Lorena Lpez-Galvis, Ph.D.

16 de Mayo de 2013

Genotipo vs. Fenotipo

Genotipo
Transcripcin
ADN

ARN
mARN

Traduccin

Protena
Funcin

Protena

Fenotipo

Genotipo vs. Fenotipo

El fenotipo o caractersticas del organismo estn definidas en parte por los genes. La relacin entre gen-caracterstica se define en 4 niveles de organizacin: 1. Expresin de genes 2. Funcionalidad de las protenas 3. Caractersticas observadas 4. Genes/Caractersticas de un especie Nivel molecular Nivel celular Nivel de organismo Nivel poblacional

Genotipo vs. Fenotipo

La variacin gentica se genera por cambios en los genes/nivel molecular de diferentes tipos: Mutaciones en los genes Cambios en la secuencia de ADN generan alelos o diferentes formas de expresin de dicho gen. Cambios en la estructura cromosmica Largos segmentos de un cromosoma se pueden duplicar, eliminar, translocar. Cambios en el numero de cromosomas Un cromosoma se puede ganar o perder o un set entero de cromosomas se hereda.

Caractersticas fenotpicas
Morfolgicas
Caracteres dominantes y recesivos

Pico de viuda

Dedo pulgar recto

Dedo izquierdo encima al cruzar los dedos

Enrollar la lengua

Caractersticas fenotpicas
Fisiolgicas
Interaccin gentica y ambiente
Color de las hortensias en diferentes pH de suelo

Caractersticas fenotpicas
79113

Comportamiento

114536

Canciones de ocho especies de Phylloscopus ordenadas de menor a mayor complejidad definidas en el estudio de Mahler & Gill, 2009 (Advances in the Study of Behavior V40: p35-66)

Genotipo vs. Fenotipo

La composicin gentica de las especies evoluciona con el paso de muchas generaciones . Los cambios genticos se acumulan y lentamente pueden llevar a fuertes modificaciones en las caractersticas de una especie. Que cambios ocurrieron durante 60 millones de aos para llegar al caballo de hoy?
Huesos mas largos para mayor tamao Menos dedos Mandbula modificada para pastar

Por qu estudiamos Gentica?

La gentica tiene muchos impactos en los individuos y en la sociedad.

Agricultura

Salud
Biologa

Social
Evolucin

Biotecnologa

Por qu estudiamos Gentica?

Agricultura
Mejorar produccin y resistencia a enfermedades.

Mejoramiento hacia cultivares de alto rendimiento durante la Revolucin Verde (1950-1960)

Mejoramiento del maz por 9000 aos a cultivares con mejores caractersticas y alto rendimiento.

Por qu estudiamos Gentica?

Social
Seleccin y cruzamiento de razas especificas con unas caractersticas deseadas ha dado paso a los perros de hoy.

Por qu estudiamos Gentica?

Salud
Los genes afectan la susceptibilidad a muchas enfermedades y trastornos. La gentica se ha usado para el diagnstico y el tratamiento de muchas enfermedades.

Rayos X de la mano de una persona con displasia distrfica.

Una zona del cromosoma 5 es la responsable de la distrofia.

Por qu estudiamos Gentica?

Biologa
Todos los organismos usan sistemas genticos con caractersticas en comn. El biologa del desarrollo requiere de la gentica para entender como se forman tejidos y rganos a partir de la expresin de genes.

Expresin especfica del gen eyeless produce un ojo en la extremidad de la mosca .

Por qu estudiamos Gentica?

Evolucin

La variacin gentica es la base del cambio evolutivo.

rbol de evolucin del aislamientos de VIH de un dentista y 7 de sus pacientes.

Por qu estudiamos Gentica?

Biotecnologa
Mtodos de gentica molecular se usan para producir sustancias de valor econmico por medio de biotecnologa. Terapia gnica para el tratamiento de enfermedades genticas.

Grandes divisiones de la Gentica

Grandes divisiones de la Gentica

1. Gentica de la Transmisin
Explora los patrones de herencia de una generacin a la otra. Involucra: La relacin entre los cromosomas y la herencia. El ordenamiento de los genes en los cromosomas. El mapeo gentico. Base experimental anidada en trabajos de cruzamiento genticos. Identificacin de parentales para la cruza. Seguimiento de caractersticas de inters. Cuantificacin de dichos fenotipos.

Grandes divisiones de la Gentica

2. Gentica Molecular
Explora el entendimiento bioqumico del material gentico. Involucra la estructura, organizacin y funcin de los genes estudiando: Replicacin del ADN Transcripcin del ADN Traduccin del ADN Regulacin gnica Expresin gnica Base de investigacin est en experimentos genticos en organismos modelo. Identificar un fenotipo de inters y buscar el gen causante: Reverse genetics. Identificar un gen y encontrar su funcin: Forward genetics.

