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Universidad Nacional de Colombia Facultad de Agronoma, Escuela de Postgrados Bogot, Colombia 2012
Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
Tesis presentada como requisito parcial para optar al ttulo de: Magister en Geomtica
Universidad Nacional de Colombia Facultad de Agronoma, Escuela de Postgrados Bogot, Colombia 2012
I regard as quite useless the reading of large treatises of pure analysis: too large a number of methods pass at once before the eyes. It is in the works of applications that one must study them; one judges their ability there and one appraises the manner of making use of them.
Agradecimientos
Proyecto SIMCI - UNODOC - DIRAN Leonardo Correa, Jefe de rea - Apoyo financiero Orlando Gonzlez, Experto en Procesamiento Digital - Asesor en Investigacin Ma. Ximena Gualdrn, Asistente de Ingeniera - Acompaamiento en sobrevuelo
Oficina CIAF - IGAC Elena Posada, Jefe de rea - Prstamo de espectroradimetro Mauricio Ramrez, Acompaamiento en captura de firmas espectrales en campo
Resumen y Abstract
IX
Resumen
Como complemento a la clasificacin convencional de cultivos de coca en Colombia, se propone una metodologa de clasificacin de imgenes satelitales, de acuerdo a la edad, en tres estados fenolgicos: juvenil, vegetativo y maduro; empleando mtodos de extraccin del parmetro REP (red edge position), el cual es un indicador de cambios fisiolgicos y fenolgicos de cualquier especie vegetal, y espectroscopia de imgenes satelitales. La metodologa contempla tres fases: 1) Captura de firmas espectrales en campo, de cultivos de coca en cada estado fenolgico, mediante un espectroradimetro, para las cuales se obtiene la posicin REP por el mtodo de extrapolacin lineal (Cho et al., 2006). 2) Toma de una imagen satelital World View II, la cual es transformada de valores de radiancias relativas (q) a valores de reflectancias (), y sobre los cuales se calcula el parmetro REP mediante el mtodo de Lagrange (Dawson et al., 1998), resultando una imagen con los cultivos de coca clasificados segn su estado fenolgico. 3) Sobrevuelo al rea de estudio para identificar lotes de coca sobre el terreno, y evaluar los resultados de la clasificacin mediante matrices de confusin y el ndice de concordancia Kappa.
Palabras clave: Red Edge Position (REP), espectroscopia de imgenes, estados fenolgicos, coca
Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
Abstract
In order to support the actual classification method of coca crops in Colombia, a new methodology is proposed, classifying crops by their phenological stages: first leaves, early leaves, full leave. The REP (red edge position) parameter was calculated as an indicator of any physiological and phenological changes in plants. Imaging spectrometry methods were used too. The methodology has three phases: 1) Collecting coca crops signatures in field using a spectroradiometer and calculating REP parameter for each phenological stage applying lineal extrapolation method (Cho et al., 2006). 2) Taking a World View II image which radiance values (q) are converted to reflectance values () to obtain REP parameter by Lagrange method (Dawson et al., 1998). A classification image of coca crops by phenological stages is obtained. 3) Flying over the interest area to identify coca crops in the field and evaluate the classification results using a confusion matrix and estimating the Kappa concordance index.
Keywords: Red Edge Position (REP), imaging spectrometry, phenological stages, coca
Contenido
XI
Contenido
Pg. 1. Introduccin ............................................................................................................... 1 1.1 Problema de Investigacin ................................................................................... 3 1.2 Objetivos ............................................................................................................... 5 Revisin de literatura ................................................................................................ 7 2.1 Espectroscopa de la vegetacin .......................................................................... 7 2.1.1 Propiedades pticas de las hojas ..................................................................... 7 2.1.2 Reflectancia de la Vegetacin ........................................................................... 9 2.1.3 Propiedades pticas de los doseles vegetales ............................................... 15 2.2 Caractersticas agro-culturales de los cultivos de coca ...................................... 16 2.2.1 Variedad Erytroxylum coca var. Ipadu ............................................................ 16 2.3 Anlisis espectral de la regin red edge y mtodos de clculo de REP ............. 16 2.3.1 Mximo de la primera deriva de la funcin espectral ...................................... 17 2.3.2 Interpolacin Lineal ......................................................................................... 17 2.3.3 Gaussiana Inversa .......................................................................................... 18 2.3.4 Ajuste de Funciones de Alto Orden ................................................................ 18 2.3.5 Extrapolacin Linear segn Cho-Skidmore (2006) ......................................... 19 Materiales y mtodos .............................................................................................. 23 3.1 Metodologa ........................................................................................................ 23 3.2 rea de estudio................................................................................................... 25 3.3 Radiometra en parcelas de prueba ................................................................... 26 3.4 Anlisis y seleccin de las firmas espectrales por estado fenolgico................. 29 3.5 Clculo de REP para cada firma espectral - mtodo extrapolacin lineal .......... 30 3.6 Toma de imagen satelital World View II ............................................................. 30 3.7 Transformacin de la imagen a radiancias absolutas (L) ................................... 32 3.8 Transformacin de la imagen a reflectancias () ................................................ 33 3.9 Clasificacin de cultivos de coca segn mtodo de Lagrange ........................... 34 3.10 Validacin mediante sobrevuelo en el rea de estudio ...................................... 36 Resultados................................................................................................................ 37 4.1 Firmas espectrales de coca en parcelas de prueba ........................................... 37 4.2 Firmas espectrales promedio por estado fenolgico .......................................... 42 4.3 Parmetros de la regin red edge para cada firma por estado fenolgico ......... 43 4.4 Imagen satelital World View II en radiancias relativas (q) .................................. 48 4.5 Imagen satelital World View II en radiancias absolutas (L) ................................ 49 4.6 Imagen satelital World View II en reflectancias () ............................................. 50
2.
3.
4.
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
4.7 Clasificacin de cultivos de coca segn estado fenolgico ................................ 52 4.8 Correlacin entre firmas espectrales de campo con la imagen .......................... 55 4.9 Correlacin parmetro REP ............................................................................... 61 4.10 Comportamiento REP segn ngulo solar ......................................................... 64 4.11 Perfil espectral REP para coberturas asociadas ................................................ 65 4.12 Clasificacin REP para coberturas asociadas .................................................... 66 4.13 Metodologa propuesta para clasificacin de cultivos de coca mediante REP ... 70 4.14 Validacin del mtodo propuesto con base en matrices de confusin y coeficiente Kappa .......................................................................................................... 72 4.15 Comparacin de resultados - Metodologa propuesta y metodologa convencional ................................................................................................................. 79 5. Conclusiones y recomendaciones .......................................................................... 82
Bibliografa ....................................................................................................................... 85
Contenido
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Lista de figuras
Pg. Figura 2-1: Flujo de radiacin solar (I) en las hojas. .......................................................... 9 Figura 2-2: Caractersticas de un espectro de vegetacin sana (400- 2500 nm) ............ 10 Figura 2-3: Principales absorciones causadas por los pigmentos foliares. ..................... 12 Figura 2-4: Regin red edge de la curva espectral vegeta .............................................. 13 Figura 2-5: Seccin transversal de una hoja .................................................................... 14 Figura 2-6: Curva espectral de la primera derivada del maz .......................................... 20 Figura 2-7: Segunda derivada de la firma espectral del maz .......................................... 21 Figura 3-1: Flujograma de actividades para el desarrollo de la investigacin ................. 24 Figura 3-2: Localizacin del rea de estudio, San Jos del Guaviare. ............................ 25 Figura 3-3: Captura de firmas espectrales en campo,mediante espectroradimetro ...... 26 Figura 3-4: Mtodo de captura de firmas espectrales en campo ..................................... 28 Figura 3-5: Lotes de cultivos de coca muestreados ......................................................... 29 Figura 3-6: Curvas de radiancia espectral relativa del sensor World View II .................. 32 Figura 4-1: Firmas espectrales de plantas en estado juvenil (n=10 plantas) ................... 38 Figura 4-2: Firma espectral promedio en estado juvenil y desviacin estndar .............. 38 Figura 4-3: Firmas espectrales de plantas en estado vegetativo (n=10) ......................... 39 Figura 4-4: Firma espectral promedio en estado vegetativo y desviacin estndar ........ 40 Figura 4-5: Firmas espectrales de plantas en estado maduro (n=10) ............................. 41 Figura 4-6: Firma espectral promedio en estado maduro y desviacin estndar ............ 41 Figura 4-7: Comparacin de firmas espectrales promedio por cada estado fenolgico .. 42 Figura 4-8: REP, mnimos y mximos para firma espectral estado juvenil ...................... 45 Figura 4-9: REP, mnimos y mximos para firma espectral estado vegetativo ................ 46 Figura 4-10: REP, mnimos y mximos para firma espectral estado maduro .................. 47 Figura 4-11: Estadsticas unibanda de la imagen WV II en radiancias relativas ............. 48 Figura 4-12: Matriz de correlacin multibanda para la imagen WV II. ............................. 49 Figura 4-13: Comparacin de curvas de reflectancia, radiancia absoluta y relativa ........ 51 Figura 4-14: Ejemplo aplicacin mtodo Langrange para un pxel de cultivo de coca. ... 53 Figura 4-15: Definicin de rangos por cada estado fenolgico de imagen REP .............. 54 Figura 4-16: Resultado final de la clasificacin por parmetro REP ................................ 55 Figura 4-17: Librera espectral de los cultivos de coca, a partir de imagen WV II ........... 56 Figura 4-18: Librera espectral de los cultivos de coca, a partir de radiometra ............... 56
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
Figura 4-19: Comparacin de firmas obtenidas con radiometra vs firmas WV II ............ 58 Figura 4-20: Firmas espectrales ajustadas a los centros de banda de la imagen WV II . 60 Figura 4-21: Rangos REP para los tres estados fenolgicos de los cultivos de coca. .... 62 Figura 4-22: Correlacin Pearson: Edad de plantas y REP, para muestras de campo. .. 63 Figura 4-23: Correlacin Pearson: Edad de las plantas y REP, para muestras WV II..... 64 Figura 4-24: Grfico de variacin de parmetro REP, respecto a la hora de captura ..... 65 Figura 4-25: Perfiles espectrales del parmetro REP para coberturas asociadas .......... 66 Figura 4-26: Clasificacin final de la imagen WV II, de acuerdo con el parmetro REP . 67 Figura 4-27: Ejemplo de rea clasificada como cultivo juvenil......................................... 68 Figura 4-28: Ejemplo de rea clasificada como cultivo vegetativo. ................................. 68 Figura 4-29: Ejemplo de rea clasificada como cultivo maduro....................................... 69 Figura 4-30: Ejemplo de un cuerpo de agua clasificado mediante mtodo Lagrange ..... 69 Figura 4-31: Metodologa propuesta para clasificacin de coca mediante REP ............. 70 Figura 4-32: Lotes de cultivos de coca juvenil identificados mediante sobrevuelo .......... 73 Figura 4-33: Lotes de cultivos de coca vegetativo identificados mediante sobrevuelo.... 74 Figura 4-34: Lotes de cultivos de coca maduro identificados mediante sobrevuelo ........ 75
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XV
Lista de tablas
................................................................................................................................ Pg. Tabla 2-1: Principales pigmentos de las plantas y sus correspondientes absorciones .... 11 Tabla 2-2: Principales factores que afectan la reflectancia de un dosel vegetal. ............. 15 Tabla 2-3: Ventaja y atributos de las tcnicas de interpolacin para determinar REP ..... 22 Tabla 3-1: Estados fenolgicos de la variedad de coca muestreada ............................... 27 Tabla 3-2: Caractersticas de la imagen World View II del rea de estudio ..................... 31 Tabla 4-1: Parmetros REP para firmas espectrales de coca, por estado fenolgico ..... 44 Tabla 4-2: Parmetros transformacin imagen radiancias relativas (q) a absolutas (L) .. 49 Tabla 4-3: Parmetros transformacin radiancias absolutas (L) a reflectancias () ........ 50 Tabla 4-4: Parmetros para calcular la imagen REP ....................................................... 52 Tabla 4-5: Comparacin de reflectancias en la imagen vs radimetro ............................. 57 Tabla 4-6: Matriz de confusin para evaluar clasificacin mediante el parmetro REP ... 76 Tabla 4-7: Medidas de exactitud derivadas de la matriz de confusin ............................. 77 Tabla 4-8: Escala de valoracin del ndice kappa, propuesto por Landis-Koch (1977) .... 79 Tabla 4-9: Comparacin de densidades de cultivos de coca en el rea de estudio ......... 80 Tabla 4-10: Detalle de densidades de cultivos por estado fenolgico .............................. 80
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Abreviaturas
Abreviatura PAR REP SIMCI Trmino Photosynthetically Active Radiation Red Edge Position Sistema Integrado de Monitoreo de cultivos Ilcitos
1. Introduccin
En los ltimos aos, las investigaciones en sensores remotos se han apoyado en el uso de la radiacin espectral, capturada por espectroradimetros de campo y radimetros satelitales y aerotransportados (espectroscopia de imgenes), para determinar las caractersticas de los materiales y/o coberturas sobre la superficie terrestre; estas caractersticas pueden ser: la identificacin de un tipo de material (tipos de minerales, especies vegetales), o la determinacin de una variable relacionada con un tipo de cobertura (estrs vegetal, estado fenolgico) (Hiles et al., 1994).
