Evaluacin Gentica de la Cabra en Antioquia Interpretacin

Las siglas utilizadas en este catlogo son:

PTA: Es la habilidad predicha de transmisin, siendo una medida de la superioridad o inferioridad promedio que transmite un (a) reproductor (a) a su descendencia, en relacin a la base gentica. Si un macho tiene un PTA para produccin de leche en el segundo mes de lactancia de +120 g/da, indica que las hijas de este cabro producen 120g ms de leche que el promedio de produccin de todas las hembras en el segundo mes de lactancia. CONFIABILIDAD: La confiabilidad representa la asociacin entre un valor gentico predicho de un reproductor y su valor gentico real. Su valor vara de 0 a 100%, entre mas prximo al 100%, mas confiable es el valor del PTA. NDICE (IS): Teniendo en cuenta los PTAs de los animales en los tres puntos de la curva (segundo, cuarto y sptimo mes de lactancia), se construyeron ndices, de la siguiente manera. El ndice para Produccin de leche: IL = 35% del PTA leche en el segundo mes, 25% del PTA leche en el cuarto mes y 40% del PTA leche en el sptimo mes. El ndice para Produccin de grasa: IG = 30% del PTA grasa en el segundo mes, 20% del PTA grasa en el cuarto mes y 50% del PTA grasa en el sptimo mes. El ndice para Produccin de protena: IP = 45% del PTA protena en el segundo mes, 12% del PTA protena en el cuarto mes y 43% del PTA protena en el sptimo mes. GENOTIPIFICACIN: En los listados de hembras aparece el genotipo para k-caseina, b-

lactoglobulina y Pit-1. Estos genes estn asociados a caractersticas productivas como se indica a continuacin:

Marcador molecular SNP en el Gen

Genotipo AA Se encuentra asociado a mayor produccin de leche. AB Es un genotipo intermedio con respecto a la produccin de leche y al porcentaje de protena en la leche. Genotipo BB Se encuentra asociado a mayor porcentaje de protena en la leche.

K-casena

Se encuentra

Se encuentra

B-lactoglobulina

asociado a mayor produccin y porcentaje de protena en la leche. TT Se encuentra asociado a menor produccin de leche y menor peso al nacimiento.

intermedio para la produccin de leche y el porcentaje de grasa en la leche. CT Se encuentra asociado a mayor produccin y mayor peso al nacimiento.

asociado a mayor porcentaje de grasa en la leche.

CC Se encuentra asociado a mayor produccin y mayor peso al nacimiento.

Pit 1

NDICE DE SELECCIN
Este mtodo de seleccin permite predecir el mrito gentico de un individuo agrupando diferentes caractersticas de inters econmico en solo una, para la cual es atribuida un puntaje. Los animales con los puntajes ms altos son los seleccionados. La influencia de cada caracterstica en el puntaje final es determinada por pesos, o sea por la importancia mayor o menor de cada una de las caractersticas en el conjunto. La cuantificacin de los pesos depende del valor zootcnico relativo de cada caracterstica.

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Segunda Evaluacin Gentica para Cabras en Antioquia

Metodologa

Generalidades de la evaluacin gentica caprina

Control lechero La informacin analizada pertenece a 14 apriscos adscritos al programa de control lechero realizado por la universidad de Antioquia y apoyado por la Asociacin de Caprino-ovinocultores de Antioquia

(ASOCABRA). Los muestreos fueron realizados bajo el protocolo A2 recomendado por la (ISAG) en el cual se realizan visitas cada 15 das aproximadamente y se recolecta la informacin de produccin y reproduccin de cada uno de los animales del aprisco. El anlisis individual de la leche se realiza por medio de un analizador lcteo (Ekomilk), el cual nos proporciona informacin sobre los porcentajes de grasa y protena, que posteriormente se transforma en contenido de grasa y protena en gramos; en el control lechero tambin se recolectaron datos de manejo, reproduccin y parentesco.

Base de datos Se usaron 6200 registros productivos y reproductivos de los cuales se analizaron 623 hembras con 2 partos en promedio. Se tomaron valores de produccin de leche, gramos de grasa y de protena, porcentaje de grasa y protena en los controles realizados en los intervalos de 61-90 das en leche (DEL) (P3), 181-210 (DEL) (P7) y 271-300 (DEL) (P10) das de lactancia (DEL) para hallar las heredabilidades (h2) de las tres caractersticas, los componentes de varianza (2), las correlaciones genticas y fenotpicas entre los tres puntos de control analizados y la repetibilidad (r) de las tres caractersticas usando el efecto del ambiente permanente (pe). Los individuos con informacin incompleta y con menos de tres datos por control fueron eliminados del anlisis final. Los promedios de produccin con sus respectivas desviaciones (SD) ms el nmero de datos para cada una de las tres caractersticas analizadas (produccin de leche, contenido de grasa y protena ), en los tres intervalos de das en leche se describen en la siguiente tabla.

