Universit PARIS-VI Pierre et Marie Curie Facult de Mdecine Piti-Salptrire

Bactriologie
a!le des "atires
a!le des "atires 9 C#apitre $ % Anato"ie &onctionnelle des !actries
3 9 1.1 La dcouverte du monde bactrien 9 1.2 Lanatomie des bactries 10 1.2.1 Lappareil nuclaire des bactries 11 1.2.2 LADN extra-chromosomique 12 1.2.3 Le c toplasme bactrien 12 1.2.! La membrane c toplasmique 13 1.2.5 La paroi bactrienne 16 1.2." #tructures inconstantes

19 C#apitre

'% (nti)ue !actrienne

19 2.1 $ariations %ntiques par mutation 19 2.1.1 &aract'res de la mutation bactrienne 22 2.1.2 La mutation ( lchelon molculaire 22 2.2 Les variations %ntiques par trans)ert de matriel 23 2.2.1 La trans)ormation 24 2.2.2 La con*u%aison 25 2.2.3 Les plasmides 26 2.2.! La transposition Les transposons 27 2.2.+ La transduction
-

%ntique

29 C#apitre *% Stap#+loco)ues 29 3.1 D)inition 29 3.2 ,istorique 29 3.3 ,abitat 29 3.! -ouvoir patho%'ne 29 3.!.1 &aract'res %nraux 30 3.!.2 .n)ections staph lococciques 31 3.+ /tude bactriolo%ique 31 3.+.1 0icroscope 31 3.+.2 &ulture 31 3.+.3 &aract'res biochimiques 32 3.+.! 1acteurs de virulence de ph siopatholo%ie 34 3." Dia%nostic bactriolo%ique 35 3.2 Les bases du traitement
2002 -2003 Bactriologie - Service de Bactriologie 33122

35 3.2.1 4raitement prventi) 35 3.2.2 4raitement curati)

37 C#apitre ,% -es streptoco)ues. 37 !.1 Les streptocoques 37 !.1.1 ,istorique 37 !.1.2 ,abitat 38 !.1.3 -ouvoir patho%'ne 39 !.1.! /tude bactriolo%ique 40 4.1.5 Dia%nostic bactriolo%ique

entroco)ues et pneu"oco)ues

41 !.1." 4raitement 42 !.2 Les entrocoques 42 !.3 Le pneumocoque 42 !.3.1 D)inition 42 !.3.2 ,abitat

42 !.3.3 -ouvoir patho%'ne naturel 43 !.3.! /tude bactriolo%ique 44 !.3.+ Dia%noctic bactriolo%ique 45 !.3." 4raitement 45 !.! 5iblio%raphie 47 C#apitre 5 % -es neisseria 47 +.1 Nes sria mnin%itidis 47 +.1.1 ,abitat 47 +.1.2 /pidmiolo%ie et pouvoir patho%'ne 48 +.1.3 /tude bactriolo%ique 49 +.1.! Dia%nostic bactriolo%ique 49 +.1.+ 4raitement 50 +.2 Neisseria %onorrhoeae 50 +.2.1 ,abitat 50 +.2.2 -ouvoir patho%'ne 51 +.2.3 /tude bactriolo%ique 52 +.2.! Dia%nostic bactriolo%ique 53 +.2.+ 4raitement 54 +.3 6)erences 55 C#apitre /% -es !acilles 55 ".1 &or nebactrium diphteriae 55 ".1.1 ,istorique 55 ".1.2 ,abitat 56 ".1.3 -ouvoir patho%'ne 56 ".1.! 5actriolo%ie

0 gra" positi& non sporules

57 ".1.+ Dia%nostic bactriolo%ique 57 ".1." 4raitement 58 ".2 Listria monoc to%'nes 58 ".2.1 ,abitat 59 ".2.2 1acteurs de virulence et ph siopatholo%ie 59 ".2.3 -ouvoir patho%'ne 60 ".2.! &aract'res bactriolo%iques et anti%niques 60 ".2.+ Dia%nostic bactriolo%ique 60 ".2." 4raitement
61 C#apitre 1% 2ntro!actries et autres !acilles 0 gra" ngati& 61 7.1 Les entrobactries 61 2.1.1 &aract'res %nraux et classi)ication des entrobactries 63 2.1.2 #almonella "" 2.1.3 #hi%ella "2 2.1.! 7ersinia "8 2.1.+ /scherichia coli 21 2.1." Autres entrobactries commensales 22 2.1.2 /ntrobactries saproph tes 22 2.2 Les autres bacilles ( %ram n%ati) aerobies non exi%eants 22 2.2.1 Les bacilles ( %ram n%ati) des %enres pseudomonas et acinetobacter 23 2.2.2 $ibrio cholerae 77 C#apitre 4% -es !acilles a gra" positi& sporules 77 9.1 5acilles aerobies sporules 77 9.1.1 5acillus anthracis 79 9.2 5acilles anarobies sporules 79 9.2.1 &aract'res %nraux des bactries du %enre clostridium 80 9.2.2 &lostridium botulinum 82 9.2.3 &lostridium ttani 84 9.2.! &lostridia de la %an%r'ne %a:euse 85 9.2.+ Les colites pseudomembraneuses provoques par les clostridia

non e3igeants

87 C#apitre 5% -es !acilles 87 8.1 ;enre %emophilus 87 8.1.1 &aract'res %nraux

0 gra" ngati& #"op#iles ou e3igeants

87 8.1.2 ,amophilus in)luen:ae 89 8.1.3 Autres haemophilus 90 8.2 ;enre bordetella 90 8.2.1 5ordetella pertussis 92 8.3 ;enre brucella

92 8.3.1 D)inition 92 8.3.2 ,abitat 92 8.3.3 -ouvoir patho%'ne naturel 92 8.3.! Dia%nostic 93 9.3.5 4raitement
95 C#apitre

$6% -a &lore "icro!ienne nor"ale de l7organis"e 97 C#apitre $$ % -es spiroc#etes

97 11.1 ;enre treponema 97 11.1.1 La maladie s philitique 99 11.1.2 5actriolo%ie 100 11.1.3 Dia%nostic biolo%ique 101 11.1.! 4raitement 102 11.2 5o))elia 102 11.3 Les leptospira

C#apitre $ Anato"ie &onctionnelle des !actries

$8$ -a dcouverte du "onde !actrien
Anton $AN L//<=/N,>/? @1"32-1223AB drapier hollandais et %rand amateur de loupes et instruments doptiqueB dcouvre et dcrit entre 1"2! et 1"92 le monde microbien ( les animalcules ). 0ais celui-ci nest vritablement reconnu qu( partir du milieu du C.Ce si'cle ( la suite des travaux de Louis -A#4/<6 et de ses l'ves. /n 19""B ,A/&?/L cre le terme de protistes pour dsi%nerB entre le monde animal et le monde v%talB les Dtres unicellulaires et les Dtres pluricellulaires sans tissus di))rencis. Les protistes sont classs en deux cat%ories E Les protistes suprieurs ou eucar otes qui poss'dent un no au entour dune membraneB des chromosomes, un appareil de mitose et une structure cellulaire complexe @mitochondries notammentA. E Les protistes in)rieurs ou procar+otes qui ont un chromosome unique sans membrane nuclaire et sans appareil de mitoseB et une structure cellulaire lmentaire @pas de mitochondriesA. Les bactries font partie des
protistes procaryotes.

/n 1929B #/D.LL>4 cre le terme de microbes parmi lesquels on distin%uera ensuite les bactries proprement dites et les virus. Le terme virusB qui au dbut dsi%nait tout a%ent in)ectieuxB est maintenant rserv ( la cat%orie bien particuli're de microbes qui ne poss'dent quun seul t pe dacide nuclique et qui sont incapables dassurer ( eux-seuls la s nth'se de leurs propres constituants. #eule lexpression rservoir de virus a %ard un sens %nral F elle si%ni)ie rservoir de %ermes @de microbesA sans pr*u%er de la nature exacte du %erme @du microbeA en question.

$8' -7anato"ie des !actries

Les bactries sont des Dtres unicellulaires qui poss'dent les lments essentiels ( la vie cellulaire.
Leur taille varie de 1 ( 1G microns @*amA. /lles ne sont donc visibles quau microscope optique @xl GA ou au microscope lectronique @xl G"A. /lles peuvent Dtre dsint%res par divers procds ph siques et chimiquesB ce qui permet dtudier les constituants bactriens ainsi librs. Huelques chi))res concernant une bactrie-t peB Escherichia cou -oids dune cellule F 1G2% /au F 2G I -oids sec dune celluleF 3 X 1G3% -roportion du poids sec F protines 55 %, lipides 1G %, lipopol saccharides @L-#A 3 %, peptido%l cane 3 %, ribosomes !G %, A6N 2G %, ADN 3 I.

$8'8$ -7appareil nuclaire des !actries

&omme tous les protistes procar otesB les bactries poss'dent un appareil nuclaire constitu dacide

desox ribonuclique @ADNA qui est le support de lin)ormation %ntique. LADN chromosomique est constitu dune double hlice dADN circulaire. &ette double hlice est pelotonneB surenroule dans le c toplasme %rJce ( laction des topoisomrases @au nombre de ! che: les bactriesA. DpliB le chromosome bactrien apr's de 1 mm de lon% @1GGG )ois la lon%ueur de la bactrieA et 3 ( 5 nanom'tres de lar%e. Les deux chaKnes de nuclotides se rpliquent selon le schma de =atson et &ricLB chaque chaKne assurant la rplication de la chaKne complmentaire selon un mode semi-conservati). Lanal se chimique de lappareil nuclaire indique quil est compos ( 9G I dADN @le chromosomeAB ( 1G I dacide ribonuclique ou A6N @rMle de structurationA et ( 1G I de protines. &es derni'res sont reprsentes en particulier par les ADN pol mrases qui copient les doubles brins dADNB les topoisomrasesB surtout les ADN % rasesB qui les droulent pour permettre laction des pol mrasesB et des A6N pol mrases qui assurent la s nth'se des divers A6N. Les constituants de lappareil nuclaire sont la cible daction de plusieurs antibiotiques F les quinolones inhibent les topoisomrases et les ri)am cines inhibent les A6N pol mrasesB tandis que les nitromida:ols entraKnent la )ra%mentation de lADN che: les anarobies stricts.

a!leau $ Ci!le d7action des principau3 anti!ioti)ues

Antibioti ues ! acti"it principalement bactricide Antibioti ues ! acti"it principalement bactriostati ue

&lasse &ible bactrienne &lasse &ible bactrienne daction daction 1. 5etalactamines paroi 1. -hnicols ribosome /x. pnicillines @peptidi%l caneA /x. chloramphnicol cphalosporines thiophnicol 2. Aminosides ribosome 2. & clines ribosome /x. streptom cine /x. ttrac cline %entamicine dox c cline 3. -ol m xines membrane 3. 0acrolides ribosome /x. colim cine c toplasmique et apparents 4. 6i)am cines A6N pol mrase /x. r throm cine /x. ri)ampicine pristinam cine +. Huinolones ADN % rase 4. #ul)amides s nth'se des acides /x. A.nalidixique et apparents nucliques cipro)loxacine /x. F cotrimoxa:ole +. Nitroimida:ols Acides nucliques /x. mtronida:ole

1.2.2 -7A9: e3tra-c#ro"oso"i)ue

A cMt du chromosomeB support de lhrditB la bactrie peut contenir des lments %ntiques @ADNA de petite taille #$,5 ! 5 I du chromosome bactrienAB extra-chromosomiques. &es lmentsB appels plasmides ne sont pas indispensables ( la vie de la bactrie dans les conditions habituelles de croissance. .ls se rpliquent indpendamment et en %nral plus rapidement que le chromosome bactrien. >n les dtecte lorsque les %'nes quils transportent con)'rent ( la bactrie de nouvelles proprits @c). chapitre % ;ntique bactrienne & pa%e 18A. Les plus connus de ces plasmides sont les suivants $8'8'8$ -e &acteur se3uel ou &acteur 1 Le )acteur sexuel ou )acteur 1 assure le trans)ert de )ra%ments de chromosome bactrien par con*u%aison @appariement de deux bactriesA.
,

1.2.2.2 -es plas"ides de rsistance au3 anti!ioti)ues ;ou &acteurs R<

.ls portent des %'nes qui con)'rent aux bactries la rsistance ( divers antibiotiques. Au contraire de la rsistance con)re par une mutation chromosomiqueB la rsistance con)re par un plasmide peut concerner des antibiotiques appartenant ( plusieurs )amilles si le plasmide porte plusieurs %'nes de rsistance. La rsistance code par les %'nes plasmidiques est souvent lie ( la production den: mes qui inactivent les antibiotiques. -ar exemple des

plasmides de rsistance tr's )rquents che: les staph locoques portent un %'ne qui code pour la production dune pnicillinase qui inactive la pnicilline ; et les pnicillines du %roupe A @ampicillineA ce qui rend la bactrie rsistante ( ces pnicillines @idem che: E.coli %onocoqueB...A. Les %'nes peuvent Dtre or%aniss dans le plasmide au sein de transposons @c). chapitre ;ntique bactrienne pa%e 18A.
,

$8'8'8* -es autres plas"ides

&ertains plasmides sont responsables de la virulence @ex. F production de toxinesAB de la rsistance aux antiseptiquesB du mtabolisme de certains composs @lactoseB l sineB etc...AB et de la d%radation de substancesB par exemple le tolu'neB loctane et lacide salic lique.

$8'8* -e c+toplas"e !actrien

La structure du c toplasme bactrien est beaucoup plus simple que celle du c toplasme des cellules eucar otes. Le c toplasme ne contient pas en e))et de mitochondries F les en: mes transporteurs dlectrons

sont localiss dans la membrane c toplasmique. /n revancheB il est particuli'rement riche en A6N solubles @A6N messa%er et A6N de trans)ertA et surtout en A6N particulaire ou ribosomal. Les ribosomesB au nombre de 1+GGG environ par bactrieB reprsentent !G I du poids sec de la bactrie et 8G I de lensemble de lA6N. Les ribosomes sont la cible daction de nombreux antibiotiquesB aminosidesB phnicolsB c clinesB macrolides @voir tableau 1 pa%e 11A. .ls sont constitus de protines ribosomales et dA6N @A6Nr1"#B A6Nr23# et A6Nr+#A. .ls sont classiquement diviss en 2 sous-units F la sous-unit 3G# contient de lA6Nr1"# et est la cible des aminosides et des c clines N la sous-unit 5$' est constitue dA6Nr23# et est la cible des macrolides et apparents. Lensemble des constituants c toplasmiques sont placs dans un %el colloOdalB qui contient 9G I deau et des substances or%aniques et minralesB ( une pression interne considrable @+ ( 2G atmosph'resA.

$8'8, -a "e"!rane c+toplas"i)ue

$8'8,8$ -a "e"!rane c+toplas"i)ue. ou "e"!rane interne
&ette membrane est la limitante externe du c toplasme. /lle est constitue dune double couche dunits de phospholipides @3+ IA et de protines qui lui sont associes @"+ IA. &ertaines de ces protines *ouent un rMle dans la s nth'se du peptido%l cane et sont appeles protines de liaison aux pnicillines @-L-A ou penicillinbindin%-proteins @-5-A car elles sont %alement la cible daction des bDta-lactaminesB )amille dantibiotiques ( laquelle appartient la pnicilline. La membrane c toplasmique des bactries se distin%ue de celle des cellules eucar otes par labsence de strols. /lle est caractrise par son lextrDme )luidit qui est lie au dplacement et ( la rotation des %roupements lipidiques.

$8'8,8' Fonctions principales de la "e"!rane c+toplas"i)ue

Les )onctions principales de la membrane c toplasmique sont les suivantes permabilit slective et transport des substances solubles ( lintrieur de la bactrie F la membrane est ( la )ois une barri're osmotique et un lieu de transport acti) %rJce ( des permases )onction respiratoire par transport dlectrons et phosphor lation ox dative dans les esp'ces bactriennes arobies @rMle quivalent ( celui des mitochondries des eucar otesA excrtion den: mes h drol tiquesB qui d%radent les pol m'res en sous-units su))isamment petites pour pouvoir traverser la membrane c toplasmique et Dtre imports dans la bactrie support den: mes et de transporteurs de molcules impliqus dans la bios nth'se de lADNB des pol m'res de la paroi et des lipides membranaires.