La espectroscopia de imgenes tiene un particular enfoque en la identificacin y clasificacin de coberturas vegetales, y an ms de las caractersticas fenolgicas y bioqumicas de las plantas. Los espectros de reflectancia correspondientes a coberturas vegetales evidencian el estado real de las mismas ya que contienen informacin inherente a: las bandas de absorcin de la clorofila en la regin del espectro visible, las altas reflectancias de la vegetacin sana en el rango del infrarrojo cercano y los efectos de absorcin en la regin del infrarrojo medio por causa del agua en la vegetacin saturada, entre otros (Gates, 1965).
De acuerdo con Clevers et al. (2002), en la franja de transicin entre el rango visible (rojo) y el rango del infrarrojo cercano de las firmas espectrales de vegetacin, conocida con el nombre de regin red edge, es donde se presentan las caractersticas de absorcin ms importantes de las curvas de reflectancia de la vegetacin, debido a que se encuentra un contraste o fuerte cambio entre el rango rojo y el infrarrojo cercano, caracterizado por un valor de reflectancia extremadamente bajo en el visible rojo, seguido por altas reflectancias en el rango infrarrojo cercano, lo cual se asocia con la poca reflectancia de luz roja de la clorofila, la estructura interna y contenido de agua foliar,
Introduccin
mostrando que esta regin del espectro es una de las ms importantes para la clasificacin de una especie segn su estado fenolgico.
Esta caracterstica de absorcin tiene un ancho de aproximadamente de 100 nm, entre los 680 y 780 nm, y por lo general se considera su punto de inflexin o de mxima pendiente de la curva, conocido como red edge position (REP), como un parmetro para realizar comparaciones entre firmas espectrales de diferentes especies vegetales, o como indicador del estrs y la senescencia vegetal entre una misma especie (Clevers et al., 2002).
Para estimar el parmetro REP, que es un punto de mxima pendiente, se requiere el uso de tcnicas o algoritmos que permitan ajustar una funcin continua a la curva de la primera derivada de la firma espectral de reflectancias, o por lo menos que permita llegar a una aproximacin. En el caso de firmas obtenidas en campo mediante radimetros con anchos de banda pequeos (< 10nm), se presenta una dificultad adicional, porque las firmas vegetales muestran dos picos mximos en la regin red edge y no una curva continua entre el valor mnimo del rojo y el mximo del infrarrojo cercano (Smith et al., 2004). Para estos casos, se puede aplicar el mtodo de extrapolacin lineal, propuesto por Cho et al. (2004); el cual tiene en cuenta los dos puntos mximos que se presentan y define la posicin REP como el punto de interseccin de dos rectas, obtenidas a partir de un par de puntos, el mnimo y el mximo, del primer pico en la regin del rojo (680-700 nm), y un par de puntos del segundo pico, en la regin del infrarrojo cercano (725- 760 nm), correspondientes a los puntos de derivada cero en la curva de la primera derivada de la firma de reflectancias de la vegetacin.
Para firmas obtenidas con radimetros de baja resolucin espectral, como es el caso de los sensores remotos multiespectrales, el parmetro REP, puede ser estimado mediante el mtodo de Lagrange, propuesto por Dawson (1998); el cual consiste en ajustar un polinomio de segundo orden de Lagrange a la curva de la primera derivada de reflectancias, obtenido a partir de tres pares de puntos con longitud de onda y reflectancia conocidas, cercanos y con centro en la regin red edge, para el cual su punto mximo representa la posicin REP.
Introduccin
Introduccin
Incorporacin de resultados en un sistema especial de base de datos y superposicin de los lotes de coca sobre el mapa administrativo de Colombia.
Sin embargo, mediante esta metodologa de clasificacin, no es posible determinar la edad de las plantas, ni el estado fenolgico de los cultivos detectados, datos que son relevantes en la sustentacin del argumento planteado por el gobierno nacional, de que un alto porcentaje de los lotes actuales de coca, son en realidad lotes nuevos de baja productividad (SIMCI, 2006).
Con base en lo anterior, se busc una respuesta a esta dificultad de determinar la edad de las plantas en los cultivos, y se plante la siguiente pregunta de investigacin: es posible desarrollar una metodologa para identificar los cultivos de coca en diferentes estados fenolgicos, haciendo uso de mtodos y tcnicas propias de la espectroscopa de imgenes?.
Para responder la pregunta anterior, se propuso que mediante anlisis del comportamiento de la reflectancia en la regin red edge de la firma espectral de la coca, se hallara un parmetro que permitiera clasificar los cultivos segn su edad, en tres estados fenolgicos, principalmente: juvenil, vegetativo y maduro. De lo cual se derivaron otras preguntas especificas en la investigacin: es posible obtener un parmetro REP, propio para cada una de las firmas espectrales correspondientes a los estados fenolgicos de los cultivos de coca?, el parmetro obtenido permite clasificar dichos cultivos segn su estado fenolgico, en una escena multiespectral?, la posicin REP calculada a partir de firmas espectrales en campo, se comporta igual que la obtenida mediante firmas espectrales de una imagen multiespectral?, qu tan concordantes son los resultados de clasificacin mediante parmetros de la regin red edge, con datos de campo y las densidades de cultivos reportadas por el censo nacional?.
Mediante la investigacin se abordan las anteriores preguntas, proponiendo una metodologa complementaria a la clasificacin convencional de cultivos de coca en Colombia, haciendo uso del anlisis de los parmetros REP, de curvas espectrales obtenidas en campo, propias de cultivos de coca en diferentes estados fenolgicos, y
Introduccin
anlisis espectroscpico de una imagen multiespectral que contiene una banda centrada en la regin red edge, como es el caso de las imgenes World View II.
1.2 Objetivos
El objetivo general de este estudio es desarrollar una metodologa para identificar cultivos de coca (Erithoxylum coca var. ipat) en diferentes estados fenolgicos mediante anlisis de parmetros espectrales en la regin red edge y espectroscopia de imgenes. Como objetivos especficos se tienen:
Determinar la posicin REP en la regin red edge, de cada una de las curvas espectrales establecidas para los cultivos de coca, en diferentes estados fenolgicos (juvenil, vegetativo y maduro).
Evaluar la correlacin de los parmetros espectrales red edge obtenidos de las firmas de hoja de coca en campo, con las respuestas espectrales de la imagen satelital.
Validar la metodologa desarrollada y determinar su nivel de confiabilidad, comparando los resultados con la metodologa tradicional de identificacin de cultivos de coca en Colombia.
2. Revisin de literatura
- Efectos trmicos: Aproximadamente el 70% de la radiacin solar incidente, es absorbida por las plantas y convertida en calor para procurar y permitir el mantenimiento de la temperatura corporal de la planta y su proceso de transpiracin.
Carotenoides: Grupo de pigmentos (molculas qumicas que reflejan o transmiten la luz visible, o hacen ambas cosas a la vez) rojos, naranjas y amarillos que aparecen con frecuencia en los organismos vivos. Algunos carotenoides intervienen como pigmentos accesorios en la fotosntesis, trasfieren a la clorofila la energa de la luz que absorben para su conversin en energa qumica (Reigosa, 2004).
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- Efectos fotosintticos: La radiacin activa fotosinttica (usada en el proceso de la fotosntesis), es aproximadamente el 28% de la energa absorbida por una planta, e interviene en la conversin y produccin de componentes orgnicos altamente energticos.
- Efectos fotomorfognicos: La naturaleza y cantidad de energa absorbida, transmitida y/o reflejada depende de la longitud de onda, del ngulo de incidencia, la rugosidad de la superficie, las diferencias en las propiedades pticas y los contenidos bioqumicos de las hojas.
Segn Jensen (2000), las hojas tienen dos capas: una cuticular y una epidrmica, interceptan o reciben el flujo de energa radiada directamente por el sol, o de luz dispersada por la atmsfera, para que luego esta energa incidente interacte con los pigmentos, agua y aire intracelular de las hojas, determinando as la cantidad de flujo reflejado, absorbido y transmitido por cada una (Figura 2-1).
La radiacin de las longitudes de onda del infrarrojo cercano pasa a travs de las hojas, de una a otra, de tal manera que se genera un efecto aditivo de reflectancia. Cada capa foliar transmite y refleja una cantidad de energa generando un ciclo de transmisin de energa y finalmente ofreciendo una reflectancia efectiva, lo que genera que la reflectancia a nivel de dosel sea mucho mayor que aquella medida directamente sobre una hoja en particular.
Revisin de literatura
Figura 2-1: Flujo de radiacin solar (I) en las hojas: energa reflejada (R), energa transmitida (T) o energa absorbida. En el grfico se muestra un ejemplo hipottico del comportamiento aditivo de la reflectancia en varias capas de hojas.
Textura superficial de la hoja e ndice de refraccin de la sustancia cuticular de la epidermis superior: controla la reflectancia de la superficie superior de la hoja. Composicin, cantidad y distribucin de los pigmentos: determina la absorcin de la radiacin en el rango visible del espectro. Estructura interna de la hoja: la dispersin de la radiacin depende de la disposicin de las clulas y los tejidos. Contenido de agua: determina la absorcin en el rango infrarrojo del espectro.