Grandes divisiones de la Gentica

3. Gentica de Poblaciones
Explora la variacin gentica y su rol en la evolucin. Involucra: Composicin gentica de la poblacin y sus cambios en el tiempo. Conecta la teora de Mendel en herencia con la de Darwin en evolucin. La variacin gentica se origina y estudia en: Variacin cromosmica Mutaciones en el ADN y su reparacin. Gentica cuantitativa. Gentica poblacional. Gentica evolutiva.

Grandes divisiones de la Gentica

Otros campos
4. Gentica cuantitativa 5. Gentica del desarrollo 6. Genmica 7. Gentica de la evolucin 8. Gentica de la ecologa 9. Gentica de la conservacin

Inicios de la revolucin en Gentica

Gentica progres de Mendel a DNA en menos de un siglo.
Teora de herencia en cromosomas. Variacin gentica La naturaleza del material gentico: DNA o protenas

Inicios de la revolucin en Gentica

El descubrimiento de la doble hlice dio inicio a la era de la gentica molecular.
Estructura del DNA y del RNA Expresin gnica: Del DNA a fenotipo. Protenas y su funcin

Anemia falciforme causada por un cambio de aminocido en la -globina.

Inicios de la revolucin en Gentica

El desarrollo de la tecnologa del DNA recombinante inici la era de la clonacin.
Enzimas de restriccin descubiertas en bacterias cortan el DNA en lugares especficos.
HindIII produce fragmentos con extremos cohesivos PvuIV produce fragmentos con extremos romos

Plsmidos modificados o vectores podan recombinar DNA para propagarlo en bacterias. DNA propagado se conoce como clon. DNA clonado en altas cantidades es usado en estudios de forma y funcin, regulacin gnica, evolucin, secuencia, etc

Inicios de la revolucin en Gentica

El DNA recombinante permiti el desarrollo de tcnicas mas refinadas de clonacin.
Clones podan ser mucho mas largos que un solo gen. Libreras de clones permitan albergar el genoma de un organismo. Las tcnicas de secuenciacin dieron paso a descubrir los genomas de organismos de importancia.

Para qu secuenciar el DNA?

Proyecto Genoma Humano

Revolucin Gentica

Secuenciacin de genomas
Shotgun sequencing

Secuenciacin de genomas
Clone by clone, map-based sequencing

Secuenciacin
Secuencias gnicas se analizan para predecir su funcin como gen y como protena Genmica funcional Anlisis requiere de herramientas computacionales que predicen la funcin o regulacin de los genes o protenas Comparan secuencia con genes ya descritos funcionalmente. Comparan motivos de regulacin en promotores para deducir su posible regulacin gnica. La prediccin funcional debe ser correlacionada con funcionalidad real en condiciones de laboratorio.

Resultados de secuenciacin de genomas

Gentica funcional
Genoma de Arabidopsis

Genoma del hombre

Gentica comparativa

Gentica comparativa
Los estudios genticos dependen del uso de los organismos modelo. Descubrimientos en organismos modelo tienen gran efecto en entendimiento biolgico, de desarrollo y de enfermedades en humanos.

Test genticos
Permiten definir el estado gentico de individuos en cuanto a ser portadores de enfermedades hereditarias. Pueden ser determinantes en la decisin de tener hijos.

PCR para identificar portadores de enfermedades

Portador Patrones diferenciales en tamao de segmentos de DNA permiten identificar individuos homocigotos (sanos o enfermos) y heterocigotos (portadores) para ciertas enfermedades. Qu tipo de mutacin pudo haber sufrido este gen que genera albinismo?
Poblacin indgena Navajo vive en el norte de Arizona, EEUU. Albinismo ocurre en 1/1500 personas comparado con blancos en los que ocurre 1/36000 individuos.

Portador

Albino

Albino

Sano

Genmica & Medicina personalizada

Descifrar el genoma de cada individuo puede predecir: Las enfermedades que puede desarrollar. El tipo de medicinas que servirn para tratar determinada enfermedad. Las dosis requeridas de frmacos para tratamientos. Se sometera a una secuenciacin de su genoma? Se sometera a test gnicos?

Farmacogenmica: Estudio de la respuesta gentica de un individuo a frmacos.

Pharmacogenomics Knowledge Database PharmGKB

DNA fingerprinting
El DNA de cada organismo es como su huella digital, nico! Por medio de DNA fingerprinting se puede descifrar la identidad de un individuo. El DNA es digerido con enzimas de http://www.sumanasinc.com/webco restriccin especficas que generan ntent/animations/content/paternityt esting.html fragmentos de DNA de diferentes tamaos. La amplificacin de esos fragmentos por PCR permite generar patrones de fragmentos de DNA exclusivos de cada persona. Mtodo usado en pruebas de paternidad o implicacin en crmenes. Test se usa para eximir posibles personas implicadas.