$8'8,8* Certaines su!stances anti!actriennes a&&ectent la "e"!rane c+toplas"i)ue

Les dter%ents qui contiennent des %roupements lipophiles et h drophiles dtruisent la membrane c toplasmique et tuent les bactries. &ertains antibiotiquesB comme les pol+"+3ines. a%issent sur la membrane c toplasmique comme de vritables dter%ents @voir tableau 1 pa%e 11A.

$8'8= -a paroi !actrienne

0al%r la )orte pression osmotique #5 ( 2G atmosph'resA qui r'%ne ( lintrieur du c toplasme bactrienB la bactrie nclate pas %rJce ( lexistence dune structure ri%ideB appele paroiB de nature pol mrique. Les pol m'res et leur mode de liaison varient selon les esp'ces bactriennes. 4oute)oisB une substance de baseB spcifi ue des bactries, est partout prsente F cest la murineB appele encore peptido%l cane.

1.2.5.1 Structure du peptidogl+cane

Le peptido%l cane est un pol m're complexe )orm de 3 lments di))rentsF 1. une pine dorsale )aite dune alternance de molcules de N-act l%lucosamine et dacide Nact lmuramiqueN 2. un ensemble de chaKnes latrales peptidiques identiquesB composes de ! acides amins et attaches ( lacide N-act lmuramiqueN 3. un ensemble de Pponts interpeptidiques identiques. Lpine dorsale est la mDme pour toutes les esp'ces bactriennes tandis que les chaKnes latrales de ttrapeptides et les ponts interpeptidiques varient dune esp'ce ( lautre. La plupart des chaKnes latrales comportent la L-alanine en position 1 @attache ( lacide N-act lmuramiqueAB le D-%lutamate en position 2B lacide diamino-pimliqueB la l sine ou un autre acide amin en position 3B et la D-alanine en position !.
La )i%ure 1 donne une reprsentation schmatique du peptido%l cane che: 'taphylococcus aureus. .l )aut noter que les ponts interpeptidiquesB qui assurent la )ermeture de ce vritable )iletQ quest le peptido%l caneB sont constitus che:

'taphylococcus aureus dune chaKne de 5 molcules de %l cine entre la D-alanine terminale et la L-l sine en position 3.

$8'8=8' 9i&&rences entre !actries 0 (ra" positi& et 0 (ra" ngati& C#e> les !actries 0 (ra" positi&.
il a de nombreuses couches de peptido%l cane qui reprsentent *usqu( 8G I des constituants de la paroi bactrienne. &elle-ci contient aussi un )eutra%e @1G ( +G I du poids sec de la paroiA dacides teichoOques @pol m'res du %l crol ou du ribitol phosphateA associs troitement au peptido%l cane et )aisant par)ois saillie ( la sur)ace de la bactrie. &ertainsB les acides lipoteichoOquesB sont placs transversalementB et sen)oncent *usqu( la membrane c toplasmique. /n %nral il n a pas ou peu de protines dans la paroi des bactries ( ;ram positi). -armi les exceptionsB notons la protine A de 'taphylococcus aureus @c) chapitre #taph locoques pa%e 28A.

C#e> les !actries 0 (ra" ngati&.

il n a quune seule ou au plus deux couches de peptido%l cane qui ne reprsente que 5 ( 2G I des constituants de la paroi bactrienne. 0ais 3 pol m'res situs en dehors du peptido%l cane viennent complter la paroiF des lipoprotinesB une Pmembrane externeQ qui contient du lipopol saccharide. Les lipoprotines sont le lien entre le peptido%l cane et la membrane externeQ F le composant protine est un pol m're de 1+ acides amins qui )orme une liaison peptidique avec le ttrapeptide des chaKnes latrales du peptido%l cane N le composant lipide est reli ( la Pmembrane externe . La Pmembrane externeQ est constitue dune double couche de phospholipides dans laquelle tout ou partie des phospholipides de la couche la plus externe sont remplacs par des molcules de lipopol saccharide. Au sein de cette membrane externe , qui est une mosaOque )luideB se trouvent associs au moins deux t pes de protines spci)iques F certaines sont dites protines de structure car elles consolident la membrane externe @exemple >0--AA N dautresB appeles porines permettent le passa%e des petites molcules h drophiles et en particulierB sur le plan mdicalB des antibiotiques @)3-lactaminesB ttrac clinesB quinolones...A. #ur le plan immunolo%iqueB le lipopol saccharide constitue lanti%'ne > des bactries ( ;ram n%ati). Le L-# est un lipide complexe auquel est attach un pol saccharide qui est responsable de la spci)icit anti%nique de lanti%'ne >. #ur le plan ph siopatholo%iqueB le L-#B extrDmement toxiqueB reprsente lendotoxine des bactries ( ;ram n%ati). -rotines de la membrane externe @>uter 0embrane -rotein = >0-A de structure N ex. F >0--A porinesB exF >0--&B >0--1 Lipoprotines @L-A qui permettent la cohsion du -; et des phospholipides @-LA -rotines de la membrane c toplasmique ou interne de structure @-#A en: mes membranaires dont celles qui sont impliques dans la s nth'se du peptido%l cane @-;A et cibles des betalactaminesB appeles protines liant la pnicilline @-L-A L-# F lipopol saccharide @ou anti%'ne >A qui remplace en tout ou partie les phospholipides de la couche externe de la membrane externe.

$8'8=8* R?le de la paroi

La paroi con)'re ( la bactrie sa morpholo%ie vritable. /lle constitue le squelette externe de la bactrie et reprsente La paroi contient la pression osmotique interne. #ans paroiB les bactries prennent une )orme sphrique appele

25 ! (5 I du poids total de la bactrie.

protoplaste sil sa%it dune bactrie ( ;ram positi)B ou sphroplaste sil sa%it dune bactrie ( ;ram n%ati). Les
bactries peuvent survivre sans paroi et mDme se multiplier @on les appelle alors )ormes LA ( condition dDtre places dans un milieu dont la pression osmotique est quilibre avec la pression osmotique qui r'%ne ( lintrieur de la bactrie. /lle *oue un rMle dterminant dans la coloration de ;ram. &he: les bactries ( ;ram positi)B la paroi bloque lextraction du violet de %entiane et de liodure par lalcool alors quelle ne bloque pas cette extraction che: les bactries ( ;ram n%ati). /lle *oue un rMle dterminant dans la spci)icit anti%nique des bactries. /lle est le support de laction de certains en: mes exo%'nes @l so: meA ou endo%'nes @autol sinesA et de certains antibiotiquesB notamment les bDtalactamines @pnicillinesA qui inhibent la s nth'se du peptido%l cane @voir tableau 1 pa%e 11A. Le lipopol saccharide @L-#A et le peptido%l cane sont capables dactiver le complment par la voie alterne ce qui lib'reB entre autreB les )ractions &3a et &+a @e))et chimiotactiqueA et &3b @e))et opsonisant par les rcepteurs des pha%oc tes pour le &3bA qui *ouent un rMle important dans la d)ense non spci)ique contre lin)ection.

$8'8/ Structures inconstantes

$8'8/8$ -a capsule
La capsule est un enduit excrDt par certaines bactries. /lle est habituellement de nature pol saccharidiqueB quoique dans le cas de )acillus anthracis @le bacille du charbonA elle consiste en un pol peptide de lacide D-%lutaniique. &he: les esp'ces bactriennes capsulesB des mutations peuvent a))ecter la production de capsule les bactries sauva%es

capsules donnent des colonies lisses @# pour smooth ) ou muqueusesB tandis que les bactries mutantes non capsules donnent des colonies ru%ueuses @6 pour rou%h ). Des variations transitoires peuvent %alement la))ecter puisque la production de capsule est souvent )onction de la prsence de )ortes concentrations de sucres ou de srum @variation phnot piqueA. La capsule *oue un rMle important dans le pouvoir patho%'ne de certaines esp'ces bactriennes #'treptococcus pneumoniae, *aemophilus influen+ae, ,iebsiella, E.coli ?iA par son rMle protecteur contre la pha%oc tose.

1.2.6.2Cils ou &lagelles
Les cilsB ou )la%ellesB sont des structures inconstantes che: les bactries. &e sont des appendices )ilamenteuxB composs enti'rement de protinesB de " ( 1+ *am de lon% sur 12 ( 3G nanom'tres dpaisseur. Les protines )la%ellaires sont appeles &lagellines8 Anti%niques @elles provoquent la )ormation danticorps que lon peut mettre en vidence dans certains srodia%nosticsB ex. )i'vre t phoOdeAB elles sont di))rentes dune esp'ce bactrienne ( une autre. Les )la%elles sont attachs dans le c toplasme bactrien par une structure complexe. .ls constituent les or%anes de locomotion pour les bactries qui en poss'dent. #elon la disposition des )la%ellesB on distin%ue les bactries monotriches @un seul )la%elle polaireAB lophotriches @une tou))e de )la%elles polairesA ou pritriches @)la%elles rpartis sur toute la sur)ace de la bactrieA. 1.2.6.3-es pili ou &i"!riae De nombreuses bactries ( ;ram n%ati) @exceptionnellement des bactries ( ;ram positi)A poss'dent des appendices de sur)ace plus courts et plus )ins que les )la%elles et que lon appelle pili @de pilus = poilAB ou )imbriae @)ran%eA. >n en distin%ue deux cat%oriesF

-es pili co""uns

Les pili communsB sont des structures protiques )ilamenteusesB de ' 0 3 *am de lon%B disposs r%uli'rement ( la sur)ace de la bactrie. .ls sont constitus par la pol mrisation dune mDme sous-unit pol peptidiqueB la pilineB assemble ( des pol peptides mineurs dont ladhsine. Ladhsine peut avoir des interactions avec un rcepteur cellulaire h drocarbon @%l colipides ou %l coprotinesA prsent ( la sur)ace dune cellule eucar ote. /n tant que support dune adhsineB les pili permettent la )ixation de certaines bactries sur les muqueusesB ce qui conditionne leur pouvoir patho%'ne @ex. )ixation de Esche richia cou sur la muqueuse vsicaleB du %onocoque sur la muqueuse de lur'treB du vibrion du cholra sur les entroc tes...A. Les structures %ntiques codant pour les complexes pili-adhsine sont des oprons en situation plasmidique ou chromosomique.

-es pili se3uels.

plus lon%s mais en nombre plus restreint @1 ( !A que les pilis communs sont cods par des plasmides @)acteur 1A. .ls *ouent un rMle essentiel dans lattachement des bactries entre elles au cours de la con*u%aison. &es pilis sexuels servent %alement de rcepteurs de bactriopha%es spci)iques. &he: certaines bactries ( ;ram positi)B des protines de sur)ace dpassent lar%ement de la paroi et *ouent un rMle dans ladhrence bactrienneB comme les )imbriaeB auxquels on pourrait les assimiler. .l sa%it de la protine A de 'taphylococcus aureus et de la protine 0 de 'treptococcus pyo-enes.

$8'8/8, -es spores

Les bactries appartenant ( certains %enresB notamment le %enre )acillus et le %enre .lostridium, sont capables de )ormer des endospores. Les bactries sporules subissent un c cle de di))rentiation en rponse aux conditions denvironnement F en labsence dalimentsB une spore se )orme ( lintrieur de chaque bactrie et est libre lorsque la bactrie sautol se. La spore est une cellule bactrienne au reposB hautement rsistante ( la dessicationB ( la chaleur et aux a%ents chimiques. 6eplace dans des conditions nutritionnelles )avorablesB la spore %erme et redonne une bactrie identique ( celle qui lui a donn naissance. La spore est donc une )orme de rsistance aux conditions d)avorables de vieB avec conservation de toutes les aptitudes %ntiquement dtermines.

1.2.6.5 -e gl+cocal+3
Le %l cocal x est un )eutra%e de )ibres pol saccharidiques @exopol m'reA prsent ( la sur)ace des bactries dans leur milieu naturel. &he: certaines esp'ces bactriennes des quantits importantes de %l cocal x sont s nthtises @cas de /seudomonas aeru-inosa ou de 'treptococcus mutans0 et en%luent les cellules bactriennes. Le %l cocal x est alors appel slime . La production de %l cocal x )avorise ladhsion de la bactrieB par exemple aux matriaux tran%ers @proth'se...A. &elui qui est produit par 'treptococcus mutans est responsable de la )ormation de la plaque dentaireB indirectement responsable des caries.

Gntique bactrienne

C#apitre ' @ (nti)ue !actrienne

LADN bactrien peut Dtre lob*et de variations qui se traduisent par lapparition de di))rences hrditaires dans les structures et3ou les )onctions permanentes des bactries. Les variations %ntiques ou %not piques @le %not pe est lensemble des dterminants %ntiques ports par une celluleA rsultent dune mutationB dune trans)ormationB dune con*u%aisonB de lacquisition dun plasmideB dune transductionB... en somme dun chan%ement de nature dun ou plusieurs %'nes. Les variations %ntiques doivent Dtre distin%ues des variations phntiques ou phnot piques @le phnot pe est lensemble des proprits observables dune celluleA. Les premi'res a))ectent le gno"e bactrien dans sa squence nuclotidique alors que les secondes a))ectent le co"porte"ent de la bactrie. Les variations phnot piques qui rsultent de ladaptation de lensemble dune population bactrienne a ant le mDme %not pe ( diverses conditions extrieures sont rversiblesB non transmissibles ( la descendance mais spci)iques @non alatoiresA. Leur mcanisme est en relation avec lactivit des %'nes qui peut Dtre r%ule par des s st'mes plus ou moins complexes F induction comme dans lopron lactoseN rpression comme dans lopron tr ptophane @Racob et 0onod 18"1...A.

'8$ Variations gnti)ues par "utation

La mutation est un chan%ementB spontan ou provoqu par un a%ent muta%'neB hrditaire @stableAB brusque @discontinuAB rare @1G-" ( 1>A et indpendant dans les caract'res dune bactrieB et qui est li ( une modi)ication du %nome bactrien @ADNA. .l n a pas de di))rence de nature entre la mutation dune cellule eucar ote et celle dune cellule procar ote.

'8$8$ Caractres de la "utation !actrienne

Spontanit ;#asard< ou induction8 -our rvler la prsence dun mutantB il est ncessaire dutiliser un mo en slecti) @par exemple milieu de culture avec un antibiotiqueB ou milieu minimum additionn dun seul acide aminA. De ce )ait on ne peut distin%uer si la mutation est spontane ou si elle est induite par la%ent slecti). Le caract're spontan de la mutation a t )ormellement tabli par lanal se statistique de la distribution des mutants dans des tubes de bouillon de culture ensemencs en parall'le avec une mDme suspension microbienne @test de )luctuation de Luria et DelbrucLB 18!3A et par le test des rpliques au tampon

de veloursB sans contact avec la%ent slecteur @Lederber% et Lederber%B 11520.