En la (Figura 2-2) se puede observar la curva general espectral de reflectancias para la vegetacin sana:
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Figura 2-2: Caractersticas de un espectro de vegetacin sana (400- 2500 nm). Los factores dominantes que controlan la reflectancia de la hojas son: pigmentos en las clulas mesoflicas retenedoras (clorofila, caroteno), clulas mesoflicas absorbedoras que controlan la reflexin y dispersin de energa en el infrarrojo, y cantidad de agua en la planta
A continuacin se describe el comportamiento de la reflectancia en la vegetacin, de manera especfica para rango del espectro:
La regin visible del espectro de reflectancia de la vegetacin est caracterizada por las bajas reflectancias y transmitancias debido a las fuertes absorciones por parte de los pigmentos foliares.
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Los pigmentos son compuestos qumicos que determinan los matices y combinaciones de colores del espectro para cualquier tipo de vegetacin, existiendo un predominio general de los colores primarios: verde, rojo y azul. El color particular que presenta un determinado rgano vegetal depende generalmente del predominio de uno u otro o la combinacin de ellos. Dentro de estos pigmentos se encuentran las clorofilas, clorofila a y clorofila b, de tonalidades verdes, las cuales se encuentran prcticamente en todas las plantas. Estos pigmentos se encuentran en el interior de las clulas vegetales especficamente en un organelo llamado cloroplasto. Los compuestos cloroflicos estn ligados qumicamente con las estructuras internas del cloroplasto, adems existen tambin en los cloroplastos dos clases de pigmentos amarillos y amarillo-anaranjados que son las xantofilas y carotenos.
Los pigmentos de la clorofila absorben luz violeta, azul y roja para el proceso de fotosntesis. La luz verde no es absorbida para realizar tal proceso, y por tal motivo la mayora de plantas son verdes. El espectro de reflectancias de la vegetacin verde muestra los principales mnimos de absorcin causados por la clorofila en las longitudes: 420, 490 y 660 nm del espectro visible; en la (Tabla 2-1) se muestran otros puntos mnimos de absorcin (Figura 2-3) que se pueden considerar importantes en el estudio de pigmentos:
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Figura 2-3: Principales absorciones causadas por los pigmentos foliares (clorofilas, carotenos y ficobilinas) en el rango del espectro visible.
Fuente: Imagen adaptada de Distance Education Course Hyperspectral Remote Sensing. ITC
Durante la senescencia, la clorofila en las hojas se degrada ms rpido que los carotenos, lo que genera un notable incremento de la reflectancia en las longitudes de onda del rojo (600-700 nm), y por lo tanto las absorciones generadas por la clorofila tendern a desaparecer; a dems, los carotenos y la xantofila dominaran qumicamente las hojas, ocasionando mayores absorciones en el rango del azul (400-500 nm), y una mayor reflectancia de luz en el rojo y el verde (500-600 nm), que resultar visualmente en un tono amarillo. Una vez que las hojas mueran, aparecern algunos pigmentos foliares conocidos como taninos, los cuales se caracterizan por reflejar luz visible con tonalidades cafs.
De acuerdo con Clevers et al. (2002), en la franja de transicin entre el rango visible rojo y el rango del infrarrojo cercano se presenta una de las caractersticas de absorcin ms importante de las curvas de reflectancias de la vegetacin, debido a que se da un contraste o fuerte cambio entre el rango rojo y el infrarrojo cercano, caracterizado por un
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valor de reflectancia extremadamente bajo en el visible rojo, seguido por altas reflectancias en el rango infrarrojo cercano, lo cual se asocia con la poca reflectancia de luz roja de la clorofila, la estructura interna y contenido de agua foliar.
Esta caracterstica de absorcin tiene un ancho de aproximadamente 30 nm, entre los 700 y 740 nm, conocida como red edge, se considera su punto de inflexin para realizar comparaciones entre curvas espectrales de diferentes especies vegetales, debido a que este punto es el de mxima pendiente de la absorcin sobre la curva (Figura 2-4) y considerado como indicador del estrs y la senescencia vegetal.
Figura 2-4: Regin red edge de la curva espectral vegetal. Curvas espectrales de vegetacin sana y otra con estrs, sobre las cuales se indica con un par de flechas sus correspondientes puntos de inflexin (1, 2), o puntos de mxima pendiente.
Fuente: Imagen adaptada de Distance Education Course Hyperspectral Remote Sensing. ITC Reflectancia en el rango espectral del infrarrojo cercano (700- 1300 nm)
Las plantas tienen una alta reflectancia y transmitancia en el Infrarrojo cercano; la cantidad de energa reflejada, absorbida o dispersada vara entre especies y depende de
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la estructura interna foliar (Figura 2-5), por lo tanto el factor determinante de la respuesta espectral de las plantas en el rango infrarrojo cercano es esta estructura. La distribucin de los espacios de aire, as como la organizacin, tamao y forma de las clulas, son caractersticas que influyen en el paso de la luz a travs de las hojas. Por ejemplo, si una hoja presenta tejidos celulares mesoflicos compactos entonces tendr pocos espacios de aire, lo que facilitar una dispersin o reflexin de energa ms que una transmisin de la misma, y ocurrir lo contrario en caso que los tejidos no sean tan compactos. Mediante diferentes estudios realizados se ha demostrado que la reflectancia en el infrarrojo cercano est fuertemente relacionado con el volumen del espacio intracelular en los tejidos mesoflicos de las hojas, adicionalmente la reflectancia de las hojas cambia durante su crecimiento y senescencia (Gausmann, 1969).
Figura 2-5: Seccin transversal de una hoja. Estructura interna y partes principales que intervienen en la interaccin de la luz con las hojas.
Fuente: Imagen adaptada de Distance Education Course Hyperspectral Remote Sensing. ITC
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Para estudiar el comportamiento de las respuestas espectrales de la vegetacin en la regin red edge, se considera como parmetro importante el punto de inflexin o punto de mxima pendiente de la curva espectral (el valor mximo de la primera deriva), en este rango, conocido como REP (red edge position). El clculo de dicho punto requiere el uso de tcnicas que permitan ajustar una funcin continua a la primera derivada de una
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firma espectral, o por lo menos que permita llegar a una aproximacin, para lo cual se cuentan con cinco diferentes mtodos conocidos, que se exponen en seguida.
La posicin REP es definida por la longitud de onda que corresponda al mximo de la primera deriva de la firma espectral, en la regin red edge. Esta primera deriva es calculada mediante una transformacin diferencial de orden 1 de la curva espectral (Dawson, 1998)(Ecuacin (2.1)).
Ecuacin (2.1)
donde: FDR = derivada de orden 1 en la longitud de onda i, que corresponde al punto medio entre las longitudes de onda j y j+1 = reflectancia en la longitud de onda j = reflectancia en la longitud de onda j+1
= diferencia en longitudes de onda de entre j y j+1
Asume que la curva de reflectancia en la regin red edge puede ser simplificada mediante una lnea recta centrada cerca al punto medio entre las reflectancias del infrarrojo cercano (780 nm aproximadamente) y el punto mnimo de reflectancia de absorcin de clorofila (670 nm aproximadamente). Donde el REP es estimado mediante un procedimiento de clculos en dos pasos (Guyot et al., 1988).
) (Ecuacin (2.2)).
Ecuacin (2.2)
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Ecuacin (2.3)
Ecuacin (2.4)
donde:
= punto mximo de reflectancia espectral = punto mnimo de reflectancia espectral = longitud de onda del punto mnimo = variancia de la funcin Gaussiana
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reflectancias en las longitudes de onda correspondientes a la reflectancia mnima de la regin del rojo y la reflectancia mxima de la regin del infrarrojo cercano (Ecuacin (2.5)).
Ecuacin (2.5)
donde: i = nmero de bandas del radimetro que se emplee para tomar las curvas de reflectancia en campo, que se encuentren en el rango de 670 to 780 nm.
REP es determinado a partir del mximo valor de la primera derivada de la funcin polinomial ajustada. Esta primera derivada es calculada mediante una transformacin diferencial de orden 1, de la firma espectral obtenida con el polinomio.
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Figura 2-6: Curva espectral de la primera derivada del maz, indicando las dos rectas de mxima pendiente en las regiones el rojo y el infrarrojo cercano, que se extrapolan para obtener la posicin REP.
Fuente: Cho-Skidmore(2006)
La posicin REP es definida por la longitud de onda correspondiente al punto de interseccin de las dos rectas (Ecuacin (2.6) - Ecuacin (2.7))
Ecuacin (2.7)
donde: m = pendiente de cada una de las rectas c = punto de corte de las rectas
En el punto de interseccin las dos rectas tienen los mismos valores de longitud de onda y FDR. Por lo tanto la posicin REP est dada por (Ecuacin (2.8)):
Revisin de literatura
21
Ecuacin (2.8)
pueden ser obtenidos por los valores mnimos de la curva de primera deriva de y pueden ser obtenidos con las mximas pendientes
de la primera deriva, tambin para estas pendiente se calcula la curva de reflectancia de segunda derivada mediante la transformacin diferencial de primer orden de la primera derivada ( Figura 2-7)
Figura 2-7: Segunda derivada de la firma espectral del maz, indicando los valores , para el clculo de REP.
Fuente: (Cho-Skidmore,2006) De los anteriores mtodos se emplear el de extrapolacin linear, teniendo en cuenta los resultados obtenidos por Cho et al. (2006), quienes compararon el desempeo de los cinco mtodos en el clculo de REP en tres coberturas vegetales: maz, centeno y herbceas mixtas, obteniendo resultados ptimos con su mtodo de extrapolacin propuesto, al evaluar la correlacin de cantidades de nitrgeno foliar (indicador de vigor
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
vegetal) medidas en campo, con las posiciones REP derivadas de imgenes hiperespectrales: Hymap, Aviris e Hyperion. (Tabla 2-3)
Tabla 2-3: Ventaja y atributos de las tcnicas de interpolacin para determinar REP
Aplicado a: curva de reflectancia o curva primera derivada Aplicabilidad para firmas espectrales de campo Idnea para firmas espectrales de imgenes
Tcnica
Complejidad
Mximo de la primera derivada Interpolacin Lineal Gaussiana Inversa Ajuste funciones alto orden Extrapolacin Linear
3. Materiales y mtodos
3.1 Metodologa
Para iniciar el desarrollo de la investigacin, se plante un flujograma de actividades (Figura 3-1) que se llev a cabo de la siguiente manera: se capturaron datos de firmas espectrales de cultivos de coca en diferentes estados fenolgicos, mediante un espectroradimetro HR4000 Ocean Optics, seguido por el anlisis y obtencin de la posicin Red Edge Position (REP), para cada una de las firmas, mediante el mtodo de extrapolacin lineal (Cho et al., 2006). Se realiz la toma de una imagen satelital World View II, la cual fue transformada de sus valores originales de radiancias relativas (q) a valores de radiancias absolutas (L), y de estas ltimas se realiz otra transformacin para obtener una imagen en valores de reflectancias (), ya que con estas unidades, los resultados de la imagen son comparables con los resultados de radiometra en campo. Sobre la imagen de reflectancias se calcul el parmetro REP mediante el mtodo lagrangiano (Dawson et al., 1998), para obtener las reas clasificadas como cultivos de coca en diferentes estados fenolgicos. En paralelo a estas actividades, se sobrevol el rea de estudio para identificar lotes de coca sobre el terreno y la imagen simultneamente, y de esta manera poder evaluar los resultados de la clasificacin mediante matrices de confusin. Finalmente se correlacionaron los parmetros obtenidos de las firmas espectrales con los parmetros obtenidos en la imagen resultante del mtodo lagrangiano, al igual que las firmas de campo con las firmas de los cultivos identificados mediante la imagen satelital.