DNA barcoding
2003, Paul Hebert sugiri usar cdigos de barras de DNA para identificar especies. Un parte del gen CO1 (mitocondrial cytocrome C oxidase 1) se secuencia para generar el cdigo de barras. CO1 se encarga de la produccin de ATP est presente en todas las especies, pero difiere en su secuencia entre sp. iBOL (international Bar Code of Life) espera en 2015 ser la librera de referencia de DNA para 5 millones de especmenes de 500mil especies. De la mano de la librera de DNA est el desarrollo de colecciones de especmenes en museos, caracterizacin de hbitat.

DNA barcoding

http://www.sumanasinc.com/webco ntent/animations/content/paternityt esting.html

Current Statistics: 2,012,391 specimens 172,280 named species

Gentica de la evolucin
Arboles filogenticos describen la evolucin de organismos o genes. El gen del citocromo c ha sufrido muchas mutaciones generando diferencias evidentes en su secuencia entre organismos. Evidencia la similaridad entre especies relacionadas.

Gentica de poblaciones

El alelo IB de locus ABO es ms frecuente en poblaciones de Asia que en la Pennsula ibrica. Indica la migracin de los mongoles desde China cuando el imperio Romano cay.

Qu es Biotecnologa?

Cualquier aplicacin tecnolgica que utilice sistemas biolgicos, organismos vivos o sus derivados, con la intencin de hacer o modificar productos o procesos para un uso especfico
Convenio de Diversidad Biolgica (CBD) www.cbd.int

Qu se hace con la Biotecnologa?

Industria Alimentaria Farmacologa y Diagnstico Biotecnologa Ambiental

Agrobiotecnologa Ingeniera Gentica

Qu se hace con la Biotecnologa?

Industria Alimentaria

Qu se hace con la Biotecnologa?

Farmacologa y Diagnstico

Qu se hace con la Biotecnologa?

Biotecnologa Ambiental
Biorremediacin Biocombustibles

Biofertilizantes

Tratamiento de aguas

Qu se hace con la Biotecnologa?

Agrobiotecnologa

Qu se hace con la Biotecnologa?

Ingeniera Gentica

Qu es Biotecnologa Moderna?
Aplicacin de tcnicas in vitro de cidos nuclicos, incluidos el cido desoxirribonucleico (ADN) y ribonuclico (ARN) recombinante y la inyeccin directa de cido nuclico en clulas u organelos, o la fusin de clulas ms all de la familia taxonmica, que supera las barreras fisiolgicas naturales de la reproduccin o de la recombinacin y que no son tcnicas utilizadas en la reproduccin y seleccin tradicional.
Protocolo de Cartagena sobre la seguridad de la Biotecnologa (CBD) bch.cbd.int/protocol

Un Organismo Modificado Genticamente OMG qu es?

Un OMG es cualquier organismo vivo que posea una combinacin nueva de material gentico que se haya obtenido mediante la aplicacin de la biotecnologa moderna.

ROJO AZUL
Rosa azul, CSIRO-Australia

Utilidades de los OMG en agricultura

Resistencia a factores biticos Resistencia a factores abiticos Biofortificacin Farmacuticos Mejoramiento agronmico

Utilidades de los OMG en agricultura

Resistencia a factores biticos
Insectos

Maz convencional

Maz Bt

Protena cry de Bacillus thuringensis es txica para larvas comedoras de hojas y tallos.

Utilidades de los OMG en agricultura

Resistencia a factores biticos
Malezas

Soya resistente a herbicidas

EPSPS (5-enolpiruvil shikimato sintasa) es una enzima que cataliza la produccin de ciertos aminocidos. El herbicida Roundup se une a esta enzima inhibiendo su actividad. EPSPS modificado evita la unin de Roundup hacindose resistente a su accin herbicida.

Utilidades de los OMG en agricultura

Resistencia a factores biticos
Enfermedades

Papaya resistente al virus de la mancha anular

Protenas de capside viral generan respuesta inmune en la papaya.

Utilidades de los OMG en agricultura

Resistencia a factores abiticos
Sequa

Maz tolerante a sequa

Gen cspb de Bacillus subtilis cold-shock gene estabiliza el mRNA en condiciones de estrs, permitiendo la traduccin de todas las protenas de respuesta a estrs.

Utilidades de los OMG en agricultura

Biofortificacin

Golden Rice Arroz con mayor cantidad de ProVitamina A

Gen psy (phytoene synthase) y crtl de plantas y bacterias permiten formar -caroteno (precursor de Vitamina A) en el endospermo del arroz.

Utilidades de los OMG en agricultura

Biofortificacin

Tomates con alta cantidad de antioxidantes

Modificacin de la ruta de produccin de antocianinas para activar su acumulacin en fruto usando un gen de snapdragon.

Utilidades de los OMG en agricultura

Mejoramiento agronmico

Tomate FLVR SVR larga vida

RNA antisentido del gen de la poligalacturonasa, la cual activa la degradacin de la pectina en la pared celular del fruto.

Omicas

Biologa de sistemas