a. Le test de fluctuation de Luria et 2elbruc3 @)i%ure 1A concerne la rsistance d4E.coli ( un bactriopha%e @virus qui in)ecte les bactries et entraKne leur l seA. <ne culture *eune en milieu liquide est divise en deux parties %ales de 1G ml. &haque partie contient 1.GGG cellules bactriennes. La premi're partie est %arde telle quelle dans un )laconB tandis que la seconde est subdivise ( parties %ales @GB2 mlA en +G petits tubes. 4ous les tubes sont mis ( cultiver ( 32S&. Apr's cultureB le contenu des tubes est tal sur des %loses recouvertes de bactriopha%es F +G chantillons %aux sont prlevs du )lacon et tals sparmentN le contenu de chacun des +G petits tubes est aussi tal sparement. >n observe les )aits suivants F le nombre de colonies bactriennes rsistant aux bactriopha%es est ( peu pr's le mDmeB entre 3 et 2 colonies rsistantesB sur chacune des cinquante %loses ensemences ( partir du )lacon. /n evancheB parmi les %loses ensemences ( partir des +G petits tubesB certaines ne montrent pas de colonies rsistantesB dautres en montrent une centaine. Lexplication du phnom'ne est la suivante F si les bactriopha%es induisaient la mutation vers la rsistance aprs que les bactries aient t exposes aux bactriopha%esB toutes les %loses devraient donner le mDme nombre de colonies rsistant aux bactriopha%es. #i au contraireB les mutations se produisaient comme des v'nements survenant au hasard dans les cultures bactriennes avant quelles ne soient exposes aux bactriopha%esB quelques-uns des petits tubes pourraient ne pas contenir de mutantsB tandis que ceux dans lesquels les mutations seraient survenues tMt au cours de la priode de culture devraient en contenir beaucoup. DoncB sil avait mutationB le nombre de colonies rsistantes aux pha%es obtenues ( partir des cinquante petits tubes devrait prsenter un )ort de%r de fluctuation compar au nombre de colonies rsistantes provenant du )lacon. &est exactement ce que lon observe T .l sa%it donc dune mutation spontane et non dune P mutation diri%e par les bactriopha%es . b. La culture par rpli ue de Lederber- et Lederber- #11520. <n morceau de velours strile est tendu sur un c lindre de mtal ou de bois dont le diam'tre est l%'rement plus petit quune boKte de -tri. /n appu ant l%'rement le velours sur une %lose en boKte de -tri contenant des colonies bactriennesB une )raction de chaque colonie est trans)re sur le velours. /n appliquant ensuite la sur)ace du velours sur une autre %lose vier%eB on obtient dun seul coup un repiqua%e colonie par colonie de la premi're %loseB etB en rptant les Prpliques , on peut repiquer lensemble des colonies dune boKte de -etri sur de multiples boKtes. >n peut dmontrer par cette technique que les mutations surviennent indpendamment du )acteur de slection @)i%ure 2A. -our cela on tale un %rand nombre d4E.coli sur une %lose sans antibiotique. Lorsque la culture a pouss en donnant des colonies con)luentesB on )aitB ( partir de cette %loseB des rpliques sur dautres boKtes contenant un antibiotique. Des colonies de mutants rsistants ( lantibiotique apparaissent sur ces boKtes repiques dont quelques unes occupent une position identique sur chaque boKte. >n peut prsumer que ceux-ci sont ori%inaires de clones1 de cellules rsistantes qui se trouvaient sur la boKte dori%ine. <n morceau de la sur)ace de la culture est alors prlev ( lemplacement correspondant sur la boKte dori%ine et ensemenc dans un tube de bouillon. Lorsque la culture en bouillon sest produiteB un chantillon est tal sur une seconde boKte de %lose sans antibiotique etB ensuiteB lorsque cette culture a poussB on repique par la technique du tampon de velours de nouvelles boKtes contenant lantibiotique. >n constate quil a maintenant une plus %rande proportion 1. <n clone est une population bactrienne descendant dune seule bactrie de colonies rsistantes que la premi're )ois. >n constate aussi que des colonies de mutants rsistants occupent une position identique sur chaque boite rplique. .l su))it de prlever ( nouveau un )ra%ment de la sur)ace de culture ( lemplacement correspondant sur la boKte dori%ine et de porter ce )ra%ment en bouillon. #i on rp'te ce processus plusieurs )oisB on obtient des cultures de plus en plus riches en colonies rsistantes ( lantibiotique. 1inalementB en nensemenUant que 1GG cellules bactriennesB on obtient plusieurs colonies rsistantes. >n peutB sur la culture dori%ineB les prlever sparment et vri)ier quelles sont toutes composes de cellules bactriennes rsistantes ( lantibiotique s. Le )ait capital de cette exprience est queB sans aucun contact direct avec l7anti!ioti)ue. on a pu au%menter la proportion de mutantsB ( chaque c cle dtalementB ce qui prouve que la mutation ori%inelle con)rent la rsistance ( lantibiotique est apparue en labsence de lantibiotique qui ne *oue dans lexprience que le rMle da%ent slecteur.

9iscontinuit ;caractre !rus)ue<

La mutation ne se))ectue pas ( la suite dune lon%ue priode dadaptation pro%ressiveB avec des )ormes intermdiairesB mais habituellement en une seule tape @loi du tout ou rienA. Dans certains casB cependantB un comportement extrDme @par exemple rsistance de #aut niveau aux quinolones che: E.coli0 apparaKt ( la suite de mutations successives de plusieurs %'nes. >n oppose cette rsistance par tapes successives ( multiple step resistanceA ( celle qui se produit en une seule tape ( one step rsistanceA.

Sta!ilit
0Dme en labsence de la%ent slecteurB le caract're acquis par la mutation est transmis ( la descendance et se maintient dans les subcultures. La stabilit nexclut cependant pas la rversibilit de la mutation ( reverse mutation ). /x. F E.coli mutabile pour le caract're lactose.

Raret
La mutation est un phnom'ne rare qui na))ecte quune )aible )raction de lensemble des cellules bactriennes au sein dune lar%e population. La proportion des mutants que lon peut observer dans la population bactrienne dori%ine

dpend de trois param'tres indpendantsF 1. la probabilit quune cellule bactrienne mute dans une unit de temps donnB correspondant ( un certain nombre de %nrations. &ette probabilit sappelle le tau3 de "utationA 2. la distribution dans le temps des v'nements mutationnels durant la priode de culture @c). le test de )luctuation de Luria et DelbrucLAB des mutations tr's prcoces produisant de tr's lar%es clones de descendants du mutantA 3. le taux de croissance du mutant compar ( celui du t pe parental sauva%e ( )itness ). 5ien que raresB les mutants peuvent Dtre slectionns au sein dune population bactrienneB soit spontan"ent @slection relativeA parce quils poss'dent un avanta%e ph siolo%ique @exF vitesse de croissanceB taux de ltalitB patho%nnicit...AB soit arti&icielle"ent @slection absolueA parce quils sont par exemple rsistants ( un antibiotique qui rv'le la mutation @a%ent slecteurA.

Indpendance et spci&icit
La mutation na))ecte habituellement quun seul caract're en respectant les autres @ex. 5.tuberculosis sensible ( tous

les antibiotiques >0.tuberculosis rsistant ( la streptom cine et sensible ( tous les autres antibiotiquesA. Dans certains casB lorsque les mutations rsultent de la modi)ication dune squence de %'nes )onctionnant ensemble @un opronAB elles peuvent a))ecter plusieurs caract'res @mutation pliotropeA. La mutation dun caract're donn ne modi)ie pas la probabilit de mutation dun autre caract're. .l a indpendance des mutations. .l en rsulte que la probabilit de mutation simultane ( l%ard de deux caract'res est %ale au produit des probabilits individuelles. #i la probabilit de la rsistance de 5.tuberculosis ( la streptom cine par mutation est de 1>/ et celle de la rsistance ( lisonia:ide de 1G-"B la probabilit de rsistance double simultane ( la streptom cine et ( lisonia:ide est de 10-11 @base de la pol chimiothrapie de la tuberculoseB du #.DA...A.

2.1.2 -a "utation 0 l7c#elon "olculaire

4out chan%ement dans la squence nuclotique dun %'ne constitue une mutation. La squence nuclotidique peut chan%er de deux mani'resB soit par substitution dune paire de bases par une autre ( la suite dune erreur durant la rplicationB soit par cassures de lossature sucre-phosphate de lADN avec perteB addition ou inversion dADN entre les deux cassures. a. .han-ement de s uence conscutif ! la substitution d4une paire de base F il peut sa%ir dune transition @ex. F A4 est remplac par ;&AB ou dune inversion ou transversion @A4R4A. La plupart des mutations par substitution dune paire de bases sont rversibles @mutations rversesA. &ertaines sont silencieuses @inapparentesAB en particulier quand la substitution concerne le 3e nuclotide du codon car elles ne modi)ient pas la squence en acides amins de la protine correspondante @d%nrescence du code %ntique. Dautres sont au contraire ltalesB par exemple lorsque la mutation introduit un codon non-sens @protine tronqueA. b. .han-ement de s uence conscuti"e ! une cassure des liaisons sucre6phosphate F la mutation a))ecte en %nral une squence de bases plutMt quune simple paire. .l a dltion @perteA dune squence @codonA dADNB inversion dune squenceB ou encore insertion dune squence. Dans ces casB la mutation est souvent ltale ou non rversible.

'8' -es variations gnti)ues par trans&ert de "atriel gnti)ue

La bactrie peut Dtre lob*et de variations %ntiques autres que la mutation. &elles-ci peuvent rsulter du trans)ert de matriel %ntique dune bactrie ( une autre par des processus aussi di))rents que la trans)ormationB la transduction et la con*u%aison.

2.2.1 -a trans&or"ation
La trans)ormation est le trans)ert passi) dADN dune bactrie donatrice ( une bactrie rceptriceB dite en tat de comptence. Le trans)ertB qui est partiel et limit ( quelques esp'ces bactriennesB entraKne lacquisition par la bactrie rceptrice de nouveaux caract'res %ntiques stables et transmis sibles. 9couverte de la trans&or"ation8 /n 1829B 1redericL ;ri))ith dmontre que linoculation sous- cutane ( la souris dun mlan%e de pneumocoques capsuls @virulentsA tus par la chaleur et de pneumocoques acapsuls @non virulentsA vivantsB entraKne une septicmie mortelle ( pneumocoques capsuls vivants @)i%ure 3aA. .l a donc eu trans)ormation ou rversion des pneumocoques acapsuls @6A en pneumocoques capsuls @#A. La trans)ormation est plus )acile lorsque les pneumocoques acapsuls vivants et les pneumocoques capsuls tus sont du mDme srot pe. /n 18!!B Aver 0ac Leod et 0c&art dmontrent que le principe trans)ormant est lADN bactrien. .ls russissent ( reproduire in vitro la trans)ormation en prsence dADN )ortement pol mris. Lactivit trans)ormante est perdue en prsence de dsox ribonuclase.

Caractres de la trans&or"ation8 La trans)ormation naturelle ou ph siolo%ique exi%e l4tat de comptence qui

napparaKt qu( certains stades de la division cellulaire et seulement che: une )raction de la population bactrienne. La trans)ormation artificielle est prcde du traitement chimique ou en: matique de la paroi bactrienne avant sa mise en contact avec lADN. La trans)ormation naturelle peut sobserver che: un nombre limit desp'ces bactriennes ( ;ram positi) #'treptococcus et )acillus0 ou ( ;ram n%ati) #7eisseria, )ranhamella, Acinetobacter, *aemophilus0. /lle se produit selon les phases suivantes @)i%ure 3bAF apparition de ltat de comptenceB )ixation puis pntration et int%ration de lADN donneur dans le %nome de la bactrie rceptrice. &he: les bactries ( ;ram positi)B les di))rentes phases mettent en *eu un activateur spci)ique desp'ceB excrDt par la bactrie et qui se )ixe ( la sur)ace de la bactrie. .l a ensuite s nth'se dune protine )ixatrice de lADNB dune autol sine et une endonuclase. LADN )ix est ensuite partiellement h drol s puis converti en un )ra%ment monocatnaire. Les bactries trans)ormables sont capables de )ixer des ADN de multiples sources mais ne sont capables de )ormer des recombinaisons %ntiques que si la bactrie donatrice et la bactrie rceptrice sont %ntiquement tr's proches. &ette relative spci)icit est lie au )ait que lappariement qui se produit avant la recombinaison exi%e une troite homolo%ie des squences nuclotidiques endo%'nes et exo%'nes. &he: les bactries ( ;ram n%ati)B ltat de comptence est aussi en relation avec la s nth'se dun activateur de paroi qui est excrDt par la bactrie ( la phase exponentielle de croissance #*. influen+ae0 ou ( la phase stationnaire #Acinetobacter0. LADN donneur se )ixe sur la paroi au niveau de sites rcepteursB dans des conditions strictes de mtabolisme cellulaireB de p,B de temprature et dosmolarit. 5ien que la trans)ormation ne permette que le trans)ert dune petite )raction du %nome bactrien @V1 B<. soit de))icacit relative @la )rquence de trans)ert est de lordre de iG! ( 1G-"A et soit limite ( quelques esp'ces bactriennesB elle est dun %rand intrDt thorique et pratique. /lle a permis de comprendre le mcanisme de la s nth'se de la capsuleB le contrMle %ntique de la rsistance aux antibiotiquesB ltablissement de cartes %ntiquesB etc... /lle *oue un rMle important dans lvolution vers la rsistance du pneumocoque @)3-lactaminesA. ;rJce ( la transfection, qui est la possibilit din)ecter des bactries par des ADN ou des A6N virauxB on a pu dmontrer luniversalit du code %ntique en 18"1.

2.2.2 -a conCugaison
La con*u%aison est un trans)ert dADN entre une bactrie donatrice et une bactrie rceptriceB qui ncessite le contact et lappariement entre les bactriesB et repose sur la prsence dans la bactrie donatrice ou mJle dune )acteur de sexualit ou de )ertilit @)acteur 1A. &elui-ci permet la s nth'se de pili sexuels et donne la polarit au chromosome. Le trans)ert dADN chromosomique qui est ( sens uniqueB orientB pro%ressi) et quelque)ois totalB a beaucoup de similitudes avec le trans)ert dADN extrachromosomique @plasmidiqueA @)i%ure !A.

2.2.2.1 Mise en vidence de la conCugaison

La dcouverte de la trans)ormation che: le pneumocoque et la possibilit dobtenir des mutants auxotrophes @incapables de )aire la s nth'se dun mtabolite essentielA ont suscit des recherches sur la recombinaison %ntique che: les bactries. Lexprience princeps de Lederber% et 4atum @18!"A est ( lori%ine de la dcouverte de la con*u%aison. Dans un milieu de culture liquideB ces auteurs ont mlan% deux t pes de mutants auxotrophes d4E.coli dune part des mutants exi%eants seulement en thronine @4A et en leucine @LA etB dautre partB des mutants exi%eants seulement en mthionine @0A et biotine @=A. Apr's plusieurs heures de contact entre les mutants 4 L 0 5 et les mutants 4 L 0 =B Lederber% et 4atum ont isol des E.coli 4 L 0 5 @environ 1GG pour 1G9 E.coli0. La recombinaison stait produite avec une )aible )rquence @1G-"A et exi%eait en plus le contact entre les deux t pes de mutants auxotrophes.
,

2.2.2.2 Caractres de la conCugaison

Spci&icit
Le trans)ert dADN chromosomique par con*u%aison ne se produit quentre bactries dune mDme esp'ce #spcificit0, et surtout che: les bactries ( ;ram n%ati) telles que les entrobactries #E.coli, 'almonella... et /seudomonas aeru-inosa0. Le trans)ert dADN extra- chromosomique @plasmideA est en revanche plus rpandu parmi les esp'ces bactriennes et est moins spci)ique desp'ce.

9i&&rentiation se3uelle
Le trans)ertB qui est ( sens unique @bactrie donatrice-bactrie rceptriceA repose sur la prsence che: la bactrie donatrice du )acteur sexuel ou )acteur de )ertilit @1A ( laquelle il con)'re la polarit ou le caract're mJle @1*. Le )acteur sexuel est le premier plasmide connu. Lin)ormation %ntique quil porte code pour la bios nth'se de pili sexuelsB pour son insertion possible dans le chromosome bactrien et pour la mobilisation @le trans)ertA de ce dernier vers des bactries rceptrices @-A.

Contact ou apparie"ent
Le trans)ert chromosomique nest possible quapr's appariement par couple des bactries donatrice et rceptrice. .l )ait dabord intervenir les pili sexuels @2 ( 3 par bactrie 1* qui reconnaissent par leurs extrDmits les :ones de contact ( la sur)ace des bactries - et s )ixent puis se rtractent en rapprochant les deux t pes de bactries. .ls permettent ainsi leur

contact et la )ormation dun pont c toplasmique de 1GG ( 3GG m*a par lequel va soprer le trans)ert chromosomique @)i%ure !A.

rans&ert de l7A9:
Le pont c toplasniique )ormB le trans)ert %ntique peut commencer. .l ne porte dabord que sur un brin dADNB ce qui permet de restaurer lint%rit du %nMme de la bactrie donatrice par un processus de rplication as mtrique. &e processus de rplication as mtrique a lieu tout pr's du pont c toplasmique et met en *eu un site rplicateur spci)ique. Le trans)ert du brin dADN est ( sens uniqueB orientB pro%ressi)B quelque)ois total. .l dure alors une centaine de minutes ( 32S&. #on interruption arti)icielle par a%itation mcanique permet de dterminer la squence des %'nes trans)rs et dtablir la carte chromosomique.