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Convenciones
Mtodos y/o procesos Resultados
Materiales y mtodos
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224'48,0579"N y Longitud: 7251'14,2789"W Latitud: 215'56,9929"N (Figura 3-2). El terreno es principalmente plano, con una altura promedio de 175 msnm. y una
temperatura de 28 C., irrigado por numerosas corrientes de agua afluentes del ro Guaviare. La mayora del territorio est constituido por selvas hmedas
tropicales, bosques de galera y sabanas naturales. En las reas de influencia de las carreteras y trochas que parten de la cabecera municipal y en diversos puntos de colonizacin existen terrenos intervenidos donde los bosques han sido sustituidos por diversos cultivos lcitos e ilcitos, o por pastos (PBOT San Jos del Guaviare, 2001).
Figura 3-2: Localizacin del rea de estudio, San Jos del Guaviare.
rea de estudio
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Figura 3-3: Captura de firmas espectrales en campo, mediante el espectroradimetro HR4000 Ocean Optics (propiedad CIAF-IGAC)
Las parcelas de prueba corresponden a un rea de cultivos experimentales de la Polica Antinarcticos Nacional (DIRAN), en el departamento del Tolima (por motivos de restricciones, no es posible indicar el sitio exacto de localizacin); los muestreos fueron realizados tres meses despus de la fecha de toma de la imagen, en perodo seco; estos cultivos se encuentran en diferentes estados fenolgicos, aptos para las mediciones de las firmas espectrales requeridas.
Materiales y mtodos
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Juvenil
Erythroxylum coca
Ipad
Dulce
0-20 cm
1-2 meses
Vegetativo
Erythroxylum coca
Ipad
Dulce
50 - 100 cm
6 meses
Maduro
Erythroxylum coca
Ipad
Dulce
> 120 cm
> 1 ao
Por cada estado fenolgico se recolectaron 30 firmas espectrales en total, a tres horas diferentes (9am, 12m, 3pm), para considerar los distintos ngulos de incidencia de radiacin solar. El lente de captura del espectroradimetro se sostiene 50 cm por encima de la parte alta de cada planta, en posicin nadir (dirigido verticalmente hacia abajo), permitiendo asegurar que todas las mediciones se tomaran con el mismo ngulo entre la ptica de muestreo y el dosel, con un campo de visin constante de 25 grados (ngulo slido que delimita la radiacin captada). Cada 10 minutos se realizaron mediciones de la radiacin solar incidente, haciendo uso de una superficie blanca de referencia para poder convertir las radiancias de cada espectro, en reflectancias. Adicionalmente las mediciones se tomaron manteniendo la misma orientacin hacia el sol (de este a oeste) para disminuir la variabilidad de las radiaciones ledas por efectos de sombra en el interior del dosel, ya que estos varan a lo largo del da dependiendo del ngulo azimut del sol y las lneas de plantacin en los cultivos. (Figura 3-4)
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
Figura 3-4: Mtodo de captura de firmas espectrales en campo para cada estado fenolgico
vista individuo
vista dosel
Juvenil
Vegetativo
Maduro
Los individuos de coca muestreados se encuentran en tres lotes individuales (Figura 3-5), para el estado fenolgico juvenil se capturaron las firmas sobre el cultivo 1 (0-20cm de altura promedio de la planta), para el estado vegetativo se tomaron sobre los cultivos 2 y 4 (entre 50-100 cm de altura), y para el estado de maduro se recolectaron firmas sobre el cultivo 3 (>120 cm de altura promedio).
Materiales y mtodos
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Ecuacin (3.1)
donde i = juvenil, vegetativo, maduro n = nmero de firmas muestreadas por estado fenolgico (n=10)
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
3.5 Clculo de REP para cada firma espectral - mtodo extrapolacin lineal
Para calcular la posicin red edge de cada una de las firmas recolectadas en campo, se aplic el mtodo de extrapolacin lineal propuesto por (Cho et al., 2006); mediante el cual se tienen en cuenta los puntos mximos y mnimos que se presentan en la curva espectral de la vegetacin, en la regin red edge. Para determinar con exatitud estos puntos, se calcul la primera derivada de la firma de reflectancias, y se localizaron las longitudes de onda cuya ordenada es igual a cero. La curva de la primera derivada se obtuvo calculando la pendiente de la recta entre cada par de puntos consecutivos de la firma de reflectancias (ver Ecuacin (3.2)).
Ecuacin (3.2)
donde i = juvenil, vegetativo, maduro j = 1, 2, 3, ..., 3649 (nmero de bandas del espectroradimetro)
Con estos valores de longitudes de onda se extrapolaron dos lneas rectas, una de estas corresponde al par de puntos en la regin del rojo (680-700 nm), y la otra al par de puntos en la regin del infrarrojo cercano (725- 760 nm); la intersecin de estas dos rectas corresponde a la posicin REP de cada curva.
Materiales y mtodos
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El sensor WorldView II captura la seal en 8 intervalos que cubre desde los 400 nm hasta los 1040 nm, del espectro. Por lo que cuenta con 8 bandas en este intervalo, y adicionalmente cuenta con una banda pancromtica que cubre el rango 450-800 nm. (Tabla 3-2)
La imagen utilizada incluy el pre-proceso efectuado por el distribuidor Digital Globe, que consiste en corregir espectralmente la imagen, normalizando las radiancias al dividir cada uno de los valores medidos por la radiancia mxima, respectivamente para cada banda. Los valores que resultan de esta normalizacin se conocen como radiancias relativas (q), razn por la cual se deben transformar posteriormente a unidades de reflectancias ( ). (Figura 3-6)
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
Figura 3-6: Curvas de radiancia espectral relativa del sensor World View II (tomado de Digital Globe, 2010)
Ecuacin (3.3)
donde i = nmero de pxel j = nmero de banda En los metadatos adjuntos de la imagen se encuentran los valores de los factores de calibracin radiomtrica absoluta (k) y los anchos de banda efectivos (), para cada
Materiales y mtodos
33
banda. Mediante la herramienta de clculo de bandas de Envi 4.7 se aplica la (Ecuacin (3.3)), respectivamente a cada una de las bandas.
Ecuacin (3.4)
donde i = nmero de pxel j = nmero de banda = ngulo cenital solar
Para aplicar la (Ecuacin 3.4), se debe conocer la distancia (d) y el ngulo solar () (Ecuacin 3.5 - Ecuacin 3.6), que se incluyen en los metadatos de la imagen, al igual que la irradiancia solar espectral promedio (E) por cada banda.
Ecuacin (3.5)
donde JD = da juliano (2455484,144)
Ecuacin (3.6)
donde sunEl = ngulo de elevacin solar ( 69,5)
Luego de aplicar estas transformaciones, finalmente se obtuvo una imagen de reflectancias, a partir de una imagen de radiancias relativas inicial, de la cual se poda extraer el parmetro de posicin REP.
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
Ecuacin (3.7) donde () = valor mximo del polinomio de Lagrange, en el punto REP = longitud de onda en el punto REP
Como se desconocan los valores de () y en el polinomio de Lagrange, pero se saba que corresponden al punto mximo de la curva, entonces la (Ecuacin 3.7), se derivo
La herramienta Spectral Derivate, es un complemento programado por David Gorodetzky, mediante el lenguaje IDL, descargable de la librera de cdigos de Envi (http://www.exelisvis.com/language/en-US/UserCommunity/CodeLibrary/id/963.aspx)
Materiales y mtodos
35
la cual representa el
Para aplicar la (Ecuacin 3.8), se empleo nuevamente la herramienta de clculo de bandas de Envi, reemplazando las variables correspondientes a las tres bandas alrededor de la regin red edge. Esta imagen se reclasifico mediante la herramienta Density Slice de Envi, estableciendo rangos de valores de longitudes de onda para cada clase fenolgica del cultivo de coca. Para definir los rangos se realizaron reas de semilleo sobre la imagen, a partir de las reas identificadas como cultivos de coca en cada estado fenolgico mediante sobrevuelo (ver Seccin 3.10). Una vez que se cont con estas reas, se extrajeron los valores REP correspondientes a cada uno de los pxeles, y se mapearon en un grfico reflectancia vs. REP, evaluando entre que longitudes de onda se mueve el parmetro REP por cada estado fenolgico, y de esta manera se determinaron los rangos correspondientes. Aplicando los rangos establecidos al mtodo density slice, se obtuvo la clasificacin de los cultivos de coca en los tres estados fenolgicos definidos. Finalmente, como parte del post-proceso de la clasificacin, se aplicaron dos tcnicas de Envi, para generalizacin y agrupamiento de las clases, conocidos como sieve y clump; primero se aplic el mtodo sieve, para remover los pxeles aislados, y seguido a esto se aplic el mtodo clump para dar una coherencia espacial a las clases resultantes, eliminando polgonos muy pequeos o reagrupndolos dentro de las clases vecinas.
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4. Resultados
Por cada estado fenolgico se obtuvieron diez firmas espectrales, cuyos valores de reflectancia son expresados en porcentaje a lo largo de cada ancho de longitud de onda, en un rango de 200 hasta 1.100 nanmetros. Las firmas espectrales correspondientes al estado juvenil (Figura 4-1), presentan un comportamiento similar entre s, con valores de reflectancias en el espectro infrarrojo entre un 30-50 %, con una desviacin estndar de 18%, en el rojo entre 5-30% de reflectancia, con una desviacin estndar del 10%, y en el verde entre 15-25% (con mayor frecuencia en 20%) de reflectancia, con una desviacin estndar del 6%; el hecho de que los valores de reflectancia entre los rangos infrarrojo y verde versus el rango rojo, no sean muy distantes, es decir, que la curva de absorcin en el rango del rojo no sea tan profunda, indica un bajo contenido de pigmentos cloroflicos en las hojas (SIMCI, 2006); las diferencias en reflectancia entre las firmas recolectadas se debe a los cambios de cantidad de energa solar incidente y a la cantidad de hojas por planta, que ocasiona una influencia de reflectancia del suelo en el momento del muestreo. Dentro de este conjunto de curvas espectrales, se present una con valores extremos de reflectancia (Figura 4.1, curva en color verde), la cual fue excluida del clculo de la firma promedio para este estado.
