectores de enfermedades, la bsqueda de enemigos naturales para las plagas introducidas, etc. La estimacin de cladogramas intraespecficos tambin permite detectar asociaciones significativas entre el fenotipo y el genotipo, contribucin importante en el campo de la epidemiologa humana; la conservacin biolgica tambin se ve enriquecida a travs de este tipo de estudios al ser aplicados al anlisis de los ecosistemas y los paisajes. Adems, en el estudio de la teora de la especiacin este tipo de anlisis se puede aplicar al estudio de la interfase micro-macroevolutiva en la definicin de la especie y al anlisis del proceso de especiacin.

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La justicia muchas veces ha recurrido al anlisis filogentico para ayudar a aportar evidencia en casos de contagio de enfermedades tales como el SIDA. Famoso es el caso del clado dental, en el estado de Florida (EEUU). La macroevolucin no es ajena a la reconstruccin filogentica para el contraste de muchas de sus hiptesis. El anlisis de rboles reconciliados (anlisis cofilogentico o de comparacin de filogenias) contemplando eventos tales como la coespeciacin y la transferencia horizontal entre otros, permite evidenciar la ocurrencia o no de coevolucin entre dos clados de hospedadores y parsitos (u hospedadores y mutualistas). La biogeografa histrica utiliza aproximaciones similares a las aplicadas en los estudios de coevolucin para explicar la distribucin de grupos de organismos, dado que procesos diferentes producen idnticos patrones en los organismos bajo estudio (la vicarianza sera similar a la coespeciacin y la dispersin a la transferencia horizontal). Las adaptaciones de los organismos pueden ser analizadas a travs de correlaciones (por ejemplo, el estudio de la correlacin entre la tasa metablica y el tamao corporal en n grupo de mamferos). Un supuesto muy importante de esta prueba estadstica es la independencia de los datos, pero las relaciones genealgicas entre las especies estudiadas pueden oscurecer el estudio, dado que el parentesco filogentico viola el supuesto de independencia. Es pertinente aplicar una metodologa que permita corregir el efecto que la descendencia comn a partir de un ancestro pueda tener en nuestras conclusiones. Para ello se puede recurrir al mtodo comparado, que no es otra cosa que el estudio comparado de los fenotipos a travs de distintos rangos taxonmicos. Existen distintas aproximaciones, dependiendo del tipo de caracteres en estudio (discretos o cuantitativos), formuladas por Mark Ridley (USA), Jonathan Coddington (USA), Joe Felsenstein (USA), y James Cheverud (USA), entre otros. Al considerar la historia en nuestro anlisis, los datos se vuelven independientes. Si an est interesado en los campos de aplicacin de la reconstruccin de filogenias ms all de la sistemtica puede consultar el libro New uses for new phylogenies (editado por Harvey PH, Leigh Brown AJ, Maynard Smith J y Nee S, Oxford University Press, 1996).

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