Caractres c#ro"oso"i)ues trans&rs

4ous les caract'res cods par le chromosome @cest-(-dire tous les %'nesA peuvent Dtre trans)rs. /n e))etBle )acteur 1 peut Dtre int%r dans le chromosome bactrien ( certains sites. Dans cette position il permet le trans)ert de %'nes chromosomiques proches de ces sites dune bactrie ( une autre mais ne trans)'re que rarement le )acteur lui-mDme. Le )acteur 1 peut rester autonome dans le c toplasme. Dans cette position il ne transmet ( la bactrie rceptrice que le )acteur 1 mais pas de %'ne chromosomique. Lors du passa%e de ltat int%r ( ltat autonomeB le )acteur 1 peut emporter avec lui des %'nes bactriens. Le rsultat en est un plasmide 1 qui contient ces %'nes et capable de les trans)rer ( une bactrie rceptrice de nouveaux %'nes F cest la 1-duction ou sex-duction. #i les %'nes trans)rs par le )acteur 1 sint'%rent dans le chromosome de la bactrie rceptriceB on dit quil a eu recombinaison l%itime @chromosomiqueA. #ils ne sint'%rent pasB ils deviennent de vritables %'nes mobiles dune bactrie ( une autre.

Plas"ides conC ugati&s

&ertains plasmides sont capables dassurer tous seuls leur trans)ert par con*u%aison. >n les appelle plasmides con*u%ati)s @c). section 2.2.3 pa%e 250.

'8'8'8* Conclusions
Le trans)ert de %'nes par con*u%aison est un )acteur ma*eur dvolution du patrimoine %ntique bactrienB qui *oue un rMle essentiel en bactriolo%ie mdicale @rsistance aux antibiotiques...A.

2.2.3 -es plas"ides

Les plasmides sont des molcules dADN bicatnaireB circulaires et c toplasmiquesB de petite taille #5 ( !GGG )ois plus petit que le chromosomeAB se replicant dune mani're autonome et non indispensables au mtabolisme normal de cellule-hMte. Leur transmission dune cellule bactrienne ( une autre peut se))ectuer par con*u%aison @4raWA ou transduction.

'8'8*8$ Mise en vidence

Le terme de plasmide a t cr en 18+2 par Lederber% pour dsi%ner tout lment %ntique c toplasmiqueB comme le )acteur 1. Les plasmides de rsistance aux antibiotiques ont t dcouverts en 1158 au Rapon ( loccasion dune pidmie de d senterie bacillaire #'hi-ella dysenteriae0 ( bacilles rsistants.

2.2.3.2 Proprits !iologi)ues portes par les plas"ides

Les %'nes ports par les plasmides peuvent coder pour la s nth'se de protines qui con)'rent des proprits biolo%iques diverses F rsistance aux antibiotiques @bDta-lactaminesB aminosidesB phnicolsB c clinesB macrolidesA che: les bactries ( ;ram positi) ou n%ati)N rsistance aux antiseptiques mercurielsB aux mtaux lourds @antimoineB ar%entB bismuth...AN rsistance aux bactriopha%es. Les plasniides permettent ainsi aux bactries de sadapter ( un environnement hostile. La virulence des bactries peut aussi Dtre ( mdiation plasmique F pouvoir patho%'ne des colibacilles entropatho%'nes @diarrhes des vo a%eursAB pouvoir patho%'ne des staph locoques dans limpti%o @ex)oliatineA. Les plasmides peuvent %alement coder pour la s nth'se de bactriocines qui inhibent la croissance dautres bactries @ex. F colicines ltales pour les entrobactriesA. .ls peuvent aussi porter les %'nes qui codent pour le mtabolisme du lactose ou de la l sine che: les /roteus, la production de ,2# che: E.coli la d%radation du tolu'ne ou de loctane che: les -seudomonas... Les plasmides poss'dent des %'nes qui assurent leur rplication autonome. &ertains plasmides poss'dent aussi des %'nes qui assurent leur trans)ert par con*u%aison @plasmides con*u%ati)sA. Des classi)ications de plasmides par classes dincompatibilit @mcA ont t tablies. Deux plasmides sexcluant mutuellementB cest-(-dire ne pouvant coexister dans la mDme bactrieB appartiennent au mDme %roupe dincompatibilit.
,

'8'8*8* Conclusion
Les plasmides con)'rent aux bactries qui les hber%ent de nombreux caract'res %ntiques par un mcanisme daddition et non par un mcanisme de substitution. .ls reprsentent un lment essentiel dadaptation bactrienne. .ls sont responsables dpidmies de %'nes @notamment de rsistance aux antibiotiquesAB qui ont )ait dcouvrir les transposonsB appels encore %'nes sauteurs ou mobiles.

2.2.4 -a transposition -es transposons

-

La transposition est lint%ration directe dune squence de %'nes @de taille limiteA au sein dun %nome

@chromosomique ou plasmidiqueAB en labsence dhomolo%ie de squence nuclotique @recombinaison ill%itimeA. Les %'nes qui sadditionnent de cette mani're sont dits transposables et sor%anisent en structures appeles transposons @4nA qui portent les dterminants de la transposition @excisionB int%rationB transpositionA et des %'nes qui codent pour dautres )onctionsB par exemple la rsistance aux antibiotiques.

'8'8,8$ Mise en vidence de la transposition

La constatationB en 1821B par N. DattaB du passa%e @sautA dun %'ne de rsistance aux bDta-lactamines dun plasmide ( un autre plasmide appartenant ( des classes dincompatiblit di))rentes au sein dune mDme bactrie a )ait dcouvrir lexistence de %'nes sauteurs ou mobiles. Lacquisition de ces %'nes se traduit par une au%mentation de taille du plasmide rcepteur et lacquisition de pro

2.2.!.2 Proprits des transposons Les dterminants %ntiques transposables peuvent Dtre la rsistance ( des antibiotiques tr's divers @bDtalactaminesB aminosidesB phnicolsB c clinesB r throm cineB sul)amides et trimthoprimeA. Dautres marqueurs peuvent Dtre ports par des transposonsF la rsistance aux sels de mtaux lourdsB certains caract'res mtaboliquesB etc... La ma*orit des transposons identi)is proviennent des plasmides de bacilles ( ;ram n%ati)B mais certains proviennent de cocci ( ;ram positi) comme le transposon de rsistance ( lr throm cine che: 'taphylococcus
aureus.

'8'8,8* Structure des transposons

Le transposon @)i%ure 50 est constitu dun )ra%ment dADN limit de part et dautre par des squences rptitives inverses @.6A appartenant ( des squences dinsertion @.#A. Les squences dinsertion portent les %'nes ncessaires ( la transposition @transposaseB lments r%ulateurs de la transpositionA et le )ra%ment central porte les marqueurs spci)iques @exemple F %'nes de rsistance aux antibiotiquesA.

'8'8,8, Conclusion
Le transposition est un mcanisme dadaptation %ntique particuli'rement e))icace des bactries ( leur environnement.

2.2.5 -a transduction
La transduction est le tran)ert dADN bactrien par lintermdiaire de bactriopha%es @ou pha%esA. &eux-ci sont des virus de bactriesB qui existent sous la )orme virulente ou tempre. Les pha%es virulents se multiplient dans la bactrie @ou mieux sont rpliqus par la bactrieA et la l sent. Les pha%es temprs sint'%rent dans le chromosome bactrien sans induire la rplication et sont rpliqus en mDme temps que lui. Le bactriopha%e est alors appel propha%e et la bactrie qui en est porteuseB une bactrie l so%'ne. Dans une population de bactries l so%'nesB un propha%e se lib're de temps ( autre du chromosome bactrienB devient virulentB se multiplieB provoque la l se de la bactrie et peut in)ecter de nouvelles bactries. #iB au cours de sa librationB le propha%e emporte avec lui plusieurs %'nes bactriensB il peut avoir trans)ert par le bactriopha%e de %'nes bactriens dune bactrie @l so%'neA ( une autre @l so%'neA. &est la transduction.

'8'8=8$ Caractres de la transduction Incidence

La transduction est lie ( lexistence de bactries l so%'nesB ( ;ram positi) @staph locoqueB streptocoqueB
)acillus0 ou ( ;ram n%ati) @entrobactriesB /seudomonas0. +pe de transduction $8 Lorsque les %'nes trans)rs @pas plus de 1 ( ' I du %nome de la bactrie l so%'neA sint'%rent dans le chromosome de la bactrie rceptrice et que celle-ci les transmet ( sa descendanceB on dit que la transduction est compl9te ou -nralise #fi-ure 80. 2. Lorsque les %'nes trans)rs ne sont pas int%rs dans le chromosomeB ce qui est )rquentB on dit que la transduction est aborti"e. Dans ce casB les %'nes passent de la cellule m're ( une seule cellule )illeB etc... .l n a pas %nralisation du caract're trans)r ( lensemble des descendants. 3. La con"ersion lyso -ni ue. Dans certains casB le %nome du bactriopha%e apporte par lui-mDme un nouveau caract're tr's important pour la bactrie rceptriceB par exempleB la scrtion de la toxine diphtriqueB la scrtion de la toxine r tho%'ne du streptocoque A @scarlatineA ou la prsence de certains )acteurs anti%niques. >n dit alors quil a eu conversion l so%nique. La conversion et la transduction sont des phnom'nes qui )ont tous deux intervenir un bactriopha%e. 0aisB dans le premier casB cest le %nome du bactriopha%e qui est responsable du nouveau caract're acquis par la bactrie N dans le second casB le bactriopha%e a seulement un rMle de vecteur et le %nome trans)r provient dune autre bactrie.

2.2.5.2 Conclusions
Le trans)ert dADN bactrien par transduction a t tr's utilis par les %nticiens en raison de sa )aible )rquence @1G"AB de son caract're partiel @1-2 I du %nome bactrienA et de sa relative non- spci)icit. >n peut concevoir quelle a

*ouB plus que la tras)ormation mais moins que la con*u%aisonB un rMle important dans lvolution bactrienne.

C#apitre * @ Stap#+loco)ues
*8$ 9&inition
Les bactries du %enre 'taphylococcus sont des coques @cocciA ( ;ram positi)B %roups en amas a ant la )orme de %rappes de raisinB immobilesB non sporulsB catalase positive et ox dase n%ative. -armi les 27 esp'ces du %enre actuellement rpertoriesB les principales sont 'taphyloccus aureus, '.epidermidis et '.saprophyticus. Lesp'ce '.aureus sera prise comme t pe de description.

*8' Distori)ue
>bservs par -asteur en 1928 dans un pus de )uroncleB les staph locoques doivent leur nom ( >;#4>N @1991A qui les a mis en vidence dans des abc's ai%us et chroniques.

*8* Da!itat
'.aureus est un commensal de la peau et des muqueuses de lhomme et des animaux @rhino-phar nxB

intestinA. >n le trouve sur la muqueuse nasale dun tiers environ des su*ets normaux. /limin dans le milieu extrieurB cette bactrie peut survivre lon%temps dans lenvironnement.

*8, Pouvoir pat#ogne

*8,8$ Caractres gnrau3

;erme p o%'ne par excellenceB '.aureus est le microbe de la suppuration.

&ertaines souches a%issent aussi par libration dune ou de plusieurs toxines @intoxication alimentaireB s ndrome de choc toxiqueB impeti%oA. La )rquence et la %ravit des in)ections ( staph locoques sont lies ( trois principaux )acteurs 1. le caract're ubiquitaire du %ermeB 2. labaissement des d)enses locales et %nrales des malades soumis ( des soins intensi)sB des interventions chirur%icales %ravesB etc.B 3. et la )rquente rsistance aux antibiotiques du staph locoqueB notamment du staph locoque hospitalier.

*8,8' In&ections stap#+lococci)ues

E 1ormes cutanes F atteinte plus ou moins sv're des )ollicules pilo-sbacs @)olliculiteB )uroncleB anthraxAB atteinte prion%uale @on xisB perion xisB atteinte du tissu sous-cutan @panarisB phle%monsA. &ertaines )ormes super)icielles @impeti%oA peuvent se compliquer de lsions bulleuses %raves lorsque la souche de staph locoque est productrice dex)oliatine.

E 1ormes muqueusesF otitesB sinusitesB mastoOditesB con*onctivites. E 1ormes %nralisesF 1. #epticmie succdant ( un )o er initial cutano-muqueux F di))usion par atteinte des veines @squence F phlbiteB caillotB embol septique en rapport respectivement avec action de la coa%ulaseB de la )ibrinol sine et de lh aluronidaseA. >n lobserve principalement che: les su*ets a ant des d)enses immunitaires a))aibliesB traumatissB su*ets soumis ( une intervention chirur%icale %raveB su*ets en unit de soins intensi)sB diabtiquesB etc...B su*ets J%sB nourrissons. Les septicmies ( staph locoquesB qui sont de pronostic redoutable @2G ( 3G I de mortalitAB se compliquent souvent de localisations viscralesB mDme lorsquelles sont peu s mptomatiques F pleuro-pulmonaires @abc's bulleuxAB ostoarticulaires @ostom litesAB uro-%nitales @phle%mon prinphrtiqueAB crbrales @abc's du cerveauAB cardiaques @endocardite ai%u'A. 2. 1ormes intestinalesF soit intoxication alimentaire par absorption de toxine pr)orme dans des aliments contamins par un staph locoque producteur dentrotoxinesB soit entrocolite ai%u' pseudo-membraneuse ( staph locoqueB conscutive ( une antibiothrapie pol valente massive et prolon%e a ant slectionn une souche entrotoxique. 3. # ndrome de choc toxique dcrit pour la premi're )ois en 1829 @4>DDA. .l associe une h potension artrielle importante avec tat de chocB de la )i'vre @X 38 S&AB une r throdermie di))useB une desquamation des paumes et des plantes une ( deux semaines apr's le dbut de la maladie et une atteinte pluriviscrale @di%estiveB musculaireB muqueuseB rnaleB hpatiqueB neurolo%iqueB hmatolo%iqueA. 1ait importantB les hmocultures sont n%atives tandis que les prl'vements locaux permettent de cultiver '.aureus. La ma*orit des cas publis sont associs ( lusa%e de tampons va%inaux priodiques particuliersB retirs mamintenant du march. Les si%nes cliniques sont lis ( la production dune exotoxine protique @4oxic #hocL # ndrome 4oxin 1 ou 4##4-1A. Dautres toxines @entrotoxine 5 ou &A seraient impliques dans le s ndrome de choc toxique. Des s ndromes similaires peuvent sobserver au cours din)ections par dautres bactries @ex. 'treptococcus A0.

3.5 2tude !actriologi)ue

*8=8$ Microscope
&occi ( ;ram positi)B isols ou %roups en diplocoques ou en amas a ant la )orme de %rappes de raisinB de GB9 ( 1 Ca de diam'tre @)i%ure 1A. La %rande ma*orit des souches sont capsulesB mais les souches peuvent perdre leur capsule par culture.

*8=8' Culture
&omme tous les %ermes tr's rpandus dans la natureB '.aureus cultive )acilement sur les milieux usuelsB ( des conditions de p, et de temprature variables. .l est mDme capable de pousser dans des conditions hostilesB par exemple en prsence de : % de .17a. &e caract're est mis ( pro)it dans le milieu de culture slecti) h persal de &,A-0AN pour isoler le staph locoque dun prl'vement pol microbien. 2n !ouillon '.aureus donne un trouble uni)orme en quelques heures Sur glose ordinaire les colonies sont lissesB rondesB bombesB brillantesB opaquesB de 1 mm de diam'tre. /lles se pi%mentent habituellement en *aune dor @aureusAB par)ois en *aune citronB et par)ois sont non pi%mentes 2n glose pro&onde '.aureus pousse dans la :one darobiose et dans la :one danarobiose. &est donc une bactrie arobieanarobie )acultativeB capable de se multiplier ( la sur)ace de la peauB en arobiose et dans les tissus mal ox %nsB plaie pro)onde par exemple.

*8=8* Caractres !ioc#i"i)ues

'.aureus a un mtabolisme arobie prdominant et anarobie )acultati). .l est catalase positi"e ! la di))rence des bactries du %enre 'treptococcus qui nont pas de mtabolisme arobie. .l est toute)ois capable de fermenter le

%lucose @mtabolisme anarobieA ( la di))rence des microcoques. .l est habituellement capable de )ermenter le mannitol. &e caract're est souventB mais pas obli%atoirementB associ ( la patho%nicit. .l est utilis dans le milieu de &,A-0AN. La )ermentation se traduit par le vira%e au *aune du milieu de culture.

3.5.4 Facteurs de virulence de p#+siopat#ologie

*8=8,8$ -es co"posants de la paroi
Les composants de la paroi comme le peptido%l caneB les acides teichoOques et lipoteichoOques poss'dent des e))ets biolo%iques dmontrs in "itro, notamment la scrtion de c toLines par les cellules l mphomonoc taires. Alors que le peptido%l cane est peu immuno%'neB les acides teichoOques @pol m'res linaires du ribitol phosphateA donnent naissance ( des anticorps que lon trouve dans le srum de malades atteints din)ection rcente. &es acides teichoOques sont les rcepteurs de bactriopha%es @l sot pie des staph locoquesA.