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Figura 4-2: Firma espectral promedio en estado juvenil (verde) y desviacin estndar
100 90
80
70 60 50
40
% Reflectancia
30 20 10
0
600,11
674,06
680,19
686,32
692,44
698,56
704,67
783,65
789,69
795,72
612,48
618,66
624,84
631,01
637,18
643,34
649,49
655,64
661,79
667,93
710,77
716,87
722,97
729,06
735,15
741,23
753,37
759,44
771,55
606,3
777,6
747,3
765,5
Resultados
39
Para el estado fenolgico vegetativo, se observ un comportamiento ms homogneo en las respuestas de reflectancia de las plantas muestreadas (Figura 4-3), lo que indica una mayor densidad foliar en los individuos de esta edad que evita la influencia de la respuesta espectral del suelo. Al igual que en el estado juvenil, en el rango del verde las reflectancias varan entre 10-30%, pero con una desviacin estndar del 2%, adems difiere del estado juvenil en el rango del espectro rojo, donde la absorcin es mayor con valores de reflectancia entre 5-10%, con una desviacin estndar del 6%, al igual que se diferencian en el rango infrarrojo cercano, debido a que las reflectancias son mayores que en una edad menor, con valores entre 45-70%, con una desviacin estndar del 8%; en este caso la curva presenta una cada de valores considerable en el espectro rojo versus un incremento de reflectancias en el infrarrojo cercano, indicando una mayor contenido de pigmentos cloroflicos, causantes de esa absorcin y por lo tanto una mayor vigorosidad en las plantas. Figura 4-3: Firmas espectrales de plantas en estado vegetativo (n=10)
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Figura 4-4: Firma espectral promedio en estado vegetativo (amarillo) y desviacin estndar
100
90
80
70
60
% Reflectancia
50
40
30
20
10
611,97
629,72
647,44
653,34
665,11
688,62
706,19
723,73
735,4
671
741,23
747,05
758,68
764,49
781,89
En el caso del conjunto de firmas recolectadas para coca en estado maduro (Figura 4-5), se observ mayor homogeneidad en las respuestas espectrales, ya que en este estado la cobertura foliar es mxima, y las otras coberturas como el suelo no influyen significativamente. A diferencia de las curvas de coca en estado vegetativo, los valores de reflectancia en el espectro verde, son mayores y estn comprendidos en el rango entre 20-35%, con desviaciones estndar del 1%, lo que indica un mayor verdor en las hojas; en los espectros del rojo y el infrarrojo cercano, con valores de reflectancia en los rangos 5-10% (desviacin estndar del 5%) y 35-70% (desviacin estndar del 6%) respectivamente, las reflectancias son similares a las del estado vegetativo, lo que indica una alta presencia de pigmentos cloroflicos y vigorosidad en las plantas.
799,24
600,11
606,04
617,89
623,81
635,63
641,54
659,23
676,87
682,75
694,48
700,34
712,04
717,89
729,57
752,87
770,29
776,09
787,68
793,46
% Reflectancia
100 50 60 70 80 90
10
20
30
40
600,11
Resultados
606,04
611,97
617,89
623,81
629,72
635,63
641,54
647,44
653,34
659,23
665,11
671
676,87
682,75
688,62
694,48
700,34
706,19
712,04
Figura 4-6: Firma espectral promedio en estado maduro (rojo) y desviacin estndar
717,89
723,73
729,57
735,4
741,23
747,05
752,87
758,68
764,49
770,29
776,09
781,89
787,68
793,46
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799,24
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
Con base en las firmas espectrales por cada estado fenolgico, se obtuvo una que corresponde al promedio (Figura 4-7), de los muestreos realizados en campo; en el caso de las firmas de cultivos juveniles se excluy la firma con valores de reflectancia extremos, ya que estos podran afectar considerablemente el clculo de la firma promedio juvenil. Figura 4-7: Comparacin de firmas espectrales promedio por cada estado fenolgico (Longitud de onda, % Reflectancia)
Juvenil
Vegetativo
Maduro
mximos
En las tres firmas promedio resultantes, se present una absorcin en el rango comprendido entre 660-680 nm, que se hace mayor a medida que avanza la edad en el cultivo; para los cultivos ms maduros se encontr la mxima absorcin de los tres estados, y para los cultivos juveniles la menor absorcin, esto se debe a los cambios en el rea cubierta por el dosel. Para los cultivos que cuentan con doseles de mayor cobertura (maduros), la cantidad de rea verde del dosel ser mayor, generando una
Resultados
43
mxima absorcin de energa en la regin de Radiacin Fotosinteticamente Activa (PAR, Photosynthetically Active Radiation, 400-700 nm), gracias a sus rganos fotosintticos (Reigosa et al., 2004). En el caso de la regin del infrarojo cercano (700-800 nm), ocurre lo contrario, los cultivos ms maduros reflejan una mayor cantidad de la energa incidente, que aquellos de menor edad; esto es debido a que las hojas sufren cambios anatmicos y fisiolgicos internos a medida que avanza la edad, requiriendo menores cantidades de energa solar, lo que a su vez les permite compensar cualquier disminucin de absorcin electromagntica debida a la falta de agua (Curran et al., 1990). (Figura 4-7) Este comportamiento en las firmas causa que la posicin REP se desplace hacia longitudes de onda anchas, lo cual est directamente relacionado con el incremento de densidad de vegetacin verde en el dosel y la edad de las plantas (Liang, 2004). Por lo tanto, los valores altos de REP corresponden a doseles vegetales sanos o maduros, y los valores de REP bajos corresponden a doseles senescentes, enfermos o juveniles.
4.3 Parmetros de la regin red edge para cada firma por estado fenolgico
En el rango comprendido entre 710 - 725 nm, para las tres firmas espectrales promedio de coca, se observan dos mximos en la reflectancia (Figura 4-7). Este comportamiento lo encontr (Horler, 1983), en un estudio realizado sobre firmas espectrales de rboles de roble (Quercus robur), para las cuales se identific una distribucin bimodal en el rango entre 700-725 nm, que generaba una discontinuidad en la relacin REP/clorofila; adems, (Smith, 2004) encontr este mismo comportamiento sobre firmas espectrales de pastos, en la regin 702-725 nm, y (Zarco et al., 2003) observaron el mismo comportamiento de doble pico, en el rango 690-710 nm, para firmas de arce negundo californiano (Acer californicum) en macetas, concluyendo que estos mximos de reflectancia estn en funcin de la emisin natural de fluorescencia de la clorofila. Debido a estos mximos, fue necesario aplicar el mtodo de extrapolacin lineal propuesto por Cho et al.(2006), para el clculo del parmetro REP. A partir de las firmas espectrales promedio por cada estado fenolgico (Figura 4-8.a, Figura 4-9.a, Figura 4-
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
10.a), se generaron las curvas de la primera derivada de la reflectancia () (Figura 4-8.b, Figura 4-9.b, Figura 4-10.b), mediante el clculo de la pendiente entra cada par de puntos (longitud de onda, % reflectancia) a lo largo de la curva espectral promedio. Sobre la curva de la primera derivada se identifican los puntos de corte con el eje de las longitudes de onda, o puntos para los cuales la derivada es igual a cero, ya que estos corresponden a las longitudes de onda donde se presentan los mximos y mnimos de reflectancia. Con estos valores de longitud de onda se aplic la (Ecuacin 3.2), para obtener los parmetros REP (Tabla 4-1).
Tabla 4-1: Parmetros REP para firmas espectrales de coca, por estado fenolgico
ESTADO FENOLOGICO REP (nm) Juvenil 717,853 Vegetativo 720,738 Maduro 721,1262
De estos valores de REP, se puede observar una diferencia poco significativa entre los estados fenolgicos vegetativo y maduro, cuyos valores de REP difieren en 1 nm. Lo anterior indica que no hay una separabilidad entre estas dos clases espectrales y en el momento de clasificar la imagen se pueden presentar traslapes entre estas.
Resultados
45
Figura 4-8: a. REP, mnimos y mximos para firma espectral promedio estado juvenil, b. Longitudes de onda con derivada cero (=0)
46
Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
Figura 4-9: a. REP, mnimos y mximos para firma espectral promedio estado vegetativo, b. Longitudes de onda con derivada cero (=0)
Resultados
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Figura 4-10: a. REP, mnimos y mximos para firma espectral promedio estado maduro, b. Longitudes de onda con derivada cero (=0)
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
Figura 4-11: a. Estadsticas unibanda de la imagen World View II en radiancias relativas. b. Histogramas de frecuencia par las bandas 5, 6 y 7 (red ,red edge, near infrared)
a.
b.
Resultados
49
Se puede observar que para las tres bandas de inters (5,6 y7), se obtienen diferentes valores promedio de radiancias relativas en los pxeles, presentndose el menor promedio en la banda 5; para las bandas 6 y 7 los histograma de frecuencias presentan una distribucin monomodal (Figura 4-11 b), con valores promedios similares, lo cual indica una alta correlacin entre estas dos bandas; adicionalmente, al calcular la matriz de correlacin (Figura 4-9) entre bandas se confirma la anterior afirmacin, al encontrar una correlacin del 76% entre la banda del red edge y la banda del infrarrojo cercano. Figura 4-12: Matriz de correlacin multibanda para la imagen World View II en radiancias relativas (en rojo los valores de correlacin para las bandas 5,6 y 7).
World
View
II
en
radiancias
Para obtener la imagen en unidades de reflectancia, se realiz primero la conversin de unidades de radiancias relativas (q) a unidades de radiancias absolutas (L), mediante la (Ecuacin 3.3) planteada por Digital Globe; la cual fue programada en la herramienta de clculo de bandas (calculadora raster) en Envi 4.7, teniendo en cuenta los valores de factor de calibracin radiomtrica (K) y ancho de banda (), que se encuentran en el archivo de metadatos adjunto a la imagen, ver (Tabla 4-2). Tabla 4-2: Parmetros para transformacin de la imagen de radiancias relativas (q) a radiancias absolutas (L)
Factor de Calibracin Radiomtrica (K )
9.295654000000000e-03 1.783568000000000e-02 1.364197000000000e-02 6.810718000000000e-03 1.851735000000000e-02 6.063145000000000e-03 2.050828000000000e-02 9.042234000000000e-03
Banda
Coastal Blue Green Yellow Red Red Edge Near-IR1 Near-IR2
Ancho de Banda ()
4.730000000000000e-02 5.430000000000000e-02 6.300000000000000e-02 3.740000000000000e-02 5.740000000000000e-02 3.930000000000000e-02 9.890000000000000e-02 9.959999999999999e-02
Expresin en Envi (0.009295654*b1)/0.0473 (0.01783568*b2)/0.0543 (0.01364197*b3)/0.063 (0.006810718*b4)/0.0374 (0.0185735*b5)/0.0574 (0.006063145*b6)/0.0393 (0.02050828*b7)/0.0989 (0.009042234*b8)/0.0996
50
Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
La imagen resultante de radiancias absolutas permite obtener firmas espectrales con influencia de factores atmosfricos, es decir, que los niveles digitales de los pixeles estn representando la cantidad de energa reflejada por las coberturas terrestres, que atraviesa la atmosfera, y finalmente es capturada por el sensor.