Caracterstica

DEL 61-90 181-210

N de datos 395 395 289 329 329 214 331 331 215 329 214 160 331 215 161

Promedio (gr) SD 1585.71 771.80 1327.19 701.28 1473.03 723.07 70.19 34.44 56.37 36.04 64.20 37.56 54.38 25.99 44.12 24.28 48.75 26.51 4.38 0.760 4.38 0.946 4.61 0.921 3.41 0.524 3.54 0.565 3.52 0.512

Produccin de leche

271-300 61-90 181-210

Grasa (gr)

271-300 61-90 181-210 271-300 61-90 181-210 271-300 61-90 181-210 271-300

Protena (gr)

% Grasa

% Protena

Anlisis genticos Se utilizaron modelos de evaluacin gentica denominados da del control o test day (PDC) , donde se consider la produccin de leche en cada control lechero como una caracterstica distinta a lo largo de la lactancia de una hembra. Este tipo de evaluacin ha sido implementada en varios pases del

mundo ya que permite acelerar el proceso de evaluacin gentica, por lo que no es necesario esperar la finalizacin de la lactancia de una hembra para que sta sea incluida en las evaluaciones. Tambin se tiene una mayor precisin en la modelacin para los efectos ambientales que interfieren en la produccin de leche (PL), tales como: grupo de manejo, nmero de ordeos, mes y ao de parto, edad al parto y rebao, entre otros. Se consider como efectos fijos el nmero de parto y el grupo contemporneo conformado por la finca, el ao y la poca de parto. Como efectos aleatorios se consideraron el efecto gentico aditivo del animal y el efecto del ambiente permanente. Para estimar los componentes de (co) varianza se utilizo el programa MTDFREML (Boldman et al. 1995) utilizando un modelo animal multivariado.

Las varianzas (2), heredabilidades (h2) y repetibilidades (r) para las caractersticas evaluadas fueron:

Caracterstica Produccin de leche

DEL 61-90 181-210 61-90 181-210

2 a 67231.71 81900.41 59791.46 120036.61 145158.25 70930.61 115294.54 127117.87 76886.991 101861.332 126872.021 76853.28 101714.77 127139.74

2 e 255511.65 209875.09 164181.98 32130.12 61901.28 78487.56 26153.48 81550.26 154005.02 24684.894 89306.074 153942.220

2 pe 18.327292 94204.505 97905.53 356.2901 270559.14 64537.25 768.2328 1814.46 3675.30 684.145 2795.289 2980.694

h2 0.21 0.33 0.35 0.64 0.66 0.50 0.72 0.52 0.45 0.75 0.59 0.45 0.75 0.75 0.45

r 0.21 0.45 0.59 0.64 0.86 0.72 0.73 0.58 0.45 0.75 0.53 0.45 0.75 0.53 0.45

271-300 142323.41

Grasa (gr)

271-300 61-90 181-210

Protena (gr)

271-300 61-90 181-210 271-300 61-90 181-210 271-300

% Grasa

24684.826 709.465 89317.067 2078.835 154005.010 3604.61

% Protena DEL= Das en leche

Las correlaciones genticas y fenotpicas para las caractersticas evaluadas fueron:

Caracterstica

Correlaciones genticas

Correlaciones fenotpicas

P3 X P7 Produccin de leche Grasa (gr) Protena (gr) % Grasa % Protena 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00

P3X P10 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00

P7 X P10 0.99 1.00 1.00 1.00 1.00

P3 X P7 P3 X P10 P7 X P10 0.33 0.98 0.97 0.93 0.96 0.30 0.98 0.94 0.94 0.94 0.55 0.69 0.94 0.98 0.98

P1=61-90 das de lactancia; P2=181-210 das de lactancia; P3= 271-300 das de lactancia.