Des pol saccharides capsulaires sont trouvs che: 8G I des souches. >n:e t pes capsulaires ont t dcrits et les t pes 5 et 9 sont les plus )rquents. &ette capsule permet une meilleure rsistance des souches ( lopsonisation et ( la pha%oc tose. &ertaines souches produisent un exopol saccharide @%l cocalixA qui entraKne la )ormation dun bio)ilm en%luant les bactries et leur permettant dadhrer aux sur)aces extrieures. .ertaines protines ou -lycoprotines sont responsables de la spcificit de type. ;l existe 14 srolypes mis en "idence par raction d4a--lutination au moyen d <immunserums.

*8=8,8' Facteurs d7invasion et d7ad#sion

'.aureus colonise la peau et les muqueuses en adhrant aux cellules et aux composants de la matrice extracellulaire. '.aureus se )ixe aux cellules par lintermdiaire de protines de sur)aceB les adhsinesB qui sont ancres dans le peptido%l cane. &inq protines ont t caractrisesF La protine AB labore uniquement par les souches dori%ine humaineB se lie au )ra%ment des immuno%lobulines. /lle intervient dans lopsonisation et la pha%oc toseN La protine de liaison au colla%'ne permet ladhsion de #. aureus au cartila%eN La protine de liaison ( la )ibronectine permet ladnsion de '.aureus aux caillots plasmatiques mais aussi aux biomatriaiux @cathtersB proth'sesAN La protine de liaison au )ibrino%'ne @dumpin% )actorA qui provoque la%r%ation de bactries en prsence de plasma permettant de trans)ormer directement le )ibrino%'ne en )ibrine. La protine de liaison ( llastine. .l existe des rcepteurs pour dautres protines plasmatiques @plasmino%'nesA ou tissulaires @vitronectineB laminineB sialoprotines de losA.

*8=8,8* Su!stances la!ores par S.aureus

'. aureus labore des protines di))usibles doues soit dactivit toxiqueB soit dactivit seulement en: matique.

-es to3ines
&inq principales toxines sont dcrites che: '.aureus Les hmolysines ont une action c totoxique sur de nombreuses cellules eucar otesB notamment les %lobules rou%es et les plaquettes. Lhmol sine , secrte par la quasi totalit des souches de '.aureus, est mise en vidence avec des hmaties de mouton de boeu) ou de lapin. La permabilisation membranaire entraKne une )uite osmotique du contenu cellulaire aboutissant ( la mort des cellules. La c tol se de plaquettes et de monoc tes lib're des c toLines et dautres mdiateurs de la raction in)lammatoire expliquant le choc septique des in)ections sv'res ( '.aureus. La destruction des cellules endothliales )avorise la dissmination des bactries et les mtastases in)ectieuses. La leucocidine est )orme de 2 compossB cods par des %'nes distinctsB a%issant en s ner%ie N elle a%it sur les pol nuclaires et les macropha%es che: lesquels elle provoque la perte de mobilitB la d%ranulationB la destruction nuclaire et la l se cellulaire. &ette protine a rMle important dans la )ormation du pus. L4exfoliatine est une protine thermostable responsable des lsions dr throdermie bulleuse que lon observe par)ois au cours des septicmies ( staph locoques et au cours de limpeti%o. /n se )ixant ( certaines protines intracellulaires cutanes @pro)ila%rine et )ila%rineA elle provoque une pidermol se F dcollement intra-pidermique entre le stratum %ranulosum et le stratum spinosum. .l a rupture entre les cellules ad*acentes suivie de celle des ponts interc toplasmiques @desmosomesA ce qui entraKne des lsions bulleuses. 9G I des su*ets adultes ont des anticorps protecteurs. Les entrotoxines, dont il existe 2 srot pes di))rents @AB 5B &lB &2B &3B DB /A sont des protines thermostables responsables dintoxications alimentaires @diarrheB vomissementsB douleurs abdominalesB rarement un collapsus cardiaqueB qui apparaissent 1 ( " heures apr's lin%estionA. 2e ($ ! 8$ % des souches de '.aureus produisent une entrotoxine. .l sa%it dune protine thermostableB insensible aux en: mes protol tiques du suc di%esti). Lentrotoxine A est de loin la plus )rquente. La toxine responsable du choc toxi ue staphylococci ue @4##4-1A F cette protine anti%nique entraKne la )ormation danticorps protecteurs prsents che: 9+ I des su*ets adultes. &ette toxineB comme les entrotoxinesB a un e))et p ro%'ne et est un superanti%'ne qui entraKne lactivation simultane de plusieurs sous-populations l mphoc tairesB ce qui entraKne la libratioin de plusieurs mdiateurs @interleuLineB inter)ron %ammaB 4N1 alpha et bDtaA responsables de la s mptomatolo%ie du choc staph lococcique.

-es en>+"es non to3i)ues -a coagulase-li!re est une exo-en: me coa%ulant le plasma dhomme ou de lapin. &est une protine thermostableB

tou=ours produite par les souches de '.aureus @et non produite par '.epidermidis et '.saprophyticus0. /lle active la prothrombine en thrombine. La thrombine ainsi active a%it sur le )ibrino%'ne quelle tran)orme en )ibrine.. &est un )acteur primordial dans le pouvoir patho%'ne en coa%ulant le plasma autour des coques et en les prot%eant de la pha%oc tose N elle est ( lori%ine des thrombophlbite s suppures. -a &i!rinol+sine est caractristique des souches patho%'nes humaines. /n activant le plasmino%'ne en plasmineB elle provoque la dislocation des caillots endoveineux qui lib're des micro-embols septiquesB )acteurs de septicmie et de

localisations septiques secondaires. -es dso3+ri!onuclases @ou DNAsesA sont des )acteurs de destruction des no aux cellulaires. -a DNAse thermostable est spci)ique de '.aureus. -a #+aluronidase est une en: me thermolabile h drol sant lacide h aluroniqueB substance )ondamentale du tissu con*oncti)F elle )avorise ainsi la di))usion des staph locoques dans le tissu con*oncti). -a lipase% 9G I des souches produisent cette en: me qui semble constituer un )acteur de virulence dans les abc's oYB en modi)iant les lipides bactriensB elles )avorisent la survie des staph locoques.

*8/ 9iagnostic !actriologi)ue

Le dia%nostic bactriolo%ique de lin)ection staph lococcique est uniquement direct @mise en vidence de la bactrieA. .l n a pas de dia%nostic indirect par recherche des anticorps circulants. Le dia%nostic repose sur les principales tapes suivantes E Le prl'vementF aseptique @pour Dtre certain que le staph locoque que lon va isoler nest pas un simple commensal de la peau ou des muqueusesA et avant le dbut du traitement antibiotique. E Lexamen microscopique dorientation ( la recherche de cocci r%uliersB ( ;ram positi)B %roups en amas. E La culture sur %lose ordinaire dans la ma*orit des cas ou sur milieu de culture slecti)B t pe milieu de &,A-0AN @qui contient 2 I de &1NaB du mannitol et un indicateur de p,A si le prl'vement est )ortement contamin par dautres bactries. Lidenti)ication de la bactrie repose sur la mise en vidence des caract'res suivants catalase @di))rence avec le streptocoqueAB fermentation du -lucose en anarobiose @di))rence avec le microcoqueAB coa-ulase @di))rence avec #. epidermidis et '. saprophyticus0, 27ase. thermostable @qui si%ne lesp'ce '.aureus0. Le dia%nostic sera tou=ours complt par la mesure de la sensibilit aux antibiotiques @antibio%rammeA tant donn la )rquence de la rsistance de '.aureus aux bDta-lactamines @ex. F pnicillineAB aux aminosides @ex. F %entamicineA et ( certains macrolides @ex. F r throm cineAB notamment che: les souches hospitalii'resA.

*81 -es !ases du traite"ent

*818$ raite"ent prventi&
.l est capital. 0esures dh %i'ne et dasepsie individuelle et collective @en particulier dans les hMpitauxA. #urveillance des denres alimentaires @cr'mes %lacesB pJtisseriesB viandes hachesA.

*818' raite"ent curati&

#taph lococcies cutano-muqueusesB localisesF macrolide ou apparent @par exempleB r throm cine 2 %3*our ou pristinam cine 2 %3*our pendant 1G *oursA. #taph lococcies %raves F association de deux antibiotiques bactricides F bDta-lactamine @pnicilline semis nthtique non h drol se par les pnicillinases F ex. oxacillineA + aminoside @ex. F %entamicineB etcA ou )luoroquinolones @ex. F o)loxacineA. /n cas de rsistance aux pnicillines semi- s nthtiquesB @souches mthicilline rsistantes isoles en milieu hospitalierA le traitement antibiotique sera un %l copeptide @vancom cine ou teicoplanineA seul ou associ ( un autre antibiotique acti) @aminosidesB ri)ampicineB acide )usidiqueB )os)om cineA. Dans tous les casB la priorit doit Dtre donne au draina%e des collections purulentes.

C#apitre , -es streptoco)ues. entroco)ues et pneu"oco)ues

Les bactries des %enres 'treptococcus et Enterococcus sont des cocci ( ;ram positi)B catalase n%ativeB ( mtabolisme anarobie. Le %enre streptococcus rassemble les streptoco ues sensu stricto et le pneumoco ue. Le %enre enterococcus re%roupe les streptocoques du %roupe DB sau) 'treptococcus bo"is.

,8$ -es streptoco)ues

,8$8$ Distori)ue
/n 1928B -A#4/<6 dcrit dans le pus dun abc's chaud des micro-or%anismes en chapelet de %rains. 6>#/N5A&, leur donneB en 199!. le nom de streptocoques. /n 182!B D.&? dmontre que la scarlatine est due au streptocoque. /n 1829B LAN&/1./LD propose la classi)ication anti%nique qui porte son nom et qui remplace les classi)ications prcdentes bases uniquement sur les proprits hmol tiques. Avec la mthode de LAN&/1./LD on peut classer les streptocoques en sro%roupes de A ( 4. &ertains streptocoques qui ne poss'dent pas danti%'ne permettant de les classer selon la mthode de LAN&/1./LD sont dits Pnon %roupables . /n 183"B lav'nement des sul)amides entraKne une baisse de la mortalit par )i'vre puerpraleB complication post partum souvent cause par les streptocoques.

,8$8' Da!itat
Les streptocoques re%roupent de nombreuses esp'ces. &ertaines sont des parasites de lesp'ce humaine @streptocoques des %roupes AB & et ; de LAN&/1./LDAB dautres des commensaux de la muqueuse buccale @streptocoques du %roupe 5 et streptocoques non %roupables et non hmol tiques ou de la muqueuse %nitale
@%roupe 5A ou de lintestin @anciens streptocoques du %roupe D ou entrocoques considrs maintenant comme )aisant partie dun %enre ( partB le %enre enterococcusA. Dautres encore sont des commensaux des animaux ou des saproph tes.

,8$8* Pouvoir pat#ogne

Les streptocoques sontB apr's les staph locoquesB les bactries p o%'nes nS 2. Le plus patho%'ne dentre eux est le streptocoque bDta-hmol tique du %roupe A de LAN&/1./LDB appel 'treptococcus pyo-enes, qui est responsable de la ma*orit des a))ections provoques par les streptocoques. Les ractions immunolo%iques de lhMte in)ect par '.pyo-enes sont beaucoup plus complexes que celles qui sobservent lorsquil est in)ect par '.aureus et peuvent conduire ( la )ormation danticorps spci)iques ( un taux lev et dauto-anticorps.

,8$8*8$ Maladies provo)ues par les streptoco)ues des groupes A. C. (8

Les streptocoques des %roupes A. C. ( qui sont bDta-hmol tiques @lar%e :one dhmol se )ranche autour des colonies cultives sur %lose au san% )raisAB ont un pouvoir patho%'ne similaire. .ls sont responsables des a))ections suivantes L4an-ine rou-e ou rythmato6pultace @de pultis = bouillieB en latinAB ou est la))ection streptococcique la plus )rquenteF elle saccompa%ne classiquement de )i'vre ( 38-!GS&B de d spha%ie par in)lammation am %dalienne et priam %dalienneB dune adnopathie satelliteB de cphales et dasthnie. 24autres infections ai-us F cutanesB muqueuses ou septicmiques. Les unes sont localesB comme limpti%o @en)antF lsions au niveau du visa%e et des mains de t pe vsiculo-pustulaireB puis crouteusesB de conta%iosit ++), lr sip'le @placard rou%e surlevB limit par un bourrelet + si%nes %nrauxAB ou encore sur les in)ections des plaies et brZlures. Les bactrimies sont souvent secondaires ( une in)ection locale. &est le cas de la )i'vre puerprale qui )ait suite ( une in)ection %nitale du post-partum. .l )aut citer aussi les endocardites ai%u'sB les mnin%ites. La scarlatine associe une an%ine et la di))usion ( partir du )o er an%ineux dune toxine r thro%'ne secrte par le streptocoque. La raction de D.&? consiste ( tester la sensibilit du su*et ( linoculation intradermique dune )aible dose de toxine r thro%'ne. Les su*ets che: lesquels lin*ection de toxine ne provoque pas une raction r thmateuse sont immuniss contre la scarlatine. -our lhistoireB la raction de #&,<L4[/ et &,A6L4>NB ou raction dextinctionB tait une preuve dia%nostique qui consistait ( in*ecter par voie intradermique au niveau dune plaque dr th'me scarlatini)orme un peu de srum de convalescent de scarlatine. #i lr th'me stei%nait au point din*ectionB cest quil sa%issait dune scarlatine. Des s ndromes de choc toxique avec d)aillance viscrale multipleB identique ( celui observ par)ois avec '.aureus @c). chapitre 3 pa%e 28AB doY son nom de 4#L# #>oxic shoc3 li3e syndrom0. 2es affections auto6immunes, consquences din)ections ( streptocoque A. &est le cas du rhumatisme articulaire ai%u @6.A.A.AB de la nphrite post-streptococciqueB de la chore de #7D/N,A0 @contractions musculairesB involontairesB persistant pendant le reposB %estes Les streptocoques, entrocoques et pneumocoques amples et rapides et incoordination des mouvements volontairesA. La parent anti%nique entre la paroi du streptocoque et certains tissus humains explique le dveloppement dauto-anticorps. /lle explique %alement le traitement des a))ections auto-immunes F pnicillinothrapie pour liminer le streptocoque et cortisone pour diminuer la raction immunitaire.

,8$8*8' Maladies provo)ues par les autres streptoco)ues a. .l peut sa%ir d7in&ections aigues% E gnitales. qui peuvent se compliquer de )i'vre puerpraleB provoques par les streptocoques du %roupe B. E nonatales svres% septicmiesB mnin%ite dZe au streptocoque du %roupe 5. E de localisations diverses @abc's du cerveauB cholc stitesB etcA. !8 Il peut sa%ir d7in&ections su!aigues dont la plus classique et la plus %rave est lendocardite lente d7FS-2R8 Celle-ci est due 0 la gre&&e. sur un endocarde pralablement ls @anomalie con%nitaleB squelle de cardite
rhumatismaleB etc...A dun streptocoque non %roupable comme #. san -uis ou #. mitis )rquemment isol de la plaque dentaire et du sillon %in%ivalB dun streptocoque du %roupe D #'.bo"is0, dori%ine intestinale @notamment en cas de cancer coliqueAB ou dun entrocoque.

,8$8, 2tude !actriologi)ue

,8$8,8$ Microscope
Les streptocoques sont des cocci de taille et de )orme irr%uli'resB ( ;ram positi)B %roups en chaKnettes plus ou moins lon%ues et )lexueusesB immobilesB acapsulsB asporuls @)i%ure 1A.

,8$8,8' Culture
Les streptocoques sont des %ermes exi%eants qui ne poussent donc pas sur les milieux de culture ordinaires. &eux-ci doivent Dtre additionns de srum ou de san% )rais.

2n !ouillon
les streptocoques poussent en donnant des )locons et un dpMt au )ond du tube dZ aux lon%ues chainettes et voquant de la mie de pain.

Sur glose au sang

ils donnent de petites colonies %risJtresB translucidesB en %rain de semouleB entoures dune :one dhmol se totale @hmol se bDtaA pour les streptocoques des %roupes AB &B ;B tandis que les autres streptocoques donnent une hmol se partielle @hmol se alphaA ou pas dhmol se du tout.