Tabla 4-3: Parmetros para transformacin de la imagen de radiancias absolutas (L) a reflectancias ()
Banda
Coastal Blue
Expresin en Envi
3.33647001*(b1/1758.2229) 3.33647001*(b2/1974.2416) Green 1856.4104 3.33647001*(b3/1856.4104) Yellow 1738.4791 3.33647001*(b4/1738.4791) Red 1559.455 3.33647001*(b5/1559.4555) Red Edge 1342.0695 3.33647001*(b6/1342.0695) Near-IR1 1069.7302 3.33647001*(b7/1069.7302) Near-IR2 861.2866 3.33647001*(b8/861.2866) constantes: d = 0,997384211761638 = 20,5
Al aplicar cada una de las expresiones anteriores a su correspondiente banda, se obtuvieron las nuevas bandas que conforman la imagen de reflectancia (), de tal manera que la curva que se extrae de cada pxel en esta ltima imagen, corresponde a la firma espectral de cada tipo de cobertura, sin influencia atmosfrica.
Resultados
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El resultado de la transformacin de la imagen desde radiancias relativas hasta reflectancias, se puede apreciar mediante un ejemplo de firmas espectrales en un pxel sobre la escena (Figura 4-13); en las curvas de radiancia se observa que estas son afectadas por las bandas de absorcin de agua en las regiones de 480, 660 y 850 nm, y en la firma de reflectancias estas absorciones son removidas por la correccin atmosfrica, correspondiendo cada porcentaje de respuesta, a la proporcin de energa solar recibida que es reflejada por los materiales contenidos en el pxel.
Figura 4-13: Comparacin de curvas de reflectancia, radiancia absoluta y radiancia relativa para un pxel de cultivo de coca
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
Banda
Red Red Edge Near-IR1
(centro de banda)
b5 b6 b7
Como resultado de este proceso se obtuvo una imagen de una sola banda, denominada imagen REP, cuyos niveles digitales para cada pxel corresponden a las longitudes de onda en las que se presentan los puntos REP de cada una las firmas espectrales de la imagen de reflectancias.
Siguiendo con el pxel de ejemplo en la Seccin 4.6, se puede evidenciar el proceso de extraccin de la imagen REP, comparando las firmas espectrales correspondientes a las imgenes de: reflectancia (), primera derivada () y segunda derivada (), para identificar visualmente la localizacin del punto de mxima pendiente en la regin red edge, que se ha definido como el punto REP (Figura 4-14). En la (Figura 4-14.c) se observa que la longitud de onda (730 nm) para el punto de segunda derivada igual a cero ( = 0), corresponde con la longitud de onda del punto mximo de primera derivada (aproximadamente =0.0015) en la (Figura 4-14.b), y que finalmente se localiza sobre la curva de reflectancias (), en una posicin cercana al centro de la banda 6 (725 nm) en la (Figura 4-14.a). Este valor de longitud de onda ( = 730 nm), corresponde al valor REP del pxel ejemplo en la (Figura 4-14.d), clasificado dentro de un rango 730-740 nm con color rojo.
Resultados
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Figura 4-14: Ejemplo de aplicacin mtodo Langrange para un pxel de cultivo de coca en estado fenolgico maduro (imgenes en falso color RGB 765). a. Imagen y firma de reflectancia (). b. Imagen y firma de la primera derivada de la reflectancia (). c. Imagen y firma de la segunda derivada de la reflectancia (). d. Imagen REP clasificada por rangos.
i-1
Imagen de Reflectancias
i+1
i+1 () i i-1
Imagen de REP
REP
b
=
REP
()
REP
() = 0
Para clasificar la imagen REP se determinaron tres rangos de longitudes de onda, correspondientes a cada estado fenolgico, a partir de los valores REP correspondientes a las reas de semilleo verificadas mediante sobrevuelo (104 pxeles por cada estado); mediante la herramienta density slice de Envi se seleccionaron los tres rangos que se muestran en la (Figura 4-15).
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
Figura 4-15: Definicin de rangos por cada estado fenolgico, a partir de reas verificadas en terreno, para clasificacin de imagen REP
Reflectancia
0,3
0,25
0,2 0,15 0,1
0,05
0
733
734
735
736
737
738
739
740
REP (nm)
De acuerdo con estos rangos, se observ como los valores de longitud de onda REP, incrementan con la edad de la vegetacin; para el estado juvenil se presentan los menores valores de la posicin REP y de igual forma para el estado maduro se presentan los valores mayores. Estos resultados son comparables con los obtenidos por Clevers et al.(2002), mediante imgenes MERIS aplicando el mtodo lineal para calcular el parmetro REP en coberturas vegetales, y cuyos valores muestran una relacin directa entre el contenido de clorofila y estado fenolgico de estas coberturas, con la posicin del punto de inflexin en la regin red edge. Tambin Boochs(1990) document como la posicin REP est relacionada directamente con cambios en el estado biolgico y morfolgico de la remolacha (beta vulgaris var. saccharata), y el trigo (triticum aestivum), mediante mediciones radiomtricas en campo.
Resultados
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A partir de estos rangos, los pxeles de la imagen REP se agruparon en cada uno de los estado fenolgicos correspondientes, para luego vectorizar las reas resultantes y generar la cartografa correspondiente (Figura 4-16).
Figura 4-16: Resultado final de la clasificacin por parmetro REP (imagen falso color RGB 756)
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
Figura 4-17: Librera espectral para los tres estados fenolgicos de los cultivos de coca, obtenida a partir de imagen World View II
Figura 4-18: Librera espectral para los tres estados fenolgicos de los cultivos de coca, obtenida a partir de radiometra en campo
Resultados
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Para comparar las curvas espectrales de las dos libreras, se extrajeron los porcentajes de reflectancias de cada firma (radiomtricas y de la imagen), correspondientes a las longitudes de onda () de los centros de banda de la imagen World View II (Tabla 4-5). A partir de estos valores, se construyeron las grficas de curvas espectrales por cada estado fenolgico, as como la curva que representa la diferencia entre las reflectancias de la radiometra y la imagen satelital (Figura 4-19).
Tabla 4-5: Comparacin de reflectancias en la imagen vs radimetro para las longitudes de onda correspondientes a los centros de banda ()
Banda 3 4 5 6 7 8 Centro de Banda () 545 605 660 725 835 950 % Reflectancia Firma Imagen WV2 Juvenil Vegetativo Maduro 14,706 14,228 13,106 13,663 12,601 11,12 13,690 12,259 10,202 23,552 24,063 23,403 35,913 38,365 39,065 28,568 30,516 30,928 % Reflectancia Firma Radiomtro Juvenil Vegetativo Maduro 16,131 15,534 14,336 11,110 8,870 7,756 11,639 8,646 7,435 46,764 49,155 50,068 16,644 17,434 21,080 3,553 4,206 4,848
? % Reflectancia Juvenil Vegetativo Maduro -1,425 -1,306 -1,230 2,553 3,731 3,364 2,051 3,613 2,768 -23,212 -25,092 -26,665 19,269 20,931 17,985 25,016 26,310 26,080
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
Figura 4-19: Comparacin de firmas espectrales obtenidas con radiometra vs firmas extradas de la imagen World View II, por cada estado fenolgico. a) Juvenil, b) Vegetativo, c) Maduro
Resultados
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Al comparar las firmas espectrales resultantes de cada librera, se observa que a lo largo de la regin 605-660 nm, las curvas siguen una misma tendencia al contar con una mxima absorcin en todos los estados fenolgicos, mostrando que a mayor edad en las plantas, esta absorcin es mayor tambin, lo cual est relacionado con la cantidad de rea verde del dosel, entonces, a mayor rea se presenta mayor absorcin de la energa electromagntica en estas longitudes de onda. En la regin comprendida entre 660-835 nm, las respuestas espectrales alcanzan su mxima reflectancia para todos los estados de los cultivos, sin embargo en este caso los cultivos juveniles son los que presentan menor reflectancia, y los que estn en edad de cosecha, son los que presentan una mayor reflectancia, esto se explica por la capacidad que adquieren las hojas al madurar, hacindose ms resistente ante eventuales periodos de dficit hdrico, y requiriendo menores cantidades de energa infrarroja, por lo que la energa incidente en estas longitudes de onda va a ser mayormente reflejada a medida que avance la edad de las plantas. Al comparar las dos curvas (imagen vs radiometra en campo) en las graficas (Figura 420) se observa que las reflectancias obtenidas en campo son ms altas que las obtenidas a partir de la imagen, esto ocurre porque los datos no fueron tomados a la par, y la reflectancia depende de la cantidad de energa solar incidente, la cual es diferente en ambo casos. Adems se observa como la mxima reflectancia se logra en una longitud de onda de 725 nm (equivalente a la banda 6 del rango red edge en la imagen) para el caso de las firmas obtenidas mediante radimetro, a diferencia de las firmas obtenidas con la imagen, para las cuales las mximas reflectancias corresponden a la banda 7 (835 nm) del infrarrojo cercano. Esto indica que los rangos de longitud de onda que se establecieron para los parmetros REP en ambos casos van a diferir, siendo menores los valores de REP de la radiometra, y los valores REP de la imagen mayores.
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
Figura 4-20: Firmas espectrales por estado fenolgico, ajustadas a los centros de banda de la imagen World View II. a) % Reflectancia de la imagen WV2. b) % Reflectancia de radiometra en campo
Resultados
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
Figura 4-21: Rangos REP para los tres estados fenolgicos de los cultivos de coca.
Resultados
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Para cada una de las firmas espectrales pertenecientes a las dos libreras obtenidas, se calcul el parmetro REP. En ambos casos para cada estado fenolgico se determinaron unos rangos de valores para REP, los cuales muestran como a mayor edad en el cultivo, la posicin red edge cambia hacia longitudes de onda ligeramente mayores, permitiendo de esta manera clasificar los tipos de cultivos en un rango especfico, de acuerdo con su comportamiento en la regin red edge (Figura 4-21). Se estableci la correlacin entre el parmetro REP y la edad de cada tipo de cultivo, mediante el coeficiente de Pearson (r). Para el caso de las muestras de campo, se obtuvo un coeficiente r = 0.79 (Figura 4-22), y para el caso de las muestras de la imagen World View II, se obtuvo un coeficiente r = 0.88 (Figura 4-23); en ambos caso estos resultados corresponden a un grado de correlacin lineal alto entre la posicin REP y la edad de las plantas, las cuales se relacionan de una manera directamente proporcional.
Figura 4-22: Correlacin de Pearson entre las variables Edad de las plantas y REP, para las muestras de campo.
Muestras de Campo
726 724 722 720
Edad vs REP n: Covarianza: Desv Edad: Desv. REP: Coeficiente Pearson (r):
REP (nm)
juvenil (2 meses)
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
Figura 4-23: Correlacin de Pearson entre las variables Edad de las plantas y REP, para las muestras obtenidas de la imagen World View II
Edad vs REP n: Covarianza: Desv Edad: Desv. REP: Coeficiente Pearson (r):
739 738
REP (nm)
737 juvenil (2 meses) 736 735 734 733 0 2 4 6 Meses 8 10 12 14 vegetativo (6 meses) maduro (12 meses)
Resultados
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Figura 4-24: Grfico de variacin de parmetro REP para cada estado fenolgico, respecto a la hora de captura de los datos
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
Figura 4-25: Perfiles espectrales del parmetro REP para coberturas asociadas a los cultivos de coca
Bosque
Bosque Bosque
Bosque
Coca
Coca Pastizal
Coca
Agua
Bosque Bosque
Coca
Pastizal
Resultados
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Figura 4-26: Clasificacin final sobre la imagen WorldView II, de acuerdo con el parmetro REP
Pastizales y Coca estado juvenil Coca estado vegetativo Coca estado maduro Bosque Agua
Para el caso de los cultivos juveniles y los pastizales, el rango REP comprendido entre 734-737 nm es coincidente, lo cual hace difcil la identificacin de cultivos de coca en reas donde hay presencia de grandes extensiones de sabana. Sin embargo, para los cultivos de esta edad que se presentan en medio de bosques naturales o secundarios, se obtiene una identificacin clara de este tipo de cultivos (Figura 4-27)
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
Figura 4-27: Ejemplo de rea clasificada como cultivo juvenil, en medio de coberturas de bosque.