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Generalidades de la evaluacin gentica caprina
Control lechero La informacin analizada pertenece a 10 apriscos adscritos al programa de control lechero realizado por la universidad de Antioquia y apoyado por la Asociacin de Caprino-ovinocultores de Antioquia (ASOCABRA). Los muestreos fueron realizados bajo el protocolo A2 recomendado por la (ISAG) en el cual se realizan visitas cada 15 das aproximadamente y se recolecta la informacin de produccin y reproduccin de cada uno de los animales del aprisco. El anlisis individual de la leche se realiza por medio de un analizador lcteo (Ekomilk), el cual nos proporciona informacin sobre los porcentajes de grasa y protena, que posteriormente se transforma en contenido de grasa y protena en gramos.

Base de datos Se usaron 716 registros productivos y reproductivos de los cuales se analizaron 256 hembras con 1,4 partos en promedio. Se tomaron valores promedios de produccin de leche, gramos de grasa y protena en los controles realizados en los intervalos de 46-65 (P1), 106-125 (P2) y 166-185 (P3) das de lactancia (DEL) para hallar las heredabilidades ( h ) de las tres caractersticas, las varianzas (2), las correlaciones genticas y fenotipicas entre los tres puntos de control analizados
2

y la repetibilidad (r) de las tres caractersticas usando el efecto del ambiente permanente ( pe). Los individuos con informacin incompleta y con menos de tres datos por control fueron eliminados del anlisis final. Los promedios de produccin con sus respectivas desviaciones ( SD) ms el nmero de datos para cada una de las tres caractersticas analizadas (produccin de leche, contenido de grasa y protena ), en los tres intervalos de das en leche se describen en la siguiente tabla.

Caracterstica

DEL 46-65 106-125 166-185 46-65 106-125 166-185 46-65 106-125 166-185

N de datos 253 252 207 96 120 124 96 120 124

Promedio (gr) SD 1948.63 624.31 1601.57 478.31 1274.27 475.29 83.41 27.54 68.67 21.15 56.8 20.55 69.42 23.59 54.80 17.69 44.66 17.23

Produccin de leche

Grasa

Protena
Anlisis genticos

Se utilizaron modelos de evaluacin gentica denominados da del control o test day (PDC) , donde se consider la produccin de leche en cada control lechero como una caracterstica distinta a lo largo de la lactancia de una hembra. Este tipo de evaluacin ha sido implementada en varios pases del mundo ya que permite acelerar el proceso de evaluacin gentica, por lo que no es necesario esperar la finalizacin de la lactancia de una hembra para que sta sea incluida en las evaluaciones. Tambin se tiene una mayor precisin en la modelacin para los efectos ambientales que interfieren en la produccin de leche (PL), tales como: grupo de manejo, nmero de ordeos, mes y ao de parto, edad al parto y rebao, entre otros. Se consider como efectos fijos el tipo racial, el nmero de parto y el grupo contemporneo conformado por la finca, el ao y la poca de parto. Como efectos aleatorios se consideraron el efecto gentico aditivo del animal y el efecto del ambiente permanente. Para estimar los componentes de (co) varianza se utilizo el programa MTDFREML (Boldman et al. 1995) utilizando un modelo animal multivariado.

Las varianzas (2), heredabilidades (h2) caractersticas evaluadas fueron:

y repetibilidades

(r) para las

Caracterstica Produccin de leche

DEL 46-65 106-125 166-185 46-65 106-125 166-185 46-65 106-125 166-185

2 a 154406.89 135331.7 73442.39 152921.04 137816.92 73074.15 154092.18 135620.55 73076.99

2 e 329360.98 199663.5 146201.53 231988.77 137513.32 130406.4 222857 146380.81 84866.09

2 pe 25466.03 11715.13 24827.51 20378.55 16232.89 15770.26 23234.88 16894.99 12042.23

h2 0.30 0.39 0.30 0.38 0.47 0.33 0.39 0.45 0.43

r 0.35 0.42 0.40 0.43 0.53 0.41 0.44 0.51 0.50

Grasa

Protena DEL= Das en leche

Las correlaciones genticas y fenotpicas para las caractersticas evaluadas fueron:

Correlaciones genticas Correlaciones fenotpicas P1 X P2 P1X P3 P2 X P3 P1 X P2 P1 X P3 P2 X P3 1.00 0.99 1.00 0.64 0.48 0.62 Produccin de leche 0.99 1.00 0.99 0.98 0.57 0.71 Grasa 1.00 1.00 1.00 0.98 0.66 0.80 Protena P1= 46-65 das de lactancia; P2=106-125 das de lactancia; P3= 166-185 das de lactancia. Caracteristica

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