,8$8,8* Caractres !ioc#i"i)ues

Les streptocoques sont des bactries ( mtabolisme anarobie mais arobie tolrants. .ls nont pas de catalase @en: me respiratoireAB ( linverse des staph locoques.

,8$8,8, Structure antigni)ue

La prsenceB dans la paroi des streptocoquesB dun polyoside . spci)ique a permis ( LAN&/1./LD la classi)ication en %roupes anti%niques. &he: le streptocoque du %roupe A de Lance)ieldB la protine 0 est le principal anti%'ne de la paroi. &est le )acteur ma*eur de la virulenceB par rsistance ( la pha%oc tose @d%radation de &35A. Les anticorps anti-

0 con)'rent une immunit durable et protectrice. .l existe plus de "G t pes di))rents danti%'ne 0F le t pe 0 12 serait plus souvent rencontr dans les nphrites.

4.1.4.5 Su!stances la!ores par streptococcus p+ognes

$8 -a to3ine r+t#rogne. responsable de la scarlatineB est une exo-en: me. /lle nest scrte que par les
streptocoques des %roupes AB & ou ; l so%'nesB cest-(-dire qui hber%ent un bactriopha%e tempr @propha%eA. La raction de D.&? et celle de #&,<L4[/ et &,A6L4>N sont en relation avec cette toxine et les anticorps spci)iques dont elle induit la )ormation. Les souches de streptocoques responsables de chocs toxiques et de d)aillances viscrales multiples produisent une toxine tr's proche de la toxine r thro%'ne et appele #pe @#treptococcal p o%enic exotoxinA. Le mode daction de ces deux toxines est proche de celle de 4##4B de '.aureus @superanti%'neB c). '.aureus0.

'8 9e no"!reuses en>+"es non to3i)ues sont scrtes par les streptoco)ues% -es #"ol+sines F et S sont appeles streptol sines. /lles sont anti%niques et donnent lieu ( la )ormation par lhMte in)ect dantistreptol sines. -7anti-streptol+sine F. ou AS-F. se dose au cours des a))ections chroniques ( streptocoquesB notamment le 6.A.A. <n taux lev d7AS-F tmoi%ne dune in)ection volutive ( streptocoque

@normal = E 2GG <R.mlA.

-a streptoGinase @)ibrinol sineA @normale = 9G U@"l<. la streptodornase @qui l se les acides nucliquesA sont

%alement anti%niques. /lles peuvent Dtre doses au cours des in)ections ( streptocoques. La streptoLinase est utilise dans le traitement mdical des embolies. -a #+aluronidase est comme celle du staph locoque un )acteur de di))usion du %erme et de ses en: mes dans lor%anisme humain @in)ections cutanesA. Une protase capable de d%rader &+AB contribuant ( lchapement ( la pha%oc tose.

,8$8= 9iagnostic !actriologi)ue

Le dia%nostic de lin)ection streptococcique peut se )aire par la mthode directe @mise en vidence du %ermeA et par la mthode indirecte @dosa%e des anticorpsA.

,8$8=8$ 9iagnostic direct

Apr's prl'vement aseptique )ait avant le dbut du traitement antibiotiqueB lexamen microscopique recherche la prsence de cocci ( ;ram positi)B de taille irr%uli'reB %roups en chaKnettes. La culture est )aite sur des milieux enrichis t pe %lose au san%. Lori%ine du prl'vement et la nature de lhmol se sur %lose au san% orientent le dia%nostic. #i le prl'vement provient dune cavit close @pus dabc'sB liquides dpanchementB L.&.6.B urinesA ou sil sa%it dune hmocultureB tous les streptocoques isols peuvent Dtre patho%'nes mDme sils ne sont pas bDta-hmol tiques #il sa%it au contraire dun prl'vement de %or%e @an%ineAB seuls les streptocoques bDta-hmol tiques doivent Dtre pris en considration. /n plus il )aut vri)ier quils appartiennent bien au %roupes AB & ou ; car certains streptocoques commensaux @5 ou DA peuvent Dtre bDta-hmol tiques. /n cas de mnin%ite nonataleB la contre-immunolectrophor'se ou la%%lutination de particules de latex portant des anticorps antistreptocoques 5 permet par)ois didenti)ier la prsence danti%'ne dans le L&6. Lantibio%rammeB notamment ltude de la sensibilit ( la pnicilline et ( lr throm cineB viendra tou*ours complter le dia%nostic direct.

,8$8=8' 9iagnostic indirect

.l repose sur le dosa%e dans le srum @srodia%nosticA des anticorps contre les en: mes du streptocoque. Lanticorps le plus souvent recherch est lantistreptol sine > @A#L>A dont le taux normal est in)rieur ou %al ( 2GG units3ml.

,8$8/ raite"ent
,8$8/8$ raite"ent curati&
Les streptocoques des %roupes AB & et ; sont extrDmement sensibles ( la pnicilline et ( lr throm cine qui sont donc les antibiotiques ( choisir pour le traitement des in)ections quils provoquent. Les autres streptocoquesB notamment les streptocoques non %roupables et 'treptococcus bo"is, sont de sensibilit intermdiaire ou rsistance ( la pnicilline. .ls posent par consquent des probl'mes thrapeutiques et obli%ent souvent ( associer de )ortes doses de pnicilline ou damoxicilline ( un aminoside @par exemple la %entamicineA.

,8$8/8' raite"ent prventi&

6Mle historique d.%nace #emmel\eis quiB ( la maternit de $ienne entre 19!2 et 19!8B puis ( celle de -est @5udapestAB a dmontr le rMle de lh %i'ne des mains des mdecins dans la prvention de la )i'vre puerprale.

,8' -es entroco)ues

Les entrocoques sont des cocci ( ;ram positi)B disposs en diplocoquesB commensaux du tube di%esti). .ls sont responsables din)ections urinaires et dendocardites. Les plus )rquemment isols sont Enterococcus

faecalis et ( un moindre de%r Enterococcus faecium.

Les entrocoques poussent sur milieu ordinaireB sur milieu hostile @Na&1 8,5 IB bileA et appartiennent au %roupe D de Lance)ield. .ls sont bien moins sensibles aux antibiotiques que les autres streptocoques et en 189" les premi'res souches dentrocoques rsistant aux %l copeptides @vancom cineB ticoplanineA ont t isoles.

,8* -e pneu"oco)ue
,8*8$ 9&inition
Le pneumocoqueB 'treptococcus pneumoniae, est un diplocoque ( ;ram positi)B encapsul B a ant les proprits mtaboliques des bactries du %enre 'treptococcus.

,8*8' Da!itat
Le pneumocoque est un h?te normal @commensalA de l4arbre respiratoire suprieur @rhino-phar nxA de lhomme. >n le trouve dautant plus souvent que le su*et est *eune @!G I de porta%e che: les en)ants )rquentant les cr'chesA.

,8*8* Pouvoir pat#ogne naturel

A loccasion dune baisse de limmunit %nrale ou localeB provoque par des anomalies du tractus respiratoireB des intoxications @alcoolAB des troubles circulatoiresB la malnutritionB la splnectomieB etc...B le pneumocoque peut se multiplier activement dans larbre respiratoire. .l va provoquerF 2es affections loco6r-ionales F bronchitesB trachobronchitesB sinusitesB otitesB con*onctivitesB pneumonies )ranches lobaires ai%u's @accompa%nes dans 1+ ( 2+ I des cas de bactrimieAB pleursies. Les pneumonies ( pneumocoque reprsentent "G ( 9G I de toutes les pneumonies bactriennes. 2es affections ! distance F pricarditesB mnin%itesB pritonitesB arthrites. <n caract're important des in)ections ( pneumocoque est ( retenirF la )rquence des ractions )ibrineuses %nratrices de cloisonnements @par exemple pleuraux ou mnin%sA quiB eux-mDmesB a%%ravent le pronostic.

,8*8, 2tude !actriologi)ue

,8*8,8$ Microscope
Les pneumocoques apparaissent comme des cocci ( ;ram positi)B en )lamme de bou%ieB encapsulsB %roups par paire @diplocoqueAB par)ois en courtes chaKnettes @)i%ure 3A.

,8*8,8' Culture
La culture du pneumocoque est aussi di))icile que celle des streptocoques. #ur %lose au san% en anarobiose ou sous &G2B le pneumocoque donne des colonies lissesB transparentesB en %outte de roseB entoures dune :one dhmol se partielle @alphaA. -ar repiqua%es successi)sB les colonies deviennent ru%ueuses et correspondent ( des pneumocoques a ant perdu leur capsule.

,8*8,8* Caractres !ioc#i"i)ues

&omme tous les streptocoquesB le pneumocoque est un %erme ( mtabolisme anarobie mais arobie tolrant. .l na pas de catalase. Lad*onction de tensio-acti)s @bileB sels biliairesA ( une culture de pneumocoque en bouillon entraKne la l se des capsules du pneumocoque et lclaircissement immdiat du bouillon @phnom'ne de N/<1/LDA. A linverse des streptocoquesB le pneumocoque est sensible ( un sel de cuivreB lth l-h drocuprine @optochineA. &ette proprit est utilise pour lidenti)ication du pneumocoque au laboratoire.

,8*8,8, Construction c#i"i)ue et antigni)ue

Le pneumocoque est caractris par la prsence dune capsule de nature polysaccharidi ue dont il existe @4 types immunolo-i ues. /n contact avec un anticorps spci)iqueB le pol saccharide )orme un complexe anti%'neanticorps qui se traduitB ( lexamen microscopiqueB par le phnom'ne du -onflement de la capsule. &e phnom'ne permet le t pa%e srolo%ique des pneumocoques et a un %rand intrDt pidmiolo%ique. La capsule du pneumocoque *oue un rMle capital dans le pouvoir patho%'ne du %erme en empDchant la pha%oc tose. Au cours dune in)ection ( pneumocoqueB le dveloppement danticorps anti-capsule entraKne la %urison de lin)ection. Les pneumocoques sans capsule ne peuvent plus se distin%uer des streptocoques non %roupables. 0is en prsence dADN extrait de pneumocoques capsulsB ils peuvent Dtre Ptrans)ormsQ en pneumocoques capsuls @trans)ormationB ;6.11.4,B 1829A.

4.3.4.5 Pouvoir pat#ogne e3pri"ental

Le pneumocoque est patho%'ne pour la souris. .n*ect par voie intrapritonaleB il entraKne la plupart du temps
une septicmie mortelle en 2!-29 heures. &ette proprit est par)ois emplo e pour isoler le pneumocoque. Actuellement elle est uniquement utilise pour la patholo%ie exprimentale dans les es sais thrapeutiques antiin)ectieux.

4.3.5 9iagnoctic !actriologi)ue

.l n a pas de dia%nostic srolo%ique des in)ections ( pneumocoque. Le dia%nostic bactriolo%ique repose donc sur la mise en vidence du pneumocoque dans les lsions. .l est relativement ais lorsque lin)ection pneumococcique est une mnin%iteB une pleursie ou encore lorsque la pneumonie saccompa%ne dune bactrimie. /n raison de la prsence normale de '.pneumoniae dans la )lore normale du rhino-phar nxB lanal se bactriolo%ique des crachats nest pas un mo en )iable de )aire le dia%nostic dune pneumonie ( pneumocoques. &he: environ 5$ I des su*ets a ant une pneumonie ( pneumocoque prouve par hmocultureB les crachats ne permettent pas lisolement du pneumocoque etB ( linverseB che: 5$ I de su*ets pour lesquels le pneumocoque est isol des crachats il nexiste pas de pneumonie. Le prel'vement des scrtions bronchiques doit Dtre )ait dans de bonnes conditions @brosses prot%esA. Dans tous les casB les prl'vements doivent Dtre e))ectus avant tout traitement antibiotique @#an%B L.&.6.B liquide pleuralB scrtions bronchiques etc...A. Le dia%nostic de pneumocoque repose sur la prsenceF ( l4examen microscopi ue, de diplocoques ( ;ram positi) encapsuls et de nombreux pol nuclaires altrsB sil sa%it dun liquide de sreuse in)ecteB dun abc'sB etc... ( la culture sur -lose au san-, de colonies en %outte de roseB alpha-hmol tiquesB sensibles ( loptochine. Lidenti)ication peutB si ncessaireB Dtre complte par la l se par la bile ou les sels biliaires dune culture en bouillon et le srot pa%e. >n compl'tera lisolement et lidenti)ication du pneumocoque par un antibio%rammeB en raison de lapparition de souches de pneumocoques rsistantes aux antibiotiques. Dapr's les rsultats publis en 1882 dans le 5ulletin /pidmiolo%ique Annuel par l.nstitut National de $eille #anitaire @2AB en mo enne !" I des souches de pneumocoque sont rsistantes ( lr throm cineB !G I au cotrimmoxa:ole. Ltude de la sensibilit ( la pnicilline ; monte que !G I des souches sont de sensibilit diminue ou rsistantes ( la pnicilline ;. .l )aut noter toute)ois que le pourcenta%e de souches rsistantes varie en )onction de lJ%e du patient. AinsiB che: les *eunes en)antsB "G I des souches sont rsistantes ( lr throm cine mais seulement che: !G I des su*ets adultes. Lapparition des souches de pneumocoques rsistantes aux antibiotiques est le rsultat de lau%mentation de la consommation des antibiotiquesB en particulier che: les *eunes en)antsB et la transmission croise des souches rsistantesB surtout dans les collectivits den)ants @cr'chesA. Des trans)erts de matriel %ntique par trans)ormation ou par transposition peut se )aire dans le rhino-phar nx entre les streptocoques commensaux rsistant aux antibiotiques et les pneumocoques /n cas de mnin%iteB la contre immunolectrophor'se ou la%%lutination de particules de latex portant des anticoprs anticapsulaires permet par)ois de mettre en vidence des danti%'nes pneumococciques dans le L&6.

,8*8/ raite"ent
Avant l're des antibiotiquesB la srothrapie par des srums spci)iques antipol saccharide capsulaire tait le seul mo en de traiter les su*ets in)ects. Lantibiotique de choix reste la pnicillineB mal%r lapparition de souches )ortement rsistantes ( cet antibiotique. .l existe un vaccin qui contient les pol saccharides des 23 t pes les plus souvent rencontrs aux <.#.A. Le))icacit de ces vaccinsB recommands che: les su*ets ( immunit d)icienteB nest pas pleinement dmontre. .l est indiqu che: les su*ets splnectomiss et les personnes J%es. <n vaccin contenant les anti%'nes pol saccharidiques de 2 srot pes @vaccin heptavalentA )rquents che: len)ant et souvent associs ( la rsistance aux antibiotiques a )ait lob*et aux <#A dun essai portant sur plus de 32.GGG en)antsB la moiti des en)ants recevant le vaccin anti-pneumococcique heptavalentB lautre moiti un vaccin anti-mnin%ococcique @!A. -armi les en)ants vaccins par le vaccin anti-pneumococcique heptavalent 3 cas din)ections sv'res sont identi)is pendant la priode de surveillance post-vaccinale alors quil en a eu !8 parmi les autres en)ants @e))icacit protectrice de 83 %). Le))icacit protectrice sur les otites mo ennes ai%us est de 5: %. &e dernier vaccinB maintenant disponible en 1ranceB est administr avant un an et ncessite trois in*ections.

C#apitre 5 / -es neisseria

Les 7eisseria sont des cocci ( ;ram n%ati)B en diplocoquesB arobies strictsB ox dase positive. &ertains sont des commensaux des cavits naturellesB tandis que deux esp'ces 7eisseria menin-itidis et 7eisseria -onorrhoeae sont des patho%'nes.

=8$ :essria "ningitidis

Le mnin%ocoqueB 7eisseria menin-itidis, est la%ent de la mnin%ite crbro-spinale.

=8$8$ Da!itat
Le mnin%ocoque est un parasite strict de l4esp9ce humaine. L e rhino-phar nx est la porte dentre du %erme dans lor%anisme. De nombreux su*ets sont porteurs sains et *ouent un rMle capital dans lpidmiolo%ie de la maladie.