Para los cultivos de coca en estado vegetativo, cuyas plantas cuentan con una edad promedio de 4-6 meses, el clasificador REP (737-738 nm) logra identificar y extraer las reas con presencia de estos cultivos, y en la clasificacin final suelen estar mezclados con pequeas reas de cultivos de coca de menor o de mayor madurez (Figura 4-28).
Figura 4-28: Ejemplo de rea clasificada como cultivo vegetativo, en medio de coberturas de bosque.
Los cultivos maduros, que estn listos para cosechar, son claramente identificables mediante el mtodo Lagrange, incluso dentro de reas con pastizales o baja densidad de cobertura vegetal, para valores de REP entre 738-740 nm (Figura 4-29).
Resultados
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Figura 4-29: Ejemplo de rea clasificada como cultivo maduro, en medio de coberturas de bosque.
Los cuerpos de agua cuentan con valores elevados de REP, entre 746-810 nm, lo que los clasifica con una buena separabilidad de las coberturas vegetales (Figura 4-30).
Figura 4-30: Ejemplo de un cuerpo de agua clasificado mediante mtodo Lagrange, en medio de coberturas de bosque.
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
Convenciones
Mtodos y/o procesos Resultados
Etapa de procesamiento
Resultados
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- Captura de imagen World View II: Se selecciona un rea de inters y se solicita la adquisicin de la escena al proveedor, en nivel basic standard. De lo cual se obtiene una imagen satelital en radiancias relativas (q). - Transformacin de la imagen a radiancias absolutas (): Mediante la calculadora raster de bandas de cualquier software de procesamiento de imgenes, se programa la expresin de la (Ecuacin 3.3), y se transforma la imagen de radiancias relativas (q) a radiancias absolutas (). - Transformacin de la imagen a reflectancias (): Mediante la calculadora raster de bandas de cualquier software de procesamiento, se programa la expresin de la (Ecuacin 3.4), y se transforma la imagen de radiancias absolutas () a reflectancias (). - Clculo de la imagen de la primera derivada (): A partir de la imagen de reflectancias (), se calcula la imagen de la primera derivada de las reflectancias (), para lo cual se recomienda el uso del algoritmo spectral derivative desarrollado en el lenguaje IDL de Envi. - Clculo de imagen REP: A partir de la imagen de la primera derivada de las reflectancias (), y mediante una calculadora raster, se emplea la expresin de la (Ecuacin 3.8) para obtener la imagen REP, la cual consta de una banda y cuyos niveles digitales por pxel corresponden a los valores de longitud de onda donde se presenta la posicin REP. - Clasificacin por rangos REP: Para esta fase final de la etapa de procesamiento se debe contar con los parmetros REP por estado fenolgico, obtenidos de radiometra en campo y tambin los correspondientes a las firmas en la imagen, a partir de los cuales se establecen los rangos de valores REP que corresponden a cada estado fenolgico. Una vez que se cuenta con los rangos definidos, estos deben ser definidos sobre la imagen unibanda REP, mediante la herramienta de clasificacin density slice (disponible en los diferentes software de procesamiento), y obtener as las clases correspondientes. Una vez que se aplique la anterior metodologa, se cuenta con una capa de reas clasificadas, cuyos resultados deben ser evaluados mediante matrices de confusin y/o el ndice de concordancia Kappa, a partir de datos conocidos sobre el terreno u otra fuente informacin confiable.
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
4.14 Validacin del mtodo propuesto con base en matrices de confusin y coeficiente Kappa
Para la validacin se identificaron algunos cultivos por estado fenolgico mediante un sobrevuelo en el rea de estudio, junto con informacin de coordenadas de campo de lotes censados por el grupo de erradicacin manual y los lotes asperjados por la DIRAN. Los lotes de coca definitivos para cada estado fenolgico, fueron identificados y registrados en video, para luego ser digitalizados como reas de verificacin.
Los lotes de cultivos juveniles identificados, se presentan en la imagen con color rojo de tono claro, mezclado con pxeles de alta reflectancia correspondientes a pastos y suelos desnudos (Figura 4-32).
Los lotes de cultivos en estado vegetativo, se identifican en la imagen con tonos de rojo ms oscuros, y con menor mezcla de pastos y suelo, lo que indica una mayor densidad de rea verde por dosel de coca (Figura 4-33).
En el caso de los lotes con cultivos en estado maduro, sobre la imagen se identifican como reas de vegetacin arbustiva de mayor densidad en medio de lotes que fragmentan bosques naturales, con tonos rojos oscuros y conglomerados (Figura 4-34).
Resultados
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Figura 4-32: Lotes de cultivos de coca juvenil identificados sobre la imagen mediante sobrevuelo a
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
Figura 4-33: Lotes de cultivos de coca en estado vegetativo identificados sobre la imagen mediante sobrevuelo
Resultados
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Figura 4-34: Lotes de cultivos de coca en estado maduro identificados sobre la imagen mediante sobrevuelo
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
Despus de vectorizar estos lotes sobre la imagen, se aplic sobre la clasificacin obtenida del mtodo de Lagrange, el proceso de validacin por matrices de confusin y clculo del ndice de concordancia Kappa.
En un sentido estricto ninguna clasificacin puede considerarse completa hasta que su grado de exactitud sea evaluado. Este puede definirse como el grado de concordancia entre las clases asignadas por el clasificador y sus ubicaciones correctas segn datos de terreno recolectados previamente, en este caso mediante verificacin por sobrevuelo.
Para evaluar la exactitud de la clasificacin se calcul una matriz de confusin (Tabla 46); dicha matriz muestra la relacin entre dos series de medidas correspondientes al rea en estudio. La primera serie (columnas) corresponde a datos de referencia adquiridos de observaciones de campo por sobrevuelo. La segunda (filas) corresponde a la categorizacin de los pixeles realizada por el clasificador REP, para las clases de coca en estudio.
Tabla 4-6: Matriz de confusin para evaluar la clasificacin mediante el parmetro REP
95 30 125
36 105 22 163
170 170
76 24 100
100 100
Los elementos en Exactitud negrilla de la diagonal indican los pxeles que fueron correctamente Usuario Exactitud Productor Exactitud Global clasificados. Todos 95/131 los elementos de la diagonal errores de omisin o de = 72,52%fuera 95/125 = 76% indican 370/458 = 80,786%
105/105 = 100% corresponden 105/163 = 64,41% comisin. Los errores de omisin a los elementos no diagonales de las
columnas que se asignaron otras clases (ejemplo: un total de 30 pixeles que debieron
170/222 = 76,57%
170/170 = 100%
Resultados
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haber sido clasificados como cultivo de coca juvenil, fueron clasificados como cultivos de coca para cosechar). Los errores de comisin corresponden a los elementos no diagonales de las filas, que se incluyeron errneamente en otras clases (ejemplo: 30 pixeles de coca juvenil y 22 de coca vegetativo se incluyeron errneamente en la clase de cultivos para cosechar).
A partir de la matriz de confusin se calcularon otras medidas de inters desde el punto de vista de la exactitud (Tabla 4-7):
Ecuacin (4.1)
95 30 125
36 105 22 163
170 170
131
100
100 100 Tabla 4-7: Medidas de exactitud derivadas de100 la matriz de confusin
Exactitud Usuario Exactitud Productor Exactitud Global 95/131 = 72,52% 105/105 = 100% 170/222 = 76,57% 95/125 = 76% 105/163 = 64,41% 170/170 = 100% 370/458 = 80,786%
La exactitud del usuario (Ecuacin 4.1), indica el porcentaje de pxeles de cada clase que ha sido correctamente clasificados, en este caso, la clase coca vegetativo cuenta con el 100% de sus pxeles correctamente clasificados, es decir que los pxeles de referencia (reas verificadas en sobrevuelo) de las otras dos clases no han sido clasificadas
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
errneamente en esta clase; para las clases coca juvenil y en cosecha algunos de sus pxeles de referencia si fueron clasificados errneamente entre ellas.
La exactitud del productor (Ecuacin 4.2), indica que tan bien los pixeles de referencia han sido clasificados en su clase respectiva, en este caso los cultivos de coca para cosechar verificados en campo, fueron totalmente clasificados dentro de su respectiva clase; los cultivos de referencia en campo de las otras dos clases, presentaron algunas reas clasificadas errneamente.
El ndice de exactitud global (Ecuacin 4.3), como su nombre lo indica, representa la cantidad de pxeles de referencia que fueron correctamente clasificados, sin discriminar a que clase pertenecen; como resultado de la clasificacin mediante el mtodo de Lagrange, esta exactitud indica que un 80.7% de pxeles de las reas verificadas mediante sobrevuelo, fueron clasificados correctamente por el mtodo de Lagrange.
Sin embargo, el ndice de exactitud global, como indicador de concordancia entre las observaciones de campo y la clasificacin REP, tiene el inconveniente de que aunque, tanto el observador en campo, como el clasificador REP, clasifiquen las reas con criterios independientes, se puede producir un cierto grado de coincidencia entre ambos, por azar. En este sentido, el ndice ms usado es el propuesto por Cohen(1960), y denominado ndice kappa (K) (Ecuacin 4.4, Ecuacin 4.5).
Ecuacin(4.4)
Ecuacin(4.5)
siendo: Po = proporcin de coincidencias observadas entre la clasificacin en campo y el clasificador REP. Es la misma exactitud global. Pe = proporcin de coincidencias esperadas por azar, entre la clasificacin en campo y el clasificador REP = total de observaciones en la fila i (total marginal a la derecha de la matriz)
Resultados
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El ndice kappa es una medida de concordancia entre dos clasificadores u observadores, en este caso: la clasificacin realizada por el observador en campo y la clasificacin realizada por el clasificador REP, corrigiendo el porcentaje de exactitud global que pueda deberse al azar. Como resultado se obtuvo un ndice K del 70.9%, con un Pe del 33.95%, lo cual quiere decir que del 80.7% de coincidencias observadas, un 70.9% son coincidencias por concordancia entre lo observado en campo y el clasificador REP, y un 29.09% es por azar. Este valor de kappa segn Landis et al. (1977) (Tabla 4-8), permite afirmar que existe concordancia entre el mtodo de clasificacin y las observaciones de referencia realizadas en sobrevuelo.