5.1.2 2pid"iologie et pouvoir pat#ogne

&he: certains su*etsB notamment les su*ets *eunes vivant en collectivitB le mnin%ocoque se multiplie et provoque une rhino-phar n%ite conta%ieuseB pidmique ou sporadique. &elle-ci survient surtout en priode hivernale et printani're. Dans un pourcenta%e tr's )aible des cas @1 %), il peut passer dans le courant san%uinB entraKner une bactrimie @mnin%ococcmieA avec )i'vre et rash hmorra%ique @ptchiesB purpuraA. -a "ningite est la complication la plus )rquente de la mnin%ococcmie. /lle apparaKt brutalement et entraKne des cphalesB des vomissements et une raideur de la nuqueB etB non traiteB volue vers le coma en quelques heures. La complication mali%ne de la mnin%ococcmie est la septicmie )ulminante avec purpuraB coa%ulation intravasculaire dissmine et collapsus circulatoire @s ndrome de =A4/6,><#/-16.D/6.&,#/NA. /xceptionnellementB 7.menin-itidis peut Dtre retrouv au niveau des or%anes %nitaux.

=8$8* 2tude !actriologi)ue

=8$8*8$ Microscope
Les mnin%ocoques apparaissent comme des cocci rni)ormesB ( ;ram n%ati)B habituellement %roups en diplocoques @)i%ure 1A. Dans les produits patholo%iques @culot de centri)u%ation du liquide cphalo-rachidienAB ils sont souvent peu nombreux et situs ( lintrieur ou ( lextrieur des pol nuclaires @mnin%ite habituellement purulenteB avec L&6 eau de ri:A.

=8$8*8' Culture
Le mnin%ocoque est un %erme moins )ra%ile que le %onocoque. Les chantillons de produit patholo%ique susceptibles de contenir des mnin%ocoques doivent cependant Dtre ensemencs le plus rapidement possible sur un milieu de culture appropri. .l )aut viter les %rands carts de temprature lors du transport au laboratoire.

Le mnin%ocoque ne pousse pas ou mal sur les milieux de culture usuels et ( 22 oc @di))rence avec les 7eisseria

commensalesA. .l pousse bien sur %lose au san% cuit @%lose chocolatAB incube ( 3"

ScB en atmosph're enrichie de 5

I de co2 @le procd de la bou%ie permet dobtenir une concentration en co2 de 3 ( 1G %). Lhumidit )avorise la croissance @)i%ure 2A. Les cultures sont positives en 19 heures et donnent des colonies %risJtresB opaquesB ( sur)ace lisse et humide. Les )ormes capsules )orment des colonies mucoOdes.

=8$8*8* Caractres !ioc#i"i)ues

Le mnin%ocoque est un arobie strictB oxydase positi"e, capable dutiliser le -lucose et le maltose @( la di))rence du %onocoqueA. Le mnin%ocoque poss'de une alpha-%lutam l-trans)raseB ( la di))rence de 7.-onorrhoeae qui nen poss'de pas.

=8$8*8, Structure c#i"i)ue et antigni)ue

La paroi du mnin%ocoqueB et des 7eisseria en %nralB a une structure voisine de celle des bacilles ( ;ram n%ati). /lle contient un lipo-pol saccharide @L-#A ou endoto3ine qui a un pouvoir lt#al par in*ection intraveineuse ou intrapritonale ( dose leve et un pouvoir der"o-ncroti)ue par in*ection intradermique. 9es pol+sacc#arides capsulaires per"ettent de classer par a%%lutination les mnin%ocoques en groupes

srologi)ues % A. B. cB 9. C7[B 28/ et H 13+. Les mnin%ocoques du %roupe A sont le plus )rquemment
rencontrs au cours des pidmies en A)riqueB ceux du %roupe 5 en /urope et c en Amrique. &haque )ois quil a une pidmieB il sa%it de mnin%ocoques des %roupes A et cB les %roupes 5 se rencontrant plus )rquemment dans les cas sporadiques ou che: les porteurs sains. Au cours des mnin%ococcmies %ravesB des anti%'nes pol saccharidiques sont librs en %rande quantit dans le san%B le liquide cphalo-rachidien et les autres liquides biolo%iques. >n peut les mettre en vidence par contre- immunolectrophor'seB a%%lutination de particules de latex ou coa%%lutination.

#euls les pol saccharides des mnin%ocoques des %roupes A et & donnent naissance ( des anticorps immunisants.

=8$8, 9iagnostic !actriologi)ue

/n pratiqueB le dia%nostic de lin)ection mnin%ococcique est un dia%nostic direct. Prlve"ents -e mnin%ocoque se recherche dans le liquide cphalo-rachidien @ponction lombaireAB dans le san% @hmocultureAB dans les lsions purpuriques @ponction-aspirationA et dans les prl'vements de %or%e @che: les su*ets contactsA. /tant donn la )ra%ilit du %ermeB les prl'vements doivent Dtre ensemencs le plus rapidement possible. -7e3a"en "icroscopi)ue notamment celui du L.&.6.B permet de noter limportance de la raction cellulaire @habituellement intenseA et de mettre en vidence des diplocoques ( ;ram n%ati)B en %nral peu nombreux ( lintrieur et ( lextrieur des pol nuclaires.

-a culture
( partir du san%B du L.&.6. et des lsions purpuriques se )ait sur des milieux enrichis spci)iques @%lose chocolatA ou non spci)iques @bouillon pour hmocultureA. La culture ( partir des prl'vements de %or%e doit se )aire sur des milieux enrichis et slecti)s pour inhiber la croissance des bactries commensales de la bouche et ne permettre que la culture des 7eisseria. .l )aut ensuite procder ( lidenti)ication biochimique et anti%nique des colonies de 7eisseria isoles. La recherche des 7eisseria dans la %or%eB qui est lon%ue et relativement di))icileB est donc rserve aux enquDtes pidmiolo%iques. -7anti!iogra""e vient tou*ours complter lisolement de 7eisseria menin-itidis. .l doit comporter le bilan de la sensibilit ( la pnicilline @rsistance exceptionnelle par scrtion de )3-lactamaseB ou sensibilit diminue par un autre mcanismeA

=8$8= raite"ent
=8$8=8$ raite"ent curati&
Le traitement curati) des mnin%ococcies repose sur ladministrationB le plus prcocment possibleB dantibiotiques F par exemple 3G millions dunits de pnicilline par 2! heures che: ladulteB en per)usion intraveineuse continueB pendant 1G *ours N ampicillineB phnicol @chloramphnicol ou mieux thiophnicolA peuvent constituer des alternatives tout aussi e))icaces que la pnicilline.

=8$8=8' raite"ent prventi&

Le traitement prventi) repose sur la chimioproph laxie et3ou la vaccination.

C#i"ioprop#+la3ie #on but est dradiquer les mnin%ocoques che: les porteurs sains. La sul)amido-proph laxieB qui tait autre)ois la r'%le nest plus possible en raison de lapparition de nombreux mnin%ocoques rsistants aux sul)amides. La chimioproph laxie par la pnicilline nest pas e))icace. >n conseille ladministration de ri)ampicine pendant 2 *ours ( raison de 2G m%3L%3 *our en 2 prisesB ( 12 heures dintervalle. Huand un cas de mnin%ococcie apparaKtB la chimioproph laxie est recommande che: les contacts )amiliauxB les en)ants des crDches et des coles maternellesB et che: les su*ets vivant dans des communauts closes @pensionnatB colonie de vacancesB caserneB etc...A. Vaccination Les pol saccharides capsulaires puri)is extraits des mnin%ocoques des %roupes A et & sont vaccinants. Leur in*ectionB qui est dune innocuit totaleB entraKne la )ormation danticorps protecteurs qui apparaissent d's le 7e *our qui suit lin*ection et ne persistent que pendant 2 ( 3 ans. La vaccination antimnin%ococcique est donc rserve aux populations exposes et doit Dtre e))ectueB au dbut dune va%ue pidmique.

5.2 :eisseria gonorr#oeae

Le %onocoque ou 7. -onorrhoeae, a t dcouvert par N/.##/6 en 1928 dans le pus de blennorra%ie. .l di))'re du mnin%ocoque par labsence dutilisation du maltoseB labsence dalpha-%lutam l-trans)rase et par sa constitution anti%nique.

5.2.1 Da!itat
Le %onocoque est un parasite strict de lesp'ce humaine.

5.2.2 Pouvoir pat#ogne

Le %onocoque est la%ent dune des maladies vnriennes ou maladies sexuellement transmissibles @0.#.4.A les plus rpanduesB la blenno))a%ie ou %onococcie. Depuis 18"GB la %onococcie est en au%mentation dans presque tous les pa s du monde. 4oute)oisB dans les pa s dveloppsB cette au%mentation a t stoppe en 11@5 et depuis cette date on note mDme une diminution sensible du nombre de cas. #a transmission est principalement le )ait des su*ets @)emmes et hommesA porteurs as mptomatiques de %onocoques. C#e> l7#o""e le risque de contamination apr's un rapport sexuel avec une partenaire in)ecte est de 35 % en mo enne. La maladie apparaKt brutalement 2 ( 5 *ours plus tard et se traduit le plus souvent par une affection ai-us A urthrite avec coulement purulent et brZlures vives ( la miction @chaude-pisseA. Dans moins de 5 I des casB lin)ection urthrale est pauci ou as mptomatique. /n se prolon%eantB lin)ection urthrale entraKne localement une raction sclreuse qui peut conduire au rtrcissement urthral. Lin)ection peut stendre aux %landes urthralesB ( la prostateB aux vsicules sminales et ( lpidid me. Des bactrimies peuvent se produireB entraKner la dissmination du %onocoque dans lor%anisme et Dtre responsables de lsions cutanes @papules hmorra%iquesB pustulesAB darthritesB de tnos novites @%enouB chevilleB poi%netAB etc... Les %onocoques responsables din)ections as mptomatiques sont responsables de la plupart des %onococcies dissmines. C#e> la &e""e le risque de contamination apr's un rapport sexuel avec un partenaire in)ect est de :5 ! 8G %. Lin)ection est le plus souvent peu ou pas s mptomatique. /lle se traduit par une urthriteB une cerviciteB une bartholiniteB et peut donner lieu ( un coulement purulent. Lin)ection peut stendre et provoquer une salpin%ite @avec risque doblitration secondaire et de strilitAB une pelvi-pritonite. .l nest pas rare que ces complications locor%ionales soient les premi'res mani)estations de lin)ection %onococcique che: la )emme. Les localisations extra%nitales @phar n%esB anales et oculairesAB les bactrimiesB et les localisations ( distance sont similaires ( celles qui sobservent che: lhomme. C#e> le nouveau-n lophtalmie purulente est acquise au moment de la traverse de la )ili're %nitale lorsque la m're est in)ecte

et non traite. /lle conduit ( la ccit. -our la prvenirB il a obli%ation l%ale dinstiller dans les eux des nouveaux-ns un coll re antiseptique @nitrate dar%ent ( GB+-1 I F mthode de &redA ou antibiotique @ttrac cline ou r throm cineA.

5.2.3 2tude !actriologi)ue

=8'8*8$ Microscope
&omme les mnin%ocoquesB les %onocoques sont des cocci rni)ormes ( ;ram n%ati)B habituellement %roups en diplocoques. Dans les produits patholo%iques @pus urthralAB les %onocoques apparaissent classiquement en amas plus ou moins importants ( lintrieur de pol nuclaires altrs.

=8'8*8' Culture
Les %onocoques sont des %ermes )ra%iles @tr's sensibles ( la dessicationA et exi%eants. Au sortir de lor%anismeB on les cultive ( 3"S& sur %lose chocolatB enrichie de supplment vitaminique et additionne dun mlan%e dantibiotiques @vancom cineB colistine et n statine ou $.&.N.A pour inhiber la croissance des bactries commensales. <ne certaine proportion des souches est cependant sensible ( la vancom cineB doY lutilit densemencer aussi sur milieu non inhibiteur en parall'le.
<ne atmosph're humideB enrichie de &G2 @+-1G IA est indispensable pour la croissance. Les coloniesB plus petites que celles des mnin%ocoquesB apparaissent en 19h habituellement mais par)ois en !9 h. /lles sont petitesB bombesB opaques ou translucidesB brillantesB de moins de lmm de diam'treB ( bords r%uliersB nets @4 1A ou dun diam'tre l%'rement suprieur @42A. Apr's repiqua%es multiplesB elles chan%ent daspectB cessent dDtre virulentes @perte des piliA et sont platesB %ranuleusesB ( contours crnelsB de 2 ( 3 mm de diam'tre @43 et 4!A.

5.2.3.3 Caractres !ioc#i"i)ues

Le %onocoque est arobie strictB ox dase positi)B %lucose positi) mais maltose n%ati) @di))rence avec le mnin%ocoqueA. Les souches responsables des %onococcies as mptomatiques et dissmines sont auxotrophes ( l%ard de lar%inineB lh poxanthine et luracile.

5.2.3.4 Structure c#i"i)ue et antigni)ue

.l )aut distin%uerF Lendotoxine de la paroiB de nature %lucido-lipido-pol peptidiqueB similaire ( celle de toutes les bactries ( ;ram n%ati) @c). section +.1 pa%e !2A. Des pol saccharides capsulaires ( partir desquels on na pas encore russi ( prparer un vaccin comme ( partir des pol saccharides des mnin%ocoques A et &. Des pili quiB avec dautres substancesB permettent aux %onocoques de se )ixer sur les cellules du tractus %nito-urinaire et sur les spermato:oOdes. 1acteurs de patho%nicitB ils ne sont prsents que che: les souches virulentes. De nature protique tr's varieB ils donnent naissance ( des anticorps anti-pili qui prot'%ent contre la souche autolo%ue seulement. Des anti%'nes protiques de sur)aceB %ntiquement indpendants des piliB qui prot'%eraient les %onocoques virulents de la pha%oc ctose et de laction bactricide des .%A scrtoires. /n)inB les %onocoques auxotrophesB responsables din)ections as mptomatiques et dissminesB sont rsistants in vitro ( certaines immuno%lobulines 0 @.%0A de srum humain. Leur prsence a une troite relation avec un d)icit ( mtaboliser le )er in situ. A linverseB les %onocoques qui donnent des in)ections localisesB s mptMmatiquesB sont tus par ces .%0.

5.2.4 9iagnostic !actriologi)ue

=8'8,8$ 9iagnoctic direct
a. Les prl'vements doivent Dtre )aits au laboratoireB le matin avant mission durine ou toilette %nito-urinaire. >n prl'vera le pus et les scrtions ( partir de lur'threB colB prostateB muqueuse rectaleB phar nx etB ventuellementB le liquide s novial et le san%. b. Lexamen microscopiqueB apr's coloration de ;ramB est )ondamental car la mise en vidence de nombreux diplocoques ( ;ram n%ati) ( lintrieur des pol nuclaires altrs permet le dia%nostic ( la phase ai%u' de la maladie @urtrite purulenteA. Dans les autres localisations @phar nxB anusB colAB lexamen microscopique est moins vocateur. c. La culture est faite immdiatement apr9s le prl9"ement, sur milieu riche et slecti)F %lose chocolat + supplment vitaminique + $.&.N. ( 3"S& + +-1G I &G2 + humidit. /lle seule permet un dia%nostic de certitude et de )aire ensuite un antibio%ramme. /lle est indispensable au dia%nostic che: la )emme et dans les localisations phar n%eB analeB etc... d. Lantibio%ramme avec recherche de la production de )3-lactamase est dimportance capitale depuis quen 182" on a isol des %onocoques rsistants ( la pnicilline par scrtion dune bDtalactamase plasmido-dpendante @--N;A. Le pourcenta%e de souches --N; a au%ment r%uli'rement depuis cette date. /n 1898B il a t isol pour la premi're )ois des souches rsistantes aux ttrac clines plasmido-dpendantes @46N;A. +.2.!.2 9iagnostic indirect &he: les su*ets in)ects il existe des anticorps anti-pili et contre les protines de sur)ace. &eux-ci peuvent Dtre mis en vidence par diverses preuves srolo%iques. 0ais aucune dentre elles @hma%%lutinationB immuno)luorescence indirecte et /lisaA nest sensible ni spci)ique en cas din)ections localises. /lles sont )ranchement positives en cas de

%onococcie complique @dissmineB in)lammation pelvienneB etc...A.

5.2.5 raite"ent
=8'8=8$ raite"ent curati&
Le traitement de la %onococcieB qui repose sur une antibiothrapie prcoce et strilisanteB doit rpondre ( plusieurs imprati)s 4raiter ( coup sZr lin)ection pour rendre le malade non conta%ieuxB en une prise unique @traitement minuteAB seule %arantie dune bonne observance. 4raiter une autre ventuelle in)ection sexuellement transmise @s philisB chlam diaeB etc...A qui a pu Dtre contracte en mDme temps que la %onococcie. #adresser non seulement aux malades mais aussi ( leurs partenaires pour viter la rin)ection @pin%-pon%A et la contamination dautres personnes. /n pratiqueB deux t pes de traitement sont disponiblesB le traitement minute @( dose uniqueA indiqu en cas din)ections ai%u'sB localisesB non compliquesB et le traitement standard rserv aux seules )ormes compliques. raite"ent "inute QF classiquementB dose uni ue de !B9 millions dunits @0.<.A de pnicilline-procaOne @pnicilline mo en retardA en in*ection intramusculaire ou de (,5 % dampicillineB associe ( 1 % de probncide @5nmide]A par voie orale @pour ralentir lexcrtion urinaire des pnicillinesA. &es traitements sont capables de traiter une s philis en incubation. raite"ent standard A pendant 15 =ours, in*ections quotidiennes de 1 0.<. de pnicilline ou administration orale de ! % dampicillineB ou de 1 % damox cilline @2xGB+ %AB ou de 2 % de ttrac clineB etc... 9ans tous les cas. les partenaires doivent tre traits en ""e te"ps et de la ""e

"anire )ue le "alade8

Devant lau%mentation constante du pourcenta%e de souches rsistantes ( la pnicillineB il est pr)rable dutiliser une cphalosporine de 3'me %nration @ce)triaxone +GG m% en in*ection 10A ou une )luoroquinolone @nor)ioxacineB 9GG m% per osB ou rosoxacineB 3GG m% per osA ou la spectinom cine @2 % en in*ection 10A. 5.2.5.2 Prvention Lophtalmie purulente du nouveau-n est prvenue par linstillation con*onctivale s stmatique dun coll re ( lr throm cine ( $,5 I ou ( la ttrac cline ( 1 %. -our les autres in)ections ( %onocoqueB en labsence de vaccin e))icaceB la seule prvention est la maKtrise sexuelle F h %i'ne sexuelle et responsabilit ( l%ard des partenairesB prvention mcanique @prservati)sAB emploi de contracepti)s chimiquesB ducation sexuelle permettant le traitement prcoce des malades et de leurs partenairesB etc...

C#apitre / @ -es !acilles 0 gra" positi& non sporules /8$ Cor+ne!actriu" dip#teriae
Les cor nbactries sont des bacilles ( ;ram positi)B immobiles et asporulsB souvent %ranuleux et ( extrDmits lar%ies. Leur %roupement en palissades ou en lettres de lalphabet est souvent caractristique. De nombreuses esp'ces )ont partie de la )lore normale de larbre respiratoireB des autres muqueuses et de la peau. .orynebacterium diphteriae scr'te une toxine qui est responsable de la diphtrie.

/8$8$ Distori)ue
/n 1993B ( une poque oY la diphtrie tuait encore "GGGG personnes par an en 1ranceB ?L/5# dcouvre le bacille dans les )ausses membranes de lan%ine diphtrique. /n 199!B L>/11L/6 le cultive et reproduit la maladie locale et %nrale che: lanimal. .l constate que le bacille reste au point dinoulation. /n 1999B 6><C et 7/6#.N reproduisent exprimentalement la diphtrie par inoculation dun )iltrat de bouillon de culture. La toxine diphtrique tait dcouverte. /n 198GB 5/,6.N; et ?.4A#A4> immunisent lanimal avec des doses )aibles de toxine et obtiennent un srum antitoxique utilis pour le traitement des malades. /n 1813B #&,.&? met au point un test dimmunit par in*ection intradermique de toxine. /n 1823B 6A0>N trans)orme la toxine en anatoxine et produit le premier vaccin antidiphtrique.

/8$8' Da!itat
.orynebacterium diphteriae est un parasite strict de lesp'ce humaine. .l se transmet directement dindividu (

individu par voie respiratoire. Les a%ents de contamination sont les malades ou les porteurs sains.

/8$8* Pouvoir pat#ogne

/8$8*8$ P#+siopat#alogie
&he: les su*ets rcepti)sB ..diphteriae se multiplie sur les muqueuses respiratoires @habituellement du rhinophar nxB par)ois du lar nxA et commence ( secrter de la toxine. &elle-ci est absorbe par les muqueusesB dtruit lpithelium et provoque une raction in)lammatoire. Lepithelium ncros se recouvre dun exsudat )ibrineux riche en hmaties et en %lobules blancsB la )ausse membrane I8 &elle-ci si'%e classiquement sur les am %dalesB le phar nx ou le lar nx @croup .asph xieA. /lle est adhrente et toute tentative de prl'vement )ait sai%ner. .l a une importante raction %an%lionnaire cervicale. Dans la )ausse membraneB .. diphteriae continue ( produire sa toxine qui di))use dans tout lor%anisme oY elle bloque les s nth'ses cellulaires. /lle provoque ainsi une d%nrescence parench mateuseB une in)iltration %raisseuseB des lsions ncrotiquesB cardiaquesB hpatiquesB rnalesB surrnaliennesB par)ois accompa%nes dhmorra%ies. La toxine peut aussi entrainer des lsions neurolo%iques qui se traduisent par des paral sies du voile du

palaisB des muscles oculaires et des extrDmits.

/8$8*8' Clini)ue
La maladie commence par une an%ine )brile ( )ausses membranes situe habituellement sur les piliers du voile avec une importante raction %an%lionnaire @dit cou Pproconsulaire I<8 Les si%nes de toxicit apparaissent rapidement et conduisent ( la prostration. .ls peuvent Dtre accompa%ns de d spne lie ( lobstruction des voies ariennes suprieures @lar nx et tracheA par la )ausse membrane @croupA. /n dehors du croupB les complications cardiaques @m ocarditeA et nerveuses @d spha%ie et paral sieA dominent le pronostic. &he: le su*et vaccinB la diphtrie se mani)este par une an%ine banale ou ( )ausses membranes mais sans si%nes %nraux.

/8$8, Bactriologie
/8$8,8$ Microscope
5acille ( ;ram positi)B immobileB sans spore ni capsule. .l est l%'rement incurvB avec des extrDmits arrondiesB en massueB en halt'resB et donne des %roupements caractristiques en paquets dpin%lesB en palissadesB en lettres chinoises. La coloration met en vidence des %ranulations mtachromatiquesB de si'%e polaire @)i%ure 1A.
/8$8,8' Culture

.orynebacterium diphteriae pousse sur la ma*orit des milieux de culture usuels. 0ais la culture est )avorise par la prsence de san% ou de srum. #ur le milieu de L>/11L/6B au srum coa%ulB il pousse plus rapidement que les autres bactries en donnant de petites colonies %risJtres %ranu +"312 Bactriologie Service de Bactriologie 2002 -2003
-

2Rf - -

Les bacilles gram positif non sporules

leusesB ( bord irr%ulier.

/8$8,8* Caractres !ioc#i"i)ues

.. diphteriae est arobie-anarobie )acultati). #es caract'res biochimiques sont sans intrDt dans la mesure oY seule la production de toxine a valeur dia%nostique.

/8$8,8, Structure antigni)ue et su!stances la!ores

Le seul anti%'ne important de ..diphteriae est la toxine. &elle-ci est commune ( tous les bacilles diphtriques et donne donc naissance ( un seul t pe danticorps neutralisants. &est une exotoxine scrte par ..diphteriae durant sa phase de croissance @)i%ure 2A. &est une protine de 5(5 acides amins. #a scrtion est %ntiquement lie ( la l so%nie par un propha%e et se produit quand il a une )aible concentration en )er. <ne partie de la protine se lie ( la protine rceptrice @,eparin bindin% epidermal %ro\th )actor ou ,5/;1A tr's abondante dans les ner)s et le coeur. Lautre partie se spare et pn'tre dans le c toplasme de la cellule dont le )onctionnement est inhhib par AD- ribos lation. #ous laction combine du )ormol @GB3 IA et de la chaleur @32S&AB la toxine est trans)orme en un produit stableB non toxique mais a ant %ard ses proprits anti%niques que lon appelle anatoxine @c). traitement prventi)B section ".1.".2 pa%e 5@0.

/8$8= 9iagnostic !actriologi)ue

Le dia%nostic bactriolo%ique a pour but de con)irmer limpression clinique et a beaucoup dimportance pidmiolo%ique. 0ais il ne doit *amais )aire retarder le traitement si le tableau clinique est tr's vocateur de diphtrie. Lexamen microscopique du prl'vement de %or%e et de la )ausse membrane peut montrer des )ormes bacillaires %ranuleuses caractristiques. La culture sur srum de boeu) coa%ul permettra disoler en 19 heures des colonies suspectes dont il )audra montrer quelles sont productrices de toxine. Linoculation au coba e et limmuno-di))usion en %el @test d/L/?A sont les deux mthodes de choix pour rvler la production de toxine.

/8$8/ raite"ent
/8$8/8$ raite"ent curati&
.l repose principalement sur lin*ection aussi prcoce que possible de srum antitoxique puri)i @de cheval habituellementA. -our limiter les lsions cellulairesB on in*ecte habituellement par voie intramusculaire 2G GGG ( 1GG GGG units antitoxiquesB une ampoule de 1G ml de srum antidiphtrique titre 1GG GGG unitsB apr's avoir vri)i @par une in*ection intradermiqueA que le su*et nest pas h persensible au srum animal. 0ais les risques de la srothrapie dori%ine animale sont tels @choc anaph lactiqueB maladie sriqueA que lon a de plus en plus souvent recours au srum de su*ets humains immuniss ou mieux ( la )raction %amma%lobulinique de ces srums. <n traitement antibiotique complmentaire ( base de pnicilline ou dr throm cine est entrepris pour arrDter la production de toxine et liminer ..diphteriae. Le repos prolon% au lit est ncessaire en raison des risques cardiaques.

La vaccination est aussi ralise pour permettre un relais de la srothrapie.

/8$8/8' raite"ent prventi&

&est la vaccination obli%atoireB par lanatoxine puri)ieB durant la premi're anne de la vie. Associe ( la vaccination antittanique et anticoquelucheuse @D.4. &oq.AB elle consiste en trois in*ections sous-cutanes ( 1 mois dintervalle avec rappel 1 et 5 ans plus tard. /lle est e))icace ( 1GG %. La diphtrie est devenue tr's rare en /urope du )ait de cette vaccination obli%atoire. &ependantB une recrudescence )ormidable de la diphtrie sest produite dans lex <6## ( partir de 1881 @moins de 1 GGG cas par an en 1899-98 et plus de 2G GGG cas en 1883-8! en 6ussieA par suite de la diminution de la couverture vaccinale. &ette recrudescence a t stoppe par un pro%ramme intensi) de vaccination.

/8' -istria "onoc+tognes

Les bactries du %enre Listeria sont des petits bacilles ! Bram positif, ! extrmits a))ondiesB asporulsB non acido-alcoolo-rsistantB mobiles ( 2G-2+S&. .l existe 2 esp'cesB mais seule lesp'ce L.monocyto-enes *oue un rMle en patholo%ie humaine.

/8'8$ Da!itat
Les Listeria sont des %ermes ubiquitaires que lon trouve dans le solB sur les plantes et dans les eaux @saproph tesA. /lles sont tr's rsistantes au milieu extrieur @plusieurs annes ( + ! S&A. /lles sont aussi des hMtes des Dtres vivants @porta%e intestinal as mptomatique de Listeria che: les animaux et lhommeA. &e sont en)in des bactries des aliments F Listeria est )rquente dans les produits laitiersB lait cru ou )roma%e @crouteA. La pasteurisation correctement ralise dtruit les Listeria. >n la trouve aussi dans les produits carnsB dans les produits de la merB dans les l%umes. &est une bactrie ps chrophile se dveloppant ( des tempraturesX ! S&B ce qui pose des probl'mes pour la conservation prolon%e des aliments. La listriose peut survenir par pidmies lies ( des lots daliments contamins @pidmie denviron 3GG cas dont +G mortels en 1882 en 1ranceA.

6.2.2 Facteurs de virulence et p#+siopat#ologie

La survenue dune in)ection ( L.monoc to%enes dpend de plusieurs )acteurs F virulence particuli're de certaines souchesB contamination par un inoculum massi)B tat immunitaire de lhMte. &ompte-tenu du mode de contamination alimentaire de lhommeB le site principal dentre de la bactrie est lintestin @entroc tes et plaques de -e erA. &est une protine de sur)ace de 9G LD qui dclenche ladhsion et la pntration dans la cellule en induisant la pha%oc tose @internalineA. Les bactries se multiplient dans le c toplasme des macropha%es et des cellules pithliales %rJce ( leur )acteur de virulenceB la listrol sine > @les mutants sans listrol sine ne sont pas patho%'nesA qui est active ( p, acideB dans le pha%ol sosome. La membrane du pha%ol sosome est l seB ce qui permet la libration dans le c toplasme cellulaire oY Listeria se multiplie. Le mouvement intracellulaire et le passa%e de cellule ( cellule de L.monocyto-enes requi'rent la pol mrisation de lactine qui est induite par une protine bactrienne de sur)ace et une phospholipase. -ar voie san%uine et l mphatiqueB les bactries attei%nent le )oie et la rate. Au niveau du )oieB elles sont pha%oc tes par les cellules de ?upp)er et 8G I de linoculum est dtruit. Les bactries survivantes in)ectent les hpatoc tes. La l se des hpatoc tes lib're les bactries qui peuvent Dtre pha%oc tes par les pol nuclaires neutrophiles ou les macropha%es. &ertains macropha%es permettent la multiplication de L.monocyto-enes alors que dautres sont listricides. La suite du processus in)ectieux dpend de ltat immunitaire de lhMte F si toutes les bactries nont pas t dtruitesB les survivants peuvent alors atteindre par voie san%uine le cerveau ou le placenta. La listeriose provoque une rponse immunitaire th modpendante sans intervention des anticorps dans le processus de d)ense.

/8'8* Pouvoir pat#ogne

/8'8*8$ Pouvoir pat#ogne naturel

L.monocyto-enes est une bactrie opportuniste responsable par di))usion hmato%'ne de trois t pes din)ections

che: lhomme
Listeriose de l4adulte et de l4enfantA mnin%itesB mnin%o-encphalitesB encphalitesB septicmie. La %rande ma*orit de ces in)ections se produisent che: des malades porteurs de tares viscrales @cirrhoseB cancersB etc...A. Lalistriose de ladulte atteint essentiellement les personnes J%es et immunodprimes. Listriose de la femme enceinte F in)ection bni%ne pour la )emmeB se traduisant souvent par une simple )i'vre mais %rave pour le )oetusB pouvant provoquer un avortementB la mort in utero ou laccouchement prmatur. Listriose nonatale F septicmieB mnin%ite secondaires ( la contamination dans les *ours qui prc'dent laccouchement ou au moment de laccouchement.

/8'8*8' Pouvoir pat#ogne e3pri"ental

De nombreuses esp'ces animales sont sensibles ( lin)ection exprimentale @ex. F con*onctivite exprimentale du coba e ou test dAN4>NA.

/8'8, Caractres !actriologi)ues et antigni)ues

-etit bacille immobile ( 32S&B mobile ( 22-25C, L.monocyto-enes est arobie-anarobie )acultati). .l pousse bien sur milieux usuels ( des tempratures allant de W!S ( 45C. et des p, de 5,8 ! 1,8. #a culture et son identi)ication au laboratoire sont )aciles @hmol se sur %lose au san%B catalase positiveB esculine positiveA. La prsence de 1+ anti%'nes somatiques et 5 anti%'nes )la%ellaires permet dindividualiser 12 srot pes. La plupart des souches isoles en 1rance appartiennent au srot pe !b et 132a. &es srot pes peuvent Dtre diviss en l sot pes.

6.2.5 9iagnostic !actriologi)ue

.l repose sur lisolement et lidenti)ication de la bactrie. LintrDt du dia%nostic srolo%ique par sro-a%%lutination @taux critique 1332GA est discut. /rl9"ements F san%B L&6B placentaB lsions diverses. /xamen microscopique et techniques de culture habituels. -ossibilit denrichissement des produits patholo%iques pol microbiens par la mthode de ;6A7 @culture ( W!S&A.

/8'8/ raite"ent
#ensibilit de L. monocyto-enes ( pnicilline ;B amoxicilline et aminosidesB mais rsistance aux cphalosporines et aux )luoroquinolones. Le traitement de base des in)ections ( L.monocyto-enes repose sur lassociation amoxicilline%entamicine.