Tabla 4-8: Escala de valoracin del ndice kappa, propuesto por Landis-Koch (1977)
kappa (K )
< 0,00 >0,00 - 0,20 0,21 - 0,40 >0,41 - 0,60 0,61 - 0,80 0,81 - 1,00
Grado de acuerdo
sin concordancia muy baja concordancia baja concordancia concordancia moderada concordancia concordancia casi perfecta
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Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
San Jos del Guaviare, el informe del censo del ao 2010, reporta una de las ms altas densidades de cultivos de coca a nivel nacional, en un rango entre 1-3 hectreas por cada kilmetro cuadrado (Tabla 4-9).
Tabla 4-9: Comparacin de densidades de cultivos de coca en el rea de estudio, obtenidas mediante las dos metodologas de clasificacin
Densidad (ha/km ) Metodologa convencional Metodologa propuesta 1-3 3,4
Para el caso de la metodologa propuesta, a partir de imgenes World View II, y el clculo del parmetro REP por cada estado fenolgico de los cultivos de coca, junto con verificacin por sobrevuelo, se obtuvo una densidad total de 3.4 hectreas por kilmetro cuadrado, resultantes al dividir el total de hectreas clasificadas como cultivo de coca (967 hectreas), entre el rea total cubierta por la escena (285 kilmetros cuadrados). Por cada estado fenolgico igualmente se discrimin la densidad, encontrando que para el momento de la toma de la imagen, se contaba con mayor presencia de cultivos maduros para cosechar, en el rea de estudio (Tabla 4-10)
Tabla 4-10: Detalle de densidades de cultivos por estado fenolgico, obtenidas a partir de la metodologa propuesta
Area Total (ha) Coca estado Juvenil Coca estado Vegetativo Coca estado Maduro Total 195 190 582 Densidad (ha/km ) 0,684 0,668 2,042
967
5. Conclusiones y recomendaciones
El desarrollo de una metodologa para identificar cultivos de coca, mediante anlisis de parmetros espectrales en la regin red edge y espectroscopia de imgenes, permiti llegar a una clasificacin de los mismos, en tres diferentes estados fenolgicos (juvenil, vegetativo y cosecha); logrando un nivel de concordancia alto en los resultados obtenidos, al aplicar el mtodo de Lagrange para calcular el parmetro REP de cada una de las curvas espectrales extradas de una imagen World View II, que cuenta con la particularidad de contener una banda exclusiva para la regin red edge del espectro electromagntico. La radiometra en cultivos experimentales de coca, permiti obtener una librera espectral de referencia para entender el comportamiento del parmetro REP en cada tipo de cultivo, y de esta manera se pudo confirmar que las firmas espectrales de los cultivos, obtenidas a partir de la imagen, presentaban los mismos comportamientos de absorcin y reflectancia que estas firmas base. Para cada una de las libreras se empleo un mtodo diferente de clculo de la posicin red edge, en el caso de las firmas en campo, se emple el mtodo de extrapolacin lineal, y para las firmas de la imagen se empleo el mtodo de Lagrange, mostrando como resultado en ambos casos, que a medida que los cultivos van madurando, la posicin REP se desplaza a longitudes de onda mayores dentro del rango cubierto por el infrarrojo cercano.
Un aspecto importante a tener en cuenta para el momento de realizar mediciones de reflectancia en campo, e incluso captura de una imagen satelital para un rea de estudio, es la posicin del sol, ya que en horas cercanas al medio da (12m), las firmas espectrales de los tres tipos de cultivos de coca, presentan posiciones REP muy similares, lo que dificultara la definicin de los rangos de longitudes de onda para la posicin red edge de cada estado fenolgico. Adems se debe mantener siempre la
Conclusiones
83
misma altura del lente del radimetro en todos los muestreos, para que las radiancias capturadas correspondan a la misma rea de dosel.
Se recomienda que las imgenes sean tomadas en la misma fecha de la radiometra, o por lo menos en condiciones atmosfrica similares; de ser posible contar con imgenes hiperespectrales de alta resolucin espectral (un ancho de banda cercano al del radimetro) y espacial ( tamao de pxel menor o igual a 1 metro, que evite la mezcla de reflectancias) que permitan obtener firmas espectrales continuas y comparables con la radiometra en campo.
El desplazamiento de la posicin REP, se debe a los cambios de rea cubierta por el dosel, y los cambios anatmicos y fisiolgicos de las hojas, a medida que las plantas van madurando; para doseles de baja cobertura se obtienen altas absorciones de energa en el rango 660-680 nm, es decir, al inicio de la regin red edge, y para cultivos maduros cuyas hojas son ms fuertes que en edades menores, la reflectancia incrementa en el rango 720-760 nm, es decir, al final de dicha regin.
En cuanto a la definicin de los rangos correspondientes para el parmetro REP por cada tipo de cultivo, y otras coberturas vegetales asociadas a los mismos, se debe realizar con un muestreo adecuado de reas verificadas en terreno y/o que el observador pueda identificar con certeza sobre la imagen, ya que estos rangos son los que permiten clasificar la imagen resultante del mtodo de Lagrange. Para el caso particular de los cultivos juveniles es necesario tener un mayor nmero de muestreos, ya que el valor de la posicin REP de estos es muy cercano al correspondiente de coberturas como pastizales o reas de sabana, o contar con las firmas espectrales de estas, para que el clasificador evite la mezcla.
Finalmente, para la validacin de los resultados se debe contar con reas identificadas en terreno, que permitan construir una matriz de confusin y calcular el ndice de concordancia Kappa, y de esta manera evaluar en qu proporcin los resultados de la clasificacin son coincidentes con las reas de terreno. En este caso se obtuvo una concordancia alta del 70 %, entre los resultados de la clasificacin REP y las reas verificadas mediante sobrevuelo, para una exactitud global del 80%. Por otra parte, se observa que la densidad de cultivos de coca en el rea de estudio (3.4 ha/km), est en
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el lmite mayor de la densidad reportada por el censo nacional de cultivos de coca en el 2010 (1-4 ha/km), debido a que en el censo realizado por el proyecto SIMCI con imgenes Landsat y ALOS, no se consideran cultivos con reas menores a 0.25 hectreas, a diferencia de la metodologa propuesta cuya imagen base es de alta resolucin espacial, permitiendo incluir en la clasificacin cultivos con reas hasta de 0.05 hectreas.
La metodologa propuesta puede ser aplicable a otro tipo de cultivos, de carcter lcito, y puede mejorarse con la determinacin del parmetro REP mediante otro tipo de imgenes, de mayor resolucin espectral, como las hiperespectrales, con las cuales se contara con un mayor nmero de bandas contenidas en la regin red edge, permitiendo incrementar el grado del polinomio de Lagrange, y ajustar ms la posicin REP. Adems, siempre debe apoyarse los datos de las imgenes con libreras espectrales en campo para los diferentes estados fenolgicos que se definan y para distintas horas del da.
Bibliografa
BONHAM CARTER, G. F., 1988. Numerical procedures and computer program for fitting an inverted Gaussian model to vegetation reflectance data. En: Computers and Geosciences. 14: 339-356.
BOOCHS, F., KUPFER, G., DOCKTER, K. AND KUHBAUCH, W., 1990. Shape of the red-edge as vitality indicator for plants. En: International Journal of Remote Sensing, 11(10): 1741-1753. CHO, M., SKIDMORE, A. 2006. A new technique for extracting the red edge position from hyperspectral data: The linear extrapolation method. En: Remote Sensing of Environment. 101: 181-193.
CLEVERS, J. G. P.W., DE JONG, S. M., EPEMA, G. F., VAN DER MEER, F., BAKKER,W. H., SKIDMORE, A. K.,. 2002. Derivation of the red edge index using MERIS standard band setting. En: International Journal of Remote Sensing. 23: 31693184. COHEN J. 1960. A coefficient of agreement for nominal scales. En: Educational and Psychological Measurement. 20: 37-46. CONCEJO MUNICIPAL SAN JOSE DEL GUAVIARE. Plan Bsico de Ordenamiento Territorial para el municipio de San Jos del Guaviare. 2001 CURRAN P.J. 1994. Imaging spectrometry - its present and future role in environmental research. En: Imaging Spectrometry - a Tool for Environmental Observations. 1-23 CURRAN, P.J., DUNGAN, J.L., GHOLZ, H.L. 1990. Exploring the relationship between reflectance red edge and chlorophyll content in slash pine. En: Tree Physiol. 7 : 33-48.
86
Metodologa para identificar cultivos de coca mediante anlisis de parmetros red edge y espectroscopia de imgenes
DAWSON, T. P., CURRAN, P. J., 1998. A new technique for interpolating red edge position. En: International Journal of Remote Sensing. 19 (11): 21332139. FILELLA, I., PEUELAS, J. 1994. The red edge position and shape as indicators of plant chlorophyll content, biomass and hydric status. En: International Journal of Remote Sensing. 15: 1459-1470.
GAUSMANN, H.W. 1969. Reflectance of cotton leaves and their structure. En: Remote Sensing of Environment. 1 (1) : 19-22.
GUYOT, G., BARET, F., MAJOR, D.J. 1988. High spectral resolution: determination of spectral shifts between the red and near infrared. En: International Archives of Photogrammetry and Remote Sensing. 11: 750-760.
HORLER, D. N. H., DOCKRAY, M., BARBER, J. 1983. The red edge of plant leaf reflectance. En: International Journal of Remote Sensing. 4(2): 273288.
ITC. 2006. Distance education course: Hyperspectral remote sensing. ITT. 2010. ENVI Users Guide. ITT Visual Information Solutions, Boulder, CO. JENSEN, J. 2000. Remote Sensing of the Environment: An Earth Resource Perspective. Prentice Hall. LANDIS J.R., KOCH, G.G. 1977. The measurement of observer agreement for categorical data. En: Biometrics. 33:159-174.
LIANG, S. 2004. Quantitative remote sensing of land surfaces. Wiley-Interscience. Pginas: 274-278.
Bibliografa
87
MILLER, J. R., HARE, E. W., AND WU, J., 1990. Quantitative characterization of the vegetation red edge reflectance I. An inverted-Gaussian reflectance model. En: International Journal of Remote Sensing. 11, 1755-1773.
parameters from Hyperion data for estimation of forest Leaf Area Index. En: IEEE Transactions on Geoscience and Remote Sensing. 41(4): 916-921. REIGOSA, J., PEDROL, N., SNCHEZ, A. (2004). La ecofisiologa vegetal Una ciencia de sntesis. Universidad de Vigo. Thompson editores. Espaa.
SMITH, K. L., STEVEN, M. D., COLLS, J. J. 2004. Use of hyperspectral derivative ratios in the red edge region to identify plant stress responses to gas leak. En: Remote Sensing of Environment. 92: 207217.
SIMCI. 2011. Cultivos de coca, estadsticas municipales, censo 31 de Diciembre de 2010. SIMCI. 2011. Monitoreo de cultivos de coca 2010.
UPDIKE, T., COMP, C. 2010. Radiometric Use of WorldView-2 Imagery. Digital Globe.
VAN DE MEER, F., DE JONG, S. 2001. Imaging Spectrometry: Basic principles and prospective applications. Kluwer academic publishers.
ZARCO-TEJADA, P. J., PUSHNIK, J. C., DOBROWSKI, S., USTIN, S. L. 2003. Steadystate chlorophyll a fluorescence detection from canopy derivative reflectance and double-peak red-edge effects. En: Remote Sensing of Environment. 84(2): 283294.